СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ГЕН NIFD<.>)

Общее количество найденных документов : 8
Показаны документы с 1 по 8

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.09-04Б2.13

Henson, Brian J.
Molecular differentiation of the heterocystous cyanobacteria, Nostoc and Anabaena, based on complete NifD sequences [Text] / Brian J. Henson, Linda E. Watson, Susan R. Barnum // Curr. Microbiol. - 2002. - Vol. 45, N 3. - P161-164 . - ISSN 0343-8651
Перевод заглавия: Молекулярная дифференциация гетероцистных цианобактерий, Nostoc и Anabaena, основанная на полных NifD последовательностях
Аннотация: До недавнего времени продолжались дебаты о сегрегации Nostoc и Anabaena в обособленные роды. Ген фиксации азота nifD был полностью секвенирован у большой группы представителей этих родов и полученные последовательности были проанализированы различными методами оценки филогенетического родства с привлечением также данных о последовательностях одноименных генов представителей других родов гетероцистных цианобактерий. Удалось провести четкое разделение родов Nostoc и Anabaena всеми использованными методами. Таким образом, была подтверждена независимость родов Nostoc и Anabaena. США, Dep. Botany, Miami Univ., Oxford, OH 45056

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: ТАКСОНОМИЯ
ГЕНОМИКА
ГЕНЫ
ГЕН NIFD
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
NOSTOC (BACT.)
ANABAENA (BACT.)
НЕЗАВИСИМОСТЬ РОДОВ

Доп.точки доступа:
Watson, Linda E.; Barnum, Susan R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.11-04Б2.54

Dedysh, Svetlana N.
NifH and NifD phylogenies: An evolutionary basis for understanding nitrogen fixation capabilities of methanotrophic bacteria [Text] / Svetlana N. Dedysh, Peter Ricke, Werner Liesack // Microbiology. - 2004. - Vol. 150, N 5. - P1301-1313 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Филогения NifH и NifD. Эволюционная основа для понимания азотфиксации у метанотрофных бактерий
Аннотация: Способность использовать N[c] как источник азота - важная фенотипическая черта большинства известных метанотрофных бактерий (МБ). Эта черта особенно важна для ацидофильных МБ, обитающих в кислых олиготрофных средах с истощенными запасами доступного N. Филогенетически ацидофильные МБ наиболее тесно связаны с гетеротрофными N[2]-фиксаторами из рода Beijerinckia. Продолжили изучение филогенетических связей между этими отличающимися своим обменом организмами. Определяли участки последовательностей в генах nifH и nifD у ацидофильных МБ из родов Methylocella и Methylocapsa в сравнении с Beijerinckia. Для сравнения использовали также эти последовательности у МБ типа II из группы Methylosinus/Methylocystis из 'альфа'-Proteobacteria и из МБ типа I 'гамма'-Proteobacteria. Эволюционные древа, выстроенные для аминокислотных последовательностей на основе генов nifH и nifD, весьма близки. Филогенетические связи среди МБ по древам белков NifH и NifD также хорошо сравнимы с данными 16S-рРНК-филогении (за двумя исключениями). В первую очередь были использованы различные методы филогенетического анализа, основанные на последовательностях NifH и NifD. Имеются в виду штаммы МБ Methylococcus capsulatus из 'гамма'-Proteobacteria в составе клады, характеризуемой, главным образом, 'альфа'-Proteobacteria, включая ацидофильные МБ и МБ типа II из группы Methylosinus/Methylocystis. Исходя из этих и других геномных данных о Methylococcus capsulatus Bath, было предположено, что произошедший в древности горизонтальный перенос гена ответственнен за эту отклонившуюся ветвь. Кроме того, величины сходства последовательностей NifH и NifD у Mehylocapsa acidiphila B2 и представителями Beijerinckia были явно выше (98,5 и 96,6% соответственно), чем следовало ожидать на основе 16S рРНК. Возможно, эти две бактерии произошли от общего ацидофильного, связывающего N[2] предка и подверглись сходному давлению эволюции в отношении добывания N. Это объяснение подтверждается наблюдением о том, что в противоположность большинству других диазотрофов, M. acidiphila B2 и Beijerinckia spp. способны хорошо расти на безазотистых средах при полной аэрации. Германия, M.-Planck Inst. fuer terrestrische Mikrobiol., Karl-von-Frisch-Str., D-35043 Marburg. E-mail: liesack@stuff.uni-marburg.de. Библ. 49

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.09
Рубрики: МЕТАНОТРОФНЫЕ БАКТЕРИИ
METHYLOCELLA (BACT.)
METHYLOCAPSA (BACT.)
ГЕНЫ
ГЕН NIFH
ГЕН NIFD
ФИЛОГЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Ricke, Peter; Liesack, Werner

РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 04.12-04Б3.239

Dedysh, Svetlana N.
NifH and NifD phylogenies: An evolutionary basis for understanding nitrogen fixation capabilities of methanotrophic bacteria [Text] / Svetlana N. Dedysh, Peter Ricke, Werner Liesack // Microbiology. - 2004. - Vol. 150, N 5. - P1301-1313 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Филогения NifH и NifD. Эволюционная основа для понимания азотфиксации у метанотрофных бактерий
Аннотация: Способность использовать N[c] как источник азота - важная фенотипическая черта большинства известных метанотрофных бактерий (МБ). Эта черта особенно важна для ацидофильных МБ, обитающих в кислых олиготрофных средах с истощенными запасами доступного N. Филогенетически ацидофильные МБ наиболее тесно связаны с гетеротрофными N[2]-фиксаторами из рода Beijerinckia. Продолжили изучение филогенетических связей между этими отличающимися своим обменом организмами. Определяли участки последовательностей в генах nifH и nifD у ацидофильных МБ из родов Methylocella и Methylocapsa в сравнении с Beijerinckia. Для сравнения использовали также эти последовательности у МБ типа II из группы Methylosinus/Methylocystis из 'альфа'-Proteobacteria и из МБ типа I 'гамма'-Proteobacteria. Эволюционные древа, выстроенные для аминокислотных последовательностей на основе генов nifH и nifD, весьма близки. Филогенетические связи среди МБ по древам белков NifH и NifD также хорошо сравнимы с данными 16S-рРНК-филогении (за двумя исключениями). В первую очередь были использованы различные методы филогенетического анализа, основанные на последовательностях NifH и NifD. Имеются в виду штаммы МБ Methylococcus capsulatus из 'гамма'-Proteobacteria в составе клады, характеризуемой, главным образом, 'альфа'-Proteobacteria, включая ацидофильные МБ и МБ типа II из группы Methylosinus/Methylocystis. Исходя из этих и других геномных данных о Methylococcus capsulatus Bath, было предположено, что произошедший в древности горизонтальный перенос гена ответственнен за эту отклонившуюся ветвь. Кроме того, величины сходства последовательностей NifH и NifD у Mehylocapsa acidiphila B2 и представителями Beijerinckia были явно выше (98,5 и 96,6% соответственно), чем следовало ожидать на основе 16S рРНК. Возможно, эти две бактерии произошли от общего ацидофильного, связывающего N[2] предка и подверглись сходному давлению эволюции в отношении добывания N. Это объяснение подтверждается наблюдением о том, что в противоположность большинству других диазотрофов, M. acidiphila B2 и Beijerinckia spp. способны хорошо расти на безазотистых средах при полной аэрации. Германия, M.-Planck Inst. fuer terrestrische Mikrobiol., Karl-von-Frisch-Str., D-35043 Marburg. E-mail: liesack@stuff.uni-marburg.de. Библ. 49

ГРНТИ	68.03.07

ВИНИТИ 681.03.07.02
Рубрики: МЕТАНОТРОФНЫЕ БАКТЕРИИ
METHYLOCELLA (BACT.)
METHYLOCAPSA (BACT.)
ГЕНЫ
ГЕН NIFH
ГЕН NIFD
ФИЛОГЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Ricke, Peter; Liesack, Werner

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.02-04Б2.81

Phylogenetic diversity and symbiotic functioning in mungbean (Vigna radiata L. Wilczek) bradyrhizobia from contrast agro-ecological regions of Nepal [Text] / Chandra Prasad Risal [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2012. - Vol. 35, N 1. - P45-53 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Филогенетическое разнообразие и симбиотическое функционирование брадиризобиев фасоли (Vigna radiata L. Wilczek) из сильно различающихся агроэкологических районов Непала
Аннотация: Изучали филогению природных брадиризобиев фасоли из 3 контрастных местообитаний Нeпала с разным климатом и топографией, а также их особенности образования клубеньков и связывания N. В качестве растения-хозяина использовали местный сорт Kalyan. Изоляты различали на основе полной нуклеотидной последовательности 16S-рРНК, участка ITS и генов nodA, а также частичных последовательностей генов nodD1 и nifD. Выявили принадлежность большинства изолятов к р. Bradyrhizobium. Среди них 50% было представлено B. yuanmingense. 29% составляли новые таксоны. Штаммы брадиризобиев всех филогенетич. групп гена nodA могли давать клубеньки на Vigna radiata, коровьем горохе и соевых бобах. Япония, Inst. of Agriculture, Tokyo Univ. of Agriculture and Technol., Fuchu, Tokyo 183-8509 (E-mail:tadashiy@cc.tuat.jp). Библ. 48

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.11.02 + 341.27.21.09.31
Рубрики: P. BRADYRHIZOBIUM (BACT.)
BRADYRHIZOBIUM YUANMINGENSE (BACT.)
СИМБИОНТЫ VIGNA RADIATA CULTIVAR. KALYAN
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ
СИМБИОТИЧЕСКИЕ ФУНКЦИИ
ГЕНЫ NODA
ГЕН NIFD
УЧАСТОК ITS

Доп.точки доступа:
Risal, Chandra Prasad; Djedidi, Salem; Dhakal, Dhruba; Ohkama-Ohtsu, Naoko; Sekimoto, Hitoshi; Yokoyama, Tadashi

РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 13.05-04Б3.177

Phylogenetic diversity and symbiotic functioning in mungbean (Vigna radiata L. Wilczek) bradyrhizobia from contrast agro-ecological regions of Nepal [Text] / Chandra Prasad Risal [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2012. - Vol. 35, N 1. - P45-53 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Филогенетическое разнообразие и симбиотическое функционирование брадиризобиев фасоли (Vigna radiata L. Wilczek) из сильно различающихся агроэкологических районов Непала
Аннотация: Изучали филогению природных брадиризобиев фасоли из 3 контрастных местообитаний Нeпала с разным климатом и топографией, а также их особенности образования клубеньков и связывания N. В качестве растения-хозяина использовали местный сорт Kalyan. Изоляты различали на основе полной нуклеотидной последовательности 16S-рРНК, участка ITS и генов nodA, а также частичных последовательностей генов nodD1 и nifD. Выявили принадлежность большинства изолятов к р. Bradyrhizobium. Среди них 50% было представлено B. yuanmingense. 29% составляли новые таксоны. Штаммы брадиризобиев всех филогенетич. групп гена nodA могли давать клубеньки на Vigna radiata, коровьем горохе и соевых бобах. Япония, Inst. of Agriculture, Tokyo Univ. of Agriculture and Technol., Fuchu, Tokyo 183-8509 (E-mail:tadashiy@cc.tuat.jp). Библ. 48

ГРНТИ	68.03.07

ВИНИТИ 681.03.07.02
Рубрики: P. BRADYRHIZOBIUM (BACT.)
BRADYRHIZOBIUM YUANMINGENSE (BACT.)
СИМБИОНТЫ VIGNA RADIATA CULTIVAR. KALYAN
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ
СИМБИОТИЧЕСКИЕ ФУНКЦИИ
ГЕНЫ NODA
ГЕН NIFD
УЧАСТОК ITS

Доп.точки доступа:
Risal, Chandra Prasad; Djedidi, Salem; Dhakal, Dhruba; Ohkama-Ohtsu, Naoko; Sekimoto, Hitoshi; Yokoyama, Tadashi

РЖ ВИНИТИ 68 (BI03) 13.07-04В4.249

Phylogenetic diversity and symbiotic functioning in mungbean (Vigna radiata L. Wilczek) bradyrhizobia from contrast agro-ecological regions of Nepal [Text] / Chandra Prasad Risal [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2012. - Vol. 35, N 1. - P45-53 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Филогенетическое разнообразие и симбиотическое функционирование брадиризобиев фасоли (Vigna radiata L. Wilczek) из сильно различающихся агроэкологических районов Непала
Аннотация: Изучали филогению природных брадиризобиев фасоли из 3 контрастных местообитаний Нeпала с разным климатом и топографией, а также их особенности образования клубеньков и связывания N. В качестве растения-хозяина использовали местный сорт Kalyan. Изоляты различали на основе полной нуклеотидной последовательности 16S-рРНК, участка ITS и генов nodA, а также частичных последовательностей генов nodD1 и nifD. Выявили принадлежность большинства изолятов к р. Bradyrhizobium. Среди них 50% было представлено B. yuanmingense. 29% составляли новые таксоны. Штаммы брадиризобиев всех филогенетич. групп гена nodA могли давать клубеньки на Vigna radiata, коровьем горохе и соевых бобах. Япония, Inst. of Agriculture, Tokyo Univ. of Agriculture and Technol., Fuchu, Tokyo 183-8509 (E-mail:tadashiy@cc.tuat.jp). Библ. 48

ГРНТИ	68.35.31

ВИНИТИ 681.35.31.19
Рубрики: P. BRADYRHIZOBIUM (BACT.)
BRADYRHIZOBIUM YUANMINGENSE (BACT.)
СИМБИОНТЫ VIGNA RADIATA CULTIVAR. KALYAN
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ
СИМБИОТИЧЕСКИЕ ФУНКЦИИ
ГЕНЫ NODA
ГЕН NIFD
УЧАСТОК ITS

Доп.точки доступа:
Risal, Chandra Prasad; Djedidi, Salem; Dhakal, Dhruba; Ohkama-Ohtsu, Naoko; Sekimoto, Hitoshi; Yokoyama, Tadashi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.12-04Б2.523

Souillard, N.
Primary structure, functional organization and expression of nitrogenase structural genes of the thermophilic archaebacterium Methanococcus thermolithotrophicus [Text] / N. Souillard, L. Sibold // Mol. Microbiol. - 1989. - Vol. 3, N 4. - P541-551
Перевод заглавия: Первичная структура, функциональная организация и экспрессия структурных генов нитрогеназы термофильных архебактерий Methanococcus thermolithottrophicus
Аннотация: Нитрогеназа эубактерий состоит из двух белков: MoFe белок и Fe белок. MoFe белок является тетромером и состоит из двух субъединиц 'альфа'[2]'бета'[2], которые кодируются генами nifD и nifK. Fe белок кодируется генами nifH. Ранее клонировали район ДНК Methanococcus thermolithotrophicus содержащий последовательность, гомологичную nifH гену эубактерий. Однако этот же ген не экспрессировался на уровне РНК в условиях фиксации азота. Клонировали и определили нуклеотидную последовательность еще одного района хромосомы M. thermolithotrophicus, который содержит последовательности ДНК, гомологичные генам nifH, nifD и nifK. Эти гены M. thermolithotrophicus экспрессировались в условиях фиксации азота. Определили размер открытой рамки считывания (ORF) мРНК nifH1 гена и определили стартовые кодоны ORF nifH1 гена и ORF nifD. Обсуждают эволюционную близость nif генов эубакттерий и архебактерий. Библ. 59. франция, Unite de Physiol. Cel. and URA 209 CNRS, Dep. des Biotechnologies, Inst. Pasteur, 25 rue du Dr Roux, 75724 Paris Cedex 15.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: METHANOCOCCUS THERMOLITHOTROPHICUS (BACT.)
АРХЕБАКТЕРИИ
ШТАММ DSM2095
АЗОТФИКСАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ГЕНЫ
ГЕН NIFH1
ГЕН NIFD
ГЕН NIFK
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
КЛОНИРОВАНИЕ
ЭУБАКТЕРИИ
СРАВНЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Sibold, L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.05-04Б2.372

Excision of an 11-Kilobase-pair DNA element from within the nifD-gene in Anabaena variabilis heterocystis [Text] / John S. Brusca [et al.] // J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 8. - P4138-4145 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Вырезание элемента ДНК 11 т. п. н. из гена nifD гетероцистов Anaebaena variabilis
Аннотация: На 3'-конце гена nifD Anaebana variabilis находится элемент 11 т. п. н., вырезающийся из хромосомы во время дифференциации гетероцист. Проведено секвенирование сайтов рекомбинации, фланкирующих этот элемент в вегетативных Кл, а также перестроенных последоательностей в гетероцистах. В вегетативных Кл этот элемент фланкирован прямыми повторами из 11 п. н. идентичными повторам, присутствующим на концах nifD-элемента в шт. Anabaena 7120. Хотя последний отличается по многим признакам от A. viraibilis, гомология между последовательностями, подвергнутыми секвенированию, составляет 96%. Подобно nifD-элементу в шт. 7120, элемент присутствующий в гене nifD A. variabilis вырезается в гетероцистах с образованием функционального гена nifD и свободного кольцевого элемента, к-рый не подвергается ни амплификации ни деградации. В шт. 7120 ген xisA локализован на проксимальном к nifK конце элемента nifD и требуется для вырезания этого элемента в гетероцистах. Соответствующий элемент A. variabilis также содержит ген xisA, к-рый может комплементировать дефектный ген xisA в шт. Anabaena 7120. Вместе с тем, в A. variabilis не содержится эквивалента элементу fdxN размером 55 т. п. н., имеющемуся у шт. 7120. Библ. 46.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.07
Рубрики: ANAEBANA VARIABILIS (BACT.)
ЦИАНОБАКТЕРИИ
КЛЕТОЧНАЯ ДИФФЕРЕНЦИРОВКА
ГЕТЕРОЦИСТЫ
ГЕНЫ
ГЕН NIFD
РЕКОМБИНАЦИЯ
ВЫРЕЗАНИЕ ДНК
ЭЛЕМЕНТ XISA

Доп.точки доступа:
Brusca, John S.; Hale, Michael A.; Carrasco, Claudio D.; Golden, James W.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска