Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=NIRI<.>)
Общее количество найденных документов : 4
Показаны документы с 1 по 4
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.08-04Б2.208

   

    cis-Acting sequences required for NtcB-dependent, nitrite-responsive positive regulation of the nitrate assimilation operon in the cyanobacterium Synechococcus sp. strain PCC 7942 [Text] / Shin-ichi Maeda [et al.] // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 16. - P4080-4088 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Цис-действующие последовательности, требующиеся для зависящей от NtcB, отвечающей на нитрат позитивной регуляции оперона ассимиляции нитрата у цианобактерии Synechococcus sp., штамм PCC 7942
Аннотация: В области между 2 дивергентно транскрибируемыми оперонами nirA и nirB ассимиляции нитрата (I) у Synechococcus sp. PCC 7942 имеются 3 сайта связывания (nirI, nirII и nirIII) глобального азотного регулятора NtcA (II). С использованием репортерской системы luxAB показано, что nirI и nirIII, к-рые расположены на расстоянии 23 п. н. с 5'-стороны от блока-10 генов nirA и nirB соотв., требуются для индукции оперонов nirA и nirB при голодании по N. Индукция оперона nirA является предпосылкой для нормальной регуляции в ответ на нитрит (III) белком NctB (IV) типа LysR (V). Сайт связывания II nirII, расположенный в середине межгенной области nirA-nirB, и потенциальный сайт L1 связывания белка типа V (ТГЦА N[5] ТГЦФ), расположенный между nirI и nirII, необходимы для зависящего от IV усиления транскрипции nirA в присутствии III. Однако IV не связывается с регулярной областью nirA in vitro в присутствии III и II. L1-подобный инвертированный повтор с консенсусной последовательностью ТГЦ N[7] ГЦА сохраняется в промоторной области nirA у цианобактерий. Его центр находится в положении - 25 относительно сайта связывания II, соответствующего nirI. Япония, Dep. Appl. Biol. Sci., Sch. Agr. Sci., Nagoya Univ., Nagoya 464-01. Библ. 41
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОНЫ АССИМИЛЯЦИИ НИТРАТА

NIRA

NIRB

САЙТЫ СВЯЗЫВАНИЯ

NIRI

NIRII

NIRIII

АЗОТНЫЙ РЕГУЛЯТОР NTCA

ПРИСУТСТВИЕ НИТРИТА

УСИЛЕНИЕ ТРАНСКРИПЦИИ

NIRA ГЕНА

БЕЛОК NCTB

SYNECHOCOCCUS (BACT.)

ШТАММ PCC7942


Доп.точки доступа:
Maeda, Shin-ichi; Kawaguchi, Yuriko; Ohe, Taka-Aki; Omata, Tatsuo


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 00.09-04В2.11

   

    cis-Acting sequences required for NtcB-dependent, nitrite-responsive positive regulation of the nitrate assimilation operon in the cyanobacterium Synechococcus sp. strain PCC 7942 [Text] / Shin-ichi Maeda [et al.] // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 16. - P4080-4088 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Цис-действующие последовательности, требующиеся для зависящей от NtcB, отвечающей на нитрат позитивной регуляции оперона ассимиляции нитрата у цианобактерии Synechococcus sp., штамм PCC 7942
Аннотация: В области между 2 дивергентно транскрибируемыми оперонами nirA и nirB ассимиляции нитрата (I) у Synechococcus sp. PCC 7942 имеются 3 сайта связывания (nirI, nirII и nirIII) глобального азотного регулятора NtcA (II). С использованием репортерской системы luxAB показано, что nirI и nirIII, к-рые расположены на расстоянии 23 п. н. с 5'-стороны от блока-10 генов nirA и nirB соотв., требуются для индукции оперонов nirA и nirB при голодании по N. Индукция оперона nirA является предпосылкой для нормальной регуляции в ответ на нитрит (III) белком NctB (IV) типа LysR (V). Сайт связывания II nirII, расположенный в середине межгенной области nirA-nirB, и потенциальный сайт L1 связывания белка типа V (ТГЦА N[5] ТГЦФ), расположенный между nirI и nirII, необходимы для зависящего от IV усиления транскрипции nirA в присутствии III. Однако IV не связывается с регулярной областью nirA in vitro в присутствии III и II. L1-подобный инвертированный повтор с консенсусной последовательностью ТГЦ N[7] ГЦА сохраняется в промоторной области nirA у цианобактерий. Его центр находится в положении - 25 относительно сайта связывания II, соответствующего nirI. Япония, Dep. Appl. Biol. Sci., Sch. Agr. Sci., Nagoya Univ., Nagoya 464-01. Библ. 41
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.29.15.15.19
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОНЫ АССИМИЛЯЦИИ НИТРАТА

NIRA

NIRB

САЙТЫ СВЯЗЫВАНИЯ

NIRI

NIRII

NIRIII

АЗОТНЫЙ РЕГУЛЯТОР NTCA

ПРИСУТСТВИЕ НИТРИТА

УСИЛЕНИЕ ТРАНСКРИПЦИИ

NIRA ГЕНА

БЕЛОК NCTB

SYNECHOCOCCUS (BACT.)

ШТАММ PCC7942


Доп.точки доступа:
Maeda, Shin-ichi; Kawaguchi, Yuriko; Ohe, Taka-Aki; Omata, Tatsuo


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.256

   

    Transcription regulation of the nir gene cluster encoding nitrite reductase of Paracoccus denitrificans involves NNR and Nirl, a novel type of membrane protein [Text] / Neil F. W. Saunders [et al.] // Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 34, N 1. - P24-36 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: В транскрипционной регуляции кластера генов nit, кодирующего нитритредуктазу Paracoccus denitrificans, участвуют NNR и NirI - новый тип мембранного белка
Аннотация: Клонирован и секвенирован кластер генов nirIX Paracoccus denitrificans, расположенный между кластерами генов nir нитритредуктазы (I) и norNO-редуктазы (II). Белок NirI (III) имеет 6 трансмембранных спиралей, большой периплазматич. домен и богатые цистеином цитоплазматич. домены, похожие на сайты связывания кластеров (4Fe-4S) ферредоксиноподобных белков. Белок NirX (IV) является растворимым белком и, вероятно, расположен в периплазме. III и IV являются гомологами белков NosR и NosX, участвующих в регуляции генов nor II у Pseudomonas stutzeri и Sinorhizobium meliloti. Анализ дефектного по III мутанта показал, что III участвует в регуляции кластера генов nir в ответ на огранивение по O[2] и присутствие N-оксидов. Мутант, дефектный по IV, временно накапливает нитрат, но по конечному выходу биомассы похож на штамм дикого типа. Транскрипция самого кластера nirIX контролируется белком NNR (V) - членом семейства FNR-подобных активаторов транскрипции. Сайт связывания V расположен в середине межгенной области nirI и nirS. Его центр находится в положении -41,5 относительно стартов транскрипции обоих генов. Попытки комплементировать мутант nirI клонированным кластером nirIX на плазмиде с широким кругом хозяев оказались неудачными. Способность экспрессировать I восстанавливается только тогда, когда кластер nirIX реинтегрировался в хромосому дефектного по III мутанта и ген nirI{+} оказался перед опероном nir. Нидерланды, Dep. Mol. Cell Physiol., Fac. Biol., Biocentrum Amsterdam, Vrije Univ., 1081 HV Amsterdam. Библ. 48
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
КЛАСТЕР ГЕНОВ NIR IX НИТРАТРЕДУКТАЗЫ

РЕГУЛЯЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ NNR

АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ NIRI

ФУНКЦИЯ

PARACOCCUS DENITRIFICANS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Saunders, Neil F.W.; Houben, Edith N.G.; Koefoed, Sarah; de, Weert Sandra; Reijnders, Willem N.M.; Westerhoff, Hans V.; De, Boer Anthonius P.N.; Van, Spanning Rob J.M.


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.08-04Б2.292

   

    Nitric oxide is a signal for NNR-mediated transcription activation in Paracoccus denitrificans [Text] / Spanning Rob J. M. Van [et al.] // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 13. - P4129-4132 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Окись азота как сигнал для опосредованной NNR активации транскрипции у Paracoccus denitrificans
Аннотация: Для изучения активности промоторов генов nirI, nirS и norC в клетках Paracoccus denitrificans дикого типа и мутантах, дефектных по регулятору транскрипции NNR, в различных условиях роста использованы слияния с `lacZ. Определены профили индукции этих промоторов в ответ на разные оксиды азота. Транскрипция с 3 промоторов требует отсутствия O[2] и присутствия NNR и NO. Активность промотора самого гена nnr уменьшается вдвое при переключении клеток с аэробного дыхания на денитрификацию. Этот ответ не связан с авторегуляцией или регуляцией белком FnrP, т. к. промотор nnr одинаково активен в клетках дикого типа и в мутантах, дефектных по NNR и FNR. Нидерланды, Dep. Mol. Cell Physiol., BioCentrum Amsterdam, Vrije Univ., NL-1081 HV Amsterdam. Библ. 19
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
ГЕНЫ NIRI

ГЕНЫ NIRS

ГЕНЫ NORC

СЛИЯНИЕ С

ГЕН LACZ

ПРОФИЛЬ ИНДУКЦИИ

РЕГУЛЯТОР ТРАНСКРИПЦИИ NNR

ОКСИДЫ АЗОТА

PARACOCCUS DENITRIFICANS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Van, Spanning Rob J.M.; Houben, Edith; Reijnders, Willem N.M.; Spiro, Stephen; Westerhoff, Hans V.; Saunders, Neil


 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)