СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Поисковый запрос: (<.>S=ОДНОНУКЛЕОТИДНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ В ГЕНЕ ЦИТОКИНА ЛИМФОТОКСИНА 'БЕТА'<.>)

Общее количество найденных документов : 1

РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 16.06-04И8.67

Оценка роли однонуклеотидного полиморфизма в гене лимфотоксина бета при доместикации свиньи на основе биоинформационного и экспериментального подходов [Текст] / Р. Б. Айтназаров [и др.] // Вавил. ж. генет. и селекции. - 2015. - Т. 19, N 6. - С. 699-706 . - ISSN 1814-554X
Аннотация: В работах, выполненных на диких и лабораторных животных, показано существование компромисса между репродуктивным успехом и иммунитетом. Поэтому в процессе доместикации могли отбираться особи с повышенными репродуктивными способностями, но со сниженным иммунитетом. Пониженная реактивность иммунной системы могла в дальнейшем стать наследуемой путем фиксации в популяции генов с "неблагоприятными" мутациями. Цель исследования - изучить: 1) частоты генотипов и аллелей однонуклеотидного полиморфизма (SNP - Single Nucleotide Polymorphism) SNP rs340283541 в гене цитокина лимфотоксина бета (LTB) у домашних свиней и диких кабанов; 2) экспрессию мРНК этого гена у миниатюрных свиней с разными генотипами; 3) провести биоинформатический анализ потенциальной функциональной роли этого SNP. Частота генотипа GG в выборке кабанов была достоверно ниже частоты данного генотипа в объединенной выборке из разных пород и популяций домашних свиней. Уровень экспрессии мРНК гена LTB в лимфатическом узле у миниатюрных свиней с генотипом GG имел тенденцию к повышению (р 0,06), по сравнению с носителями аллеля А. SNP rs340283541 входит в состав мотива ДНК с высокой степенью консервативности у 12 видов млекопитающих, что косвенно свидетельствует о его важной функциональной роли. С помощью контекстного анализа выявлено, что аллель А содержит потенциальные сайты связывания транскрипционных факторов BRN-2 и AP-1, а аллель G - факторов RFX1, ISGF3 (сайт ISRE) и USF, которые экспрессируются в клетках иммунной системы. Таким образом, в процессе доместикации свиней произошло повышение частоты генотипа GG SNP rs340283541 в 3'-области гена LTB. Генотип GG, вероятно, ассоциирован с повышенным уровнем экспрессии мРНК гена LTB в ткани лимфатического узла. Повышение уровня экспрессии у свиней с генотипом GG может быть связано с образованием сайтов связывания транскрипционных факторов RFX1, ISRE, USF и/или разрушением сайтов связывания BRN-2 и AP-1. Также не исключено, что полиморфизм rs340283541 находится в неравновесии по сцеплению с другой функционально значимой мутацией.

ГРНТИ	34.23.59

ВИНИТИ 341.23.59.02.07
Рубрики: ГЕНЫ
ОДНОНУКЛЕОТИДНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ В ГЕНЕ ЦИТОКИНА ЛИМФОТОКСИНА 'БЕТА'
ДОМЕСМИКАЦИЯ
ВОСПРОИЗВОДСТВО
ИММУНИТЕТ
СВИНЬИ

Доп.точки доступа:
Айтназаров, Р.Б.; Игнатьева, Е.В.; Базарова, Н.Э.; Левицкий, В.Г.; Князев, С.П.; Гон, Я.; Юдин, Н.С.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска