СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=МИШЕННЫЕ САЙТЫ<.>)

Общее количество найденных документов : 3
Показаны документы с 1 по 3

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.07-04Б1.87

Sekiguchi, JoAnn.
Nick sensing by vaccinia virus DNA ligase requires a 5' phosphate at the nick and occupancy of the adenylate binding site on the enzyme [Text] / JoAnn Sekiguchi, Stewart Shuman // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 12. - P9679-9684 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Узнавание однонитевого разрыва ДНК-лигазой вируса осповакцины требует 5'-фосфата в однонитевом разрыве и занятости сайта связывания аденилата на ферменте
Аннотация: При связывании с субстратом ДНК-лигаза (I) вируса осповакцины различает ДНК, содержащую в однонитевом разрыве (ОР) 5'-фосфат, от ДНК, содержащей в ОР 5'-гидроксил. Мутант I с заменой К231 в активном центре (IA), неспособен образовывать ковалентный интермедиат I - аденилат (II) и активировать ДНК с ОР через образование интермедиата ДНК-II. Тем не менее IA катализирует образование фосфодиэфирной связи на преаденилированном ОР. Т. обр., остаток лиз активного центра I не требуется для стадии замыкания в реакции лигирования. IA прочно связывается с ДНК-II в ОР, но имеет низкое сродство к стандартному ОР. I дикого типа, находящаяся преимущественно в форме I-II, прочно связывается с ОР в ДНК. Это позволяет предположить, что занятость кармана связывания АМФ в I существенна для стабильного связывания с ДНК. Секвестрирование внеспирального нуклеотида связанной с ДНК I напоминает механизм "выскакивания" основания, используемый в узнавании мишенных сайтов др. ферментами модификации и репарации ДНК. США, Mol. Biol. Program, Sloan-Kettering Inst., New York, NY 10021. Библ. 31

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУС ОСПОВАКЦИНЫ
ДНК-ЛИГАЗА
ОДНОНИТЕВЫЕ РАЗРЫВЫ
УЗНАВАНИЕ
МИШЕННЫЕ САЙТЫ
ЛИГИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Shuman, Stewart

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.08-04Б1.88

Mapping target site selection for the non-specific nuclease activities of retroviral integrase [Text] / Michael Katzman [et al.] // Virus Res. - 2000. - Vol. 66, N 1. - P87-100 . - ISSN 0168-1702
Перевод заглавия: Картирование участка выбора мишени для неспецифических нуклеазных активностей интегразы ретровируса
Аннотация: Чтобы идентифицировать часть ретровирусной интегразы, к-рая взаимодействует со своим субстратом (ДНК), сравнили свойства участка мишени при использовании химерных ферментов и фрагментов белка в методах, обнаруживающих неспецифические активности нуклеазы интегразы. Обнаружили, что центральная область из 12 химерных белков между интегразами вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) и вируса висна (ВВ) отвечает за селекцию участков мишени невирусной ДНК, если слабые спирты снабжают атакующие нуклеофильные ОН-группы во время использования неспецифического алкоголизма. Тестирование делеционных производных белков интегразы, к-рые обладают сходством в реакции присоединения к ДНК, возникающей при интеграции ретровирусов, определяет мелкий центральный домен, достаточный для активности. Этот домен сердцевины одинаково содержит и участок ДНК хозяина, и нуклеофильный участок. Участок интегразы, отвечающий за селекцию участков-мишеней невирусной ДНК, когда конец вирусной ДНК является атакуемым нуклеофилом, не может быть сходно картирован методом стандартного олигонуклеотидного связывания. Определили белки в более чувствительном методе, к-рый показывает предпочтительные участки внедрения вирусной ДНК в мишень плазмидной ДНК. Все 12 химер обладали новыми свойствами по сравнению с природными ферментами, хотя свойство локальной вставки указывает на важную роль центрального домена в отборе участка мишени. Считают, что с ретровирусной ДНК могут взаимодействовать 2 различной области интегразы. США, Dep. of Med., Sec. of Inf. Dis., Pennsylvania, State Univ. Coll. of Med., Hershey, PA 17033-2390. Библ. 39

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: РЕТРОВИРУСЫ
ИНТЕГРАЗА
МИШЕННЫЕ САЙТЫ
СЕЛЕКЦИЯ
КАРТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Katzman, Michael; Sudol, Malgorzata; Pufnock, Jeffrey S.; Zeto, Shawn; Skiner, Lynn M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.10-04Б2.140

Defining the Bacillus subtilis 'сигма'{W} regulon: A comparative analysis of promoter consensus search, run-off transcription/macroarray analysis (ROMA), and transcriptional profiling approaches [Text] / Min Cao [et al.] // J. Mol. Biol. - 2002. - Vol. 316, N 3. - P443-457 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Определение 'дельта'{w} регулона Bacillus subtilis: сравнительный анализ методов поиска промоторного консенсуса, выключение транскрипции/анализ макропоследовательностей (ROMA) и транскрипционных профилей
Аннотация: В Bacillus subtilis фактор 'дельта'{w} контролирует большой регулон, индуцируемый щелочным шоком. Для определения его физиологической роли идентифицировали множество генов, находящихся под контролем 'дельта'{w}. Ввели новый метод для идентификации дополнительной мишени промоторов - ROMA. Сравнили с результатами изучения профилей транскрипции и установили минимум 30 промоторных сайтов (контролирующих около 60 генов) в качестве мишени для активации 'дельта'{w} фактором. Ни один из методов не идентифицировал более 80% регулона. Предложили использовать комбинацию методов и установили, что 'дельта'{w} контролирует гены, защищающие клетку от агентов, нарушающих биосинтез клеточной стенки, но не обнаружили роли оперонов в адаптации к щелочным условиям. Сделали заключение, щелочной стресс в Bacillus subtilis активирует 'дельта'{w} стрессовый ответ путем нарушения функций биосинтеза клеточной стенки. США, Dep. of Microbiology Cornell Univ. Ithaca NY 14853-8101. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
МИШЕННЫЕ САЙТЫ
АКТИВАЦИЯ
'ДЕЛЬТА'{W} ФАКТОР
СТРЕССОВЫЙ ОТВЕТ
ЩЕЛОЧНОЙ СТРЕСС
КЛЕТОЧНАЯ СТЕНКА
ФУНКЦИИ БИОСИНТЕЗА
НАРУШЕНИЕ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
ГЕНОМИКА

Доп.точки доступа:
Cao, Min; Kobel, Phil A.; Morshedi, Maud M.; Wu, Ming Fang Winston; Paddon, Chris; Helmann, John D.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска