Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=АННОТИРОВАНИЕ<.>)
Общее количество найденных документов : 22
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-22 
1.
Патент 5605158 Соединенные Штаты Америки, МКИ A61B 5/04.

    Snell, Jeffery D.
    Apparatus for annotating physiological waveforms [Текст] / Jeffery D. Snell ; Pacesetter, Inc. - № 510448 ; Заявл. 02.08.1995 ; Опубл. 25.02.1997
Перевод заглавия: Аппаратура для аннотирования физиологических сигналов
Аннотация: Краткая аннотация на патент. Патентуется аппаратура для мониторинга параметров, определяющих состояние пациента, включающая имплантируемое устройство, имеющее несколько режимов работы, и внешнее устройство, состоящее из средств определения хотя бы одного физиологического параметра пациента и передачи его в виде сигнала, средств сравнения этого сигнала с заданным и изменения режима имплантируемого устройства в соответствии с этими данными, средств передачи кодов событий, а также устройство для мониторинга. Ил. 1
ГРНТИ  
34.57.15
ВИНИТИ 341.57.15.43
Рубрики: АППАРАТУРА
МОНИТОРЫ
БИОЛОГИЧЕСКИЕ СИГНАЛЫ
АННОТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Pacesetter; Inc.
Свободных экз. нет
2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 00.02-04А3.848

   
    An ontology for bioinformatics applications [Text] / Patricia G. Baker [et al.] // Bioinformatics. - 1999. - Vol. 15, N 6. - P510-520 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Онтология применений биоинформатики
Аннотация: Задачи создания, использования и анализа различных баз данных требует общей для них семантической сети, к-рая необходима также для обобщения различных источников биол. информации и систематического аннотирования экспериментальных результатов. В работе описана такая система онтологии для разных источников информации и приведены примеры ее использования. Великобритания, Sch. Biol. Sci., Univ. Manchester, Manchester М13 9РТ. Библ. 34
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БИОИНФОРМАТИКА
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ДАННЫЕ
СИСТЕМАТИЧЕСКОЕ АННОТИРОВАНИЕ
ОНТОЛОГИЯ

Доп.точки доступа:
Baker, Patricia G.; Goble, Carole A.; Bechhofer, Sean; Paton, Norman W.; Stevens, Robert; Brass, Andy

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 00.03-04А1.2

   
    An ontology for bioinformatics applications [Text] / Patricia G. Baker [et al.] // Bioinformatics. - 1999. - Vol. 15, N 6. - P510-520 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Онтология применений биоинформатики
Аннотация: Задачи создания, использования и анализа различных баз данных требует общей для них семантической сети, к-рая необходима также для обобщения различных источников биол. информации и систематического аннотирования экспериментальных результатов. В работе описана такая система онтологии для разных источников информации и приведены примеры ее использования. Великобритания, Sch. Biol. Sci., Univ. Manchester, Manchester М13 9РТ. Библ. 34
ГРНТИ  
34.01.05
ВИНИТИ 341.01.05
Рубрики: БИОИНФОРМАТИКА
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ДАННЫЕ
СИСТЕМАТИЧЕСКОЕ АННОТИРОВАНИЕ
ОНТОЛОГИЯ

Доп.точки доступа:
Baker, Patricia G.; Goble, Carole A.; Bechhofer, Sean; Paton, Norman W.; Stevens, Robert; Brass, Andy

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 00.03-04Б3.20

   
    An ontology for bioinformatics applications [Text] / Patricia G. Baker [et al.] // Bioinformatics. - 1999. - Vol. 15, N 6. - P510-520 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Онтология применений биоинформатики
Аннотация: Задачи создания, использования и анализа различных баз данных требует общей для них семантической сети, к-рая необходима также для обобщения различных источников биол. информации и систематического аннотирования экспериментальных результатов. В работе описана такая система онтологии для разных источников информации и приведены примеры ее использования. Великобритания, Sch. Biol. Sci., Univ. Manchester, Manchester М13 9РТ. Библ. 34
ГРНТИ  
34.27.39
ВИНИТИ 341.27.39.07.07
Рубрики: БИОИНФОРМАТИКА
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ДАННЫЕ
СИСТЕМАТИЧЕСКОЕ АННОТИРОВАНИЕ
ОНТОЛОГИЯ

Доп.точки доступа:
Baker, Patricia G.; Goble, Carole A.; Bechhofer, Sean; Paton, Norman W.; Stevens, Robert; Brass, Andy

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.11-04А3.711

   
    BioEditor - simplifying macromolecular structure annotation [Text] / Peng Yang [et al.] // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 7. - P897-898 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: BioEditor - программа, упрощающая аннотирование макромолекулярных структур
Аннотация: BioEditor - это программа, позволяющая исследователям и преподавателям подготавливать и представлять аннотации, содержащие форматированный текст, графики, данные о последовательностях и интерактивные изображения молекулярных структур. Предполагается, что BioEditor перекрывают разрыв между представлением в статьях в печатных журналах и в формате интернета. BioEditor доступен по адресу: http.//bioeditor.sdsc.edu. США, San Diego Supercomp. Ctr., Univ. California, San Diego, La Jolla, CA 92093-0505. Библ. 9
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА
АННОТИРОВАНИЕ
КОМПЬЮТЕРНАЯ ПРОГРАММА BIOEDITOR
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Yang, Peng; Craig, Paul A.; Goodsell, David; Bourne, Philip E.

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.02-04А3.620

   
    Modeling the percolation of annotation errors in a database of protein sequences [Text] / Walter R. Gilks [et al.] // Bioinformatics. - 2002. - Vol. 18, N 12. - P1641-1649 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Моделирование проникновения ошибок аннотаций в базу данных белковых последовательностей
Аннотация: Публичные базы данных последовательностей содержат информацию о последовательности, структуре и функции белков. Определение последовательностей геномов привело к быстрому росту баз данных последовательностей, но достоверная, экспериментально проверенная информация в этих случаях сильно запаздывает. Поэтому часто приводится аннотация, касающаяся сходства последовательностей с уже аннотированными гомологами, что чревато ошибками. Такие ошибки могут размножаться по цепи при использовании такой аннотации как источника аннотирования новых гомологов. На базе некоторых простых предположений разработана динамическая вероятностная модель таких цепей ошибочных аннотаций. Использование следствий из модели для оценки качества аннотаций показало, что такой метод создания новых аннотаций ведет к систематическому ухудшению качества баз данных. Великобритания, MRC Biostatistics Unit., Cambridge, CB10 1SD. Библ. 19
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
БАЗЫ ДАННЫХ
АННОТИРОВАНИЕ
ОШИБКИ АННОТАЦИЙ
ВЕРОЯТНОСТНАЯ МОДЕЛЬ

Доп.точки доступа:
Gilks, Walter R.; Audit, Benjamin; De, Angelis Daniela; Tsoka, Sophia; Ouzounis, Christos A.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.03-04А3.468

    McDermott, Jason.
    Bioverse: Functional, structural and contextual annotation of proteins and proteomes [Text] / Jason McDermott, Ram Samudrala // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 13. - P3736-3737 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Bioverse - функциональное, структурное и контекстуальное аннотирование белков и протеомов
Аннотация: Функциональное аннотирование обычно проводится в крупномасштабных проектах и базах данных геномики. Сервер для аннотирования последовательностей Bioverse (http://bioverse.compbio.washington.edu) содержит интерфейс, позволяющий пользователю вводить белковые последовательности в Bioverse. Последовательности обеспечиваются функциональными, структурными и возможными контекстуальными аннотациями. Пользователь может также вводить геномы для аннотирования всех кодируемых ими белков (протеома). США, Comput. Genomics Grp, Dep. Microbiol., Univ. Washington Sch. Med., Seattle, WA 08195. Библ. 16
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
ПРОТЕОМЫ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ФУНКЦИОНАЛЬНОЕ И СТРУКТУРНОЕ АННОТИРОВАНИЕ
СЕРВЕР BIOVERSE
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Samudrala, Ram

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.04-04А3.431

    Nair, Rajesh.
    LOC3D: Annotate sub-cellular localization for protein structures [Text] / Rajesh Nair, Burkhard Rost // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 13. - P3337-3340 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: LOC3D - аннотирование внутриклеточной локализации для белковых структур
Аннотация: LOC3D (http://cubic.bioc.columbia.edu/db/LOC3d/) - это одновременно еженедельно обновляемая база данных и сетевой сервер для предсказания внутриклеточной локализации белков эукариот с известной трехмерной структурой. Локализация предсказывается с помощью 4 разных методов: (1) PredictNLS, предсказывающей локализацию в ядре по наличию сигнала локализации; (2) LOChom, предсказывающей локализацию по гомологии последовательностей; (3) LOCkey, использующей автоматический анализ текста по ключевым словам базы данных SWISS-PROT; и (4) LOC3Dini, осуществляющей предсказания ab initio с помощью нейронных сетей и машин с векторной поддержкой. Окончательное предсказание выбирается по наибольшей доверительности. База данных LOC3D содержит 8700 цепей белков эукариот из банка белковых данных PDB. Сервер LOC3D можно использовать для предсказания локализации и таких белков, для которых структуры лишь предсказаны с помощью "протягивания". США, CUBIC, Dep. Biochem. & Mol. Biophys., Columbia Univ., New York, NY 10032. Библ. 30
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
ТРЕХМЕРНАЯ СТРУКТУРА
ВНУТРИКЛЕТОЧНАЯ ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ПРЕДСКАЗАНИЕ
АННОТИРОВАНИЕ
ЭУКАРИОТЫ
БАЗА ДАННЫХ LOC3D
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Rost, Burkhard

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.06-04А3.591

   
    Автоматизированное аннотирование функциональных свойств белков надсемейства цитохромов Р450 [Текст] : докл.[Отчетная конференция за 2002 год по проблеме "Создание лекарственных средств" подраздела "Медицина" раздела "Технологии живых систем" Федеральной научно-технической программы на 2002-2006 гг. "Исследование и разработка по приоритетным направлениям развития науки и техники", Москва, март, 2002] / Е. А. Пономаренко [и др.] // Аллергия, астма и клин. иммунол. - 2003. - Т. 7, N 8. - С. 95-99
Аннотация: Автоматизация обработки научных текстов становится одной из первоочередных задач современной биоинформатики. Рассмотрен способ упорядочивания коллекции научных публикаций по тематике цитохромов P450, при котором на первое место помещаются тексты, относящиеся к описанию взаимодействия белка с низкомолекулярным лигандом (субстратом или ингибитором). В основе метода лежит подсчет относительной частоты встречаемости ключевых слов в обучающей выборке по сравнению со всей совокупностью имеющихся резюме. В результате работы из более 36 тыс. текстов было отобрано 3 тыс. публикаций, представляющих наибольший интерес с точки зрения получения информации о взаимодействии блок-лиганд. Анализ отобранных резюме показал, что точность прогноза содержания документа составляет 77%. Россия, Гос. учреждение ин-т биомед. хим. РАМН, Москва. Библ. 7
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: ЦИТОХРОМ P450
ЛИГАНДЫ
НАУЧНЫЕ ТЕКСТЫ
АННОТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Пономаренко, Е.А.; Лисица, А.В.; Карузина, И.И.; Мирошниченко, Ю.В.

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.10-04А3.924

   
    Automated annotation of microbial proteomes in SWISS-PROT [Text] / Alexandre Gattiker [et al.] // Computat. Biol. and Chem. - 2003. - Vol. 27, N 1. - P49-58 . - ISSN 1476-9271
Перевод заглавия: Автоматизированная аннотация микробных протеомов в базе данных SWISS-PROT
Аннотация: Проект HAMAP предназначен для интеграции методов ускоренной высококачественной аннотации протеомов прокариот. Автоматическая аннотация применима лишь к ограниченным ортологическим семействам и протеомам. Методы контроля позволяют избежать ошибочной аннотации и выделить сомнительные случаи, подлежащие мануальному анализу. Результаты интегрированы в SWISS-PROT (http://www.expasy.org/sprot/hamap/). Швейцария, SWISS-PROT Group, Swiss Inst. Bioinformatics, CH1211 Geneva. Библ. 22
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
ПРОТЕОМЫ
АВТОМАТИЧЕСКОЕ АННОТИРОВАНИЕ
БАЗА ДАННЫХ SWISS-PROT
ПРОЕКТ HAMAP
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ
БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Gattiker, Alexandre; Michoud, Karine; Rivoire, Catherine; Auchincloss, Andrea H.; Coudert, Elisabeth; Lima, Tania; Kersey, Paul; Pagni, Marco; Sigrist, Christian J.A.; Lachaize, Corinne

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.10-04А3.968

   
    WILMA- automated annotation of protein sequences [Text] / Andreas Prlic [et al.] // Bioinformatics. - 2004. - Vol. 20, N 1. - P127-128 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: WILMA - автоматическое аннотирование белковых последовательностей
Аннотация: Представлена автоматизированная система WILMA для функционального аннотирования крупных наборов белковых последовательностей. При помощи различных методов биоинформатики достигается всеобъемлющее описание белковых последовательностей и устанавливаются связи между этими результатами и стандартными дескрипторами Gene Ontology для молекулярных функций, биологических процессов и компонент клетки. Доступ к WILMA осуществляется через сетевой интерфейс и опрос баз данных. Результаты аннотирования системой WILMA протеомов Homo sapiens, Mus musculus, Arabidopsis thaliana и Caenorhabditis elegans доступны по адресу: http://www.came.sbg.ac.at/wilma. Австрия, Ctr. Appl. Mol. Eng., Inst. Chem. & Biochem., Univ. Salzburg, 5020 Salzburg. Библ. 17
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
ПРОТЕОМЫ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ФУНКЦИОНАЛЬНОЕ АННОТИРОВАНИЕ
АВТОМАТИЗИРОВАННАЯ СИСТЕМА WILMA
АДРЕС ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Prlic, Andreas; Domingues, Francisco S.; Lackner, Peter; Sippl, Manfred J.

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 05.01-04А3.940

    Kopp, Jurgn.
    The SWISS-MODEL Repository of annotated three-dimensional protein structure homology models [Text] / Jurgn Kopp, Torsten Schwede // Nucl. Acids Res. - 2004. - Vol. 32, прил. Dat. Iss. - P230-234 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Хранилище SWISS-MODEL для построенных по гомологии аннотированных моделей трехмерных структур белков
Аннотация: SWISS-MODEL (http://swissmodel.expasy.org/repository/) является базой данных аннотированных моделей белковых структур, построенных по гомологии полностью автоматически. SWISS-MODEL содержит 'ЭКВИВ'300 000 трехмерных моделей, построенных по последовательностям из Swiss-Prot и TrEMBL. Каждый файл содержит не менее одной трехмерной модели, наложение последовательностей исследуемого белка и белка-матрицы, детали процесса моделирования и описание силового поля, используемого для оценки качества. Швейцария, Biozentrum, Univ. Basel, 4056 Basel. Библ. 39
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
ТРЕХМЕРНАЯ СТРУКТУРА
АННОТИРОВАНИЕ МОДЕЛИ
АВТОМАТИЧЕСКОЕ ПОСТРОЕНИЕ ПО ГОМОЛОГИИ
ХРАНИЛИЩЕ SWISS-MODEL
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Schwede, Torsten

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 05.02-04А3.698

    Young, Nelson.
    GelScape: A web-based server for interactively annotating, manipulating, comparing and archiving 1D and 2D gel images [Text] / Nelson Young, Zhan Chang, David S. Wishart // Bioinformatics. - 2004. - Vol. 20, N 6. - P976-978 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Сервер GelScape на основе всемирной сети для интерактивного аннотирования одномерных и двухмерных изображений гелей, манипулирования ими, сравнения и архивирования
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
ГЕЛЬ-ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКОЕ РАЗДЕЛЕНИЕ
ОДНОМЕРНЫЕ И ДВУХМЕРНЫЕ ИЗОБРАЖЕНИЯ
АННОТИРОВАНИЕ
СРАВНЕНИЕ
АРХИВИРОВАНИЕ
СЕРВЕР GELSCAPE
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Chang, Zhan; Wishart, David S.

14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 05.08-04А3.526

    Porollo, Aleksey A.
    POLYVIEW: A flexible visualization tool for structural and functional annotations of proteins [Text] / Aleksey A. Porollo, Rafal Adamczak, Joroslaw Meller // Bioinformatics. - 2004. - Vol. 20, N 15. - P2460-2462 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: POLYVIEW - гибкое средство визуализации для структурного и функционального аннотирования белков
Аннотация: Сервер POLYVIEW (http://polyview.cchmc.org) можно использовать для создания аннотаций к белковым последовательностям, включая описание вторичных структур, относительной доступности растворителю, функциональных мотивов и центров полиморфизма. Двумерные графические представления в привычном формате можно создавать как для известных белковых структур, так и для предсказаний, полученных с помощью серверов, предсказывающих белковые структуры. POLYVIEW можно использовать для автоматического создания картин структурных и функциональных связей. США, Children's Hosp. Res. Fdn, Cincinnati, OH 45229. Библ. 8
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БЕЛОК
СТРУКТУРНОЕ И ФУНКЦИОНАЛЬНОЕ АННОТИРОВАНИЕ
СРЕДСТВО ВИЗУАЛИЗАЦИИ
СЕРВЕР POLYVIEW
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Adamczak, Rafal; Meller, Joroslaw

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI21) 07.11-04И2.1

    Nilsson, Daniel.
    A graphical tool for parasite genome annotation [Text] / Daniel Nilsson, Bjorn Andersson // Comput. Meth. and Programs Biomed. - 2004. - Vol. 73, N 1. - P55-60
Перевод заглавия: Графические средства для аннотирования генома паразитов
Аннотация: Разработана графическая среда для быстрого предварительного аннотирования последовательностей генома. Реализован эффективный интерфейс пользователя для импорта последовательностей и обмена информацией с базами данных. Описаны алгоритмы прогнозирования, поиска на основе подобия, фильтрации результатов, внесения изменений в данные вручную, редактирования аннотаций и визуализации. Разработана система правил для принятия решений в спорных ситуациях. Приведены примеры практического применения предлагаемого подхода в анализе генома паразитов
ГРНТИ  
34.33.23
ВИНИТИ 341.33.23.02
Рубрики: ПАРАЗИТЫ
ГЕНОМ
АННОТИРОВАНИЕ
ГРАФИЧЕСКИЕ СРЕДСТВА

Доп.точки доступа:
Andersson, Bjorn

16.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI38) 07.12-04А3.66

    Lin, I-Jong.
    CMAS, a rich media annotation system for medical imaging [Text] : докл. [Conference "Medical Imaging 2006: PASC and Imaging Informatics", San Diego, Calif., 14-16 Febr., 2006] / I-Jong Lin, Hui Chao // Proc. SPIE. - 2006. - Vol. 6145. - P614506/1-614506/8 . - ISSN 1605-7422
Перевод заглавия: CMAS, усовершенствованная медийная аннотационная система для медицинских изображений
Аннотация: Разработана система, названная CMAS, облегчающая возможность для медицинских работников аннотировать цифровые медицинские записи, включающие медицинские изображения или видеозаписи медицинских процедур. США, Hewlett-Packard Labs, Palo Alto, Ca (e-mail: i-jong.lin@hp.com). Ил. 5. Библ. 13
ГРНТИ  
76.03.59
ВИНИТИ 761.03.59.09.02
Рубрики: МЕДИЦИНСКАЯ ИНФОРМАЦИОННАЯ СИСТЕМА
СИСТЕМА CMAS
МЕДИЦИНСКИЕ ЗАПИСКИ
МЕДИЦИНСКИЕ ИЗОБРАЖЕНИЯ
АННОТИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Chao, Hui

17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.11-04Б2.95

    Уваровский, А. Н.
    Протеогеномный анализ Mycoplasma gallisepticum и Spiroplasma millifera [Текст] / А. Н. Уваровский, Д. Г. Алексеев // Труды 53 научной конференции МФТИ "Современные проблемы фундаментальных и прикладных наук", Москва-Долгопрудный (Моск. обл.), 24-29 нояб., 2010. - Долгопрудный (Моск. обл.), 2010. - Молекулярная и биологическая физика, Ч. 4. - С. 130-131 . - ISBN 978-5-7417-0383-0
Аннотация: Одним из новейших алгоритмов, позволяющих увеличить точность аннотации генома, является протеогеномное аннотирование. Суть метода заключается в параллельном использовании методов протеомного профилирования при аннотации генома или использовании данных о протеоме для коррекции уже сделанной геномной аннотации. В данной работе было проведено протеогеномное профилирование Mycoplasma gallisepticum и Spiroplasma milliferum, что позволило создать более точную аннотацию геномов данных микроорганизмов. Используя ранее полученные данные о других штаммах, авторы исследовали протеом на предмет толерантности к геному. Россия, Московский физико-технический ин-т (гос. ун-т)
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: MYCOPLASMA GALLISEPTICUM (BACT.)
SPIROPLASMA MILLIFERUM (BACT.)
ГЕНОМ
АННОТИРОВАНИЕ
ПРОТЕОМ
ПРОФИЛИРОВАНИЕ
ПРОТЕОГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Алексеев, Д.Г.

18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 12.11-04А4.207

   
    3D annotation and manipulation of medical anatomical structures [Text] : докл.[Conference "Medical Imaging 2009: Visualization, Image-Guided Procedures, and Modeling", Lake Buena Vista, Fla, 8-10 Febr., 2009] / Dime Vitanovski [et al.] // Proc. SPIE. - 2009. - Vol. 7261. - P72611H/1-72611H/8 . - ISSN 1605-7422
Перевод заглавия: Трехмерное аннотирование и манипуляция для медицинских анатомических структур
Аннотация: Несмотря на возможность трехмерной регистрации с помощью медицинских сканеров, манипуляции и аннотирование собранных данных выполняются в стандартной двумерной среде. Разработана структура для аннотирования непосредственно в трехмерной среде с помощью двух новых передовых технологий устройства отображения и контроллера данных. Определена некомпланарная установка инфракрасных светодиодов с известной и точной позицией, которая отслеживается контроллером. Германия, Chair of Pattern Recognition, Martensstr. 3, 91058 Erlangen. Библ. 11
ГРНТИ  
34.49.33
ВИНИТИ 341.49.33.13.19.99.05
Рубрики: ИНТЕРВЕНЦИОННАЯ РАДИОЛОГИЯ
РЕНТГЕНОВСКИЙ КОНТРОЛЬ
АНАТОМИЧЕСКИЕ СТРУКТУРЫ
ЗАРЕГИСТРИРОВАННЫЕ ИЗОБРАЖЕНИЯ
ТРЕХМЕРНОЕ АННОТИРОВАНИЕ
ОТСЛЕЖИВАЮЩИЙ КОНТРОЛЛЕР

Доп.точки доступа:
Vitanovski, Dime; Schaller, Christian; Han, Dieter; Daum, Volker; Hornegger, Joachim

19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 13.01-04М1.14

   
    3D annotation and manipulation of medical anatomical structures [Text] : докл.[Conference "Medical Imaging 2009: Visualization, Image-Guided Procedures, and Modeling", Lake Buena Vista, Fla, 8-10 Febr., 2009] / Dime Vitanovski [et al.] // Proc. SPIE. - 2009. - Vol. 7261. - P72611H/1-72611H/8 . - ISSN 1605-7422
Перевод заглавия: Трехмерное аннотирование и манипуляция для медицинских анатомических структур
Аннотация: Несмотря на возможность трехмерной регистрации с помощью медицинских сканеров, манипуляции и аннотирование собранных данных выполняются в стандартной двумерной среде. Разработана структура для аннотирования непосредственно в трехмерной среде с помощью двух новых передовых технологий устройства отображения и контроллера данных. Определена некомпланарная установка инфракрасных светодиодов с известной и точной позицией, которая отслеживается контроллером. Германия, Chair of Pattern Recognition, Martensstr. 3, 91058 Erlangen. Библ. 11
ГРНТИ  
34.41.05
ВИНИТИ 341.41.05.07.99
Рубрики: ИНТЕРВЕНЦИОННАЯ РАДИОЛОГИЯ
РЕНТГЕНОВСКИЙ КОНТРОЛЬ
АНАТОМИЧЕСКИЕ СТРУКТУРЫ
ЗАРЕГИСТРИРОВАННЫЕ ИЗОБРАЖЕНИЯ
ТРЕХМЕРНОЕ АННОТИРОВАНИЕ
ОТСЛЕЖИВАЮЩИЙ КОНТРОЛЛЕР

Доп.точки доступа:
Vitanovski, Dime; Schaller, Christian; Han, Dieter; Daum, Volker; Hornegger, Joachim

20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.07-04Б2.161

   
    Полногеномное секвенирование и филогенетический анализ штамма Vibrio cholerae 01 Eltor Inaba N301 [Текст] : тез.[10 Съезд Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов "Итоги и перспективы обеспечения эпидемиологического благополучия населения Российской Федерации", Москва, 12-13 апр., 2012] / М. Л. Маркелов [и др.] // Инфекц. и иммунитет. - 2012. - Т. 2, N 1-2. - С. 297 . - ISSN 2220-7619
Аннотация: Объектом нашего исследования явился штамм Vibrio cholerae Ol Eltor Inaba N 30 выделенный из морской воды в районе г. Таганрог летом 2011. Протокол полногеномного секвенирования включал следующие этапы: секвенирование фрагментных библиотек на Roche 454 GS Junior system с использованием версии реактивов Titanium; сборка контигов de novo с помощью программного обеспечения Newbler 2,5, параметры сборки контигов были оптимизированы для получения высоких значений N50. Всего секвенировано 218 882 участка считывания (УО), при этом средняя длина УО составила 350 п.н. В результате сборки de novo собрано 124 контига со средним покрытием 33х, при этом 50% всех секвенированных нуклеотидов были включены в контиги длинной не менее 132 тыс. п.н. Общая длина всех контигов составила порядка 4 млн. п.н., GC состав - 47,6%. Автоматическое аннотирование контигов на основе алгоритма Glimmer3 выявило 3680 открытых рамок считывания. Исследуемый изолят 2011EL-0301 несет гибридный профаг СТХф локализованный в 1 хромосоме при этом профаг несет аллель сtx B классического типа, arstR - аллель типа Эль-Тор. Россия, ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: VIBRIO CHOLERAE (BACT.)
ШТАММ О1 ELTOR INABA N301
ГЕНОМ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
БИБЛИОТЕКИ
ФРАГМЕНТНЫЕ
КОНТИГИ
АННОТИРОВАНИЕ
БИОИНФОРМАТИКА
ПРОГРАММА GLIMMER3

Доп.точки доступа:
Маркелов, М.Л.; Кулешов, К.В.; Детков, В.Г.; Шипулин, Г.А.; Водпьянов, С.О.; Керманов, А.В.; Кругликов, В.Д.; Водопьянов, А.С.; Мазрухо, А.Б.; Писанов, Р.В.
 1-20    21-22 
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)