СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Карасев, В. А.$<.>)

Общее количество найденных документов : 6
Показаны документы с 1 по 6

Деп. 3676-В96

Карасев, В. А.
Матрица состояний связности четырехзвенного линейного графа, ее трансформация в топологический генетический код и применение для кодирования и декодирования надмолекулярной структуры белка [Текст] : деп. С.-Петербург. гос. электротехн. ун-т 19961217, N 3676-В96 / В. А. Карасев ; депонент С.-Петербург. гос. электротехн. ун-т (СПб). - Введ. с 19961217. - [Б. м. : б. и.], 1996. - 24 с. : ил. - 17 назв
Аннотация: С целью установления взаимосвязи между топологической структурой генетического кода (Карасев В. А., Сорокин С. Г. Деп.ВИНИТИ 10.07.96, No.2283-В96) и надмолекулярной структурой белка проведен анализ состояний связности 4-звенного линейного графа - аналога фрагмента белковой цепи. Показано, что состояние связности этого графа описывается в двоичной системе полуматрицей из шести элементов, а матрица из всех его 64 состояний путем замены пар значений на буквенные символы (00 - C, 10 - G, 01 - U, 11 - A) трансформируется в триплетный генетический код, что подтверждает связь последнего с кодированием структуры белков. Как следствие этого, n-звенный линейный граф, являющийся аналогом полипептидной цепи, может быть описан квазидиагональной матрицей истинных значений связности. В процессе непрерывного трансляционного сдвига ее состояния связности кодируются в виде полуматриц состояний 4-звенного графа, преобразуются в триплеты и в цепь из условных названий триплетов. Процесс декодирования может быть осуществлен в обратном порядке. Применимость данного подхода к белкам показана на фрагментах структуры рибонуклеазы A и конканавалина A. Предложенный метод кодирования и декодирования надмолекулярной структуры белка может быть использован как при создании новых белков, так и для предсказания структуры белков с известной полинуклеотидной последовательностью

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.09.99
Рубрики: БЕЛКИ
НАДМОЛЕКУЛЯРНАЯ СТРУКТУРА
ТОПОЛОГИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА
4-ЗВЕННЫЙ ЛИНЕЙНЫЙ ГРАФ
АНАЛИЗ СОСТОЯНИЙ СВЯЗНОСТИ
АНАЛОГ ФРАГМЕНТА БОКОВОЙ ЦЕПИ

Доп.точки доступа:
С.-Петербург. гос. электротехн. ун-т (СПб)
Свободных экз. нет

Деп. 1379-В97

Карасев, В. А.
Компьютерная программа PROTEIN 3D (Decoder of Protein Supramolecular Structure) и ее применение для декодирования надмолекулярной структуры белков [Текст] : деп. Петербург. гос. электротехн. ун-т 19970424, N 1379-В97 / В. А. Карасев, Е. Л. Демченко ; депонент Петербург. гос. электротехн. ун-т (СПб). - Введ. с 19970424. - [Б. м. : б. и.], 1997. - 37 с. : ил. - 37 назв
Аннотация: На основе предложенного ранее (Карасев В. А. // Деп. в ВИНИТИ 17.12.96. No.3676-B96.24 c.) алгоритма кодирования n-звенного линейного графа, пригодного для предсказания, надмолекулярной структуры белка, разработана компьютерная программа PROTEIN 3D, к-рая позволяет декодировать вторичную структуру белка в виде квазидиагональной матрицы, описывающей состояния связности его 'альфа'-углеродных атомов, и визуализировать структуру полипептидного остова с помощью n-звенного линейного графа и констант связности. Показано, что 'бета'-структуру, спираль 3[10], слабую и сильную 'альфа'-спираль, а также их сочетания можно визуализировать на основе комбинаций всего двух констант связности - 'РАДИКАЛ'2 и 'РАДИКАЛ'3. С помощью программы проведено декодирование фрагмента структуры белка конканавалина A, сопоставленное с экспериментальными данными. Россия, С.-Петербургский гос. электротехн. ун-т, С.-Петербург

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БЕЛОК
НАДМОЛЕКУЛЯРНАЯ СТРУКТУРА
ДЕКОДИРОВАНИЕ
КОМПЬЮТЕРНАЯ ПРОГРАММА PROTEIN 3D

Доп.точки доступа:
Демченко, Е.Л.; Петербург. гос. электротехн. ун-т (СПб)
Свободных экз. нет

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 99.09-04Б3.24

Карасев, В. А.
Как закодировать топологию биочипа? [Текст] / В. А. Карасев // Биотехнология. - 1998. - N 3. - С. 62-75 . - ISSN 0234-2758
Аннотация: Предложена модель структурного кода и алгоритм кодирования-декодирования топологии биочипов - устройств молекулярной электроники. Технологическим требованием к топологическому коду является его ориентация на линейные цепные полимеры, повторяющиеся звенья которых, а также боковые цепи - физические операторы обладают свойством связности. Для описания топологии цепных макромолекул использован их аналог - n-звенный цепной граф. В основу структурного кода положено описание в двоичной системе состояний связности 4-звенного цепного графа, состояния связности к-рого описываются в бинарной системе верхней треугольной матрицей (полуматрицей) из шести переменных. Матрица состояний связности этого графа состоит из 64 полуматриц. Используя соответствия пар переменных в полуматрице буквам кода, матрица преобразована в 4-буквенный триплетный топологический код. Предложена возможная структура соответствий триплетов кода физическим операторам связности. Алгоритм кодирования структуры n-звенного цепного графа использует логику дизъюнкции и состоит в разложении описания его структуры в виде квазидиагональной матрицы из трех переменных на ряд трансляционно сдвинутых полуматриц из шести переменных, перекодировании их в триплетный 4-буквенный код и в цепь операторов связности. Процесс декодирования осуществляется в обратном порядке. "Идеальная" модель топологического кода сопоставлена с реальным генетическим кодом. Предполагается возможность участия последнего в кодировании топологии 'альфа'-углеродного скелета белков. Россия, С.-Петербургский электротехн. ун-т, С.-Петербург, 197376. Библ. 18

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.07.07
Рубрики: УСТРОЙСТВА
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭЛЕКТРОНИКА
БИОЧИПЫ
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ КОМПЬЮТЕРЫ
КОНСТРУИРОВАНИЕ
ТОПОЛОГИЧЕСКОЕ КОДИРОВАНИЕ

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 00.03-04А3.7

Моделирование процессов молекулярного узнавания при создании наносистем биоорганической природы [Текст] / Е. Л. Демченко [и др.] // Инф. технол. - 1999. - N 7. - С. 6-10
Аннотация: С использованием теоретических представлений о системах сопряженных ионно-водородных связей, рассматриваемых в качестве основы построения надмолекулярных биоструктур и каналов переноса зарядов, осуществлен анализ возможного механизма процесса молекулярного узнавания. Создана компьютерная программа Protein 3D W95/98, предназначенная для анализа процессов восприятия и обработки информации бионическими микро- и наносистемами, с помощью к-рой проведен анализ процесса молекулярного узнавания "белок-лиганд" на примере фермента рибонуклеазы T[1]. Россия, Санкт-Петербургский гос. электротехн. ун-т, С.-Петербург. Библ. 11

ГРНТИ	34.55.15

ВИНИТИ 341.55.15.09
Рубрики: БЕЛОК
ЛИГАНД
МОЛЕКУЛЯРНОЕ УЗНАВАНИЕ
МЕХАНИЗМ
МОДЕЛИРОВАНИЕ
КОМПЬЮТЕРНАЯ ПРОГРАММА

Доп.точки доступа:
Демченко, Е.Л.; Карасев, В.А.; Лучинин, В.В.; Мальцев, П.П.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 10.09-04А3.114К

Карасев, В. А.
Введение в конструирование бионических наносистем [Текст] / В. А. Карасев, В. В. Лучинин. - М. : Физматлит, 2009. - 464 с. : ил. - ISBN 978-5-9221-1047-1
Аннотация: Целью монографии является ознакомление широкого круга читателей с базовыми понятиями, необходимыми для решения инженерных задач в области нанобиоэлектроники. Представлен системный подход, ориентированный на интеграцию физико-технического и молекулярно-биологического направлений в исследовании нанобиосистем. Описана концепция систем сопряженных ионно-водородных связей как основы построения биоорганических наноструктур и каналов переноса заряда, а также ее применение к построению структурно-функциональных моделей нанобиоструктур (катализаторов, мембран и наносенсоров). Изложена теория топологического кодирования цепных полимеров, в том числе представления о топологическом коде, системе физических операторов и молекулярной векторной машине. Предложены пространственные структуры генетического кода и канонического набора аминокислот, сформулированы принципы создания наборов базовых модулей для самоорганизующихся цепных полимеров. Обсуждаются возможности конструирования на этой основе сенсоров, полимерных катализаторов и других биотехнических наносистем, а также средств медицинской терапии. Для научных работников, аспирантов и инженеров, специализирующихся в области нанотехнологий и биомолекулярной инженерии, а также бакалавров и магистров, обучающихся по специальностям "Нанотехнологии и микросистемная техника", "Электроника и наноэлектроника", "Биомедицинская инженерия"

ГРНТИ	34.53.15

ВИНИТИ 341.53.15.02
Рубрики: НАНОБИОЭЛЕКТРОНИКА
НАНОБИОСИСТЕМЫ
МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОДХОД
ФИЗИКО-ТЕХНИЧЕСКИЙ ПОДХОД
ИНТЕГРАЦИЯ
КАТАЛИЗАТОРЫ
МЕМБРАНЫ
НАНОСЕНСОРЫ
КОНЦЕПЦИЯ СИСТЕМЫ СОПРЯЖЕННЫХ ИОННО-ВОДА
ТОПОЛОГИЧЕСКОЕ КОДИРОВАНИЕ РОДНЫХ СВЯЗЕЙ

Доп.точки доступа:
Лучинин, В.В.
Свободных экз. нет

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 89.06-04А2.264

Экологический анализ водной системы, находящейся под антропогенной нагрузкой, на модели Пясинского озера и реки Пясины [Текст] / А. А. Шарыгин [и др.] // Пробл. экол. Прибайкалья. - Иркутск, 1988. - Ч. 2. - С. 29
Аннотация: С целью анализа процессов самоочищения водоемов, подвергающихся антропогенной нагрузке, проведено изучение численности нефтеокисляющих и нефтерезистентных форм микроорганизмов в пробах грунта р. Пясины и ее притока р. Тарея. Существенное нефтяное загрязнение р. Пясины не выявлено, установлены последствия самоочищения от нефти, возможное накопление загрязняющих в-в в грунте. Обсуждается вклад микробиол. составляющей в полное выведение нефтепродуктов из воды в условиях сев. широт. СССР, Ленинградский техн. ин-т.

ГРНТИ	34.35.33

ВИНИТИ 341.35.33.67.11.41
Рубрики: САМООЧИЩЕНИЕ ВОД
НЕФТЕОКИСЛЯЮЩИЕ МИКРООРГАНИЗМЫ
РЕКА ПЯСИНА
ПЯСИНСКОЕ ОЗЕРО

Доп.точки доступа:
Шарыгин, А.А.; Карасев, В.А.; Пацей, С.В.; Гинак, А.И.; Левченко, А.Б.; Антоненко, Л.Д.; Родина, Л.В.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска