СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Поисковый запрос: (<.>S=МИКРОПОСТРОЕНИЯ<.>)

Общее количество найденных документов : 1

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.03-04Б2.88

Fingerprinting of prokaryotic 16S rRNA genes using oligodeoxyribonucleotide microarrays and virtual hybridization [Text] / Miguel Angel Reyes-Lopez [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 2. - P779-789 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Фингерпринтирование прокариотических генов 16S рРНК с использованием микропостроений и виртуальной гибридизации
Аннотация: Олигонуклеотидная микросистема гибридизации для дифференциации различных видов микробов была разработана и проверена. Исследовали 7 видов микробов, включая один штамм Bacillus и шесть штаммов Pseudomonas. Последовательности ДНК рядом с 5'-концом генов рРНК 16S были "выравнены", что привело к обнаружению 2-х соприкасающихся районов с высокой вариабельностью, фланкированные высоко консервативными последовательностями. Консервативные последовательности были использованы для конструирования 88-ми 9-ти мерных гибридных проб, которые наносили на стеклянные пластинки. Односпиральные флюоресцентно меченные продукты ПЦР гибридизовали в микросистеме при 15{'ГРАДУС'}C. Результаты экспериментов сравнили с значениями 'ДЕЛЬТА'G{0} для парных и непарных дуплексов, возможных между синтетическими пробами и последовательностью-мишенью 16S семи проверенных видов. Для расчетов использовали программу "виртуальной гибридизации". Хотя наблюдаемые образцы гибридизации отличались значительно от образцов, определенных исключительно на основании безупречных пар последовательностей, уникальные образцы гибридизации были получены для каждого вида, включая близкородственные виды Pseudomonas. Наблюдали корреляцию между интенсивностью сигналов гибридизации и подсчитанными значениями 'ДЕЛЬТА'G{0}. Делают вывод, что как идеальные, так и ошибочные пары могут вносить вклад в идентификацию микробов с помощью гибридизационного фингерпринтирования. США, Life Sci. Div., Oak Ridge Nat., Lab., Building 4500-S, MS 6123, Bethel Valley Road, PO Box 2008, Oak Ridge, TN 37831. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ РИБОСОМНОЙ РНК 16S
ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ
МИКРОПОСТРОЕНИЯ
ВИРТУАЛЬНАЯ ГИБРИДИЗАЦИЯ
ГЕНОМ
РИБОТИПИРОВАНИЕ
МЕТОД
РАЗРАБОТКА
PSEUDOMONAS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Reyes-Lopez, Miguel Angel; Mendez-Tenorio, Alfonso; Maldonado-Rodriguez, Rogelio; Doktycz, Mitchel J.; Fleming, James T.; Beattie, Kenneth L.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска