СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ДАННЫЕ CHIP-SEQ<.>)

Общее количество найденных документов : 2
Показаны документы с 1 по 2

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 14.11-04М1.23

Mammana, Alessandro.
Inferring nucleosome positions with their histone mark annotation from ChIP data [Text] / Alessandro Mammana, Martin Vingron, Ho-Ryun Chung // Bioinformatics. - 2013. - Vol. 29, N 20. - P2547-2554 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Соотнесение позиций нуклеосом с аннотацией их гистоновых меток из ChIP данных
Аннотация: Разработали алгоритм NucHunter (I) к-рый в определении позиций нуклеосом (NS) использует данные ChIP-seq для различных модификаций гистонов (Н). I картирует каждую NS в зависимости от паттерна Н-модификаций, а особенности NS-кластерирования могут быть скоррелированы с функциями хроматина типа зон начала транскрипции/энхансерами либо последующими (в транскрипции) процессами, напр. polII-элонгацией. Обсуждают использование I в качестве быстрого и достаточно надежного приема в предсказании NS-позиций, ассоциированных с различными состояниями хроматина, из панелей Н-модификаций ChIP-seq экспериментов. Германия, Epigenomics, M. Planck Inst. Mol. Genet., D-14195 Berlin. Библ. 21

ГРНТИ	34.19.17

ВИНИТИ 341.19.17.09.07
Рубрики: НУКЛЕОСОМЫ
ПОЛОЖЕНИЕ
КАРТИРОВАНИЕ
БИОИНФОРМАТИКА
АЛОГОРИТМ NUCHUNTER
ДАННЫЕ CHIP-SEQ

Доп.точки доступа:
Vingron, Martin; Chung, Ho-Ryun

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 15.05-04М1.53

Long non-coding RNA identification over mouse brain development by integrative modeling of chromatin and genomic features [Text] / J. Lv [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2013. - Vol. 41, N 22. - P10044-10061 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Идентификация длинных некодирующих РНК в развитии мозга мыши посредством объединяющего моделирования особенностей хроматина и генома
Аннотация: В анализе возможностей конструирования некодирующих регуляторных сетей на основе in silico предсказаний lncРНК (I) установили, что точность I-предсказаний с использованием данных ChIP-seq существенно улучшается за счет включения в рассмотрение модификаций хроматина. Последние оценены в ходе дифференцировки эмбриональных стволовых клеток (ESC) мыши вплоть до зрелого мозжечка. В анализ включили Н3К9me 3-, Н3К27ас- и Н3К4me1-метки, а также данные для ORF и нек-рых повторяющихся элементов ESC-генома мыши. В рамках подобной объединяющей модели получили набор потенциальных молекул I, а экспериментально и анализом представленности мишеней в генной онтологии подтвердили регуляторную роль I для соседствующих генных локусов. Установили также возможность моделирования времезависимой специфичности экспрессии I при учете данных для хроматина тех же онтостадий. Китай, Sch. Life Sci., Inst. Technol, Harbin 150001. Библ. 85

ГРНТИ	34.19.17

ВИНИТИ 341.19.17.09.07
Рубрики: РАЗВИТИЕ
ГОЛОВНОЙ МОЗГ
РНК
ДЛИННЫЕ НЕКОДИРУЮЩИЕ
АНАЛИЗ IN SILICO
ДАННЫЕ CHIP-SEQ
ХРОМАТИН
ОБЪЕДИНЯЮЩЕЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
МЫШИ

Доп.точки доступа:
Lv, J.; Liu, H.; Huang, Z.; Su, J.; He, H.; Xiu, Y.; Zhang, Y.; Wu, Q.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска