СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Harayama, Shigeaki$<.>)

Общее количество найденных документов : 63
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-63

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 10.04-04Б3.137

Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov., a thermophilic, nitrate-reducing bacterium isolated from a terrestrial hot spring in Japan [Text] / Takao Iino [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2008. - Vol. 58, N 7. - P1675-1679 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov., термофильная, нитратредуцирующая бактерия, выделенная из наземного горячего источника в Японии
Аннотация: Из горячего водного источника, Юмата, Нагано, Япония, выделили умеренно термофильную, нитратредуцирующую бактерию, штамм Yu37-1{T}. Клетки изолята строго анаэр., грамотрицательные, неспорообразующие, подвижные за счет единственного полярного жгутика, вибриоподобной формы и 1,4-2,0 мкм в длину. Т-ра и рН для оптимального роста были 55'ГРАДУС'C и рН 7,0-7,5, соответственно. Изолят рос лучше всего на основной среде без добавления NaCl. Приведены хемотаксономические признаки. Филогенетический анализ, основанный на последовательности 16S рРНК, показал, что изолят может быть отнесен к сем. Deferribacteraceae, и что его ближайшие соседи - члены пяти родов сем. Deferribacteraceae, а именно, Deferribacter, Denitrovibrio, Flexistipes, Geovibrio и Mucispirillum, со сходствами всего 83,2-86,2%. Т-ра роста и диапазон солености штамма отличались от таковых филогенетически родственных организмов. На основании фенотипических признаков и филогенетического положения предлагаются новый род и вид, Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov. Типовой штамм Yu37-1{T}

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.23
Рубрики: CALDITERRIVIBRIO NITROREDUCENS GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ГОРЯЧЕГО ВОДНОГО ИСТОЧНИКА
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ РОДЫ
НОВЫЕ ВИДЫ

Доп.точки доступа:
Iino, Takao; Nakagawa, Tatsunori; Mori, Koji; Harayama, Shigeaki; Suzuki, Ken-ichiro

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.04-04Б2.49

Iino, Takao.
Lacticigenium naphtae gen. nov., sp. nov., a halotolerant and motile lactic acid bacterium isolated from crude oil [Text] / Takao Iino, Ken-ichiro Suzuki, Shigeaki Harayama // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2009. - Vol. 59, N 4. - P775-780
Перевод заглавия: Lacticigenium naphtae gen. nov., sp. nov., галотолерантная и подвижная молочнокислая бактерия, выделенная из сырой нефти
Аннотация: Из неочищенной нефти, отобранной из скважины в Akita, Япония, содержащей нефть и воду, выделили новую молочнокислую бактерию, штамм MIC1-18. Клетки штамма были факультативно анаэр., мезофильные, нейтрофильные, грамотрицательные, неспорообразующие, подвижные благодаря перитрихиальному жгутикованию, овальные палочки 1,8-2,5 мкм в длину. Оптимальный рост был при 30'ГРАДУС'C, рН 7,0 и 3% NaCl. Приведены физиологические и хемотаксономические признаки, Филогенетический анализ, основанный на последовательности 16S рРНК, показал, что изолят относится к молочнокислым бактериям (с низким содержанием Г+Ц грамотрицательным). Ближайшим соседом изолята был Atopococcus tabaci CCUG48253, с 90,0% сходства последовательности. На основании полученных данных предлагается новый род и вид, Lacticigenium naphtae gen. nov. sp. nov. для выделенного изолята. Япония, NITE Biol. Resourse Center, Nat. Inst. of Technology and Evaluation, 2-5-8, Kisazaru, Chiba 292-0818. E-mail: iinotakao@nite.go.jp

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: LACTICIGENIUM NAPHTAE GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ СЫРОЙ НЕФТИ
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ РОДЫ
НОВЫЕ ВИДЫ

Доп.точки доступа:
Suzuki, Ken-ichiro; Harayama, Shigeaki

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.04-04Б2.45

Iamia majanohamensis gen. nov., sp. nov., an actinobacterium isolated from sea cucumber Holothuria edulis, and proposal of Iamiaceae fam. nov. [Text] / Midori Kurahashi [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2009. - Vol. 59, N 4. - P869-873
Перевод заглавия: Iamia majanohamensis gen. nov., sp. nov., актинобактерия, выделенная из голотурии Holothuria edulis, и предложение Iamiaceae fam. nov
Аннотация: Из кишечного эпидермиса голотурии, взятой из морской воды на расстоянии от побережья Японии, выделили новый, грамположительный бактериальный штамм, F12. В соответствии с анализом последовательности 16S рРНК этот штамм представляет новую, рано отделившуюся линию родства в пределах класса Actinobacteria и кластеризуется с некультивируемыми бактериями и Acidimicrobium ferrooxidans. В сравнении с известными опубликованными названиями, наивысшее сходство последовательности (89,8%) было с Acid. ferrooxidans DSM 10331. Филогенетические анализы показали, что штамм представляет отчетливую филогенетическую линию, близкородственную р. Acidimicrobium. Приведены хемотаксономические признаки. Исходя из полученных данных, для изолята предлагается название Iamia majanohamensis gen. nov., sp. nov., с типовым штаммом F12. Также предлагается название Iamiaceae fam. nov. для отдельной филетической линии, представленной р. Iamia. Япония, Inst. of Molecular and Cellular Biosci., The Univ. of Tokyo, Yayoi 1-1-1, Tokyo 113-0032. E-mail: kuramido@iam.u-tokyo.ac.jp

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: IAMIA MAJANOHAMENSIS GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ КИШЕЧНИКА ГОЛОТУРИИ
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ РОДЫ
НОВЫЕ ВИДЫ
IAMIACEAE FAM. NOV. (BACT.)
НОВЫЕ СЕМЕЙСТВА

Доп.точки доступа:
Kurahashi, Midori; Fukunaga, Yukiyo; Sakiayama, Yayoi; Harayama, Shigeaki; Yokota, Akira

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.05-04Б2.40

Acanthopleuribacter pedis gen. nov., sp. nov., a marine bacterium isolated from a chiton, and description of Acanthopleuribacteraceae fam. nov., Acanthopleuribacterales ord. nov., Holophagaceae fam. nov., Holophagales ord. nov. and Holophagae classis nov. in the phylum 'Acidobacteria' [Text] / Yukiyo Fukunaga [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2008. - Vol. 58, N 11. - P2597-2601 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Acanthopleuribacter pedis gen. nov., sp. nov., морская бактерия, выделенная с хитона и описание Acanthopleuribacteraceae fam. nov., Acanthopleuribacterales ord. nov., Holophagaceae fam. nov., Holophagales ord. nov. и Holophagae classis nov. в филе `Acidobacteria'
Аннотация: Штамм FYK2218 выделен с панцирного моллюска Acanthopleura japonica на берегу полуострова Босо в Японии. Согласно филогенетическому анализу последовательностей 16S-рРНК штамм был отнесен к филе `Acidobacteria'. Штамм был наиболее близок к Holophaga foetida TMBS4 и Geothrix fermentans H-5 в подразделе 8 ацидобактерий. Штамм был представлен мезофильными, строго аэр. подвижными грамотрицательными палочками. Содержание Г+Ц составляло 56,7 мол% с главными изопреновыми хинонами MK-6 и MK-7 и характерным набором жирных к-т. Штамм классифицируется как Acanthopleuribacter pedis gen. nov., sp. nov. в составе новых семейства, порядка и класса. Описано также новое сем. Holopahaceae. Япония, Inst. of Molec. and Cellular Bioscis., Univ. of Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0032 (E-mail: fukunaga-yukiyo@nite.go.jp)

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: ACANTHOPLEURIBACTER PEDIS GEN. NOV. SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ПАНЦИРНОГО МОЛЛЮСКА
НОВЫЕ РОДЫ
НОВЫЕ ВИДЫ
HOLOPHAGACEAE FAM. NOV. (BACT.)
НОВЫЕ СЕМЕЙСТВА
ОПИСАНИЕ

Доп.точки доступа:
Fukunaga, Yukiyo; Kurahashi, Midori; Yanagi, kensuke; Yokota, Akira; Harayama, Shigeaki

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.08-04Б2.4

Khan, Shams Tabrez.
Paraferrimonas sedimenticola gen. nov., sp. nov., a marine bacterium of the family Ferrimonadaceae [Text] / Shams Tabrez Khan, Shigeaki Harayama // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2007. - Vol. 57, N 7. - P1493-1498 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Paraferrimonas sedimenticola gen. nov., sp. nov., морская бактерия семейства Ferrimonadaceae
Аннотация: Из образцов морских отложений, собранных на побережье о-ва Окинава, Япония, выделили 3 штамма (Mok-106{T}, Mok-142 и Mok-143). На основании сходств последовательности 16S рРНК изоляты были присоединены с сем. Ferrimonadaceae; Shewanella denitrificans и Ferrimonas balearica были ближайшими родственниками, имея сходства последовательностей 93,7 и 93,0%, соответственно. Новые изоляты разделили высокие уровни сходства последовательности 16S рРНК друг с другом (98,7-99,3%), а рез-ты ДНК-ДНК гибридизации показали, что три изолята принадлежат к одному и тому же виду. Клетки были палочковидные, подвижные за счет единственного полярного жгутика и образовывали колонии, образующие розовый пигмент в течение 6 дней инкубации при 25'ГРАДУС'C. Изоляты росли в присутствии 0,5-4,0% (в/об) NaCl и при 15-40'ГРАДУС'С. Приводятся хемотаксономические признаки. Филогенетические и фенотипические показатели этих изолятов означали, что они принадлежат к новому роду и виду сем. Ferrimonadaceae, для к-рого предложено название Paraferrimonas sedimenticola gen. nov., sp. nov. Типовой штамм Mok-106{T}. Япония, Biol. Resource Center (NBRC), Nat. Inst. of Technology and Evaluation (NITE), K sarazu, Chiba 292-0818. E-mail: shams-tabrex-khan@nite.go.jp

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: PARAFERRIMONAS SEDIMENTICOLA GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ МОРСКИХ ОСАДКОВ
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ РОДЫ
НОВЫЕ ВИДЫ

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki

РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 10.05-04Б3.163

Nocardia amamiensis sp. nov., isolated from a sugar-cane field in Japan [Text] / Hideki Yamamura [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2007. - Vol. 57, N 7. - P1599-1602 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Nocardia amamiensis sp. nov., выделенная из поля под сахарным тростником в Японии
Аннотация: Из почвы поля под сахарным тростником на о-ве Амами, Япония, выделили актиномицет, штамм TT00-78{T}, к-рый был изучен таксономически. Хемотаксономические и морфологические признаки четко показали, что штамм принадлежит р. Nocardia. Анализ последовательности 16S рРНК показал, что изолят близкородственен типовым штаммам Nocardia pneumoniae (98,6%), N. araoensis (98,1%), N. arthritidis (97,9%) и N. beijingensis (97,7%). Однако, рез-ты ДНК-ДНК гибридизации и физиологические и биохимические признаки показали, что изолят можно было дифференцировать от его ближайших филогенетических родственников и генотипически и фенотипически. Следовательно, этот штамм представляет новый вид р. Nocardia, для к-рого предложено название Nocardia amamiensis sp. nov., типовой штамм TT00-78{T}. Япония, NITE Biol, Resource Center, Nat. Inst. of Technology and Evaluation, Kisarazu, Chiba 292-0818. E-mail: yamamura-hideki@nite.go.jp

ГРНТИ	68.03.07

ВИНИТИ 681.03.07.02
Рубрики: NOCARDIA AMAMIENSIS SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ПОЧВЫ
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ ВИДЫ

Доп.точки доступа:
Yamamura, Hideki; Tamura, Tomohiko; Sakiyama, Yayoi; Harayama, Shigeaki

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 10.05-04Б3.148

Iino, Takao.
Lacticigenium naphtae gen. nov., sp. nov., a halotolerant and motile lactic acid bacterium isolated from crude oil [Text] / Takao Iino, Ken-ichiro Suzuki, Shigeaki Harayama // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2009. - Vol. 59, N 4. - P775-780
Перевод заглавия: Lacticigenium naphtae gen. nov., sp. nov., галотолерантная и подвижная молочнокислая бактерия, выделенная из сырой нефти
Аннотация: Из неочищенной нефти, отобранной из скважины в Akita, Япония, содержащей нефть и воду, выделили новую молочнокислую бактерию, штамм MIC1-18. Клетки штамма были факультативно анаэр., мезофильные, нейтрофильные, грамотрицательные, неспорообразующие, подвижные благодаря перитрихиальному жгутикованию, овальные палочки 1,8-2,5 мкм в длину. Оптимальный рост был при 30'ГРАДУС'C, рН 7,0 и 3% NaCl. Приведены физиологические и хемотаксономические признаки, Филогенетический анализ, основанный на последовательности 16S рРНК, показал, что изолят относится к молочнокислым бактериям (с низким содержанием Г+Ц грамотрицательным). Ближайшим соседом изолята был Atopococcus tabaci CCUG48253, с 90,0% сходства последовательности. На основании полученных данных предлагается новый род и вид, Lacticigenium naphtae gen. nov. sp. nov. для выделенного изолята. Япония, NITE Biol. Resourse Center, Nat. Inst. of Technology and Evaluation, 2-5-8, Kisazaru, Chiba 292-0818. E-mail: iinotakao@nite.go.jp

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.23
Рубрики: LACTICIGENIUM NAPHTAE GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ СЫРОЙ НЕФТИ
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ РОДЫ
НОВЫЕ ВИДЫ

Доп.точки доступа:
Suzuki, Ken-ichiro; Harayama, Shigeaki

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 10.03-04Б3.23

Oscillibacter valericigenes gen. nov., sp. nov., a valerate-producing anaerobic bacterium isolated from the alimentary canal of a Japanese corbicula clam [Text] / Takao Iino [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2007. - Vol. 57, N 8. - P1840-1845 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Oscillibacter valericigenes gen. nov., sp. nov., анаэробная бактерия, образующая валерат, выделенная из пищеварительного тракта японского двустворчатого моллюска
Аннотация: Выделили мезофильную, строго анаэр. бактерию, штамм Sjm18-20{T}. Клетки изолята грамотрицательные, неспорообразующие, от прямых до слабо искривленных палочек 2,5-6,0 мкм в длину, подвижные за счет колебательных движений с помощью перитрихиального жгутикования. Клетки вытягивались до 30 мкм после длительного культивирования. Оптимальный рост наблюдался при 30'ГРАДУС'C и рН 6,0-6,5. Рост происходил при конц-ии NaCl 4,0% (в/об). Приводится хемотаксономическая характеристика изолята. Филогенетический анализ, основанный на последовательности 16S рРНК, показал, что изолят мог быть помещен в клостридиальный кластер IV грамположительных бактерий с низким содержанием Г+", и что ближайший сосед этого организма (92,6-92,9% сходства) не культивируемая до сих пор, предположительно, Oscillospira guilliermondii. Ближайшими культивируемыми соседями изолята были Clostridium orbiscindens DSM 6740{T} и Cl. viride T2-7{T} со сходствами последовательностей 91,3 и 89,1%, соответственно. На основании фенотипических признаков и филогенетического положения предполагается, что изолят представляет новый вид нового рода, Oscillibacter valericigenes gen. nov., sp. nov. с типовым штаммом Sjm18-20{T}. Япония, NITE Biol. Resource Center (NBRC), Nat. Inst. of Technology and Evaluation (NITE), Kisarazu, Chiba 292-0818. E-mail: iino-takao@nite.go.jp

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: OSCILLIBACTER VALERICIGENES GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ПИЩЕВАРИТЕЛЬНОГО ТРАКТА МОЛЛЮСКА
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ РОДЫ
НОВЫЕ ВИДЫ

Доп.точки доступа:
Iino, Takao; Mori, Koji; Tanaka, Kenji; Suzuki, Ken-ichiro; Harayama, Shigeaki

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.12-04Б2.94

Oscillibacter valericigenes gen. nov., sp. nov., a valerate-producing anaerobic bacterium isolated from the alimentary canal of a Japanese corbicula clam [Text] / Takao Iino [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2007. - Vol. 57, N 8. - P1840-1845 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Oscillibacter valericigenes gen. nov., sp. nov., анаэробная бактерия, образующая валерат, выделенная из пищеварительного тракта японского двустворчатого моллюска
Аннотация: Выделили мезофильную, строго анаэр. бактерию, штамм Sjm18-20{T}. Клетки изолята грамотрицательные, неспорообразующие, от прямых до слабо искривленных палочек 2,5-6,0 мкм в длину, подвижные за счет колебательных движений с помощью перитрихиального жгутикования. Клетки вытягивались до 30 мкм после длительного культивирования. Оптимальный рост наблюдался при 30'ГРАДУС'C и рН 6,0-6,5. Рост происходил при конц-ии NaCl 4,0% (в/об). Приводится хемотаксономическая характеристика изолята. Филогенетический анализ, основанный на последовательности 16S рРНК, показал, что изолят мог быть помещен в клостридиальный кластер IV грамположительных бактерий с низким содержанием Г+", и что ближайший сосед этого организма (92,6-92,9% сходства) не культивируемая до сих пор, предположительно, Oscillospira guilliermondii. Ближайшими культивируемыми соседями изолята были Clostridium orbiscindens DSM 6740{T} и Cl. viride T2-7{T} со сходствами последовательностей 91,3 и 89,1%, соответственно. На основании фенотипических признаков и филогенетического положения предполагается, что изолят представляет новый вид нового рода, Oscillibacter valericigenes gen. nov., sp. nov. с типовым штаммом Sjm18-20{T}. Япония, NITE Biol. Resource Center (NBRC), Nat. Inst. of Technology and Evaluation (NITE), Kisarazu, Chiba 292-0818. E-mail: iino-takao@nite.go.jp

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: OSCILLIBACTER VALERICIGENES GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ПИЩЕВАРИТЕЛЬНОГО ТРАКТА МОЛЛЮСКА
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ РОДЫ
НОВЫЕ ВИДЫ

Доп.точки доступа:
Iino, Takao; Mori, Koji; Tanaka, Kenji; Suzuki, Ken-ichiro; Harayama, Shigeaki

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.12-04Б2.24

Khan, Shams Tabrez.
Sediminitomix flava gen. nov., sp. nov., of the phylum Bacteroidetes, isolated from marine sediment [Text] / Shams Tabrez Khan, Yasuyoshi Nakagawa, Shigeaki Harayama // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2007. - Vol. 57, N 8. - P1689-1693 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Sediminitomix flava gen. nov., sp. nov., филы Bacteroidetes, выделенный из морских отложений
Аннотация: Из образца морских отложений, взятого на о-ве Окинава, Япония, выделили новую бактерию, обозначенную Mok-1-85{T}. Клетки штамма грамотрицательные, каталазо- и оксидазо-положительные и неподвижные. На древе близкой связи, основанном на последовательностях 16S рРНК, новый штамм кластеризовался с р. Flammeovirga, членом сем. "Flammeovirgaceae". Новый изолят обнаружил низкие сходства ('

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: SEDIMINITOMIX FLAVA GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ МОРСКИХ ОТЛОЖЕНИЙ
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ РОДЫ
НОВЫЕ ВИДЫ

Доп.точки доступа:
Nakagawa, Yasuyoshi; Harayama, Shigeaki

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.08-04Б2.13

Sneathiella glossodoripedis sp. nov., a marine alphaproteobacterium isolated from the nudibranch Glossodoris cincta, and proposal of Sneathiellales ord. nov. and Sneathiellaceae fam. nov. [Text] / Midori Kurahashi [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2008. - Vol. 58, N 3. - P548-552
Перевод заглавия: Sneathiella glossodoripedis sp. nov., морская альфа-протеобактерия выделенная из Glossodoris cincta, и предложение Sneathiellales ord. nov. и Sneathiellaceae fam. nov
Аннотация: Из Gl. cincta (моллюски), собранных в морской воде вдали от побережья Японии на глубине 4 м, выделили новую морскую бактерию, обозначенную MKT133{T}. Эта бактерия была грамотрицательной, подвижной, мезофильной и строго аэр., с небольшими палочковидными клетками. Колонии штамма после 4-5 дней инкубации на морском агаре 2216 при 30'ГРАДУС'C были 1 мм в диам. Приводится хемотаксономическая характеристика изолята. Анализ последовательности 16S рРНК показал, что изолят имел наивысшее сходство последовательностей с Sneathiella ehinensis, 97,2% сходства с типовым штаммом. Филогенетический анализ также показал, что этот клад представляет отдельную линию родства и формирует раннее ответвление с 90% сходства последовательностей 16S рРНК с членами 8 известных порядков в пределах альфа-протеобактерий. Показано достаточно отличий, чтобы отделить этот штамм от Sn. chinensis. Предлагается название Sneathiella glossodoripedis sp. nov. с типовым штаммом MKT133{T}. Для обособленной филетической линии, представленной р. Sneathiella, предлагаются новый пор. Sneathiellales ord. nov. и сем. Sneathiellaceae fam. nov. Япония, Inst. of Molecular and Cellular Biosci., The Univ. of Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0032. E-mail: kuramido@iam.u-toryo.ac.jp

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03 + 341.27.23.17
Рубрики: SNEATHIELLA GLOSSODORIPEDIS SP. NOV. (BACT.)
МОРСКАЯ АЛЬФА-ПРОТЕОБАКТЕРИЯ
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ МОРСКОГО МОЛЛЮСКА
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ ВИДЫ
SNEATHIELLALES ORD. NOV. (BACT.)
SNEATHIELLACEAE FAM. NOV. (BACT.)
ПРЕДЛОЖЕНИЕ НОВОГО ПОРЯДКА
ПРЕДЛОЖЕНИЕ НОВОГО СЕМЕЙСТВА

Доп.точки доступа:
Kurahashi, Midori; Fukunaga, Yukiyo; Harayama, Shigeaki; Yokota, Akira

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.01-04Б2.31

Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov., a thermophilic, nitrate-reducing bacterium isolated from a terrestrial hot spring in Japan [Text] / Takao Iino [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2008. - Vol. 58, N 7. - P1675-1679 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov., термофильная, нитратредуцирующая бактерия, выделенная из наземного горячего источника в Японии
Аннотация: Из горячего водного источника, Юмата, Нагано, Япония, выделили умеренно термофильную, нитратредуцирующую бактерию, штамм Yu37-1{T}. Клетки изолята строго анаэр., грамотрицательные, неспорообразующие, подвижные за счет единственного полярного жгутика, вибриоподобной формы и 1,4-2,0 мкм в длину. Т-ра и рН для оптимального роста были 55'ГРАДУС'C и рН 7,0-7,5, соответственно. Изолят рос лучше всего на основной среде без добавления NaCl. Приведены хемотаксономические признаки. Филогенетический анализ, основанный на последовательности 16S рРНК, показал, что изолят может быть отнесен к сем. Deferribacteraceae, и что его ближайшие соседи - члены пяти родов сем. Deferribacteraceae, а именно, Deferribacter, Denitrovibrio, Flexistipes, Geovibrio и Mucispirillum, со сходствами всего 83,2-86,2%. Т-ра роста и диапазон солености штамма отличались от таковых филогенетически родственных организмов. На основании фенотипических признаков и филогенетического положения предлагаются новый род и вид, Calditerrivibrio nitroreducens gen. nov., sp. nov. Типовой штамм Yu37-1{T}

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: CALDITERRIVIBRIO NITROREDUCENS GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ГОРЯЧЕГО ВОДНОГО ИСТОЧНИКА
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ РОДЫ
НОВЫЕ ВИДЫ

Доп.точки доступа:
Iino, Takao; Nakagawa, Tatsunori; Mori, Koji; Harayama, Shigeaki; Suzuki, Ken-ichiro

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.03-04Б2.48

Nocardia amamiensis sp. nov., isolated from a sugar-cane field in Japan [Text] / Hideki Yamamura [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2007. - Vol. 57, N 7. - P1599-1602 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Nocardia amamiensis sp. nov., выделенная из поля под сахарным тростником в Японии
Аннотация: Из почвы поля под сахарным тростником на о-ве Амами, Япония, выделили актиномицет, штамм TT00-78{T}, к-рый был изучен таксономически. Хемотаксономические и морфологические признаки четко показали, что штамм принадлежит р. Nocardia. Анализ последовательности 16S рРНК показал, что изолят близкородственен типовым штаммам Nocardia pneumoniae (98,6%), N. araoensis (98,1%), N. arthritidis (97,9%) и N. beijingensis (97,7%). Однако, рез-ты ДНК-ДНК гибридизации и физиологические и биохимические признаки показали, что изолят можно было дифференцировать от его ближайших филогенетических родственников и генотипически и фенотипически. Следовательно, этот штамм представляет новый вид р. Nocardia, для к-рого предложено название Nocardia amamiensis sp. nov., типовой штамм TT00-78{T}. Япония, NITE Biol, Resource Center, Nat. Inst. of Technology and Evaluation, Kisarazu, Chiba 292-0818. E-mail: yamamura-hideki@nite.go.jp

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: NOCARDIA AMAMIENSIS SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ПОЧВЫ
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ ВИДЫ

Доп.точки доступа:
Yamamura, Hideki; Tamura, Tomohiko; Sakiyama, Yayoi; Harayama, Shigeaki

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.02-04Б2.86

Khan, Shams Tabrez.
Paraferrimonas sedimenticola gen. nov., sp. nov., a marine bacterium of the family Ferrimonadaceae [Text] / Shams Tabrez Khan, Shigeaki Harayama // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2007. - Vol. 57, N 7. - P1493-1498 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Paraferrimonas sedimenticola gen. nov., sp. nov., морская бактерия семейства Ferrimonadaceae
Аннотация: Из образцов морских отложений, собранных на побережье о-ва Окинава, Япония, выделили 3 штамма (Mok-106{T}, Mok-142 и Mok-143). На основании сходств последовательности 16S рРНК изоляты были присоединены с сем. Ferrimonadaceae; Shewanella denitrificans и Ferrimonas balearica были ближайшими родственниками, имея сходства последовательностей 93,7 и 93,0%, соответственно. Новые изоляты разделили высокие уровни сходства последовательности 16S рРНК друг с другом (98,7-99,3%), а рез-ты ДНК-ДНК гибридизации показали, что три изолята принадлежат к одному и тому же виду. Клетки были палочковидные, подвижные за счет единственного полярного жгутика и образовывали колонии, образующие розовый пигмент в течение 6 дней инкубации при 25'ГРАДУС'C. Изоляты росли в присутствии 0,5-4,0% (в/об) NaCl и при 15-40'ГРАДУС'С. Приводятся хемотаксономические признаки. Филогенетические и фенотипические показатели этих изолятов означали, что они принадлежат к новому роду и виду сем. Ferrimonadaceae, для к-рого предложено название Paraferrimonas sedimenticola gen. nov., sp. nov. Типовой штамм Mok-106{T}. Япония, Biol. Resource Center (NBRC), Nat. Inst. of Technology and Evaluation (NITE), K sarazu, Chiba 292-0818. E-mail: shams-tabrex-khan@nite.go.jp

ГРНТИ	34.27.15

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.01-04Б2.32

Khan, Shams Tabrez.
Fulvibacter tottoriensis gen. nov., sp. nov., a member of the family Flavobacteriaceae isolated from marine sediment [Text] / Shams Tabrez Khan, Yasuyoshi Nakagawa, Shigeaki Harayama // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2008. - Vol. 58, N 7. - P1670-1674 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Fulvibacter tottoriensis gen. nov., sp. nov., член семейства Flavobacteriaceae, выделенный из морских отложений
Аннотация: Из образца морских отложений, собранных в Тоттори, на побережье Японского моря, выделили новую бактерию, MTT-39{T}. Клетки были грамотрицательные, палочковидные и неподвижные. Бактерия образовывала желтовато-коричневые колонии на морском агаре 2216. Хотя последовательность 16S рРНК изолята классифицировала его как члена сем. Flavobacteriaceae, максимальное сходство по-последовательности показалось только 91,5% (с Kordia algicida OT-1{T}). В древе максимального правдоподобия, основанного на последовательностях 16S рРНК, новая бактерия кластеризовалась с типовыми штаммами Kordia algicida, Lutibacter litoralis, Tenacibaculum maritimum и Polaribacter filamentus. Приведены хемотаксономические признаки. На основании отчетливых фенотипических св-в и филогенетической дистанции между этим морским изолятом и др. известными таксонами установлено, что изолят представляет новый род и вид сем. Flavobacteriaceae, для к-рого предложено название Fulvibacter tottoriensis gen. nov., sp. nov. Типовой штамм MTT-39{T}. Япония, Biological Resource Center (NRBC), Nat. Inst. of Technology and Evaluation (NITE), 2-5-8 Kazusakamatari, Kisarazu, Chiba 202-0818. E-mail: stkhan@nbrc.nite.go.j

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: FULVIBACTER TOTTORIENSIS GEN. NOV., SP. NOV. (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ МОРСКИХ ОТЛОЖЕНИЙ
СИСТЕМАТИКА
НОВЫЕ РОДЫ
НОВЫЕ ВИДЫ

Доп.точки доступа:
Nakagawa, Yasuyoshi; Harayama, Shigeaki

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 10.09-04Б3.66

Physicochemical characters of a tyrosinase inhibitor produced by Streptomyces roseolilacinus NBRC 12815 [Text] / Takuji Nakashima [et al.] // Biol. and Pharm. Bull. - 2009. - Vol. 32, N 5. - P832-836 . - ISSN 0918-6158
Перевод заглавия: Физико-химические характеристики ингибитора тирозиназы продуцируемого Streptomyces roseolilacinum NBRc 12815
Аннотация: Определены метаболиты Streptomyces roseolilacinum NBRC 12815, проявляющие антитирозиназную активности. С помощью хроматографических методов эти соединения были очищены. Идентифицированы два антитирозиназных соединения, SF2583A и SF2583B. Соединение SF2582A (IC[50] 8 мкМ) проявляло более сильную ингибирующую тиразиназу активность, чем соединение SF25838 (IC[50] 1086 мкМ). Структурное различие между этими соединениями заключалось в присутствии добавочного иона хлора. Активность SF2583A была значительно ниже в кислых условиях, что приводит к обратимой инактивации. Инактивированное SF2583A продолжает сохранять остаточную активность при экспозиции и детергентом, Твин 80. Япония, Kitasato Inst. Lige Sci., Kitasato Univ., Minato-Ku, Tokyo 108-8641. Библ. 28

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.25
Рубрики: STREPTOMYCES ROSEOLILACINUM (BACT.)
ШТАММ NBRX12815
ПРОДУКЦИЯ МЕТАБОЛИТОВ
ИНГИБИТОРЫ ФЕРМЕНТОВ
ИНГИБИТОРЫ ТИРОЗИНАЗЫ
ВЫДЕЛЕНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА

Доп.точки доступа:
Nakashima, Takuji; Anzai, Kozue; Kuwahara, Natsumi; Komaki, Hisayuki; Miyadoh, Shinji; Harayama, Shigeaki; Tianero, Ma Diarye Bordon; Tanaka, Junichi; Kanamoto, Akihiko; Ando, Katsuhiko

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 92.04-04А1.103

Harayama, Shigeaki.
Divergent evolution of chloroplast-type ferredoxins [Text] / Shigeaki Harayama, Alessandra Polissi, Monique Rekik // FEBS Lett. - 1991. - Vol. 285, N 1. - P85-88 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Дивергентная эволюция ферредоксинов хлоропластного типа
Аннотация: ТОЛ плазмида pWWO Pseudomonas putida кодирует набор ферментов для окисления толуола в интермедиаты цикла Кребса. Структурные гены этих ферментов кодируются в двух оперонах, к-рые содержат соответственно гены xyl CMABN и xyl XYZLTEGFJQKIH. Функция гена xylT была неизвестна. Определена нуклеотидная последовательность xylT и вероятный продукт гена, к-рый содержит последовательность, характерную для ферредоксинов хлоропластного типа. Ген nahТ, гомолог xylT, присутствует в плазмиде NAH7, кодирующем фермент деградации нафталина. Он также секвенирован. Сходство последовательностей xylT и nahT подтверждает, что оба генных продукта имеют сходную физиол. функцию. Ферредоксины хлоропластного типа открыты у фотосинтезирующих организмов (растений, водорослей, цианобактерий, Rhodobacter) и видов Halobacterium. Последовательность этого типа найдены в оксигеназах цепи переноса электрона. Построено филогенетическое дерево 13 ферредоксинов хлоропластного типа. Швейцария, Univ. Med. Center 1211 Geneva 4. Библ. 22.

ГРНТИ	34.03.17

ВИНИТИ 341.03.17.27.17
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
ФЕРРЕДОКСИНЫ ХЛОРОПЛАСТНОГО ТИПА
ФИЛОГЕНЕТЧЕСКИЕ ДРЕВА

Доп.точки доступа:
Polissi, Alessandra; Rekik, Monique

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.10-04Б2.183

Primary structure of xylene monooxygenase: Similarities to and differences from the alkane hydroxylation system [Text] / Masahiko Suzuki [et al.] // J. Bacteriol. - 1991. - Vol. 173, N 5. - P1690-1695 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Первичная структура ксилолмонооксигеназы: сходство и отличия от системы гидроксилирования алканов
Аннотация: Ксилолмонооксигеназа (I), кодируемая плазмидой TOL у Pseudomonas putida, катализирует окисление толуола и ксилолов и состоит из двух разных субъединиц, кодируемых генами xyl A и xyl M. На основании установленных нуклеотидных последовательностей этих генов определены аминокислотные последовательности их продуктов. Белок Xyl M имеет 25% гомологии с алкангидролазой, катализирующей 'омега'-гидроксилирование жирных к-т и концевое гидроксилирование алканов. Последовательность первых 90 аминокислот в белке Xyl A имеет большое сходство с последовательностями ферредоксинов хлоропластов, а остальная последовательность Xyl А напоминает таковую у ферредоксин-НАДФ-редуктаз. Xyl М, возможно, является каталитическим компонентом для гидроксилирования углеродного атома боковой цепи толуола и ксилолов подобно алкангидроксилазному белку, и м. б. мембраносвязанным белком, содержащим Fe{2}+ и простетическую группу. Xyl A может иметь два домена, состоящих из N-концевого р-на, близкого к ферредоксинам хлоропластов, и С-концевого р-на, близкого к ферредоксин-НАДФ-редуктазам. Ферредоксиновая часть Xyl A может содержать кластер [2Fe-2S] и восстанавливать окисленную форму Xyl M. Активность, определяемая С-концевой частью Xyl A, может состоять в восстановлении окисленной формы ферредоксина. Библ. 27. Швейцария (Harayama S.), Dep. of Med. Biochem., Fac. of Med., Univ. Med. Center, 1211 Geneva 4.

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: КСИЛОМОНООКСИГЕНАЗА
БЕЛОК XYL А
БЕЛОК XYL M
ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА
ГИДРОКСИЛИРОВАНИЕ
СИСТЕМЫ ГИДРОКСИЛИРОВАНИЯ
ГОМОЛОГИИ
ОТЛИЧИЯ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Suzuki, Masahiko; Hayakawa, Takahiko; Shaw, Jeffrey P.; Rekik, Monique; Harayama, Shigeaki

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.09-04Б2.587

Growth-phase-dependent expression of the Pseudomonas putida TOL plasmid pWWO catabolic genes [Text] / Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat [et al.] // J. Bacteriol. - 1990. - Vol. 172, N 12. - P6651-6660 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Зависимая от фазы роста экспрессия генов катаболизма TOL плазмиды pWWO Pseudomonas putida
Аннотация: Гены биодеградации TOL плазмиды pWWO Pseudomonas putida образуют 2 оперона, к-рые контролируются генами xylR и xylS; экспрессия xylS контролируется геном xylR. В P. putida и рекомбинантных Кл Escherichia coli опероны биодеградации индуцируются только в поздней лог-фазе роста, но не на ранних стадиях. Сконструированы рекомбинантные гены lacZ, находящиеся под контролем 4-х промоторов оперонов биодеградации TOL. В отсутствие регуляторных белов XylR и XylS экспрессия с промоторов Pm, Pu и Ps является конститутивной, тогда как XylS-зависимая экспрессия Pm и XylR-зависимая экспрессия Ps и Pu варьируют на разных стадиях роста. По-видимому, взаимодействие XylS и XylR с промоторами определяется фазой роста. Ил. 5. Табл. 1. Библ. 43. (S. Harayama). Швейцария, Dep. of Medical Biochemistry, Fac. of Medicine, Univ. of Geneva, 1211 Geneva 4.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.09
Рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
ФАЗЫ РОСТА
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОНЫ БИОДЕГРАДАЦИИ TOL
ТРАНСКРИПЦИЯ
ИНДУКЦИЯ
КОРРЕЛЯЦИЯ
ПЛАЗМИДЫ БИОДЕГРАДАЦИИ
TOL ПЛАЗМИДА PWWO
ДНКБЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
БЕЛОК XYLS
БЕЛОК XYLR
ПРОМОТОРЫ TOL

Доп.точки доступа:
Hugouvieux-Cotte-Pattat, Nicole; Kohler, Thilo; Rekik, Monique; Harayama, Shigeaki

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 93.04-04Б2.113

Shaw, Jeffrey P.
Purification and characterisation of the NADH: acceptor reductase component of xylene monooxygenase encoded by the TOL plasmid pWWO of Pseudomonas putida mt-2 [Text] / Jeffrey P. Shaw, Shigeaki Harayama // Eur. J. Biochem. - 1992. - Vol. 209, N 1. - P51-61 . - ISSN 0014-2956
Перевод заглавия: Очистка и характеристика НАДН: акцепторредуктазного компонента ксилолмонооксигеназы, кодируемой TOL-плазмидой pWWO Pseudomonas putida mt-2
Аннотация: Электрон-переносящий компонент (XylA) ксилолмонооксигеназы из P. putida кодируется геном xylA, расположенным на TOL-плазмиде pWWO. Выделение XylA, обладающего НАДН: цитохром С - редуктазной активностью, проведено из штамма Escherichia coli, содержащего ген xylA из P. putida на гибридной плазмиде под контролем промотера 'лямбда' P. Очистка до гомогенного состояния включала ИОХ на TSK ДЭАЭ-5РW, фракционирование сульфатом аммония и гидрофобную хр-фию на TSK фенил-5РW. Очищ. XylA имеет Mr 'ЭКВИВ'40 кД, содержит одну молекулу ФАД и один железо-серный кластер [2Fe-2S]. Окисленный XylA имеет максимумы поглощения при 457 и 390 нм, плечи при 350 и 550 нм. Эти максимумы исчезают после восстановления белка дитионитом или НАДН. XylA способен восстанавливать одно- и двухэлектронные акцепторы с оптимумом при рН 8,5. К для НАДН составляет 22 мкМ. Восстановительное титрование XylA дает три разных формы фермента. Потенциалы средней точки составили -171 мВ для кластера [2Fe-2S], -244 мВ для восстановления ФАД до ФАД и -297 мВ для восстановления ФАД до ФАД. Поток электронов в XylA происходит в направлении НАДН ФАД [2Fe-2S]. Ил. 13. Табл. 1. Библ. 34. Швейцария, Harayama S. Dept. de Biochim. Med. Centre Med. Univ., CH-1211 Geneve 4.

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: БЕЛКИ
ЭЛЕКТРОН-ПЕРЕНОСЯЩИЙ БЕЛОК XYLA
КОДИРОВАНИЕ ГЕНОМ XYLA
НАДН: ЦИТОХРОМ С-РЕДУКТАЗНАЯ АКТИВНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПЛАЗМИДЫ
ГИБРИДНАЯ ПЛАЗМИДА
PSEUDOMONAS PUTIDA [BACT.)

Доп.точки доступа:
Harayama, Shigeaki

1-20 21-40 41-60 61-63

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска