СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Поисковый запрос: (<.>A=Васьков, Ю. И.$<.>)

Общее количество найденных документов : 1

РЖ ВИНИТИ 34 (BI08) 06.06-04Я6.7

Васьков, Ю. И.
Сравнительный анализ ГТФ-связывающих сайтов тубулина [Текст] / Ю. И. Васьков, В. Е. Стефанов // Вестн. С.-Петербург. ун-та. Сер. 3. - 2004. - N 2. - С. 58-67, 126 . - ISSN 0321-186X
Аннотация: Методами биоинформатики (множественное выравнивание аминокислотных последовательностей, визуализация пространственной структуры молекулы и трехмерное выравнивание) проанализированы все полностью расшифрованные аминокислотные последовательности 'альфа'- и 'бета'-тубулинов из доступных банков данных. Использованы программы ClustalX и DeepView/Swiss-PdbViewer. Создана база данных аминокислотных последовательностей, представляющая 200 видов и включающая 162 последовательности 'альфа'-тубулинов и 256 последовательностей 'бета'-тубулинов. По трехмерной модели молекулы тубулина определены аминокислоты, удаленные от ГТФ не более чем на 6A, способные прямо или посредством связанной воды вступать с ним в контакт. Составлена таблица аминокислот, образующих активный центр, и возможных замен. По результатам пространственного выравнивания субъединиц - и 'бета'-тубулина, установлено, что аминокислоты, формирующие в них центры связывания ГТФ, практически идентичны и, следовательно, функциональная неэквивалентность субъединиц непосредственно не связана с особенностями структуры самих ГТФ-центров. В свете выявленных замен в 'альфа'-тубулине K254 на E, а в 'бета'-тубулине - E254 на K проанализирована гипотетическая роль перекрестных взаимодействий с участием обеих субъединиц в активности димера. Трехмерное выравнивание 'альфа'- и 'бета'-тубулина позволяет задать положение иона магния в активном центре -a-тубулина, что создает базу для последующих квантовохимических расчетов. Примененные методы анализа могут быть использованы для планирования и прогнозирования экспериментов по сайт-направленному мутагенезу. Россия, С.-Петерб. ун-т, С.-Петербург. Библ. 14

ГРНТИ	34.19.05

ВИНИТИ 341.19.05.99
Рубрики: ТУБУЛИН 'АЛЬФА'
ТУБУЛИН 'БЕТА'
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫРАВНИВАНИЕ
ГТФ-СВЯЗЫВАЮЩИЕ САЙТЫ
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ
МЕТОДЫ БИОИНФОРМАТИКИ

Доп.точки доступа:
Стефанов, В.Е.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска