СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Поисковый запрос: (<.>S=САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКИЕ ИНТЕГРАЗЫ<.>)

Общее количество найденных документов : 1

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 05.03-04А3.360

Mantri, Yogita.
Islander: A database of integrative islands in prokaryotic genomes, the associated integrases and their DNA site specificities [Text] / Yogita Mantri, Kelly P. Williams // Nucl. Acids Res. - 2004. - Vol. 32, прил. Dat. Iss. - P55-58 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Islander: база данных интегративных островов в прокариотических геномах, интегразы и сайты ДНК специфичности
Аннотация: Прокариотические хромосомы часто содержат острова патогенности, освобождаемые при действии сайт-специфичных интеграз. Интеграция обычно происходит внутри гена тРНК или tmРНК, последовательности внутри острова восстанавливают разрушенный ген. Регенерированный ген РНК и фрагмент гена маркируют концы острова. Этот принцип использовали для поиска островов в геномной ДНК. Представленный алгоритм производит список генов тРНК и tmРНК, используемые для BLAST-поиска стартовой ДНК, и пропускает данные через серию фильтров. Поиск островов в 106 бактериальных геномах выявил 143 кандидата, три из которых оказались ложными. Филогенетический анализ ассоциативных интеграз уменьшил этот набор до 89 случаев сайто-специфичности. Веб-сайт Islander (http://www.indiana.edu/'ЭКВИВ'islander) представляет кандидатов на острова в файлах банка генов и коррелирует интегразную филогению с сайто-специфичностью. США, Dep. of Biol., Indiana Univ., 1001 E. Third Street, Bloomington, IN 47405. Библ. 20

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: ФЕРМЕНТЫ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКИЕ ИНТЕГРАЗЫ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ГЕНОМ
СТРУКТУРА
ОСТРОВА ПАТОГЕННОСТИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
БАЗА ДАННЫХ ISLANDER
СОЗДАНИЕ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Williams, Kelly P.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска