СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ПРОКАРИОТИЧЕСКИЕ СООБЩЕСТВА<.>)

Общее количество найденных документов : 8
Показаны документы с 1 по 8

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.08-04Б2.113

A DNA microarray platform based on direct detection of rRNA for characterization of freshwater sediment-related prokaryotic communities [Text] / Jorg Peplies [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 72, N 7. - P4829-4838 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Платформа ДНК-микроэрреев, основанная на прямом обнаружении рРНК для характеристики прокариотических сообществ пресноводных донных отложений
Аннотация: Платформа основана на гетерогенном наборе семидесяти 16S рРНК - олигонуклеотидных зондов и прямом мечении РНК, выделенной из окружающей среды. Применение простого протокола для эффективного блокирования фона предметных стекол, покрытых аминосиланом, привело к улучшению отношения сигнал/шум и повышению предела обнаружения до 10 нг для отдельных 16S рРНК-мишеней. ЛОжноположительные сигналы составили 'ЭКВИВ'5%. Анализ донных отложений четырех рек в Германии показал невысокое разнообразие среди членов сообществ, но выявил определенные различия в составах сообществ. Рез-ты подтверждены параллельной флуоресцентной гибридизацией in situ в сочетании с чувствительным каталитическим отложением репортера (CARD-FISH). Германия, Ribocon GmbH, 28359 Bremen. Fax: 49-421 2298 150 E-mail: jpeplies@ribocon.com. Библ. 48

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: МИКРОБНЫЕ СООБЩЕСТВА
ПРОКАРИОТИЧЕСКИЕ СООБЩЕСТВА
ХАРАКТЕРИСТИКА
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ
16SPРНК-ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ЗОНДЫ
ПРЯМОЕ МЕЧЕНИЕ РНК
ПРЕСНОВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
ДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Peplies, Jorg; Lachmund, Christine; Glockner, Frank Oliver; Manz, Werner

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 09.09-04А2.62

Analysis of DGGE profiles to explore the relationship between prokaryotic community composition and biogeochemical processes in deep subseafloor sediments from the Peru Margin [Text] / John C. Fry [et al.] // FEMS Microbiol. Ecol. - 2006. - Vol. 58, N 1. - P86-98 . - ISSN 0168-6496
Перевод заглавия: Анализ профилей DGGE для объяснения взаимосвязи между составом прокариотического сообщества и биогеохимическими процессами в глубоководных поддонных отложениях вдоль побережья перу
Аннотация: Цель работы - связать состав прокариотического сообщества с геохимическими процессами в глубокой биосфере под ложем океана на двух мелководных участках берега Перу в Тихом океане. Анализ главных компонентов типов полос DGGE из глубоких отложений Bacteria, Archaea, Euryarchaeota и нового кандидатного подразделения JS1 с последующей множественной регрессией показа четкой взаимосвязи с активностью прокариотов и геохимией (R{2}=55-100%). Последующий корреляционный анализ, на одном участке, между главными компонентами профилей состава сообщества для Bacteria и 12 др. переменных количественно подтвердили их взаимосвязь с активностью и геохимией, к-рая ранее только подразумевалась. Сравнение с опубликованными ранее кол-вами клеток, определенными с помощью FISH с рРНК-нацеленными зондами, подтвердило, что эти профили DGGE описали активное прокариотическое сообщество. Великобритания [John C. Fry], Cardiff School of Biosciences, Cardiff Univ., Park Place, Cardiff, CF10 3TL. E-mail: fry@cardiff.ac.uk

ГРНТИ	34.35.33

ВИНИТИ 341.35.33.37.37.53.11
Рубрики: ПРОКАРИОТЫ
ПРОКАРИОТИЧЕСКИЕ СООБЩЕСТВА
СОСТАВ
ВЗАИМОСВЯЗЬ С БИОГЕОХИМИЧЕСКИМИ ВОДНЫМИ ПРОЦЕССАМИ
ОКЕАНЫ
ГЛУБОКОВОДНЫЕ ПОДДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Fry, John C.; Webster, Gordon; Cragg, Barry A.; Weightman, Andrew J.; Parkes, R.John

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.09-04Б2.96

Analysis of DGGE profiles to explore the relationship between prokaryotic community composition and biogeochemical processes in deep subseafloor sediments from the Peru Margin [Text] / John C. Fry [et al.] // FEMS Microbiol. Ecol. - 2006. - Vol. 58, N 1. - P86-98 . - ISSN 0168-6496
Перевод заглавия: Анализ профилей DGGE для объяснения взаимосвязи между составом прокариотического сообщества и биогеохимическими процессами в глубоководных поддонных отложениях вдоль побережья перу
Аннотация: Цель работы - связать состав прокариотического сообщества с геохимическими процессами в глубокой биосфере под ложем океана на двух мелководных участках берега Перу в Тихом океане. Анализ главных компонентов типов полос DGGE из глубоких отложений Bacteria, Archaea, Euryarchaeota и нового кандидатного подразделения JS1 с последующей множественной регрессией показа четкой взаимосвязи с активностью прокариотов и геохимией (R{2}=55-100%). Последующий корреляционный анализ, на одном участке, между главными компонентами профилей состава сообщества для Bacteria и 12 др. переменных количественно подтвердили их взаимосвязь с активностью и геохимией, к-рая ранее только подразумевалась. Сравнение с опубликованными ранее кол-вами клеток, определенными с помощью FISH с рРНК-нацеленными зондами, подтвердило, что эти профили DGGE описали активное прокариотическое сообщество. Великобритания [John C. Fry], Cardiff School of Biosciences, Cardiff Univ., Park Place, Cardiff, CF10 3TL. E-mail: fry@cardiff.ac.uk

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: ПРОКАРИОТЫ
ПРОКАРИОТИЧЕСКИЕ СООБЩЕСТВА
СОСТАВ
ВЗАИМОСВЯЗЬ С БИОГЕОХИМИЧЕСКИМИ ВОДНЫМИ ПРОЦЕССАМИ
ОКЕАНЫ
ГЛУБОКОВОДНЫЕ ПОДДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Fry, John C.; Webster, Gordon; Cragg, Barry A.; Weightman, Andrew J.; Parkes, R.John

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 10.01-04Б3.150

Analysis of DGGE profiles to explore the relationship between prokaryotic community composition and biogeochemical processes in deep subseafloor sediments from the Peru Margin [Text] / John C. Fry [et al.] // FEMS Microbiol. Ecol. - 2006. - Vol. 58, N 1. - P86-98 . - ISSN 0168-6496
Перевод заглавия: Анализ профилей DGGE для объяснения взаимосвязи между составом прокариотического сообщества и биогеохимическими процессами в глубоководных поддонных отложениях вдоль побережья перу
Аннотация: Цель работы - связать состав прокариотического сообщества с геохимическими процессами в глубокой биосфере под ложем океана на двух мелководных участках берега Перу в Тихом океане. Анализ главных компонентов типов полос DGGE из глубоких отложений Bacteria, Archaea, Euryarchaeota и нового кандидатного подразделения JS1 с последующей множественной регрессией показа четкой взаимосвязи с активностью прокариотов и геохимией (R{2}=55-100%). Последующий корреляционный анализ, на одном участке, между главными компонентами профилей состава сообщества для Bacteria и 12 др. переменных количественно подтвердили их взаимосвязь с активностью и геохимией, к-рая ранее только подразумевалась. Сравнение с опубликованными ранее кол-вами клеток, определенными с помощью FISH с рРНК-нацеленными зондами, подтвердило, что эти профили DGGE описали активное прокариотическое сообщество. Великобритания [John C. Fry], Cardiff School of Biosciences, Cardiff Univ., Park Place, Cardiff, CF10 3TL. E-mail: fry@cardiff.ac.uk

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.23
Рубрики: ПРОКАРИОТЫ
ПРОКАРИОТИЧЕСКИЕ СООБЩЕСТВА
СОСТАВ
ВЗАИМОСВЯЗЬ С БИОГЕОХИМИЧЕСКИМИ ВОДНЫМИ ПРОЦЕССАМИ
ОКЕАНЫ
ГЛУБОКОВОДНЫЕ ПОДДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Fry, John C.; Webster, Gordon; Cragg, Barry A.; Weightman, Andrew J.; Parkes, R.John

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 13.09-04А2.90

Temporal and depth-related differences in prokaryotic communities in abyssal sediments associated with particulate organic carbon flux [Text] / M. M. Moeseneder [et al.] // Deep-Sea Res. Pt 1. - 2012. - Vol. 70. - P26-35 . - ISSN 0967-0637
Перевод заглавия: Различия в прокариотических сообществах, зависящие от времени и погружения в глубоководные осадки, связанные с потоком частиц органического углерода
Аннотация: Предполагают, что поток частиц органического углерода (ЧОУ) - наиболее важный параметр, влияющий на активность и биомассу сообществ прокариот (СП) и глубоководную фауну морского дна. Но данных о связи ЧОУ с СП мало. Используя анализ 16S-рРНК, исследовали СП в глубоководных осадках в периоды сильного и малого потока ЧОУ. Анализ карт фрагментов ДНК (fingerprint) показал, что 'ЭКВИВ'50% филотипов были сходны на каждом из горизонтов осадка вне связи с колебаниями потока ЧОУ. Был обнаружен и относительно изменчивый компонент в составе СП. Он зависел от потока ЧОУ. Те же закономерности наблюдалилсь в более глубоких горизонтах осадков. На доступность ЧОУ сильнее откликались кренархеотные СП в сравнении с бактериальными СП. Большое число филотипов, общих в каждый отрезок времени, подтвержают устойчивость биомассы и активных СП. Великобритания, Шотландия, Oceanlab, Univ. of Aberdeetn, Newburgh, AB41 6AA. E-mail:m.moeseneder@noc.ac.uk. Библ. 82

ГРНТИ	34.35.33

ВИНИТИ 341.35.33.37.37.53.11
Рубрики: ПРОКАРИОТИЧЕСКИЕ СООБЩЕСТВА
BACTERIA (BACT.)
CRENORCHAEOTA (ARCH.)
АНАЛИЗ 16S-РРНК
ГЛУБОКОВОДНЫЕ ОСАДКИ
ЧАСТИЦЫ ОРГАНИЧЕСКОГО С
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
МОРЯ

Доп.точки доступа:
Moeseneder, M.M.; Smith, K.L.; Ruhl, H.A.; Jones, D.O.B.; Witte, U.; Prosser, J.I.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.09-04Б2.78

Temporal and depth-related differences in prokaryotic communities in abyssal sediments associated with particulate organic carbon flux [Text] / M. M. Moeseneder [et al.] // Deep-Sea Res. Pt 1. - 2012. - Vol. 70. - P26-35 . - ISSN 0967-0637
Перевод заглавия: Различия в прокариотических сообществах, зависящие от времени и погружения в глубоководные осадки, связанные с потоком частиц органического углерода
Аннотация: Предполагают, что поток частиц органического углерода (ЧОУ) - наиболее важный параметр, влияющий на активность и биомассу сообществ прокариот (СП) и фауну глубоководного морского дна. Но данных о связи ЧОУ с СП мало. Используя анализ 16S-рРНК, исследовали СП в глубоководных осадках в периоды сильного и малого потока ЧОУ. Анализ карт фрагментов ДНК (fingerprint) показал, что 'ЭКВИВ'50% филотипов были сходны на каждом из горизонтов осадка вне связи с колебаниями потока ЧОУ. Был обнаружен и относительно изменчивый компонент в составе СП. Он зависел от потока ЧОУ. Те же закономерности наблюдалилсь в более глубоких горизонтах осадков. На доступность ЧОУ сильнее откликались кренархеотные СП в сравнении с бактериальными СП. Большое число филотипов, общих в каждый отрезок времени, подтвержают устойчивость биомассы и активных СП. Великобритания, Шотландия, Oceanlab, Univ. of Aberdeetn, Newburgh, AB41 6AA. E-mail:m.moeseneder@noc.ac.uk. Библ. 82

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09 + 341.27.21.09.31.02
Рубрики: ПРОКАРИОТИЧЕСКИЕ СООБЩЕСТВА
BACTERIA (BACT.)
CRENORCHAEOTA (ARCH.)
АНАЛИЗ 16S-РРНК
ГЛУБОКОВОДНЫЕ ОСАДКИ
ЧАСТИЦЫ ОРГАНИЧЕСКОГО С

Доп.точки доступа:
Moeseneder, M.M.; Smith, K.L.; Ruhl, H.A.; Jones, D.O.B.; Witte, U.; Prosser, J.I.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.11-04Б2.194

Мустафин, З. С.
Высокопроизводительное моделирование эволюции прокариотических сообществ с использованием программного комплекса "Гаплоидный эволюционный конструктор" [Текст] / З. С. Мустафин, Ю. Г. Матушкин, С. А. Лашин // Вавиловский ж. генет. и селекции. - 2012. - Т. 16, N 4. - С. 825-829 . - ISSN 1814-554X
Аннотация: В работе приведены результаты разработки высокопроизводительной версии программного комплекса "Гаплоидный эволюционный конструктор" предназначенного для моделирования функционирования и эволюции прокариотических сообществ. Разработана параллельная версия программы, предназначенная для работы на высокопроизводительных кластерах с поддержкой MPI. Оказалось, что общее ускорение параллельной версии программного комплекса почти линейно зависит от числа используемых процессоров, и время расчета сложных моделей сообществ на кластере ЦКП "Биоинформатика" СО РАН уменьшилось с десятков часов до нескольких минут. Россия, Фед. гос. бюджетное учреждение науки Ин-т цитологии и генетики Сиб. отд-я РАН, Новосибирскк@

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: ПРОКАРИОТИЧЕСКИЕ СООБЩЕСТВА
ЭВОЛЮЦИЯ
ВЫСОКОПРОИЗОВДИТЕЛЬНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
ПРОГРАММНЫЙ КОМПЛЕКС
"ГАПЛОИДНЫЙ ЭВОЛЮЦИОННЫЙ КОНСТРУКТОР"

Доп.точки доступа:
Матушкин, Ю.Г.; Лашин, С.А.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 13.12-04Б3.135

Temporal and depth-related differences in prokaryotic communities in abyssal sediments associated with particulate organic carbon flux [Text] / M. M. Moeseneder [et al.] // Deep-Sea Res. Pt 1. - 2012. - Vol. 70. - P26-35 . - ISSN 0967-0637
Перевод заглавия: Различия в прокариотических сообществах, зависящие от времени и погружения в глубоководные осадки, связанные с потоком частиц органического углерода
Аннотация: Предполагают, что поток частиц органического углерода (ЧОУ) - наиболее важный параметр, влияющий на активность и биомассу сообществ прокариот (СП) и глубоководную фауну морского дна. Но данных о связи ЧОУ с СП мало. Используя анализ 16S-рРНК, исследовали СП в глубоководных осадках в периоды сильного и малого потока ЧОУ. Анализ карт фрагментов ДНК (fingerprint) показал, что 'ЭКВИВ'50% филотипов были сходны на каждом из горизонтов осадка вне связи с колебаниями потока ЧОУ. Был обнаружен и относительно изменчивый компонент в составе СП. Он зависел от потока ЧОУ. Те же закономерности наблюдалилсь в более глубоких горизонтах осадков. На доступность ЧОУ сильнее откликались кренархеотные СП в сравнении с бактериальными СП. Большое число филотипов, общих в каждый отрезок времени, подтвержают устойчивость биомассы и активных СП. Великобритания, Шотландия, Oceanlab, Univ. of Aberdeetn, Newburgh, AB41 6AA. E-mail:m.moeseneder@noc.ac.uk. Библ. 82

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: ПРОКАРИОТИЧЕСКИЕ СООБЩЕСТВА
BACTERIA (BACT.)
CRENORCHAEOTA (ARCH.)
АНАЛИЗ 16S-РРНК
ГЛУБОКОВОДНЫЕ ОСАДКИ
ЧАСТИЦЫ ОРГАНИЧЕСКОГО С

Доп.точки доступа:
Moeseneder, M.M.; Smith, K.L.; Ruhl, H.A.; Jones, D.O.B.; Witte, U.; Prosser, J.I.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска