СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Поисковый запрос: (<.>S=МОДУЛЬ ГЕНЕРАЦИИ ТРАНСКРИПТОВ<.>)

Общее количество найденных документов : 1

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.06-04Б2.166

TAAPP: Tiling array analysis pipeline for prokaryotes [Text] / Ranjit Kumar [et al.] // Genomics, Proteomics and Bioinf. - 2011. - Vol. 9, N 1-2. - P56-62 . - ISSN 1672-0229
Перевод заглавия: ТААРР: tiling (крытие черепицей) - анализ информационного канала в прокариотах
Аннотация: Транскрипционный анализ высокой плотности (tiling array) обычно используют для исследования генома эукариот. Чтобы его применить для идентификации ранее неизвестных транскрипционных элементов, подобно малым РНК и антисмысловым РНК в прокариотах, существующие инструменты необходимо подстроить к архитектуре генома прокариот. В данной работе описали метод ТААРР на основе базы веб-данных, состоящий из двух модулей анализа данных. Модуль генерации транскриптов работает на нормализованных данных для генерирования транскрипционно активных районов (TAR). Аннотационный модуль картирует TAR для создания аннотации генома. Этот модуль далее делит по категориям транскрипционные профили в потенциально новой некодирующей РНК, антисмысловой РНК, и структурных оперонах. Веб-интерфейс доступен для академического использования по адресу: at http://lims.Isbi.mafes.msstste.edu/TAAPP-HTML. США, College of Veterinary Med., Mississipi State Univ., Mississippi 39762

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: МЕТОДЫ
МЕТОД ТААРР
ОСНОВА БАЗЫ ВЕБ-ДАННЫХ
МОДУЛЬ ГЕНЕРАЦИИ ТРАНСКРИПТОВ
ГЕНОМ
АННОТАЦИЯ
СОЗДАНИЕ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ПРОФИЛИ
АНТИСМЫСЛОВАЯ РНК
СТРУКТУРНЫЕ ОПЕРОНЫ
ПРОКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Kumar, Ranjit; Burgess, Shane C.; Lawrence, Mark L.; Nanduri, Bindu

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска