Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S='ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)<.>)
Общее количество найденных документов : 29
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-29 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 15.02-04Б3.6

   

    Arcobacter anaerophilus sp. nov., isolated from an estuarine sediment and emended description of the genus Arcobacter [Text] / Jyothsna T. S. Sasi [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2013. - Vol. 63, N 12. - P4619-4625
Перевод заглавия: Arcobacter anaerophilus sp.nov., выделенная из осадка прибойной зоны, и улучшенное описание рода Arcobacter
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: ARCOBACTER ANAEROPHILIS SP.NOV. (BACT.)
'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

ОСАДОК ЭСТУАРИЯ

ХЕМООРГАНОГЕТРОТРОФ

ХЕМОТАКСОНОМИЯ

ДНК/ДНК-ГИБРИДИЗАЦИЯ

СОДЕРЖАНИЕ Г+Ц

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ 16S-РРНК

НОВЫЕ ВИДЫ


Доп.точки доступа:
Sasi, Jyothsna T.S.; Rahul, K.; Ramaprasad, E.V.V.; Sasikala, Ch.; Ramana, Ch.V.


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 14.12-04Б4.88

   

    Arcobacter anaerophilus sp. nov., isolated from an estuarine sediment and emended description of the genus Arcobacter [Text] / Jyothsna T. S. Sasi [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2013. - Vol. 63, N 12. - P4619-4625
Перевод заглавия: Arcobacter anaerophilus sp.nov., выделенная из осадка прибойной зоны, и улучшенное описание рода Arcobacter
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.19
Рубрики: ARCOBACTER ANAEROPHILIS SP.NOV. (BACT.)
'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

ОСАДОК ЭСТУАРИЯ

ХЕМООРГАНОГЕТРОТРОФ

ХЕМОТАКСОНОМИЯ

ДНК/ДНК-ГИБРИДИЗАЦИЯ

СОДЕРЖАНИЕ Г+Ц

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ 16S-РРНК

НОВЫЕ ВИДЫ


Доп.точки доступа:
Sasi, Jyothsna T.S.; Rahul, K.; Ramaprasad, E.V.V.; Sasikala, Ch.; Ramana, Ch.V.


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.12-04Б2.22

   

    Arcobacter anaerophilus sp. nov., isolated from an estuarine sediment and emended description of the genus Arcobacter [Text] / Jyothsna T. S. Sasi [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2013. - Vol. 63, N 12. - P4619-4625
Перевод заглавия: Arcobacter anaerophilus sp.nov., выделенная из осадка прибойной зоны, и улучшенное описание рода Arcobacter
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.15.03 + 341.27.21.09.35
Рубрики: ARCOBACTER ANAEROPHILIS SP.NOV. (BACT.)
'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

ОСАДОК ЭСТУАРИЯ

ХЕМООРГАНОГЕТРОТРОФ

ХЕМОТАКСОНОМИЯ

ДНК/ДНК-ГИБРИДИЗАЦИЯ

СОДЕРЖАНИЕ Г+Ц

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ 16S-РРНК

НОВЫЕ ВИДЫ


Доп.точки доступа:
Sasi, Jyothsna T.S.; Rahul, K.; Ramaprasad, E.V.V.; Sasikala, Ch.; Ramana, Ch.V.


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 16.06-04Б3.183

   

    Bacterial community dynamics and activity in relation to dissolved organic matter availability during sea-ice formation in a mesocosm experiment [Text] / Eeva Eronen-Rsimus [et al.] // Microbiol. Open. - 2014. - Vol. 3, N 1. - P139-156 . - ISSN 2045-8827
Перевод заглавия: Динамика и активность сообществ бактерий в связи с доступностью растворимого органического вещества при образовании морского льда в опытных мезокосмах
Аннотация: Исследовали изменения в сообществах морских бактерий (СМБ) при переходах от открытой воды (ОВ) к морскому льду (МЛ). Учитывали и питательный статус ОВ, поскольку он может влиять на СМБ при образовании МЛ. Сукцессии СМБ изучали в мезокосмах в воде под МЛ и на МЛ. Первая серия мезокосмов содержала ОВ Северного моря. Вторая - ОВ, обогащенную р-ренным органич. в-вом (DOV). Состав и динамику СМБ отслеживали с помощью полиморфизма конечных рестрикционных фрагментов (Т-RELP), клонирования и по поглощению меченых тимидина и лейцина. Плотность СМБ регистрировали с помощью проточной цитометрии. Обогащенные и активные СМБ н а МЛ развивались на льду, сформированному как в обогащенных DOM-образцах (0-6 дней), так и в необогащенных. В обогащенных DOM образцах преобладали 'эпсилон'-Proteobcteria. Отмечена их спососбность к росту на МЛ. СМБ в необогащенных водах и в МЛ были представлены классами Flavobacteria, а также 'альфа'- и 'эпсилон'-Proteobacteria, часто встречающимися в ОВ полярных областей. Подчеркнута способность СМБ к быстрой адаптации на внезапные изменения среды: т-ры, солености, пищевого статуса и снабжению DOM при образовании МЛ. Финляндия, Finnish Environment Inst., Marine Res. Cet., Helsinki 00251. E-mail: eeva.eronen@gmail.com
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.23
Рубрики: СООБЩЕСТВА МОРСКИХ БАКТЕРИЙ
'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

'АЛЬФА'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

FLAVOBACTERIA (BACT.)

ОБРАЗОВАНИЕ ЛЬДА

МЕЗОКОСМЫ

ПОЛИМОРФИЗМ КОНЕЧНЫХ РЕСТРИКЦИОННЫХ ФРАГМЕНТОВ

КЛОНИРОВАНИЕ

ПРОТОЧНАЯ ИНТОМЕТРИЯ

МЕЧЕНЫЕ АНАБОЛИТЫ


Доп.точки доступа:
Eronen-Rsimus, Eeva; Kaartokallio, Hermanni; Lyra, Christina; Autio, Riitta; Kuosa, Harri; Dieckmann, Gerhard S.; Thomas, David N.


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 16.02-04А2.57

   

    Bacterial community dynamics and activity in relation to dissolved organic matter availability during sea-ice formation in a mesocosm experiment [Text] / Eeva Eronen-Rsimus [et al.] // Microbiol. Open. - 2014. - Vol. 3, N 1. - P139-156 . - ISSN 2045-8827
Перевод заглавия: Динамика и активность сообществ бактерий в связи с доступностью растворимого органического вещества при образовании морского льда в опытных мезокосмах
Аннотация: Исследовали изменения в сообществах морских бактерий (СМБ) при переходах от открытой воды (ОВ) к морскому льду (МЛ). Учитывали и питательный статус ОВ, поскольку он может влиять на СМБ при образовании МЛ. Сукцессии СМБ изучали в мезокосмах в воде под МЛ и на МЛ. Первая серия мезокосмов содержала ОВ Северного моря. Вторая - ОВ, обогащенную р-ренным органич. в-вом (DOV). Состав и динамику СМБ отслеживали с помощью полиморфизма конечных рестрикционных фрагментов (Т-RELP), клонирования и по поглощению меченых тимидина и лейцина. Плотность СМБ регистрировали с помощью проточной цитометрии. Обогащенные и активные СМБ на МЛ развивались на льду, сформированном как в обогащенных DOM-образцах (0-6 дней), так и в необогащенных. В обогащенных DOM образцах преобладали 'эпсилон'-Proteobcteria. Отмечена их спососбность к росту на МЛ. СМБ в необогащенных водах и в МЛ были представлены классами Flavobacteria, а также 'альфа'- и 'эпсилон'-Proteobacteria, часто встречающимися в ОВ полярных областей. Подчеркнута способность СМБ к быстрой адаптации на внезапные изменения среды: т-ры, солености, пищевого статуса и снабжению DOM при образовании МЛ. Финляндия, Finnish Environment Inst., Marine Res. Cet., Helsinki 00251. E-mail: eeva.eronen@gmail.com
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.35.33.37.37.33.11
Рубрики: СООБЩЕСТВА МОРСКИХ БАКТЕРИЙ
'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

'АЛЬФА'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

FLAVOBACTERIA (BACT.)

ОБРАЗОВАНИЕ ЛЬДА

МЕЗОКОСМЫ

ПОЛИМОРФИЗМ КОНЕЧНЫХ РЕСТРИКЦИОННЫХ ФРАГМЕНТОВ

КЛОНИРОВАНИЕ

ПРОТОЧНАЯ ИНТОМЕТРИЯ

МЕЧЕНЫЕ АНАБОЛИТЫ


Доп.точки доступа:
Eronen-Rsimus, Eeva; Kaartokallio, Hermanni; Lyra, Christina; Autio, Riitta; Kuosa, Harri; Dieckmann, Gerhard S.; Thomas, David N.


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 16.01-04Б2.190

   

    Bacterial community dynamics and activity in relation to dissolved organic matter availability during sea-ice formation in a mesocosm experiment [Text] / Eeva Eronen-Rsimus [et al.] // Microbiol. Open. - 2014. - Vol. 3, N 1. - P139-156 . - ISSN 2045-8827
Перевод заглавия: Динамика и активность сообществ бактерий в связи с доступностью растворимого органического вещества при образовании морского льда в опытных мезокосмах
Аннотация: Исследовали изменения в сообществах морских бактерий (СМБ) при переходах от открытой воды (ОВ) к морскому льду (МЛ). Учитывали и питательный статус ОВ, поскольку он может влиять на СМБ при образовании МЛ. Сукцессии СМБ изучали в мезокосмах в воде под МЛ и на МЛ. Первая серия мезокосмов содержала ОВ Северного моря. Вторая - ОВ, обогащенную р-ренным органич. в-вом (DOV). Состав и динамику СМБ отслеживали с помощью полиморфизма конечных рестрикционных фрагментов (Т-RELP), клонирования и по поглощению меченых тимидина и лейцина. Плотность СМБ регистрировали с помощью проточной цитометрии. Обогащенные и активные СМБ н а МЛ развивались на льду, сформированному как в обогащенных DOM-образцах (0-6 дней), так и в необогащенных. В обогащенных DOM образцах преобладали 'эпсилон'-Proteobcteria. Отмечена их спососбность к росту на МЛ. СМБ в необогащенных водах и в МЛ были представлены классами Flavobacteria, а также 'альфа'- и 'эпсилон'-Proteobacteria, часто встречающимися в ОВ полярных областей. Подчеркнута способность СМБ к быстрой адаптации на внезапные изменения среды: т-ры, солености, пищевого статуса и снабжению DOM при образовании МЛ. Финляндия, Finnish Environment Inst., Marine Res. Cet., Helsinki 00251. E-mail: eeva.eronen@gmail.com
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: СООБЩЕСТВА МОРСКИХ БАКТЕРИЙ
'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

'АЛЬФА'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

FLAVOBACTERIA (BACT.)

ОБРАЗОВАНИЕ ЛЬДА

МЕЗОКОСМЫ

ПОЛИМОРФИЗМ КОНЕЧНЫХ РЕСТРИКЦИОННЫХ ФРАГМЕНТОВ

КЛОНИРОВАНИЕ

ПРОТОЧНАЯ ИНТОМЕТРИЯ

МЕЧЕНЫЕ АНАБОЛИТЫ


Доп.точки доступа:
Eronen-Rsimus, Eeva; Kaartokallio, Hermanni; Lyra, Christina; Autio, Riitta; Kuosa, Harri; Dieckmann, Gerhard S.; Thomas, David N.


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.03-04Б2.80

   

    Bacterial diversity in hydrothermal sediment and epsilonproteobacterial dominance in experimental microcolonizers at the Mid-Atlantic Ridge [Text] / Purificacion Lopez-Garcia [et al.] // Environ. Microbiol. - 2003. - Vol. 5, N 10. - P961-976 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Бактериальное разнообразие в гидротермальных отложениях и доминирование 'эпсилон'-протеобактерий на экспериментальных микроколонизаторах в Срединно-Атлантическом [подводном] хребте
Аннотация: Сообщается о молек. исследовании, основанном на 16SрРНК, бактериального разнообразия, обнаруженного в двух глубоководных вентах Срединно-Атлантического хребта: гидротермальных отложениях (участок Rainbow) и микровселенцах, образованных из 3 различных субстратов (богатого органикой, богатого железом и пемзы), к-рые выдерживались в течение 15 дней у эмиссий гидротермальных вентов. Наиболее обильные и разнообразные нуклеотидные последовательности (филотипы) в библиотеках генов соответствовали 'гамма'-Proteobacteria, за к-рыми следовали Acidobacteria. Определяли представителей всех подразделений внутри Proteobacteria. Линии родства миксобактерий были лучше всего представлены внутри 'ДЕЛЬТА'-подгруппы. Также были идентифицированы филотипы, относящиеся к Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides, Planctomycetales, грамположительным бактериям с высоким и низким содержанием Г+Ц, Nitrospirae и кандидатной подгруппе 7М7. Напротив, микровселенцы были почти исключительно колонизованы 'эпсилон'-Proteobacteria, хотя они обнаружили значительное морфологическое и филогенетическое разнообразие внутри группы. Не обнаружено специфичности ни для одного из испытанных субстратов. Эти рез-ты подчеркивают идею об экологическом доминировании 'эпсилон'-Proteobacteria на границе газ-морская вода во внешней среде. Изучали также различные окислительные состояния S в отдельных бактериальных филаментах из богатого железом микровселенца. Для этого использовали недеструктивную синхротронную микрорентгеновскую спектроскопию на краю поглощения (micro-XANES), к-рая показала сосуществование различных состояний окисления S, от сульфида до сульфата, на уровне отдельных клеток. Это означает, что эти клетки метаболизировали S in situ
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: 'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
РАЗНООБРАЗИЕ

ДОМИНИРОВАНИЕ

МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ

ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ВЕНТЫ

КРУГОВОРОТ СЕРЫ


Доп.точки доступа:
Lopez-Garcia, Purificacion; Duperron, Sebastien; Philippot, Pascal; Foriel, Julien; Susini, Jean; Moreira, David


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 07.07-04Б3.170

   

    Bacterial diversity in hydrothermal sediment and epsilonproteobacterial dominance in experimental microcolonizers at the Mid-Atlantic Ridge [Text] / Purificacion Lopez-Garcia [et al.] // Environ. Microbiol. - 2003. - Vol. 5, N 10. - P961-976 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Бактериальное разнообразие в гидротермальных отложениях и доминирование 'эпсилон'-протеобактерий на экспериментальных микроколонизаторах в Срединно-Атлантическом [подводном] хребте
Аннотация: Сообщается о молек. исследовании, основанном на 16SрРНК, бактериального разнообразия, обнаруженного в двух глубоководных вентах Срединно-Атлантического хребта: гидротермальных отложениях (участок Rainbow) и микровселенцах, образованных из 3 различных субстратов (богатого органикой, богатого железом и пемзы), к-рые выдерживались в течение 15 дней у эмиссий гидротермальных вентов. Наиболее обильные и разнообразные нуклеотидные последовательности (филотипы) в библиотеках генов соответствовали 'гамма'-Proteobacteria, за к-рыми следовали Acidobacteria. Определяли представителей всех подразделений внутри Proteobacteria. Линии родства миксобактерий были лучше всего представлены внутри 'ДЕЛЬТА'-подгруппы. Также были идентифицированы филотипы, относящиеся к Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides, Planctomycetales, грамположительным бактериям с высоким и низким содержанием Г+Ц, Nitrospirae и кандидатной подгруппе 7М7. Напротив, микровселенцы были почти исключительно колонизованы 'эпсилон'-Proteobacteria, хотя они обнаружили значительное морфологическое и филогенетическое разнообразие внутри группы. Не обнаружено специфичности ни для одного из испытанных субстратов. Эти рез-ты подчеркивают идею об экологическом доминировании 'эпсилон'-Proteobacteria на границе газ-морская вода во внешней среде. Изучали также различные окислительные состояния S в отдельных бактериальных филаментах из богатого железом микровселенца. Для этого использовали недеструктивную синхротронную микрорентгеновскую спектроскопию на краю поглощения (micro-XANES), к-рая показала сосуществование различных состояний окисления S, от сульфида до сульфата, на уровне отдельных клеток. Это означает, что эти клетки метаболизировали S in situ
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.23
Рубрики: 'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
РАЗНООБРАЗИЕ

ДОМИНИРОВАНИЕ

МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ

ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ВЕНТЫ

КРУГОВОРОТ СЕРЫ


Доп.точки доступа:
Lopez-Garcia, Purificacion; Duperron, Sebastien; Philippot, Pascal; Foriel, Julien; Susini, Jean; Moreira, David


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.02-04Б2.53

   

    Biogeography and biodiversity in sulfide structures of active and inactive vents at deep-sea hydrothermal fields of the Southern Mariana Trough [Text] / Shingo Kato [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2010. - Vol. 76, N 9. - P2968-2979 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Биогеография и биоразнообразие [микроорганизмов] в сульфидных структурах активных и неактивных вентов на глубoководных гидротермальных полях в южной части Марианской впадины
Аннотация: С помощью молекулярных методов обследовали микробные сообщества (МС) сульфидных структур активных и неактивных вентов (I и II). Несмотря на геологические отличия, в I преобладали фелотипы, родственные 'эпсилон'-Proteobacteria и гипертермофильным культивируемым Archeae. В образцах МС из II относительная численность этих филотипов была крайне низкой. Сравнительные анализы показали, что плотность, активность и разнообразие МС в сульфидных структурах II сравнимы или выше таковых в I. При этом строение МС в I и II различно. Заключается, что МС в составе сульфидных структур сильно изменяется в зависимости от степени гидротермальной активности, что подтверждается статистическим анализом в I и II. Япония, Dep. of Molec. Biology, Tokyo Univ. of Pharmacy and Life Sci., Tokyo 192-0392. E-mail:yamagish@ls.toyaku.ac.jp. Библ. 83
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
ГЛУБОКИЕ ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ПОЛЯ

АКТИВНЫЕ ВЕНТЫ

НЕАКТИВНЫЕ ВЕНТЫ

МИКРОБНЫЕ СООБЩЕСТВА

'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

ГИПЕРТЕРМОФИЛЬНЫЕ ARCHAEA


Доп.точки доступа:
Kato, Shingo; Takano, Yoshinori; Kakegawa, Takeshi; Oba, Hironori; Inoue, kazuhiko; Kobayashi, Chiyori; Utsumi, Motoo; Marumo, Katsumi; Kobayashi, Kensei; Ito, Yuki; Ishibashi, Jun-ichiro; Yamagishi, Akihiko


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.01-04Б2.37

    Coenye, Tom.

    A genomic perspective on the relationship between the Aquificales and the e-proteobacteria [Text] / Tom Coenye, Peter Vandamme // Syst. and Appl. Microbiol. - 2004. - Vol. 27, N 3. - P313-322 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Геномная перспектива [изучения] взаимоотношений между Aquificales и 'эпсилон'-Proteobacteria
Аннотация: Исследовали взаимоотношения между бактериями пор. Aquificales и 'эпсилон'-Proteobacteria на генетическом уровне, поскольку в настоящее время полностью секвенированы геномы Aquifex aeolicus и ряда представителей 'эпсилон'-Proteobacteria. Проведено сравнение последовательностей генов 16 S рРНК и еще 20 генов. Полученные рез-ты указывают на отсутствие близкого родства между Aquifex aeolicus и 'эпсилон'-Proteobacteria, а также свидетельствуют в пользу помещения р. Aquifex вблизи основания филогенетического дерева бактерий. Бельгия, Univ. Gent, Gent. Библ. 40
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.15.09
Рубрики: AQUIFEX AEOLICUS (BACT.)
'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

ТАКСОНОМИЧЕСКАЯ ВЗАИМОСВЯЗЬ

ФИЛОГЕНИЯ


Доп.точки доступа:
Vandamme, Peter


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 07.02-04Б3.145

   

    Distribution, phylogenetic diversity and physiological characteristics of epsilon-Proteobacteria in a deep-sea hydrothermal field [Text] / Satoshi Nakagawa [et al.] // Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 7, N 10. - P1619-1632 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Распространение, филогенетическое разнообразие и физиологические характеристики 'эпсилон'-Proteobacteria в гидротермальном глубоководном морском поле
Аннотация: Изучали пространственное распределение, разнообразие и физиологические характеристики 'эпсилон'-Proteobacteria в различных микробных местообитаниях в непосредственной близости от гидротермального вента во впадине Mid-Okinawa, используя культуральные и молекулярные методы. Были размещены устр-ва для колонизации бактерий около выходов из вентов. В трубках полихет было физиологически и филогенетически разнообразное сообщество. Пробоотборники in situ были преимущественно колонизованы 'эпсилон'-Proteobacteria. Энергетический метаболизм их изолятов был сильно неустойчив. Топология древа, сконструированная из метаболических характерных особенностей, значительно отличалась от таковой (P=0,000) древа на базе 16S рРНК, показывая, что анализы на основе 16S рРНК не дают достаточной информации, чтобы сделать выводы о физиологии 'эпсилон'-Proteobacteria. Тем не менее, культивируемость их в различных микробных местообитаниях отличалась среди филогенетических подгрупп. Члены Sulfurimonas характеризовались устойчивой культивируемостью, а др. филогенетические подгруппы, как оказалось, потеряли эту способность в морской воде, вероятно, из-за чувствительности к кислороду. Эти рез-ты по-новому характеризуют экофизиологию 'эпсилон'-Proteobacteria из глубоководных гидротермальных вентов, к-рая никогда не оценивалась с помощью сравнительного анализа генов 16S рРНК. Япония, Lab. of Marine Microbiol., Div. of Applied Biosci., Graduate School of Agriculture, Kyoto Univ., Kyoto 606-8502
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: 'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
РАСПРОСТРАНЕНИЕ

ФИЗИОЛОГИЯ

ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ

ГЛУБОКОВОДНЫЕ ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ВЕНТЫ


Доп.точки доступа:
Nakagawa, Satoshi; Takai, Ken; Inagaki, Fumio; Hirayama, Hisako; Nonoura, Takuro; Horikoshi, Koki; Sako, Yoshihiko


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.12-04Б2.84

   

    Distribution, phylogenetic diversity and physiological characteristics of epsilon-Proteobacteria in a deep-sea hydrothermal field [Text] / Satoshi Nakagawa [et al.] // Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 7, N 10. - P1619-1632 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Распространение, филогенетическое разнообразие и физиологические характеристики 'эпсилон'-Proteobacteria в гидротермальном глубоководном морском поле
Аннотация: Изучали пространственное распределение, разнообразие и физиологические характеристики 'эпсилон'-Proteobacteria в различных микробных местообитаниях в непосредственной близости от гидротермального вента во впадине Mid-Okinawa, используя культуральные и молекулярные методы. Были размещены устр-ва для колонизации бактерий около выходов из вентов. В трубках полихет было физиологически и филогенетически разнообразное сообщество. Пробоотборники in situ были преимущественно колонизованы 'эпсилон'-Proteobacteria. Энергетический метаболизм их изолятов был сильно неустойчив. Топология древа, сконструированная из метаболических характерных особенностей, значительно отличалась от таковой (P=0,000) древа на базе 16S рРНК, показывая, что анализы на основе 16S рРНК не дают достаточной информации, чтобы сделать выводы о физиологии 'эпсилон'-Proteobacteria. Тем не менее, культивируемость их в различных микробных местообитаниях отличалась среди филогенетических подгрупп. Члены Sulfurimonas характеризовались устойчивой культивируемостью, а др. филогенетические подгруппы, как оказалось, потеряли эту способность в морской воде, вероятно, из-за чувствительности к кислороду. Эти рез-ты по-новому характеризуют экофизиологию 'эпсилон'-Proteobacteria из глубоководных гидротермальных вентов, к-рая никогда не оценивалась с помощью сравнительного анализа генов 16S рРНК. Япония, Lab. of Marine Microbiol., Div. of Applied Biosci., Graduate School of Agriculture, Kyoto Univ., Kyoto 606-8502
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: 'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
РАСПРОСТРАНЕНИЕ

ФИЗИОЛОГИЯ

ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ

ГЛУБОКОВОДНЫЕ ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ВЕНТЫ


Доп.точки доступа:
Nakagawa, Satoshi; Takai, Ken; Inagaki, Fumio; Hirayama, Hisako; Nonoura, Takuro; Horikoshi, Koki; Sako, Yoshihiko


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 06.07-04А2.30

   

    Geomicrobiological exploration and characterization of a novel deep-sea hydrothermal system at the TOTO caldera in the Mariana Volcanic Arc [Text] / Tatsunori Nakagawa [et al.] // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 1. - P37-49 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Геомикробиологическое исследование и характеристика новой гидротермальной глубоководной системы в кальдере TOTO на Марианском вулканическом поднятии
Аннотация: Исследовали гидротермальные системы, связанные с "белыми курильщиками", кальдеры TOTO. Т-ра потока составляла 170'ГРАДУС'C, pH 1,6. Отмечено высокое содержание сульфида (15 мМ). По рез-там анализа клонов 16S рДНК и FISH-анализа отмечено доминирование представителей эпсилон-протеобактерий. В меньшем кол-ве присутствовали филотипы архей, соответствующие Thermococcus, Pyrodictyum, Aeropyrum, а также некультивируемым формам. Отмечается значительный вклад хемолитотрофов в первичную продукцию экосистем гидротермальных полей. Япония, Japan Agency for Marine-Earth Sci. and Technol. (JANSTEC), Yokosuka 237-0061
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.35.33.37.37.02
Рубрики: 'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
АРХЕИ

ОБНАРУЖЕНИЕ

ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ


Доп.точки доступа:
Nakagawa, Tatsunori; Takai, Ken; Suzuki, Yohey; Hirayama, Hisako; Konno, Uta; Tsunogai, Urumu; Horikoshi, Koki


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 06.08-04Б3.154

   

    Geomicrobiological exploration and characterization of a novel deep-sea hydrothermal system at the TOTO caldera in the Mariana Volcanic Arc [Text] / Tatsunori Nakagawa [et al.] // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 1. - P37-49 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Геомикробиологическое исследование и характеристика новой гидротермальной глубоководной системы в кальдере TOTO на Марианском вулканическом поднятии
Аннотация: Исследовали гидротермальные системы, связанные с "белыми курильщиками", кальдеры TOTO. Т-ра потока составляла 170'ГРАДУС'C, pH 1,6. Отмечено высокое содержание сульфида (15 мМ). По рез-там анализа клонов 16S рДНК и FISH-анализа отмечено доминирование представителей эпсилон-протеобактерий. В меньшем кол-ве присутствовали филотипы архей, соответствующие Thermococcus, Pyrodictyum, Aeropyrum, а также некультивируемым формам. Отмечается значительный вклад хемолитотрофов в первичную продукцию экосистем гидротермальных полей. Япония, Japan Agency for Marine-Earth Sci. and Technol. (JANSTEC), Yokosuka 237-0061
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.23
Рубрики: 'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
АРХЕИ

ОБНАРУЖЕНИЕ

ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ


Доп.точки доступа:
Nakagawa, Tatsunori; Takai, Ken; Suzuki, Yohey; Hirayama, Hisako; Konno, Uta; Tsunogai, Urumu; Horikoshi, Koki


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.07-04Б2.126

   

    Geomicrobiological exploration and characterization of a novel deep-sea hydrothermal system at the TOTO caldera in the Mariana Volcanic Arc [Text] / Tatsunori Nakagawa [et al.] // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 1. - P37-49 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Геомикробиологическое исследование и характеристика новой гидротермальной глубоководной системы в кальдере TOTO на Марианском вулканическом поднятии
Аннотация: Исследовали гидротермальные системы, связанные с "белыми курильщиками", кальдеры TOTO. Т-ра потока составляла 170'ГРАДУС'C, pH 1,6. Отмечено высокое содержание сульфида (15 мМ). По рез-там анализа клонов 16S рДНК и FISH-анализа отмечено доминирование представителей эпсилон-протеобактерий. В меньшем кол-ве присутствовали филотипы архей, соответствующие Thermococcus, Pyrodictyum, Aeropyrum, а также некультивируемым формам. Отмечается значительный вклад хемолитотрофов в первичную продукцию экосистем гидротермальных полей. Япония, Japan Agency for Marine-Earth Sci. and Technol. (JANSTEC), Yokosuka 237-0061
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: 'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
АРХЕИ

ОБНАРУЖЕНИЕ

ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ


Доп.точки доступа:
Nakagawa, Tatsunori; Takai, Ken; Suzuki, Yohey; Hirayama, Hisako; Konno, Uta; Tsunogai, Urumu; Horikoshi, Koki


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 07.07-04И1.163

   

    Host-symbiont relationships in hydrothermal vent gastropods of the genus Alviniconcha from the Southwest Pacific [Text] / Yohey Suzuki [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 72, N 2. - P1388-1393 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Взаимоотношения между хозяином и симбионтом у гастропод рода Alviniconcha, живущих вблизи гидротермальных выходов юго-западной Пацифики
Аннотация: Живущие вблизи гидротермальных выходов гастроподы р. Alviniconcha характеризуются уникальной среди Metazoa особенностью - питанием за счет эндосимбионтов из числа гамма- и эпсилон-протеобактерий. Взаимоотношения этих гастропод с бактериями-симбионтами в Индийском океане (Центральный Индийский Хребет) и в западной части Тихого океана (Марианская впадина) довольно подробно исследованы, для гастропод же в юго-западной части Тихого океана они еще не изучены. В статье приводятся рез-ты филогенетического анализа гена субъединицы 1 митохондриальной цитохром c оксидазы гастропод из ряда участков в юго-западной Пацифике, позволившие выявить новую филогенетическую ветвь гастропод р. Alviniconcha. Анализ 16S рРНК бактерий-эндосимбионтов позволил идентифицировать две ветви гамма-протеобактерий в одну - эпсилон-протеобактерий. Изотопный состав углерода в биомассе и состав жирных к-т в тканях гастропод свидетельствуют о функционировании у бактерий-эндосимбионтов цикла Кальвина и восстановительного цикла трикарбоновых к-т. Обсуждается специфичность хозяев и эндосимбионтов в разных гидротермальных выходах. Япония, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, 2-15 Matsushima-cho, Yokosuka, Kanagawa 237-0061. Библ. 25
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.33.15.35.09.02.21
Рубрики: 'ГАММА'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

ЭНДОСИМБИОЗ С ГАСТРОПОДАМИ

ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ

ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ВЫХОДЫ


Доп.точки доступа:
Suzuki, Yohey; Kojima, Shigeaki; Sasaki, Takenori; Suzuki, Masae; Utsumi, Takashi; Watanabe, Hiromi; Urakawa, Hidetoshi; Tsuchida, Shinji; Nunoura, Takuro; Hirayama, Hisako; Takai, Ken; Nealson, Kenneth H.; Horikoshi, Koki


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.07-04Б2.87

   

    Host-symbiont relationships in hydrothermal vent gastropods of the genus Alviniconcha from the Southwest Pacific [Text] / Yohey Suzuki [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 72, N 2. - P1388-1393 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Взаимоотношения между хозяином и симбионтом у гастропод рода Alviniconcha, живущих вблизи гидротермальных выходов юго-западной Пацифики
Аннотация: Живущие вблизи гидротермальных выходов гастроподы р. Alviniconcha характеризуются уникальной среди Metazoa особенностью - питанием за счет эндосимбионтов из числа гамма- и эпсилон-протеобактерий. Взаимоотношения этих гастропод с бактериями-симбионтами в Индийском океане (Центральный Индийский Хребет) и в западной части Тихого океана (Марианская впадина) довольно подробно исследованы, для гастропод же в юго-западной части Тихого океана они еще не изучены. В статье приводятся рез-ты филогенетического анализа гена субъединицы 1 митохондриальной цитохром c оксидазы гастропод из ряда участков в юго-западной Пацифике, позволившие выявить новую филогенетическую ветвь гастропод р. Alviniconcha. Анализ 16S рРНК бактерий-эндосимбионтов позволил идентифицировать две ветви гамма-протеобактерий в одну - эпсилон-протеобактерий. Изотопный состав углерода в биомассе и состав жирных к-т в тканях гастропод свидетельствуют о функционировании у бактерий-эндосимбионтов цикла Кальвина и восстановительного цикла трикарбоновых к-т. Обсуждается специфичность хозяев и эндосимбионтов в разных гидротермальных выходах. Япония, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, 2-15 Matsushima-cho, Yokosuka, Kanagawa 237-0061. Библ. 25
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.17 + 341.27.23.09
Рубрики: 'ГАММА'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

ЭНДОСИМБИОЗ С ГАСТРОПОДАМИ

ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ

ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ВЫХОДЫ


Доп.точки доступа:
Suzuki, Yohey; Kojima, Shigeaki; Sasaki, Takenori; Suzuki, Masae; Utsumi, Takashi; Watanabe, Hiromi; Urakawa, Hidetoshi; Tsuchida, Shinji; Nunoura, Takuro; Hirayama, Hisako; Takai, Ken; Nealson, Kenneth H.; Horikoshi, Koki


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 05.11-04И1.141

   

    Hydrothermal vent gastropods from the same family (Provannidae) harbour 'эпсилон'- and 'гамма'-proteobacterial endosymbionts [Text] / Hidetoshi Urakawa [et al.] // Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 7, N 5. - P750-754 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: В брюхоногих моллюсках одного и того же семейства, выделенных из гидротермальных вентов, обитают 'эпсилон'- и 'гамма'-протеобактерии-эндосимбионты
Аннотация: Открытие новых гидротермальных вентов в акваториях зап. части Тихого океана обнаружило сообщества хемосинтетиков, отличающихся от таковых в других вентах. В вентах доминировали 2 родственных брюхоногих моллюска (Alviniconcha spp. и Ifremeria nautilei), в к-рых обитали бактерии-симбионты. Использовали сравнительное секвенирование 16S рРНК и in situ гибридизацию со специфичными рРНК зондами для характеристики бактериальных симбионтов Alviniconcha sp. и I. nautilei, выделенных из зап. части Тихого океана. Рез-ты показали, что эти 2 вида моллюсков, хотя и относятся к одному и тому же семейству, содержат филогенетически дистанцированных друг от друга хемосимбионтов, т. обр. предполагается независимое происхождение этих эндосимбиозов. Эндосимбионт I. nautilei кластеризуется с сероокисляющими бактериями внутри 'гамма'-Proteobacteria, как и в случае со всеми ранее описанными эндосимбионтами большого кол-ва хозяев-таксонов, "приютивших" тиоавтотрофных прокариотов. Напротив, эндосимбионт Alviniconcha объединяется с сероокисляющими бактериями внутри 'эпсилон'-Proteobacteria. Рез-ты показывают, что бактерии из 'эпсилон'-Proteobacteria способны формировать эндосимбиотические ассоциации с морскими беспозвоночными из хемосинтетических местообитаний. Т. обр., эндосимбиоз, как оказалось, распространен среди всех известных классов Proteobacteria. США, Dep. of Civil and Eniron. Engineering, Univ. of Washington, Seattle, WA 98195
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.33.15.35.09.02.21
Рубрики: 'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
'ГАММА'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

ХЕМОСИНТЕТИЧЕСКИЕ БАКТЕРИИ

СИМБИОЗ

БРЮХОНОГИЕ МОЛЛЮСКИ

БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ЭНДОСИМБИОНТЫ

ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ВЕНТЫ


Доп.точки доступа:
Urakawa, Hidetoshi; Dubilier, Nicole; Fujiwara, Yoshihiro; Cunningham, Dale E.; Kojima, Shigeaki; Stahl, David A.


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.11-04Б2.198

   

    Hydrothermal vent gastropods from the same family (Provannidae) harbour 'эпсилон'- and 'гамма'-proteobacterial endosymbionts [Text] / Hidetoshi Urakawa [et al.] // Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 7, N 5. - P750-754 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: В брюхоногих моллюсках одного и того же семейства, выделенных из гидротермальных вентов, обитают 'эпсилон'- и 'гамма'-протеобактерии-эндосимбионты
Аннотация: Открытие новых гидротермальных вентов в акваториях зап. части Тихого океана обнаружило сообщества хемосинтетиков, отличающихся от таковых в других вентах. В вентах доминировали 2 родственных брюхоногих моллюска (Alviniconcha spp. и Ifremeria nautilei), в к-рых обитали бактерии-симбионты. Использовали сравнительное секвенирование 16S рРНК и in situ гибридизацию со специфичными рРНК зондами для характеристики бактериальных симбионтов Alviniconcha sp. и I. nautilei, выделенных из зап. части Тихого океана. Рез-ты показали, что эти 2 вида моллюсков, хотя и относятся к одному и тому же семейству, содержат филогенетически дистанцированных друг от друга хемосимбионтов, т. обр. предполагается независимое происхождение этих эндосимбиозов. Эндосимбионт I. nautilei кластеризуется с сероокисляющими бактериями внутри 'гамма'-Proteobacteria, как и в случае со всеми ранее описанными эндосимбионтами большого кол-ва хозяев-таксонов, "приютивших" тиоавтотрофных прокариотов. Напротив, эндосимбионт Alviniconcha объединяется с сероокисляющими бактериями внутри 'эпсилон'-Proteobacteria. Рез-ты показывают, что бактерии из 'эпсилон'-Proteobacteria способны формировать эндосимбиотические ассоциации с морскими беспозвоночными из хемосинтетических местообитаний. Т. обр., эндосимбиоз, как оказалось, распространен среди всех известных классов Proteobacteria. США, Dep. of Civil and Eniron. Engineering, Univ. of Washington, Seattle, WA 98195
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.17 + 341.27.23.09
Рубрики: 'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)
'ГАММА'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

ХЕМОСИНТЕТИЧЕСКИЕ БАКТЕРИИ

СИМБИОЗ

БРЮХОНОГИЕ МОЛЛЮСКИ

БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ЭНДОСИМБИОНТЫ

ГИДРОТЕРМАЛЬНЫЕ ВЕНТЫ


Доп.точки доступа:
Urakawa, Hidetoshi; Dubilier, Nicole; Fujiwara, Yoshihiro; Cunningham, Dale E.; Kojima, Shigeaki; Stahl, David A.


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.01-04Б2.80

   

    Identification of a Thiomicrospira denitrificans-like epsilonproteobacterium as a catalyst for autotrophic denitrification in the central Baltic Sea [Text] / Ingrid Brettar [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 72, N 2. - P1364-1372 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Идентификация Thiomicrospira denitrificans-подобной 'эпсилон'-протеобактерии в кач-ве катализатора автотрофной денитрификации в центральной части Балтийского моря
Аннотация: Идентификация и функциональный анализ ключевых членов бактериальных сообществ в морских и эстуарных местообитаниях - главные задачи для получения механистического понимания биогеохимических процессов. В бассейнах Балтийского моря, как и во многих др. морских местообитаниях с аноксическими водоемами, кислородная - бескислородная граница раздела рассматривается как слой большого бактериального кругооборота соединений серы, азота и углерода, к-рые имеют большое влияние на балансы в-в в целой экосистеме. Изучали автотрофную денитрификацию, происходящую путем окисления восстановленных соединений серы, как биогеохимически важный процесс, сопровождающийся кругооборотом S, N и C. Использовали недавно разработанный подход, состоящий из молекулярных анализов в экспериментах с добавлением субстратов и при колич. определении бактерий in situ. С помощью молек. методов идентифицировали бактерии, ответственные за автотрофную идентификацию как единичный таксон, 'эпсилон'-протеобактерию, родственную автотрофному денитрификатору Thiomicrospira denitrificans. Эти данные были подтверждены балансом в-в в экспериментах, к-рые согласовались с таковыми, полученными с непрерывными культурами Th. denitrificans. Присутствие и активность бактерии, филогенетически и физиологически близкородственной Th. denitrificans, могут быть важны для кол-ва углерода в центр. части Балтийского моря, т. к. Th. denitrificans проявляет только половину эффективности фиксации CO[2] на 1 моль окисленного сульфида и 1 моль нитрата, восстановленного Th. denitrificans согласно гипотезе, существовавшей ранее для этой функции. Германия, GBF - German Res. Center for Biotechnology, Dep. of Environ. Microbiol., D-38124 Braunschweig. Библ. 43
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.09 + 341.27.17.09.07.09.37
Рубрики: АВТОТРОФНАЯ ДЕНИТРИФИКАЦИЯ
КРУГООБОРОТ СЕРЫ

КРУГООБОРОТ АЗОТА

КРУГООБОРОТ УГЛЕРОДА

'ЭПСИЛОН'-PROTEOBACTERIA (BACT.)

THIOMICROSPORA DENITRIFICANS (BACT.)

ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ


Доп.точки доступа:
Brettar, Ingrid; Labrenz, Matthias; Flavier, Sebastien; Botel, Julia; Kuosa, Harri; Christen, Richard; Hofle, Manfred G.


 1-20    21-29 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)