Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Davidov, Yaacov$<.>)
Общее количество найденных документов : 8
Показаны документы с 1 по 8
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.04-04Б2.33

    Davidov, Yaacov.

    Diversity and evolution of Bdellovibrio-and-like organisms (BALOs), reclassification of Bacteriovorax starrii as Peredibacter starrii gen. nov., comb. nov., and description of the Bacteriovorax-Peredibacter clade as Bacteriovoracaceae fam. nov. [Text] / Yaacov Davidov, Edouard Jurkevitch // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2004. - Vol. 54, N 5. - P1439-1452 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Разнообразие и эволюция Bdellovibrio и подобных организмов (BALOs), реклассификация Bacteriovorax starrii как Peredibacter starrii gen. nov., comb. nov. и описание клады Bacteriovorax-Peredibacter как Bacteriovoracaceae fam. nov
Аннотация: Провели филогенетический анализ BALOs. Он основывался на характеристике 71 штамма и на всех последующих данных о последовательностях 16S рРНК, имеющихся в базах данных, включая в общей сложности 120 штаммов из очень разных биотопов. Рестрикционный анализ амплифицированной рДНК (ARDRA) четко отразил разнообразие и филогенетическое родство BALOs, тем самым обеспечив эффективный инструмент отбора. Обширный филогенетический анализ последовательностей 16S рРНК показал очень большое разнообразие внутри клод Bdellovibrio (14% дивергенции) и Bacteriovorax (16%), к-рые представляют 9 и 8 кластеров, соответственно, показывая более 3% внутрикластерной дивергенции. Клоды различались больше, чем на 20%. Анализ консервативных вторичных структур 16S рРНК показал, что Bdellovibrio обладал чертами, нетипичными для 'дельта'-Proteobacteria, сближаясь т. обр. с Bacteriovorax. В то время как ни один из штаммов Bdellovibrio не был морского происхождения, Bacteriovorax включал отдельные почвенно-пресноводные и специфические морские группы. На основании описанных различий предлагается Bacteriovorax starrii поместить в новый род, Peredibacter gen. nov., с Peredibacter starrii A312{T} в качестве типового штамма. Также предлагается реклассификация линий Bdellovibrio и Bacteriovorax-Peredibacter как двух различных семейств, т. е. "Bdellovibrionaceae" и нового семейства Bacteriovoracaceae. Также предлагается пересмотр олигонуклеотидов, адресованных BALO и обсуждается значение большого разнообразия этих организмов и их распространение в самых разных местообитаниях. Израиль, Dep. of Plant Pathology and Microbiol., Fac. of Agric., Food and Environmental
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: BACTERIOVORAX STARRII (BACT.)
РЕКЛАССИФИКАЦИЯ

PEREDIBACTER STARRII GEN. NOV., COMB. NOV. (BACT.)

BACTERIOVORACACEAE FAM. NOV. (BACT.)

СИСТЕМАТИКА

BDELLOVIBRIO (BACT.)

РАЗНООБРАЗИЕ

ЭВОЛЮЦИЯ

НОВЫЕ РОДЫ


Доп.точки доступа:
Jurkevitch, Edouard


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.04-04Б2.106

   

    Azospirillum brasilense does not affect population structure of specific rhizibactderial communities of inoculated maize (Zea mays) [Text] / Yoav Herschkovitz [et al.] // Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 7, N 11. - P1847-1852 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Azospirillum brasilense не влияет на популяционную структуру специфических ризобиальных сообществ инокулированной кукурузы (Zea mays)
Аннотация: Положительная р-ция вида растений на ризобактерии, ускоряющие рост растений, привела к повышенному интересу при их использовании в кач-ве бактериальных инокулянтов. Однако, внесение экзогенных бактерий в природные экосистемы может нарушить равновесие в бактериальных популяциях внутри микробного сообщества и привести к разрушению местных популяций, выполняющих ключевые функции. В работе оценивали влияние инокуляции культурой Az. brasilense на ризосферные бактерии кукурузы (Zea mays) Bacteroidetes, 'альфа'-Proteobacteria, Pseudomonas и Bdellovibrio spp. с помощью ПЦР-DGGE в сочетании с группоспецифичными праймерами. Анализ фракций DGGE (электрофореза в денатурирующем градиенте геля) показал, что введение A. brasilense не изменяло и не разрушало микробную систему на группоспецифичном уровне. Однако, на некоторые сообщества, такие как 'альфа'-Proteobacteria и Bdellovibrio, влиял возраст растения, тогда как др. бактериальные группы не испытывали влияния. На основании полученных и более ранних рез-тов можно сделать вывод, что инокуляция A. brasilense не нарушает равновесия в изученных природных бактериальных популяциях. Израиль, Dep. of Plant Pathology and Microbiology and The Otto Warburg Minerva Center for Agric. Biotechnology, Fac. of Agric., Food and Environ. Quality Sci., The Hebrew Univ. of Jerusalem, Rehovot 76100
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.11
Рубрики: AZOSPIRILLUM BRASILENSE (BACT.)
ИНОКУЛЯЦИЯ КУКУРУЗЫ

ВЛИЯНИЕ

РИЗОСФЕРНАЯ МИКРОФЛОРА

МЕСТНЫЕ БАКТЕРИИ


Доп.точки доступа:
Herschkovitz, Yoav; Lerner, Anat; Davidov, Yaacov; Okon, Yaacov; Jurkevitch, Edouard


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.06-04Б2.116

   

    Inoculation with the plant-growth-promoting rhizobacterium Azospirillum brasilense causes little disturbance in the rhizosphere and rhizoplane of maize (Zea mays) [Text] / Yoav Herschkovitz [et al.] // Microbial Ecol. - 2005. - Vol. 50, N 2. - P277-288 . - ISSN 0095-3628
Перевод заглавия: Инокуляция ризобактерией Azospirillum brasilense, ускоряющей рост растений, вызывает незначительные нарушения в ризосфере и ризоплане кукурузы (Zea mays)
Аннотация: Инокуляция A. brasilense оказывает благотворное действие на рост и урожай растений. Провели сравнительный анализ корней Z. mays, инокулированных или не инокулированных штаммами A. brasilense, в двух почвах. Динамика колонизации ризобактерий была прослежена в разных компартментах корней с помощью специфичных для 16S рРНК зондов и окрашивания 4',6'-диамидин-2-фенилиндолом, и структура бактериальных популяций в одних и тех же образцах была проанализирована с помощью ПЦР-DGGE гена 16S рРНК. На основании гибридизации целых клеток обнаружили значительную часть бактериального сообщества активной и в ризоплане - эндоризосфере, и в ризосферной почве, т. е. в обоих типах почв. Анализ DGGE показал,что инокуляция растения A. brasilense не влияет на структурный состав бактериальных сообществ, к-рые оказались схожи на верхушке корня и в местах ветвления корней. Однако, ризобиальные популяции находились под влиянием возраста растения, и их многообразие уменьшалось в ризоплане - эндоризосфере, по сравнению с ризосферной почвой. Библиотека клонов, полученная из ризосферной ДНК, обнаружила высоко разнообразное сообщество почвы и пропорция этих клонов была только в отдаленном родстве с известными видами
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.11
Рубрики: AZOSPIRILLUM BRASILENSE (BACT.)
ИНОКУЛЯЦИЯ КОРНЕЙ КУКУРУЗЫ

РИЗОСФЕРА

РИЗОПЛАНА

СРАВНЕНИЕ С РИЗОСФЕРНОЙ ПОЧВОЙ

БАКТЕРИАЛЬНЫЕ СООБЩЕСТВА

ВЛИЯНИЕ ВОЗРАСТА РАСТЕНИЙ


Доп.точки доступа:
Herschkovitz, Yoav; Lerner, Anat; Davidov, Yaacov; Rothaballer, Michael; Hartmann, Anton; Okon, Yaacov; Jurkevitch, Edouard


4.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 06.07-04Б3.345

   

    Inoculation with the plant-growth-promoting rhizobacterium Azospirillum brasilense causes little disturbance in the rhizosphere and rhizoplane of maize (Zea mays) [Text] / Yoav Herschkovitz [et al.] // Microbial Ecol. - 2005. - Vol. 50, N 2. - P277-288 . - ISSN 0095-3628
Перевод заглавия: Инокуляция ризобактерией Azospirillum brasilense, ускоряющей рост растений, вызывает незначительные нарушения в ризосфере и ризоплане кукурузы (Zea mays)
Аннотация: Инокуляция A. brasilense оказывает благотворное действие на рост и урожай растений. Провели сравнительный анализ корней Z. mays, инокулированных или не инокулированных штаммами A. brasilense, в двух почвах. Динамика колонизации ризобактерий была прослежена в разных компартментах корней с помощью специфичных для 16S рРНК зондов и окрашивания 4',6'-диамидин-2-фенилиндолом, и структура бактериальных популяций в одних и тех же образцах была проанализирована с помощью ПЦР-DGGE гена 16S рРНК. На основании гибридизации целых клеток обнаружили значительную часть бактериального сообщества активной и в ризоплане - эндоризосфере, и в ризосферной почве, т. е. в обоих типах почв. Анализ DGGE показал,что инокуляция растения A. brasilense не влияет на структурный состав бактериальных сообществ, к-рые оказались схожи на верхушке корня и в местах ветвления корней. Однако, ризобиальные популяции находились под влиянием возраста растения, и их многообразие уменьшалось в ризоплане - эндоризосфере, по сравнению с ризосферной почвой. Библиотека клонов, полученная из ризосферной ДНК, обнаружила высоко разнообразное сообщество почвы и пропорция этих клонов была только в отдаленном родстве с известными видами
ГРНТИ  
ВИНИТИ 681.03.07.02
Рубрики: AZOSPIRILLUM BRASILENSE (BACT.)
ИНОКУЛЯЦИЯ КОРНЕЙ КУКУРУЗЫ

РИЗОСФЕРА

РИЗОПЛАНА

СРАВНЕНИЕ С РИЗОСФЕРНОЙ ПОЧВОЙ

БАКТЕРИАЛЬНЫЕ СООБЩЕСТВА

ВЛИЯНИЕ ВОЗРАСТА РАСТЕНИЙ


Доп.точки доступа:
Herschkovitz, Yoav; Lerner, Anat; Davidov, Yaacov; Rothaballer, Michael; Hartmann, Anton; Okon, Yaacov; Jurkevitch, Edouard


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.02-04Б2.166

    Davidov, Yaacov.

    Structure analysis of a soil community of predatory barcteria using culture-dependent and culture-independent methods reveals a hitherto undetected diversity of Bdellovibrio-and-like organisms [Text] / Yaacov Davidov, Avital Friedjung, Edouard Jurkevitch // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 9. - P1667-1673 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Структурный анализ почвенного сообщества бактерий-хищников с использованием культурального и некультурального методов показывает не определенное до сих пор разнообразие Bdellovibrio и подобных организмов
Аннотация: Были сконструированы группы 16S рРНК праймеров, специфически нацеленных на Bdellovibrio и подобные организмы (BALO). ПЦР в сочетании с DGGE определили частичные последовательности 16S рДНК. Этот простой метод дает возможность специфического in situ, не связанного с культивированием, определения BALO в почвенных местообитаниях. BALO были также выделены из той же почвы, и проанализированы филогения и целый ряд изолятов-жиров. 17 выделенных изолятов, пользующихся 5 различными возможными жертвами, обнаружили 8 различных типов использования жертв и сформировали 9 операционных таксономических единиц (OTU). Эти OTU принадлежали Bdellovibrionaceae, Bacteriovorax, Peredibacter или Micavibrio, т. е. к известным группам BALO. Для сравнения, 15 OTU, включая 10, к-рые не были определены культуральными методами, были получены с помощью специфических праймеров в ПЦР - DGGE методе. Существование сложного сообщества BALO означает, что хищничество существует на гораздо большем разнообразии (кол-ве) жертв, чем можно было определить классическим культуральным методом. Израиль, Dep. of Plant Pathology and Microbiol., The He brew Univ. of Jerusalem, Rehovot
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.17
Рубрики: BDELLOVIBRIO (BACT.)
ВЗАИМООТНОШЕНИЯ ХИЩНИК-ЖЕРТВА

КУЛЬТУРАЛЬНЫЕ МЕТОДЫ

МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ

ПОЧВА


Доп.точки доступа:
Friedjung, Avital; Jurkevitch, Edouard


6.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 07.04-04Б3.165

    Davidov, Yaacov.

    Structure analysis of a soil community of predatory barcteria using culture-dependent and culture-independent methods reveals a hitherto undetected diversity of Bdellovibrio-and-like organisms [Text] / Yaacov Davidov, Avital Friedjung, Edouard Jurkevitch // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 9. - P1667-1673 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Структурный анализ почвенного сообщества бактерий-хищников с использованием культурального и некультурального методов показывает не определенное до сих пор разнообразие Bdellovibrio и подобных организмов
Аннотация: Были сконструированы группы 16S рРНК праймеров, специфически нацеленных на Bdellovibrio и подобные организмы (BALO). ПЦР в сочетании с DGGE определили частичные последовательности 16S рДНК. Этот простой метод дает возможность специфического in situ, не связанного с культивированием, определения BALO в почвенных местообитаниях. BALO были также выделены из той же почвы, и проанализированы филогения и целый ряд изолятов-жиров. 17 выделенных изолятов, пользующихся 5 различными возможными жертвами, обнаружили 8 различных типов использования жертв и сформировали 9 операционных таксономических единиц (OTU). Эти OTU принадлежали Bdellovibrionaceae, Bacteriovorax, Peredibacter или Micavibrio, т. е. к известным группам BALO. Для сравнения, 15 OTU, включая 10, к-рые не были определены культуральными методами, были получены с помощью специфических праймеров в ПЦР - DGGE методе. Существование сложного сообщества BALO означает, что хищничество существует на гораздо большем разнообразии (кол-ве) жертв, чем можно было определить классическим культуральным методом. Израиль, Dep. of Plant Pathology and Microbiol., The He brew Univ. of Jerusalem, Rehovot
ГРНТИ  
ВИНИТИ 681.03.07.02
Рубрики: BDELLOVIBRIO (BACT.)
ВЗАИМООТНОШЕНИЯ ХИЩНИК-ЖЕРТВА

КУЛЬТУРАЛЬНЫЕ МЕТОДЫ

МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ

ПОЧВА


Доп.точки доступа:
Friedjung, Avital; Jurkevitch, Edouard


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.08-04Б2.149

   

    A new 'альфа'-proteobacterial clade of Bdellovibrio-like predators: Implications for the mitochondrial endosymbiotic theory [Text] / Yaacov Davidov [et al.] // Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 12. - P2179-2188 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Новый 'альфа'-протеобактериальный клад Bdellovibrio - подобных хищников: значение для митохондриальной теории эндосимбиоза
Аннотация: Bdellovibrio и подобные организмы (BALO) - своеобразные, широко распространенные, малого размера, высоко подвижные гармотрицательные бактерии, к-рые являются облигатными хищниками для др. бактерий. Обычно они проникают в периплазму своей жертвы, где они растут и размножаются. К настоящему времени BALO составляют два сильно различающихся сем-ва, отнесенные к классу дельта-протеобактерий. В данной работе Micavibrio spp., линия родства BALO эпибиотических хищников, были выделены из почвы. Эти бактерии прикрепляются, чтобы переваривать и расти за счет др. прокариотов, сильно похожих на др. BALO. Многочисленные филогенетические анализы, основанные на 6 генах, показали, что они сформировали раннюю ветвь в пределах альфа-протеобактерий, не объединенную ни с одним порядком альфа-протеобактерий. Присутствие BALO как ранней ветви среди альфа-протеобактерий означает, что их своеобразный тип паразитизма может иметь анцестральный характер в этом классе протеобактерий. Происхождение митохондрии из альфа-протеобактериального эндосимбионта строго поддерживается молекулярной филогенией. Накопленные данные предполагают, что хозяином эндосимбионта был также прокариот. Т. к. прокариоты неспособны к фагоцитозу, способы, благодаря к-рым эндосимбионт получал доступ к своему хозяину, остаются неразгаданными. В данной работе предлагается сценарий, основанный на типе питания BALO, чтобы выдвинуть гипотезу о механизму происхождения митохондриального эндосимбиоза
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.17
Рубрики: BDELLOVIBRIO (BACT.)
BDELLOVIBRIO - ПОДОБНЫЕ ХИЩНИКИ

ПРОНИКНОВЕНИЕ В ПЕРИПЛАЗМУ МИКРОБА-ЖЕРТВЫ

MICAVIBRIO (BACT.)

ВЫДЕЛЕНИЕ ХИЩНИКОВ ИЗ ПОЧВЫ

ЭНДОСИМБИОЗ

МИТОХОНДРИАЛЬНЫЙ ЭНДОСИМБИОЗ


Доп.точки доступа:
Davidov, Yaacov; Huchon, Dorothee; Koval, Susan F.; Jurkevitch, Edouard


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.12-04Б2.133

    Davidov, Yaacov.

    Predation between prokaryotes and the origin of eukaryotes [Text] / Yaacov Davidov, Edouard Jurkevitch // BioEssays. - 2009. - Vol. 31, N 7. - P748-757 . - ISSN 0265-9247
Перевод заглавия: Хищничество среди прокариотов и происхождение эукариотов
Аннотация: Накопленные данные предполагают, что эукариотическая клетка произошла от слияния двух прокариотов, архейного хозяина и бактериального эндосимбионта. Однако, т.к. прокариоты не способны осуществлять фагоцитоз, способы, благодярая к-рым эндосимбионт проникает в своего хозяина, являются загадкой. Авт. предполагают, что хищнические или паразитические взаимодействия между прокариотами обеспечивают разумное объяснение этой загадки. Согалсно предложенной здесь модели хозяин в этом взаимодействии - анаэр. архей с периплазма-подобным прострнанством. Хищник - небольшая (факультативно) аэр. альфа-протеобактерия, к-рая проникала и реплицировалась внутри периплазмы хозяина и позднее превращалась в митохондрии. Обсуждаются вероятные условия, при к-рых это взаимодействие имело место, и обстоятельства, к-рые могли привести к современной сложной эукариотической клетке. Израиль (E. Jurkevitch), Dep. of Plant Pathology and Microbiology, The Hebrew Univ. of Jerusalem, Rehovot. E-mail:jurkevi@agri.huji.ac.il
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.15.09
Рубрики: ЭУКАРИОТЫ
ПРОИСХОЖДЕНИЕ

АРХЕЙНЫЙ ХОЗЯИН

БАКТЕРИАЛЬНЫЙ ЭНДОСИМБИОНТ

СЛИЯНИЕ

УСЛОВИЯ


Доп.точки доступа:
Jurkevitch, Edouard


 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)