Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК<.>)
Общее количество найденных документов : 12
Показаны документы с 1 по 12
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.09-04Б2.82

    Anderson, Michael.
    Characterization and identification of productivity-associated rhizobacteria in wheat [Text] / Michael Anderson, Joshua Habiger // Appl. and Environ. Microbiol. - 2012. - Vol. 78, N 12. - P4434-4446 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Характеристика и определение ризобактерий, связанных с продуктивностью пшеницы
Аннотация: Ризосфера заселена различными бактериями, влияние к-рых на продуктивность растений часто неизвестно. С использованием пиросеквенирования 16S-рРНК описано бактериальное сообщество ризосферы пшеницы. Растения выращивали в теплице в гомогенизированной полевой почве. В рез-те экстракции и пиросеквенирования ДНК получено 29007 последовательностей. Идентифицированы операционные таксономич. единицы (ОТЕ), значимо связанные с продуктивностью биомассы проростков. ИЗ 710 ОТЕ у 42 обнаружили положительный ответ и у 39 - отрицательный. Наибольшая положительная связь (+) отмечена для Duganella, Janthinobacterium, Pseudomonas и Cellvibrio. Отрицательная связь (-) отмечена для Bacteria, Chryseobacterium, Proteobacteria и Enterobacter. Авт. заключают, что продуктивность биомассы проростков тесно связана с соотношением + и - ризобактерий. США, Dep. of Plant and Soil Sci., Oklahoma State Univ., Stillwater, Oklahoma. E-mail:michael.anderson@okstate.edu. Библ. 49
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.11.02 + 341.27.21.09.31.05
Рубрики: БАКТЕРИИ РИЗОСФЕРЫ
ПШЕНИЦА
DUGANELLA (BACT.)
TANTHINOBACTERIUM (BACT.)
PSEUDOMONAS (BACT.)
CELLVIBRIO (BACT.)
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК
ОПЕРАЦИОННЫЕ ТАКСОНОМИЧЕСКИЕ ЕДИНИЦЫ
ПРОДУКТИВНОСТЬ ПРОРОСТКОВ

Доп.точки доступа:
Habiger, Joshua

2.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI03) 13.10-04В4.59

    Anderson, Michael.
    Characterization and identification of productivity-associated rhizobacteria in wheat [Text] / Michael Anderson, Joshua Habiger // Appl. and Environ. Microbiol. - 2012. - Vol. 78, N 12. - P4434-4446 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Характеристика и определение ризобактерий, связанных с продуктивностью пшеницы
Аннотация: Ризосфера заселена различными бактериями, влияние к-рых на продуктивность растений часто неизвестно. С использованием пиросеквенирования 16S-рРНК описано бактериальное сообщество ризосферы пшеницы. Растения выращивали в теплице в гомогенизированной полевой почве. В рез-те экстракции и пиросеквенирования ДНК получено 29007 последовательностей. Идентифицированы операционные таксономич. единицы (ОТЕ), значимо связанные с продуктивностью биомассы проростков. ИЗ 710 ОТЕ у 42 обнаружили положительный ответ и у 39 - отрицательный. Наибольшая положительная связь (+) отмечена для Duganella, Janthinobacterium, Pseudomonas и Cellvibrio. Отрицательная связь (-) отмечена для Bacteria, Chryseobacterium, Proteobacteria и Enterobacter. Авт. заключают, что продуктивность биомассы проростков тесно связана с соотношением + и - ризобактерий. США, Dep. of Plant and Soil Sci., Oklahoma State Univ., Stillwater, Oklahoma. E-mail:michael.anderson@okstate.edu. Библ. 49
ГРНТИ  
68.35.29
ВИНИТИ 681.35.29.15.99
Рубрики: БАКТЕРИИ РИЗОСФЕРЫ
ПШЕНИЦА
DUGANELLA (BACT.)
TANTHINOBACTERIUM (BACT.)
PSEUDOMONAS (BACT.)
CELLVIBRIO (BACT.)
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК
ОПЕРАЦИОННЫЕ ТАКСОНОМИЧЕСКИЕ ЕДИНИЦЫ
ПРОДУКТИВНОСТЬ ПРОРОСТКОВ

Доп.точки доступа:
Habiger, Joshua

3.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 13.11-04Б3.175

    Anderson, Michael.
    Characterization and identification of productivity-associated rhizobacteria in wheat [Text] / Michael Anderson, Joshua Habiger // Appl. and Environ. Microbiol. - 2012. - Vol. 78, N 12. - P4434-4446 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Характеристика и определение ризобактерий, связанных с продуктивностью пшеницы
Аннотация: Ризосфера заселена различными бактериями, влияние к-рых на продуктивность растений часто неизвестно. С использованием пиросеквенирования 16S-рРНК описано бактериальное сообщество ризосферы пшеницы. Растения выращивали в теплице в гомогенизированной полевой почве. В рез-те экстракции и пиросеквенирования ДНК получено 29007 последовательностей. Идентифицированы операционные таксономич. единицы (ОТЕ), значимо связанные с продуктивностью биомассы проростков. ИЗ 710 ОТЕ у 42 обнаружили положительный ответ и у 39 - отрицательный. Наибольшая положительная связь (+) отмечена для Duganella, Janthinobacterium, Pseudomonas и Cellvibrio. Отрицательная связь (-) отмечена для Bacteria, Chryseobacterium, Proteobacteria и Enterobacter. Авт. заключают, что продуктивность биомассы проростков тесно связана с соотношением + и - ризобактерий. США, Dep. of Plant and Soil Sci., Oklahoma State Univ., Stillwater, Oklahoma. E-mail:michael.anderson@okstate.edu. Библ. 49
ГРНТИ  
68.03.07
ВИНИТИ 681.03.07.02
Рубрики: БАКТЕРИИ РИЗОСФЕРЫ
ПШЕНИЦА
DUGANELLA (BACT.)
TANTHINOBACTERIUM (BACT.)
PSEUDOMONAS (BACT.)
CELLVIBRIO (BACT.)
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК
ОПЕРАЦИОННЫЕ ТАКСОНОМИЧЕСКИЕ ЕДИНИЦЫ
ПРОДУКТИВНОСТЬ ПРОРОСТКОВ

Доп.точки доступа:
Habiger, Joshua

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.10-04Б2.90

   
    Analysis of the bacterial community in the two typical intertidal sediments of Bohai Bay, China by pyrosequencing [Text] / Liping Wang [et al.] // Mar. Pollut. Bull. - 2013. - Vol. 72, N 1. - P181-187 . - ISSN 0025-326X
Перевод заглавия: Анализ сообществ бактерий в двух типичных осадках зоны прилива в заливе Бохай (Китай) методом пиросеквенирования
Аннотация: Объектом изучения были сообщества бактерий (СБ) в осадках в 2 участках зоны прилива в заливе Бохай в Желтое море. Были выбраны участки в Qikou (Qi) и Gaoshaling (Ga). Анализ СБ был основан на пиросеквенировании генов 16S-рРНК. При интервале, равном 0,03, последовательности СБ и Qi обнаруживали 3252 операционных таксономич. единиц, принадлежащих 34 филумам, 69 классам и 110 родам. Те же показатели в Ga были: 33 филума, 66 классов и 146 родов. Подчеркиваются существенные различия в составе СБ на двух сходных участках. Канонический анализ соответствия показал. что наиболее существенными факторами, отличающимия Qi и Ga, были средний размер песчинок и содержание растворенного O[2]. Другие факторы среды давали меньший эффект
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.09 + 341.27.21.09.31.02
Рубрики: БАКТЕРИИ МОРСКИХ ОСАДКОВ
ПРИЛИВНАЯ ЗОНА ЖЕЛТОГО МОРЯ
БИОРАЗНООБРАЗИЕ
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК
РАЗМЕР ПЕСЧИНОК
СОДЕРЖАНИЕ РАСТВОРЕННОГО O[2]

Доп.точки доступа:
Wang, Liping; Liu, Lusan; Zheng, Binghui; Zhu, Yanzhong; Wang, Xing

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 14.11-04А2.31

   
    Analysis of the bacterial community in the two typical intertidal sediments of Bohai Bay, China by pyrosequencing [Text] / Liping Wang [et al.] // Mar. Pollut. Bull. - 2013. - Vol. 72, N 1. - P181-187 . - ISSN 0025-326X
Перевод заглавия: Анализ сообществ бактерий в двух типичных осадках зоны прилива в заливе Бохай (Китай) методом пиросеквенирования
Аннотация: Объектом изучения были сообщества бактерий (СБ) в осадках в 2 участках зоны прилива в заливе Бохай в Желтом море. Были выбраны участки в Qikou (Qi) и Gaoshaling (Ga). Анализ СБ был основан на пиросеквенировании генов 16S-рРНК. При интервале, равном 0,03, последовательности СБ в Qi обнаруживали 3252 операционные таксономич. единицы, принадлежащие 34 филумам, 69 классам и 110 родам. Те же показатели в Ga были: 33 филума, 66 классов и 146 родам. Подчеркиваются существенные различия в составе СБ на двух сходных участках. Канонический анализ соответствия показал. что наиболее существенными факторами, отличающимия Qi и Ga, были средний размер песчинок и содержание растворенного O[2]. Другие факторы среды давали меньший эффект
ГРНТИ  
34.35.33
ВИНИТИ 341.35.33.37.37.02
Рубрики: БАКТЕРИИ МОРСКИХ ОСАДКОВ
ПРИЛИВНАЯ ЗОНА ЖЕЛТОГО МОРЯ
БИОРАЗНООБРАЗИЕ
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК
РАЗМЕР ПЕСЧИНОК
СОДЕРЖАНИЕ РАСТВОРЕННОГО O[2]
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
МОРСКИЕ ЗАЛИВЫ

Доп.точки доступа:
Wang, Liping; Liu, Lusan; Zheng, Binghui; Zhu, Yanzhong; Wang, Xing

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 14.11-04Б3.132

   
    Analysis of the bacterial community in the two typical intertidal sediments of Bohai Bay, China by pyrosequencing [Text] / Liping Wang [et al.] // Mar. Pollut. Bull. - 2013. - Vol. 72, N 1. - P181-187 . - ISSN 0025-326X
Перевод заглавия: Анализ сообществ бактерий в двух типичных осадках зоны прилива в заливе Бохай (Китай) методом пиросеквенирования
Аннотация: Объектом изучения были сообщества бактерий (СБ) в осадках в 2 участках зоны прилива в заливе Бохай в Желтое море. Были выбраны участки в Qikou (Qi) и Gaoshaling (Ga). Анализ СБ был основан на пиросеквенировании генов 16S-рРНК. При интервале, равном 0,03, последовательности СБ и Qi обнаруживали 3252 операционных таксономич. единиц, принадлежащих 34 филумам, 69 классам и 110 родам. Те же показатели в Ga были: 33 филума, 66 классов и 146 родов. Подчеркиваются существенные различия в составе СБ на двух сходных участках. Канонический анализ соответствия показал. что наиболее существенными факторами, отличающимия Qi и Ga, были средний размер песчинок и содержание растворенного O[2]. Другие факторы среды давали меньший эффект
ГРНТИ  
34.27.39
ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: БАКТЕРИИ МОРСКИХ ОСАДКОВ
ПРИЛИВНАЯ ЗОНА ЖЕЛТОГО МОРЯ
БИОРАЗНООБРАЗИЕ
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК
РАЗМЕР ПЕСЧИНОК
СОДЕРЖАНИЕ РАСТВОРЕННОГО O[2]

Доп.точки доступа:
Wang, Liping; Liu, Lusan; Zheng, Binghui; Zhu, Yanzhong; Wang, Xing

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 15.10-04Б2.413

   
    Bacterial and archaeal diversities in Yunnan and Tibetan hot springs, China [Text] / Z. -Q. Song [et al.] // Environ. Microbiol. - 2013. - Vol. 15, N 4. - P1160-1175 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Разнообразие бактерий и архей в горячих источниках Юннаня и Тибета, Китай
Аннотация: Используя метод пиросеквенирования 16S-рРНК исследовали 16 горячих источников Юннань-Тибетской геотермальной системы (pH 3,2-8,6; т-ра 47-96'ГРАДУС'C). Значительная часть бактерий в них представлена Aquificae, Proteobacteria, Firmicutes, Deinococcus-Thermus и Bacteroidetes. В нейтральных и щелочных горячих источниках разнообразие и численность бактерий выше, чем в кислых. Из архей в большинстве некислых источников доминируют представители Desulfurococcales и Crenarchaeota с неясной таксономией, а в кислых - Sulfolobales и Thermoplasmata. Филогенетический анализ представителей Aquificae и Crenarchaeota выявил ряд филогенетических линий, к-рые ранее никогда не обнаруживали в горячих источниках Земли. Китай, Key Lab. of Microbial Diversity in Southwest China, Yunnan Inst. of Microbiology, Yunnan Univ., Kunming, 650091. Библ. 51
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.09 + 341.27.21.09.21.02
Рубрики: ПРОКАРИОТЫ
БАКТЕРИИ
АРХЕИ
ГОРЯЧИЕ ИСТОЧНИКИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК

Доп.точки доступа:
Song, Z.-Q.; Wang, F.-P.; Zhi, X.-Y.; Chen, J.-Q.; Zhou, E.-M.; Liang, F.; Xiao, X.; Tang, S.-K.; Jiang, H.-C.; Zhang, C.L.; Dong, H.; Li, W.-J.

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 15.10-04Б2.430

   
    Defining the functional potential and active community members of a sediment microbial community in a high-arctic hypersaline subzero spring [Text] / Chih-Ying Lay [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2013. - Vol. 79, N 12. - P3637-3648 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Определение функционального потенциала и активных членов микробного сообщества в осадках высокоширотного арктического (ниже нулевой температуры) сверхсоленого источника
Аннотация: Обследовали самый холодный и самый соленый известный источник Lost Hammer (LH) в Канадской Арктике (79'ГРАДУС'7' с.ш., 90'ГРАДУС'21' з.д.). Показали LH: -5'ГРАДУС'C, 24% солености, а также редуцирующие ('ЭКВИВ'-165 мВ), микрооксич. и олиготрофные условия. LH богат сульфатами, р-ренными H[2]S-сульфидами, аммиаком и метаном. Для анализа микробного сообщества (МС) LH применяли метагеномный анализ путем пиросеквенирования генов 16S-рРНК. Выявили участников биогеохимич. циклов: окислителей аммония (Thaumarchaeota), денитрификаторов (Pseudomonas spp.), восстановителей сульфата (Desulfobulbus spp.) и окислителей S (Thermoprotei). В МС были обнаружены гены стресса: адаптации к холоду, осмотич. и окислительному стрессам. Сравнили полученные данные с таковыми у МС из аналогичных местообитаний. Обнаружили сходство, особенно в генах обмена S и обеспечивающих состояние покоя. Получены данные по возможностям обмена в-в и активному МС в условиях сверхсолености и отрицательных т-р с возможным выходом на цели астробиологии. Канада, Dep. of Natural Res. Scis., McGill Univ. E-mail:LyleWhyte@mcgill.ca. Библ. 99
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.09 + 341.27.21.09.35
Рубрики: ПРОКАРИОТЫ-ЭКСТРЕМОФИЛЫ
THAUMARCHAEOTA (ARCH.)
PSEUDOMONAS SPP. (BACT.)
DEESULFOBULBUS SPP. (BACT.)
THERMOPROTEI (ARCH.)
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК
СВЕРХСОЛЕНЫЙ ВЫСОКОШИРОТНЫЙ ИСТОЧНИК
ТЕМПЕРАТУРА -5'ГРАДУС'

Доп.точки доступа:
Lay, Chih-Ying; Mykytczuk, Nadia C.S.; Yergeau, Etienne; Lamarche-Gagnon, Guillaume; Greer, Charles W.; Whyte, Lyle G.

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 15.10-04Б4.212

   
    Defining the functional potential and active community members of a sediment microbial community in a high-arctic hypersaline subzero spring [Text] / Chih-Ying Lay [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2013. - Vol. 79, N 12. - P3637-3648 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Определение функционального потенциала и активных членов микробного сообщества в осадках высокоширотного арктического (ниже нулевой температуры) сверхсоленого источника
Аннотация: Обследовали самый холодный и самый соленый известный источник Lost Hammer (LH) в Канадской Арктике (79'ГРАДУС'7' с.ш., 90'ГРАДУС'21' з.д.). Показали LH: -5'ГРАДУС'C, 24% солености, а также редуцирующие ('ЭКВИВ'-165 мВ), микрооксич. и олиготрофные условия. LH богат сульфатами, р-ренными H[2]S-сульфидами, аммиаком и метаном. Для анализа микробного сообщества (МС) LH применяли метагеномный анализ путем пиросеквенирования генов 16S-рРНК. Выявили участников биогеохимич. циклов: окислителей аммония (Thaumarchaeota), денитрификаторов (Pseudomonas spp.), восстановителей сульфата (Desulfobulbus spp.) и окислителей S (Thermoprotei). В МС были обнаружены гены стресса: адаптации к холоду, осмотич. и окислительному стрессам. Сравнили полученные данные с таковыми у МС из аналогичных местообитаний. Обнаружили сходство, особенно в генах обмена S и обеспечивающих состояние покоя. Получены данные по возможностям обмена в-в и активному МС в условиях сверхсолености и отрицательных т-р с возможным выходом на цели астробиологии. Канада, Dep. of Natural Res. Scis., McGill Univ. E-mail:LyleWhyte@mcgill.ca. Библ. 99
ГРНТИ  
34.27.29
ВИНИТИ 341.27.29.02
Рубрики: ПРОКАРИОТЫ-ЭКСТРЕМОФИЛЫ
THAUMARCHAEOTA (ARCH.)
PSEUDOMONAS SPP. (BACT.)
DEESULFOBULBUS SPP. (BACT.)
THERMOPROTEI (ARCH.)
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК
СВЕРХСОЛЕНЫЙ ВЫСОКОШИРОТНЫЙ ИСТОЧНИК
ТЕМПЕРАТУРА -5'ГРАДУС'

Доп.точки доступа:
Lay, Chih-Ying; Mykytczuk, Nadia C.S.; Yergeau, Etienne; Lamarche-Gagnon, Guillaume; Greer, Charles W.; Whyte, Lyle G.

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 16.07-04Б2.80

   
    Differences in bacterial community structure in two color morphs of the Hawaiian reef coral Montipora capitata [Text] / Amanda Shore-Maggio [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2015. - Vol. 81, N 20. - P3112-7318. - 43 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Различия в строении сообществ бактерий у двух морф коралла гавайских рифов Montipora capitata, отличающихся по окраске
Аннотация: Кораллы дают приют различным бактериальным сообществам (БС), вносящим вклад в здоровье хозяина. Сравнивали БС красной и оранжевой морфы гавайского коралла Montipora capitata. Анализ БС проводили с помощю пиросеквенирования 16S-рРНК. В обеих морфах выделялись общие преобладающие роды БС. При этом взвешенный и невзвешенный UniFrac-анализы показали различия в БС. Одиночная операционная таксономич. единица (ОТЕ), классифицированная как Vibrio, представляла собой самый весомый фактор различий между цветовыми формами. Эта ОТЕ составляла 35,4% ('+-'5,5%) в БС оранжевой морфы и 1,1% ('+-'0,6%) БС красной морфы. Проводили высевы эндофитов обеих морф, сравнивали высевы и определяли антибактериальную активность. 14 выявленных родов составляли 7% от родов, обнаруженных с помощью секвенирования. Только 2 высеваемых изолята давали совпадения с ОТЕ на основе данных секвенирования. Половина из испытанных изолятов (8 из 16) проявляли антибактериальную активность, направленную на другие высеваемые изоляты, но не на известные патогены M. capitata. Заключается, что специфичность бактериально-коралловых ассоциаций выходит за пределы отдельного вида коралла. Методом высева удалось показать как редкие, так и преобладающие члены БС. Вся их совокупность была показана с помощью секвенирования. США, Dep. of Microbiology, Univ. of Hawaii at Manoa, Honolulu. E-mail: scallaha@hawaii.edu
ГРНТИ  
34.27.23
ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: БАКТЕРИИ-ОБИТАТЕЛИ КОРАЛЛА MONTIPORA CAPITATA
ОТЛИЧАЮЩИЕСЯ ЦВЕТОМ МОРФЫ
VIBRIO (BACT.)
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК
UNI-FRAC-АНАЛИЗЫ
АНТИБАКТЕРИАЛЬНАЯ АКТИВНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Shore-Maggio, Amanda; Runyon, Christina M.; Ushijima, Blake; Aeby, Greta S.; Callahan, Sean M.

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 16.08-04Б2.47

   
    Effect of the Organic Loading Rate Increase and the Presence of Zeolite on Microbial Community Composition and Process Stability During Anaerobic Digestion of Chicken Wastes [Text] / Elvira E. Ziganshina [et al.] // Microbial Ecol. - 2015. - Vol. 70, N 4. - P948-960 . - ISSN 0095-3628
Перевод заглавия: Влияние возрастания степени нагрузки органикой и присутствия цеолита на состав микробного сообщества и его устойчивость при анаэробной переработке отходов птицефабрики
Аннотация: Исследовали работу мезофильного анаэробного биореактора на птицефабрике. Перерабатывали богатые аммонием стоки в отсутствие и в присутствии цеолита (I). Степень нагрузки органикой (ORL) возрастала от 1,0 до 3,5 г/л/день при постоянном времени гидравлической задержки в течение 35 дней. Изучали действие параметров анаэробного процесса на строение микробного сообщества (МС) и его динамику. Применяли пиросеквенирование гена 16S-рРНК. В реакторе с закрепленным слоем I на 87-й день удалялось до 12% общего аммонийного N (TAN). В подобном реакторе пониженные конц-ии летучих жирных к-т (VFA) отмечали при повышенных значениях ORL (3,2-3,5 г/л/день). МС в реакторе с I или без него было представлено в основном членами Bacteroidales и Methanobacterium sp. при умеренных уровнях TAN и VFA. Возрастание ORL сопровождалось накоплением TAN и VFA и возрастанием рН. В этих условиях преобладали представители сем. Erysipelotrichaceae и рр. Clostridium и Methanosarcina. Methanosarcina sp. составляли 94% и 57% всего МС в конце эксперимента в реакторе с I и в реакторе без I соответственно. С возрастанием в реакторе TAN, VFA и рН уменьшалось присутствие Synergistaceae и Crenarchaeota и возрастало присутствие Acholeplasmataceae
ГРНТИ  
34.27.17
ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.13
Рубрики: МИКРОБНЫЕ СООБЩЕСТВА
МЕЗОФИЛЬНЫЙ АНАЭРОБНЫЙ БИОРЕАКТОР
АРХЕИ
БАКТЕРИИ
ЗАКРЕПЛЕННЫЙ СЛОЙ ЦЕОЛИТА
АНАЭРОБНАЯ ПЕРЕРАБОТКА СТОКОВ ПТИЦЕФАБРИКИ
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК

Доп.точки доступа:
Ziganshina, Elvira E.; Belostotskiy, Dmitry E.; Ilinskaya, Olga N.; Boulygina, Eugenia A.; Grigoryeva, Tatiana V.; Ziganshin, Ayrat M.

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 16.08-04Б4.175

   
    Differences in bacterial community structure in two color morphs of the Hawaiian reef coral Montipora capitata [Text] / Amanda Shore-Maggio [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2015. - Vol. 81, N 20. - P3112-7318. - 43 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Различия в строении сообществ бактерий у двух морф коралла гавайских рифов Montipora capitata, отличающихся по окраске
Аннотация: Кораллы дают приют различным бактериальным сообществам (БС), вносящим вклад в здоровье хозяина. Сравнивали БС красной и оранжевой морфы гавайского коралла Montipora capitata. Анализ БС проводили с помощю пиросеквенирования 16S-рРНК. В обеих морфах выделялись общие преобладающие роды БС. При этом взвешенный и невзвешенный UniFrac-анализы показали различия в БС. Одиночная операционная таксономич. единица (ОТЕ), классифицированная как Vibrio, представляла собой самый весомый фактор различий между цветовыми формами. Эта ОТЕ составляла 35,4% ('+-'5,5%) в БС оранжевой морфы и 1,1% ('+-'0,6%) БС красной морфы. Проводили высевы эндофитов обеих морф, сравнивали высевы и определяли антибактериальную активность. 14 выявленных родов составляли 7% от родов, обнаруженных с помощью секвенирования. Только 2 высеваемых изолята давали совпадения с ОТЕ на основе данных секвенирования. Половина из испытанных изолятов (8 из 16) проявляли антибактериальную активность, направленную на другие высеваемые изоляты, но не на известные патогены M. capitata. Заключается, что специфичность бактериально-коралловых ассоциаций выходит за пределы отдельного вида коралла. Методом высева удалось показать как редкие, так и преобладающие члены БС. Вся их совокупность была показана с помощью секвенирования. США, Dep. of Microbiology, Univ. of Hawaii at Manoa, Honolulu. E-mail: scallaha@hawaii.edu
ГРНТИ  
34.27.29
ВИНИТИ 341.27.29.25.07
Рубрики: БАКТЕРИИ-ОБИТАТЕЛИ КОРАЛЛА MONTIPORA CAPITATA
ОТЛИЧАЮЩИЕСЯ ЦВЕТОМ МОРФЫ
VIBRIO (BACT.)
ПИРОСЕКВЕНИРОВАНИЕ 16S-РРНК
UNI-FRAC-АНАЛИЗЫ
АНТИБАКТЕРИАЛЬНАЯ АКТИВНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Shore-Maggio, Amanda; Runyon, Christina M.; Ushijima, Blake; Aeby, Greta S.; Callahan, Sean M.
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)