СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=МЕТАГЕНОМНОЕ<.>)

Общее количество найденных документов : 6
Показаны документы с 1 по 6

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.03-04Б2.41

Wilson, S. L.
Prospecting for ice association: Characterization of freeze-thaw selected enrichment cultures from latitudinally distant soils [Text] / S. L. Wilson, P. Grogan, V. K. Walker // Can. J. Microbiol. - 2012. - Vol. 58, N 4. - P402-412 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Исследования, связанные со льдом. Описание накопительных культур, отобранных под действием замораживания-оттаивания в почвах высоких широт
Аннотация: В качестве фактора отбора среди микробных сообществ (МС) использовали стресс, вызванный замораживанием-оттаиванием (ЗО). Получали высеваемые психротолерантные МС организмов, обитателей почв приарктического Канадского щита (плато). Для анализа МС до и после ЗО применяли колич. ПЦР-анализ 16S-рРНК и метагенномное секвенирование. Из 22 исходных родов МС после ЗО оставалось только 6. До начала отбора они не преобладали в составе МС. Выживших проверяли на торможение рекристаллизации льда и на способность образовывать центры нуклеации льда. Свыше 60% изолятов проявляли по меньшей мере одно из этих свойств. Подчеркнуто, что подобные фенотипы не составляли большинства в МС арктических почв. Стратегия накопительных культур с использованием ЗО показала функционально сходные МС в различных районах приарктического плато. Канада, Dep. of Biology, Queen's Univ., Kingston, ON K7L 3N6

ГРНТИ	34.27.19

ВИНИТИ 341.27.19.13.09 + 341.27.21.09.31.02
Рубрики: ПОЧВЕННЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ
ПРИАРАКТИЧЕСКИЙ КАНАДСКИЙ ЩИТ
ОТБОР ЗАМОРАЖИВАНИЕМ-ОТТАИВАНИЕМ
АНТИФРИЗНАЯ АКТИВНОСТЬ
НУКЛЕАЦИЯ ЛЬДА
РЕКРИСТАЛЛИЗАЦИЯ ЛЬДА
АНАЛИЗ 16S-РРНК
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР
МЕТАГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Grogan, P.; Walker, V.K.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.03-04Б2.52

Unveiling microbial life in the new deep-sea hypersaline Lake Thetis [Text]. Pt.II. A metagenomic study / M. Ferer [et al.] // Environ. Microbiol. - 2012. - Vol. 14, N 1. - P268-281 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Особенности существования микроорганизмов в недавно открытом глубоководном сверхсоленом озере Тетис. II. Метагеномное исследование
Аннотация: Предполагается, что недавно открытое в юго-восточной части Средиземного моря оз. Тетис может служить моделью ранней Земли. С помощью метагеномики впервые исследовали микробное сообщество (МС) оз. Тетис и особенности обмена в нем. Выявили контрастный состав МС и высокое число новых (candidate) таксонов. На границе рассол (РА)/морская вода были выявлены не менее 3 автотрофных путей усвоения CO[2], связанных с разветвленными путями S-цикла. В РА-МС были найдены гены редуктивных путей: ацетил-КоА и цикла трикарбоновых к-т. Подчеркивается роль автотрофии в экстремальной среде. Выявлены гены, кодирующие ферментативный путь RuBisCo. На границе сред были обнаружены гены, кодирующие 3 типа окисления S{2-}: мультиферментный комплекс Sox, катализирующий полное окисление S{2-} в SO[4]{2-}, следование по пути SOR сульфид:хинон-редуктаза для окисления S{2-} до S'ГРАДУС', которая в присутствии S{2-} может дальше восстанавливаться полисульфидредуктазами по 3-му пути. Наличие двух последних путей позволяет достигать максимальной энергетич. выгоды при окислении S{2-}, одновременно предупреждая подкисление и отложение S'ГРАДУС'. Италия, Lab. of Marine Molec. Microbiology, IAMC, CNR, Messina. E-mail:michail.yakimov@iamc.cnr.it

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09 + 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: СООБЩЕСТВА БАКТЕРИЙ
ХЕМОАВТОТРОФЫ
БИОРАЗНООБРАЗИЕ
МОРСКОЕ СВЕРХСОЛЕНОЕ ОЗЕРО
МЕТАГЕНОМНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
МЕТАБОЛИЧЕСКИЕ ПУТИ
РЕКОНСТРУКЦИЯ

Доп.точки доступа:
Ferer, M.; Werner, J.; Chernikova, T.N.; Bargiela, R.; Fernandez, L.; La, Cono V.; Waldmann, J.; Teeling, H.; Golyshina, O.V.; Glockner, F.O.; Yakimov, M.M.; Golyshin, P.N.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 13.06-04Б3.136

Unveiling microbial life in the new deep-sea hypersaline Lake Thetis [Text]. Pt.II. A metagenomic study / M. Ferer [et al.] // Environ. Microbiol. - 2012. - Vol. 14, N 1. - P268-281 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Особенности существования микроорганизмов в недавно открытом глубоководном сверхсоленом озере Тетис. II. Метагеномное исследование
Аннотация: Предполагается, что недавно открытое в юго-восточной части Средиземного моря оз. Тетис может служить моделью ранней Земли. С помощью метагеномики впервые исследовали микробное сообщество (МС) оз. Тетис и особенности обмена в нем. Выявили контрастный состав МС и высокое число новых (candidate) таксонов. На границе рассол (РА)/морская вода были выявлены не менее 3 автотрофных путей усвоения CO[2], связанных с разветвленными путями S-цикла. В РА-МС были найдены гены редуктивных путей: ацетил-КоА и цикла трикарбоновых к-т. Подчеркивается роль автотрофии в экстремальной среде. Выявлены гены, кодирующие ферментативный путь RuBisCo. На границе сред были обнаружены гены, кодирующие 3 типа окисления S{2-}: мультиферментный комплекс Sox, катализирующий полное окисление S{2-} в SO[4]{2-}, следование по пути SOR сульфид:хинон-редуктаза для окисления S{2-} до S'ГРАДУС', которая в присутствии S{2-} может дальше восстанавливаться полисульфидредуктазами по 3-му пути. Наличие двух последних путей позволяет достигать максимальной энергетич. выгоды при окислении S{2-}, одновременно предупреждая подкисление и отложение S'ГРАДУС'. Италия, Lab. of Marine Molec. Microbiology, IAMC, CNR, Messina. E-mail:michail.yakimov@iamc.cnr.it

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.21
Рубрики: СООБЩЕСТВА БАКТЕРИЙ
ХЕМОАВТОТРОФЫ
БИОРАЗНООБРАЗИЕ
МОРСКОЕ СВЕРХСОЛЕНОЕ ОЗЕРО
МЕТАГЕНОМНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
МЕТАБОЛИЧЕСКИЕ ПУТИ
РЕКОНСТРУКЦИЯ

Доп.точки доступа:
Ferer, M.; Werner, J.; Chernikova, T.N.; Bargiela, R.; Fernandez, L.; La, Cono V.; Waldmann, J.; Teeling, H.; Golyshina, O.V.; Glockner, F.O.; Yakimov, M.M.; Golyshin, P.N.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 13.06-04Б3.164

Wilson, S. L.
Prospecting for ice association: Characterization of freeze-thaw selected enrichment cultures from latitudinally distant soils [Text] / S. L. Wilson, P. Grogan, V. K. Walker // Can. J. Microbiol. - 2012. - Vol. 58, N 4. - P402-412 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Исследования, связанные со льдом. Описание накопительных культур, отобранных под действием замораживания-оттаивания в почвах высоких широт
Аннотация: В качестве фактора отбора среди микробных сообществ (МС) использовали стресс, вызванный замораживанием-оттаиванием (ЗО). Получали высеваемые психротолерантные МС организмов, обитателей почв приарктического Канадского щита (плато). Для анализа МС до и после ЗО применяли колич. ПЦР-анализ 16S-рРНК и метагенномное секвенирование. Из 22 исходных родов МС после ЗО оставалось только 6. До начала отбора они не преобладали в составе МС. Выживших проверяли на торможение рекристаллизации льда и на способность образовывать центры нуклеации льда. Свыше 60% изолятов проявляли по меньшей мере одно из этих свойств. Подчеркнуто, что подобные фенотипы не составляли большинства в МС арктических почв. Стратегия накопительных культур с использованием ЗО показала функционально сходные МС в различных районах приарктического плато. Канада, Dep. of Biology, Queen's Univ., Kingston, ON K7L 3N6

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.23
Рубрики: ПОЧВЕННЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ
ПРИАРАКТИЧЕСКИЙ КАНАДСКИЙ ЩИТ
ОТБОР ЗАМОРАЖИВАНИЕМ-ОТТАИВАНИЕМ
АНТИФРИЗНАЯ АКТИВНОСТЬ
НУКЛЕАЦИЯ ЛЬДА
РЕКРИСТАЛЛИЗАЦИЯ ЛЬДА
АНАЛИЗ 16S-РРНК
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР
МЕТАГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Grogan, P.; Walker, V.K.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 15.10-04Б1.22

Особенности исследований вирусов человека методами высокопроизводительного секвенирования [Текст] / Е. О. Рубальский [и др.] // Естеств. науки. - 2014. - N 4. - С. 100-108 . - ISSN 1818-507X
Аннотация: В обзоре рассматривается использование современных методов высокопроизводительного секвенирования (next generation sequencing, NGS) в исследованиях вирусов человека. Проанализированы и обобщены особенности NGS, возникающие в зависимости от поставленных практических задач при полногеномном секвенировании de novo, повторном секвенировании (ресеквенировании), секвенировании РНК, метагеномном секвенировании. Подходы NGS изложены с учетом ключевых проблем, важных для эффективного использования методов. Приведены некоторые особенности пробоподготовки, выделения нуклеиновых кислот, полногеномной амплификации, получения ампликонов, приготовления библиотек для секвенирования. Типовые этапы биоинформационного анализа данных NGS изложены с учетом прикладных задач медицинской вирусологии. Россия, Московский НИИ эпид. и микробиол. им. Г.Н. Габричевского, Москва. Библ. 31

ГРНТИ	34.25.05

ВИНИТИ 341.25.05.07 + 761.03.41.02
Рубрики: ВИРУСЫ ЧЕЛОВЕКА
ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ПОЛНОГЕНОМНОЕ
DE NOVO
РНК
МЕТАГЕНОМНОЕ
БИОИНФОРМАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
МЕДИЦИНСКИЕ АСПЕКТЫ
ОБЗОРЫ

Доп.точки доступа:
Рубальский, Е.О.; Тихонова, Н.Т.; Алешкин, В.А.; Чикобава, М.Г.; Афанасьев, С.С.; Рубальская, А.Ф.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 16.03-04Б2.38

Таксономический состав прокариот-ассоциантов галофильных протистов [Текст] / Е. А. Селиванова [и др.] // 6 Международная Верещагинская Байкальская конференция, Иркутск, 7-12 сент., 2015, 4 Байкальский микробиологический симпозиум с международным участием "Микроорганизмы и вирусы в водных экосистемах", Иркутск, 14-20 сент., 2015. - Иркутск, 2015. - С. 306-307. - 2 . - ISBN 978-5-4340-0050-5
Аннотация: Впервые методом 16S метагеномного секвенирования изучен таксономический состав прокариот-ассоциантов автотрофных и гетеротрофных протистов, выделенных из соленых водоемов Соль-Илецка и Приэльтонья. Важным фактором, определяющим таксономический состав прокариот в ассоциациях галофильных протистов, является уровень минерализации среды. В ассоциациях с гетеротрофными протистами таксономическое разнообразие прокариот выше, чем в ассоациях с автротрофными. Россия, Ин-т клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, Оренбург

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: ПРОКАРИОТЫ
ГАЛОФИЛЬНЫЕ ПРОТИСТЫ
ПРОК-АРИОТЫ-АССОЦИАНТЫ
ТАКСОНОМИЧЕСКИЙ СОСТАВ
МЕТОДЫ
16S МЕТАГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Селиванова, Е.А.; Гоголева, Н.Е.; Хлопко, Ю.А.; Плотников, А.О.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска