Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткий полный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=SYBR<.>)
Общее количество найденных документов : 28
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-28 
1.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 04.04-04А2.148

Автор(ы) : Halinen, Katrianna, Vaitomaa, Jaana, Rouhiainen, Leo, Lepisto, Liisa, Sivonen, Kaarina
Заглавие : Studying cyanobacteria in Finnish lakes by quantitative real-time PCR
Источник статьи : 5 European Workshop on the Molecular Biology of Cyanobacteria, Stockholm, June 9-12, 2002. - Stockholm, 2002. - С. 24
Аннотация: Для выявления "цветения" в водоемах токсичных цианобактерий оптимизировали систему Light Cycler O подсчета Anabaena с помощью количественной полимеразной р-ции в реальном времени (Quantitative Real-Time-PCR, QRT-ПЦР). Метод основан на мониторинге флуоресценции красителя SYBR зеленый I, связывающегося с ds-ДНК. Результаты подсчета цианобактерий с помощью QRT-ПЦР и под микроскопом показали положительную корреляцию. Порог чувствительности QRT-ПЦР при определении гена mcyE клеток Anabaena, образующих микроцистин, составлял 100 клеток при р-цию. Показали, что QRT-ПЦР является специфическим методом для количественного определения цианобактерий в озерной воде. Финляндия, Dep. of Appl. Chemistry and Microbiol., Univ. of Helsinki (E-mail: khainen@hotmail.com)
ГРНТИ : 34.35.33
Предметные рубрики: ANABAENA (BACT.)
КОЛИЧЕСТВЕННОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ
МИКРОЦИСТИН
ГЕН MCYE
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ КРАСИТЕЛЬ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ I
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
ЦВЕТЕНИЕ ВОДОЕМОВ
Дата ввода:
2.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.06-04Б2.100

Автор(ы) : Popoviciu, Dan Razvan, Ardelean Ioan I.
Заглавие : Bacterial abundance, biomass and proportion of living cells in littoral sandy sediments on the Romanian Black Sea Coast
Источник статьи : 11 International Multidisciplinary Scientific GeoConference and Expo "Surveying Geology and Mining Ecology Management" (SGEM 2011), Albena, 20-24 June, 2011. - Tokyo, 2011. - С. 14.01/995-14.01/1002
Аннотация: В 8 пробах, взятых с поверхности песчаного осадка (ОС) на Черноморском побережье Румынии, исследовали численность, биомассу, морфологич. характерстики методом флуоресцентной микроскопии SYBR зеленый I и физиологич. состояние бактерий (Б). Численность Б составляла 4,62-9,64 10{7} кл*см{-3} ОС и зависела от размеров частиц ОС. Биомасса (сухой вес) составляла 3,03-6,39 мкг*см{-3}. Среди Б доминировали палочки (57-65%), соотношение палочки:кокки коррелировало с гранулометрическим составом ОС. Значительная часть клеток характеризовались нарушенной мембраной, т.е. были мертвыми. Румыния, "Ovidius" Univ., Constanta
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: БАКТЕРИИ ПЕСЧАНЫХ ОСАДКОВ
ЛИТОРАЛЬ ЧЕРНОГО МОРЯ
БИОМАССА
МОРФОЛОГИЯ
ДОЛЯ ЖИВЫХ КЛЕТОК
ГРАНУЛОМЕТРИЯ ОСАДКОВ
ФЛУОРОХРОМ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ I
Дата ввода:
3.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.04-04Б2.104

Автор(ы) : Halinen, Katrianna, Vaitomaa, Jaana, Rouhiainen, Leo, Lepisto, Liisa, Sivonen, Kaarina
Заглавие : Studying cyanobacteria in Finnish lakes by quantitative real-time PCR
Источник статьи : 5 European Workshop on the Molecular Biology of Cyanobacteria, Stockholm, June 9-12, 2002. - Stockholm, 2002. - С. 24
Аннотация: Для выявления "цветения" в водоемах токсичных цианобактерий оптимизировали систему Light Cycler O подсчета Anabaena с помощью количественной полимеразной р-ции в реальном времени (Quantitative Real-Time-PCR, QRT-ПЦР). Метод основан на мониторинге флуоресценции красителя SYBR зеленый I, связывающегося с ds-ДНК. Результаты подсчета цианобактерий с помощью QRT-ПЦР и под микроскопом показали положительную корреляцию. Порог чувствительности QRT-ПЦР при определении гена mcyE клеток Anabaena, образующих микроцистин, составлял 100 клеток при р-цию. Показали, что QRT-ПЦР является специфическим методом для количественного определения цианобактерий в озерной воде. Финляндия, Dep. of Appl. Chemistry and Microbiol., Univ. of Helsinki (E-mail: khainen@hotmail.com)
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: ANABAENA (BACT.)
КОЛИЧЕСТВЕННОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ
МИКРОЦИСТИН
ГЕН MCYE
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ КРАСИТЕЛЬ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ I
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
ЦВЕТЕНИЕ ВОДОЕМОВ
Дата ввода:
4.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 04.04-04Б3.151

Автор(ы) : Halinen, Katrianna, Vaitomaa, Jaana, Rouhiainen, Leo, Lepisto, Liisa, Sivonen, Kaarina
Заглавие : Studying cyanobacteria in Finnish lakes by quantitative real-time PCR
Источник статьи : 5 European Workshop on the Molecular Biology of Cyanobacteria, Stockholm, June 9-12, 2002. - Stockholm, 2002. - С. 24
Аннотация: Для выявления "цветения" в водоемах токсичных цианобактерий оптимизировали систему Light Cycler O подсчета Anabaena с помощью количественной полимеразной р-ции в реальном времени (Quantitative Real-Time-PCR, QRT-ПЦР). Метод основан на мониторинге флуоресценции красителя SYBR зеленый I, связывающегося с ds-ДНК. Результаты подсчета цианобактерий с помощью QRT-ПЦР и под микроскопом показали положительную корреляцию. Порог чувствительности QRT-ПЦР при определении гена mcyE клеток Anabaena, образующих микроцистин, составлял 100 клеток при р-цию. Показали, что QRT-ПЦР является специфическим методом для количественного определения цианобактерий в озерной воде. Финляндия, Dep. of Appl. Chemistry and Microbiol., Univ. of Helsinki (E-mail: khainen@hotmail.com)
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: ANABAENA (BACT.)
КОЛИЧЕСТВЕННОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ
МИКРОЦИСТИН
ГЕН MCYE
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ КРАСИТЕЛЬ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ I
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
ЦВЕТЕНИЕ ВОДОЕМОВ
Дата ввода:
5.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 13.06-04А2.65

Автор(ы) : Popoviciu, Dan Razvan, Ardelean Ioan I.
Заглавие : Bacterial abundance, biomass and proportion of living cells in littoral sandy sediments on the Romanian Black Sea Coast
Источник статьи : 11 International Multidisciplinary Scientific GeoConference and Expo "Surveying Geology and Mining Ecology Management" (SGEM 2011), Albena, 20-24 June, 2011. - Tokyo, 2011. - С. 14.01/995-14.01/1002
Аннотация: В 8 пробах, взятых с поверхности песчаного осадка (ОС) на Черноморском побережье Румынии, исследовали численность, биомассу, морфологич. характерстики методом флуоресцентной микроскопии SYBR зеленый I и физиологич. состояние бактерий (Б). Численность Б составляла 4,62-9,64 10{7} кл*см{-3} ОС и зависела от размеров частиц ОС. Биомасса (сухой вес) составляла 3,03-6,39 мкг*см{-3}. Среди Б доминировали палочки (57-65%), соотношение палочки:кокки коррелировало с гранулометрическим составом ОС. Значительная часть клеток характеризовались нарушенной мембраной, т.е. были мертвыми. Румыния, "Ovidius" Univ., Constanta
ГРНТИ : 34.35.33
Предметные рубрики: БАКТЕРИИ ПЕСЧАНЫХ ОСАДКОВ
ЛИТОРАЛЬ ЧЕРНОГО МОРЯ
БИОМАССА
МОРФОЛОГИЯ
ДОЛЯ ЖИВЫХ КЛЕТОК
ГРАНУЛОМЕТРИЯ ОСАДКОВ
ФЛУОРОХРОМ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ I
Дата ввода:
6.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 13.08-04Б3.124

Автор(ы) : Popoviciu, Dan Razvan, Ardelean Ioan I.
Заглавие : Bacterial abundance, biomass and proportion of living cells in littoral sandy sediments on the Romanian Black Sea Coast
Источник статьи : 11 International Multidisciplinary Scientific GeoConference and Expo "Surveying Geology and Mining Ecology Management" (SGEM 2011), Albena, 20-24 June, 2011. - Tokyo, 2011. - С. 14.01/995-14.01/1002
Аннотация: В 8 пробах, взятых с поверхности песчаного осадка (ОС) на Черноморском побережье Румынии, исследовали численность, биомассу, морфологич. характерстики методом флуоресцентной микроскопии SYBR зеленый I и физиологич. состояние бактерий (Б). Численность Б составляла 4,62-9,64 10{7} кл*см{-3} ОС и зависела от размеров частиц ОС. Биомасса (сухой вес) составляла 3,03-6,39 мкг*см{-3}. Среди Б доминировали палочки (57-65%), соотношение палочки:кокки коррелировало с гранулометрическим составом ОС. Значительная часть клеток характеризовались нарушенной мембраной, т.е. были мертвыми. Румыния, "Ovidius" Univ., Constanta
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: БАКТЕРИИ ПЕСЧАНЫХ ОСАДКОВ
ЛИТОРАЛЬ ЧЕРНОГО МОРЯ
БИОМАССА
МОРФОЛОГИЯ
ДОЛЯ ЖИВЫХ КЛЕТОК
ГРАНУЛОМЕТРИЯ ОСАДКОВ
ФЛУОРОХРОМ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ I
Дата ввода:
7.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 16.09-04В5.47

Автор(ы) : Drab T., Svobodova E., Ripl J., Jarosova J., Rabenstein F., Melcher U., Kundu J.K.
Заглавие : SYBR green i based RT-qPCR assays for the detection of RNA viruses of cereals and grasses
Источник статьи : Crop and Pasture Sci. - 2014. - Vol. 65, N 12. - С. 1323-1328
Аннотация: Разработаны и оценены пары праймеров для обнаружения и подсчета пяти РНК-содержащих вирусов семейства Poaceae. Методом одноступенчатой количественной ОТ-ПЦР с детекцией SYBR green. Проанализированы образцы злаковых трав и зерновых культур, произрастающих в Чехии, и выявлены паттерны их инфицированности. Респ. Чехия, Div. Crop Protection & Plant Hlth., Crop Res. Inst., 16106 Prague.
ГРНТИ : 68.37.31
Предметные рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
РНК-СОДЕРЖАЩИЕ ВИРУСЫ
РАСТЕНИЯ СЕМ. POACEAE
СИСТЕМЫ ДЕТЕКЦИИ
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОТ-ПЦР
НА ОСНОВЕ SYBR GREEN
НАБОРЫ ПРАЙМЕРОВ
ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ
ИНФИЦИРОВАННОСТЬ ЗЛАКОВЫХ
ПАТТЕРНЫ
РЕСП. ЧЕХИЯ
Дата ввода:
8.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 13.05-04И4.12

Автор(ы) : Андреева А.Ю., Муханов В.с.
Заглавие : Метод прижизненной морфометрии ядерных эритроцитов рыб
Источник статьи : Гидробиол. ж. - 2012. - Т. 48, N 3. - С. 115-120
Аннотация: Разработан метод прижизненной морфометрии эритроцитов рыб с использованием витальных красителей. Для окраски ядер клеток применен флюорохром SYBR Green I. Сделаны фотографии эритроцитов в толстой капле, снимки проанализированы в компьютерной программе ImageJ 1.44p. Полученные значения длин большой и малой оси ядра и клетки усреднены и сопоставлены с результатами измерений на мазках крови, окрашенных по Паппенгейму. Различия не превышали 2%. Библ. 20
ГРНТИ : 34.33.33
Предметные рубрики: ЭРИТРОЦИТЫ
ЯДЕРНЫЕ ЭРИТРОЦИТЫ
МОРФОМЕТРИЧЕСКИЕ ПОКАЗАТЕЛИ
ПРИЖИЗНЕННЫЕ КРАСИТЕЛИ
SYBR GREEN I
РЫБЫ
Дата ввода:
9.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.07-04Б2.52

Автор(ы) : Andersson, Patiyan, Harris, Tegan, Tong Steven Y.C., Giffard Philip M.
Заглавие : Analysis of bla[SHV] codon 238 and 240 allele mixtures using Sybr green high-resolution melting analysis
Источник статьи : Antimicrob. Agents and Chemother. - 2009. - Vol. 53, N 6. - С. 2679-2683
Аннотация: Изоляты Klebsiella pneumoniae часто содержат сложную смесь аллелей bla[SHV]. Разработали высоко-разрешающий метод мелтинг-анализа полиморфизма кодонов 238 и 240. Метод позволяет обнаруживать аллели, кодирующие бета-лактамазы с минорным спектром активности, оценивать соотношении аллелей и выявлять отличия между одиночными и двойными мутантами. Австралия, Menzises School of Health Research, Inst. of Advanced Studies, Charles Darvin Univ., Darvin, Nothern Territory. Библ. 16
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: АЛЛЕЛИ
ГЕНЫ
ГЕНЫ BLA[SHV]
СООТНОШЕНИЕ
СМЕСЬ
КОДОНЫ
238
240
ПОЛИМОРФИЗМ
АНАЛИЗ
МЕТОДЫ
МЕЛТИНГ-АНАЛИЗ
SYBR-ЗЕЛЕНЫЙ
KLEBSIELLA PNEUNONIAE (BACT.)
Дата ввода:
10.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.04-04Б2.3

Автор(ы) : Samant, Suvidha, Sha, Qiong, Iyer, Anita, Dhabekar, Priti, Hahn, Dittmar
Заглавие : Quantification of Frankia in soils using SYBR Green based qPCR
Источник статьи : Syst. and Appl. Microbiol. - 2012. - Vol. 35, N 3. - С. 191-197
Аннотация: Разработан метод колич. ПЦР, основанный на SYBR зеленом, для количественного штамма кластеров 1 и 3 актиномицета Frankia в почвах. В качестве обратной затравки был создан праймер nifHr 158 в комбинации с прямым праймером nifHf1. При этом избирательно амплифицировался участок гена nifH у Frankia размером в 191 п.н. Это сочетание затравок было испытано на специфичность на отобранных чистых культурах. Кроме того, были проведены сравнительные анализы случайно отобранных клонов клоновой библиотеки, созданной с применением этих затравок к экстрактам почвенной ДНК. После выверки условий экстракции ДНК и определения эффективности экстракции, использованной для нормализации образцов, было определено число копий генов nifH, представляющих кластеры 1 и 3 Frankia в различных почвах. США, Texas State Univ., Dept. of Biology, San Marcos, TX 78666. E-mail:dh49@txstate.edu. Библ. 55
ГРНТИ : 34.27.05
Предметные рубрики: FRANKIA (ACTINOBACTERIA) (BACT.)
МЕТОД КОЛИЧЕСТВЕННОГО ОПРЕДЕЛЕНИЯ
ПОЧВЕННАЯ ДНК
ЗАТРАВКИ ДЛЯ NIFH
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР
SYBR ЗЕЛЕНЫЙ
Дата ввода:
11.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 16.05-04Б3.10

Автор(ы) : Ren, Dawei, Madsen, Jonas Stenlokke, Cruz-Perera, Claudia I, Bergmark, Lasse, Sorensen Soren J., Burmolle, Mette
Заглавие : High-Throughput Screening of Multispecies Biofilm Formation and Quantitative PCR-Based Assessment of Individual Species Proportions, Useful for Exploring Interspecific Bacterial Interactions
Источник статьи : Microbial Ecol. - 2014. - Vol. 68, N 1. - С. 146-154
Аннотация: В большинстве природных сред биопленки (БП) содержат многие виды, взаимодействующие как синергически, так и антагонистически. Взаимодействия в БП изучены мало. Предложен быстрый, чувствительный и воспроизводимый подход (I) к количественному выявлению видов бактерий в БП. I основан на Nunc-TSP lid-системе и окрашивании кристаллвиолетом. Относит. долю отдельных видов в составе БП, состоящей из 4 видов, оценивали, применив колич. ПЦР, основанную на флуоресценции SY BR Green I с избирательными затравками. Показали сильное синергистское взаимодействие в модельной 4-видовой БП. Наблюдали 3-кратное увеличение скорости формирования БП. Показали сильное преобладание 2 видов, Xanthomonas retroflexus и Paenibacillus amylolyticus. I может быть использован как стандартная процедура известного состава. I может иметь важное значение в колич. изучении микробного состава в микробных сообществах многовидовых БП как природных сред, так и при инфекционных заболеваниях. I может помочь в понимании мех-мов кооперации, конкуренции и приспособленности отдельных видов в смешанных по составу БП
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: МИКРОБНЫЕ БИОПЛЕНКИ
МОДЕЛИРОВАНИЕ
XANTHOMONAS RETROFLEXUS (BACT.)
PAENIBACILLUS AMYLOLYTICUS (BACT.)
ВЫЯВЛЕНИЕ ВИДОВОГО СОСТАВА
СИСТЕМА NUNC-TSP LID
КРИСТАЛЛВИОЛЕТ
ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР
КРАСИТЕЛЬ SYBR GREEN I
МЕЖВИДОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
Дата ввода:
12.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 15.12-04Б2.26

Автор(ы) : Kawaguchi, Yuko, Sugino, Tomohiro, Tabata, Makoto
Заглавие : Fluorescence imaging of microbe-containing particles shot from a two-stage light-gas gun into an aerogel
Источник статьи : Orig. Life and Evol. Bios. - 2014. - Vol. 44, N 1. - С. 43-60
Аннотация: Моделировали захват микробов из космоса на Японском опытном модуле Международной космической станции (миссия Tanpopo). Кремниевый аэрогель Lucentite с частицами, содержащими устойчивую к облучениям бактерию Deinococcus radiodurans, выдерживали в космосе в течение года. Опыты проводили в аппарате LGG, движущемся со скоростью 4,2 км/с. После возвращения аэрогеля частицы, содержащие бактерии, выявляли с помощью флуоресцентной микроскопии после окрашивания специфическим к ДНК флуоресцентным красителем SYBR зеленый - I. Показали, что опробованный метод позволял обнаруживать микробов, находившихся на орбите. Были также разработаны методы, позволяющие выделить из аэрогеля микробную ДНК и провести определение их видов, анализируя 16S-рРНК. Япония, A. yamagishi, Dep. of Applied Life Scis. School of Life Scis., Tokyo Univ. of pharmacy and Life Sciences, Horinouchi, Hachioji, Tokyo 192-0392 (E-mail: yamagish@ls.toyaku.ac.jp
ГРНТИ : 34.27.19 + 34.27.21
Предметные рубрики: DEINOCOCCUS RADIODURANS (BACT.)
ПРЕБЫВАНИЕ В КОСМОСЕ
КРЕМНИЕВЫЙ АЭРОГЕЛЬ
ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ КРАСИТЕЛЬ SYBR ЗЕЛЕНЫЙ-I
ВЫДЕЛЕНИЕ МИКРОБНОЙ ДНК
АНАЛИЗ 16S-РРНК
Дата ввода:
13.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 13.07-04Б3.7

Автор(ы) : Samant, Suvidha, Sha, Qiong, Iyer, Anita, Dhabekar, Priti, Hahn, Dittmar
Заглавие : Quantification of Frankia in soils using SYBR Green based qPCR
Источник статьи : Syst. and Appl. Microbiol. - 2012. - Vol. 35, N 3. - С. 191-197
Аннотация: Разработан метод колич. ПЦР, основанный на SYBR зеленом, для количественного штамма кластеров 1 и 3 актиномицета Frankia в почвах. В качестве обратной затравки был создан праймер nifHr 158 в комбинации с прямым праймером nifHf1. При этом избирательно амплифицировался участок гена nifH у Frankia размером в 191 п.н. Это сочетание затравок было испытано на специфичность на отобранных чистых культурах. Кроме того, были проведены сравнительные анализы случайно отобранных клонов клоновой библиотеки, созданной с применением этих затравок к экстрактам почвенной ДНК. После выверки условий экстракции ДНК и определения эффективности экстракции, использованной для нормализации образцов, было определено число копий генов nifH, представляющих кластеры 1 и 3 Frankia в различных почвах. США, Texas State Univ., Dept. of Biology, San Marcos, TX 78666. E-mail:dh49@txstate.edu. Библ. 55
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: FRANKIA (ACTINOBACTERIA) (BACT.)
МЕТОД КОЛИЧЕСТВЕННОГО ОПРЕДЕЛЕНИЯ
ПОЧВЕННАЯ ДНК
ЗАТРАВКИ ДЛЯ NIFH
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР
SYBR ЗЕЛЕНЫЙ
Дата ввода:
14.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 16.05-04Б1.132

Автор(ы) : Drab T., Svobodova E., Ripl J., Jarosova J., Rabenstein F., Melcher U., Kundu J.K.
Заглавие : SYBR green i based RT-qPCR assays for the detection of RNA viruses of cereals and grasses
Источник статьи : Crop and Pasture Sci. - 2014. - Vol. 65, N 12. - С. 1323-1328
Аннотация: Разработаны и оценены пары праймеров для обнаружения и подсчета пяти РНК-содержащих вирусов семейства Poaceae. Методом одноступенчатой количественной ОТ-ПЦР с детекцией SYBR green. Проанализированы образцы злаковых трав и зерновых культур, произрастающих в Чехии, и выявлены паттерны их инфицированности. Респ. Чехия, Div. Crop Protection & Plant Hlth., Crop Res. Inst., 16106 Prague.
ГРНТИ : 34.25.29 + 34.25.05
Предметные рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
РНК-СОДЕРЖАЩИЕ ВИРУСЫ
РАСТЕНИЯ СЕМ. POACEAE
СИСТЕМЫ ДЕТЕКЦИИ
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОТ-ПЦР
НА ОСНОВЕ SYBR GREEN
НАБОРЫ ПРАЙМЕРОВ
ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ
ИНФИЦИРОВАННОСТЬ ЗЛАКОВЫХ
ПАТТЕРНЫ
РЕСП. ЧЕХИЯ
Дата ввода:
15.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 15.12-04Б2.90

Автор(ы) : Ren, Dawei, Madsen, Jonas Stenlokke, Cruz-Perera, Claudia I, Bergmark, Lasse, Sorensen Soren J., Burmolle, Mette
Заглавие : High-Throughput Screening of Multispecies Biofilm Formation and Quantitative PCR-Based Assessment of Individual Species Proportions, Useful for Exploring Interspecific Bacterial Interactions
Источник статьи : Microbial Ecol. - 2014. - Vol. 68, N 1. - С. 146-154
Аннотация: В большинстве природных сред биопленки (БП) содержат многие виды, взаимодействующие как синергически, так и антагонистически. Взаимодействия в БП изучены мало. Предложен быстрый, чувствительный и воспроизводимый подход (I) к количественному выявлению видов бактерий в БП. I основан на Nunc-TSP lid-системе и окрашивании кристаллвиолетом. Относит. долю отдельных видов в составе БП, состоящей из 4 видов, оценивали, применив колич. ПЦР, основанную на флуоресценции SY BR Green I с избирательными затравками. Показали сильное синергистское взаимодействие в модельной 4-видовой БП. Наблюдали 3-кратное увеличение скорости формирования БП. Показали сильное преобладание 2 видов, Xanthomonas retroflexus и Paenibacillus amylolyticus. I может быть использован как стандартная процедура известного состава. I может иметь важное значение в колич. изучении микробного состава в микробных сообществах многовидовых БП как природных сред, так и при инфекционных заболеваниях. I может помочь в понимании мех-мов кооперации, конкуренции и приспособленности отдельных видов в смешанных по составу БП
ГРНТИ : 34.27.17 + 34.27.21
Предметные рубрики: МИКРОБНЫЕ БИОПЛЕНКИ
МОДЕЛИРОВАНИЕ
XANTHOMONAS RETROFLEXUS (BACT.)
PAENIBACILLUS AMYLOLYTICUS (BACT.)
ВЫЯВЛЕНИЕ ВИДОВОГО СОСТАВА
СИСТЕМА NUNC-TSP LID
КРИСТАЛЛВИОЛЕТ
ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР
КРАСИТЕЛЬ SYBR GREEN I
МЕЖВИДОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
Дата ввода:
16.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 08.11-04Н1.6

Автор(ы) : Маценко Н.Ю., Рыжикова В.С., Коваленко С.П.
Заглавие : Сравнение SYBR Green I и TaqMan форматов ПЦР в реальном времени для анализа дозы гена her2 в опухолях молочной железы человека
Источник статьи : Бюл. эксперим. биол. и мед. - 2008. - Т. 145, N 2. - С. 201-205
Аннотация: Проведен сравнительный анализ двух технологий ПЦР в реальном времени при оценке дозы гена her2 в опухолях молочной железы: с использованием флюоресцентного красителя SYBR Green I и специфического TaqMan зонда. По данным TaqMan анализа наибольшее увеличение дозы гена составило 10 раз, а по данным SYBR Green I - 5 раз. Установлено, что TaqMan технология позволяет достоверно определять количество матрицы в интервале, который соответствует 1-100 нг геномной ДНК, в то время как SYBR Green I анализ позволяет оценивать количество матрицы в интервале 2.5-40.0 нг. Увеличение дозы гена в 10 и более раз приводит к некорректной оценке кратности увеличения с использованием SYBR Green I. Результаты исследования демонстрируют, что для корректного определения дозы гена her2 предпочтительнее использовать TaqMan технологию. Россия. Лаб. генно-инженерных методов исслед. Ин-та молек. биол. и биофиз. СО РАМН, Новосибирск. Библ. 7
ГРНТИ : 76.29.49
Предметные рубрики: РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
ОНКОГЕНЫ
HER
ПЦР
SYBR GREEN 1
TAQMAN
IN VITRO
Дата ввода:
17.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.11-04Б2.4

Автор(ы) : Lebaron, Philippe, Parthuisot, Nathalie, Catala, Philippe
Заглавие : Comparison of blue nucleic acid dyes for flow cytometric enumeration of bacteria in aquatic systems
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 5. - С. 1725-1730
Аннотация: Проведено сравнение 7 голубых красителей, производимых Корпорацией Молекулярных зондов (Molecular Probes Inc.) (SYTO-9, -11, -13, -16, -BC, SYBR-I, -II) с 4,6-диамидино-2-фенилиндолом для подсчета живых и фиксированных бактерий в водных системах методом проточной цитометрии. SYBR-II и SYTO-9 наиболее эффективны для достижения цели в несоленых водах, и их можно применять к живым и фиксированным бактериям. При использовании SYTO-9 для окраски живых бактерий в несоленой воде улучшено соотношение сигнал/шум. Для образцов морской воды (с фиксированными и нефиксированными клетками) более пригоден краситель SYBR-II. Франция, Lab. ARAGO, BP44, F-66651 Banyuls-sur-Mer Cedex. E-mail: lebaron
ГРНТИ : 34.27.05
Предметные рубрики: МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ЗОНДЫ
SYTO
SYBR
DAPI
ЭФФЕКТИВНОСТЬ
СРАВНЕНИЕ
БАКТЕРИИ
ПОДСЧЕТ
ПРОТОЧНАЯ ЦИТОМЕТРИЯ
Дата ввода:
18.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 99.11-04Б3.26

Автор(ы) : Lebaron, Philippe, Parthuisot, Nathalie, Catala, Philippe
Заглавие : Comparison of blue nucleic acid dyes for flow cytometric enumeration of bacteria in aquatic systems
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 5. - С. 1725-1730
Аннотация: Проведено сравнение 7 голубых красителей, производимых Корпорацией Молекулярных зондов (Molecular Probes Inc.) (SYTO-9, -11, -13, -16, -BC, SYBR-I, -II) с 4,6-диамидино-2-фенилиндолом для подсчета живых и фиксированных бактерий в водных системах методом проточной цитометрии. SYBR-II и SYTO-9 наиболее эффективны для достижения цели в несоленых водах, и их можно применять к живым и фиксированным бактериям. При использовании SYTO-9 для окраски живых бактерий в несоленой воде улучшено соотношение сигнал/шум. Для образцов морской воды (с фиксированными и нефиксированными клетками) более пригоден краситель SYBR-II. Франция, Lab. ARAGO, BP44, F-66651 Banyuls-sur-Mer Cedex. E-mail: lebaron
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ЗОНДЫ
SYTO
SYBR
DAPI
ЭФФЕКТИВНОСТЬ
СРАВНЕНИЕ
БАКТЕРИИ
ПОДСЧЕТ
ПРОТОЧНАЯ ЦИТОМЕТРИЯ
Дата ввода:
19.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI34) 00.10-04Т4.47

Автор(ы) : Singer Victoria L., Lawlor Timothy E., Yue, Stephen
Заглавие : Comparison of SYBR{R} Green I nucleic acid gel stain mutagenicity and ethidium bromide mutagenicity in the Salmonella/mammalian microsome reverse mutation assay (Ames test)
Источник статьи : Mutat. Res. Genet. Toxicol. and Environ. Mutagen. - 1999. - Vol. 439, N 1. - С. 37-47
Аннотация: Высокочувствительный метод окрашивания нуклеиновых кислот в геле с помощью SYBR Green I (I) имеет ряд преимуществ в сравнении с применением этидиум бромида (ЭБ), известного интеркалятора. Изучена мутагенная активность обоих красителей в тестах Эймса: Сальмонелла/микросомы. Как и ожидалось, ЭБ проявил очень высокую мутагенную активность по индукции мутаций различных типов. I характеризовался очень незначительной мутагенной активностью, и, по-видимому, не является интеркалятором. США, Molecular Probes, 4849 Pitchford Avenue, Eugene, OR. Библ. 43
ГРНТИ : 34.47.03
Предметные рубрики: КРАСИТЕЛИ
SYBR CREEN I
ЭТИДИУМБРОМИД
МУТАГЕННАЯ АКТИВНОСТЬ
ТЕСТЫ ЭЙМСА
САЛЬМОНЕЛЛЫ
МИКРОСОМЫ
Дата ввода:
20.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 99.09-04Я6.223

Автор(ы) : Myers Mark A.
Заглавие : Direct measurement of cell numbers in microtitre plate cultures using the fluorescent dye SYBR green I
Источник статьи : J. Immunol. Meth. - 1998. - Vol. 212, N 1. - С. 99-103
Аннотация: В ячейках культуральных плашек клетки окрашивали связывающим ДНК флуоресцентным красителем SYBR-зеленым-1. Одностадийный метод обладает чувствительностью 1000 клеток в лунке при слабой флуоресценции фона (без ДНК) и близости спектров флуоресценции красителя со спектрами флуоресцеина. Метод позволяет нормировать данные соответственно результатам данным иммуноферментного анализа для цельных клеток. Метод применяется в отношении нефиксированных и фиксированных клеток; более высокая проницаемость для красителя фиксированных клеток увеличивает чувствительность метода. Австралия, Dep. Bioch. a. Mol. Biol., Monash Univ., Clayton, Victoria 3168. Библ. 7
ГРНТИ : 34.19.21
Предметные рубрики: БЕЛОК
РНК
ДНК
ЧИСЛО КЛЕТОК
ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ КРАСИТЕЛИ
SYBR-ЗЕЛЕНЫЙ-1
Дата ввода:
 1-20    21-28 
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)