СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=PPGPP<.>)

Общее количество найденных документов : 40
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 16.09-04Б2.178

Автор(ы) : Ancona, Veronica, Lee, Jae Hoon, Chatnaparat, Tiyakhon, Oh, Jinrok, Hong, Jong-In, Zhao, Youfu
Заглавие : The bacterial alarmone (p)ppGpp activates the type III secretion system in Erwinia amylovora
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2015. - Vol. 197, N 8. - С. 1433-1443
Аннотация: Система секреции типа III (T3SS) является ключевым фактором патогенности Erwinia amylovora. Ранее установлено, что T3SS E. amylovora транскрипционно регулируется каскадом сигма-фактора. Мутационный анализ гена алармона ppGpp показал, что экспрессия генов T3SS резко супрессируется у мутанта ppGpp, тогда как сверхэкспрессия гена ppGpp вызывает снижение размера клеток E. amylovora. Обсуждается роль алармона (p)ppGpp в активации T3SS через каскад сигма-фактора и регуляции вирулентности E. amylovora.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: СИСТЕМЫ СЕКРЕЦИИ
ТИП III
АКТИВАЦИЯ
АЛАРМОН
(P)PPGPP
ERWINIA AMYLOVORA (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 15.04-04Б4.125

Автор(ы) : He P., Deng C., Liu B., Zeng L., Zhao W., Zhang Y., Jiang X., Guo X., Qin J.
Заглавие : Characterization of a bifunctional enzyme with (p)ppGpp-hydrolase/synthase activity in Leptospira interrogans
Источник статьи : FEMS Microbiol. Lett. - 2013. - Vol. 348, N 2. - С. 133-142
Аннотация: Считается, что за изменения внутриклеточной конц-ии (р)ppGpp (I) у E. coli ответственны 2 гомолога, RelA и SpoT, в то время кау у грамположительных бактерий существует только единичный RelA/SpoT-фермент. У L. interrogans (L.i.) выявили бифункциональный белок с активностями I-гидролазы/синтазы, к-рый способен полностью комплементировать двойной relA/spoT-мутант E. coli. Он кодируется геном rel[Lin], белок функционирует в качестве I-деградазы и I-синтазы в условиях аминокислотного стресса L.i. и недостаточности С-источников. Способностью восстанавливать рост двойных мутантов E. coli обладают N-концевые HD и PSD домены. Очищенные полноразмерный белок и его N-домены проявляют высокую активность синтеза I in vitro. Обсуждают роль бифункционального белка Rel[Lin] у L.i. в поддержании базального уровня I для регуляции стрессового ответа. Китай, Inst. Med. Sci., Jiao Tong Univ. Sch. Med., Shanghai. Библ. 58
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: ГИДРОЛАЗЫ/СИНТАЗЫ
ТИП (P)PPGPP-ГИДРОЛАЗА/СИНТАЗА
ГЕНЫ
REL[LIN]
КЛОНИРОВАНИЕ
ЭКСПРЕССИЯ
LEPTOSPIRA INTERROGANS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.10-04Б2.188

Автор(ы) : Murdeshwar Maya S., Chatterji, Dipankar
Заглавие : MS-RHII-RSD, a dual-function RNase HII-(p)ppGpp synthetase from Mycobacterium smegmatis
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2012. - Vol. 194, N 15. - С. 4003-4014
Аннотация: Представлены биохимические и функциональные характеристики продукта гена MSMEG"849, кодирующего новую (p)ppGpp - cинтетазу у Mycobacterium smegmatis - MS'РО'HII-RSD. Установлено, что кроме способности синтезировать (p)ppGpp, фермент обладает и HРК-азной активностью, осуществляя гидролиз РНК : ДНК гибридов. Показано, что MS'РО'HII-RSD близок РНК-азам HII типа. Данный энзим конститутивно экспрессируется и функционирует in vivo, но in vitro проявляет себя как монофункциональная (p)ppGpp-синтетаза. Полагают, что MS'РО'HII-RSD обеспечивает взаимосвязь жизненно важных для клеток процессов репликации ДНК, репарации и транскрипции с высоко консервативными путями выживания в стрессовых условиях. Индия, Mol. Biophys. Unit, Indian Inst. Sci., Bangalore. Библ. 58
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ФЕРМЕНТЫ
БИФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ
(P)PPGPP-СИНТАЗА
РНКАЗЫ
РНК-АЗА HII
MYCOBACTERIUM SMEGMATIS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.11-04Б2.110

Автор(ы) : Seaton, Kinda, Ahn, Sang-Joon, Sagstetter Ann M., Burne Robert A.
Заглавие : A transcriptional regulator and ABC transporters link stress tolerance, (p)ppGpp, and genetic competence in Streptococcus mutans
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2011. - Vol. 193, N 4. - С. 862-874
Аннотация: С помощью биоинформативного анализа предсказали, что SMu0836 и SMu0837 кодируют АВС экспортеры, которые обозначили rcrPQ. Smu0835 (rcrR) кодирует трансркипционный регулятор семейства MarR. Используя обратно-транскриптазную ПЦР и количественную ПЦР, установили, что RcrR функционирует как аутогенный негативный регулятор экспрессии оперона rcrRPQ. Мутант, в котором имеется полярная инсерция, рос медленнее штамма дикого типа. Замена rcrR на неполярный маркер устойчивости к антибиотикам ('ДЕЛЬТА'835np), ведующая к сверхэкспрессии rcrPQ, привела к получению штамма, не трансформируемого эндогенной ДНК. Совокупность всех полученных результатов привела к заключению, что продукты генов rcrRPQ играют важную роль в физиологическом гомеостазе и толерантности к стрессу за счет связи метаболизма (p)ppGpp, толерантности к кислотному и окислительному стрессу и генетич. компетентности. США, Dep. of Oral Biology, College of Dentistry, Univ. of Florida, Gainesville, Florida 32610. Библ. 47
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ОПЕРОНЫ
ГЕНЫ АВС ЭКСПОРТЕРОВ RCRRPQ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ АУТОГЕННЫЙ НЕГАТИВНЫЙ РЕГУЛЯТОР RCRR
ТОЛЕРАНТНОСТЬ
СТРЕСС
МЕТАБОЛИЗМ (P)PPGPP СИНТАЗ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОМПЕТЕНТНОСТЬ
STREPTOCOCCUS MATUNS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.05-04Б2.180

Автор(ы) : Krol, Elizaveta, Becker, Anke
Заглавие : ppGpp in Sinorhizobium meliloti: biosynthesis in response to sudden nutritional downshifts and modulation of the transcriptome
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2011. - Vol. 81, N 5. - С. 1233-1254
Аннотация: Sinorhizobium meliloti отвечает на внезапный сдвиг к условиям голодания по азоту и углероду накоплением алармона ppGpp и ремоделированием транскриптомы. Продукт гена relA-RelSm имеет сходство с SpoT E. coli. С помощью сшивки промотор-egfp показали, что в Rm2011 relA экспрессируется с низкой скоростью с промотора proZ и со своего слабого промотора. Низкий уровень экспрессии физиологически объясним, поскольку сверхэкспрессия RelSm ингибирует накопление ppGpp. N-концевая часть RelSm требуется для деградации ppGpp и может участвовать в регуляции синтазной и гидролазной активности белка. Выявили, что репрессия генов домашнего хозяйства зависит от relA, тогда как активация мишени стрессового сигма фактора RpoE2 происходит независимо от relA. dksA требуется для relA-зависимой регуляции. Германия, Faculty of Biology and Center for Systems Biology. Univ. of Freiburg, Schanzlestr., 1, 79104, Freiburg
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: АЛАРМОН
PPGPP
НАКОПЛЕНИЕ
ГОЛОДАНИЕ
АЗОТ
УГЛЕРОД
ТРАНСКРИПТОМА
МОДУЛЯЦИЯ
SINORHIZOBIUM MELILOTI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.08-04Б4.161

Автор(ы) : Abranches, Jacqueline, Martinez Alaina R., Kajfasz Jessica K., Chavez, Violeta, Garsin Danielle A., Lemos Jose A.
Заглавие : The molecular alarmone (p)ppGpp mediates stress responses, vancomycin tolerance, and virulence in Enterococcus faecalis
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 7. - С. 2248-2256
Аннотация: Строгий ответ является глобальным ответом бактерий к стрессу, который опосредуется накоплением алармона (p)ppGpp. В данной работе показали, что лечение с помощью мупироцина индуцирует высокие уровни продукции (p)ppGpp у Enterococcus faecalis. Эти уровни показывают, что нозокомиальный патоген E. faecalis может продуцировать классический строгий ответ. Кроме того показали, что (p)ppGpp аккумулируется в клетках, подвергнутых тепловому шоку, воздействию щелочи или ингибирующих концентраций ванкомицина. Анализ последовательности генома E. faecalis показал, что синтез (p)ppGpp катализируется бифункциональной синтетазой/гидролазой RelA и небольшой синтазой. Изучение профилей (p)ppGpp у штаммов 'ДЕЛЬТА'relA, 'ДЕЛЬТА'relQ и 'ДЕЛЬТА'relAQ позволил обнаружить, что RelA является главным ферментом, ответственным за аккумуляцию (p)ppGpp при воздействии антибиотика или при воздействии физического стресса, тогда как RelQ, по-видимому, отвечает за поддержание базовых уровней алармона для поддержания гомеостаза в процессе роста бактерий. По сравнению с родительским штаммом 'ДЕЛЬТА'relA был более чувствителен к некоторым условиям стресса, тогда как полная элиминация (p)ppGpp в двойном мутанте 'ДЕЛЬТА'relAQ восстанавливал многие из стрессочувствительных фенотипов 'ДЕЛЬТА'relA. Кривые роста и изучение времени убийства показали, что толерантность к ванкомицину увеличилась в 'ДЕЛЬТА'relA, но уменьшилась в 'ДЕЛЬТА'relQ и 'ДЕЛЬТА'relAQ штаммах. Вирулентность 'ДЕЛЬТА'relAQ штаммах, но не 'ДЕЛЬТА'relA или 'ДЕЛЬТА'relQ была значительно уменьшена в Caenorhabditis elegans. Результаты данной работы показали, что пул (p)ppGpp модулирует ответы к стрессу окружающей среды, толерантность к ванкомицину и вирулентность у этого важного нозокомиального патогена. США, Center for Oral Biology and Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of Rochester Medical Center, Rochester, New York, 14642. Библ. 54
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: АЛАРМОН
PPGPP
АККУМУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ФЕРМЕНТ RELA
СТРЕСС
АНТИБИОТИКИ
ФИЗИЧЕСКИЙ СТРЕСС
ВИРУЛЕНТНОСТЬ
ТОЛЕРАНТНОСТЬ
ВАНКОМИЦИН
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ШТАММЫ 'ДЕЛЬТА'RELA
'ДЕЛЬТА'RELQ
'ДЕЛЬТА'RELAQ
ENTEROCOCCUS FAECALIS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.04-04Б2.148

Автор(ы) : Natori, Yousuke, Tagami, Kazumi, Murakami, Kana, Yoshida, Sawako, Tanigawa, Osamu, Moh, Yoonsuh, Masuda, Kenta, Wada, Tetsuya, Suzuki, Shota, Nanamiya, Hideaki, Tozawa, Yuzuru, Kawamura, Fujio
Заглавие : Transcription activity of individual rrn operons in Bacillus subtilis mutants deficient in (p)ppGpp synthetase genes, relA, yjbM, and ywaC
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 14. - С. 4555-4561
Аннотация: У Bacillus subtilis ген relA кодирует продукт, участвующий в синтезе и/или гидролизе (p)ppGpp. Мутация null в гене relA вызывает дефект роста, который может быть супрессирован посредством мутаций yjb M и/или ywaC, кодирующих небольшие (p)ppGpp синтетазы. Получили 35 супрессорных мутаций и классифицировали эти мутанты на две группы, либо yjb M, либо ywaC, с помощью картирования и секвенирования этих мутаций. Чтобы изучить в большей степени связь между RelA и синтезом рРНК изучили регуляцию транскрипции каждого из 7 оперонов рРНК (rrnO, -A, -J, -I, -E, -D, или -B) в мутанте relA после встраивания безпромоторного и безтерминаторного гена cat. Идентифицировали стартовые сайты транскрипции каждого оперона rrn. Обнаружили, что транскрипция всех оперонов rrn с промоторов P1 значительно уменьшилась в мутанте relA, тогда как уровень транскрипции полностью восстанавливался в тройном мутанте relAyjbMywaC. Результаты данной работы и результаты прежних исследований показали что внутриклеточная концентрация GTP уменьшалась в мутанте rel A, тогда как эта концентрация восстанавливалась в тройном мутанте, что показывает, что продолжительный синтез (p)ppGpp посредством YjbM и/или посредством YwaC на базальном уровне вызывает уменьшение количества внутриклеточной GTP. Япония, Lab. of Molecular Genetics and Res. Information Center for Extremophile, College of Sci., Rikkyo Univ., Toshima-ku, Nishiikebukuro 3-34-1, Tokyo 171-8501. Библ. 40
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОНЫ РРНК RRN
ТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕН YJBM
ГЕН YWA C
ГЕН REL A
ГЕНЫ (P)PPGPP ТРАНСКРИПТАЗ
МУТАЦИИ
(P)PPGPP
СИНТЕЗ
ВЛИЯНИЕ НА
GTP
ВНУТРИКЛЕТОЧНАЯ
КОЛИЧЕСТВО
BACILLUS SUBTILUS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.02-04Б4.103

Автор(ы) : Abranches, Jacqueline, Martinez Alaina R., Kajfasz Jessica K., Chavez, Violeta, Garsin Danielle A., Lemos Jose A.
Заглавие : The molecular alarmone (p)ppGpp mediates stress responses, vancomycin tolerance, and virulence in Enterococcus faecalis
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 7. - С. 2248-2256
Аннотация: Строгий ответ является глобальным ответом бактерий к стрессу, который опосредуется накоплением алармона (p)ppGpp. В данной работе показали, что лечение с помощью мупироцина индуцирует высокие уровни продукции (p)ppGpp у Enterococcus faecalis. Эти уровни показывают, что нозокомиальный патоген E. faecalis может продуцировать классический строгий ответ. Кроме того показали, что (p)ppGpp аккумулируется в клетках, подвергнутых тепловому шоку, воздействию щелочи или ингибирующих концентраций ванкомицина. Анализ последовательности генома E. faecalis показал, что синтез (p)ppGpp катализируется бифункциональной синтетазой/гидролазой RelA и небольшой синтазой. Изучение профилей (p)ppGpp у штаммов 'ДЕЛЬТА'relA, 'ДЕЛЬТА'relQ и 'ДЕЛЬТА'relAQ позволил обнаружить, что RelA является главным ферментом, ответственным за аккумуляцию (p)ppGpp при воздействии антибиотика или при воздействии физического стресса, тогда как RelQ, по-видимому, отвечает за поддержание базовых уровней алармона для поддержания гомеостаза в процессе роста бактерий. По сравнению с родительским штаммом 'ДЕЛЬТА'relA был более чувствителен к некоторым условиям стресса, тогда как полная элиминация (p)ppGpp в двойном мутанте 'ДЕЛЬТА'relAQ восстанавливал многие из стрессочувствительных фенотипов 'ДЕЛЬТА'relA. Кривые роста и изучение времени убийства показали, что толерантность к ванкомицину увеличилась в 'ДЕЛЬТА'relA, но уменьшилась в 'ДЕЛЬТА'relQ и 'ДЕЛЬТА'relAQ штаммах. Вирулентность 'ДЕЛЬТА'relAQ штаммах, но не 'ДЕЛЬТА'relA или 'ДЕЛЬТА'relQ была значительно уменьшена в Caenorhabditis elegans. Результаты данной работы показали, что пул (p)ppGpp модулирует ответы к стрессу окружающей среды, толерантность к ванкомицину и вирулентность у этого важного нозокомиального патогена. США, Center for Oral Biology and Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of Rochester Medical Center, Rochester, New York, 14642. Библ. 54
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: АЛАРМОН
PPGPP
АККУМУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ФЕРМЕНТ RELA
СТРЕСС
АНТИБИОТИКИ
ФИЗИЧЕСКИЙ СТРЕСС
ВИРУЛЕНТНОСТЬ
ТОЛЕРАНТНОСТЬ
ВАНКОМИЦИН
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ШТАММЫ 'ДЕЛЬТА'RELA
'ДЕЛЬТА'RELQ
'ДЕЛЬТА'RELAQ
ENTEROCOCCUS FAECALIS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.09-04Б4.77

Автор(ы) : Dalebroux Zachary D., Edwards Rachel L., Swanson Michele S.
Заглавие : SpoT governs Legionella pneumophila differentiation in host macrophages
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 71, N 3. - С. 640-658
Аннотация: В течение цикла жизни Legionella pneumophila изменяется между репликативным и трансмиссивным состояним. Чтобы определить вклад двух ppGpp-синтез RelA и SpoT в дифференциацию L. pneumophila разрушали эти ppGpp-синтезы в изучаемом микроорганизме. Синтез ppGpp был необходим для трансмиссии и мутанты relAspoT были убиты при входе в макрофаги и при выходе из макрофагов. Rel A, который реагирует на аминокислотное голодание, вызванное гидроксаматом серина, распределяется в макрофагах и мутанты relA распределяются в макрофагах эффективно. SpoT контролирует биосинтез жирных кислот (FAB). После обработки церулинином штамма дикого типа и штамма relA эти штаммы экспрессировали трансмиссивный ген fla A, но мутанты relAspoT не экспрессировали трансмиссивный ген fla A. Для ответа SpoT к изменениям FAB в Escherichia coli, вероятно, необходимо, взаимодействие с ацилированным белком-переносчиком, изученный с помощью штамма, в котором отсутствие аллели spoT-A413E обуславливало экспрессию трансмиссивного пути relAspoT бактерии. SpoT была существенной для трансмиссии между макрофагами, так как вторичные инфекции, вызываемые мутантами relAspoT, были восстановлены посредством индукции spo T, но не relA. Для осуществления репликации ppGpp должна быть гидролизована и мутанты, не имеющие spoT-гидролазной активности, не обладают способностью превращаться из трансмиссивной фазы в репликативную фазу в какой-либо бактериологической среде или макрофагах. L. pneumophila необходим SpoT, чтобы контролировать FAB и изменения между репликацией и трансмиссией в макрофагах. США, Dep. of. Microbiology and Immunology and Celluar and Molecular Biology Program, Univ. of Michigan Medical Sch., Ann Arbor, MI. И.Э.Б. Библ. 54
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: LEGIONELLA PNEUMOPHILA (BACT.)
ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ
РЕПЛИКАЦИЯ
ИЗМЕНЕНИЕ
ТРАНСМИССИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
PPGPP-СИНТЕЗА SPOT
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
БАКТЕРИИ-МАКРОФАГИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.12-04Б2.242

Автор(ы) : Das, Bhabatosh, Pal, Ritexh Ranjan, Bag, Satyabrata, Bhadra Rupak K.
Заглавие : Stringent response in Vibrio cholerae: Genetic analysis of spoT gene function and identification of a noevl (p)ppGpp synthetase gene
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 72, N 2. - С. 380-398
Аннотация: У грамотрицательных бактерий уровень (р)ppGpp в клетке контролируется белками RelA и SpoT. Однако мутант Vibrio cholerae 'ДЕЛЬТА'relA 'ДЕЛЬТА'spoT в условиях голодания по глюкозе или жирным кислотам сохраняет способность аккумулировать (p)ppGpp. Биоинформатическими методами анализ генома V. cholerae установлен ген, кодирующий маленький белок с (р)ppGpp-синтетазным доменом. Это тген оказался высококонсервативен в роде Vibrio. Этот ген назван relV. С помощью конплементационного анализа с использованием мутантов Escherichia coli 'ДЕЛЬТА'relA или 'ДЕЛЬТА'relA 'ДЕЛЬТА'spoT показано, что этот ген кодирует (p)ppGpp-синтетазу. Сконструирован тайронйо мутант V. cholerae 'ДЕЛЬТА'relA 'ДЕЛЬТА'spoT 'ДЕЛЬТА'relV, с его помощью доказано, что внутриклеточное содержание (p)ppGpp y V. cholerae регулируется продуктами трех этих генов, и эта регуляция достаточно сложная. Индия (Bharda R.K.) Infect. Diseae and Ummunol. Div., Inst. of Chem. Biol., Council of Sci. and Indust. Res., Kolkata 700 032. Библ. 44
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: СТРОГИЙ КОНТРОЛЬ
(P)PPGPP
ВНУТРИКЛЕТОЧНОЕ СОДЕРЖЕНИЕ
РЕГУЛЯЦИЯ
ПРОДУКТЫ ГЕНОВ
ГЕНЫ
ГЕН RELA
ГЕН SPOT
ГЕН (P)PPGPP-СИНТЕТАЗЫ RELV
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ФУНКЦИИ
VIBRIO CHOLERAE (BACT.)
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.10-04Б2.152

Автор(ы) : Lemke Justin J., Durfee, Tim, Gourse Richard L.
Заглавие : DksA and ppGpp directly regulate transcription of the Escherichia coli flagellar cascade
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 74, N 6. - С. 1368-1379
Аннотация: Установлено, что в клетках Escherichia coli, лишенных транскрипционных регуляторов DksA или ррGрр, наблюдаются изменения экспрессии компонентов жгутика, причем, описанные эффекты чаще всего непрямые и противоречивые. Показано, что активности промоторов всех трех уровней флагеллярного транскрипционного каскада существенно выше у штаммов, лишенных DksA, следствием чего является супрепродукция флагеллина и появление гиперфлагеллярных клеток. In vitro DksA/ppGpp ингибируют промотор flhDC и 'сигма'{70}-зависимый промотор fliA, транскрибирующий ген 'сигма'{28}. Однако, DksA и ppGpp не влияют на 'сигма'{28}-зависимый промотор fliA или на 'сигма'{28}-зависимый промотор fliC in vitro, то есть наблюдаемые in vivo эффекты DksA и ppGpp на экспрессию этих генов носят опосредованный характер через влияние DksA/ppGpp на экспрессию FlhDC и 'сигма'{28}. Полагают, что DksA/ppGpp ингибирует экспрессию флагеллярного каскада в стационарной фазе и при последующем голодании. Таким образом, осуществляется координация между образованием жгутиков и сборкой рибосом, а также сохраняются ограниченные энергетические ресурсы. США, Dept. Bcteriol., 1550 Linden Drive, Univ. Wisconsin-Madison, WI 53706. Библ. 53
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ЖГУТИКИ
БИОСИНТЕЗ
ГЕНЫ
ГЕНЫ БИОСИНТЕЗА ЖГУТИКОВ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ РЕГУЛЯТОРЫ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯТОР DKSA
PPGPP
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.12-04Б2.279

Автор(ы) : Persky Nicole S., Ferullo Daniel J., Cooper Deani L., Moore Hayley R., Lovett Susan T.
Заглавие : The ObgE/CgtA GTPase influences the stringent response to amino acid starvation in Escherichia coli
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 73, N 2. - С. 253-266
Аннотация: Жесткий ответ на стрессовые условия, как, например, дефицит аминокислот, важен для выживания бактерий и характеризуется накоплением ppGpp и pppGpp. ObgE (CgtA, YhbZ) является существенной консервативной ГТФазой у Escherichia coli и по некоторым наблюдениям этот белок участвует в контроле жесткого ответа. Показано, что in vitro ObgE связывается с ppGpp с биологически релевантной аффинностью, следовательно, ppGpp in vivo может быть лигандом ObgE. У мутантов obgE отмечено увеличение уровней ppGpp и pppGpp во время строгого ответа. Эти изменения коррелируют с отложенным завершением и началом репликации ДНК и снижением выживаемости после уменьшения аминокислот. Таким образом, ObgE предлагается рассматривать как активный эффектор ответа на дефицит аминокислот in vivo. Имеет место корреляция величины отношения ppGpp/pppGpp с контролем репликации ДНК в условиях недостатка питательных веществ, что предполагает важную роль баланса этих нуклеотидов в регуляции клеточного цикла. США, Dept. Biol., Brandeis Univ., Waltham, MA. Библ. 53
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ
ДНК
РЕПЛИКАЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
PPGPP/PPPGPP СООТНОШЕНИЕ
СТРЕСС
ДЕФИЦИТ АМИНОКИСЛОТ
ГТФАЗА
OBGE
ФУНКЦИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.02-04Б2.177

Автор(ы) : Nascimento Marcelle M., Lemos Jose A., Abranches, Jacqueline, Lin Vanessa K., Burne Robert A.
Заглавие : Role of RelA of Streptococcus mutans in global control of gene expression
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2008. - Vol. 190, N 1. - С. 28-36
Аннотация: Продукция (p) ppGpp у Streptococcus mutans UA159 катализируется посредством генных продуктов: RelA, RclP и RelQ. В данной работе исследовали роль RelA (Rel)-гомолога S. mutans в строгом ответе генов и глобальном контроле экспрессии генов. Показано, что RelA из S. mutans обуславливает образование pppGpp in vito из ГТФ и АТФ в отсутствии прибавления рибосом, также как in vivo в relA-spoT мутанте Escherichia coli. Показали, что мупироцин (MUP) индуцирует высокие уровни продукции (p) ppGpp в S. mutans посредством relA-зависимого способа с сопутствующим уменьшением в пуле ГТФ. Транскрипционные профили после воздействия MUP на микробные клетки S. mutans позволили обнаружить, что 104 гена были активированы и 130 генов были инактивированы (P'
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ СИНТЕЗА PPGPP RELA, RELP, RELQ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ГЛОБАЛЬНЫЙ РЕГУЛЯТОР ТРАНСКРИПЦИИ RELA
(P)PPGPP-СИНТАЗА
ФУНКЦИЯ
STREPTOCOCCUS MUTANS (BACT.)
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.07-04Б2.182

Автор(ы) : Harinarayanan, Rajendran, Murphy, Helen, Cashel, Michael
Заглавие : Synthetic growth phenotypes of Escherichia coli lacking ppGpp and transketolase A (tktA) are due to ppGpp-mediated transcriptional regulation of tktB
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2008. - Vol. 69, N 4. - С. 882-894
Аннотация: ppGpp участвует во многих физиологических адаптациях к изменениям питания. Используя случайный скрининг искусственных леталей, обнаружили ppGpp-зависимый функциональный путь, действующий через транскетолазу B (tktB) и который затруднен в штамме дикого типа присутствием изозима - транскетолазы А (TktA). Активность транскетолазы требуется в клетках для эритрозо-4-фосфата - предшественника ароматических аминокислот и витаминов. Выявили положительную транскрипционную регуляцию оперона talA-tktB под действием ppGpp. Полученные результаты показали существование RpoS-зависимых и RpoS-независимых моделей положительной регуляции под влиянием ppGpp, что подтвердил анализ мутаций spotT (spot-R39A), вызывающих дефект гидролазы, и супрессорных мутаций rpoB-A532'ДЕЛЬТА' или rpoB-T563P. США, Lab. of Mol. Genetics, Nat. Inst. of Child Health and Human Develop., Nat. Inst. of Health, Bethesda, MD 20892. Библ. 47
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОН TAL A=TKTB
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
PPGPP
ФЕРМЕНТЫ
ТРАНСКЕТОЛАЗА A
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.08-04Б4.188

Автор(ы) : Lemos Jose A., Nascimento Marcelle M., Lin Vanessa K., Abranches, Jacqueline, Burne Robert A.
Заглавие : Global regulation by (p)ppGpp and CodY in Streptococcus mutans
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2008. - Vol. 190, N 15. - С. 5291-5299
Аннотация: Ферменты Rel A, Rel P и RelQ отвечают за продукцию алармона (p) ppGpp в Streptococcus mutans. Штамм, который не содержит все три синтетазы ('ДЕЛЬТА' relAPQ), не растет в минимальной среде, не содержащей аминокислот с боковыми цепями (BCAA), лейцин или валин, но растет хорошо, если в среде отсутствует изолейцин. В данной работе исследовали корреляцию между ростом в отсутствии лейцина и валина с пулом (p) pp Gpp и активацией Cod Y. Используя комбинацию одиночных, двойных и тройных мутантов, не имеющих (p) ppGpp синтетаз, показали, что для роста в отсутствии лейцина или валина необходимы базальные уровни продукции (p) ppGpp с помощью Rel P и RelQ. Восстановление мутации cod Y в штамме 'ДЕЛЬТА' relAPQ полностью восстановило рост в среде, не содержащий лейцина или валина, что позволило обнаружить, что штамм 'ДЕЛЬТА' relAPQ, дефектный в отношении роста, был непосредственно связан с Cod Y. Уменьшение уровней GTP с помощью прибавления декоинина не увеличило репрессию CodY и не повлияло на экспрессию генов, участвующих в биосинтезе BCAA. Предположили, что CodY у S. mutans не активируется посредством GTP. Результаты фенотипических исследований позволили обнаружить, что мутант codY характеризуется уменьшенной способностью образовывать биопленки и рост этого мутанта более чувствителен к низкому pH. Предположили, что CodY играет роль в двух ключевых механизмах вирулентности S. mutans. Использование микрочипа позволило установить размер регулона Cod Y. Обнаружение предполагаемых CodY-связывающих боксов выше генов, которые инактивированы в мутанте codY, показало, что CodY может активизировать транскрипцию в S. mutans. США, Dep. of Microbiology and Immunology and Center for Oral Biology, Univ. of Rochester Medical Center, Rochester, New York 14642. Библ. 47
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: РОСТ
БАКТЕРИИ
ЛЕЙЦИН
ВАЛИН
ОТСУТСТВИЕ
КОРРЕЛЯЦИЯ
АЛАРМОНЫ
PPGPP
ПУЛ
БЕЛОК CODY
АКТИВАЦИЯ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
АКТИВАЦИЯ
STUPTOCOCCUS MUTANS (BACT.)
ОБРАЗОВАНИЕ
Дата ввода:

16.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.05-04Б2.179

Автор(ы) : Traxler Matthew F., Summers Sean M., Nguyen, Huyen-Tan, Zacharia Vineetha M., Hightower G.Aaron, Smith Joel T., Conway, Tyrrell
Заглавие : The global, ppGpp-mediated stringent response to amino acid starvation in Escherichia coli
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2008. - Vol. 68, N 5. - С. 1128-1148
Аннотация: Для оценки влияния ppGpp на экспрессию генов клетки дикого типа Escherichia coli и мультиауксотрофного мутанта relA spoT (ppGpp{0}) выращивали при недостатке изолейцина и с помощью микрочипов определяли изменения в транскрипционной активности генов. Ответ клеток дикого типа включает индукцию экспрессии генов основного стрессового ответа, снижение уровня транскрипции генов, участвующих в образовании макромолекулярных структур и общую перестройку экспрессии метаболических генов, однако, индукция генов биосинтеза аминокислот en masse отсутствовала. Ответ мутантного штамма ppGpp{0} существенно отличался. Кроме того, при недостатке изолейцина увеличивался размер клеток мутантного штамма и продолжительность роста, при этом накопление биомассы было на 50% больше, чем у клеток дикого типа, несмотря на то, что содержание белка было одинаково. Этот мутантный фенотип коррелировал с аберрантной экспрессией генов в различных процессах, включая репликацию ДНК, клеточное деление, биосинтез жирных кислот и мембран. Предлагается модель, которая охватывает и функционально объединяет ppGpp-зависимый обязательный ответ с контролем макромолекулярных синтезов и промежуточным метаболизмом. США, Advanced Center Genome Technology, Univ. Oklahoma, Norman, OK 73019). Библ. 65
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ИЗМЕНЕНИЯ
РЕГУЛЯТОРЫ ОТВЕТА
PPGPP
МАКРОМОЛЕКУЛЫ
СИНТЕЗ
АМИНОКИСЛОТЫ
ДЕФИЦИТ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ДИКИЙ ТИП
МУТАНТЫ RELA SPOT
СРАВНЕНИЕ
Дата ввода:

17.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.02-04Б4.120

Автор(ы) : Lemos Jose A., Nascimento Marcelle M., Lin Vanessa K., Abranches, Jacqueline, Burne Robert A.
Заглавие : Global regulation by (p)ppGpp and CodY in Streptococcus mutans
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2008. - Vol. 190, N 15. - С. 5291-5299
Аннотация: Ферменты Rel A, Rel P и RelQ отвечают за продукцию алармона (p) ppGpp в Streptococcus mutans. Штамм, который не содержит все три синтетазы ('ДЕЛЬТА' relAPQ), не растет в минимальной среде, не содержащей аминокислот с боковыми цепями (BCAA), лейцин или валин, но растет хорошо, если в среде отсутствует изолейцин. В данной работе исследовали корреляцию между ростом в отсутствии лейцина и валина с пулом (p) pp Gpp и активацией Cod Y. Используя комбинацию одиночных, двойных и тройных мутантов, не имеющих (p) ppGpp синтетаз, показали, что для роста в отсутствии лейцина или валина необходимы базальные уровни продукции (p) ppGpp с помощью Rel P и RelQ. Восстановление мутации cod Y в штамме 'ДЕЛЬТА' relAPQ полностью восстановило рост в среде, не содержащий лейцина или валина, что позволило обнаружить, что штамм 'ДЕЛЬТА' relAPQ, дефектный в отношении роста, был непосредственно связан с Cod Y. Уменьшение уровней GTP с помощью прибавления декоинина не увеличило репрессию CodY и не повлияло на экспрессию генов, участвующих в биосинтезе BCAA. Предположили, что CodY у S. mutans не активируется посредством GTP. Результаты фенотипических исследований позволили обнаружить, что мутант codY характеризуется уменьшенной способностью образовывать биопленки и рост этого мутанта более чувствителен к низкому pH. Предположили, что CodY играет роль в двух ключевых механизмах вирулентности S. mutans. Использование микрочипа позволило установить размер регулона Cod Y. Обнаружение предполагаемых CodY-связывающих боксов выше генов, которые инактивированы в мутанте codY, показало, что CodY может активизировать транскрипцию в S. mutans. США, Dep. of Microbiology and Immunology and Center for Oral Biology, Univ. of Rochester Medical Center, Rochester, New York 14642. Библ. 47
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: РОСТ
БАКТЕРИИ
ЛЕЙЦИН
ВАЛИН
ОТСУТСТВИЕ
КОРРЕЛЯЦИЯ
АЛАРМОНЫ
PPGPP
ПУЛ
БЕЛОК CODY
АКТИВАЦИЯ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
АКТИВАЦИЯ
STUPTOCOCCUS MUTANS (BACT.)
ОБРАЗОВАНИЕ
Дата ввода:

18.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.07-04Б2.205

Автор(ы) : Saito, Natsumi, Xu, Jun, Hosaka, Takeshi, Okamoto, Susumu, Aoki, Hiroyuki, Bibb Mervyn J., Ochi, Kozo
Заглавие : EshA accentuates ppGpp accumulation and is conditionally required for antibiotic production in Streptomyces coelicolor A3(2)
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2006. - Vol. 188, N 13. - С. 4952-4961
Аннотация: Разрушение гена eshA, кодирующего 52-кДа белок, продуцируемый в позднюю фазу роста Streptomyces coelicolor A3(2), ведет к прекращению продукции актинородина. Разрушение eshB, близкого гомолога eshA, не оказывает подобного эффекта на выход антибиотика. В мутанте eshA накопление ppGpp было намного ниже, чем в штамме дикого типа. Экспрессия укороченного гена повышала уровень ppGpp до уровня штамма дикого типа. Продукция антибиотика также восстанавливалась в мутанте eshA введением мутации в rpoB (кодирующего бета-субъединицу РНК полимеразы), что позволяло обойти потребность в ppGpp, в соответствии с ролью EshA в модуляции уровней ppGpp. EshA содержит нуклеотид-связывающий домен, необходимый для его роли в запуске продукции актинородина. Полученные результаты позволяют по-новому оценить молекулярные события во время физиологической дифференциации стрептококков. Япония, National Food Research Inst., Tsukuba, Ibaraki. Библ. 62
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: АНТИБИОТИКИ
СТРЕПТОМИЦИН
АКТИНОРОДИН
БИОСИНТЕЗ
ГЕНЫ
ГЕН СИНТЕЗА АКТИНОРОДИНА ESHA
ФУНКЦИЯ
PPGPP
НАКОПЛЕНИЕ
STREPTOMYCES COELICOLOR (BACT.)
Дата ввода:

19.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.12-04Б4.182

Автор(ы) : Nakanishi, Noriko, Abe, Hiroyuki, Ogura, Yoshitoshi, Hayashi, Tetsuy, Tashiro, Kosuke, Kuhara, Satoru, Sugimoto, Nakaba, Tobe, Toru
Заглавие : ppGpp with DksA controls gene expression in the locus of enterocyte effacement (LEE) pathogenicity island of enterohaemorrhagic Escherichia coli through activation of two virulence regulatory genes
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 61, N 1. - С. 194-205
Аннотация: Недостаток питательных веществ или остановка роста индуцируют ответную реакцию Escherichia coli через увеличение ppGpp. Установили, что способность к прикреплению энтерогеморрагических Escherichia coli (EHEC) и генная экспрессия локуса прикрепления энтероцитов (LEE) усиливаются при недостатке питания или входе в стационарную фазу роста, то есть при каждом событии, приводящем к увеличению ppGpp. Активация зависит от relA и spoT, кодирующих энзимы синтеза и деградации ppGpp, или dksA, кодирующего аксессорный белок РНК-полимеразы. При индукции экспрессии RelA, транскрипция гена LEE активируется в течение 20 минут, даже без голодания. Экспрессия транскрипционных регуляторов LEE - Ler и Pch, активируется ppGpp и важна для генной экспрессии LEE. Промоторы ler и pch непосредственно активируются ppGpp в системе транскрипции in vitro. Полученные данные привели к заключению, что регуляция генов вирулентности в EHEC объединена с системой ответа E. coli через регуляторные гены вирулентности. Япония, Division of Applied Microbiology, Graduate School of Med., Osaka Univ., Osaka 565-0871
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛКИ СИНТЕЗА PPGPP RELA, SPOT
БЕЛОК СТРОГОГО ОТВЕТА DKSA
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

20.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.08-04Б2.226

Автор(ы) : Nakanishi, Noriko, Abe, Hiroyuki, Ogura, Yoshitoshi, Hayashi, Tetsuy, Tashiro, Kosuke, Kuhara, Satoru, Sugimoto, Nakaba, Tobe, Toru
Заглавие : ppGpp with DksA controls gene expression in the locus of enterocyte effacement (LEE) pathogenicity island of enterohaemorrhagic Escherichia coli through activation of two virulence regulatory genes
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 61, N 1. - С. 194-205
Аннотация: Недостаток питательных веществ или остановка роста индуцируют ответную реакцию Escherichia coli через увеличение ppGpp. Установили, что способность к прикреплению энтерогеморрагических Escherichia coli (EHEC) и генная экспрессия локуса прикрепления энтероцитов (LEE) усиливаются при недостатке питания или входе в стационарную фазу роста, то есть при каждом событии, приводящем к увеличению ppGpp. Активация зависит от relA и spoT, кодирующих энзимы синтеза и деградации ppGpp, или dksA, кодирующего аксессорный белок РНК-полимеразы. При индукции экспрессии RelA, транскрипция гена LEE активируется в течение 20 минут, даже без голодания. Экспрессия транскрипционных регуляторов LEE - Ler и Pch, активируется ppGpp и важна для генной экспрессии LEE. Промоторы ler и pch непосредственно активируются ppGpp в системе транскрипции in vitro. Полученные данные привели к заключению, что регуляция генов вирулентности в EHEC объединена с системой ответа E. coli через регуляторные гены вирулентности. Япония, Division of Applied Microbiology, Graduate School of Med., Osaka Univ., Osaka 565-0871
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛКИ СИНТЕЗА PPGPP RELA, SPOT
БЕЛОК СТРОГОГО ОТВЕТА DKSA
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

1-20 21-40

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска