СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=PPGPP<.>)

Общее количество найденных документов : 40
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.04-04Б2.285

Автор(ы) : Zhang, Shuyu, Haldenwang W.G.
Заглавие : RelA is a component of the nutritional stress activation pathway of the Bacillus subtilis transcription factor 'сигма'{B}
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, N 19. - С. 5714-5721
Аннотация: В Bacillus subtilis стрессовый регулон индуцируется активацией транскрипционного фактора 'сигма'{B}. Представили доказательства с помощью инсерционного мутагенеза, что RelA, (p)ppGpp синтетаза, и ключевой фермент ответа на стресс, вызванный изменениями питания, играет важную роль в активации фактора 'сигма'{B}. Роль RelA в активации отличается от его участия в стрессовом ответе. Аминокислотные аналоги, индуцирующие ответ и RelA-зависимый синтез (p)ppGpp не запускают активность 'сигма'{B}. Ни миссенс мутации в relA, ни нуль мутации в гене rplK, ингибирующие ответ и RelA-зависимый синтез (p)ppGpp, не блокируют активацию 'сигма'{B} при недостатке глюкозы. США, Dep. of Microbiol. and Immunol., Univ. of Texas Health Sci. Center, San Antonio, Texas 78229-3900. Библ. 46
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: АДАПТАЦИЯ
ГОЛОДАНИЕ
МЕХАНИЗМ
ФЕРМЕНТЫ
(P)PPGPP СИНТАЗА
ФУНКЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ФАКТОР СИГМА B
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.10-04Б2.83

Автор(ы) : Wendrich Thomas M., Beckering Carsten L., Marahiel Mohamed A.
Заглавие : Characterization of the relAlspoT gene from Bacillus stearothermophilus
Источник статьи : FEMS Microbiol. Lett. - 2000. - Vol. 190, N 2. - С. 195-201
Аннотация: С помощью вырожденных праймеров амплифицирован фрагмент ДНК Bacillus stearothermophilus, гомологичный генам relA/spoT. "Прогулка по хромосоме" позволила секвенировать полноразмерный ген и его фланкирующие области. Предсказанная аминокислотная последовательность продукта гена relA/spoT B. stearothermophilus на 78% идентична таковой для одноименного пептида Bacillus subtilis и локусы обоих генов имеют одинаковую организацию. Ген rel B. stearothermophilus восстанавливает нормальный рост мутанта B. subtilis с делецией в relA. С помощью иммунохимического анализа был обнаружен рекомбинантный белок Rel[Bst] и продукт катализируемой им реакции - гуанозин-3-дифосфат-5-(три)дифосфат ((p)ppGpp) в условиях аминокислотного стресса и недостатка источников углерода. Полученные in vivo данные, генетическая организация и первичная структура других гомологов RelA/SpoT свидетельствуют о том, что идентифицированный ген кодирует (p)ppGpp-синтазу у B. stearothermophilus, кроме того полагают, что этот фермент выполняет функции (p)ppGpp-гидролазы. Германия, Dep. Chem., PhilippsUniv., D-35032 Marburg
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕН RELA/SPOT
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
(P)PPGPP - СИНТАЗА
БИФУНКЦИОНАЛЬНОСТЬ
BACILLUS SPEAROTHERMOPHILUS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.08-04Б2.341

Автор(ы) : Wei W., Jiang J., Yang S.S.
Заглавие : Mutagenesis and complementation of relA from Sinorhizobium meliloti 042BM as a salt tolerance involvement gene
Источник статьи : Ann. Microbiol. - 2004. - Vol. 54, N 3. - С. 317-324
Аннотация: Sinorhizobium melioti 042BM может расти при 0,6М концентрации NaCl. Сконструировали Tn5-инсерционную библиотеку S. melioti и провели скрининг солеустойчивых мутантов. У мутанта W9 ингибирование роста наступало при 0,2М NaCl. Мутацию отнесли к солечувствительным, а не осмочувствительным. Секвенирование локуса показало, что Tn5-1063a локализован в гене relA, кодирующем (p)ppGpp-синтетазу. Тест на комплементацию в Escherichia coli relA-мутанта позволил установить, что ген обладает (p)ppGpp-синтетазной активностью. Обнаружили нарушение симбиоза в мутанте relA S. melioti 042BM. Китай, Dep. of Microbiol., College of Biol. Sci., China Agricultural Univ., Beijing 100094, PR. Библ. 25
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: УСТОЙЧИВОСТЬ
СОЛЕВОЙ СТРЕСС
МЕХАНИЗМ
ФЕРМЕНТЫ
(P)PPGPP-СИНТЕТАЗА
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
SINORHIZOBIUM MELIOTI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.04-04Б2.148

Автор(ы) : Natori, Yousuke, Tagami, Kazumi, Murakami, Kana, Yoshida, Sawako, Tanigawa, Osamu, Moh, Yoonsuh, Masuda, Kenta, Wada, Tetsuya, Suzuki, Shota, Nanamiya, Hideaki, Tozawa, Yuzuru, Kawamura, Fujio
Заглавие : Transcription activity of individual rrn operons in Bacillus subtilis mutants deficient in (p)ppGpp synthetase genes, relA, yjbM, and ywaC
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 14. - С. 4555-4561
Аннотация: У Bacillus subtilis ген relA кодирует продукт, участвующий в синтезе и/или гидролизе (p)ppGpp. Мутация null в гене relA вызывает дефект роста, который может быть супрессирован посредством мутаций yjb M и/или ywaC, кодирующих небольшие (p)ppGpp синтетазы. Получили 35 супрессорных мутаций и классифицировали эти мутанты на две группы, либо yjb M, либо ywaC, с помощью картирования и секвенирования этих мутаций. Чтобы изучить в большей степени связь между RelA и синтезом рРНК изучили регуляцию транскрипции каждого из 7 оперонов рРНК (rrnO, -A, -J, -I, -E, -D, или -B) в мутанте relA после встраивания безпромоторного и безтерминаторного гена cat. Идентифицировали стартовые сайты транскрипции каждого оперона rrn. Обнаружили, что транскрипция всех оперонов rrn с промоторов P1 значительно уменьшилась в мутанте relA, тогда как уровень транскрипции полностью восстанавливался в тройном мутанте relAyjbMywaC. Результаты данной работы и результаты прежних исследований показали что внутриклеточная концентрация GTP уменьшалась в мутанте rel A, тогда как эта концентрация восстанавливалась в тройном мутанте, что показывает, что продолжительный синтез (p)ppGpp посредством YjbM и/или посредством YwaC на базальном уровне вызывает уменьшение количества внутриклеточной GTP. Япония, Lab. of Molecular Genetics and Res. Information Center for Extremophile, College of Sci., Rikkyo Univ., Toshima-ku, Nishiikebukuro 3-34-1, Tokyo 171-8501. Библ. 40
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОНЫ РРНК RRN
ТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕН YJBM
ГЕН YWA C
ГЕН REL A
ГЕНЫ (P)PPGPP ТРАНСКРИПТАЗ
МУТАЦИИ
(P)PPGPP
СИНТЕЗ
ВЛИЯНИЕ НА
GTP
ВНУТРИКЛЕТОЧНАЯ
КОЛИЧЕСТВО
BACILLUS SUBTILUS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.04-04Б2.210

Автор(ы) : Wehmeier, Lutz, Schafer, Andreas, Burkovski, Andreas, Kramer, Reinhard, Mechold, Undine, Malke, Horst, Puhler, Alfred, Kalinowski, Jorn
Заглавие : The role of the Corynebacterium glutamicum rel gene in (p)ppGpp metabolism
Источник статьи : Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 7. - С. 1853-1862
Аннотация: Методом ПЦР с вырожденными консенсусными праймерами выделен ген rel Corynebacterium glutamicum АТСС 13032. Ген имеет длину 2283 п. н. и кодирует белок длиной 760 остатков (м. м. 84400), высокогомологичный родственным белкам RelA и SpoT Escherichia coli, участвующим в биосинтезе и деградации (p)ppGpp. Ген rel C. glutamicum расположен с 3'-стороны от гена apt аденинфосфорибозилтрансферазы и открытой рами считывания, похожей на гены dciAE, кодирующие часть системы транспорта дипептидов у E. coli. Сконструирован мутант C. glutamicum с делецией в гене rel. Он не накапливает (p)ppGpp в ответ на аминокислотное голодание. При гиперэкспрессии в E. coli ген rel C. glutamicum устраняет ростовые дефекты, вызванные гиперэкспрессией гена relA. Высказано предположение, что ген rel кодирует бифункциональный фермент с активностями (p)ppGpp-синтетазы и деградации (p)ppGpp. Германия, Lehrstuhl Genet., Fak. Biol., Univ. Biclefeld, D-33501 Bielefeld. Библ. 52
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕН REL
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ В ГЕНОМЕ
ФУНКЦИИ
(P)PPGPP
МЕТАБОЛИЗМ
РЕГУЛЯЦИЯ
CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.12-04Б2.279

Автор(ы) : Persky Nicole S., Ferullo Daniel J., Cooper Deani L., Moore Hayley R., Lovett Susan T.
Заглавие : The ObgE/CgtA GTPase influences the stringent response to amino acid starvation in Escherichia coli
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 73, N 2. - С. 253-266
Аннотация: Жесткий ответ на стрессовые условия, как, например, дефицит аминокислот, важен для выживания бактерий и характеризуется накоплением ppGpp и pppGpp. ObgE (CgtA, YhbZ) является существенной консервативной ГТФазой у Escherichia coli и по некоторым наблюдениям этот белок участвует в контроле жесткого ответа. Показано, что in vitro ObgE связывается с ppGpp с биологически релевантной аффинностью, следовательно, ppGpp in vivo может быть лигандом ObgE. У мутантов obgE отмечено увеличение уровней ppGpp и pppGpp во время строгого ответа. Эти изменения коррелируют с отложенным завершением и началом репликации ДНК и снижением выживаемости после уменьшения аминокислот. Таким образом, ObgE предлагается рассматривать как активный эффектор ответа на дефицит аминокислот in vivo. Имеет место корреляция величины отношения ppGpp/pppGpp с контролем репликации ДНК в условиях недостатка питательных веществ, что предполагает важную роль баланса этих нуклеотидов в регуляции клеточного цикла. США, Dept. Biol., Brandeis Univ., Waltham, MA. Библ. 53
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ
ДНК
РЕПЛИКАЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
PPGPP/PPPGPP СООТНОШЕНИЕ
СТРЕСС
ДЕФИЦИТ АМИНОКИСЛОТ
ГТФАЗА
OBGE
ФУНКЦИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.02-04Б4.103

Автор(ы) : Abranches, Jacqueline, Martinez Alaina R., Kajfasz Jessica K., Chavez, Violeta, Garsin Danielle A., Lemos Jose A.
Заглавие : The molecular alarmone (p)ppGpp mediates stress responses, vancomycin tolerance, and virulence in Enterococcus faecalis
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 7. - С. 2248-2256
Аннотация: Строгий ответ является глобальным ответом бактерий к стрессу, который опосредуется накоплением алармона (p)ppGpp. В данной работе показали, что лечение с помощью мупироцина индуцирует высокие уровни продукции (p)ppGpp у Enterococcus faecalis. Эти уровни показывают, что нозокомиальный патоген E. faecalis может продуцировать классический строгий ответ. Кроме того показали, что (p)ppGpp аккумулируется в клетках, подвергнутых тепловому шоку, воздействию щелочи или ингибирующих концентраций ванкомицина. Анализ последовательности генома E. faecalis показал, что синтез (p)ppGpp катализируется бифункциональной синтетазой/гидролазой RelA и небольшой синтазой. Изучение профилей (p)ppGpp у штаммов 'ДЕЛЬТА'relA, 'ДЕЛЬТА'relQ и 'ДЕЛЬТА'relAQ позволил обнаружить, что RelA является главным ферментом, ответственным за аккумуляцию (p)ppGpp при воздействии антибиотика или при воздействии физического стресса, тогда как RelQ, по-видимому, отвечает за поддержание базовых уровней алармона для поддержания гомеостаза в процессе роста бактерий. По сравнению с родительским штаммом 'ДЕЛЬТА'relA был более чувствителен к некоторым условиям стресса, тогда как полная элиминация (p)ppGpp в двойном мутанте 'ДЕЛЬТА'relAQ восстанавливал многие из стрессочувствительных фенотипов 'ДЕЛЬТА'relA. Кривые роста и изучение времени убийства показали, что толерантность к ванкомицину увеличилась в 'ДЕЛЬТА'relA, но уменьшилась в 'ДЕЛЬТА'relQ и 'ДЕЛЬТА'relAQ штаммах. Вирулентность 'ДЕЛЬТА'relAQ штаммах, но не 'ДЕЛЬТА'relA или 'ДЕЛЬТА'relQ была значительно уменьшена в Caenorhabditis elegans. Результаты данной работы показали, что пул (p)ppGpp модулирует ответы к стрессу окружающей среды, толерантность к ванкомицину и вирулентность у этого важного нозокомиального патогена. США, Center for Oral Biology and Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of Rochester Medical Center, Rochester, New York, 14642. Библ. 54
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: АЛАРМОН
PPGPP
АККУМУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ФЕРМЕНТ RELA
СТРЕСС
АНТИБИОТИКИ
ФИЗИЧЕСКИЙ СТРЕСС
ВИРУЛЕНТНОСТЬ
ТОЛЕРАНТНОСТЬ
ВАНКОМИЦИН
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ШТАММЫ 'ДЕЛЬТА'RELA
'ДЕЛЬТА'RELQ
'ДЕЛЬТА'RELAQ
ENTEROCOCCUS FAECALIS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.08-04Б4.161

Автор(ы) : Abranches, Jacqueline, Martinez Alaina R., Kajfasz Jessica K., Chavez, Violeta, Garsin Danielle A., Lemos Jose A.
Заглавие : The molecular alarmone (p)ppGpp mediates stress responses, vancomycin tolerance, and virulence in Enterococcus faecalis
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 7. - С. 2248-2256
Аннотация: Строгий ответ является глобальным ответом бактерий к стрессу, который опосредуется накоплением алармона (p)ppGpp. В данной работе показали, что лечение с помощью мупироцина индуцирует высокие уровни продукции (p)ppGpp у Enterococcus faecalis. Эти уровни показывают, что нозокомиальный патоген E. faecalis может продуцировать классический строгий ответ. Кроме того показали, что (p)ppGpp аккумулируется в клетках, подвергнутых тепловому шоку, воздействию щелочи или ингибирующих концентраций ванкомицина. Анализ последовательности генома E. faecalis показал, что синтез (p)ppGpp катализируется бифункциональной синтетазой/гидролазой RelA и небольшой синтазой. Изучение профилей (p)ppGpp у штаммов 'ДЕЛЬТА'relA, 'ДЕЛЬТА'relQ и 'ДЕЛЬТА'relAQ позволил обнаружить, что RelA является главным ферментом, ответственным за аккумуляцию (p)ppGpp при воздействии антибиотика или при воздействии физического стресса, тогда как RelQ, по-видимому, отвечает за поддержание базовых уровней алармона для поддержания гомеостаза в процессе роста бактерий. По сравнению с родительским штаммом 'ДЕЛЬТА'relA был более чувствителен к некоторым условиям стресса, тогда как полная элиминация (p)ppGpp в двойном мутанте 'ДЕЛЬТА'relAQ восстанавливал многие из стрессочувствительных фенотипов 'ДЕЛЬТА'relA. Кривые роста и изучение времени убийства показали, что толерантность к ванкомицину увеличилась в 'ДЕЛЬТА'relA, но уменьшилась в 'ДЕЛЬТА'relQ и 'ДЕЛЬТА'relAQ штаммах. Вирулентность 'ДЕЛЬТА'relAQ штаммах, но не 'ДЕЛЬТА'relA или 'ДЕЛЬТА'relQ была значительно уменьшена в Caenorhabditis elegans. Результаты данной работы показали, что пул (p)ppGpp модулирует ответы к стрессу окружающей среды, толерантность к ванкомицину и вирулентность у этого важного нозокомиального патогена. США, Center for Oral Biology and Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of Rochester Medical Center, Rochester, New York, 14642. Библ. 54
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: АЛАРМОН
PPGPP
АККУМУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ФЕРМЕНТ RELA
СТРЕСС
АНТИБИОТИКИ
ФИЗИЧЕСКИЙ СТРЕСС
ВИРУЛЕНТНОСТЬ
ТОЛЕРАНТНОСТЬ
ВАНКОМИЦИН
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ШТАММЫ 'ДЕЛЬТА'RELA
'ДЕЛЬТА'RELQ
'ДЕЛЬТА'RELAQ
ENTEROCOCCUS FAECALIS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.05-04Б2.179

Автор(ы) : Traxler Matthew F., Summers Sean M., Nguyen, Huyen-Tan, Zacharia Vineetha M., Hightower G.Aaron, Smith Joel T., Conway, Tyrrell
Заглавие : The global, ppGpp-mediated stringent response to amino acid starvation in Escherichia coli
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2008. - Vol. 68, N 5. - С. 1128-1148
Аннотация: Для оценки влияния ppGpp на экспрессию генов клетки дикого типа Escherichia coli и мультиауксотрофного мутанта relA spoT (ppGpp{0}) выращивали при недостатке изолейцина и с помощью микрочипов определяли изменения в транскрипционной активности генов. Ответ клеток дикого типа включает индукцию экспрессии генов основного стрессового ответа, снижение уровня транскрипции генов, участвующих в образовании макромолекулярных структур и общую перестройку экспрессии метаболических генов, однако, индукция генов биосинтеза аминокислот en masse отсутствовала. Ответ мутантного штамма ppGpp{0} существенно отличался. Кроме того, при недостатке изолейцина увеличивался размер клеток мутантного штамма и продолжительность роста, при этом накопление биомассы было на 50% больше, чем у клеток дикого типа, несмотря на то, что содержание белка было одинаково. Этот мутантный фенотип коррелировал с аберрантной экспрессией генов в различных процессах, включая репликацию ДНК, клеточное деление, биосинтез жирных кислот и мембран. Предлагается модель, которая охватывает и функционально объединяет ppGpp-зависимый обязательный ответ с контролем макромолекулярных синтезов и промежуточным метаболизмом. США, Advanced Center Genome Technology, Univ. Oklahoma, Norman, OK 73019). Библ. 65
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ИЗМЕНЕНИЯ
РЕГУЛЯТОРЫ ОТВЕТА
PPGPP
МАКРОМОЛЕКУЛЫ
СИНТЕЗ
АМИНОКИСЛОТЫ
ДЕФИЦИТ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ДИКИЙ ТИП
МУТАНТЫ RELA SPOT
СРАВНЕНИЕ
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 16.09-04Б2.178

Автор(ы) : Ancona, Veronica, Lee, Jae Hoon, Chatnaparat, Tiyakhon, Oh, Jinrok, Hong, Jong-In, Zhao, Youfu
Заглавие : The bacterial alarmone (p)ppGpp activates the type III secretion system in Erwinia amylovora
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2015. - Vol. 197, N 8. - С. 1433-1443
Аннотация: Система секреции типа III (T3SS) является ключевым фактором патогенности Erwinia amylovora. Ранее установлено, что T3SS E. amylovora транскрипционно регулируется каскадом сигма-фактора. Мутационный анализ гена алармона ppGpp показал, что экспрессия генов T3SS резко супрессируется у мутанта ppGpp, тогда как сверхэкспрессия гена ppGpp вызывает снижение размера клеток E. amylovora. Обсуждается роль алармона (p)ppGpp в активации T3SS через каскад сигма-фактора и регуляции вирулентности E. amylovora.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: СИСТЕМЫ СЕКРЕЦИИ
ТИП III
АКТИВАЦИЯ
АЛАРМОН
(P)PPGPP
ERWINIA AMYLOVORA (BACT.)
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.12-04Б2.242

Автор(ы) : Das, Bhabatosh, Pal, Ritexh Ranjan, Bag, Satyabrata, Bhadra Rupak K.
Заглавие : Stringent response in Vibrio cholerae: Genetic analysis of spoT gene function and identification of a noevl (p)ppGpp synthetase gene
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 72, N 2. - С. 380-398
Аннотация: У грамотрицательных бактерий уровень (р)ppGpp в клетке контролируется белками RelA и SpoT. Однако мутант Vibrio cholerae 'ДЕЛЬТА'relA 'ДЕЛЬТА'spoT в условиях голодания по глюкозе или жирным кислотам сохраняет способность аккумулировать (p)ppGpp. Биоинформатическими методами анализ генома V. cholerae установлен ген, кодирующий маленький белок с (р)ppGpp-синтетазным доменом. Это тген оказался высококонсервативен в роде Vibrio. Этот ген назван relV. С помощью конплементационного анализа с использованием мутантов Escherichia coli 'ДЕЛЬТА'relA или 'ДЕЛЬТА'relA 'ДЕЛЬТА'spoT показано, что этот ген кодирует (p)ppGpp-синтетазу. Сконструирован тайронйо мутант V. cholerae 'ДЕЛЬТА'relA 'ДЕЛЬТА'spoT 'ДЕЛЬТА'relV, с его помощью доказано, что внутриклеточное содержание (p)ppGpp y V. cholerae регулируется продуктами трех этих генов, и эта регуляция достаточно сложная. Индия (Bharda R.K.) Infect. Diseae and Ummunol. Div., Inst. of Chem. Biol., Council of Sci. and Indust. Res., Kolkata 700 032. Библ. 44
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: СТРОГИЙ КОНТРОЛЬ
(P)PPGPP
ВНУТРИКЛЕТОЧНОЕ СОДЕРЖЕНИЕ
РЕГУЛЯЦИЯ
ПРОДУКТЫ ГЕНОВ
ГЕНЫ
ГЕН RELA
ГЕН SPOT
ГЕН (P)PPGPP-СИНТЕТАЗЫ RELV
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ФУНКЦИИ
VIBRIO CHOLERAE (BACT.)
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 96.11-04Б2.83

Автор(ы) : Scoarughi, Gian Luca, Cimmino, Carmen, Donini, Pierluigi
Заглавие : Lack of production of (p)ppGpp in Halobacterium volcanii under conditions that are effective in the eubacteria
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1995. - Vol. 177, N 1. - С. 82-85
Аннотация: В условиях температурного сдвига (при оптимальной температуре роста штамма 45'ГРАДУС'C использовали сдвиг к 31'ГРАДУС'C и 48'ГРАДУС'C), обработки цианидом, общего голодания и (как показано авт. ранее) при голодании по аминокислотам у Halobacterium volcanii DSM 3757 не образуется (p)ppGpp. В ходе экспоненциального роста в клетках обнаруживаются фосфорилированные соединения, похожие, но не идентичные по электрофоретической подвижности, на (p)ppGpp, в ходе стационарной фазы роста и при вышеуказанных воздействиях концентрация этих соединений значительно возрастает. Соединения идентифицированы как короткоцепочечные полифосфаты, идентичные таковым, найденным у Saccharomyces cerevisiae в сходных условиях. Италия, Dip. di Biol. Cellulare e dello Sviluppo, Univ. "La Sapienza", Rome
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: HALOBACTERIUM VOLCANII (BACT.)
ШТАММ DSM 3757
ТЕМПЕРАТУРНЫЙ СДВИГ
ОБРАБОТКА ЦИАНИДОМ
ОБЩЕЕ ГОЛОДАНИЕ
ГУАНОЗИНТЕТРАФОСФАТ
(P)PPGPP
ОТСУТСТВИЕ
ПОЛИФОСФАТЫ
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.02-04Б2.177

Автор(ы) : Nascimento Marcelle M., Lemos Jose A., Abranches, Jacqueline, Lin Vanessa K., Burne Robert A.
Заглавие : Role of RelA of Streptococcus mutans in global control of gene expression
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2008. - Vol. 190, N 1. - С. 28-36
Аннотация: Продукция (p) ppGpp у Streptococcus mutans UA159 катализируется посредством генных продуктов: RelA, RclP и RelQ. В данной работе исследовали роль RelA (Rel)-гомолога S. mutans в строгом ответе генов и глобальном контроле экспрессии генов. Показано, что RelA из S. mutans обуславливает образование pppGpp in vito из ГТФ и АТФ в отсутствии прибавления рибосом, также как in vivo в relA-spoT мутанте Escherichia coli. Показали, что мупироцин (MUP) индуцирует высокие уровни продукции (p) ppGpp в S. mutans посредством relA-зависимого способа с сопутствующим уменьшением в пуле ГТФ. Транскрипционные профили после воздействия MUP на микробные клетки S. mutans позволили обнаружить, что 104 гена были активированы и 130 генов были инактивированы (P'
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ СИНТЕЗА PPGPP RELA, RELP, RELQ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ГЛОБАЛЬНЫЙ РЕГУЛЯТОР ТРАНСКРИПЦИИ RELA
(P)PPGPP-СИНТАЗА
ФУНКЦИЯ
STREPTOCOCCUS MUTANS (BACT.)
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.01-04Б2.229

Автор(ы) : Metzger, Shula, Sarubbi, Edoardo, Glaser, Gad, Cashel, Michael
Заглавие : Protein sequences encoded by the relA and the spoT genes of Escherichia coli are interrelated
Источник статьи : J. Biol. Chem. - 1989. - Vol. 264, N 16. - С. 9122-9125
Аннотация: Сравнены предсказанные аминокислотные последовательности 2 белков Escherichia r coli, принимающих участие в метаболизме гаунозин-3',5'-биопирофосфата (I): RelA (II; 744 аминокислотных остатка) и SpoT (III; 702 аминокислотных остатка). II катализирует перенос 3'-пирофосфата между АТФ и ГТФ, а III является 3'-пирофосфогидролазой I. Показано, что II и III являются родственными белками: 219 аминок-тных остатков совпадают, а 308 замен являются консервативными. Это позволяет предположить, что гены relA и spoT произошли в результате дупликации-дивергенции общего гена-предка. II и III не родственны белкам InfA, InfB и FusA. Библ. 44. США, Lab. of Mol. Genet, Nat. Insf. ug Child Health and Human Develop, NIH, Bethesda, MD 20892.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ЭВОЛЮЦИЯ
ЭВОЛЮЦИЯ ГЕНОВ
МЕХАНИЗМ
ГЕНЫ
ГЕН PPGPPСИНТЕТАЗЫ I RELA
ГЕН ПИРОФОСФОГИДРОЛАЗЫ*3-SPOT
КЛОНИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ФЕРМЕНТЫ
PPGPP-СИНТЕТАЗА I
ПИРОФОСФОГИДРОЛАЗА*3
АМИНОКИСЛОТНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
СРАВНЕНИЕ
ГОМОЛОГИЯ
ГЕН-ПРЕДОК
СХОДСТВО
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.08-04Б2.226

Автор(ы) : Nakanishi, Noriko, Abe, Hiroyuki, Ogura, Yoshitoshi, Hayashi, Tetsuy, Tashiro, Kosuke, Kuhara, Satoru, Sugimoto, Nakaba, Tobe, Toru
Заглавие : ppGpp with DksA controls gene expression in the locus of enterocyte effacement (LEE) pathogenicity island of enterohaemorrhagic Escherichia coli through activation of two virulence regulatory genes
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 61, N 1. - С. 194-205
Аннотация: Недостаток питательных веществ или остановка роста индуцируют ответную реакцию Escherichia coli через увеличение ppGpp. Установили, что способность к прикреплению энтерогеморрагических Escherichia coli (EHEC) и генная экспрессия локуса прикрепления энтероцитов (LEE) усиливаются при недостатке питания или входе в стационарную фазу роста, то есть при каждом событии, приводящем к увеличению ppGpp. Активация зависит от relA и spoT, кодирующих энзимы синтеза и деградации ppGpp, или dksA, кодирующего аксессорный белок РНК-полимеразы. При индукции экспрессии RelA, транскрипция гена LEE активируется в течение 20 минут, даже без голодания. Экспрессия транскрипционных регуляторов LEE - Ler и Pch, активируется ppGpp и важна для генной экспрессии LEE. Промоторы ler и pch непосредственно активируются ppGpp в системе транскрипции in vitro. Полученные данные привели к заключению, что регуляция генов вирулентности в EHEC объединена с системой ответа E. coli через регуляторные гены вирулентности. Япония, Division of Applied Microbiology, Graduate School of Med., Osaka Univ., Osaka 565-0871
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛКИ СИНТЕЗА PPGPP RELA, SPOT
БЕЛОК СТРОГОГО ОТВЕТА DKSA
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

16.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.12-04Б4.182

Автор(ы) : Nakanishi, Noriko, Abe, Hiroyuki, Ogura, Yoshitoshi, Hayashi, Tetsuy, Tashiro, Kosuke, Kuhara, Satoru, Sugimoto, Nakaba, Tobe, Toru
Заглавие : ppGpp with DksA controls gene expression in the locus of enterocyte effacement (LEE) pathogenicity island of enterohaemorrhagic Escherichia coli through activation of two virulence regulatory genes
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 61, N 1. - С. 194-205
Аннотация: Недостаток питательных веществ или остановка роста индуцируют ответную реакцию Escherichia coli через увеличение ppGpp. Установили, что способность к прикреплению энтерогеморрагических Escherichia coli (EHEC) и генная экспрессия локуса прикрепления энтероцитов (LEE) усиливаются при недостатке питания или входе в стационарную фазу роста, то есть при каждом событии, приводящем к увеличению ppGpp. Активация зависит от relA и spoT, кодирующих энзимы синтеза и деградации ppGpp, или dksA, кодирующего аксессорный белок РНК-полимеразы. При индукции экспрессии RelA, транскрипция гена LEE активируется в течение 20 минут, даже без голодания. Экспрессия транскрипционных регуляторов LEE - Ler и Pch, активируется ppGpp и важна для генной экспрессии LEE. Промоторы ler и pch непосредственно активируются ppGpp в системе транскрипции in vitro. Полученные данные привели к заключению, что регуляция генов вирулентности в EHEC объединена с системой ответа E. coli через регуляторные гены вирулентности. Япония, Division of Applied Microbiology, Graduate School of Med., Osaka Univ., Osaka 565-0871
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛКИ СИНТЕЗА PPGPP RELA, SPOT
БЕЛОК СТРОГОГО ОТВЕТА DKSA
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

17.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.07-04Б2.202

Автор(ы) : Potrykus, Katarzyna, Wegrzyn, Grzegorz, Hernandez V.James
Заглавие : Multiple mechanisms of transcription inhibition by ppGpp at the 'лямбда'p[R] promoter
Источник статьи : J. Biol. Chem. - 2002. - Vol. 277, N 46. - С. 43785-43794
Аннотация: Условия стресса в бактериальной клетке вызывают клеточный ответ, названный строгим ответом. Первым этапом этого контроля является продукция больших количеств регуляторного нуклеотида - гуанозин-3',5'-(бис) пирофосфата (ppGpp). Недавно выдвинули гипотезу, что ppGpp действует через уменьшение стабильности открытых комплексов промоторов, производящих короткоживущие открытые комплексы, в том числе и pРНК-промоторы. В данной работе, однако, установили, что промотор бактериофага 'лямбда'p[R], который образует короткоживущие открытые комплексы, ингибируется ppGpp in vitro и in vivo. Провели систематическое исследование ингибирования инициации транскрипции 'лямбда'p[R] и обнаружили, что ppGpp не уменьшает стабильность открытых комплексов 'лямбда'p[R], оказывает только незначительное воздействие. Основной эффект ppGpp-опосредованного ингибирования заключается в уменьшении скорости выхода промотора. Результаты привели к заключению, что ингибирование инициации транскрипции не ограничено промоторами, производящими короткоживущие открытые комплексы. Начальным каталитическим шагом, ингибируемым ppGpp в 'лямбда'p[R], является образование первой фосфодиэфирной связи. Польша, Dep. of Molecular Biology, Univ. of Gdansk, Kladki 24, 80-822 Gdansk. Библ. 26Ы
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: УСТОЙЧИВОСТЬ
СТРЕСС
СТРОГИЙ ОТВЕТ
МЕХАНИЗМ
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ ЛАМБДА
СИНТЕЗ
ПРОМОТОРЫ
ПРОМОТОР ЛАМБДА P[R]
ИНГИБИРОВАНИЕ
PPGPP
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

18.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.04-04Б2.321

Автор(ы) : Ochi, Kozo
Заглавие : The tsr gene-coding plasmid pIJ702 prevents thiopeptin from inhibiting ppGpp synthesis in Streptomyces lividans
Источник статьи : FEMS Microbiol. Lett. - 1989. - Vol. 61, N 1-2. - С. 219-223
Аннотация: Шт. Streptomyces lividans накапливает большое кол-во ppGpp после переноса Кл. из полноценной среды в синтетическую. Этот процесс ингибируется в присутствии в синтетической среде небольших кол-в (5-10 mg/мл) тиопептина, аналога тиострептона. Однако шт. S. lividans, содержащий плазмиду pIJ702 с геном резистентности к тиострептону tsr, кодирующим метилазу 23S pРНК, способен накаливать большое кол-во ppGpp в присутствии 100 mg/мл тиопептина. Т. обр. метилирование рРНК этого шт. предотвращает ингибирование тиопептином роста Кл. и синтеза ppGpp. Эти данные позволили заключить, что наблюдаемый эффект у S. lividans также как и у E. coli и B. subfilis связан с функциями рибосом. Ил. 3. Библ. 20. Япония, Fujisawa Pharmaceutical Co., Ltd., Ibaraki, J.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: STREPTOMYCES LIVIDANS (BACT.)
БЕЛКИ
PPGPP
СИНТЕЗ
ПРИДОТВРАЩЕНИЕ ИНГИБИРОВАНИЯ
ТИОПЕПТИН
ГЕНЫ
ГЕН МЕТИЛИРОВАНИЯ РРНК TSR
КЛОНИРОВАНИЕ
ФУНКЦИИ
Дата ввода:

19.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.10-04Б2.188

Автор(ы) : Murdeshwar Maya S., Chatterji, Dipankar
Заглавие : MS-RHII-RSD, a dual-function RNase HII-(p)ppGpp synthetase from Mycobacterium smegmatis
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2012. - Vol. 194, N 15. - С. 4003-4014
Аннотация: Представлены биохимические и функциональные характеристики продукта гена MSMEG"849, кодирующего новую (p)ppGpp - cинтетазу у Mycobacterium smegmatis - MS'РО'HII-RSD. Установлено, что кроме способности синтезировать (p)ppGpp, фермент обладает и HРК-азной активностью, осуществляя гидролиз РНК : ДНК гибридов. Показано, что MS'РО'HII-RSD близок РНК-азам HII типа. Данный энзим конститутивно экспрессируется и функционирует in vivo, но in vitro проявляет себя как монофункциональная (p)ppGpp-синтетаза. Полагают, что MS'РО'HII-RSD обеспечивает взаимосвязь жизненно важных для клеток процессов репликации ДНК, репарации и транскрипции с высоко консервативными путями выживания в стрессовых условиях. Индия, Mol. Biophys. Unit, Indian Inst. Sci., Bangalore. Библ. 58
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ФЕРМЕНТЫ
БИФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ
(P)PPGPP-СИНТАЗА
РНКАЗЫ
РНК-АЗА HII
MYCOBACTERIUM SMEGMATIS (BACT.)
Дата ввода:

20.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.11-04Б2.205

Автор(ы) : Barker Melanie M., Gaal, Tamas, Josaitis Cathleen A., Gourse Richard L.
Заглавие : Mechanism of regulation of transcription initiation by ppGpp . I : Effects of ppGpp on transcription initiation in vivo and in vitro
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 2001. - Vol. 305, N 4. - С. 673-688
Аннотация: Изучали роль ppGpp в позитивной и негативной регуляции инициации транскрипции на экспоненциальной фазе роста Escherichia coli. С этой целью анализировали транскрипцию in vivo и in vitro с зависящего от скорости роста промотора (ПР) генов рРНК, rrnB P1 и с обратно пропорционально зависящих от скорости роста ПР генов биосинтеза аминокислот (ГБА)/транспортных белков PargI, PhisG, PlysC, PpheA, PthrABC и PlivJ. В штаммах 'ДЕЛЬТА'relA'ДЕЛЬТА'spoT, не способных синтезировать ppGpp, активность ПР rrnB P1 была выше, чем в штаммах дикого типа. ppGpp подавляет транскрипцию с ПР rrnB P1 in vitro. Активность ПР ГБА в штаммах 'ДЕЛЬТА'relA'ДЕЛЬТА'spoT была значительно ниже, чем в штаммах дикого типа, но ppGpp не влиял на эти ПР in vitro. Кинетический анализ in vitro показал, что на ПР ГБА открытые комплексы (ОК) формируются намного медленнее, и они "живут" дольше, чем ОК rrnB P1. ppGpp снижает время полужизни ОК на всех ПР. Т. обр., показано, что ppGpp прямо ингибирует транскрипцию, но только на ПР типа rrnB P1, которые формируют короткоживущие ОК. Стимуляция ПР ГБА происходит не прямо. Предложены модели позитивного контроля ПР ГБА ppGpp, которые могут объяснить необходимость ppGPP для прототрофности штаммов по аминокислотам. США, Dep. Bacteriol., Univ. Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706. Библ. 27
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
PPGPP
УЧАСТИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

1-20 21-40

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска