СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ORIC<.>)

Общее количество найденных документов : 62
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-62

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.05-04Б2.258

Автор(ы) : Bramhill, David, Kornberg, Arthur
Заглавие : A model for initiation at origins of DNA replication
Источник статьи : Cell. - 1988. - Vol. 25, N 7. - С. 915-918
Аннотация: Предложена модель инициации репликации хромосомы Escherichia coli в локусе oriC, постулирующая, что белок DnaA имеет 3 главных функции: он прочно связывается с 9-членными повторами (dnaA-боксами) с образованием инициационного комплекса; он эффективно расплавляет 3 АТ-богатых 13-членных повтора с образованием открытых комплексов и, наконец, он направляет DNaB-DnaC-комплекс в этот расплавленный район с образованием презатравочного комплекса. Последний развинчивает ДНК-матрицу, обеспечивая возможность осуществления двунаправленной репликации. Рассмотрены возможные инициационные события не только в локусе oriC хромосомы Е. соli, но и в других участках начала репликации, включая хромосому B. subtilis, плазмиды pSC101, F, P1, R1, R6К, Р4, RК2, СolЕ1, а также лямбдоидные фаги. Предполагается, что у эукариот роль АТ-богатых последовательностей в открывании дуплекса в точке ori сходна с тем, что имеет место для ДНК вируса SV40. В последнем случае локус ori прочно связывается с Т-антигеном, являющимся белком-инициатором, кодируемым самим вирусом, и служащим одновременно хеликазой, а также раскручивающим дуплекс ДНК в ori. Рассмотрена также роль регуляторных факторов, таких как АТР, белок DnaC, транскрипционная активация ori и прикрепление белка DnaA к мембране. Сделан вывод, что многие прокариотические ori напоминают локус oriC E. coli наличием необходимых АТ-богатых последовательностей, локализованных в виде тандемных повторов. Роль этих повторов, вероятно, состоит в первоначальном открывании ДНК-дуплекса белком-инициатором. Регуляторное действие белков типа DnaA E. coli состоит в активации транскрипции ori, связывании нуклеотидов, прикреплении к мембране и формировании репликативной вилки. Ил. 2. США, Stanford Univ. School of Medicine Stanford, CA 94305.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ
МОДЕЛЬ
УЧАСТКИ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC
БЕЛОК DNAA
ФУНКЦИИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.209

Автор(ы) : Hughes, Patrick, Landoulsi, Ahmed, Kohiyama, Masamichi
Заглавие : A novel role for cAMP in the control of the activity of the E. coli chromosome replication initiator protein, DnaA
Источник статьи : Cell. - 1988. - Vol. 55, N 2. - С. 343-350
Аннотация: Белок DnaA обладает выраженным сродством к АТФ и слабой ДНК-зависимой АТФ-азной активностью. АТФ активирует DnaA в качестве инициатора репликатора ДНК. В данной работе установлено, что белок DnaA связывается с цАМФ с К=1 мкМ, причем на молекуле белка находится 'ЭКВИВ'1,18 сайтов связывания с цАМФ. Взаимодействие с цАМФ стимулирует связывание DnaA с локусом oriC, а также промоторным районом mioC. В результате присоединения к цАМФ белок DnaA защищается от термоинактивации, а его реактивация происходит за счет быстрого выхода АДФ после каждого акта гидролиза АТФ. Показано, что добавление цАМФ к неактивным препаратам DnaA, связанного с АДФ, восстанавливает нормальную инициирующую активность белка и его способность к гидролизу АТФ. Предложена модель, по к-рой уровень клеточной цАМФ контролирует репликативную активность белка DnaA, обеспечивая превращение неактивного АДФ-DnaA комплекса в активный, связанный с АТФ. Ил. 7. Табл. 3. Библ. 28. Франция, Institut Jacques Monod Tour 43 Universite Paris VII 2 Place Jussieu 75251 Paris Cedex 05.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
АМФ ЦИКЛИЧЕСКИЙ
РОЛЬ
РЕПЛИКАЦИЯ
ORIC
ИНДУКЦИЯ
ДНК-СВЯЗЫВАЮЩИЕ БЕЛКИ
БЕЛОК DNAA - АДФ КОМПЛЕКС
АКТИВАЦИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.09-04Б2.447

Автор(ы) : Roland Jensen M., Lobner-Olesen A., Rasmussen K.V.
Заглавие : Absence of copy number control of minichromosomes
Источник статьи : J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N 13Д. - С. 139
Аннотация: Тезисы. Минихромосомы (МХ; плазмиды, использующие хромосомную область начала репликации oriC) имеют след. особенности: 1) повышенное число копий (ЧК) по сравнению с хромосомными ori C; 2) отсутствие несовместимости с хромосомами; 3) высокую частоту утраты. Разработан метод анализа распределения ЧК МХ в Кл E. coli, трансформированных МХ и растущих вплоть до достижения стационарного состояния. Для этого использована устойчивость отдельных Кл к тетрациклину и ампициллину. Показано, что эти Кл должны расти в течение очень большого числа генераций, прежде чем установится очень широкое распределение ЧК МХ, характерное для стационарного роста. Если МХ несут гены sop плазмиды F, установление распределения ЧК еще более сильно задерживается. Высказано предположение, что Кл E. coli не имеют механизма, непосредственно контролирующего ЧК хромосом или МХ. Дания, Inst. of Microbiol., Univ. of Copenhagen, 1953 Copenhagen.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
МИНИХРОМОСОМЫ
УЧАСТКИ ORIC
КОПИЙНОСТЬ ПЛАЗМИД
СЕГРЕГАЦИЯ ПЛАЗМИД
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.10-04Б2.563

Автор(ы) : Kuratomi K., Kobayashi Y.
Заглавие : Ap4А and its binding proteins regulate the topological conversion of oriC-containing pSY317 and SV40 DNAs
Источник статьи : J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N13Д. - С. 130
Аннотация: Изучали роль диаденозин-5',5"-P{1},P{4}-тетрафосфата (Аф4А) и связывающихся с ним белков при инициации репликации ДНК плазмиды pSY317 и вируса SV40 на участке инициации репликации oriC. Для этого из клеток E. coli были очищены 3 вида Аф4А-связывающих белков с мол. м. 64, 40 и 14 кД. Исследовали влияние различных факторов на процесс связывания Аф4А с этими белками. Обнаружено, что связывание усиливается некоторыми типами фосфолипидов (кардиолипин, фосфатидилхолин) и ингибируется другими (фосфоинозитиды, фосфоглицериды). Связывание Аф4А усиливалось также белком dnaA, участвующим в процессе инициации репликации ДНК с oriC. Показано также, что 40кД- и 14кД-белки в комплексе с Аф4А стимулируют активность топоизомеразы I на oriC-содержащих ДНК. Высказано предположение, что Аф4А-связывающие белки регулируют инициацию репликации oriC-содержащих ДНК путем взаимодействия с белком dnaA и топоизомеразой I. Библ. 2. Япония, Dep. of Biochemistry, Tokyo Medical College, Tokyo 160.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ДНК ПЛАЗМИДНАЯ
ДНК ВИРУСНАЯ
ЛОКУС ORIC
ДИАДЕНОЗИНТЕТРАФОСФАТ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛКИ СВЯЗЫВАЮЩИЕ ДИАДЕНОЗИНТЕТРАФОСФАТ
ТОПОИЗОМЕРАЗА I
БЕЛОК DNAA
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ
ПЛАЗМИД PSY317
ВИРУС SV40
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.04-04Б2.274

Автор(ы) : Asai, Tsuneaki, Bates David B., Boye, Erik, Kogoma, Tokio
Заглавие : Are minichromosomes valid model systems for DNA replication control? Lessons learned from Escherichia coli
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 29, N 3. - С. 671-675
Аннотация: Инициация хромосомной репликации является ключевым событием в жизненном цикле любого организма. Инициация хромосомной репликации микроорганизмов обычно исследуется с помощью плазмид, в составе к-рых клонирован участок начала хромосомной репликации. Последние исследования хромосомной репликации Escherichia coli, к-рые проводились на самой хромосоме с последовательным введением в нее определенных модификаций, показали, что потребности для инициации репликации в хромосомном oriC значительно отличаются от факторов, требуемых для ее инициации на клонированном oriC. Например, могут быть пересмотрены границы oriC. Белок Fis, абсолютно необходимый для плазмидной репликации с oriC, необходим для репликации хромосомы только при повышенных температурах. Норвегия, Dep. Cell Biol., Inst. Can. res., Montebello, 0310 Oslo. Библ. 27
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА
МИНИХРОМОСОМЫ
УЧАСТОК ORIC
КЛОНИРОВАНИЕ
СРАВНЕНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.188

Автор(ы) : Myllykallio, Hannu, Lopez, Philippe, Lopez-Garcia, Purificacion, Heilig, Roland, saurin, William, Zicvanovic, Yvan, Philippe, Herve, Forterre, Patrick
Заглавие : Bacterial mode of replication with eukaryotic-like machinery in a hyperthermophilic archaeon
Источник статьи : Science. - 2000. - Vol. 288, N 5474. - С. 2212-2215
Аннотация: Единственная область oriC начала двунаправленной репликации хромосомы у Pyrococcus abyssi идентифицирована методом компьютерного кумулятивного анализа распределения тетрануклеотидов ГГГТ и АЦЦЦ и выделением рано реплицирующегося сегмента хромосомы. Область oriC у 3 видов Pyrococcus высококонсервативна и не похожа на области oriC эубактерий. Вокруг oriC у Pyrococcus обнаружены гены репликации ДНК, похожие на эукариотические. Они кодируют ортологи белков, участвующих в стадиях инициации (Cdc6/Orc1) и элонгации (RF-C) репликации эукариотич. ДНК. Как и у Bacteria, область терминации транскрипции у Pyrococcus является горячей точкой перетасовок геномов. Таким образом, хотя белки репликации археев и бактерий различаются, они используются для одинаковой моды репликации хромосомы в обоих прокариотич. царствах. Франция, Inst. Genet. et Microbiol., Univ. Paris-Sud, 91405 Orsay. Библ. 27
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
МОДА
ОБЛАСТЬ НАЧАЛА ДВУНАПРАВЛЕННОЙ
РЕПЛИКАЦИИ ORIC
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕНЫ ИНИЦИАЦИИ CDC6/ORC1
ГЕНЫ ЭЛОНГАЦИИ RF-C
БЕЛКИ
СХОДСТВО
ЭУКАРИОТИЧЕСКИЕ БЕЛКИ
PYROCOCCUS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.226

Автор(ы) : Roos, Marco, van Geel Anton B.M., Aarsman Mirjam E.G., Veuskens Jacques T.M., Woldringh Conrad L., Nanninga, Nanne
Заглавие : Cellular localization of oriC during the cell cycle of Escherichia coli as analysed by fluorescent in situ hybridization : Pap. Bacter. Cell Cycle Meet., Abondance, 10-14 March, 1999
Источник статьи : Biochimie. - 1999. - Vol. 81, N 8-9. - С. 797-802
Аннотация: С помощью флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) определяли положение участка начала репликации oriC Escherichia coli K12. Клетки выращивали до достижения стационарной фазы со временем удвоения 79 мин при 28'ГРАДУС'C. В этих условиях репликация ДНК начинается на 33 мин предыдущего цикла. Новая клетка содержит 2 участка начала репликации, которые видны в виде 2 отдельных фокусов. Число фокусов возрастает с увеличением длины клетки. Расстояние от фокуса до ближайшего клеточного полюса определяли в клетках различной длины. Предполагается, что 2 наиболее близких к поверхности фокуса располагаются на одном и том же расстоянии от полюса клетки и двигаются постепенно в соотв. с элонгацией клетки. Инициация репликации происходит вблизи центра будущей дочерней клетки. Нидерланды, Inst. Molec. Cell Biol., BioCentrum Amsterdam, Univ. Amsterdam, 1098 SM Amsterdam. Библ. 24
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМЫ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.05-04Б2.204

Автор(ы) : Qin, Ming-Hui, Madiraju Murty V.V.S., Rajagopalan, Malini
Заглавие : Characterization of the functional replication origin of Mycobacterium tuberculosis
Источник статьи : Gene. - 1999. - Vol. 233, N 1-2. - С. 121-130
Аннотация: Фрагмент ДНК Mycobacterium tuberculosis, содержащий межгенную область dnaA-dnaN, функционирует как область начала репликации (ОНР) oriC, т. е. обеспечивает автономную репликацию плазмид в M. tuberculosis H37Ra и M. bovis BCG. Удаление ОНР ColE1 Escherichia coli из плазмид с oriC M. tuberculosis не устраняет их автономную репликацию. Делеционный анализ показал, что минимальная ОНР oriC имеет длину 814 п. н. Число копий плазмид с oriC M. tuberculosis и ori ColE1 по отношению к хромосомной ОНР oriC равно 1. 5'-фланговая область минимальной ОНР oriC содержит элементы, поддерживающие стабильную репликацию плазмид. ОНР oriC M. tuberculosis не функционирует в быстро растущих микобактериях, напр. в M. smegmatis. ОНР oriC M. smegmatis функционирует только в M. fortuitum, но не в медленно растущих видах микобактерий (M. tuberculosis и BCG). Эти данные показали, что механизмы инициации репликации неодинаковы у быстро и медленно растущих микобактерий. США, Dep. Biochem., Univ. Texas Hlth. Ctr., Tyler, TX 75708-3154. Библ. 20
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА
РЕГУЛЯЦИЯ
УЧАСТОК ORJ
ОБЛАСТЬ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 02.07-04Б4.141

Автор(ы) : Qin, Ming-Hui, Madiraju Murty V.V.S., Rajagopalan, Malini
Заглавие : Characterization of the functional replication origin of Mycobacterium tuberculosis
Источник статьи : Gene. - 1999. - Vol. 233, N 1-2. - С. 121-130
Аннотация: Фрагмент ДНК Mycobacterium tuberculosis, содержащий межгенную область dnaA-dnaN, функционирует как область начала репликации (ОНР) oriC, т. е. обеспечивает автономную репликацию плазмид в M. tuberculosis H37Ra и M. bovis BCG. Удаление ОНР ColE1 Escherichia coli из плазмид с oriC M. tuberculosis не устраняет их автономную репликацию. Делеционный анализ показал, что минимальная ОНР oriC имеет длину 814 п. н. Число копий плазмид с oriC M. tuberculosis и ori ColE1 по отношению к хромосомной ОНР oriC равно 1. 5'-фланговая область минимальной ОНР oriC содержит элементы, поддерживающие стабильную репликацию плазмид. ОНР oriC M. tuberculosis не функционирует в быстро растущих микобактериях, напр. в M. smegmatis. ОНР oriC M. smegmatis функционирует только в M. fortuitum, но не в медленно растущих видах микобактерий (M. tuberculosis и BCG). Эти данные показали, что механизмы инициации репликации неодинаковы у быстро и медленно растущих микобактерий. США, Dep. Biochem., Univ. Texas Hlth. Ctr., Tyler, TX 75708-3154. Библ. 20
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА
РЕГУЛЯЦИЯ
УЧАСТОК ORJ
ОБЛАСТЬ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (BACT.)
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.229

Автор(ы) : Molina, Felipe, Jimenez-Sanchez A., Zyskind J.W., Guzman Elena C.
Заглавие : Chromosomal insertions localized around oriC affect the cell cycle in Escherichia coli : Pap. Bacter. Cell Cycle Meet., Abondance, 10-14 March, 1999
Источник статьи : Biochimie. - 1999. - Vol. 81, N 8-9. - С. 811-818
Аннотация: Анализировали влияние инсерций в область oriC Escherichia coli на параметры клеточного цикла. Эти инсерции увеличивают период C, причем влияние тем больше, чем меньше расстояние от oriC. Инсерция 'ОМЕГА' увеличивает число вилок репликации на хромосому, а инсерция Tn10 снижает скорость роста клеток. Показано также, что инсерции вне oriC негативно влияют на продолжительность периода C. Предполагается, что инсерции, локализованные ближе 2 т. п. н. от oriC могут влиять на структуру участка начала репликации. Испания, Dep. Bioquim. Biol. Molec. Genet., Fac. Ciencias, Univ. Extremadura Badajoz, 06080. Библ. 28
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ
ДНК
ОБЛАСТЬ ORIC
ИНСЕРЦИИ
ВЛИЯНИЕ
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.04-04Б2.235

Автор(ы) : Maisnier-Patin, Sophie, Dasgupta, Santanu, Krabbe, Margareta, Nordstrom, Kurt
Заглавие : Conversion to bidirectional replication after unidirectional initiation from R1 plasmid origin integrated at oriC in Escherichia coli
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 30, N 5. - С. 1067-1079
Аннотация: Фенотипы клеточного деления штаммов Escherichia coli, у к-рых репликация хромосомы направляется областью oriR плазмиды R1, изучены методами флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии. Характер репликации хромосомы у этих штаммов исследован анализом частоты маркеров. У одного из штаммов однонаправленная oriR ориентирована так, что репликативная вилка движется по часовой стрелке от oriC. Этот штамм растет и делится, как родитель дикого типа, и превращает однонаправленную инициацию на oriC в двунаправленную репликацию. Сайт конверсии однонаправленной репликации в двунаправленную картирован генетическими методами на расстоянии 6 мин справа от минимальной области oriC. Репликация, начинающаяся в направлении против часовой стрелки из репликона R1, интегрированного в тот же сайт в противоположной ориентации, не является ни одно-, ни двунаправленной. Этот штамм проявляет выраженную филаментацию, нерегулярное распределение нуклеоидов и присутствие безъядерных клеток. Это указывает на дефекты по сегрегации и делению. Сравнение производных intR1 с различным положением интегрированной oriR позволило предположить, что сама последовательность oriC не нужна для конверсии к двунаправленности. Для двунаправленной репликации и нормального клеточного деления необходимо прохождение репликативной вилки через область в пределах 6 мин справа от oriC. Швеция, Dep. Microbiol., Biomed. Ctr., Uppsala Univ., S-751 23 Uppsala. Библ. 43
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА R1
РЕПЛИКАЦИЯ
ДВУНАПРАВЛЕННАЯ
ОБЛАСТЬ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
ИНТЕГРАЦИЯ В ORIC
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.241

Автор(ы) : Fujii, Shingo, Akiyama, Masahiro, Aoki, Kazuhiro, Sugaya, Yutaka, Higuchi, Kumiko, Hiraoka, Mina, Miki, Youhei, Saitoh, Naotoshi, Yoshiyama, Kaoru, Ihara, Keiichi
Заглавие : DNA replication errors produced by the replicative apparatus of Escherichia coli
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 289, N 4. - С. 835-850
Аннотация: Ген rpsL из Escherichia coli кодирует маленький рибосомный белок S 12, к-рый связывает стрептомицин. На основании этого свойства бактериальных клеток создали экспериментальную систему, позволяющую оценивать природу различных мутаций, к-рые являются модификацией нуклеотидной последовательности (НП) генов бактерий in vitro и in vivo. Проанализировали коллекцию из 1000 rpsL{-} мутантов с замещениями оснований в НП генов. Разработали систему, используя плазмидную ДНК с ориджином репликации oriC, позволяющую оценить точность работы репликативного аппарата E. coli in vitro. Сконструировали плазмиду (П) pMOL 3, к-рая несет область oriC и ген rpsL. Применив электрофоретические методы и рестрикционный анализ изучили с помощью этой П модель репликации под названием модель катящегося кольца. Установили, что средний размер фрагмента Оказаки для этой модели репликация составляет величину от 'ЭКВИВ'6 до 20 т. п. н. Оценили частоту rpsL мутаций в процессе репликации oriL плазмидной ДНК in vitro. Среди мутаций генерированных in vitro в связи с ошибками репликативного аппарата, наиболее часто встречаются мутации по сдвигу рамки считывания на один или несколько нуклеотидов как in vitro, так in vivo. Кроме этого встречаются мутации по замещению оснований типа транзиций и трансверсий, а также делеции и дупликации разного размера. Обсуждают модели механизмов мутаций со сдвигом рамки считывания, обусловленных ошибками репликативного аппарата E. coli. Япония, Dep. of Molecular Biology, Graduate Sch. of Biological Sci., Nara Inst. of Sci. and Technology, Koma Nara 630-0101. Библ. 45
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ORIC
ГЕН RPSL
ПЛАЗМИДА PMOL 3
КОНСТРУИРОВАНИЕ
ОШИБКА РЕПЛИКАЦИИ
МУТАЦИИ ПО СДВИГУ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ
ТРАНЗИЦИИ
ТРАНСВЕРСИИ
МОДЕЛИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.191

Автор(ы) : Weigel, Christoph, Schmidt, Andrea, Ruckert, Beate, Lurz, Rudi, Messer, Walter
Заглавие : DnaA protein binding to individual DnaA boxes in the Escherichia coli replication origin, oriC
Источник статьи : EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16, N 21. - С. 6574-6583
Аннотация: В экспериментах in vitro изучено формирование нуклеопротеиновых комплексов между белком-инициатором репликации Dna (I) Escherichia coli и отдельными боксами DnaA в участке начала репликации oriC. I связывался с равной эффективностью с линейными и суперскрученными субстратами oriC, однако выявлено предпочтительное связывание I в пределах боксов RI, M, R2 и R3. В частности, более высокая конц-ия I была необходима для связывания DnaAc M. Показатели низкого сродства у этого сайта позволяют считать его еще одним кандидатом на роль регулятора бокса DnaA. Германия, Max-Planck-Institut fur molekulare Genetik, Ihnestrasse 73, D-14195 Berlin-Dahlem. Библ. 36
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: БЕЛОК
DNAA БЕЛОК
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БОКС DNAA
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.03-04Б2.166

Автор(ы) : Simmons Lyle A., Felczak, Magdalena, Kaguni Jon M.
Заглавие : DnaA Protein of Escherichia coli: Orligomerization at the E. coli chromosomal origin is required for initiation and involves specific N-terminal amino acids
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2003. - Vol. 49, N 3. - С. 849-958
Аннотация: Повторяющиеся последовательности бокса DnaA внутри репликационных ориджинов бактерий и прокариотических плазмид узнаются инициатором репликации, белком DnaA. Предполагают, что на хромосомном ориджине Escherichia coli, oriC, происходит олигомеризация DnaA, чтобы инициировать репликацию ДНК. В данной работе осуществили подсчет образования олигомера на oriC, основывающийся на комплементации между двумя аллелями dnaA, которые являются неактивными сами по себе. Одна аллель - dnaA46. Ее неактивность при непермиссивной температуре обусловлена специфическим дефектом в АТФ связывании. Вторая аллель T435K не поддерживает репликацию ДНК из-за неспособности связываться с последовательностями бокса DnaA внутри oriC. Показали, что аллель T435K может комплементировать аллель dnaA46(Ts). Результаты поддерживают модель, где олигомер образуется при связывании последовательностей бокса DnaA на oriC с DnaA46, с которой затем связывается T435K, чтобы образовать активный комплекс. Основываясь на этом подсчете показали, что при изменении лейцина 5, триптофана 6 и цистеина 9 в предсказанной альфа-спирали возникают препятствия для образования олигомера. Глутамин 8 необходим для образования олигомера на oriC - содержащих плазмидах. Предполагают, что комплекс DnaA - oriC на хромосомном локусе oriC сходен, но не идентичен комплексу, собираемому на плазмиде. Результаты позволяют предположить, что пролин 28 у DnaA участвует в пополнении DnaB на oriC. Результаты обеспечивают прямое доказательство, что олигомеризация DnaA на oriC необходима для осуществления инициации. США, Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Michigan State University, East Lansing, Michigan 48824-131. Библ. 48
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
УЧАСТОК ORIC
БЕЛОК DNAA
АЛЛЕЛИ
ОЛИГОМЕРИЗАЦИЯ
СПЕЦИФИЧЕСКИЕ N-ТЕРМИНАЛЬНЫЕ АМИНОКИСЛОТЫ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.02-04Б4.55

Автор(ы) : Simmons Lyle A., Felczak, Magdalena, Kaguni Jon M.
Заглавие : DnaA Protein of Escherichia coli: Orligomerization at the E. coli chromosomal origin is required for initiation and involves specific N-terminal amino acids
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2003. - Vol. 49, N 3. - С. 849-958
Аннотация: Повторяющиеся последовательности бокса DnaA внутри репликационных ориджинов бактерий и прокариотических плазмид узнаются инициатором репликации, белком DnaA. Предполагают, что на хромосомном ориджине Escherichia coli, oriC, происходит олигомеризация DnaA, чтобы инициировать репликацию ДНК. В данной работе осуществили подсчет образования олигомера на oriC, основывающийся на комплементации между двумя аллелями dnaA, которые являются неактивными сами по себе. Одна аллель - dnaA46. Ее неактивность при непермиссивной температуре обусловлена специфическим дефектом в АТФ связывании. Вторая аллель T435K не поддерживает репликацию ДНК из-за неспособности связываться с последовательностями бокса DnaA внутри oriC. Показали, что аллель T435K может комплементировать аллель dnaA46(Ts). Результаты поддерживают модель, где олигомер образуется при связывании последовательностей бокса DnaA на oriC с DnaA46, с которой затем связывается T435K, чтобы образовать активный комплекс. Основываясь на этом подсчете показали, что при изменении лейцина 5, триптофана 6 и цистеина 9 в предсказанной альфа-спирали возникают препятствия для образования олигомера. Глутамин 8 необходим для образования олигомера на oriC - содержащих плазмидах. Предполагают, что комплекс DnaA - oriC на хромосомном локусе oriC сходен, но не идентичен комплексу, собираемому на плазмиде. Результаты позволяют предположить, что пролин 28 у DnaA участвует в пополнении DnaB на oriC. Результаты обеспечивают прямое доказательство, что олигомеризация DnaA на oriC необходима для осуществления инициации. США, Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Michigan State University, East Lansing, Michigan 48824-131. Библ. 48
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
УЧАСТОК ORIC
БЕЛОК DNAA
АЛЛЕЛИ
ОЛИГОМЕРИЗАЦИЯ
СПЕЦИФИЧЕСКИЕ N-ТЕРМИНАЛЬНЫЕ АМИНОКИСЛОТЫ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

16.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.12-04Б2.254

Автор(ы) : Cassler Michael R., Grimwade Julia E., McGarry Kevin C., Mott Ryan T., Leonard Alan C.
Заглавие : Drunken-cell footprints: Nuclease treatment of ethanol-permeabilized bacteria reveals an initiation-like nucleoprotein complex in stationary phase replication origins
Источник статьи : Nucl. Acids Res. - 1999. - Vol. 27, N 23. - С. 4570-4576
Аннотация: Разработан метод футпринтинга in situ ("футпринтинг пьяных клеток") для изучения структуры нуклеопротеиновых комплексов (НПК) на области начала репликации oriC Escherichia coli. Он основан на том, что кратковременная обработка клеток этанолом делает внутриклеточные НПК доступными для модифицирующих ДНК ферментов. Этим методом обнаружено связывание с oriC in vivo белка Fis в экспоненциально растущих клетках и белков DnaA (I) и IHF (II) в клетках стационарной фазы (СФ). Т. к. связывание I и II вызывает расплетание oriC in vitro, для изучения внутриклеточного расплетания oriC in vivo использована эндонуклеаза P1 (III). Кол-во сайтов расщепления III, расположенных в области расплетания oriC длиной 13 п. н., значительно увеличивается в СФ в случае oriC дикого типа, но не мутантов oriC, неспособных к расплетанию. Эти данные позволили предположить, что большинство копий oriC расплетается во время СФ, образуя НПК, похожие на инициирующие. США, Dep. Biol. Sci., Florida Inst. Technol., Melbourne, FL 32901. Библ. 34
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: МЕТОДЫ
ФУТПРИНТ ПЬЯНЫХ КЛЕТОК
НУКЛЕОПРОТЕИНОВЫЙ КОМПЛЕКС
ИНИЦИИРУЮЩИЙ
ПЕРМЕАБИЛИЗИРУЮЩИЙ ЭТАНОЛОМ
ОБЛАСТЬ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC
СТАЦИОНАРНАЯ ФАЗА
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

17.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.08-04Б2.321

Автор(ы) : Campbell Joseph L., Kleckner, Nancy
Заглавие : E. coli oriC and the dnaA Gene promoter are sequestered from dam methyltransferase following the passage of the chromosomal replication fork
Источник статьи : Cell. - 1990. - Vol. 62, N 5. - С. 967-979
Аннотация: Исследовали кинетику реметилирования сайтов GATC dam-метилазой в геноме Escherichia coli вслед за прохождением хромосомной репликативной вилки. Показано, что oriC и промоторный район гена damA после инициации транскрипции длительное время защищены от действия dam-метилазы, с последующим снятием "защиты", заключающейся в недометилировании сайтов GATC, по мере завершения клеточного цикла. Эти сведения согласуются с мнением о том, что недометилирование в этих 2 районах действует скоординировано, что гарантировать только одну инициацию с oriC в клеточном цикле. Библ. 48. США, Dep. of Biochem. and Mol. Biol. Harvard Univ. 7 Divinity Avenue Cambridge, MA 02138.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РЕПЛИКАЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
КОРРЕЛЯЦИЯ
ORIC
НЕДОМЕТИЛИРОВАНИЕ
ГЕН МЕТИЛАЗЫ DAM
Дата ввода:

18.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.10-04Б2.547

Автор(ы) : Baker Tania A., Yung Benjamin Y.-M., Kornberg, Arthur
Заглавие : Early events in the enzymatic replication of plasmid containing the origin of the E. coli chromosome
Источник статьи : J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N13Д. - С. 68
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РЕПЛИКАЦИЯ
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC
СВЯЗЫВАНИЕ
БЕЛОК DNA А
БЕЛОК DNA С
ОТКРЫТЫЙ КОМПЛЕКС
ДНК ПЛАЗМИДНАЯ
РЕКОМБИНАНТНАЯ МОЛЕКУЛА
Дата ввода:

19.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.09-04Б2.81

Автор(ы) : Fiebig, Aretha, Keren, Kinneret, Theriot Julie A.
Заглавие : Fine-scale time-lapse analysis of the biphasic, dynamic behaviour of the two Vibrio cholerae chromosomes
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 60, N 5. - С. 1164-1178
Аннотация: С помощью флуоресцентной репрессорно-операторной системы в живых клетках исследовали динамику поведения хромосом в Vibrio cholerae, геном которого состоит из двух хромосом. Разработали метод анализа движения хромосом в виброидных бактериях и охарактеризовали две различных модели поведения хромосом, соответствующие периоду между сегрегациями и этапу сегрегации. Между сегрегациями позиция ориджина не фиксируется, но сохраняется внутри элипсоидных доменов, шириной 0,4 мкм и длиной 0,6 мкм. Во время сегрегации удалось наблюдать передвижение ориджинов по различным механизмам. Специфичной особенностью явилось то, что oriC1 - домен удерживался на постоянном расстоянии от полюса, независимо от длины клетки, тогда как oriC2 сохранялся в относительно постоянной позиции, то есть реально расположение oriC2 варьировало в зависимости от длины клетки. В то время как поведение двух ориджинов различалось, временная динамика их была примерно одинаковой, свидетельствуя о близких характеристиках окружающей микросреды. США, Dep. of Biochemistry, Stanford Univ. School of Med., Beckman Center, 279 W. Campus Dr., Stanford, CA 95305. Библ. 38
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ХРОМОСОМЫ
ВИБРОИДНЫЕ БАКТЕРИИ
СЕГРЕГАЦИЯ ХРОМОСОМ
ВРЕМЕННОЙ АНАЛИЗ
УЧАСТОК ORI
УЧАСТКИ OROC1, ORIC2
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА
VIBRIO CHOLERAE (BACT.)
Дата ввода:

20.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.12-04Б4.190

Автор(ы) : Fiebig, Aretha, Keren, Kinneret, Theriot Julie A.
Заглавие : Fine-scale time-lapse analysis of the biphasic, dynamic behaviour of the two Vibrio cholerae chromosomes
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 60, N 5. - С. 1164-1178
Аннотация: С помощью флуоресцентной репрессорно-операторной системы в живых клетках исследовали динамику поведения хромосом в Vibrio cholerae, геном которого состоит из двух хромосом. Разработали метод анализа движения хромосом в виброидных бактериях и охарактеризовали две различных модели поведения хромосом, соответствующие периоду между сегрегациями и этапу сегрегации. Между сегрегациями позиция ориджина не фиксируется, но сохраняется внутри элипсоидных доменов, шириной 0,4 мкм и длиной 0,6 мкм. Во время сегрегации удалось наблюдать передвижение ориджинов по различным механизмам. Специфичной особенностью явилось то, что oriC1 - домен удерживался на постоянном расстоянии от полюса, независимо от длины клетки, тогда как oriC2 сохранялся в относительно постоянной позиции, то есть реально расположение oriC2 варьировало в зависимости от длины клетки. В то время как поведение двух ориджинов различалось, временная динамика их была примерно одинаковой, свидетельствуя о близких характеристиках окружающей микросреды. США, Dep. of Biochemistry, Stanford Univ. School of Med., Beckman Center, 279 W. Campus Dr., Stanford, CA 95305. Библ. 38
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: ХРОМОСОМЫ
ВИБРОИДНЫЕ БАКТЕРИИ
СЕГРЕГАЦИЯ ХРОМОСОМ
ВРЕМЕННОЙ АНАЛИЗ
УЧАСТОК ORI
УЧАСТКИ OROC1, ORIC2
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА
VIBRIO CHOLERAE (BACT.)
Дата ввода:

1-20 21-40 41-60 61-62

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска