СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ORIC<.>)

Общее количество найденных документов : 62
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-62

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.02-04Б2.253

Автор(ы) : Баландина А.В., Кутузова Г.И., Макеев В.Ю., Франк Г.К., Камашев Д.Э., Есипова Н.Г.
Заглавие : Периодичности в расположении нуклеотидов на участке начала репликации хромосомы Oric из E. coli
Источник статьи : 2-й Съезд. биофизиков России, Москва, 23-27 авг., 1999. - М., 1999. - Т.3. - С. 933
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: НУКЛЕОТИДЫ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ПЕРИОДИЧНОСТЬ
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИЯ ORIC
КОНТАКТ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ФУРЬЕ-СПЕКТРЫ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.06-04Б2.200

Автор(ы) : Baker Tanla A., Kornberg, Artur
Заглавие : Transcriptional activation of initiation of replication from the E. coli chromosomal origin: an RNA-DNA hybrid near oriC
Источник статьи : Cell. - 1988. - Vol. 55, N 1. - С. 113-123
Аннотация: РНК-полимераза (РНКП) участвует в инициации репликации хромосомы Escherichia coli. Транскрипция предшествует инициации репликации с ориджина (oriC) хромосомы E. coli, давая возможность белку DnaA расплавить участок двойной спирали ДНК. Исследовали, как РНКП влияет на отдельные этапы инициации репликации. Сконструировали плазмиды, содержащие oriC и разл. промоторы. Изучили отдельные этапы репликации этих плазмид в системе in vitro. Установили, что для инициации репликации с oriC с помощью РНКП требуется наличие высокой конц-ии гистоноподобного белка HU, высокая степень суперскрученности ДНК и температура реакционной среды ниже 27'ГРАДУС' С. Кроме того, для инициации репликации с oriC необходимо наличие гибрида ДНК-РНК рядом с oriC. Длина активирующей РНК зависит от расстояния между промотором и oriC. Оно должно составлять не менее 500 п. н. ДНК-РНК гибрид образует R-петлю, необходимую для активации репликации. Делают вывод, что транскрипт помогает DnaA-белку изменить конформацию ДНК в участке инициации репликации и интродуцировать DnaB-хеликазу в oriG-комплекс. Библ. 75. США, Dep. of Bioch. Stanford Univ Medical School Stanford, CA 04305.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИЯ
УЧАСТОК ORIC
АКТИВАЦИЯ
ТРАНСКРИПТ
СИНТЕЗ
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.05-04Б2.258

Автор(ы) : Bramhill, David, Kornberg, Arthur
Заглавие : A model for initiation at origins of DNA replication
Источник статьи : Cell. - 1988. - Vol. 25, N 7. - С. 915-918
Аннотация: Предложена модель инициации репликации хромосомы Escherichia coli в локусе oriC, постулирующая, что белок DnaA имеет 3 главных функции: он прочно связывается с 9-членными повторами (dnaA-боксами) с образованием инициационного комплекса; он эффективно расплавляет 3 АТ-богатых 13-членных повтора с образованием открытых комплексов и, наконец, он направляет DNaB-DnaC-комплекс в этот расплавленный район с образованием презатравочного комплекса. Последний развинчивает ДНК-матрицу, обеспечивая возможность осуществления двунаправленной репликации. Рассмотрены возможные инициационные события не только в локусе oriC хромосомы Е. соli, но и в других участках начала репликации, включая хромосому B. subtilis, плазмиды pSC101, F, P1, R1, R6К, Р4, RК2, СolЕ1, а также лямбдоидные фаги. Предполагается, что у эукариот роль АТ-богатых последовательностей в открывании дуплекса в точке ori сходна с тем, что имеет место для ДНК вируса SV40. В последнем случае локус ori прочно связывается с Т-антигеном, являющимся белком-инициатором, кодируемым самим вирусом, и служащим одновременно хеликазой, а также раскручивающим дуплекс ДНК в ori. Рассмотрена также роль регуляторных факторов, таких как АТР, белок DnaC, транскрипционная активация ori и прикрепление белка DnaA к мембране. Сделан вывод, что многие прокариотические ori напоминают локус oriC E. coli наличием необходимых АТ-богатых последовательностей, локализованных в виде тандемных повторов. Роль этих повторов, вероятно, состоит в первоначальном открывании ДНК-дуплекса белком-инициатором. Регуляторное действие белков типа DnaA E. coli состоит в активации транскрипции ori, связывании нуклеотидов, прикреплении к мембране и формировании репликативной вилки. Ил. 2. США, Stanford Univ. School of Medicine Stanford, CA 94305.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ
МОДЕЛЬ
УЧАСТКИ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC
БЕЛОК DNAA
ФУНКЦИИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.04-04Б2.342

Автор(ы) : O'Neill Edward A., Bender Robert A.
Заглавие : Klebsiella pneumoniae origin of replication (oriC) is not active in Caulobacter crescentus, Pseudomonas putida, and Rhodobacter sphaeroides
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 8. - С. 3774-3777
Аннотация: Сконструирована плазмида pEON1, в к-рой фрагмент ДНК, несущий гены, детерминирующие систему конъюгативного переноса плазмиды широкого спектра хозяев RK2, включали в плазмиду, содержащую локус oriC хромосомы K. pneumoniae. Выявлено, что плазмида pEON1 легко переносится между грамотрицательными бактериями и содержит 2 потенциальных участка начала репликации, поскольку в ней, наряду с указанным oriC, присутствует oriPBR плазмиды pBR322. Обнаружено, что pEON1 может переноситься в шт. C. aulobacter crescentus, Pseudomonas putida и Rhodobacter sphaeroides, но не способна поддерживаться в этих хозяевах. Включение локуса ori репликации из плазмиды RK2 приводит к тому, что полученный дериват плазмиды pEON1 приобретает способность реплицироваться в этой группе бактерий, не относящихся к энтеробактериям. Сделан вывод, что неспособность плазмиды pEON1 поддерживаться в этих бактериях связана с неактивностью в них oriC K. pneumoniae, а не с токсическим эффектом этого локуса. Табл. 1. Библ. 24. США, The Univ. of Michigan, Ann Arbor, MI48109.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: KLEBSIELLA PNEUMONIAE (BACT.)
КИШЕЧНЫЕ БАКТЕРИИ
УЧАСТОК ORIC
КЛОНИРОВАНИЕ
АКТИВНОСТЬ
МЕХАНИЗМ
KLEBSIELLA PNEUMONIAE (BACT.)
PSEUDOMONAS PUTIDA
RHODOBACTER SPHAEROIDES
НЕКИШЕЧНЫЕ БАКТЕРИИ-ХОЗЯЕВА
ПОДДЕРЖАНИЕ ПЛАЗМИД
ВЕКТОР PEON1;Д КОНСТРУИРОВАНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.09-04Б2.264

Автор(ы) : Kowalski, David, Eddy Martha J.
Заглавие : The dna unwinding element: An essential, cis-acting component of the E. coli replication origin
Источник статьи : J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N13D. - С. 129
Аннотация: Расплетание ДНК, необходимое для инициации репликации, индуцируется взаимодействием белка DnaA с участком ДНК oriC. Расплетание происходит в трех тандемно повторяющихся последовательностях из 13 п. н. (ТПП). Показали, что расплетание ТПП может происходить и без участия белка DnaA, только под воздействием отрицательной сверхспиральности ДНК. Обнаружили, что одна из трех ТПП является наиболее существенной для функции oriC. Обозначили эту последовательность DUE(ДНК-расплетающий элемент). Установили наличие DUE у др. энтеробактерий, а также у дрожжей. Полагают, что DUE является существенным компонентом механизма инициации репликации клетки. США, Mol. & Cellular Biol. Dep., Roswell Park Memorial Inst., Buffalo, NY 14263.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ
РАСПЛЕТАНИЕ ДНК
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ТАНДЕМНО ПОВТОРЯЮЩИЕСЯ НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЛИЯНИЕ НА ORIC
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ DUE
ДРОЖЖИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.09-04Б2.268

Автор(ы) : Samitt Craig E., Hansen Flemming G., Miller Jeffery F., Schaechter, Moselio
Заглавие : In vivo studies of DnaA binding to the origin of replication of Escherichia coli
Источник статьи : EMBO Journal. - 1989. - Vol. 8, N 3. - С. 989-993
Аннотация: Показано, что белок DnaA, необходимый для инициации репликации ДНК у E. coli, присоединяется к 3 из 4 DnaAсвязываемых последовательностей в участке начала репликации oriC. (бокс R1, R2, R4) Минихромосомы в dna (Тс)мутантах не только не обнаруживают связывания с DnaA при непермиссивной температуре, но обладают сниженной эффективностью связывания при пермиссивной температуре. Показатели процессов связывания in vivo в штамме дикого типа были идентичны таковым, полученным in vitro с использованием очищенных DnaA и oriC ДНК. Транскрипция в oriC влияет на связывание DnaA в бокс- DnaA. Эти данные свидетельствуют о том, что именно белок DnaA обеспечивает связывание с oriC in vivo. Ил. 5. Библ. 32. США, Dept. of Molecular Biology and Microbiology, Tufts Univ. Sch. of Medicine, 136 Harrison Ave., Boston MA 02111.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РЕПЛИКАЦИЯ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
IN VIVO
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC
БЕЛОК DNAA
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.06-04Б2.201

Автор(ы) : Gielow, Annette, Kucherer, Claudia, Kolling, Ralf, Messer, Walter
Заглавие : Transcription in the region of the replication origin, oriC, of Escherichia coli: Termination of asnC transcripts
Источник статьи : Mol. and Gen. Genet. - 1988. - Vol. 214, N 3. - С. 474-481
Аннотация: С помощью S1-картирования установлено, что транскрипция с промотора asnC проходит через прилегающий к нему локус oriC и доходит до гена gidA. В системе in vivo 10-20% транскриптов asnC достигают oriC и лишь 10% транскриптов терминируются в терминаторе (Т[a][s][n]). Установлена локализация сайтов терминации в межгенном районе между asnC и oriC, а также внутри прилегающего локуса mioC. Зависимая от белка DnaA терминация обнаружена вблизи сайта связывания этого белка с dnaA-боксом. В системе in vitro транскрипты asnC не доходят до oriC, а транскрипты mioC доходят. Отсюда сделан вывод, что последние, в отличие от первых, принимают участие в инициации репликации хромосомы с oriC. Предполагается, что локусы oriC и mioC транспозировались в регулон asnC в процессе эволюции. Ил. 6. Табл. 2. Библ. 44. Зап. Берлин, Max-Planck-Institut fur Molekulare Genetik, Ihnestrasse 73, D-1000 Berlin 33.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ТРАНСКРИПТЫ
ТРАНСКРИПТЫ ГЕНА ASNC
ФУНКЦИИ
ТРАНСКРИПЦИЯ
УЧАСТОК ТЕРМИНАЦИИ ТРАНСКРИПЦИИ
КАРТИРОВАНИЕ
ЛОКУС ORIC
РЕПЛИКАЦИЯ IN VITRO
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.209

Автор(ы) : Hughes, Patrick, Landoulsi, Ahmed, Kohiyama, Masamichi
Заглавие : A novel role for cAMP in the control of the activity of the E. coli chromosome replication initiator protein, DnaA
Источник статьи : Cell. - 1988. - Vol. 55, N 2. - С. 343-350
Аннотация: Белок DnaA обладает выраженным сродством к АТФ и слабой ДНК-зависимой АТФ-азной активностью. АТФ активирует DnaA в качестве инициатора репликатора ДНК. В данной работе установлено, что белок DnaA связывается с цАМФ с К=1 мкМ, причем на молекуле белка находится 'ЭКВИВ'1,18 сайтов связывания с цАМФ. Взаимодействие с цАМФ стимулирует связывание DnaA с локусом oriC, а также промоторным районом mioC. В результате присоединения к цАМФ белок DnaA защищается от термоинактивации, а его реактивация происходит за счет быстрого выхода АДФ после каждого акта гидролиза АТФ. Показано, что добавление цАМФ к неактивным препаратам DnaA, связанного с АДФ, восстанавливает нормальную инициирующую активность белка и его способность к гидролизу АТФ. Предложена модель, по к-рой уровень клеточной цАМФ контролирует репликативную активность белка DnaA, обеспечивая превращение неактивного АДФ-DnaA комплекса в активный, связанный с АТФ. Ил. 7. Табл. 3. Библ. 28. Франция, Institut Jacques Monod Tour 43 Universite Paris VII 2 Place Jussieu 75251 Paris Cedex 05.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
АМФ ЦИКЛИЧЕСКИЙ
РОЛЬ
РЕПЛИКАЦИЯ
ORIC
ИНДУКЦИЯ
ДНК-СВЯЗЫВАЮЩИЕ БЕЛКИ
БЕЛОК DNAA - АДФ КОМПЛЕКС
АКТИВАЦИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.05-04Б2.168

Автор(ы) : Sibley Christopher D., MacLellan Shawn R., Finan, Turlough
Заглавие : The Sinorhizobium meliloti chromosomal origin of replication
Источник статьи : Microbiology. - 2006. - Vol. 152, N 2. - С. 443-455
Аннотация: Показано, что предсказанный ориджин репликации (oriC), локализованный на хромосоме Sinorhizobium meliloti, определяет автономную репликацию плазмиды, нереплицирующейся в норме в клетках S. meliloti. Таким образом, впервые экспериментально локализован ориджин репликации на хромосоме Rhizobiaceae и его положение по соседству с hemE аналогично позиции oriC у Caulobacter crescentus. По изменению подвижности в геле комплексов образуемых oriC с очищенным гомологичным белком инициации репликации DnaA, в районе oriC были картированы сайты связывания DnaA. Мутации в этих сайтах исключают автономную репликацию. При экспрессии DnaA с плазмидного промотора lac клетки S. meliloti приобретают нитевидную форму, что свидетельствует о нарушении клеточного деления. Интересно отметить, что эти нитевидные клетки напоминают дифференцированные бактероиды, наблюдаемые внутри растительных клеток корневых клубеньков люцерны. Канада, Centr Environment. Genom., Dep Biol., McMaster Univ. 1280 Main St West, Hamilton, Ontario, Canada L8S 4K1. Библ. 53
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ОРИДЖИН РЕПЛИКАЦИИ ORIC
ХРОМОСОМНЫЙ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
SINORHIZOBIUM MELILOTI (BACT.)
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.01-04Б2.241

Автор(ы) : Duret, Sybille, Andre, Aurelie, Renaudin, Joel
Заглавие : Specific gene targeting in Spiroplasma citri: Improved vectors and production of unmarked mutations using site-specific recombination
Источник статьи : Microbiology. - 2005. - Vol. 151, N 8. - С. 2793-2803
Аннотация: В Spiroplasma citri, где гомологичная рекомбинация неэффективна, специфичная генная мишень может быть выбрана с использованием репликативных oriC-плазмид. Сконструировали новые векторы, используемые для инактивации гена ccr, кодирующего компонент IIA глюкозофосфотрансферазной системы (PTS) пермеазы. Селекция рекомбинантов проходила в два этапа с использованием различных маркеров отбора, один из которых мог экспрессироваться, только если происходила рекомбинация в результате кроссинговера в намеченном гене. Провели скрининг полученных трансформантов и размножили их в присутствии гентамицина, до того как crr-трансформанты были отобраны по устойчивости к тетрациклину. Мутант GII3-gt1 с разрушенным геном crr не мог использовать ни глюкозу, ни трегалозу, показывая этим, что в S. citri PTS-пермеазы функционируют с одним компонентом IIA. Продемонстрировали также возможность использования рекомбинационной системы транспозона 'гамма''дельта'TnpR/res для полученных немаркированных мутаций в S. citri. Франция, UMR 1090 Genomique Develop. et Pouvoir Pathogene, INRA, Univ. De Bordeaux 2. Библ. 41
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
СПЕЦИФИЧНЫЕ ГЕННЫЕ МИШЕНИ
ПЛАЗМИДЫ
РЕПЛИКАТИВНЫЕ ORIC-ПЛАЗМИДЫ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
ТРАНСПОЗОНЫ
ТРАНСПОЗОН ГАММА, ДЕЛЬТА TUPR/RES
НЕМАРКИРОВАННЫЕ МУТАЦИИ
SPIROPLASMA CITRI (BACT.)
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.06-04Б2.207

Автор(ы) : Lartigue, Carole, Blanchard, Alain, Renaudin, Joel, Thiaucourt, Francois, Sirand-Pugnet, Pascal
Заглавие : Host specificity of mollicutes oriC plasmids: Functional analysis of replication origin
Источник статьи : Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 22. - С. 6610-6618
Аннотация: Необычные oriC-плазмиды, содержащие ген dnaA и последовательности, окружающие DnaA-бокс, получили из Spiroplasma citri и Mycoplasma pulmonis. Для исследования их специфичности разработали набор подобных плазмид из трех микоплазм, относящихся к кластеру Mycoides - Mycoplasma mucoides subsp. mycoides LC (MmmLC), M. mycoides subsp. mycoides (MmmSC) и Mycoplasma capricolum subsp. capricolum. Микоплазмы S. citri и M. pulmonis использовали в качестве реципиентов для трансформации гомологичными и гетерологичными oriC-плазмидами. Все пять видов были успешно трансформированы гомологичными плазмидами, свидетельствуя, что район гена dnaA представляет собой ориджин репликации. Однако способность реплицировать гетерологичные oriC-плазмиды варьировала в зависимости от вида. Например, плазмида oriC из M. capricorum не реплицировалась в близкородственных видах MmmSC и MmmLC. Наоборот, плазмиды, несущие oriC из MmmSC, MmmLC и более отдаленного вида S. citri, реплицировались в M. capricolum. Полученные результаты привели к выводу, что cis-элементы, присутствующие в последовательностях oriC не только детерминанты хозяйской специфичности. Франция, UMR GDPP, INRA-Univ. Voctor Segalen Bordeaux 2, BP 81, 33883 Villenave d'Ornon Cedex. Библ. 39
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДЫ ORIC
РЕПЛИКАЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕН РЕПЛИКАЦИИ DNAA
DNAA-БОКС
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
SPIROPLASMA CITRI (BACT.)
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.09-04Б2.81

Автор(ы) : Fiebig, Aretha, Keren, Kinneret, Theriot Julie A.
Заглавие : Fine-scale time-lapse analysis of the biphasic, dynamic behaviour of the two Vibrio cholerae chromosomes
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 60, N 5. - С. 1164-1178
Аннотация: С помощью флуоресцентной репрессорно-операторной системы в живых клетках исследовали динамику поведения хромосом в Vibrio cholerae, геном которого состоит из двух хромосом. Разработали метод анализа движения хромосом в виброидных бактериях и охарактеризовали две различных модели поведения хромосом, соответствующие периоду между сегрегациями и этапу сегрегации. Между сегрегациями позиция ориджина не фиксируется, но сохраняется внутри элипсоидных доменов, шириной 0,4 мкм и длиной 0,6 мкм. Во время сегрегации удалось наблюдать передвижение ориджинов по различным механизмам. Специфичной особенностью явилось то, что oriC1 - домен удерживался на постоянном расстоянии от полюса, независимо от длины клетки, тогда как oriC2 сохранялся в относительно постоянной позиции, то есть реально расположение oriC2 варьировало в зависимости от длины клетки. В то время как поведение двух ориджинов различалось, временная динамика их была примерно одинаковой, свидетельствуя о близких характеристиках окружающей микросреды. США, Dep. of Biochemistry, Stanford Univ. School of Med., Beckman Center, 279 W. Campus Dr., Stanford, CA 95305. Библ. 38
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ХРОМОСОМЫ
ВИБРОИДНЫЕ БАКТЕРИИ
СЕГРЕГАЦИЯ ХРОМОСОМ
ВРЕМЕННОЙ АНАЛИЗ
УЧАСТОК ORI
УЧАСТКИ OROC1, ORIC2
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА
VIBRIO CHOLERAE (BACT.)
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.06-04Б2.139

Автор(ы) : Stepankiw, Nicholas, Kaidow, Akihiro, Boye, Erik, Bates, David
Заглавие : The right halt of the Escherichia coli replication origin is not essential for viability, but facilitates multi-forded replication
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 74, N 2. - С. 467-479
Аннотация: Инициация репликации - ключевое событие в клеточном цикле всех организмов и oriC, ориджин репликации в Escherichia coli, служит типичной модель этого процесса. Минимальная последовательность требуется для функции oriC. Первоначально ее определяли с помощью плазмид, используя клонированные фрагменты ориджина, которые сильно отличаются от последовательностей хромосомы. С помощью метода рекомбинирования in vivo определили последовательность минимального ориджина, поддерживающего репликацию хромосомы. Показали, что правая половина oriC может быть удалена без потери функции ориджина. Клетки, несущие новый 163-п.н минимальный oriC, мало отличались от выживаемости в условиях медленного роста, но были чувствительны к богатой среде, что позволило сделать заключение, что плотная упаковка сайтов связывания инициатора, признак прокариотического происхождения, эволюционировала в сторону поддержки мульти-вилочной репликации. США, Dep. of Human and Molecular Genetics, Baylor College of med., Houston, TX 77030. Библ. 58
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
ORIC
ПРАВАЯ ПОЛОВИНА
УДАЛЕНИЕ
УЧАСТОК 163 П.Н ORIC
МУЛЬТИ-ВИЛОЧНАЯ РЕПЛИКАЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.01-04Б2.273

Автор(ы) : Berkmen Melanie B., Grossman Alan D.
Заглавие : Spatial and temporal organization of the Bacillus subtilis replication cycle
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 62, N 1. - С. 57-71
Аннотация: Репликация ДНК происходит в определенных местах в клетке. Для изучения пространственной и временной организации репликации Bacillus subtilis создали конструкции, позволяющие видеть сайты начала репликации (oriC) и реплисомы в живых клетках. В первом случае рядом с сайтом oriC встроили несколько сайтой lacO. Репрессор lac-оперона, слитый с синим флюоресцирующим белком, присоединялся к сайтам lacO и визуализировал участок рядом с сайтом oriC. Для визуализации реплисом использовали слияние тау-субъединицы ДНК-полимеразы с желтым флюоресцирующим белком. Показано, что перед репликацией сайт начала репликации располагается в середине клетки. После инициации репликации реплисома обнаруживается рядом с oriC. Реплисома остается в середине клетки и после разделения дуплицированных oriC. Если искусственно сместить сайт oriC, то реплисома также изменит расположение, что указывает на то, что во время инициации позиция oriC определяет позицию реплисомы. При помощи цейтраферной микросъемки показано, что каждые несколько секунд единый фокус реплисомы обратимо расходится на 2 близкорасположенных фокуса. Похоже, что сестринские репликационные вилки не так тесно связаны друг с другом во время цикла репликации. Такая динамика расположения вилок сохраняется и при остановке элонгации, что указывает на независимость этого от движения ДНК относительно реплисомы. США [Grossman A. D.], Dep. of Biol., Massachusetts Inst. of Technol., Cambridge, MA 02139. Библ. 55
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ХРОМОСОМА
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
УЧАСТОК ORI
САЙТ ORIC
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
БЕЛОК
РЕПЛИСОМА
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.12-04Б4.190

Автор(ы) : Fiebig, Aretha, Keren, Kinneret, Theriot Julie A.
Заглавие : Fine-scale time-lapse analysis of the biphasic, dynamic behaviour of the two Vibrio cholerae chromosomes
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 60, N 5. - С. 1164-1178
Аннотация: С помощью флуоресцентной репрессорно-операторной системы в живых клетках исследовали динамику поведения хромосом в Vibrio cholerae, геном которого состоит из двух хромосом. Разработали метод анализа движения хромосом в виброидных бактериях и охарактеризовали две различных модели поведения хромосом, соответствующие периоду между сегрегациями и этапу сегрегации. Между сегрегациями позиция ориджина не фиксируется, но сохраняется внутри элипсоидных доменов, шириной 0,4 мкм и длиной 0,6 мкм. Во время сегрегации удалось наблюдать передвижение ориджинов по различным механизмам. Специфичной особенностью явилось то, что oriC1 - домен удерживался на постоянном расстоянии от полюса, независимо от длины клетки, тогда как oriC2 сохранялся в относительно постоянной позиции, то есть реально расположение oriC2 варьировало в зависимости от длины клетки. В то время как поведение двух ориджинов различалось, временная динамика их была примерно одинаковой, свидетельствуя о близких характеристиках окружающей микросреды. США, Dep. of Biochemistry, Stanford Univ. School of Med., Beckman Center, 279 W. Campus Dr., Stanford, CA 95305. Библ. 38
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: ХРОМОСОМЫ
ВИБРОИДНЫЕ БАКТЕРИИ
СЕГРЕГАЦИЯ ХРОМОСОМ
ВРЕМЕННОЙ АНАЛИЗ
УЧАСТОК ORI
УЧАСТКИ OROC1, ORIC2
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА
VIBRIO CHOLERAE (BACT.)
Дата ввода:

16.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.09-04Б2.399

Автор(ы) : Verma, Meera, Moffat Kevin G., Egan J.Barry
Заглавие : UV irradiation inhibits initiation of DNA replication from oriC in Escherichia coli
Источник статьи : Mol. and Gen. Genet. - 1989. - Vol. 216, N 2-3. - С. 446-454
Аннотация: Исследовался эффект временного ингибирования репликации ДНК в Escherichia coli при облучении УФ. Ранее считалось, что этот эффект обусловлен блокированием элонгации репликации-ДНК из-за повреждений ДНК, вызванных УФ (cis-эффект). В работе показано, что при введении необлученного oriC-зависимого репликона E. coli в УФ-облученные клетки окружение облученных клеток ингибирует инициацию репликации от oriC на свободном от тиминовых димеров репликоне. Для работы использовался фаг 'лямбда' poriC в условиях, когда репликация инициировалась от oriC, а не от ori'лямбда'. Делается вывод о том, что УФ-облучение клетки блокируют синтез ДНК независимо от тиминовых димеров, и ингибирование происходит на уровне инициации репликации. Это временное ингибирование названо trans-эффектом, оно не является SOS-функцией. Библ. 46. Рис. 4. Табл. 6. Австралия, Dep. of Biochemistry, Univ. of Adelaide, Adelaide S. A. 5000.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
УФ-ОБЛУЧЕНИЕ
РЕПЛИКАЦИЯ
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC
ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ
ИНГИБИРОВАНИЕ
Дата ввода:

17.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.12-04Б2.402

Автор(ы) : Landoulsi, Ahmed, Malki, Adrerrahim, Kern, Renee, Kohlyama, Masamichi, Hughes, Patrick
Заглавие : The E. coli cell surface specifically prevents the initiation of DNA replication at oriC on hemimethylated DNA templates
Источник статьи : Cell. - 1990. - Vol. 63, N 5. - С. 1053-1060
Аннотация: Показано, что фракция внешней мембраны Escherichia coli ингибирует инициацию репликации полуметилированной ДНК в сайте oriC in vitro. При этом не ингибируется репликация полностью метилированной или совсем не метилированной ДНК. Не обнаружено и ингибирование инициации репликации полуметилированной ДНК в случайных сайтах матрицы. Основной причиной ингибирующего эффекта оказалась инактивация белка DnaA, связывающегося с последовательности oriC. Полученные результаты указывают на прямое участие мембраны в контроле репликации ДНК E. coli. Библ. 40. Франция, Inst. Jacques Monod, Tour 43, Univ. Paris VII, 2 Place Jussieu 75251 Paris Cedex 05.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
УЧАСТОК ORI
ORIC
ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ
РЕГУЛЯЦИЯ
МЕТИЛИРОВАНИЕ
ВНЕШНЯЯ МЕМБРАНА
Дата ввода:

18.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.11-04Б2.450

Автор(ы) : Trun Nancy J., Gottesman, Susan
Заглавие : On the bacterial cell cycle: Escherichia coli mutants with altered ploidy
Источник статьи : Genes and Dev. - 1990. - Vol. 4, N 12А. - С. 2036-2047
Аннотация: Выделены новые мутанты Escherichia coli по клеточ. циклу. Они устойчивы к парам камфоры и имеют повышенную плоидность. Они имеют мутации, к-рые названы mbr и картированы в 4 разных локусах: mbrA на 68-ой мин, mbrB на 88,5-ой мин, mbrC на 89,5-ной мин и mbrD на 90-ой мин. Мутации mbrD, вероятно, являются аллелями гена rpoB 'бета'-субъединицы РНК-полимеразы. Большинство мутантов не растет в богатых средах или при повышенной т-ре. Сконструированы также производные мутантов mbr, имеющие дополнительные мутации в генах dnaA (требуется для репликации ДНК, специфич. для клеточ. цикла) или rnh РНКазы Н, необходимой для специфичности инициации репликации ДНК. Мутации mbrA несовместимы с нулевой мутацией rnh, т. е. мутанты mbrA зависят от инициации репликации на oriC. Фенотипы мутантов mbrB, C и D не зависят от инициации на oriC. Высказано предположение, что мутации mbr влияют на расписание клеточ. цикла и/или вызывают дефект по распределению хромосом. Библ. 43. США, Lab. of Molecular Biol., Nat. Cancer Inst., NIH, Bethesda, MD 20892.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ
МУТАЦИИ
МУТАЦИИ MBR
ПОЛУЧЕНИЕ
КАРТИРОВАНИЕ
КОРРЕЛЯЦИЯ
ПЛОИДНОСТЬ
УСТОЙЧИВОСТЬ
КАМФОРА
РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМЫ
УЧАСТОК ORIC
Дата ввода:

19.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.08-04Б2.409

Автор(ы) : Sommer, Suzanne, Leitao, Alvaro, Bernardi, Alberto, Bailone, Adriana, Devoret, Raymond
Заглавие : Introduction of a UV-damaged replicon into a recipient cell is not a sufficient condition to produce an SOS-inducing signal
Источник статьи : Mutat. Res. DNA Repair. - 1991. - Vol. 254, N 2. - С. 107-117
Аннотация: Сконструированы фагемиды 'лямбда'imm434, несущие область начала репликации ori C хромосомы Escherichia coli. Эффективность их репликации зависит от Dam-метилирования. УФ-облученные фагемиды ori C, в отличие от УФоблученных фагемид 'лямбда'oriF с областью начала репликации oriF полового фактора, не индуцируют SOS-функцию (экспрессию слияния sfiA::lacZ) в реципиентных клетках. Это противоречит 2 моделям образования SOS-индуцирующего сигнала, предполагающим, что сигналом являются продукты деградации УФ-облученной ДНК или сами УФ-повреждения ДНК. Неспособность УФ-поврежденного репликона ori C индуцировать SOS-систему можно объяснить третьей моделью, согласно к-рой активацию белка RecA вызывают однонитевые пострепликативные пробелы в ДНК, если дополнительно постулировать, что УФ-облученный репликон ori C не дает однонитевую ДНК при репликации. Библ. 63. Франция, Lab. d'Enzymologie, CNRS, F-91198 Gif-sur-Yvette.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММ СМ897
УФ-ОБЛУЧЕНИЕ
РЕПАРАЦИЯ*SOS-
ИНДУКЦИЯ
РЕПЛИКОН ORIC
РЕПЛИКАЦИЯ
БЕЛОК RECA
ИНДУКЦИЯ
СИГНАЛЫ SOS
ПРИРОДА
Дата ввода:

20.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.12-04Б2.404

Автор(ы) : Kataoka T., Gayama S., Takahashi K., Wachi M., Yamasaki M., Nagai K.
Заглавие : Only oriC and its flanking region are recovered from the complex formed at the time of initiation of chromosome replication in Escherichia coli
Источник статьи : Res. Microbiol. - 1991. - Vol. 142, N 2-3. - С. 155-159
Аннотация: Многочисленные данные, полученные ранее, свидетельствуют об ассоциации oriC Escherichia coli с фракцией внешней мембраны (oriC-комплекс). Формирование этого комплекса происходит до и во время короткого периода после инициации репликации. С целью обнаружения других специфич. последовательностей, связывающихся с внешней мембраной, геномная библиотека E. coli была проанализирована на наличие таких комплексов с помощью гибридизации негативных колоний с использованием ДНК, выделенной из фракции внешней мембраны сразу после инициации репликации, в кач-ве радиоактивной пробы. Показано, что район oriC с прилежащим к нему в направлении против часовой стрелки участком является уникальным локусом хромосомы, к-рый связывается с внешней мембраной во время инициации репликации. Библ. 14. Япония, Dep. of Bioengineering, Tokyo Inst. of Technology, O-akayama, Meguro-ku, Tokyo 152.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ХРОМОСОМА
РЕПЛИКАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
УЧАСТОК ORI
ORIC
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
НАРУЖНАЯ МЕМБРАНА
КОМПЛЕКС
ОБРАЗОВАНИЕ
БИБЛИОТЕКА ГЕНОВ
Дата ввода:

1-20 21-40 41-60 61-62

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска