СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ORIC<.>)

Общее количество найденных документов : 62
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-62

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 16.05-04Б2.118

Автор(ы) : Donczew, Rafal, Makowski, Lukasz, Jaworski, Pawel, Bezulska, Martyna, Nowaczyk, Malgorzata, Zakrzewska-Czerwinska, Jolanta, Zawilak-Pawlik, Anna
Заглавие : The atypical response regulator HP1021 controls formation of the Helicobacter pylori replication initiation complex
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2015. - Vol. 95, N 2. - С. 297-312
Аннотация: Репликация бактериальной хромосомы инициируется белком DnaA, который связывается с областью oriC и расплетает дуплексную ДНК в ДНК-расплетающем элементе (DUE). Инициация репликации строго регулируется рядом фактором, обеспечивающих дупликацию только в условиях, благоприятных для выживаемости дочерних клеток. Показано, что активность oriC у Helicobacter pylori контролируется белком НР1021, членом семейства регуляторов атипичного ответа. Белок НР1021 специфически взаимодействует с oriC в блоках связывания, которые перекрываются с тремя модулями, необходимыми для функционирования oriC: блоками DnaA, гиперчувствительной (hs) областью и DUE. Сделан вывод о том, что НР1021 действует как отрицательный регулятор сборки орисомы in vitro. Предполагается, что НР1021 H. pylori может координировать репликацию хромосомы и другие клеточные процессы в желудке человека. Польша, Dep. Microbiol., Polish Acad. Sci., Inst. Immunol. and Exp. Ther., Weigla 12, Wroclaw 53-114
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
ОРИСОМА
СБОРКА
ДНК
ОБЛАСТЬ ORIC
БЕЛОК
НР1021
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
HELICOBACTER PYLORI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 15.08-04Б2.121

Автор(ы) : Sharma, Atul, Kamran, Mohammad, Verma, Vijay, Dasgupta, Santanu, Dhar, Suman Kumar
Заглавие : Intracellular locations of replication proteins and the origin of replication during chromosome duplication in the slowly growing human pathogen Helicobacter pylori
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2014. - Vol. 196, N 5. - С. 999-1011
Аннотация: С помощью антител к белку, связывающему одноцепочечную ДНК, и репликативной хеликазы (DnaB) из Helicobacter pylori было прослежено перемещение репликативного комплекса при дупликации хромосомы. Также с помощью in situ гибридизации с флуоресцентно меченными последовательностями ДНК, соседствующими с oriC, было определено положение ориджина репликации, в растущих клетках этого патогена. Показано, что сборка реплисомы происходит на ориджине вблизи одного из полюсов клетки и затем две репликативные вилки движутся к центру клетки. Терминация и разборка вилок происходит вблизи от середины клетки с одной стороны от септальной мембраны. Удвоенные копии oriC не разделяются вплоть до поздних стадий элонгации, когда расходятся дочерние хромосомы и формируются два нуклеоида, что свидетельствует о сцепленности сестринских хроматид в самом или рядом с oriC. Кроме того, показано, что такие компоненты репликативной "машины" как DnaB и DnaG (ДНК праймаза) ассоциированы с клеточной мембраной. Предлагается модель сборки и локализации репликативной "машины" H.pylori во время дупликации хромосомы. Индия, Special Centre Mol. Med., Jawaharlal Nerhuru Univ., New Delhi. Библ.73.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ФЕРМЕНТЫ РЕПЛИКАЦИИ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ORIC
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
HELICOBACTER PYLORI (BACT.)
ДУПЛИКАЦИЯ ХРОМОСОМЫ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 15.08-04Б4.80

Автор(ы) : Sharma, Atul, Kamran, Mohammad, Verma, Vijay, Dasgupta, Santanu, Dhar, Suman Kumar
Заглавие : Intracellular locations of replication proteins and the origin of replication during chromosome duplication in the slowly growing human pathogen Helicobacter pylori
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2014. - Vol. 196, N 5. - С. 999-1011
Аннотация: С помощью антител к белку, связывающему одноцепочечную ДНК, и репликативной хеликазы (DnaB) из Helicobacter pylori было прослежено перемещение репликативного комплекса при дупликации хромосомы. Также с помощью in situ гибридизации с флуоресцентно меченными последовательностями ДНК, соседствующими с oriC, было определено положение ориджина репликации, в растущих клетках этого патогена. Показано, что сборка реплисомы происходит на ориджине вблизи одного из полюсов клетки и затем две репликативные вилки движутся к центру клетки. Терминация и разборка вилок происходит вблизи от середины клетки с одной стороны от септальной мембраны. Удвоенные копии oriC не разделяются вплоть до поздних стадий элонгации, когда расходятся дочерние хромосомы и формируются два нуклеоида, что свидетельствует о сцепленности сестринских хроматид в самом или рядом с oriC. Кроме того, показано, что такие компоненты репликативной "машины" как DnaB и DnaG (ДНК праймаза) ассоциированы с клеточной мембраной. Предлагается модель сборки и локализации репликативной "машины" H.pylori во время дупликации хромосомы. Индия, Special Centre Mol. Med., Jawaharlal Nerhuru Univ., New Delhi. Библ.73.
ГРНТИ : 76.03.43
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ФЕРМЕНТЫ РЕПЛИКАЦИИ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ORIC
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
HELICOBACTER PYLORI (BACT.)
ДУПЛИКАЦИЯ ХРОМОСОМЫ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.06-04Б2.139

Автор(ы) : Stepankiw, Nicholas, Kaidow, Akihiro, Boye, Erik, Bates, David
Заглавие : The right halt of the Escherichia coli replication origin is not essential for viability, but facilitates multi-forded replication
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 74, N 2. - С. 467-479
Аннотация: Инициация репликации - ключевое событие в клеточном цикле всех организмов и oriC, ориджин репликации в Escherichia coli, служит типичной модель этого процесса. Минимальная последовательность требуется для функции oriC. Первоначально ее определяли с помощью плазмид, используя клонированные фрагменты ориджина, которые сильно отличаются от последовательностей хромосомы. С помощью метода рекомбинирования in vivo определили последовательность минимального ориджина, поддерживающего репликацию хромосомы. Показали, что правая половина oriC может быть удалена без потери функции ориджина. Клетки, несущие новый 163-п.н минимальный oriC, мало отличались от выживаемости в условиях медленного роста, но были чувствительны к богатой среде, что позволило сделать заключение, что плотная упаковка сайтов связывания инициатора, признак прокариотического происхождения, эволюционировала в сторону поддержки мульти-вилочной репликации. США, Dep. of Human and Molecular Genetics, Baylor College of med., Houston, TX 77030. Библ. 58
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
ORIC
ПРАВАЯ ПОЛОВИНА
УДАЛЕНИЕ
УЧАСТОК 163 П.Н ORIC
МУЛЬТИ-ВИЛОЧНАЯ РЕПЛИКАЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.09-04Б2.81

Автор(ы) : Fiebig, Aretha, Keren, Kinneret, Theriot Julie A.
Заглавие : Fine-scale time-lapse analysis of the biphasic, dynamic behaviour of the two Vibrio cholerae chromosomes
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 60, N 5. - С. 1164-1178
Аннотация: С помощью флуоресцентной репрессорно-операторной системы в живых клетках исследовали динамику поведения хромосом в Vibrio cholerae, геном которого состоит из двух хромосом. Разработали метод анализа движения хромосом в виброидных бактериях и охарактеризовали две различных модели поведения хромосом, соответствующие периоду между сегрегациями и этапу сегрегации. Между сегрегациями позиция ориджина не фиксируется, но сохраняется внутри элипсоидных доменов, шириной 0,4 мкм и длиной 0,6 мкм. Во время сегрегации удалось наблюдать передвижение ориджинов по различным механизмам. Специфичной особенностью явилось то, что oriC1 - домен удерживался на постоянном расстоянии от полюса, независимо от длины клетки, тогда как oriC2 сохранялся в относительно постоянной позиции, то есть реально расположение oriC2 варьировало в зависимости от длины клетки. В то время как поведение двух ориджинов различалось, временная динамика их была примерно одинаковой, свидетельствуя о близких характеристиках окружающей микросреды. США, Dep. of Biochemistry, Stanford Univ. School of Med., Beckman Center, 279 W. Campus Dr., Stanford, CA 95305. Библ. 38
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ХРОМОСОМЫ
ВИБРОИДНЫЕ БАКТЕРИИ
СЕГРЕГАЦИЯ ХРОМОСОМ
ВРЕМЕННОЙ АНАЛИЗ
УЧАСТОК ORI
УЧАСТКИ OROC1, ORIC2
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА
VIBRIO CHOLERAE (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.05-04Б2.168

Автор(ы) : Sibley Christopher D., MacLellan Shawn R., Finan, Turlough
Заглавие : The Sinorhizobium meliloti chromosomal origin of replication
Источник статьи : Microbiology. - 2006. - Vol. 152, N 2. - С. 443-455
Аннотация: Показано, что предсказанный ориджин репликации (oriC), локализованный на хромосоме Sinorhizobium meliloti, определяет автономную репликацию плазмиды, нереплицирующейся в норме в клетках S. meliloti. Таким образом, впервые экспериментально локализован ориджин репликации на хромосоме Rhizobiaceae и его положение по соседству с hemE аналогично позиции oriC у Caulobacter crescentus. По изменению подвижности в геле комплексов образуемых oriC с очищенным гомологичным белком инициации репликации DnaA, в районе oriC были картированы сайты связывания DnaA. Мутации в этих сайтах исключают автономную репликацию. При экспрессии DnaA с плазмидного промотора lac клетки S. meliloti приобретают нитевидную форму, что свидетельствует о нарушении клеточного деления. Интересно отметить, что эти нитевидные клетки напоминают дифференцированные бактероиды, наблюдаемые внутри растительных клеток корневых клубеньков люцерны. Канада, Centr Environment. Genom., Dep Biol., McMaster Univ. 1280 Main St West, Hamilton, Ontario, Canada L8S 4K1. Библ. 53
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ОРИДЖИН РЕПЛИКАЦИИ ORIC
ХРОМОСОМНЫЙ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
SINORHIZOBIUM MELILOTI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.01-04Б2.273

Автор(ы) : Berkmen Melanie B., Grossman Alan D.
Заглавие : Spatial and temporal organization of the Bacillus subtilis replication cycle
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 62, N 1. - С. 57-71
Аннотация: Репликация ДНК происходит в определенных местах в клетке. Для изучения пространственной и временной организации репликации Bacillus subtilis создали конструкции, позволяющие видеть сайты начала репликации (oriC) и реплисомы в живых клетках. В первом случае рядом с сайтом oriC встроили несколько сайтой lacO. Репрессор lac-оперона, слитый с синим флюоресцирующим белком, присоединялся к сайтам lacO и визуализировал участок рядом с сайтом oriC. Для визуализации реплисом использовали слияние тау-субъединицы ДНК-полимеразы с желтым флюоресцирующим белком. Показано, что перед репликацией сайт начала репликации располагается в середине клетки. После инициации репликации реплисома обнаруживается рядом с oriC. Реплисома остается в середине клетки и после разделения дуплицированных oriC. Если искусственно сместить сайт oriC, то реплисома также изменит расположение, что указывает на то, что во время инициации позиция oriC определяет позицию реплисомы. При помощи цейтраферной микросъемки показано, что каждые несколько секунд единый фокус реплисомы обратимо расходится на 2 близкорасположенных фокуса. Похоже, что сестринские репликационные вилки не так тесно связаны друг с другом во время цикла репликации. Такая динамика расположения вилок сохраняется и при остановке элонгации, что указывает на независимость этого от движения ДНК относительно реплисомы. США [Grossman A. D.], Dep. of Biol., Massachusetts Inst. of Technol., Cambridge, MA 02139. Библ. 55
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ХРОМОСОМА
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
УЧАСТОК ORI
САЙТ ORIC
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
БЕЛОК
РЕПЛИСОМА
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.12-04Б4.190

Автор(ы) : Fiebig, Aretha, Keren, Kinneret, Theriot Julie A.
Заглавие : Fine-scale time-lapse analysis of the biphasic, dynamic behaviour of the two Vibrio cholerae chromosomes
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 60, N 5. - С. 1164-1178
Аннотация: С помощью флуоресцентной репрессорно-операторной системы в живых клетках исследовали динамику поведения хромосом в Vibrio cholerae, геном которого состоит из двух хромосом. Разработали метод анализа движения хромосом в виброидных бактериях и охарактеризовали две различных модели поведения хромосом, соответствующие периоду между сегрегациями и этапу сегрегации. Между сегрегациями позиция ориджина не фиксируется, но сохраняется внутри элипсоидных доменов, шириной 0,4 мкм и длиной 0,6 мкм. Во время сегрегации удалось наблюдать передвижение ориджинов по различным механизмам. Специфичной особенностью явилось то, что oriC1 - домен удерживался на постоянном расстоянии от полюса, независимо от длины клетки, тогда как oriC2 сохранялся в относительно постоянной позиции, то есть реально расположение oriC2 варьировало в зависимости от длины клетки. В то время как поведение двух ориджинов различалось, временная динамика их была примерно одинаковой, свидетельствуя о близких характеристиках окружающей микросреды. США, Dep. of Biochemistry, Stanford Univ. School of Med., Beckman Center, 279 W. Campus Dr., Stanford, CA 95305. Библ. 38
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: ХРОМОСОМЫ
ВИБРОИДНЫЕ БАКТЕРИИ
СЕГРЕГАЦИЯ ХРОМОСОМ
ВРЕМЕННОЙ АНАЛИЗ
УЧАСТОК ORI
УЧАСТКИ OROC1, ORIC2
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА
VIBRIO CHOLERAE (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.01-04Б2.241

Автор(ы) : Duret, Sybille, Andre, Aurelie, Renaudin, Joel
Заглавие : Specific gene targeting in Spiroplasma citri: Improved vectors and production of unmarked mutations using site-specific recombination
Источник статьи : Microbiology. - 2005. - Vol. 151, N 8. - С. 2793-2803
Аннотация: В Spiroplasma citri, где гомологичная рекомбинация неэффективна, специфичная генная мишень может быть выбрана с использованием репликативных oriC-плазмид. Сконструировали новые векторы, используемые для инактивации гена ccr, кодирующего компонент IIA глюкозофосфотрансферазной системы (PTS) пермеазы. Селекция рекомбинантов проходила в два этапа с использованием различных маркеров отбора, один из которых мог экспрессироваться, только если происходила рекомбинация в результате кроссинговера в намеченном гене. Провели скрининг полученных трансформантов и размножили их в присутствии гентамицина, до того как crr-трансформанты были отобраны по устойчивости к тетрациклину. Мутант GII3-gt1 с разрушенным геном crr не мог использовать ни глюкозу, ни трегалозу, показывая этим, что в S. citri PTS-пермеазы функционируют с одним компонентом IIA. Продемонстрировали также возможность использования рекомбинационной системы транспозона 'гамма''дельта'TnpR/res для полученных немаркированных мутаций в S. citri. Франция, UMR 1090 Genomique Develop. et Pouvoir Pathogene, INRA, Univ. De Bordeaux 2. Библ. 41
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
СПЕЦИФИЧНЫЕ ГЕННЫЕ МИШЕНИ
ПЛАЗМИДЫ
РЕПЛИКАТИВНЫЕ ORIC-ПЛАЗМИДЫ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
ТРАНСПОЗОНЫ
ТРАНСПОЗОН ГАММА, ДЕЛЬТА TUPR/RES
НЕМАРКИРОВАННЫЕ МУТАЦИИ
SPIROPLASMA CITRI (BACT.)
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 05.03-04Я6.108

Автор(ы) : Bach, Trond, Skarstad, Kirsten
Заглавие : Re-replication from non-sequesterable origins generates three-nucleoid cells which divide asymmetrically
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2004. - Vol. 51, N 6. - С. 1589-1600
Аннотация: В быстро растущих клетках Escherichia coli репликационные циклы перекрываются, а инициация происходит в многочисленных точках начала репликации (oriC), которые инициируются синхронно и только один раз на цикл. Ре-инициация новых oriC, устраняется секвестрацией, механизмом, зависимым от белка SeqA и Dam-метилирования GATC сайтов в oriC. В данной работе CATC сайты заменили на GTTC, что уменьшило секвестирование до уровня SeqA клеток. Ре-инициация в мутантах приводила к появлению дополнительного вне-нуклеоида. Трех-нуклеоидные клетки делились ассиметрично на клетку с двумя нуклеоидами и клетку с одним нуклеоидом. Полученные результаты свидетельствуют, что преждевременные циклы репликации, хромосомной сегрегации и клеточного деления гибко приспосабливаются к существующему контролю клеточного цикла. Норвегия, Dep. of Cell Biol., Inst. for Cancer Res., The Norwegian Radium Hosp., 0310 Oslo. Библ. 51
ГРНТИ : 34.19.19
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ПОВТОРНАЯ
УЧАСТКИ ORIC
НЕСЕКВЕСТИРУЕМЫЕ
МУТАНТЫ
КЛЕТОЧНОЕ ДЕЛЕНИЕ
ТРЕХНУКЛЕОИДНЫЕ КЛЕТКИ
АССИМЕТРИЧНОЕ ДЕЛЕНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.05-04Б2.308

Автор(ы) : Bach, Trond, Skarstad, Kirsten
Заглавие : Re-replication from non-sequesterable origins generates three-nucleoid cells which divide asymmetrically
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2004. - Vol. 51, N 6. - С. 1589-1600
Аннотация: В быстро растущих клетках Escherichia coli репликационные циклы перекрываются, а инициация происходит в многочисленных точках начала репликации (oriC), которые инициируются синхронно и только один раз на цикл. Ре-инициация новых oriC, устраняется секвестрацией, механизмом, зависимым от белка SeqA и Dam-метилирования GATC сайтов в oriC. В данной работе CATC сайты заменили на GTTC, что уменьшило секвестирование до уровня SeqA клеток. Ре-инициация в мутантах приводила к появлению дополнительного вне-нуклеоида. Трех-нуклеоидные клетки делились ассиметрично на клетку с двумя нуклеоидами и клетку с одним нуклеоидом. Полученные результаты свидетельствуют, что преждевременные циклы репликации, хромосомной сегрегации и клеточного деления гибко приспосабливаются к существующему контролю клеточного цикла. Норвегия, Dep. of Cell Biol., Inst. for Cancer Res., The Norwegian Radium Hosp., 0310 Oslo. Библ. 51
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ПОВТОРНАЯ
УЧАСТКИ ORIC
НЕСЕКВЕСТИРУЕМЫЕ
МУТАНТЫ
КЛЕТОЧНОЕ ДЕЛЕНИЕ
ТРЕХНУКЛЕОИДНЫЕ КЛЕТКИ
АССИМЕТРИЧНОЕ ДЕЛЕНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.02-04Б4.55

Автор(ы) : Simmons Lyle A., Felczak, Magdalena, Kaguni Jon M.
Заглавие : DnaA Protein of Escherichia coli: Orligomerization at the E. coli chromosomal origin is required for initiation and involves specific N-terminal amino acids
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2003. - Vol. 49, N 3. - С. 849-958
Аннотация: Повторяющиеся последовательности бокса DnaA внутри репликационных ориджинов бактерий и прокариотических плазмид узнаются инициатором репликации, белком DnaA. Предполагают, что на хромосомном ориджине Escherichia coli, oriC, происходит олигомеризация DnaA, чтобы инициировать репликацию ДНК. В данной работе осуществили подсчет образования олигомера на oriC, основывающийся на комплементации между двумя аллелями dnaA, которые являются неактивными сами по себе. Одна аллель - dnaA46. Ее неактивность при непермиссивной температуре обусловлена специфическим дефектом в АТФ связывании. Вторая аллель T435K не поддерживает репликацию ДНК из-за неспособности связываться с последовательностями бокса DnaA внутри oriC. Показали, что аллель T435K может комплементировать аллель dnaA46(Ts). Результаты поддерживают модель, где олигомер образуется при связывании последовательностей бокса DnaA на oriC с DnaA46, с которой затем связывается T435K, чтобы образовать активный комплекс. Основываясь на этом подсчете показали, что при изменении лейцина 5, триптофана 6 и цистеина 9 в предсказанной альфа-спирали возникают препятствия для образования олигомера. Глутамин 8 необходим для образования олигомера на oriC - содержащих плазмидах. Предполагают, что комплекс DnaA - oriC на хромосомном локусе oriC сходен, но не идентичен комплексу, собираемому на плазмиде. Результаты позволяют предположить, что пролин 28 у DnaA участвует в пополнении DnaB на oriC. Результаты обеспечивают прямое доказательство, что олигомеризация DnaA на oriC необходима для осуществления инициации. США, Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Michigan State University, East Lansing, Michigan 48824-131. Библ. 48
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
УЧАСТОК ORIC
БЕЛОК DNAA
АЛЛЕЛИ
ОЛИГОМЕРИЗАЦИЯ
СПЕЦИФИЧЕСКИЕ N-ТЕРМИНАЛЬНЫЕ АМИНОКИСЛОТЫ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.03-04Б2.166

Автор(ы) : Simmons Lyle A., Felczak, Magdalena, Kaguni Jon M.
Заглавие : DnaA Protein of Escherichia coli: Orligomerization at the E. coli chromosomal origin is required for initiation and involves specific N-terminal amino acids
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2003. - Vol. 49, N 3. - С. 849-958
Аннотация: Повторяющиеся последовательности бокса DnaA внутри репликационных ориджинов бактерий и прокариотических плазмид узнаются инициатором репликации, белком DnaA. Предполагают, что на хромосомном ориджине Escherichia coli, oriC, происходит олигомеризация DnaA, чтобы инициировать репликацию ДНК. В данной работе осуществили подсчет образования олигомера на oriC, основывающийся на комплементации между двумя аллелями dnaA, которые являются неактивными сами по себе. Одна аллель - dnaA46. Ее неактивность при непермиссивной температуре обусловлена специфическим дефектом в АТФ связывании. Вторая аллель T435K не поддерживает репликацию ДНК из-за неспособности связываться с последовательностями бокса DnaA внутри oriC. Показали, что аллель T435K может комплементировать аллель dnaA46(Ts). Результаты поддерживают модель, где олигомер образуется при связывании последовательностей бокса DnaA на oriC с DnaA46, с которой затем связывается T435K, чтобы образовать активный комплекс. Основываясь на этом подсчете показали, что при изменении лейцина 5, триптофана 6 и цистеина 9 в предсказанной альфа-спирали возникают препятствия для образования олигомера. Глутамин 8 необходим для образования олигомера на oriC - содержащих плазмидах. Предполагают, что комплекс DnaA - oriC на хромосомном локусе oriC сходен, но не идентичен комплексу, собираемому на плазмиде. Результаты позволяют предположить, что пролин 28 у DnaA участвует в пополнении DnaB на oriC. Результаты обеспечивают прямое доказательство, что олигомеризация DnaA на oriC необходима для осуществления инициации. США, Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Michigan State University, East Lansing, Michigan 48824-131. Библ. 48
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
УЧАСТОК ORIC
БЕЛОК DNAA
АЛЛЕЛИ
ОЛИГОМЕРИЗАЦИЯ
СПЕЦИФИЧЕСКИЕ N-ТЕРМИНАЛЬНЫЕ АМИНОКИСЛОТЫ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.06-04Б2.207

Автор(ы) : Lartigue, Carole, Blanchard, Alain, Renaudin, Joel, Thiaucourt, Francois, Sirand-Pugnet, Pascal
Заглавие : Host specificity of mollicutes oriC plasmids: Functional analysis of replication origin
Источник статьи : Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 22. - С. 6610-6618
Аннотация: Необычные oriC-плазмиды, содержащие ген dnaA и последовательности, окружающие DnaA-бокс, получили из Spiroplasma citri и Mycoplasma pulmonis. Для исследования их специфичности разработали набор подобных плазмид из трех микоплазм, относящихся к кластеру Mycoides - Mycoplasma mucoides subsp. mycoides LC (MmmLC), M. mycoides subsp. mycoides (MmmSC) и Mycoplasma capricolum subsp. capricolum. Микоплазмы S. citri и M. pulmonis использовали в качестве реципиентов для трансформации гомологичными и гетерологичными oriC-плазмидами. Все пять видов были успешно трансформированы гомологичными плазмидами, свидетельствуя, что район гена dnaA представляет собой ориджин репликации. Однако способность реплицировать гетерологичные oriC-плазмиды варьировала в зависимости от вида. Например, плазмида oriC из M. capricorum не реплицировалась в близкородственных видах MmmSC и MmmLC. Наоборот, плазмиды, несущие oriC из MmmSC, MmmLC и более отдаленного вида S. citri, реплицировались в M. capricolum. Полученные результаты привели к выводу, что cis-элементы, присутствующие в последовательностях oriC не только детерминанты хозяйской специфичности. Франция, UMR GDPP, INRA-Univ. Voctor Segalen Bordeaux 2, BP 81, 33883 Villenave d'Ornon Cedex. Библ. 39
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДЫ ORIC
РЕПЛИКАЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕН РЕПЛИКАЦИИ DNAA
DNAA-БОКС
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
SPIROPLASMA CITRI (BACT.)
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.06-04Б2.209

Автор(ы) : d'Alencon, Emmanuelle, Taghbalout, Aziz, Bristow, Claire, Kern, Renee, Aflalo, Revital, Kohiyama, Masamichi
Заглавие : Isolation of a new hemimethylated DNA binding protein which regulates dnaA gene expression
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, N 9. - С. 2967-2971
Аннотация: Установлено, что ген yccV Escherichia coli, функция которого была неизвестна, кодирует белок, обладающий выраженной аффинностью по отношению к полуметилированной ДНК в районе oriC. Показано, что данный белок осуществляет in vivo негативный контроль экспрессии гена dnaA. Франция, Inst. J. Monod, Univ. Paris VI-VII, 75251 Paris Cedex 05
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ДНК
МЕТИЛИРОВАНИЕ ДНК
ПОЛУМЕТИЛИРОВАННЫЕ САЙТЫ
РЕГУЛЯТОРНЫЙ БЕЛОК YCCV
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ORIC
ГЕНЫ
ГЕН DNAA
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ НЕГАТИВНАЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

16.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.10-04Б2.126

Автор(ы) : Messer, Walter
Заглавие : The bacterial replication initiator DnaA. DnaA and oriC, the bacterial mode to initiate DNA replication
Источник статьи : FEMS Microbiol. Rev. - 2002. - Vol. 26, N 4. - С. 355-374
Аннотация: Инициация репликации является центральным событием в бактериальном клеточном цикле. Клетки контролируют скорость синтеза ДНК посредством модулирования частоты, с которой инициируются новые цепи, подобно другим видам макромолекулярного синтеза. Конец репликационного цикла характеризуется контрольной точкой, которая должна быть достигнута, чтобы произошло клеточное деление. Обзор суммирует данные последних лет о биохимии, генетике и контроле репликации в бактериях и центральной роли инициирующего белка DnaA. Германия, Max-Plank-Institut fur molekulare Genetik, Ihnestrasse 73, D-14195 Berlin-Dahlem
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
БЕЛОК DNAA
РЕПЛИКАЦИОННЫЙ ЦИКЛ
УЧАСТОК ORIC
МОДЕЛЬ
БАКТЕРИИ
ОБЗОРЫ
Дата ввода:

17.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.03-04Б2.167

Автор(ы) : Cordova Caio M.M., Lartigue, Carole, Sirand-Pugnet, Pascal, Renaudin, Joel, Gunha Regina A.F., Blanchard A.
Заглавие : Identification of the origin of replication of the Mycoplasma pulmonis chromosome and its use in oriC replicative plasmids
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 19. - С. 5426-5435
Аннотация: Mycoplasma pulmonis, патоген грызунов, является хорошей моделью для изучения микоплазмозов. Сравнение полностью секвенированных геномов Mollicutes выявило отсутствие консервативности в расположении генов в области oriC и локализацию потенциальных DnaA-боксов перед и после гена dnaA. С использованием клонирования предсказанной области oriC в искусственную плазмиду и трансформации микоплазм показали, что oriC обладает функциональной активностью. Через несколько пассажей in vitro плазмида интегрировала в хромосомную область oriC. Укорачивание области oriC до участка, расположенного перед или после dnaA, привело к образованию плазмид, неспособных к репликации в M. pulmonis, за исключением конструкций, в которых эти 2 межгенных участка клонировали с использованием tetM в качестве спейсера. В такую плазмиду oriC клонировали фрагмент ген гемолизина hlyA, и трансформировали полученной в результате плазмидой клетки M. pulmonis. Показали, что плазмиды oriC могут использоваться для изучения роли определенных генов, в том числе генов, вовлеченных в патогенез. Франция, Lab. Interact. Plantes-Pathgenes, INRA-Univ. Victor Segalen Bordeaux 2, 33883 Villenave d'Ornon Cedex. Библ. 46
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: MYCOPLASMA PULMONIS (BACT.)
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ПЛАЗМИДЫ
РЕПЛИКАТИВНЫЕ
ОБЛАСТЬ ORIC
ПРИМЕНЕНИЕ
ГЕНЫ
РОЛЬ
Дата ввода:

18.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.03-04Б2.163

Автор(ы) : Weigel, Christoph, Seitz, Harald
Заглавие : Strand-specific loading of DnaB helicase by DnaA to a substrate mimicking unwound oriC
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2002. - Vol. 46, N 4. - С. 1149-1156
Аннотация: У Escherichia coli на зеркально симметричных парах олигонуклеотидных субстратов, имитирующих расплетенный сайт oriC, изучена ферментативная активность (замещение нитей) хеликазы DnaB. Присоединение хеликазного комплекса происходило исключительно к одноцепочечной "нижней нити" субстрата. Для полной выраженности хеликазной активности необходимо, чтобы к двуцепочечной части и к одноцепочечной "верхней нити" субстрата был присоединен белок DnaA. Сделан вывод, что in vivo белок DnaA связывает первый из двух хеликазных комплексов, необходимых для сборки двух репликативных вилок, с нижней нитью oriC при инициации репликации хромосомы E. coli в обоих направлениях. Германия [Seitz H.], Max-Planck-Inst. fur mol. Genet., Ihnestrasse 73, D-14195 Berlin. Библ. 35
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ФЕРМЕНТЫ
ХЕЛИКАЗА DNAB
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА
САЙТ ORIC
РАСПЛЕТАНИЕ
БЕЛОК DNAA
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

19.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.02-04Б2.139

Автор(ы) : Lopez, Philippe, Forterre, Patrick, le, Guyader Herve, Philippe, Herve
Заглавие : Origin of replication of Thermotoga maritima
Источник статьи : Trends Genet. - 2000. - Vol. 16, N 2. - С. 59-60
Аннотация: Анализ распределения тетрануклеотида ГАГТ и его инвертированного варианта АЦТЦ в геноме Thermotoga maritima обнаружил одну сингулярную точку в области между положениями 155 060 и 162 813, к-рая фланкирована 2 оперонами рРНК. Высказано предположение, что в этом интервале содержится область начала репликации oriC. Этот сегмент генома содержит одну большую межгенную область длиной 559 п. н. между генами TM0151 и TM0152, в к-рой обнаружены 5 прямых и 5 инвертированных повторов мотива АААЦЦТАЦЦАЦЦ, похожего на блоки DnaA Escherichia coli. Полученные данные позволили предположить, что уникальная область начала репликации в геноме T. thermotoga имеет координаты 156 960-157 918. Франция, Phylogenic et Evolution Mol., Univ. Paris Sud, 91405 Orsay. Библ. 7
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ОБЛАСТЬ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC
МЕЖСГЕННАЯ ОБЛАСТЬ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
THERMOTOGA MARITIMA (BACT.)
Дата ввода:

20.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.10-04Б2.122

Автор(ы) : Barekzi, Nazir, Beinlich, Kerry, Hoang Tung T., Pham, Xuan-Quynh, Karkhoff-Schweizer, Roxann, Schweizer Herbert P.
Заглавие : High-frequency Flp recombinase-mediated inversions of the oriC-containing region of the Pseudomonas aeruginosa genome
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 24. - С. 7070-7074
Аннотация: Геномы 2 прототипных клональных штаммов PAO1 и DSM-1707 Pseudomonas aeruginosa отличаются друг от друга инверсией области длиной 2,19 м. п. н., содержащей область начала репликации oriC. Интеграция 2 мишенных сайтов для рекомбиназы Flp (I) рядом с 2 оперонами rrn, содержащими концевые точки инверсии у штамма PAO1, приводит к катализируемой I инверсии расположенного между этими сайтами сегмента хромосомы длиной 1,59 м. п. н., содержащего oriC. Инверсия происходит с высокой частотой (83%) и приводит к конфигурации хромосомы, найденной у штамма DSM-1707. Эти данные показали, что содержащая oriC область хромосомы Ps. aeruginosa толерантна к инверсиям. США, Dep. Microbiol., Colorado State Univ., Fort Collins, CO 80523. Библ. 19
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ХРОМОСОМА
СТРУКТУРА
РЕПЛИКАЦИЯ
УЧАСТОК ORI
УЧАСТОК ORIC
ИНВЕРСИЯ
ФЕРМЕНТЫ
РЕКОМБИНАЗА FLP
ФУНКЦИЯ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)
Дата ввода:

1-20 21-40 41-60 61-62

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска