СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ARGR<.>)

Общее количество найденных документов : 23
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-23

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.05-04Б2.468

Автор(ы) : Stirling C.J., Szatmari G., Stewart G., Smith M.C.M., Sherratt D.J.
Заглавие : The arginine repressor is essential for plasmid-stabilizing site-specific recombination at the ColE1 cer locus
Источник статьи : EMBO Journal. - 1988. - Vol. 7, N 13. - С. 4389-4395
Аннотация: Известно, что наследуемая стабильность в клетках Escherichia coli многокопийной плазмиды ColE1 и родственных ей плазмид связана с поддержанием их ДНК в мономерной форме. Образующиеся в результате recA-зависимой рекомбинации мультимеры обычно разрешаются в мономеры с помощью сайт-специфичной системы рекомбинации, действующей в случае ColE1 на сайт cer. Вместе с тем, конкретные продукты, кодируемые плазмидой и использующие этот сайт в качестве мишени, не идентифицированы. Ранее выявлены 2 гена на хромосоме E. coli, несцепленные между собой и кодирующие продукты, вовлеченные в опосредованную сайтом cer сайт-специфическую рекомбинацию. Проведено выделение, картирование и секвенирование одного из этих генов, xerA. Выявлено, что он идентичен гену argR, кодирующему репрессор генов биосинтеза аргинина. Белок ArgR присоединяется к сайту cer в присутствие аргинина как in vivo, так и in vitro. Предполагается, что такое связывание необходимо для образования комплекса ДНК-белок высокого порядка, вовлеченного в рекомбинационный синапс. Обнаружено также, что ген argR B. subtilis комплементирует мутант argR E. coli по cer-зависимой рекомбинации, несмотря на то, что белки ArgR этих бактерий имеют лишь 27% гомологии. Ил. 5. Табл. 2. Библ. 40. Великобритания, Univ. of Glasgow, Church Street, Glasgow.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ПЛАЗМИДА COLE1
СТАБИЛЬНОСТЬ ПЛАЗМИД
РЕКОМБИНАЦИЯ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
УЧАСТОК CER
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
РЕПРЕССОРЫ
РЕПРЕССОР ARGR
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ РЕГУЛЯЦИЯ
ГЕНЫ XERA
КАРТИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.06-04Б2.600

Автор(ы) : Qiu, Hongfang, Dubois, Evelyne, Broen, Patrick, Messenguy, Francine
Заглавие : Functional analysis of ARGRI and ARGRIII regulatory proteins involved in the regulation of arginine metabolism in Saccharomyces cerevisiae
Источник статьи : Mol. and Gen. Genet. - 1990. - Vol. 222, N 2-3. - С. 192-200
Аннотация: В регуляции процессов синтеза и разрушения аргинина Saccharomyces cerevisiae принимают участие регуляторные белки семейства ARGR. Проведен анализ функциональных доменов 2 из этих белков ARGRI и ARGRIII. В отличие от ARGRII рассматриваемые белки не обладают способностью к активации транскрипции. Показано, что в ARGRI первые 60 аминокислот не существенны для его активности, а функциональные домены ARGRI локализованы в районе, гомологичном таковым в белках МСМ1 и SRF. Белок ARGRIII содержит на С-конце участок, включающий 17 остатков аспартата, к-рый в свою очередь не важен для проявления белком его регуляторных свойств. Нарушение структуры гена белка ARGRIII (делеции) приводят к уменьшению скорости роста мутантов на богаой среде, что свидетельствует о плейотропной роли ARGRII в клетках. Библ. 29. Бельгия, Inst. de Recherches de CERIA and Laboratoire de Microbiologie de l'Universite Libre de Bruxelles, 1. Avenue E. Gryson, B-1070 Brussels.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
СЕМЕЙСТВО ARGR
ДОМЕНЫ ПЛЕЙОТРОПИЯ
МЕТАБОЛИЗМ
АРГИНИН
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.03-04Б2.490

Автор(ы) : Саканян В.А., Овсепян А.С., Метт И.Л., Кочикян А.В., Петросян П.К.
Заглавие : Молекулярное клонирование и структурнофункциональный анализ генов биосинтеза аргинина термофильной бактерии Bacillus stearothermophilus
Источник статьи : Генетика. - 1990. - Т. 26, N 1. - С. 1915-1925
Аннотация: Биосинтетич. гены аргинина штамма Bacillus stearothermophilus 718 отклонированы в мутантном по гену argA штамме E. coli K-12. Установлено, что на фрагменте ДНК размером 3,7 т. ц. н. расположены три функционально активных гена в порядке argA-argE-argB. Экспрессия гена argA B. stearothermophilus в составе многокопийного вектора в 2 раза выше в argRштамме E. coli К-12 по сравнению с изогенным argR+-штаммом. Согласно гибридизац. анализу, гены argA B. stearothermophilus и B. subtilis имеют слабую гомологию, что свидетельствует об их эволюц. удаленности. Библ. 22. СССР, Научно-исследоват. технологич. ин-т аминокислот. НПО "Армбиотехнология", Ереван.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS (BACT.)
ШТАММ 718
ТЕРМОФИЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ
ГЕНЫ
ГЕНЫ СИНТЕЗА АРГИНИНА ARG
КЛОНИРОВАНИЕ
КАРТИРОВАНИЕ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
СРАВНЕНИЕ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
МУТАНТ ARGR COLI (BACT.)
ХОЗЯЙСКИЕ КЛЕТКИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.07-04Б2.45

Автор(ы) : Tian, Guoling, Lim, Dongbin, Oppenheim Joel D., Maas Werner K.
Заглавие : Explanation for different types of regulation of arginine biosynthesis in Escherichia coli B and Escherichia coli K12 caused by a difference between their arginine repressors
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1994. - Vol. 235, N 1. - С. 221-230
Аннотация: У шт. Escherichia coli K12 ферменты биосинтеза аргинина (A) в присутствии экзогенного A полностью репрессированы. В его отсутствие, когда активизирован синтез эндогенного A, они репрессированы частично, а в хемостате, где A является лимитирующим фактором, полностью дерепрессированы. В аналогичных условиях у шт. E. coli B наблюдается неполная репрессия, частичная репрессия и незначительная дерепрессия соотв., т.е. ферменты биосинтеза A образуются у него квазиконститутивно. Как было показано ранее, эти особенности связаны с различиями между аллелями регуляторного гена argR, кодирующего белок-репрессор arg-генов. У обоих штаммов изучали взаимодействие репрессора с операторным участком гена орнитинкарбамоилтрансферазы argF. Выяснилось, что когда репрессоры связаны с A, то репрессор шт. K12 имеет значительно большее сродство к соотв. операторной последовательности, чем репрессор шт. B, а в случае, если оба репрессора свободны, имеет место обратная зависимость. Полученные данные позволяют объяснить различия в регуляции arg-генов двух штаммов. США, Dept Microbiol., NY Univ. Med. Ctr, 50 First Av., New York, NY 10016. Библ. 21
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI
ШТАММЫ B И K12
МЕТАБОЛИЗМ
БИОСИНТЕЗ АРГИНИНА
РЕГУЛЯЦИЯ
ГЕНЫ
БЕЛКА-РЕПРЕССОРА
ARGR
АЛЛЕЛИ
РАЗЛИЧИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 95.08-04Б3.59

Автор(ы) : Tian, Guoling, Lim, Dongbin, Oppenheim Joel D., Maas Werner K.
Заглавие : Explanation for different types of regulation of arginine biosynthesis in Escherichia coli B and Escherichia coli K12 caused by a difference between their arginine repressors
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1994. - Vol. 235, N 1. - С. 221-230
Аннотация: У шт. Escherichia coli K12 ферменты биосинтеза аргинина (A) в присутствии экзогенного A полностью репрессированы. В его отсутствие, когда активизирован синтез эндогенного A, они репрессированы частично, а в хемостате, где A является лимитирующим фактором, полностью дерепрессированы. В аналогичных условиях у шт. E. coli B наблюдается неполная репрессия, частичная репрессия и незначительная дерепрессия соотв., т.е. ферменты биосинтеза A образуются у него квазиконститутивно. Как было показано ранее, эти особенности связаны с различиями между аллелями регуляторного гена argR, кодирующего белок-репрессор arg-генов. У обоих штаммов изучали взаимодействие репрессора с операторным участком гена орнитинкарбамоилтрансферазы argF. Выяснилось, что когда репрессоры связаны с A, то репрессор шт. K12 имеет значительно большее сродство к соотв. операторной последовательности, чем репрессор шт. B, а в случае, если оба репрессора свободны, имеет место обратная зависимость. Полученные данные позволяют объяснить различия в регуляции arg-генов двух штаммов. США, Dept Microbiol., NY Univ. Med. Ctr, 50 First Av., New York, NY 10016. Библ. 21
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI
ШТАММЫ B И K12
МЕТАБОЛИЗМ
БИОСИНТЕЗ АРГИНИНА
РЕГУЛЯЦИЯ
ГЕНЫ
БЕЛКА-РЕПРЕССОРА
ARGR
АЛЛЕЛИ
РАЗЛИЧИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.08-04Б2.289

Автор(ы) : Dion, Michel, Charlier, Daniel, Wang, Haifeng, Gigot, Daniel, Savchenko, Alexey, Hallet, Jean-Noel, Glansdorff, Niclas, Sakanyan, Vahary
Заглавие : The highly thermostable arginine repressor of Bacillus stearothermophilus: Gene cloning and repressor-operator interaction
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 25, N 2. - С. 385-398
Аннотация: Клонирован и секвенирован ген argR аргининового белка-репрессора ArgR (I) Bacillus stearothermophilus. I имеет мол. м. 16800 и на 72% идентичен своему мезофильному аналогу - белку AhrC (II) из Bac. subtilis. I состоит из N-концевого домена связывания с ДНК и С-концевых областей олигомеризации и связывания аргинина (III). I гиперэкспрессирован в Escherichia coli и очищен в форме тримерного белка с мол. м. 48 кД. I ингибирует в E. coli экспрессию слияния argC-lacZ с геном argC из Bac. stearothermophilus. Очищенный I в присутствии III прочно и специфически связывается с оператором argC, перекрывающимся с промотором argC. Очищенный I очень термостабилен: его период полураспада при 90'ГРАДУС' равен 30 мин, в то время как II инактивируется уже при 65'ГРАДУС'. Комплексы I - оператор также очень стабильны и могут эффективно образовываться даже при 85'ГРАДУС', что гораздо выше оптимальной ростовой температуры Bac. stearothermophilus. Франция, Lab. de Biotechnol., Facultedes Sci. et Techniques, Univ. de Nantes, F-44322 Nantes. Библ. 47
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
АРГИНИНОВЫЙ РЕПРЕССОР ARGR
СИНТЕЗ
СТРУКТУРА
ФИЗИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
ГЕНЫ
ГЕН РЕПРЕССОРА ARGR
КЛОНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.12-04Б2.297

Автор(ы) : Niersbach, Helmut, Lin, Robert, Van Duyne Gregory D., Maas Werner K.
Заглавие : A superrepressor mutant of the arginine repressor with a correctly predicted alteration of ligand binding specificity
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1998. - Vol. 279, N 4. - С. 753-760
Аннотация: На основании известной 3-мерной структуры кармана связывания L-аргинина (I) в аргининовом репрессоре ArgR (II) Escherichia coli предсказано, что замена Asp[128]'-'Asn должна привести к преимущественному связыванию L-цитруллина (III) по сравнению с I. Сконструирован мутант II D128N (IIA), к-рый сильнее связывает III, чем I. Обмен между тримерами IIA в гексамере ингибируется так же, как это делает I в случае II дикого типа. IIA преципитируется III, а не I, а II дикого типа - наоборот. Показать корепрессорное действие III не удалось, т. к. сама мутация D128N вызывает суперрепрессорный эффект: IIA в отсутствие I и III является таким же сильным репрессором, как II в присутствии I. США, Dep. Microbiol., New York Univ. Med. Ctr., New York, NY 10016. Библ. 31
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПРЕССОРЫ
АРГИНИНОВЫЙ РЕПРЕССОР ARGR
СУПЕРРЕПРЕССОРНЫЙ МУТАНТ
ЛИГАНДЫ
ИЗМЕНЕНИЕ СПЕЦИФИЧНОСТИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.227

Автор(ы) : Lu, Chung-Dar, Winteler, Harald, Abdelal, Ahmed, Haas, Dieter
Заглавие : The ArgR regulatory protein, a helper to the anaerobic regulator ANR during transcriptional activation of the arcD promoter in Pseudomonas aeruginosa
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 8. - С. 2459-2464
Аннотация: В условиях низкой конц-ии O[2] транскрипц. активатор ANR (I) связывается с сайтом с центром в положении -41,5 перед опероном arcDAB ферментов аргининдеиминазного пути у Pseudomonas aeruginosa. Анаэробная индукция этого оперона усиливается в 2-3 раза внеклеточным аргинином. Этот эффект I зависит в транс-положении от транскрипц. регулятора ArgR (II) и в цис-положении от сайта связывания II с центром в положении -73,5 промотора arcD. Методами сдвига ЭФ-подвижности и ДНКазного футпринтинга продемонстрировано связывание II с этим сайтом in vitro. Этот сайт содержит последовательность 5'-ТГАЦГЦ-3', к-рая только на 1 н. отличается от мотива 5'-ТГТЦГЦ-3', найденного в др. сайтах связывания II у Ps. aeruginosa. Сравнение всех известных сайтов связывания II показало, что они состоят из прямого повтора 2 полусайтов. II в отсутствие I не индуцирует оперон arc. Предложена модель, согласно к-рой II физически контактирует с I и облегчает инициацию транскрипции оперона arc. США, Dep. Biol., Georgia State Univ., Atlanta, GA 30303. Библ. 33
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛОК ARGR
КОНТАКТ С
ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ АКТИВАТОР ANR
ВЛИЯНИЕ НА
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН ARC
ИНИЦИАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
РЕГУЛЯЦИЯ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.289

Автор(ы) : Karaivanova, Iovka Miltcheva, Weigel, Pierre, Takahashi, Masayuki, Fort, Cecile, Versavaud, Alain, Van, Duyne Gregory, Charlier, Daniel, Hallet, Jean-Noel, Glansdorff, Nicolas, Sakanyan, Vehary
Заглавие : Mutational analysis of the termostable arginine repressor from Bacillus stearothermophilus: Dissecting residues involved in DNA binding properties
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 291, N 4. - С. 843-855
Аннотация: Клонировали гены argR из нескольких штаммов Bacillus stearothermophilus и провели их секвенирование, чтобы оценить консервативность аминокислотной последовательности в аргининовом репрессоре среди видов известных по своей высокой дивергенции. Применив ПЦР амплификацию сконструировали фрагмент ДНК, комплементарный определенному участку ДНК из B. stearothermophilus ATCC31783 и использовали его в качестве argR - специфической пробы для скрининга 'лямбда'Zap фаговой библиотеки в E. coli. Аминокислотные последовательности ArgR белка из исследованных штаммов характеризовались высоким уровнем сходства. Изолировали 7 ArgR мутантов и протестировали их на способность репрессировать экспрессию смешанного argC-lacZ в E. coli. Показали дерепрессию репортерного гена в E. coli. Подтвердили, что несколько консервативных аминокислотных остатков, локализованных в N-терминальной области репрессоров ArgR ответственны за связывание ДНК. Изолировали 8 ArgR мутантов и протестировали их на способность репрессировать экспрессию смешанного argC-lacZ в E. coli. Подтвердили, что несколько лейциновых остатков включены в структуру домена олигомеризации репрессоров ArgR из трех штаммов B. stearothermophilus. Франция, Laboratoire de Biotechnologie, UPRES Biocatalyse, Faculte des Sciences et des Techniques Universite de Nantes, Nantes 44322, Cedex 3. Библ. 49
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ АРГИНИНОВОГО РЕПРЕССОРА ARGR
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
РЕПРЕССОРЫ
ARGR
АМИНОКИСЛОТНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
КОНСЕРВАТИВНОСТЬ
N-КОНЦЫ
СВЯЗЫВАНИЕ ДНК
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS (BACT.)
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.11-04Б2.231

Автор(ы) : Ochs Martina M., Lu, Chung-Dar, Hancock Robert E.W., Abdelal Ahmed T.
Заглавие : Amino acid-mediated induction of the basic amino acid-specific outer membrane porin OprD from Pseudomonas aeruginosa
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 17. - С. 5426-5432
Аннотация: Показано, что у Pseudomonas aeruginosa экспрессия порина внешней мембраны OprD, облегчающего диффузию основных аминокислот и антибиотика имипенема, сильно индуцируется при использовании аргинина, гистидина, глутамата или аланина в кач-ве единственных источников С. Индукция oprD подавляется сукцинатом, вероятно, из-за катаболитной репрессии. Индукция аргинином зависит от регуляторного белка ArgR. Методами сдвига ЭФ-подвижности и защиты от ДНКазы показано, что очищенный ArgR связывается оператором перед геном oprD. Индукция экспрессии oprD глутаматом не зависит от ArgR. Уровень OprD сильно реагирует на использование глутамата или аланина в кач-ве единственных источников N. Таким образом, экспрессия oprD связана у Ps. aeruginosa с углеродным и азотным метаболизмом. Канада, Dep. Microbiol. and Immunol., Univ. British Columbia, Vancouver, B.C. V6T 1Z3. Библ. 28
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТРАНСПОРТ ВЕЩЕСТВ
ОСНОВНЫЕ АМИНОКИСЛОТЫ
АНТИБИОТИК ИМИПЕНЕМ
МЕХАНИЗМ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН ПОРИНА ВНЕШНЕЙ МЕМБРАНЫ OPRD
РЕГУЛЯЦИЯ
ВЛИЯНИЕ
АМИНОКИСЛОТЫ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ ARGR
ФУНКЦИЯ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.06-04Б2.279

Автор(ы) : Barcelona-Andres, Belen, Marina, Alberto, Rubio, Vicente
Заглавие : Gene structure, organization, expression, and potential regulatory mechanisms of arginine catabolism in Enterococcus faecalis
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 22. - С. 6289-6300
Аннотация: Для характеристики путей аргинина в Enterococcus faecalis клонировали район (8228 п. н.) из 'лямбда'gtl1 геномной библиотеки E. faecalis, кластер из 5 генов, соответствующий ADI-оперону. Идентифицировали 4 дополнительных гена на одной нити ДНК и один ген - на другой. Исследование белковых продуктов позволило определить функции всех 10 генов. Показали, что аргинин индуцирует экспрессию arcABCD при помощи двух гомологичных регуляторов типа ArgR/AhrC, кодируемых генами argR1 и argR2. Последовательности для связывания ArgR1/ArgR2 обнаружили в промоторных районах arcA и argR1/argR2, а связывающие последовательности для ArcR и для CcpA - в argR1/argR2 и arcA промоторных районах. Среди трех других идентифицированных генов две формировали транскрипционную единицу и кодировали транскрипционный регулятор ArsR и цистеинпротеазу. Испания, Inst. de Biomed. De Valencia (IBV-CSIC), Valencia. Библ. 72
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: АМИНОКИСЛОТЫ
АРГИНИН
КАТАБОЛИЗМ
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН КАТАБОЛИЗМА АРГИНИНА ADY
КЛОНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
АКТИВАТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ ARGR1, ARGR2
ENTEROCOCCUS FAECALIS (BACT.)
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.08-04Б2.207

Автор(ы) : Bringel, Francoise, Nicoloff, Herve, Arsene-Ploetze, Florence, Hubert, Jean-Claude
Заглавие : Recherche d'orthologues d'ArgR/AhrC dans le genome de bacteries a Gram positif. Mise en evidence de groupes de syntenie : Докл. [11 Reunion du Club des bacteries lactiques, Bordeaux, 14-16 nov., 2001]
Источник статьи : Sci. alim. - 2002. - Vol. 22, N 1-2. - С. 133-142
Аннотация: В регуляции транскрипции генов метаболизма аргинина (I) участвуют аргининовый репрессор ArgR (I) у Lactobacillus plantarum и его гомолог AhrC у Bacillus subtilis. Предпринят поиск гомологов I в полностью и частично секвенированных геномах грамположительных бактерий. От 2 до 4 похожих на I белков (паралогов) найдено у Staphylococcus aureus, Lactococcus lactis, Enterococcus faecalis и различных видов Streptococcus. Анализ генов, окружающих argR, обнаружил 3 группы ассоциированных с argR генов, к-рые в целом соответствуют кластерам гомологов I на филогенетич. древе. В 15 случаях, включая L. plantarum и Bac. subtilis, ген argR сцеплен с recN, в 7 случаях - с генами arc аргининдеиминазного пути катаболизма I и в 3 случаях с генами arg биосинтеза I. Первые 2 группы сцепления генов найдены у Lc. lactis, S. aureus и Streptococcus (S. thermophilus, S. equi, S. mutans, S. pyogenes и S. pheumoniae). У E. faecalis 2 из 4 копий являются смежными и дивергентно транскрибируемыми. Гены argR, сцепленные со специфич. генами, кодируют гомологичные группы паралогов I. Это позволило предположить, что эти наборы I могут играть разные роли. Франция, Lab. Microbiol. et Genet., Univ. Louis Pasteur Strasbourg I, 67083 Strasbourg. Библ. 30
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: АМИНОКИСЛОТЫ
АРГИНИН
МЕТАБОЛИЗМ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
РЕПРЕССОР ТРАНСКРИПЦИИ ARGR
ФУНКЦИЯ
ОРТОЛОГИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
LACTOCOBACILLUS PLANTARUM (BACT.)
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.237

Автор(ы) : Ghochikyan, Anahit, Karaivanova, Iovka Miltcheva, Lecocq, Michele, Vusio, Patricia, Arnaud, Marie-Claire, Snapyan, Marina, Weigel, Pierre, Guevel, Laetitia, Buckle, Malcolm, Sakanyan, Vehary
Заглавие : Arginine operator binding by heterologous and chimeric ArgR repressors from Escherichia coli and Bacillus stearothermophilus
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 23. - С. 6602-6614
Аннотация: Репрессор Arg R из Bacillus stearothermophilus связывает оператор car AB из Escherichia coli, тогда как репрессор из Escherichia coli слабо связывает оператор argCo из B. stearothermophilus. Для того, чтобы прояснить это противоречивое поведение репрессоров ArgRs сконструировали химерные белки посредством обмена N-терминальных ДНК-связывающих доменов и C-терминальных доменов олигомеризации или посредством обмена линкерного пептида. Химеры, несущие ДНК связывающий домен из E. coli и домен олигомеризации из B. stearothermophilus, показали неспецифичность во взаимодействии с последовательностями arg-операторов, скорее чем специфичность взаимодействия. Химеры, несущие ДНК-связывающий домен из B. stearothermophilus и домен олигомеризации из E. coli, характеризуются высокой аффинностью ДНК-связывания с оператором argCo из B. stearothermophilus и оператором can AB из E. coli и репрессируют транскрипцию репортерного гена из PargCo контрольной области B. stearothermophilus in vitro. Аргинин не оказывал эффекта на эти процессы и в действительности даже уменьшал аффинность ДНК-связывания. Используя метод белкового набора, показали, что ArgR дикого типа из B. stearothermophilus и его производные, содержащие только обменный линкер из ArgR E. coli или несущие ДНК связывающий домен из B. stearothermophilus вдоль линкера и 'альфа'4-областей, были способны связывать argCo, содержащий одиночный Arg бокс. Это связывание было слабее, чем связывание с двухбоксовым оператором, но менее зависимо от аргинина. Сходные наблюдения показали, что 'альфа'4-спираль в домене олигомеризации и линкерный пептид могли вносить вклад в узнавание одиночного или двойного Arg-боксов и, следовательно, в операторную ДНК-связывающую специфичность в сходных, но не идентичных ArgR-репрессорах из двух различных бактерий. Франция, Lab. de Biotechnologie, FRE CNRS 2230, Unite Biocatalyse, Faculte des Sci. et des Techniques, Univ. de Nantes, 44322 Nantes. Библ. 47
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: АМИНОКИСЛОТЫ
АРГИНИН
БИОСИНТЕЗ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ СИНТЕЗА АРГИНИНА
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
РЕПРЕССОР ТРАНСКРИПЦИИ ARGR
СТРУКТУРА
ФУНКЦИИ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS (BACT.)
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 05.03-04Б4.87

Автор(ы) : Barcelona-Andres, Belen, Marina, Alberto, Rubio, Vicente
Заглавие : Gene structure, organization, expression, and potential regulatory mechanisms of arginine catabolism in Enterococcus faecalis
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 22. - С. 6289-6300
Аннотация: Для характеристики путей аргинина в Enterococcus faecalis клонировали район (8228 п. н.) из 'лямбда'gtl1 геномной библиотеки E. faecalis, кластер из 5 генов, соответствующий ADI-оперону. Идентифицировали 4 дополнительных гена на одной нити ДНК и один ген - на другой. Исследование белковых продуктов позволило определить функции всех 10 генов. Показали, что аргинин индуцирует экспрессию arcABCD при помощи двух гомологичных регуляторов типа ArgR/AhrC, кодируемых генами argR1 и argR2. Последовательности для связывания ArgR1/ArgR2 обнаружили в промоторных районах arcA и argR1/argR2, а связывающие последовательности для ArcR и для CcpA - в argR1/argR2 и arcA промоторных районах. Среди трех других идентифицированных генов две формировали транскрипционную единицу и кодировали транскрипционный регулятор ArsR и цистеинпротеазу. Испания, Inst. de Biomed. De Valencia (IBV-CSIC), Valencia. Библ. 72
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: АМИНОКИСЛОТЫ
АРГИНИН
КАТАБОЛИЗМ
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН КАТАБОЛИЗМА АРГИНИНА ADY
КЛОНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
АКТИВАТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ ARGR1, ARGR2
ENTEROCOCCUS FAECALIS (BACT.)
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.05-04Б2.229

Автор(ы) : Nandineni Madhusudan R., Gowirshankar J.
Заглавие : Evidence for an arginine exporter encoded by yggA (argO) that is regulated by the LysR-type transcriptional regulator ArgP in Escherichia coli
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 11. - С. 3539-3546
Аннотация: Идентифицировали рамку считывания yggA в Escherichia coli как ген, находящийся под транскрипционным контролем argP (iciA), кодирующим транскрипционный регулятор типа LysR. Штаммы с нуль-мутациями по данным генам yggA и argP были суперчувствительны к аналогу аргинина - канаванину. Комплементация лизином останавливала экспрессию yggA, даже в argP{+} штамме. Получили доминантные миссенс-мутации в argP, которые несли устойчивость к канаванину. Белок, кодируемый yggA, имел сходство с аминокислотным транспортером (LysE) Corynebacterium glutamaticum. Получили доказательства усиления вытекания аргинина из штаммов E. coli с argP{d} или мультикопийным yggA. Нуль мутация yggA вела к прекращению усиления вытекания аргинина из argP{d}-штамма. Полученные результаты привели к заключению, что ген yggA кодирует ArgP-регулируемый аргининовый экспортер, поэтому его переименовали в argO. Физиологическая функция argO - либо в предотвращении накопления токсических уровней канаванина или аргинина, либо в поддержании баланса между концентрациями лизина и аргинина. Индия, Center for Cellular and Mol. Biol., Hyderabad 500007. Библ. 43
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТРАНСПОРТ ВЕЩЕСТВ
АРГИНИН
МЕХАНИЗМ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН ТРАНСПОРТЕРА АРГИНИНА YGGA
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
АКТИВАТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ ARGR, LYSR
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

16.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.06-04Б2.263

Автор(ы) : Larsen, Rasmus, Buist, Girbe, Kuipers Oscar P., Kok, Jan
Заглавие : ArgR and AhrC are both required for regulation of arginine metabolism in Lactococcus lactis
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 4. - С. 1147-1157
Аннотация: ДНК связывающие белки ArgR и AhrC являются существенными для регуляции метаболизма аргинина в Escherichia coli и Bacillus subtilis, соответственно. Уникальное свойство этих регуляторов заключается в том, что они образуют гексамерные белковые комплексы, опосредующие как репрессию путей биосинтеза аргинина, так и активацию катоболитных путей аргинина. Оперон gltS-argE из Lactococcus lactis кодирует предполагаемый глютаматтранспортный или аргининтраспортный белки и ацетилорнитиндиацетилазу, которая катализирует важный этап в пути биосинтеза аргинина. При скрининге случайной "нокаут"-интеграции обнаружили, что мутанты с дерепрессией характеризовались наличием ISS1 интеграций, в том числе в генах argR и ahrC. Одиночный также как и двойные регуляторные мутанты были сконструированы при использовании Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363. Показали, что три оперона, кодирующих биосинтез аргинина, argCJDBF, argGH и glt-argE были репрессированы посредством продуктов, кодируемых argR и ahrC. Оперон, кодирующий катаболитный путь аргинина arcABD1C1C2TD2, был активирован посредством продукта, кодируемого ahrC, но не посредством продукта, кодируемого argR. Уровень экспрессии с промотора оперона argCJDBF достигал сходных уровней в одиночных мутантах и в двойном мутанте. Предположили, что регуляторы являются взаимозависимыми и не способны комплементировать друг друга. В тоже время они, по-видимому, имеют различные функции, так как только AhrC участвует в активации катаболизма аргинина. Это первое исследование, где показали, что два гомолога регуляторов аргинина участвуют в регуляции биосинтеза аргинина у прокариот и представляют фрагменты необычного механизма регуляции. Нидерланды, Dep of Mol Genetics, Groningen Biomolecular Sci and Biotechnology Inst., Univ of Groningen, 9751 NN Haren. Библ. 52
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: АМИНОКИСЛОТЫ
АРГИНИН
БИОСИНТЕЗ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОН GLTS-ARGE
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
РЕГУЛЯТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ ARGR, AHRC
ФУНКЦИЯ
LACTOCOCCUS LACTIS (BACT.)
Дата ввода:

17.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.06-04Б2.274

Автор(ы) : Hernandez-Flores, Jose Luis, Lopez-Lopez, Karina, Garciduenas-Pina, Rogelio, Jofre-Garfias Alba E., Alvarez-Morales, Ariel
Заглавие : The global arginine regulator ArgR controls expression of argF in Pseudomonas syringae pv. phaseolicola but is not required for the synthesis of phaseolotoxin or for the regulated expression of argK
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 11. - С. 3653-3655
Аннотация: Установлено, что ген argF, кодирующий чувствительный к фазеолину фермент орнитинкарбамоилтрансферазу у Pseudomonas syringae pv. phaseolicola, находится под негативным контролем ArgR, аналогично тому, что отмечено в клетках Pseudomonas aeruginosa. Однако, образование фазеолотоксин-устойчивого фермента орнитинкарбамоилтрансферазы, кодируемого геном argK, синтез фазеолотоксина и инфекционность для стручков бобов не зависят от белка ArgR. Мексика, Dep. Ingener. Genet. Plant., Cent. Investig. Estudios Avanzaddos I. P. N., Unidad Irapuato, Irapuato Gto., C. P. 36500, Mexico
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕН ARGF
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОР ARGR
ГЕНЫ
ГЕН ОРНИТИНКАРБОМОИЛТРАНСФЕРАЗЫ ARGK
PSEUDOMONAS SYRINGAE (BACT.) PV. PHASEOLICOLA
Дата ввода:

18.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.07-04Б2.339

Автор(ы) : Nicoloff, Herve, Arsene-Ploetze, Florence, Malandain, Cedric, Kleerebezem, Michiel, Bringel, Francoise
Заглавие : Two arginine repressors regulate arginine biosynthesis in Lactobacillus plantarum
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 18. - С. 6059-6069
Аннотация: Репрессия carAB-оперона, кодирующего карбомоилфосфатсинтазу, приводит к ингибированию роста Lactobacilus plantarum FB331 в присутствии аргинина. Этот фенотип был использован для положительного скрининга, чтобы отобрать спонтанные мутанты с нарушенной регуляцией в отношении биосинтеза аргинина. 14 мутантов были генетически охарактеризованы в отношении конститутивной продукции аргинина. Мутации были локализованы либо в одном из аргининовых репрессорных генов (argR1 или argR2), представленных в L. plantarum или в предполагаемом ARG-операторе в межгенной области биполярных carAB-argCJBDF-оперонов, участвующих в биосинтезе аргинина. Хотя присутствие двух ArgR-регуляторов обычно обнаруживали в грамположительных бактериях, только одиночные аргининовые репрессоры были до сих пор изучены в Escherichia coli или Bacillus subtilis. У L. plantarum аргининовая репрессия была устранена при возникновении мутаций в ДНК-связывающем домене или домене олигомеризации ArgR1 или ArgR2 или когда мутация A123D встречалась в ArgR1.A123, эквивалент консервативного остатка A124 в ArgR E. coli, участвующего в связывании аргинина, был отличным в ArgR2 у дикого типа. Таким образом, корепрессорные связывающие сайты могут быть отличными у ArgR1 и ArgR2, которые имеют только 35% идентичных остатков. Другие мутанты содержали arg-гены дикого типа и 20 мутантов теряли свою способность расти в нормальной атмосфере без обогащения двуокисью углерода; это позволило обнаружить звено между биосинтезом аргинина и еще неизвестным CO[2]-зависимым метаболическим путем. Во многих грамположительных бактериях экспрессия и взаимодействие ArgR-подобных белков может указывать на наличие сложной регуляторной сети, связанной с ответами к окружающим стимулам. Франция, Lab. de Dynamique, Evolution et Expression de Genomes de Microorganismes, Univ. Louis Pasteur/CNRS FRE2326, Strasbourg. Библ. 39
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: АМИНОКИСЛОТЫ
АРГИНИН
БИОСИНТЕЗ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОН CARAB
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
РЕПРЕССОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ ARGR1, ARGR2
ФУНКЦИЯ
LACTOBACILLUS PLANTARUM (BACT.)
Дата ввода:

19.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.04-04Б2.297

Автор(ы) : Lu, Chung-Dar, Yang, Zhe, Li, Wei
Заглавие : Transcriptome analysis of the ArgR regulon in Pseudomonas aeruginosa
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 12. - С. 3855-3851
Аннотация: Провели транскриптомный анализ для идентификации генов Pseudomonas aeruginosa, контролирующих белок регуляции синтеза аргинина ArgR, и для выяснения путей метаболизма аргинина. Сравнили по генной экспрессии штамм дикого типа PAO1 со мутантом по argR, PAO501, при росте на среде с аргинином и без него. 10 транскрипционных единиц 28 генов индуцировались ArgR и аргинином, включая известные ArgR-регулируемые опероны при аэробных условиях. Вновь идентифицированные гены включали оперон adcAB, кодирующий аргинин декарбоксилазу, белок антипорта и PA0328, кодирующий сшивку пептидазы и автотранспортера IV-типа. Идентифицировали также транспортные системы - PA1971 (braZ), PA2042, PA3934 и PA5152-5155. Только пять транскрипционных единиц 9 генов репрессировались аргинином и ArgR, с тремя оперонами (argR, carAB и argG) в биосинтезе аргинина и двумя оперонами (gltBD и gdhA) в биосинтезе глутамата. Полученные результаты свидетельствуют, что ArgR важен для контроля аргинина и метаболизма глутамата, а аргинин и ArgR могут влиять на индукцию систем поглощения определенных веществ. США, Dep. of Biol., Georgia State Univ., Atlanta, Georgia 30303. Библ. 51
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: АМИНОКИСЛОТЫ
АРГИНИН
БИОСИНТЕЗ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ ARGR
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОН ADCAB
РЕГУЛЯЦИЯ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)
Дата ввода:

20.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.12-04Б2.177

Автор(ы) : Larsen, Rasmus, van Hijum Sacha A.F.T., Martinussen, Jan, Kuipers Oscar P., Kok, Jan
Заглавие : Transcriptome analysis of the Lactococcus lactis ArgR and AhrC regulons
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 74, N 15. - С. 4768-4771
Аннотация: Ранее было показано, что непосредственное взаимодействие двух регуляторов ArgR и AhrC у Lactococcus lactis необходимо для зависимой от аргинина репрессии биосинтетического промотора argC и активации катаболического промотора arcA. С помощью транскриптомного анализа определены глобальные регулоны ArgR и AhrC и установлено, что оба регулятора контролируют аргининовый метаболизм у L. lactis. Нидерланды, Dep. Mol. Genet., Groningen Biomol. Sci., & Biothechnol. Inst., Univ. Groningen, Kerklaan 30, NL-9751 NN Haren. Библ. 19
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: МЕТАБОЛИЗМ
АРГИНИН
КОНТРОЛЬ
РЕГУЛОНЫ
РЕГУЛЯТОРЫ
РЕГУЛЯТОР ARGR
РЕГУЛЯТОР AHRC
LACTOCOCCUS LACTIS (BACT.)
Дата ввода:

1-20 21-23

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска