Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткий полный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ<.>)
Общее количество найденных документов : 82
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-82 
1.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 76 (BI28) 95.08-04Н3.122

Автор(ы) : Kotera, Yasuo, Fontenot J.Darrell, Pecher, Gabriele, Metzgar Richard S., Finn Olivera J.
Заглавие : Humoral immunity against a tandem repeat epitope of human mucin MUC-1 in sera from breast, pancreatic, and colon cancer patients
Источник статьи : Cancer Res. - 1994. - Vol. 54, N 11. - С. 2856-2860
Аннотация: Using synthetic peptides 60, 80, and 105 residues long, corresponding to 3, 4, and 5.25 tandem repeats of human mucin MUC-1 protein core, as antigens in a solid-phase enzyme-linked immunosorbent assay, we screened sera from 24 breast cancer patients, 10 colon cancer patients, and 12 pancreatic cancer patients, at various stages of disease, for the presence of mucin-specific antibodies. The 105-residue peptide was superior in allowing detection of high levels of anti-mucin antibodies in 10.9% of sera in each cancer group. Another 4.3% showed intermediate reactivity. Lower levels of detection were achieved with the 80-residue peptide, and no specific reactivity was detectable with the 60-residue peptide. Anti-mucin antibodies were previously undetectable when this assay was performed with purified whole mucin or short synthetic peptides. The presence or absence of antibody did not correlate with the levels of circulating mucin or stage of disease. One highly reactive serum sample was used to identify more precisely the epitope on the long synthetic peptide to which the reactivity was directed. The reactivity of this serum specific for the 105-residue peptide was blocked by a 9-residue peptide from the NH[2]-terminal region of the 20-residue tandem repeat containing the previously identified immunogenic epitope APDTRP. Another 9-residue mucin peptide, from the COOH-terminal region of the tandem repeat which does not contain the APDTRP epitope, had no effect. All the mucin-specific reactivity was found to be of the IgM isotype, indicating a helper T-cell-independent response, unusual for an antibody against a peptide epitope, but not unexpected for tandemly repeated epitopes. США, Pittsburgh Cancer Inst., Univ. Pittsburgh Sch. Med. Pittsburgh, PA 15261. Библ. 30.
ГРНТИ : 76.29.49
Предметные рубрики: РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
РАК ПОДЖЕЛУДОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
РАК ТОЛСТОЙ КИШКИ
МУЦИН
MUC-1
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ЧЕЛОВЕК
Дата ввода:
2.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.12-04Б1.93

Автор(ы) : Sun, Huaichang, Jacobs Susan C., Smith Geoffrey L., Dixon Linda K., Parkhouse R.M.E.
Заглавие : African swine fever virus gene j13L encodes a 25-27 kDa virion protein with variable numbers of amino acid repeats
Источник статьи : J. Gen. Virol. - 1995. - Vol. 76, N 5. - С. 1117-1127
Аннотация: Исследовали продукт гена j13L вируса африканской лихорадки свиней, кодирующего белок состоящий из 177 аминокислотных остатков с трансмембранным доменом между остатками 32 и 52. Установлен участок отщепления сигнального пептида и участки фосфорилирования и меристилирования. В инфицированных клетках обнаруживают продукты гена j13L с мол. массой 25-27 кД. Различия в размерах связаны с вариациями в числе и последовательностях тандемных повторов аминокислотных остатков. Великобритания, BBSRC Inst. for Animal Health, Pirbright, Woking GU24 ONF. Библ. 47
ГРНТИ : 34.25.17
Предметные рубрики: ВИРУС АФРИКАНСКОЙ ЛИХОРАДКИ СВИНЕЙ
ВИРУСНЫЕ БЕЛКИ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ВАРИАЦИИ
Дата ввода:
3.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 96.02-04И4.220

Автор(ы) : Слободянюк С.Я., Павлова М.Е., Федоров А.Н., Беликов С.И.
Заглавие : BspMII-семейство тандемно организованных последовательностей ДНК байкальских коттоидных рыб (Cottoidei)
Источник статьи : Молекул. биол. - 1994. - Т. 28, N 2. - С. 419-428
Аннотация: Изучали новое семейство высокоповторяющихся тандемно организованных повторов байкальских коттоидных рыб (Cottoidei), выявленных методом ЭФ в ПААГ BspMII-гидролизатов (T'CCGGA) геномной ДНК. Показана способность цепей ДНК повторов к образованию in vitro устойчивых втор. структур. Клонирование и определение нукл. последовательностей ДНК трех таких повторов у двух видов коттид - B.nikolskii и P.kneri - позволило установить их размеры: 238, 154 и 123 п. н.; все три повтора имеют высокогомологич. фланговые р-ны длиной 53 и 63 п. н. Предполагается, что более короткие повторы (154 и 123 п. н.) возникают из 238 п. н. повтора посредством делетирования фрагментов его центральной части. В составе 238 п. н. повтора обнаружен элемент, имеющий промотор для РНК-полимеразы III. Предполагается происхождение этого элемента из одного из генов, кодирующего тРНК. Обсуждается возможность использования BspMII-повторов в кач-ве эволюционного маркера для изучения генезиса Cottoidei. Библ. 19. Россия, ИМГРАН, Москва.
ГРНТИ : 34.33.33
Предметные рубрики: ДНК
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
СЕМЕЙСТВО BSPMII
ОРГАНИЗАЦИЯ
КОТТОИДНЫЕ РЫБЫ
БАЙКАЛЬСКИЕ
COTTOIDEI
Дата ввода:
4.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 96.02-04И2.53

Автор(ы) : Yang, Yong-min, Ortega, Ynes, Sterling, Charles, Adam Rodney D.
Заглавие : Giardia lamblia trophozoites contain multiple alleles of a variant-specific surface protein gene with 105-base pair tandem repeats
Источник статьи : Mol. and Biochem. Parasitol. - 1994. - Vol. 68, N 2. - С. 267-276
Аннотация: Трофозоиты Giardia lamblia проявляют антигенную вариабельность, обусловленную присутствием вариант-специфического поверхностного белка (VSP). VSP богаты остатками Cys и содержат многочисленные копии мотива Cys-X-X-Cys. Ранее клонированный ген VSP (vspA6) из клонированной линии WBA6 содержит 21 копию тандемного повтора длиной 195 п. н., др. изученные VSP не содержат повторов. Из линии WBC5 - производной WBA6 клонировали ген vspC5, к-рый содержит короткие 5'- и 3'-концевые участки, фланкирующие 26 копий тандемного повтора длиной 105 п. н., составляющих 93% кодирующей последовательности (ПС). В геноме этой линии есть также гены, содержащие меньшее число копий повтора. Нуклеотидные ПС, фланкирующие повторы идентичны. Все копии гена vspC5 локализованы в одном участке хромосомы, что указывает на существование множественных аллелей гена vspC5. США, Dep. Med. and Microbiol./Immunol., Coll. Med., Dep. Veterinary Sci., Coll Agricult., Univ. Arizona, Tucson, AZ 85724. Библ. 31
ГРНТИ : 34.33.23
Предметные рубрики: LAMBLIA INTESTINALIS (PROT.)
ТРОФОЗОИТЫ
БЕЛОК
ПОВЕРХНОСТНЫЙ
ВАРИАНТ-СПЕЦИФИЧЕСКИЙ
БЕЛОК VSP
ГЕНЫ
МНОЖЕСТВЕННЫЕ АЛЛЕЛИ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
АНТИГЕННАЯ ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
Дата ввода:
5.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 96.02-04Н1.476

Автор(ы) : Fontenot J.D., Santhana Mariappan S.V., Catasti P., Domenech N., Finn O.J., Gupta G.
Заглавие : Elongated structure of the human muc-1 tandem repeat domain
Источник статьи : Biophys. J. - 1994. - Vol. 66, N 2. - С. 28
Аннотация: Синтезировали пептиды, содержащие 1; 2 или 3 тандемно-соединенных повтора PTDRPAPGSTAPPAHGVTSA из содержащего повторы домена корового белка muc-1 муцина (антигена раков молочной и поджелудочной желез). Исследовав пептиды методами многомерной {1}H-ЯМР-спектроскопии, показали, что они образуют арки с удлиненным концом из аминокислотных остатков 13-20. Обнаружены различия в динамике 20- и 60-звенных молекул. Иммунодоминантность последовательности APDTR в опухолях объясняется ее выступающим положением в молекуле; в результате затрудняется доступность других частей молекулы для лимфоцитарных рецепторов. США, Los Alamos Natl Lab., Los Alamos NM 87545
ГРНТИ : 76.29.49
Предметные рубрики: МУЦИН
MUC-1
БЕЛОК КОРОВЫЙ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ЧЕЛОВЕК
Дата ввода:
6.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 97.03-04И8.177

Автор(ы) : Zardoya R., Villalta M., Lopez-Perez M.J., Garrido-Pertierra A., Montoya J., Bautista J.M.
Заглавие : Nucleotide sequence of the sheep mitochondrial DNA D-loop and its flanking tRNA genes
Источник статьи : Curr. Genet. - 1995. - Vol. 28, N 1. - С. 94-96
Аннотация: Осуществлено секвенирование контрольного сегмента (D-петли) овцы Ovis aries - всего 1189 п. н. В составе этой последовательности выявлен ряд консервативных для D-петли мтДНК млекопитающих: в частности, 10 участков терминационного типа и мотив CSB-1. Напротив, мотивы CSB-2 и CSB-3, обычно выявляемые в мтДНК многих видов млекопитающих, у овцы не найдены. Отмечено, что на долю пары AT приходится 63% секвенированного фрагмента мтДНК овцы. В составе консервативного мотива CSB-1 и фланкирующего гена тРНК фенилаланина отмечен большой полипиримидиновый тракт. В левом домене D-петли мтДНК овцы, фланкируемом тРНК пролина, отмечено присутствие коротких повторов, включающих 3 TAS-мотива (TAS-5, TAS-6 и TAS-7). Полученные данные обсуждаются с точки зрения оценки информативности параметров контрольного сегмента мтДНК в анализе эволюции митохондриальных геномов млекопитающих. Испания [J. M. Bautista], Dep. Bioquim. y Biol. Mol. IV, Fac. Vet., Univ. Complutense Madrid, E-28040 Madrid. Библ. 18
ГРНТИ : 34.23.59
Предметные рубрики: ДНК
МИТОХОНДРИАЛЬНАЯ
D-ПЕТЛЯ
КЛОНИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ЭВОЛЮЦИЯ
ОВЦЫ
OVIS ARIES
Дата ввода:
7.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 97.03-04И8.207

Автор(ы) : Dufresne, Catherine, Mignotte, Francoise, Gueride, Monique
Заглавие : The presence of tandem repeats and the initiation of replication in rabbit mitochondrial DNA
Источник статьи : Eur. J. Biochem. - 1996. - Vol. 235, N 3. - С. 593-600
Аннотация: Подтверждено присутствие в некодирующем сегменте мтДНК кролика Oryctolagus cuniculus высокополиморфного участка, обусловливающего интенсивную гетероплазмию в популяциях и линиях - между консервативным блоком CSB1 и геном тРНК фенилаланина имеется короткий (20 п. н.) и длинный (ДП: 153 п. н.) повторы. Эти повторы локализованы вблизи точки начала репликации Н-цепи мтДНК, поэтому не исключается участие повторов в регуляции этого процесса. Молекулярный анализ подтверждает гетерогенность 5'- и 3'-концевых участков D-петли. Установлена локализация точки начала репликации вплотную к консервативному сегменту CSB1, что также является консервативным признаком митохондриальных геномов млекопитающих. Сайты инициации репликации картированы на самом краю одного из повторов в составе ДП: этот участок характеризуется повышенным содержанием пары АТ - соотв., на каждом ДП инициируется синтез РНК, соотв. Н-цепи мтДНК. Амплификация регуляторного сегмента приводит к мультипликации сайтов инициации и образованию семейства различающихся репликационных РНК-затравок. Полученные данные обсуждаются с точки зрения выяснения роли пространственной структуры анализируемого участка мтДНК в процессе репликации Н-цепи. Франция [M. Gueride], CNRS Ctr Genet. Mol., av. de la Terrasse, F-91198 Gif-sur-Yvette Cedex. Библ. 22
ГРНТИ : 34.23.59
Предметные рубрики: ГЕНОМ МИТОХОНДРИАЛЬНЫЙ
ДНК
НЕКОДИРУЮЩИЙ СЕГМЕНТ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
РЕПЛИКАЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
КАРТИРОВАНИЕ
КРОЛИКИ
Дата ввода:
8.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 76 (BI36) 97.12-04А4.156

Автор(ы) : Kodaira, Mieko, Satoh, Chiyoko, Hiyama, Keiko, Toyama, Kyoko
Заглавие : Lack of effect of atomic bomb radiation on genetic instability of tandem-repetitive elements in human germ cells
Источник статьи : Amer. J. Hum. Genet. - 1995. - Vol. 57, N 6. - С. 1275-1283
Аннотация: Проведен анализ мутаций в 6 микросателлитных локусах - Pc-1, 'лямбда'TM-18, ChdTC-15, p'лямбда'g3, CEB-1, 'лямбда'MS-1 - в семьях, где один или оба родителя были облучены в дозе более 0,001 Зв при ядерных взрывах в Хиросиме и Нагасаки, и в контрольных необлученных семьях. Всего было проанализировано 183 гаметы от необлученных родителей и 65 гамет от облученных лиц со средней дозой 1,9 Зв на гамету. Всего выявлено 28 различных мутаций во всех 6 изученных локусах, при этом частота мутаций оказалась равна (в расчете на 1 локус на 1 гамету) 1,5% у облученных лиц и 2% в контрольной группе. Т. обр., облучение во время ядерных взрывов не привело к заметной дестабилизации генома у облученных лиц. Япония, Dep. of Genetics, Radiation Effects Res. Found. 5-2 Hijiyama Park, Minami-ku, Hiroshima 732. Библ. 38
ГРНТИ : 76.33.39
Предметные рубрики: ОБЛУЧЕНИЕ
АТОМНЫЕ БОМБЫ
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ПОСЛЕДСТВИЯ
МУТАЦИИ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
СТАБИЛЬНОСТЬ
МИКРОСАТЕЛЛИТНЫЕ ЛОКУСЫ
ЧЕЛОВЕК
БИБЛ. 38
Дата ввода:
9.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI19) 99.02-04И4.33

Автор(ы) : Bentzen P., Wright J.M., Bryden L.T., Sargent M., Zwanenburg K.C.T.
Заглавие : Tandem repeat polymorphism and heteroplasmy in the mitochondrial control region of redfishes (Sebastes: Scorpaenidae)
Источник статьи : J. Hered. - 1998. - Vol. 89, N 1. - С. 1-7
Аннотация: Проанализировали 3 вида морских окуней рода Sebastes - S. fasciatus (36 особей), S. mentella (52) и S. marinus (13): рыб отлавливали в р-не Ньюфаундленда (Канада). Отмечен очень высокий уровень сходства в полиморфизме контрольной области мтДНК, включая число повторов из 275 п. н. У 3 видов число копий этого повтора изменялось от 9 до 17. Секвенирование выявило низкий уровень вариабельности и значительное сходство генов тРНК Phe и 12SpРНК. Вся выборка характеризовалась существенной гетероплазмией (наличием более 1 варианта мтДНК у 1 особи) - 42% всех рыб: по этому параметру также отмечено сходство исследованных видов. Пока неясно, что лежит в основе подобного сходства видов - наличие межвидового обмена митохондриальными генами или существование единой системы баланса мутаций в них. США, Mar. Mol. Biotechnol. Lab., Univ. Washington, NE, Seattle, WA 98105-6715. Библ. 37
ГРНТИ : 34.33.33
Предметные рубрики: ДНК МИТОХОНДРИАЛЬНАЯ
КОНТРОЛЬНЫЕ РАЙОНЫ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ПОЛИМОРФИЗМ
ГЕТЕРОПЛАЗМИЯ
МОРСКИЕ ОКУНИ
Дата ввода:
10.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.224

Автор(ы) : Frothingham, Richard, Meeker-O'Connell Winifred A.
Заглавие : Genetic diversity in the Mycobacterium tuberculosis complex based on variable numbers of tandem DNA repeats
Источник статьи : Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 5. - С. 1189-1196
Аннотация: Изучены 11 локусов тандемных повторов (ТП) в геноме Mycobacterium tuberculosis: 5 локусов главных полиморфных ТП (ГПТП) с повторами 15 п. н., смежные копии к-рых существенно отличаются друг от друга, и 6 локусов точных ТП (ТТП), смежные копии к-рых идентичны. Определено число ТП в эти 11 локусах у 48 штаммов: 25 штаммов дикого типа M. tuberculosis, M. bovis, M. africanum и M. microti и 23 субклонов аттенюированной вакцины M. bovis BCG. Один из 5 главных ГПТП и все 6 локусов ТТП имеют полиморфизмы длины из-за вставок или делеций ТП. Большинство локусов ТТП расположено в межгенных областях, где число копий ТП может влиять на экспрессию 3-генов. Каждый локус ТТП имеет множественные аллели. Идентифицированы 22 разных аллельных профиля у 23 субштаммов M. bovis BCG. Аллельные профили у изолятов стандартных штаммов из разных лабораторий воспроизводимы и стабильны. США, Veterans Affaires Med. Ctr., Durham, NC 27705. Библ. 29
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНОТИП
ХАРАКТЕРИСТИКА
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
СТРУКТУРА
ПОЛИМОРФИЗМ ДЛИНЫ
MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (BACT.)
Дата ввода:
11.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.07-04Б2.190

Автор(ы) : Bierne, Helene, Seigneur, Marie, Ehrlich S.Dusko, Michel, Benedicte
Заглавие : uvrD mutations enhance tandem repeat deletion in the Escherichia coli chromosome via SOS induction of the RecF recombination pathway
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 26, N 3. - С. 557-567
Аннотация: При изучении механизмов делеций (Д) тандемных повторов исследована роль гена uvrD. Показано, что uvrD - обусловленная стимуляция (С) Д не наблюдается в мутантах lexAind3, равно как и при инактивации любого из recA, recF, recQ и ruvA генов. Сделано заключение, что 1) эта С зависит от SOS-индукции, 2) рекомбинация (Р) между тандемными повторами в мутантах uvrD происходит через RecF путь. В клетках uvrD{+} конститутивной экспрессии SOS генов недостаточно для стимуляции формирования Д. По-видимому, RecF путь P, активируемый SOS-индукцией, подавляется белком UvrD, и эта Uvr геликаза контролирует баланс между различными вариантами Д в тандемных повторах. Франция, Lab. de Genetique Microbienne, Domaine de Vilvert, Inst. National de la Recherche Agronomique, 78352 Jouy en Josas Cedex. Библ. 50
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ДЕЛЕЦИИ
БАЛАНС
РЕГУЛЯЦИЯ
REC F ПУТЬ
ИНДУКЦИЯ
ГЕНЫ SOS
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
МУТАЦИИ UVRD
Дата ввода:
12.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 76 (BI30) 99.07-04Н2.145

Автор(ы) : Beckmann Michael J., Perez-Reyes, Nuria, Bernacki Edward G.
Заглавие : Low grade mucoepidermoid carcinoma of salivary gland: Fine needle aspiration biopsy and differential diagnostic considerations : Abstr. 45th Annu. Sci. Meet. Amer. Soc. Cytopathol., Boston, Mass., Nov. 4-8, 1997
Источник статьи : Acta cytol. - 1997. - Vol. 41, N 5. - С. 1602
ГРНТИ : 76.29.49
Предметные рубрики: ДНК КОМПЛЕМЕНТАРНАЯ
STR47
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ПОЛЕВКИ
MICROTUS ROSSIAEMERIDIONALIS
Дата ввода:
13.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 76 (BI30) 99.07-04Н2.212

Автор(ы) : Chhieng David C., Saigo Patricia E., Tan Lee K.
Заглавие : Fine needle aspiration (FNA) cytology of invasive lobular carcinoma (ILC): Classic type and variants with histologic correlation : Abstr. 45th Annu. Sci. Meet. Amer. Soc. Cytopathol., Boston, Mass., Nov. 4-8, 1997
Источник статьи : Acta cytol. - 1997. - Vol. 41, N 5. - С. 1590
ГРНТИ : 76.29.49
Предметные рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ДНК
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
КОТТОИДНЫЕ РЫБЫ
Дата ввода:
14.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 76 (BI40) 99.07-04М7.169

Автор(ы) : Beckmann Michael J., Perez-Reyes, Nuria, Bernacki Edward G.
Заглавие : Low grade mucoepidermoid carcinoma of salivary gland: Fine needle aspiration biopsy and differential diagnostic considerations : Abstr. 45th Annu. Sci. Meet. Amer. Soc. Cytopathol., Boston, Mass., Nov. 4-8, 1997
Источник статьи : Acta cytol. - 1997. - Vol. 41, N 5. - С. 1602
ГРНТИ : 76.03.49
Предметные рубрики: ДНК КОМПЛЕМЕНТАРНАЯ
STR47
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ПОЛЕВКИ
MICROTUS ROSSIAEMERIDIONALIS
Дата ввода:
15.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.09-04Б1.71

Автор(ы) : Yamaguchi, Yaihei, Yamashita, Yumi, Kasamo, Kohtaro, Inoue, Masakazu, Sakaoka, Hiroshi, Fujinaga, Kei
Заглавие : Genomic heterogeneity maps to tandem repeat sequences in the herpes simplex virus type 2 U[L] region
Источник статьи : Virus Res. - 1998. - Vol. 55, N 2. - С. 221-231
Аннотация: BamHI-фрагменты Y и W в области U[L] вируса простого герпеса типа 2 (ВПГ-2) гетерогенны по размеру среди клонов из одного штамма и из эпидемиологически не родственных изолятов. Построены подробные рестрикц. карты этих фрагментов. Гетерогенные субфрагменты ДНК клонированы и секвенированы. Субфрагмент BamHI-Y содержит тандемный повтор (ТП), состоящий из разного числа единиц длиной 15 п. н. (5'-АГГГГЦГГЦТГГГЦ-3'). Субфрагмент BamHI-W содержит др. ТП единицы длиной 9 п. н. (5'-ЦЦТЦЦЦГЦЦ-3'). В области U[L] штамма ВПГ-2 эти ТП консервативны и число единиц каждого из ТП очень вариабельно во время репликации генома ВПГ-2. Япония, Dep. Oral Bacteriol., Hokkaido Univ. Dental Sch., Sapporo 060. Библ. 26
ГРНТИ : 34.25.17
Предметные рубрики: ВИРУС ГЕРПЕСА ПРОСТОГО
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ГЕНОМНАЯ ГЕТЕРОГЕННОСТЬ
КАРТИРОВАНИЕ
Дата ввода:
16.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.12-04Б2.227

Автор(ы) : Feschenko Vladimir V., Lovett Susan T.
Заглавие : Slipped misalignment mechanisms of deletion formation:Analysis of deletion endpoints
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1998. - Vol. 276, N 3. - С. 559-569
Аннотация: Для изучения механизмов образования делеций между тандемными повторами (ТП) у Escherichia coli использованы плазмиды с тандемной дупликацией 101 п. н. в гене tetA. Делеция одного из ТП восстанавливает целый ген tetA и придает клеткам устойчивость к тетрациклину. В кач-ве генетич. маркера в один из ТП введено изменение 4 п. н. После селекции на образование делеции индивидуальные плазмиды секвенировали для установления положения делеции в ТП. Показано, что большинство делеций вызывает слияние двух ТП в одном интервале длиной 20 п. н. Это согласуется с простым механизмом проскальзывания - спаривания при репликации для образования делеций. Обнаружены также димерные репликоны, у к-рых, кроме делеции, произошло событие сестринского хромосомного обмена. Они содержат 2 локуса tetA: локус с делецией ТП и таким же распределением концевых точек делеции, как и в мономерных продуктах, и локус с неизмененными ТП. Иногда встречаются квазиреципрокные димеры, несущие локус с делецией ТП и триплицированный локус tetA. Они не являются истинно реципрокными, т. к. секвенирование показало, что делеция и трипликация произошли в разных интервалах. Анализ димерных продуктов согласуется с моделью обменов сестринских нитей, в к-рой выравнивание - проскальзывание вновь синтезированных нитей вызывает образование делеции и сестринский хромосомный обмен. США, Dep. Biol., Brandeis Univ., Waltham, MA 02254-9110. Библ. 50
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ДНК
РЕПЛИКАЦИЯ
ГЕНОМ
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ДЕЛЕЦИИ
ОБМЕН СЕСТРИНСКИХ ХРОМОСОМ
ПЕРЕСТРОЙКИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:
17.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.04-04Б2.211

Автор(ы) : Wilton Jody L., Scarman Anthony L., Walker Mark J., Djordjevic Steven P.
Заглавие : Reiterated repeat region variability in the ciliary adhesion gene of Mycoplasma hyopneumoniae
Источник статьи : Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 7. - С. 1931-1943
Аннотация: В экспрессионных клоннотеках геномной ДНК непатогенного штамма J Mycoplasma hyopneumoniae идентифицирован клон, экспрессирующий ген белка 28 кД, к-рый реагирует с моноспецифичным антителом к антигену 94 кД (I) штамма J, расположенному на поверхности клеток. Секвенирование показало, что ген I гомологичен на 90% генам 2 др. адгезинов P97 и Mhp1 из патогенного шт. 232 и шт. P5722 соотв. В гене I обнаружены 2 области повторов, к-рые кодируют 9 тандемных повторов (ТП) RR1 A(T)KPE(V)A(T) и 5 ТП RR2 GA(E,S)PN(S)QGKKAE. Гены, кодирующие адгезины P97 и Mhp1 и I, содержат соотв. 15, 12 и 9 ТП в RR1 и 4, 5 и 5 ТП в RR2. Саузерн-гибридизация EcoRI-фрагментов геномной ДНК с зондом фрагмента длиной 820 п. н., содержащего RR1 и RR2, обнаружило сильно гибридизирующийся фрагмент длиной 2,15-2,30 т. п. н. у 7 штаммов M. hyopneumoniae различного географического происхождения. Этот зонд не гибридизируется с ДНК M. hyorhinis и M. flocculare Ms42. ПЦР-амплификация с праймерами, фланкирующими область ТП RR1 и RR2, и секвенирование ее продуктов для 7 штаммов M. hyopneumoniae обнаружило вариацию числа ТП RR1. У шт. YZ, Beaufort, Sue, OMZ407 и C1735/2 найдены соотв. 11, 15, 12, 15 и 8 ТП в RR1 и 4, 3, 4, 3 и 4 ТП в RR2. I имеет 2 предполагаемых сайта связывания интегрина (LET и RXXXD). Австралия, Microbiol. and Immunol. Section, E. Macarthur Agr. Inst., Camden, NSW 2570. Библ. 49
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: АДГЕЗИНЫ
РЕСНИЧНЫЙ ЭПИТЕЛИЙ
ГЕНЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
МЕЖШТАММОВАЯ
MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE (BACT.)
Дата ввода:
18.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 00.04-04Б4.159

Автор(ы) : Wilton Jody L., Scarman Anthony L., Walker Mark J., Djordjevic Steven P.
Заглавие : Reiterated repeat region variability in the ciliary adhesion gene of Mycoplasma hyopneumoniae
Источник статьи : Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 7. - С. 1931-1943
Аннотация: В экспрессионных клоннотеках геномной ДНК непатогенного штамма J Mycoplasma hyopneumoniae идентифицирован клон, экспрессирующий ген белка 28 кД, к-рый реагирует с моноспецифичным антителом к антигену 94 кД (I) штамма J, расположенному на поверхности клеток. Секвенирование показало, что ген I гомологичен на 90% генам 2 др. адгезинов P97 и Mhp1 из патогенного шт. 232 и шт. P5722 соотв. В гене I обнаружены 2 области повторов, к-рые кодируют 9 тандемных повторов (ТП) RR1 A(T)KPE(V)A(T) и 5 ТП RR2 GA(E,S)PN(S)QGKKAE. Гены, кодирующие адгезины P97 и Mhp1 и I, содержат соотв. 15, 12 и 9 ТП в RR1 и 4, 5 и 5 ТП в RR2. Саузерн-гибридизация EcoRI-фрагментов геномной ДНК с зондом фрагмента длиной 820 п. н., содержащего RR1 и RR2, обнаружило сильно гибридизирующийся фрагмент длиной 2,15-2,30 т. п. н. у 7 штаммов M. hyopneumoniae различного географического происхождения. Этот зонд не гибридизируется с ДНК M. hyorhinis и M. flocculare Ms42. ПЦР-амплификация с праймерами, фланкирующими область ТП RR1 и RR2, и секвенирование ее продуктов для 7 штаммов M. hyopneumoniae обнаружило вариацию числа ТП RR1. У шт. YZ, Beaufort, Sue, OMZ407 и C1735/2 найдены соотв. 11, 15, 12, 15 и 8 ТП в RR1 и 4, 3, 4, 3 и 4 ТП в RR2. I имеет 2 предполагаемых сайта связывания интегрина (LET и RXXXD). Австралия, Microbiol. and Immunol. Section, E. Macarthur Agr. Inst., Camden, NSW 2570. Библ. 49
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: АДГЕЗИНЫ
РЕСНИЧНЫЙ ЭПИТЕЛИЙ
ГЕНЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
МЕЖШТАММОВАЯ
MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE (BACT.)
Дата ввода:
19.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.06-04Б1.297

Автор(ы) : Yoshida, Masami, Tamura, Takahiro, Hiruma, Masataro
Заглавие : Analysis of strain variation of R1 repeated structure in varicella-zoter virus DNA by polymerase chain reaction
Источник статьи : J. Med. Virol. - 1999. - Vol. 58, N 1. - С. 76-78
Аннотация: Тандемный прямой повтор R1 в геноме вируса ветряной оспы-герпеса зостер (ВВОГЗ) состоит из элементов длиной 18 и 15 п. н. (Э-18 и Э-15), число и типы сочетаний к-рых различны у разных штаммов. Вариация структуры R1 изучена методом ПЦР с 2 наборами праймеров, чтобы отличить штаммы дикого типа от вакцинного штамма Oka. Показано, что 31 штамм дикого типа можно отнести к 9 группам: повторы R1 образованы сочетанием 5-7 Э-18 и 8-12 Э-15. В Японии преобладающим является штамм ВВОГЗ с 6 Э-18 и 10 Э-15. Такую же структуру имеет R1 у штамма Oka, так что анализ структуры R1 не позволяет отличить штаммы ВВОГЗ дикого типа от вакцинного штамма. Япония, Dep. Dermatol., Sch. Med., Kinki Univ., Osaka 589-8511. Библ. 11
ГРНТИ : 34.25.29
Предметные рубрики: ВИРУС ВЕТРЯНОЙ ОСПЫ-ГЕРПЕСА ЗОСТЕР
ДНК ГЕНОМНАЯ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ШТАММОВЫЕ ВАРИАЦИИ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
Дата ввода:
20.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI45) 00.07-04И5.60

Автор(ы) : Рудых И.А., Гречко В.В., Крамеров Д.А., Даревский И.С.
Заглавие : Распространение HindIII-повтора в геномах кавказских ящериц рода Lacerta отражает их филогенетическое родство
Источник статьи : Докл. РАН. - 1999. - Т. 367, N 4. - С. 563-566
Аннотация: Сообщается о тандемно организованном повторе с размером HindIII-выщепляемого звена в 146 п. н. (HindIII-повтор), содержание которого в геномах различных видов кавказских ящериц рода Lacerta сильно варьирует и в общих чертах отражает филогенетическое родство внутри этой группы видов. Число этих повторов в геномах группы партеногенетических видов рода Lacerta, чье гибридогенное происхождение сейчас не вызывает сомнения, на порядок больше средней величины, характерной для двуполых видов, и составляет 10{5} копий на гаплоидный геном. Эволюционно более отдаленные виды рода Lacerta, по-видимому, имеют лишь единичные копии этого повтора
ГРНТИ : 34.33.27
Предметные рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
LACERTA
ГЕНОМ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
Дата ввода:
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-82 
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)