СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=СКВОЗНОЕ СЧИТЫВАНИЕ<.>)

Общее количество найденных документов : 8
Показаны документы с 1 по 8

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.11-04Б1.126

Автор(ы) : Filichkin S.A., Lister R.M., McGrath P.F., Young M.J.
Заглавие : In vivo expression and mutational analysis of the barley yellow dwart virus roadthrough gene
Источник статьи : Virology. - 1994. - Vol. 205, N 1. - С. 290-299
Аннотация: Ген белка оболочки (I) вируса желтой карликовости ячменя (ВЖКЯ) отделен от смежной фланговой 3'-открытой рамки считывания (3'-ОРС) одним терминирующим кодоном. Из-за сквозного считывания этого кодона 3'-ОРС транслируется с образованием нескольких составных белков (II) - продуктов слияния с I. Полноразмерный II с мол. массой 72000 (Р72) обнаружен в лизатах зараженных ВЖКЯ клеток. Однако очищенные вирионы ВЖКЯ содержат только II с мол. массой 50000 (Р50), у к-рого отсутствует С-концевой домен Р72. Фракция клеточных мембран содержит белок с мол. массой 33000 (Р33), соответствующий С-концевой части 3'-ОРС. Сайт-направленный и делеционный мутагенез показал, что 3'-ОРС не нужен для репликации ВЖКЯ и накопления вирионов в протопластах. Мутация, вызывающая образование полного II, устраняет жизнеспособность ВЖКЯ. Картированы области, требующиеся для синтеза Р50 и Р72. Предложена модель, объясняющая взаимоотношения между 3 формами II. США, Dep. of Biol. Sci., Purdue Univ., West Lafayette, IN 47907. Библ. 34
ГРНТИ : 34.25.19
Предметные рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ЛЮТЕОВИРУСЫ
ВИРУС ЖЕЛТОЙ КАРЛИКОВОСТИ ЯЧМЕНЯ
ГЕНЫ
СКВОЗНОЕ СЧИТЫВАНИЕ
ЭКСПРЕССИЯ
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.04-04Б1.138

Автор(ы) : Maxfield Lori F., Spector David J.
Заглавие : Readthrough activation of early adenovirus E1b gene transcription
Источник статьи : J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 11. - С. 8321-8329
Аннотация: В клетках, продуктивно зараженных аденовирусом типа 5, транскрипция не терминируется между генами E1a и E1b. Ранее было показано, что встраивание последовательности ГГТ терминатора транскрипции (ПТТ) мышиного гена глобина 'бета'{maj} в кодирующую область E1a значительно понижает раннюю, но не позднюю экспрессию E1b. Найдено, что замены нуклеотидов в глобиновой ДНК, специфически ослабляющие терминацию транскрипции, восстанавливают раннюю промоторную активность E1b в цис-положении, т. е. макс. ранняя экспрессия E1b требует сквозной транскрипции из предыдущего гена E1a. Сконструированы двойные мутанты, имеющие ПТТ в первом экзоне E1a и делеция в области контроля транскрипции E1b. Ранняя экспрессия E1b у двойных мутантов более дефектна, чем у штаммов, имеющих эти мутации порознь. Это показало, что делетированная область (положения от -362 до -35) не является мишенью для активации сквозным считыванием. Найдено также, что: 1) ранний дефект E1b, вызванный вставкой ПТТ, не комплементируется в транс-положении факторами, присутствующими на поздней стадии заражения; 2) восстановление транскрипции E1b на поздней стадии происходит одновременно с репликацией вирусной ДНК. Высказано предположение, что активация сквозным считыванием превращает вирионную ДНК в транскрипционно компетентную матрицу до репликации ДНК и запуска поздней транскрипции. США, Dep. Microbiol. and Immunol., Coll. Med., Pennsylvania State Univ., Hershey, PN 17 033. Библ. 57
ГРНТИ : 34.25.19
Предметные рубрики: АДЕНОВИРУСЫ
ГЕН E1B
РАННЯЯ ТРАНСКРИПЦИЯ
АКТИВАЦИЯ
МЕХАНИЗМЫ
СКВОЗНОЕ СЧИТЫВАНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.04-04Б1.147

Автор(ы) : Hardy Richard W., Wertz Gail W.
Заглавие : The product of the respiratory syncytial virus M2 gene ORF1 enhances readthrough of intergenic junctions during viral transcription
Источник статьи : J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 1. - С. 520-526
Аннотация: мРНК респираторно-синцитиального вируса (РСВ), кодирующая белок М2 (I), содержит 2 открытые рамки считывания (ОРС). ОРС1 кодирует I, а ОРС2 может кодировать белок длиной 90 остатков (II) с мол. м. 10 кД. С использованием экспрессионной системы вируса осповакцины и РНК-полимеразы фага Т7 изучена синтетическая активность моно- и дицистронных субгеномных репликонов РСВ в присутствии и в отсутствие I и II. В отсутствие I и II синтезируются (-) и (+)-нити геномной РНК и полиаденилированные (+)-мРНК (III). Экспрессия целой транскрипционной единицы М2 или одной ОРС1 усиливает синтез III, увеличивая кол-во III, образующихся из-за неспособности РНК-полимеразы (IV) терминировать транскрипцию на сигналах концов генов. II ингибирует репликацию РНК РСВ и транскрипцию III. Полученные данные показали, что I является транскрипционным антитерминатором, повышающим способность IV к сквозному считыванию межгенных стыков. США, Dep. Microbiol., Univ. Alabama Sch. Med., Birmingham, AL 35294. Библ. 35
ГРНТИ : 34.25.19
Предметные рубрики: РЕСПИРАТОРНО-СИНЦИТИАЛЬНЫЕ ВИРУСЫ
ТРАНСКРИПЦИЯ
МЕЖГЕННЫЕ СТЫКИ
СКВОЗНОЕ СЧИТЫВАНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.391

Автор(ы) : Pagel Frances T., Zhao Song Q., Hijazi Katthryn A., Murgola Emanuel J.
Заглавие : Phenotypic heterogeneity of mutational changes at a conserved nucleotide in 16 S ribosomal RNA
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 267, N 5. - С. 1113-1123
Аннотация: Сконструированы делеция и все возможные замены остатка Ц[1054] в высококонсервативном выступе петли 34 в рРНК 16S (I) Escherichia coli. Обнаружены различные фенотипы 3 разных замен нуклеотидов в этом положении, включающие супрессию нонсенс-кодонов в разных средах и при разных температурах, зависящую от температуры летальность, уровень экспрессии мутантных I, профиль рибосом при центрифугировании в градиенте концентрации сахарозы, ассоциацию мутантных субъединиц 30 S с субъединицами 50 S и влияние на действие супрессорных тРНК. Отмечено, что описанная ранее мутация этого сайта I является не делецией, а заменой Ц[1054]'-'А. Сконструированная делеция Ц[1054] не супрессирует мутации trpA. Полученные данные показали, что сквозное считывание терминирующих кодонов в результате мутаций в положении 1054 является результатом дефекта по терминации пептидных цепей, а не уменьшения общей точности трансляции. США, Dep. of Molecular Genetics, Univ. of Texas Cancer Center, Houston, TX 77030. Библ. 54
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
ПЕТЛЯ 34
Ц[1054]
ЗАМЕНЫ
ФЕНОТИПИЧЕСКАЯ ГЕТЕРОГЕННОСТЬ
ТЕРМИНАЦИЯ
ПОЛИПЕПТИДНЫЕ ЦЕПИ
ДЕФЕКТ
ТЕРМИНИРУЮЩИЕ КОДОНЫ
СКВОЗНОЕ СЧИТЫВАНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.407

Автор(ы) : Wenthzel Anne-Marie K., Stancek, Martin, Isaksson Leif A.
Заглавие : Growth phase dependent stop codon readthrough and shift of translation reading frame in Escherichia coli
Источник статьи : FEBS Lett. - 1998. - Vol. 421, N 3. - С. 237-242
Аннотация: В экспоненциальной и стационарной фазах (ЭФ и СФ) роста клеток Escherichia coli изучены сквозное считывание стоп-кодона (СССК) и сдвиг трансляц. рамки считывания (СТРС). Для этого использованы штаммы с плазмидными конструкциями, несущими репортерский ген с внутренним стоп-кодоном или участок из нескольких остатков У. Терминация или СТРС дают стабильные белки, количество к-рых можно оценить методом электрофореза в полиакриламидном геле. СССК УГА неродственной тРНК в середине ЭФ в несколько раз выше, чем в конце ЭФ. В ранней ЭФ частота СТРС типа -1 на скользкой последовательности У9 равна 7%. Она повышается до 40% во время перехода в СФ и уменьшается в самой СФ. Частота СТРС типа +1 равна 13% в ранней ЭФ, увеличивается до 38% в начале СФ, а затем уменьшается. Т. обр. СССК и СТРС зависят от фазы роста, но по-разному. Швеция, Dept. of Microbiol., Stockholm Univ., S-10691 Stockholm. Библ. 39
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
СТОП-КОДОН
СКВОЗНОЕ СЧИТЫВАНИЕ
ВЛИЯНИЕ
ФАЗА РОСТА
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.229

Автор(ы) : Matsugi, Jitsuhiro, Murao, Katsutoshi, Ishikura, Hisayuki
Заглавие : Effect of B. subtilis tRNA{Trp} on readthrough rate at an opal UGA codon
Источник статьи : J. Biochem. - 1998. - Vol. 123, N 5. - С. 853-858
Аннотация: Изучена трансляция in vitro синтетич. мРНК, содержащей тест-кодоны УГА, УАГ, УАА или УГГ в открытой рамке считывания. Показано, что добавление триптофанил-тРНК{трп} (I) Bacillus subtilis значительно повышает скорость сквозного считывания только в случае опалового нонсенс-кодона УГА. Эти данные позволяют предположить, что I узнает не только канонич. кодон УГГ триптофана, но и стоп-кодон УГА. Япония, Lab. Chem., Jichi Med. Sch., Tochigi 329-0498. Библ. 28
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СТОП-КОДОН УГА
СКВОЗНОЕ СЧИТЫВАНИЕ
ВЛИЯНИЕ
ТРНК{ТРП}
СИНТЕТИЧЕСКАЯ МРНК
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.04-04Б1.59

Автор(ы) : Alam Steve L., Wills Norma M., Ingram Jennifer A., Atkins John F., Gesteland Raymond F.
Заглавие : Structural studies of the RNA pseudoknot required for readthrough of the gag-termination codon of murine leukemia virus
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 288, N 5. - С. 837-852
Аннотация: У вируса лейкоза мышей (ВЛМ) гены gag и pol находятся в одной рамке считывания, но разделены стоп-кодоном YAG, сквозное считывание к-рого 5-10% рибосом приводит к синтезу полипротеина GaG-Pol. Для такого переопределения стоп-кодона YAG требуется специфический псевдоузел (ПУ), расположенный на расстоянии 8 н. с 3'-стороны от YAG. Изучение структуры и мутагенез показали, что петля I ПУ длиной 1 н., стебель III длиной 7 н. и нуклеотиды с 3'-стороны от стебля III важны для ф-ции. Стебель II более устойчив к зондам, специфичным для онРНК, чем стебель II. Последовательности перед кодоном YAG могут образовывать 2 конкурирующие структуры: шпильку или ПУ. США, Dep. Human Genet., Univ. Utah, Salt Lake City, UT 84112-5330. Библ. 48
ГРНТИ : 34.25.17
Предметные рубрики: ВИРУС ЛЕЙКОЗА МЫШЕЙ
ГЕНЫ
GAG
СТОП-КОДОН YAG
СКВОЗНОЕ СЧИТЫВАНИЕ
РНК
ПСЕВДОУЗЕЛ
ФУНКЦИИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.238

Автор(ы) : Paul, Ligi, Ferguson Donald J., Krzycki Joseph A.
Заглавие : The trimethylamine methyltransferase gene and multiple dimethylamine methyltransferase genes of Methanosarcina barkeri contain in-frame and read-through amber codons
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 9. - С. 2520-2529
Аннотация: У Methanosarcina barkeri изучены гены mtt триметиламинметилтрансферазы (I) и mtb диметиламинметилтрансферазы (II), продукты к-рых метилируют разные корриноидные белки (III), впоследствии метилирующие КоМ. Единственная копия гена I (mttB) котранскрибируется с копией гена II (mtbB1). В геноме найдены также 2 почти идентичные копии mtbB1, названные mtbB2 и mtbB3. С зондами для генов mttB и mtbB1, а также mtbC и mttC, кодирующих III, родственные с I и II, обнаружен транскрипт длиной 6,8 т. н., к-рый гибридизируется также с зондами гена mttP предполагаемой метиламинпермеазы. Эти данные показали, что гены mtbC-mttB-mttC-mttP-mtbB1 образуют одну транскрипционную единицу. Ее стартовый сайт транскрипции картирован на расстоянии 303 или 304 п. н. с 5'-стороны от старта трансляции mtbC. I, II монометиламинметилтрансферазы (IV) содержат по одному амбер-кодону в рамке считывания. Каждая из 3 копий гена II содержит в одном и том же положении амберкодон, за к-рым расположены кодоны УАА или УГА. С-концевые остатки II, выделенных из выращенных на триметиламине клеток, соответствуют предсказанным продуктам генов mtbB1, mtbB2 и mtbB3, терминируемых на кодонах УАА или УГА, но не на амбер-кодоне в рамке считывания. Ген mttB M. thermophila содержит кодон УАГ в том же положении, что и ген mttB M. barkeri. Кодон УАГ присутствует в транскриптах mttB. Т. обр., гены, кодирующие 3 типа метилтрансфераз, инициирующих метаногенез из метиламинов, содержат в рамке считывания супрессируемые амбер-кодоны. США, Dep. Microbiol., Ohio State Univ. Columbus, OH. Библ. 48
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕН ТРИМЕТИЛАМИНМЕТИЛТРАНСФЕРАЗЫ MTT
ГЕН ДИМЕТИЛАМИНМЕТИЛТРАНСФЕРАЗЫ MTB
ГЕН MTTB
КОТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕН MTBB1
ТРАНСКРИПЦИОННАЯ ЕДИНИЦА
MTBC-MTTB-MTTC-MTTP-MTB1
АМБЕР-КОДОНЫ
РАМКА СЧИТЫВАНИЯ
СКВОЗНОЕ СЧИТЫВАНИЕ
METHANOSARCINA BARKERI (BACT.)
Дата ввода:

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска