Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткий полный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ<.>)
Общее количество найденных документов : 13
Показаны документы с 1 по 13
1.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 98.01-04Н1.64

Автор(ы) : Morris, Christine, Jeffs, Aaron, Smith, Tania, McDonald, Margaret, Board, Phillip, Kennedy, Martin, Fitzgerald, Peter
Заглавие : BCR gene recombines with genomically distinct sites on band 11Q13 in complex BCR-ABL translocations of chronic myeloid leukemia
Источник статьи : Oncogene. - 1996. - Vol. 12, N 3. - С. 677-685
Аннотация: Проведен анализ клонированного фрагмента геномной ДНК клеток хронического миелоидного лейкоза, соотв. продукту рекомбинации 11q13/3'BCR. Показано, что 3'-конец BCR рекомбинирует с 11q13 по специфическому сайту, локализованному между двумя противоположно ориентированными Alu-элементами. По данным сравнения сайтов интеграции BCR в 11q13 лейкозных клеток от разных больных, описанных в литературе, в 11q13 имеется протяженный домен, предрасположенный к рекомбинации, а не единственный сайт точной интеграции BCR. Сайты рекомбинации в этой области находятся вблизи Alu-повторов. Новая Зеландия, Cytogenet., Mol. Oncol. Univ, Dep. Pathol., Sch. Med., Christchurch. Библ. 48
ГРНТИ : 76.29.49
Предметные рубрики: ЛЕЙКОЗ
ХРОНИЧЕСКИЙ МИЕЛОИДНЫЙ
ГЕНЫ
BCR
ПОЛОСА 11Q13
РЕКОМБИНАЦИЯ
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ЧЕЛОВЕК
Дата ввода:
2.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.346

Автор(ы) : Cormack Brendan P., Falkow, Stanley
Заглавие : Efficient homologous and illegitimate recombination in the opportunistic yeast pathogen Candida glabrata
Источник статьи : Genetics. - USA, 1999. - Vol. 151, N 3. - С. 979-987
Аннотация: Сконструированы ауксотрофные мутанты клинического изолята Candida glabrata с дефектами хромосомных генов ura3 или his3. Линеаризированные плазмиды с геном URA3 Saccharomyces cerevisiae эффективно трансформируют мутант ura3 к прототрофности. Если эти плазмиды содержат короткие концевые области гомологии с хромосомой C. glabrata, наблюдается гомологическая рекомбинация. В отсутствие гомологии с хромосомой плазмиды интегрируются по механизму незаконной рекомбинации в случайные сайты генома. Секвенирование показало, что у большинства незаконных рекомбинантов отсутствует микрогомология в сайтах интеграции. Около 0,25% вставок приводит к ауксотрофности по аминокислотам. Секвенирование позволило предположить, что незаконная рекомбинация является неслучайной на уровне одного гена и что интегрирующаяся плазмида предпочитает встраиваться в некодирующие области генома. Сравнение числа событий гомологической и незаконной рекомбинации показало, что C. glabrata имеет эффективные системы как гомологической, так и незаконной рекомбинации. США, Dep. Microbiol. and Immunol., Stanford Univ. Sch. Med., Stanford, CA 94305-5402. Библ. 23
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
ВСТРАИВАЕМЫЕ ГЕНЫ
ГОМОЛОГИЯ
ФУНКЦИЯ
CANDIDA GLABRATA (FUNGI)
Дата ввода:
3.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 01.12-04В2.399

Автор(ы) : Cormack Brendan P., Falkow, Stanley
Заглавие : Efficient homologous and illegitimate recombination in the opportunistic yeast pathogen Candida glabrata
Источник статьи : Genetics. - USA, 1999. - Vol. 151, N 3. - С. 979-987
Аннотация: Сконструированы ауксотрофные мутанты клинического изолята Candida glabrata с дефектами хромосомных генов ura3 или his3. Линеаризированные плазмиды с геном URA3 Saccharomyces cerevisiae эффективно трансформируют мутант ura3 к прототрофности. Если эти плазмиды содержат короткие концевые области гомологии с хромосомой C. glabrata, наблюдается гомологическая рекомбинация. В отсутствие гомологии с хромосомой плазмиды интегрируются по механизму незаконной рекомбинации в случайные сайты генома. Секвенирование показало, что у большинства незаконных рекомбинантов отсутствует микрогомология в сайтах интеграции. Около 0,25% вставок приводит к ауксотрофности по аминокислотам. Секвенирование позволило предположить, что незаконная рекомбинация является неслучайной на уровне одного гена и что интегрирующаяся плазмида предпочитает встраиваться в некодирующие области генома. Сравнение числа событий гомологической и незаконной рекомбинации показало, что C. glabrata имеет эффективные системы как гомологической, так и незаконной рекомбинации. США, Dep. Microbiol. and Immunol., Stanford Univ. Sch. Med., Stanford, CA 94305-5402. Библ. 23
ГРНТИ : 34.29.15
Предметные рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
ВСТРАИВАЕМЫЕ ГЕНЫ
ГОМОЛОГИЯ
ФУНКЦИЯ
CANDIDA GLABRATA (FUNGI)
Дата ввода:
4.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.01-04Б2.229

Автор(ы) : Pavlovic, Guillaume, Burrus, Vincent, Gintz, Brigitte, Decaris, Bernar, Guedon, Gerard
Заглавие : Evolution of genomic islands by deletion and tandem accretion by site-specific recombination: ICESt1-related elements from Streptococcus thermophilus
Источник статьи : Microbiology. - 2004. - Vol. 150, N 4. - С. 759-774
Аннотация: Ранее показали наличие ICESt1 элемента на 3'-конце локуса fda Streptococcus thermophilus CNRZ368 и геномных островов 4-х типов, связанных с ICESt1, и интегрированных в той же позиции в семи других штаммах S. thermophilus. Установили, что ICESt1 содержит функциональный внутренний сайт рекомбинации attL', идентичный сайту attL CIME19258. Рекомбинация между attl и attR ICESt1 приводит к эксцизии кольцевой молекулы (ICE), cis-элемент (CIME), фланкированный сайтами attL и attB', остается интегрированным на 3'-конце fda. Полученные результаты привели к заключению, что эти геномные острова эволюционируют путем делеций и создания тандемов ICE и CIME в результате сайт-специфичной рекомбинации. Обсуждается модель эволюции такого рода и ее применение для других геномных островов. Франция, lab. de Genetique et Microbiol. (UMR INRA-UHP no. 1128, IFR no. 110), Univ. Henry Poincare, BP239, 54506. Vandoeuvre-les-Nancy. Библ. 65
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНОМНЫЕ ОСТРОВА
ЭВОЛЮЦИЯ
МОДЕЛЬ
ЛОКУСЫ FDA
3-КОНЦЫ
ICEST1
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
РЕКОМБИНАЦИЯ
ТАНДЕМЫ TCE
CIME
STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS (BACT.)
Дата ввода:
5.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 14.03-04Б1.141

Автор(ы) : Lin, Chao-Nan, Chang, Ruey-Yi, Su, Bi-Ling, Chueh, Ling-Ling
Заглавие : Full genome analysis of a novel type II feline coronavirus NTU156
Источник статьи : Virus Genes. - 2013. - Vol. 46, N 2. - С. 316-322
Аннотация: Вирус NTU156, по-видимому, возник в результате двух перекрестных событий между коронавирусом кошек I типа и коронавирусом собак. Обмен почти трети генома с другими членами альфа-коронавирусов приводит к появлению новой антигенности, что представляет угрозу для кошек, ранее инфицированных вирусом I типа
ГРНТИ : 34.25.29
Предметные рубрики: ВИРУСЫ ЖИВОТНЫХ
КОШАЧИЙ КОРОНАВИРУС II ТИПА (FCOV)
ИЗОЛЯТ NTU156
БОЛЬНАЯ КОШКА (ИНФЕКЦИОННЫЙ ПЕРИТОНИТ)
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
СОБЫТИЕ РЕКОМБИНАЦИИ
(FCOV I ТИПА) - (КОРОНАВИРУС СОБАК)
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
АНТИГЕНЫ
НОВЫЕ ДЕТЕРМИНАНТЫ
Дата ввода:
6.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 89.07-04Б1.111

Автор(ы) : King Andrew M.O.
Заглавие : Preferred sites of recombination in potiovirus RNA: An analysis of 40 intertypic cross-over Sequences
Источник статьи : Nucl. Acids Res. - 1988. - Vol. 16, N 24. - С. 11705-11723
Аннотация: Для изучения механизмов рекомбинации РНК пикорнавирусов определяли предпочтительные сайты рекомбинации в РНК полиомиелита. Проведено секвенирование участков рекомбинантных РНК, прилегающих к сайту рекомбинации, у 40 независимых межтиповых рекомбинантов ВП. На основании статистич. анализа полученных последовательностей автор приходит к выводу о существовании некоторых предпочтительных сайтов рекомбинации. В частности обнаружено, что последовательности по 3'-сторону от сайта перекреста как правило характеризуются большей степенью гомологии, чем последовательности двух "родительских" РНК в целом. Кроме того, почти в 2/3 всех случаев перекрест происходил после синтеза динуклеотида УУ. Обнаруженные закономерности, по мнению автора, свидетельствуют в пользу уже высказывавшегося предположения, что рекомбинация у ВП происходит за счет смены матрицы в ходе синтеза минус-цепи РНК. Высказывается также ряд предположений о механизмах инициации и элонгации в ходе репликации РНК ВП. Великобритания, AFRC Inst. for Animal Health, Pirbright Lab., Ash Road, Pirbright, Woking, Surrey GU24 ONF. Библ. 27.
ГРНТИ : 34.25.17
Предметные рубрики: ВИРУС ПОЛИОМИЕЛИТА
РНК ВИРУСНАЯ
РЕКОМБИНАЦИЯ
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
ПИКОРНАВИРУСЫ
РЕПЛИКАЦИЯ
Дата ввода:
7.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 89.08-04К1.332

Автор(ы) : Fujii, Hiroaki, Matsuno, Yoshihiro, Misonou, Jun, Kakinuma, Mitsuaki, Aizawa, Miki, Natori, Takashi
Заглавие : Recombinational sites observed in naturally occurring intra-RT1 recombinant strains
Источник статьи : Immunogenetics. - 1989. - Vol. 29, N 3. - С. 217-221
Аннотация: Получены инбредные и конгенные линии крыс, нек-рые из к-рых имеют встречающиеся в природе рекомбинантные гаплотипы ГКГС (RT1-комплекса). Исследован полиморфизм длины рестрикционных фрагментов генов класса II этих рекомбинантных линий и связь их с серологически определяемыми гаплотипами. Гибридизация с зондом, специф. к HLA-DP, с целью идентификации DP'бета'-подобного гена у крыс показала также наличие сайтов рекомбинации у этих рекомбинантных линий. У крыс NIG-III, WIN, KGH и LEJ сайты рекомбинации расположены справа от субрайона RT1. Н (между RT1.Н и RT1.В), а у крыс DA.11(BI) и BDIX - слева от субрайона RT1.Н (между RT1.Н и RT1.А). Библ. 11. Dept Pathol., Hokkaido Univ. Sch. Med., Sapporo 070, JP.
ГРНТИ : 34.43.31
Предметные рубрики: ИММУНОГЕНЕТИКА
РЕКОМБИНАНТНЫЕ ЛИНИИ КРЫС
ГАПЛОТИПЫ RT1-КОМПЛЕКС
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
Дата ввода:
8.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.01-04Б2.417

Автор(ы) : Fulks Karla A., Marrs Carl F., Stevens Scott P., Green Monica R.
Заглавие : Sequence analysis of the inversion region containing the Pilin genes of Moraxella bovis
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1990. - Vol. 172, N 1. - С. 310-316
Аннотация: Moraxella bovis EPPG3 образует 2 различ. типа фимбрий: Q и I (ранее 'альфа' и 'бета'). Переходы Q'-'I связаны с инверсией сегмента хромосмной ДНК длиной 2100 п.н. Секвенирована область клонированной ДНК M. bovis длиной 4100 п.н., содержащая всю область инверсии в ориентации I, вызывающей экспрессию пилина Q. Сравнение этой последовательности с последовательностью амплифицированного методом полимеразной цепной р-ции сегмента хромосомной ДНК в ориентации 2 (экспрессия пилина J) показало, что сайтспецифич. рекомбинация происходит на участке длиной 26 п.н., гомологичном левому инвертированному повтору hin-системы Salmonella typhimurium. Сегмент секвенированной последовательности M. bovis длиной 60 п.н. на 50% гомологичен рекомбинац. усилителю фага Р1. Идентифицированы 2 открытых рамки считывания, кодирующие пилины Q и I и гомологичные друг другу на 73%. Библ. 51.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: MORAXELLA BOVIS (BACT.)
ШТАММ EPPG 3
ПАТОГЕННЫЕ ШТАММЫ
ФИМБРИИ
ФИМБРИИ I
ФИМБРИИ Q
СИНТЕЗ
КОРРЕЛЯЦИЯ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ИНВЕРСИИ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
СРАВНЕНИЕ
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
ФАГ Р1
ГЕНЫ
ГЕН ПИЛИНА Q
ГЕН ПИЛИНА I
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
Дата ввода:
9.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 15.09-04Б1.96

Автор(ы) : Al-Hello H., Jorba J., Blomqvist S., Raud R., Kew O., Roivainen M.
Заглавие : Highly divergent type 2 and 3 vaccine-derived polioviruses isolated from sewage in Tallinn, Estonia
Источник статьи : J. Virol. - 2013. - Vol. 87, N 23. - С. 13076-13080
Аннотация: Высокодивергентные вакцинные полиовирусы 2 и 3 типов выделены в 2002 г. Сиквенс-анализ показал их происхождение из одной дозы тривалентной оральной вакцины, применявшейся в 1986-1998 гг. Финляндия, Nat. Inst. Hlth Welfare, Helsinki. Библ. 35
ГРНТИ : 34.25.37
Предметные рубрики: ПОЛИОВИРУСЫ
ВЫСОКОДИВЕРГЕНТНЫЕ ВАКЦИННЫЕ ШТАММЫ
ИЗОЛЯТ
СТОЧНЫЕ ВОДЫ
ГЕНОТИПИРОВАНИЕ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
ВНЕКАПСИДНАЯ ОБЛАСТЬ
ВАКЦИННЫЙ ШТАММ 1986-1998 ГГ.
Дата ввода:
10.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 16.03-04Б1.17

Автор(ы) : Джиоев Ю.П., Зелинская Н.Е., Парамонов А.И., Степаненко Л.А., Малов С.И., Колбасеева О.В., Шмидт Н.В., Злобин В.И.
Заглавие : БИОИНФОРМАЦИОННАЯ ДЕТЕКЦИЯ САЙТОВ РЕКОМБИНАЦИИ В ГЕНОМНЫХ СТРУКТУРАХ ШТАММОВ ГЕНОТИПА 2 ВИРУСА ГЕПАТИТА С
Источник статьи : Сиб. мед. ж. - Иркутск, 2015. - N 2. - С. 98-102
Аннотация: В кодируемой части полных геномов 26 штаммов генотипа 2 вируса гепатита С впервые посредством комплекса биоинформационных программ RDP выявлена группа из 10 штаммов-рекомбинантов, в которых зафиксированы 11 сайтов рекомбинации. Для выявленных рекомбинантов определены родительские штаммы, от которых они могли быть получены. Большая часть выявленных сайтов рекомбинации приходится на область структурных генов C, E1 и E2 и на область неструктурных генов NS5a и NS5b. В одном штамме выявлен уникальный сайт рекомбинации в высококонсервативном гене NS3. По результатам исследования определены "горячие точки" рекомбинации в штаммах генотипа 2 вируса гепатита С.
ГРНТИ : 34.25.05 + 34.25.21 + 34.25.29
Предметные рубрики: ГЕПАТИТ C
ВИРУС ГЕПАТИТА С (HCV)
ГЕНОТИП II
КЛИНИЧЕСКИЕ ИЗОЛЯТЫ
ГЕНОМЫ
БИОИНФОРМАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ШТАММЫ-РЕКОМБИНАНТЫ
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
"ГОРЯЧИЕ ТОЧКИ"
IN SIVICO
Дата ввода:
11.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 16.07-04Б1.140

Автор(ы) : Verma, Rakesh Kumar, Mishra, Ritesh, Petrov, Nikolay Manchev, Stoyanova, Mariya, Stoev, Antoniy, Bakardjieva, NonkaValentinova, Gaur R.K.
Заглавие : Molecular characterization and recombination analysis of an Indian isolate of Onion yellow dwarf virus
Источник статьи : Eur. J. Plant Pathol. - 2015. - Vol. 143, N 3. - С. 437-445
Аннотация: Филогенетический и рекомбинационный анализ показали дивергенцию индийских изолятов от австралийского штамма. Наиболее высокая вариабельность выявлена для геномных областей P1 и P3. В индийском изоляте обнаружено 6 точек рекомбинации в различных областях генома, которые отнесены главным образом к изолятам MS/SW1 (Австралия) и SG1 (Испания).
ГРНТИ : 34.25.29 + 34.25.21
Предметные рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС ЖЕЛТОЙ КАРЛИКОВОСТИ ЛУКА (OYDV)
ИНДИЙСКИЕ ИЗОЛЯТЫ
ГЕНЫ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
ПРОСТЫЕ ПОВТРЫ (SSR)
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
МЕХАНИЗМЫ ЭВОЛЮЦИИ
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ
Дата ввода:
12.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 16.10-04В5.36

Автор(ы) : Verma, Rakesh Kumar, Mishra, Ritesh, Petrov, Nikolay Manchev, Stoyanova, Mariya, Stoev, Antoniy, Bakardjieva, NonkaValentinova, Gaur R.K.
Заглавие : Molecular characterization and recombination analysis of an Indian isolate of Onion yellow dwarf virus
Источник статьи : Eur. J. Plant Pathol. - 2015. - Vol. 143, N 3. - С. 437-445
Аннотация: Филогенетический и рекомбинационный анализ показали дивергенцию индийских изолятов от австралийского штамма. Наиболее высокая вариабельность выявлена для геномных областей P1 и P3. В индийском изоляте обнаружено 6 точек рекомбинации в различных областях генома, которые отнесены главным образом к изолятам MS/SW1 (Австралия) и SG1 (Испания).
ГРНТИ : 68.37.31
Предметные рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС ЖЕЛТОЙ КАРЛИКОВОСТИ ЛУКА (OYDV)
ИНДИЙСКИЕ ИЗОЛЯТЫ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
ПРОСТЫЕ ПОВТРЫ (SSR)
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
Дата ввода:
13.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 16.12-04Б1.85

Автор(ы) : Зелинская Н.Е., Парамонов А.И.
Заглавие : Детекция потенциальных сайтов рекомбинации в геномах штаммов генотипа 2 вируса гепатита С методами биоинформатики
Источник статьи : Экология и здоровье населения. - Иркутск, 2015. - С. 60-70
Примечания : 31
Аннотация: В кодируемой части полных геномов 26 штаммов генотипа 2 вируса гепатита С впервые посредством комплекса программ RDP выявлена группа из 10 штаммов-рекомбинантов, в которых зафиксированы 11 потенциальных сайтов рекомбинации. Для этих рекомбинантов определены их родительские штаммы, от которых они могли быть получены. Большая часть зафиксированных сайтов рекомбинации приходится на область структурных генов - С, Е1 и Е2 и на область неструктрных генов - NS5a и NS5b. В одном штамме выявлен уникальный сайт рекомбинации в высоко консервативном гене NS3. По результатам исследования показаны "горячие точки" рекомбинации в штаммах генотип 2 ВГС. Россия, ГБОУ ВПО "Иркутский ГМУ" Минздрава РФ, Иркутск
ГРНТИ : 34.25.21 + 34.25.29
Предметные рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
ГЕНОТИП 2
ГЕНОМ
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
"ГОРЯЧИЕ ТОЧКИ" РЕКОМБИНАЦИИ
БИОИНФОРМАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ПРОГРАММНЫЕ МЕТОДЫ RDP
IN SILICO
Дата ввода:
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)