СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ПРОМОТОР PU<.>)

Общее количество найденных документов : 5
Показаны документы с 1 по 5

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.04-04Б2.142

Автор(ы) : Delgado, Asuncion, Salto, Rafael, Marques, Silvia, Ramos Juan L.
Заглавие : Single amino acids changes in the signal receptor domain of XylR resulted in mutants that stimulate transcription in the absence of effectors
Источник статьи : J. Biol. Chem. - 1995. - Vol. 270, N 10. - С. 5144-5150
Аннотация: Pseudomonas putida, несущая плазмиду TOL способна расти на толуоле за счет его окисления по 2 путям. При реализации одного из них белок XylR активируется эффекторами и стимулирует транскрипцию с промотора Pu оперона верхнего пути и промотора Ps гена xylS. С помощью мутагенеза N'-метил-N'-нитро-N-нитрозогуанидином выделили 2 клона с аллелями xylR, кодирующими регуляторы XylRD135N и XylRP85S, способные стимулировать транскрипцию без эффекторов. Они содержат замены Asp[135]'-'Asn и Pro[85]'-'Ser соотв. в N-домене, к-рый вероятно участвует в узнавании эффекторов. Высокий базальный уровень транскрипции с промотора Pu, опосредованный обоими мутантными белками, еще более увеличивается в присутствии o- и p-нитротолуола, подобный эффект у промотора Ps отсутствует. У XylRP85S профиль узнаваемых эффектов совпадает с белком дикого типа, а XylRD135N узнает в кач-ве эффектора также и m-нитротолуол (у XylR дикого типа - ингибитор). Транскрипция с промотора Pu, активируемая белком XylR и его мутантными вариантами, нуждается в сохранении 3 белков промотора - сайта связывания 'сигма'{54} -12/-24, сайта IHF -40/-70 и UAS -120/-180. Присутствие фактора 'сигма'{54} обязательно и для активации промотора Pu мутантами. Обсуждают связь конформационных изменений с появлением у мутантов независимости от эффекторов. Испания, Estacion Exptl Zaidin, E-18008 Granada. Библ. 41
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕЦЕПТОРЫ
РЕЦЕПТОР XYLR
СИГНАЛЬНЫЙ ДОМЕН
АКТИВАТОРНЫЕ ФУНКЦИИ
ЕДИНИЧНЫЕ МУТАЦИИ
ОТСУТСТВИЕ ЗАВИСИМОСТИ ОТ ЭФФЕКТОРОВ
ТОЛУОЛ
УТИЛИЗАЦИЯ
ПРОМОТОР PU
ПЛАЗМИДА TOL
PSEUDOMONAS PUTIDA
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.02-04Б2.103

Автор(ы) : Perez-Martin, Jose, De, Lorenzo Victor
Заглавие : VTR expression cassettes for engineering conditional phenotypes in Pseudomonas: Activity of the Pu promoter of the TOL plasmid under limiting concentrations of the Xy1R activator protein
Источник статьи : Gene. - 1996. - Vol. 172, N 1. - С. 81-86
Аннотация: Разработан метод конструирования штаммов Pseudomonas putida и родственных бактерий, к-рые транскрибируют специфические гены, встроенные в их хромосому в ответ на индуктор lac-оперона (ИПТГ). Метод основан на использовании т. н. кассет экспрессии VTR. VTR - это 3 небольших NotI-фрагмента ДНК (1,98 т. п. н.), к-рые включают ген lacI{q} и гибридный trp/lac-промотор Ptrc, к-рые обеспечивают оптим. инициацию трансляции с расположенного следом ATG-кодона и содержат полилинкер в 3 рамках считывания. Метод позволяет встраивать в хромосому условно экспрессируемые гены с помощью переноса с использованием векторов на основе мини-транспозона Tn5. Систему использовали для изучения влияния внутриклеточной конц-ии регулятора TOL-плазмиды pWWO-XylR на экспоненциальное подавление промотора оперона Pu. Повышение конц-ии XylR приводило к более интенсивной индукции оперона, однако в условиях быстрого роста клеток промотор Pu был неактивен независимо от конц-ии XylR. Испания, Ctr. Nac. Biotecnol., CSIC, Campus de Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 22
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
КОНСТРУИРОВАНИЕ ШТАММОВ
МЕТОДЫ
КАССЕТЫ ЭКСПРЕССИИ
VTR-КАССЕТЫ
ПЛАЗМИДА TOL
ПРОМОТОР PU
АКТИВНОСТЬ
БЕЛОК-АКТИВАТОР XYLR
СОДЕРЖАНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.252

Автор(ы) : Perez-Martin, Jose, de, Lorenzo Victor
Заглавие : Coactivation in vitro of the 'сигма'{54}-dependent promoter Pu of the TOL plasmid of Pseudomonas putida by HU and the mammalian HMG-1 protein
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 8. - С. 2757-2760
Аннотация: Изучен механизм, позволяющий гистоноподобному белку HU (I) заменять хозяйский фактор интеграции IHF (II) в коактивации 'сигма'{54}-зависимого промотора Pu плазмиды TOL у Pseudomonas putida. С использованием предактивированной формы белка-коактиватора XylR показано, что функциональная замена II на I, обнаруженная in vivo, может быть воспроизведена in vitro с очищенными белками. Более того, II можно заменить негистоновый белок HMG-1 млекопитающих или характеристический изгиб ДНК. По-видимому 2 разных механизма (образование сайт-специфического статического изгиба ДНК или общее увеличение гибкости промоторной области) вызывают один и тот же структурный эффект в стимуляции транскрипции с промотора Pu. Испания, Centro Nacional de Biotechnol., Campus de Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 41
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ПРОМОТОР PU
'СИГМА'{54}-ЗАВИСИМЫЙ
КОАКТИВАЦИЯ
БЕЛОК
ГИСТОНОПОДОБНЫЙ HU
ЗАМЕНА ХОЗЯЙСКОГО ФАКТОРА ИНТЕГРАЦИИ
ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА TOL
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.07-04Б2.231

Автор(ы) : Cases, Ildefonso, Perez-Martin, Jose, de, Lorenzo Victor
Заглавие : The IIA{Ntr} (PtsN) protein of Pseudomonas putida mediates the C source inhibition of the 'сигма'{54}-dependent Pu promoter of the TOL plasmid
Источник статьи : J. Biol. Chem. - 1999. - Vol. 274, N 22. - С. 15562-15568
Аннотация: Изучено влияние кластера генов, смежного с геном rpoN фактора 'сигма'{54} Pseudomonas putida, на регуляцию источниками С промотора Pu верхнего оперона плазмиды TOL, участвующего в катаболизме толуола. Эта область содержит 4 гена, 2 из которых (ptsN и ptsO) кодируют белки, похожие на компоненты фосфоенолпируват:сахарфосфотрансферазной системы. Сконструированы разрушения этих генов неполярной вставкой и изучено влияние мутаций на экспрессию репортерского гена с промотора Pu. Разрушения генов ORF102, ORF284 и ptsO не вызывают заметного фенотипа. Разрушение гена ptsN, кодирующего белок IIA{Ntr} (PtsN), устраняет чувствительность промотора Pu к репрессии глюкозой, но не влияет на скорости потребления глюкозы и глюконата. Замена H68D в консервативном фосфоакцепторном сайте IIA{Ntr} приводит к нечувствительности Pu к присутствию или отсутствию глюкозы. Эти данные подтвердили существование пути корегуляции некоторых зависящих от 'сигма'{54} промоторов, в котором ключевую роль играет белок IIA{Ntr}. Испания, Ctr. Nac. Biotecnol., CSIC, Madrid 28049. Библ. 54
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ПРОМОТОРЫ
ПРОМОТОР PU
ЗАВИСЯЩИЙ ОТ 'СИГМА'{54}
РЕГУЛЯЦИЯ
ГЛЮКОЗА
БЕЛОК PTSN
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.02-04Б2.312

Автор(ы) : Carmona, Manuel, de, Lorenzo Victor, Betoni, Giovanni
Заглавие : Recruitment of RNA polymerase is a rate-limiting step for the activation of the 'сигма'{54} promoter Pu of Pseudomonas putida
Источник статьи : J. Biol. Chem. - 1999. - Vol. 274, N 47. - С. 33790-33794
Аннотация: Активность зависящего от 'сигма'{54} (I) промотора Pu Pseudomonas putida изучена in vitro с матрицей ДНК, не имеющей 5'-активаторных последовательностей. В этом случае РНК-полимераза (II) может активироваться связывающимся с энхансером белком XylR (III) только из раствора. Хотя в этой системе отсутствует путь активации транскрипции за счет выпетливания ДНК хозяйским фактором IHF (IV), он стимулирует активность промотора. Позитивный эффект IV наблюдается не только с III из раствора, но и с другими зависящими от I активаторами (NtrC и NifA). Стимуляцию транскрипции вызывает также белок HU (V), неспецифически связывающийся с ДНК. Стимуляция транскрипции в отсутствие энхансера обусловлена вербовкой I, т. е. повышением эффективности образования закрытого комплекса, вызванной связыванием IV или V. Таким образом, при лимитирующих конц-иях II опосредованное факторами связывание II с Pu вводит в систему кинетич. контрольную точку, предотвращающую опосредованное III образование открытого комплекса. Испания, Dep. Microbial Biotechnol., Ctr. Nac. Biotechnol., CSIC, Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 34
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ПРОМОТОРЫ
ПРОМОТОР PU
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
АКТИВАЦИЯ
ЛИМИТИРУЮЩАЯ СТАДИЯ
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
СВЯЗЫВАНИЕ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)
Дата ввода:

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска