Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткий полный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК<.>)
Общее количество найденных документов : 12
Показаны документы с 1 по 12
1.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 15.09-04Б2.28

Автор(ы) : Ramasamy, Dhamodharan, Mishra, Ajay Kumar, Lagier, Jean-Christophe, Padhmanabha, Roshan, Rossi, Morgane, Sentausa, Erwin, Raoult, Didier, Fournier, Pierre-Edouard
Заглавие : A polyphasic strategy incorporating genomic data for the taxonomic description of novel bacterial species
Источник статьи : Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2014. - Vol. 64, N 2. - С. 384-391
Аннотация: Обзор. В наши дни таксономия бактерий опирается на многосторонний подход. Он основан на сочетании фенотипич. и генотипич. признаков. Но современное положение парадоксально. Применяемые генетич. критерии, включая ДНК/ДНК-гибридизацию, сходство в последовательности нуклеотидов в гене 16S-рРНК и филогению, а также содержание Г+Ц, - имеют серьезные ограничения. Не используются для таксономич. целей геномные последовательности, составляющие целостную генетич. информацию. При этом нарастают секвенирование и число доступных геномов, а цена секвенирования падает. Недавно с целью выделения некультивируемых бактерий авт. расширили спектр условий культивирования. Чтобы классифицировать предполагаемые новые виды, выращиваемые авт., была применена многосторонняя (polyphasic) стратегия. Она влключала фенотипич. и геномные критерии (геномные характеристики, а также сходство геномных последовательностей). Исходя из этого, были рассмотрены "за" и "против" геномного секвенирования для таксономии. Заключили, что включение геномных последовательностей в таксономич. исследования дает преимущество применения надежных и воспроизводимых данных. Эту стратегию авт. предложили назвать таксоногеномикой. E-mail:pierre-edouard.fournier@univ.amu.fr
ГРНТИ : 34.27.15
Предметные рубрики: НОВЫЕ ВИДЫ БАКТЕРИЙ
ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ ОПИСАНИЕ
МНОГОСТОРОННЯЯ СТРАТЕГИЯ
ДНК/ДНК-ГИБРИДИЗАЦИЯ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
ФИЛОГЕНИЯ
СОДЕРЖАНИЕ Г+Ц
ФЕНОТИПИЧЕСКИЕ ПРИЗНАКИ
ТАКСОНОГЕНОМИКА
ОБЗОРЫ
Дата ввода:
2.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 15.09-04А1.16

Автор(ы) : Ramasamy, Dhamodharan, Mishra, Ajay Kumar, Lagier, Jean-Christophe, Padhmanabha, Roshan, Rossi, Morgane, Sentausa, Erwin, Raoult, Didier, Fournier, Pierre-Edouard
Заглавие : A polyphasic strategy incorporating genomic data for the taxonomic description of novel bacterial species
Источник статьи : Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2014. - Vol. 64, N 2. - С. 384-391
Аннотация: Обзор. В наши дни таксономия бактерий опирается на многосторонний подход. Он основан на сочетании фенотипич. и генотипич. признаков. Но современное положение парадоксально. Применяемые генетич. критерии, включая ДНК/ДНК-гибридизацию, сходство в последовательности нуклеотидов в гене 16S-рРНК и филогению, а также содержание Г+Ц, - имеют серьезные ограничения. Не используются для таксономич. целей геномные последовательности, составляющие целостную генетич. информацию. При этом нарастают секвенирование и число доступных геномов, а цена секвенирования падает. Недавно с целью выделения некультивируемых бактерий авт. расширили спектр условий культивирования. Чтобы классифицировать предполагаемые новые виды, выращиваемые авт., была применена многосторонняя (polyphasic) стратегия. Она влключала фенотипич. и геномные критерии (геномные характеристики, а также сходство геномных последовательностей). Исходя из этого, были рассмотрены "за" и "против" геномного секвенирования для таксономии. Заключили, что включение геномных последовательностей в таксономич. исследования дает преимущество применения надежных и воспроизводимых данных. Эту стратегию авт. предложили назвать таксоногеномикой. E-mail:pierre-edouard.fournier@univ.amu.fr
ГРНТИ : 34.03.21
Предметные рубрики: НОВЫЕ ВИДЫ БАКТЕРИЙ
ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ ОПИСАНИЕ
МНОГОСТОРОННЯЯ СТРАТЕГИЯ
ДНК/ДНК-ГИБРИДИЗАЦИЯ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
ФИЛОГЕНИЯ
СОДЕРЖАНИЕ Г+Ц
ФЕНОТИПИЧЕСКИЕ ПРИЗНАКИ
ТАКСОНОГЕНОМИКА
ОБЗОРЫ
Дата ввода:
3.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 15.10-04Б4.208

Автор(ы) : Ramasamy, Dhamodharan, Mishra, Ajay Kumar, Lagier, Jean-Christophe, Padhmanabha, Roshan, Rossi, Morgane, Sentausa, Erwin, Raoult, Didier, Fournier, Pierre-Edouard
Заглавие : A polyphasic strategy incorporating genomic data for the taxonomic description of novel bacterial species
Источник статьи : Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2014. - Vol. 64, N 2. - С. 384-391
Аннотация: Обзор. В наши дни таксономия бактерий опирается на многосторонний подход. Он основан на сочетании фенотипич. и генотипич. признаков. Но современное положение парадоксально. Применяемые генетич. критерии, включая ДНК/ДНК-гибридизацию, сходство в последовательности нуклеотидов в гене 16S-рРНК и филогению, а также содержание Г+Ц, - имеют серьезные ограничения. Не используются для таксономич. целей геномные последовательности, составляющие целостную генетич. информацию. При этом нарастают секвенирование и число доступных геномов, а цена секвенирования падает. Недавно с целью выделения некультивируемых бактерий авт. расширили спектр условий культивирования. Чтобы классифицировать предполагаемые новые виды, выращиваемые авт., была применена многосторонняя (polyphasic) стратегия. Она влключала фенотипич. и геномные критерии (геномные характеристики, а также сходство геномных последовательностей). Исходя из этого, были рассмотрены "за" и "против" геномного секвенирования для таксономии. Заключили, что включение геномных последовательностей в таксономич. исследования дает преимущество применения надежных и воспроизводимых данных. Эту стратегию авт. предложили назвать таксоногеномикой. E-mail:pierre-edouard.fournier@univ.amu.fr
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: НОВЫЕ ВИДЫ БАКТЕРИЙ
ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ ОПИСАНИЕ
МНОГОСТОРОННЯЯ СТРАТЕГИЯ
ДНК/ДНК-ГИБРИДИЗАЦИЯ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
ФИЛОГЕНИЯ
СОДЕРЖАНИЕ Г+Ц
ФЕНОТИПИЧЕСКИЕ ПРИЗНАКИ
ТАКСОНОГЕНОМИКА
ОБЗОРЫ
Дата ввода:
4.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 15.10-04Б3.54

Автор(ы) : Ramasamy, Dhamodharan, Mishra, Ajay Kumar, Lagier, Jean-Christophe, Padhmanabha, Roshan, Rossi, Morgane, Sentausa, Erwin, Raoult, Didier, Fournier, Pierre-Edouard
Заглавие : A polyphasic strategy incorporating genomic data for the taxonomic description of novel bacterial species
Источник статьи : Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2014. - Vol. 64, N 2. - С. 384-391
Аннотация: Обзор. В наши дни таксономия бактерий опирается на многосторонний подход. Он основан на сочетании фенотипич. и генотипич. признаков. Но современное положение парадоксально. Применяемые генетич. критерии, включая ДНК/ДНК-гибридизацию, сходство в последовательности нуклеотидов в гене 16S-рРНК и филогению, а также содержание Г+Ц, - имеют серьезные ограничения. Не используются для таксономич. целей геномные последовательности, составляющие целостную генетич. информацию. При этом нарастают секвенирование и число доступных геномов, а цена секвенирования падает. Недавно с целью выделения некультивируемых бактерий авт. расширили спектр условий культивирования. Чтобы классифицировать предполагаемые новые виды, выращиваемые авт., была применена многосторонняя (polyphasic) стратегия. Она влключала фенотипич. и геномные критерии (геномные характеристики, а также сходство геномных последовательностей). Исходя из этого, были рассмотрены "за" и "против" геномного секвенирования для таксономии. Заключили, что включение геномных последовательностей в таксономич. исследования дает преимущество применения надежных и воспроизводимых данных. Эту стратегию авт. предложили назвать таксоногеномикой. E-mail:pierre-edouard.fournier@univ.amu.fr
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: НОВЫЕ ВИДЫ БАКТЕРИЙ
ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ ОПИСАНИЕ
МНОГОСТОРОННЯЯ СТРАТЕГИЯ
ДНК/ДНК-ГИБРИДИЗАЦИЯ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
ФИЛОГЕНИЯ
СОДЕРЖАНИЕ Г+Ц
ФЕНОТИПИЧЕСКИЕ ПРИЗНАКИ
ТАКСОНОГЕНОМИКА
ОБЗОРЫ
Дата ввода:
5.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 14.08-04Б3.25

Автор(ы) : Li, Lubin, Sun, Lei, Shi, Nan, Liu, Lin, Guo, Huijuan, Xu, Aifang, Zhang, Xiaoxia, Yao, Na
Заглавие : Chitinophaga cymbidii sp. nov., isolated from Cymbidium goeringii roots
Источник статьи : Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2013. - Vol. 63, N 5. - С. 1800-1804
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: CHITINOPHAGA CYMBIDII SP.NOV. (BACT.)
СИМБИОНТ CYMBIDIUM GOERINGII
МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ ПРИЗНАКИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
ХЕМОТАКСОНОМИЯ
СОДЕРЖАНИЕ Г+Ц
НОВЫЕ ВИДЫ
Дата ввода:
6.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.06-04Б2.32

Автор(ы) : Li, Lubin, Sun, Lei, Shi, Nan, Liu, Lin, Guo, Huijuan, Xu, Aifang, Zhang, Xiaoxia, Yao, Na
Заглавие : Chitinophaga cymbidii sp. nov., isolated from Cymbidium goeringii roots
Источник статьи : Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2013. - Vol. 63, N 5. - С. 1800-1804
ГРНТИ : 34.27.15
Предметные рубрики: CHITINOPHAGA CYMBIDII SP.NOV. (BACT.)
СИМБИОНТ CYMBIDIUM GOERINGII
МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ ПРИЗНАКИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
ХЕМОТАКСОНОМИЯ
СОДЕРЖАНИЕ Г+Ц
НОВЫЕ ВИДЫ
Дата ввода:
7.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 14.08-04Б3.26

Автор(ы) : Soby Scott D., Gadagkar Sudhindra R., Contreras, Cristina, Caruso Frank L.
Заглавие : Chromobacterium vaccinii sp. nov., isolated from native and cultivated cranberry (Vaccinium macrocarpon Ait.) bogs and irrigation ponds
Источник статьи : Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2013. - Vol. 63, N 5. - С. 1840-1846
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: CHROMOBACTERIUM VACCINII SP.NOV. (BACT.)
ИЗОЛЯТ КЛЮКВЫ
МОРФОЛОГИЯ КОЛОНИЙ
ОСОБЕННОСТИ ОБМЕНА
ФИЛЬГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
НОВЫЕ ВИДЫ
Дата ввода:
8.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.06-04Б2.33

Автор(ы) : Soby Scott D., Gadagkar Sudhindra R., Contreras, Cristina, Caruso Frank L.
Заглавие : Chromobacterium vaccinii sp. nov., isolated from native and cultivated cranberry (Vaccinium macrocarpon Ait.) bogs and irrigation ponds
Источник статьи : Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2013. - Vol. 63, N 5. - С. 1840-1846
ГРНТИ : 34.27.15
Предметные рубрики: CHROMOBACTERIUM VACCINII SP.NOV. (BACT.)
ИЗОЛЯТ КЛЮКВЫ
МОРФОЛОГИЯ КОЛОНИЙ
ОСОБЕННОСТИ ОБМЕНА
ФИЛЬГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
НОВЫЕ ВИДЫ
Дата ввода:
9.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.04-04Б2.39

Автор(ы) : Savio, Claudia, Mazzon, Luca, Martinez-Sanudo, Isabel, Simonato, Mauro, Squartini, Andrea, Girolami, Vincenzo
Заглавие : Evidence of two lineages of the symbiont 'Candidatus Erwinia dacicola' in Italian populations of Bactrocera oleae (Rossi) based on 16S rRNA gene sequences
Источник статьи : Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2012. - Vol. 62, N 1. - С. 179-187
Аннотация: В луковице пищевода оливковой мухи Bactrocera oleae (Tephritidae) выявили некультивируемую, передающуюся по наследству, специфичную к хозяину бактерию "Candidatus Erwinia dacicola". Сравнили последовательности в гене 16S-рРНК у 26 итальянских популяций оливковой мухи на диких и культурных оливковых деревьях по всей Италии. Проанализировали 314 мух на последовательности в 781 п.н. гена 16S-рРНК и в 776 п.н. митохондриального генома. У "Ca. F. dacicola" были обнаружены два гаплотипа [ГТ](57% и 43%). Они не встречались в одном индивиде. На Сицилии и на Сардинии встречался или один, или другой ГТ, а на полуострове в разных популяциях встречались оба ГТ в разных отношениях. Корреляции между ГТ симбионта и 16 ГТ у мух-хозяев обнаружено не было. Подчеркнуто наличие смешанной модели вертикальной и горизонтальной передачи симбионта в жизненном цикле мух. E-mail:vincenzo.girolami@unipd.it
ГРНТИ : 34.27.15
Предметные рубрики: "CANDIDATUS ERWINIA DACICOLA" (BACT.)
ГАПЛОТИПЫ
СИМБИОНТЫ МУХ BACTROCERA OLEAE
ИТАЛЬЯНСКИЕ ПОПУЛЯЦИИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНОМА
Дата ввода:
10.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.09-04Б2.77

Автор(ы) : Hashimoto R., Yoshida T., Kuno S., Nishikawa T., Sako Y.
Заглавие : The first assessment of cyanobacterial and diazotrophic divesities in the Japan Sea
Источник статьи : Fish. Sci. - 2012. - Vol. 78, N 6. - С. 1293-1300
Аннотация: Анализировали разнообразие цианобактерий (ЦБ) и диазотрофов (ДТ) в Японском море до глубины в 100 м. Использовали последовательности 16S-рРНК у ЦБ и генов связывания N-nifH. Получили 107 последовательностей рРНК-генов ЦБ. Из них 97 и 3 последовательности относились к субкластеру 5.1 Synechococcus и Prochlorococcus HL (II) соотв. В отличие от других участков в океане, на 2 станциях в этой работе последовательностей, связываемых с Synechococcus, субкластер 5,3, было относительно много (8%). Среди ЦН-16S-рРНК генов таковых, относящихся к ДТ-ЦБ, не обнаружили. Среди 36 последовательностей клоновой библиотеки nifH - к Proteobacteria. Подчеркивается преобладание в Японском море гетеротрофных бактерий, включая UCYN-A. Обнаружили доминирование в ЦБ-сообществе Synechococcus и (фото)гетеротрофных ДТ в ДТ-сообществе Японского моря, подтвердив их уникальные характеристики. Япония, Graduate School of Agriculture, Kyoto Uni., Kyoto, 606-8502. Библ. 44
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: ЦИАНОБАКТЕРИИ
ДИАЗОТРОФЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНА NIFH
ЯПОНСКОЕ МОРЕ
PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
SYNECHOCOCCUS СУБКЛАСТЕР 5.3 (BACT.)
UCYN-A (BACT.)
Дата ввода:
11.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 14.01-04В2.269

Автор(ы) : Hashimoto R., Yoshida T., Kuno S., Nishikawa T., Sako Y.
Заглавие : The first assessment of cyanobacterial and diazotrophic divesities in the Japan Sea
Источник статьи : Fish. Sci. - 2012. - Vol. 78, N 6. - С. 1293-1300
Аннотация: Анализировали разнообразие цианобактерий (ЦБ) и диазотрофов (ДТ) в Японском море до глубины в 100 м. Использовали последовательности 16S-рРНК у ЦБ и генов связывания N-nifH. Получили 107 последовательностей рРНК-генов ЦБ. Из них 97 и 3 последовательности относились к субкластеру 5.1 Synechococcus и Prochlorococcus HL (II) соотв. В отличие от других участков в океане, на 2 станциях в этой работе последовательностей, связываемых с Synechococcus, субкластер 5,3, было относительно много (8%). Среди ЦН-16S-рРНК генов таковых, относящихся к ДТ-ЦБ, не обнаружили. Среди 36 последовательностей клоновой библиотеки nifH - к Proteobacteria. Подчеркивается преобладание в Японском море гетеротрофных бактерий, включая UCYN-A. Обнаружили доминирование в ЦБ-сообществе Synechococcus и (фото)гетеротрофных ДТ в ДТ-сообществе Японского моря, подтвердив их уникальные характеристики. Япония, Graduate School of Agriculture, Kyoto Uni., Kyoto, 606-8502. Библ. 44
ГРНТИ : 34.29.15
Предметные рубрики: ЦИАНОБАКТЕРИИ
ДИАЗОТРОФЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНА NIFH
ЯПОНСКОЕ МОРЕ
PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
SYNECHOCOCCUS СУБКЛАСТЕР 5.3 (BACT.)
UCYN-A (BACT.)
Дата ввода:
12.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 14.01-04Б3.137

Автор(ы) : Hashimoto R., Yoshida T., Kuno S., Nishikawa T., Sako Y.
Заглавие : The first assessment of cyanobacterial and diazotrophic divesities in the Japan Sea
Источник статьи : Fish. Sci. - 2012. - Vol. 78, N 6. - С. 1293-1300
Аннотация: Анализировали разнообразие цианобактерий (ЦБ) и диазотрофов (ДТ) в Японском море до глубины в 100 м. Использовали последовательности 16S-рРНК у ЦБ и генов связывания N-nifH. Получили 107 последовательностей рРНК-генов ЦБ. Из них 97 и 3 последовательности относились к субкластеру 5.1 Synechococcus и Prochlorococcus HL (II) соотв. В отличие от других участков в океане, на 2 станциях в этой работе последовательностей, связываемых с Synechococcus, субкластер 5,3, было относительно много (8%). Среди ЦН-16S-рРНК генов таковых, относящихся к ДТ-ЦБ, не обнаружили. Среди 36 последовательностей клоновой библиотеки nifH - к Proteobacteria. Подчеркивается преобладание в Японском море гетеротрофных бактерий, включая UCYN-A. Обнаружили доминирование в ЦБ-сообществе Synechococcus и (фото)гетеротрофных ДТ в ДТ-сообществе Японского моря, подтвердив их уникальные характеристики. Япония, Graduate School of Agriculture, Kyoto Uni., Kyoto, 606-8502. Библ. 44
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: ЦИАНОБАКТЕРИИ
ДИАЗОТРОФЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 16S-РРНК
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНА NIFH
ЯПОНСКОЕ МОРЕ
PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
SYNECHOCOCCUS СУБКЛАСТЕР 5.3 (BACT.)
UCYN-A (BACT.)
Дата ввода:
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)