СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ ORF<.>)

Общее количество найденных документов : 7
Показаны документы с 1 по 7

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.05-04Б2.461

Автор(ы) : Kendall Kevin J., Cohen Stanley N.
Заглавие : Complete nucleotide sequence of the Streptomyces lividans plasmid pIJ101 and correlation of the sequence with genetic properties
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 10. - С. 4634-4651
Аннотация: Определена полная нуклеотидная последовательность мультикопийной плазмиды pIJ101 Streptomyces. Кольцевая молекула ДНК имеет длину 8,830 п.н., Г+Ц состав 72,98%. Идентифицировано 4 открытые рамки считывания (ОРС), кодирующие белки tra (621 аминокислота), spdA (146), spdB (274) и kilB (177), участвующие в передаче плазмиды. Две ОРС соотв. локусам korB (80) и korA (241), к-рые контролируют экспрессию некоторых промоторов, локализованных на плазмиде. С этих промоторов транскрибируются, по крайней, мере два из вышеперечисленных генов. Большая ОРС rep (450) входит в состав автономно реплицирующегося сегмента плазмидной ДНК. Предполагается, что белок, кодируемый этим геном, ответственен за репликацию этого сегмента, т. к. еще одна OPC orf (56), присутствующая в сегменте, не связана с репликацией. Три ОРС orf (66), orf (179), orf (185), а также orf (56) не удалось связать с какими-либо известными плазмидными функциями. Определена также нуклеотидная последовательность области репликации плазмидных векторов pIJ350 и pIJ702. Библ. 32. США, Stanford Univ. School of Medicine, Stanford, CA 94305.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: STREPTOMYCES LIVIDANS (BACT.)
ПЛАЗМИДА PIJ101
ДНК ПЛАЗМИДНАЯ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ ORF
СООТВЕТСТВИЕ
ГЕНЫ ПЕРЕНОСА TRA
ГЕНЫ РЕПЛИКАЦИИ REP
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.213

Автор(ы) : Overduin P., Boos W., Tommassen J.
Заглавие : Nucleotide sequence of the ugp genes of Escherichia coli K-12: homology to the maltose system
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 1988. - Vol. 2, N 6. - С. 767-775
Аннотация: Ugp-система E. coli осуществляет поглощение sn-глицерол-3-фосфата (ГЗФ). Синтез Ugp-системы корегулируется с синтезом многих др. белков pho-регулона. Определили последовательность нуклеотидов ugp-локуса и его промотора. Показали, что промотор ugp-локуса, как и др. промоторы pho-регуляторной системы содержит "pho box". За промотором следуют 4 открытые рамки считывания, которые обзначили ugp B, A, E, C. Ген ugp B кодирует периплазматический белок с мол. м. 46 565 D. ugp A и Е кодируют гидрофобные белки внутренней мембраны E. coli. Ugp A состоит из 295, а Ugp E - из 281 остатков аминокислот. Ugp C белок состоит 356 остатков аминокислот и, видимо, является поставщиком энергии для Ugp-системы. Сравнили нкулеотидную последовательность генов Ugp-системы с генами др. транспортных систем и обнаружили, что наибольшая гомология имеется с генами системы транспорта мальтозы (Mal-система). Библ. 42. Нидерланды, Dept. of Mol. Cell Biol., State Univ. of Utrecht, Padualaan 8, 3584 CH Utrecht.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММ К-12
ТРАНСПОРТНАЯ СИСТЕМА
СОСТАВ
ГЛИЦЕРОЛ-3ФОСФАТ* SN-
ГЕНЫ
ГЕНЫ ТРАНСПОРТНОЙ СИСТЕМЫ UGP
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ПРОМОТОРЫ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ ORF
ГОМОЛОГИЯ
СИСТЕМА ТРАНСПОРТА МАЛЬТОЗЫ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.254

Автор(ы) : Kunst, Frank, Debarbouille, Michel, Msadek, Tarek, Young, Michael, Maue, Catherine, Karamata, Dimitri, Klier, Andre, Rapoport, Georges, Dedonder, Raymond
Заглавие : Deduced polypeptides encoded by the Bacillus subtilis sacU locus share homology with twocomponent sensor-regulator systems
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 11. - С. 5093-5101
Аннотация: Регуляторный локус sacU Bacillus subtilis клонирован на фаговом векторе 'лямбда' EMBL 3 и на многокопийной плазмиде рН V1431d. Делеционное картирование позволило локализовать локус sacU на рестрикционном фрагменте SalI-SphI длиной 2600 п. н. Определена его нуклеотидная последовательность. Обнаружены 2 открытых рамки считывания (ОРС) ОРС 1 кодирует белок с м. м. 44906, гомологичный продуктам генов cheA Salmonella typhimurium и срхА Escherichia coli, к-рые являются сенсорными передатчиками. ОРС 2 кодирует белок с мол. м. 25833, похожий на семейство транскрипционных активаторов, включая продукты генов spoOA и spoOF Bac. subtilis и dye и ompR E. coli. Эти данные позволяют предположить, что локус SacU кодирует сенсорно-регуляторную пару белков, функция к-рой состоит в передаче к аппарату транскрипции информации о специфических изменениях окружающей среды (ограничении кол-ва питательных в-в). Библ. 53. Франция, Unite de Biochim. Microbienne, Inst. Pasteur, 75724 Paris, G. Rapoport.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: BACILLS SUBTILIS (BACT.)
СЕНСОРНО-РЕГУЛЯТОРНАЯ СИСТЕМА
ФЕРМЕНТЫ ДЕГРАДАЦИИ
СИНТЕЗ
РЕГУЛЯЦИЯ
АДАПТАЦИЯ
ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ГЕНЫ
ГЕНЫ SACU
КЛОНИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ ORF
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.358

Автор(ы) : Kuiper Martin T.R., Lambowitz Alan M.
Заглавие : A novel reverse transcriptase activity associated with mitochondrial plasmids of Neurospora
Источник статьи : Cell. - 1988. - Vol. 55, N 4. - С. 693-704
Аннотация: Показано, что шт. Mauriceville-1с Neurospora crassa и шт. Varkud-1с Neurospora intermedia обладают активностью обратной транскриптазы, специфически связанной с митохондриальными плазмидами. Транскриптазная активность обнаружена в лизатах митохондрий и в препаратах рибонуклеопротеиновых частиц обоих упомянутых шт., но не шт. дикого типа 74А, к-рый не содержит митохондриальные плазмиды. Транскриптаза специфически действует только на эндогенную плазмидную РНК в препаратах рибонуклеиновых частиц и синтезирует полноразмерную минус-нить ДНК, начиная с 3'-конца плазмидной РНК. Предположено, что обнаруженная транскриптазная активность связана с кодируемым открытой рамкой считывания плазмиды белком (710 аминокислот), к-рый гомологичен обратным транскриптазам ретровирусов. Ил. 8. Табл. 3. Библ. 47. США, Dep. of Mol. Genet., Ohio State Univ. Columbus, OH 43210.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: NEUROSPORA (FUNGI)
ШТАММ MAURICEVILLE-1С
ШТАММ VARKUD-1С
РИБОНУКЛЕОПРОТЕИДЫ
РНК
ТРАНСКРИПЦИЯ
ОБРАТНАЯ ТРАНСКРИПТАЗА
СПЕЦИФИЧНОСТЬ ДЕЙСТВИЯ
АКТИВНОСТЬ
ЛИЗАТЫ МИТОХОНДРИЙ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ ORF
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.10-04Б2.582

Автор(ы) : Krishnan, Rajendra, Iver V.N.
Заглавие : Molecular mechanisms in DNA replication and recombination
Источник статьи : J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N13D. - С. 130
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ПЛАЗМИДА PCU1
ГРУППА НЕСОВМЕСТИМОСТИ INC N
ГЕНОМ ПЛАЗМИДНЫЙ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ ORF
ОРГАНИЗАЦИЯ
ФУНКЦИИ
БЕЛКИ РЕПЛИКАЦИИ
АМИНОКИСЛОТНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ПРЕДСКАЗАНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.10-04Б2.349

Автор(ы) : Uffen Robert L., Colbeau, Annette, Richaud, Pierre, Vignais Paulette M.
Заглавие : Cloning and sequencing the genes encoding uptake-hydrogenase subunits of Rhodocyclus gelatinosus
Источник статьи : Mol. and Gen. Genet. - 1990. - Vol. 221, N 1. - С. 49-58
Аннотация: Rhodocyclus gelatinosus на свету фотосинтезирует и потребляет Н[2] с интенсивностью 665 нмол/мин*мг белка. Гидрогеназа связывания Н[2] [Г] является мембраносвязаным ферментом, нечувствительным к ингибированию СО. Структурные гены Г R. gelatinosus выделили из 40 т. п. н. фрагментов космидной библиотеки ДНК R. gelatinosus путем гибридизации со структурными генами hup Bradyrhizobium japonicum и R. capsulatus. Гены Г R. gelatinosus находились на 2 перекрывающихся рестрикционных фрагментах, субклонированных на pUC 18, причем каждый фрагмент имел открытую рамку считывания ORF1 и ORF2. ORF 1 (1080 т. п. н.) кодировала белок с мол. м. 39.4 кД, ORF2 (1854 т. п. н.) соответствовала белку с мол. м. 68.5 кД. Анализ аминокислотной последовательности белков показал, что ORF кодируют соотв. малую (HupS) и большую (HypL) субъединицы Г R. gelatinosus. ORF имеют соотв. 80% и 68% гомологии с генами аналогичных субъединиц известных мембраносвязанных Г. Библ. 33. Франция, Biochimie Microbienne (UA 1130CNRS) Departement de Recherche Fondamentale, Centre d'Etudes Nucleaires, 85Х. F-38041 Grenoble Cedex.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: RHODOCYCLUS GELATINOSUS (BACT.)
ПУРПУРНЫЕ НЕ СЕРНЫЕ ФОТОСИНТЕТИЧЕСКИЕ БАКТЕРИИ
ГЕНЫ
ГЕНЫ СУБЪЕДИНИЦ ГИДРОГЕНАЗЫ СВЯЗЫВАЮЩЕЙ ВОДОРОД NYP
КЛОНИРОВАНИЕ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ ORF
ГИДРОГЕНАЗА
СУБЪЕДИНИЧНЫЙ СОСТАВ
ПРЕДСКАЗАНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.01-04Б2.414

Автор(ы) : Brown David P., Idler Kenneth B., Katz, Leonard
Заглавие : Characterization of the genetic elements required for site-specific integration of plazmid pSE21 in Saccharopolyspora erythraea
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1990. - Vol. 172, N 4. - С. 1877-1888
Аннотация: Плазмида pSE211 (18,1 т.п.н.) интегрируется в хромосому актиномицета Saccharopolyspora erythraca (прежнее название Streptomyces erythraeus) в специфическом сайте attB. Продемонстрировано, что для интеграции необходим и достаточен сегмент pS211 размером 2,4 т.п.н. При секвенировании этого сегмента выявлены 2 полных открытых рамки считывания и часть третьей открытой рамки считывания. Одна из полных открытых рамок считывания способна кодировать белок, родственный сайт-специфическим рекомбиназам семейства интеграз, а др. - белок, родственный Xis-белкам бактериофагов. Интеграция плазмиды pSE211 происходит путем недупликативной рекомбинации. Сайт att B соответствует гену фенилаланиновой тРНК. Ил. 10. Табл. 1. Библ. 52. США, Corporate Mol. Biol., Abbott Lab., Abbott Park, IL 60064.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: SACCHAROPOLYSPORA ERYTHREAE (BACT.)
ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ
АКТИНОМИЦЕТЫ
ГЕНОМ
УЧАСТКИ ИНТЕГРАЦИИ ATT B
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ ORF
ПЛАЗМИДА PSE211
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ ИНТЕГРАЦИЯ
ДУПЛИКАТИВНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
Дата ввода:

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска