СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ<.>)

Общее количество найденных документов : 26
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-26

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.12-04Б1.213

Автор(ы) : Yamaguchi, Hirotaka, Yamashita, Teruhito, Shimizu, Hatsushi, Ikeda, Hideo
Заглавие : A hotspot of spontaneous and UV-induced illegitimate recombination during formation of 'лямбда' bio transducing phage
Источник статьи : Mol. and Gen. Genet. - 1995. - Vol. 248, N 6. - С. 637-643
Аннотация: Для изучения механизма спонтанной и УФ-индуцированной незаконной рекомбинации у Escherichia coli исследовано образование специализированных трансдуцирующих фагов (СТФ). Т. к. большинство СТФ 'лямбда' bio дефектно по генам red и gam и образует негативные колонии на лизогене по фагу Р2, для селекции СТФ 'лямбда' bio использован этот фенотип Spi{-}. Секвенированы рекомбинац. стыки СТФ 'лямбда' bio и определены последовательности родительских сайтов рекомбинации. Они широко распределены по ДНК локуса bio и фага 'лямбда', за исключением одной горячей точки рекомбинации (ГТР), к-рая отвечает за 57% УФ-индуцированных и 77% спонтанно индуцированных СТФ 'лямбда' bio. Сайты ГТР в ДНК E. coli и 'лямбда' имеют общую область гомологии длиной 9 п. н. (ТТЦЦАТГЦГ). Кроме того в самих ГТР и рядом с ними имеются прямые повторы 8 п. н. (АТГYГYТЦ). Мутация recA не влияет на частоту рекомбинации в ГТР, так что рекомбинация не является вариантом RecA-зависимой гомологич. рекомбинации. Обсуждается модель, согласно к-рой короткий участок гомологии и прямые повторы играют важную роль в незаконной рекомбинации в ГТР. Япония, Dep. of Molecular Biol., Inst. of Med. Sci., Univ. of Tokyo, Tokyo 108. Библ. 25
ГРНТИ : 34.25.21
Предметные рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ ЛЯМБДА BIO
ТРАНСДУКЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ESCHERICHIA COLI
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.03-04Б1.160

Автор(ы) : Marais, Armelle, Bove Joseph M., Renaudin, Joel
Заглавие : Spiroplasma citri virus SpV1-derived cloning vector: Deletion formation by illegitimate and homologous recombination in a spiroplasmal host strain which probably lacks a functional recA gene
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1996. - Vol. 178, N 3. - С. 862-870
Аннотация: Ранее было описано применение репликативной формы (РФ) ДНК фага SpV1 Spiroplasma citri в качестве вектора для экспрессии в S. citri эпитопа адгезина Р1 из Mycoplasma pneumoniae. Найдено, что рекомбинантная РФ ДНК нестабильна и часто утрачивает вставку. Анализ фаговых клонов с делециями показал, что в образовании делеций участвует как незаконная, так и гомологич. рекомбинация. В одном из таких клонов делеция образовалась в результате двойного кроссоверного обмена между кольцевой свободной РФ ДНК и последовательностями ДНК фага SpV1 в хромосоме S. citri. Гомологич. рекомбинация обычно зависит от белка RecA. Однако изучение гена recA в использованном штамме R8A2 S. citri показало, что более 2/3 открытой рамки считывания recA делетировано в С-концевой части, так что этот штамм должен быть дефектен по RecA. Франция, Lab. de Biol. Cellulaire et Moleculaire, INRA, Univ. de Bordeaux II, 33883 Villenave d'Ornan. Библ. 71
ГРНТИ : 34.25.21
Предметные рубрики: ВЕКТОРЫ
ВИРУС SPV1
ДЕЛЕЦИИ
ОБРАЗОВАНИЕ
ВЛИЯНИЕ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
SPIROPLASMA CITRI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.08-04Б2.226

Автор(ы) : Marais, Armelle, Bove Joseph M., Renaudin, Joel
Заглавие : Spiroplasma citri virus SpV1-derived cloning vector: Deletion formation by illegitimate and homologous recombination in a spiroplasmal host strain which probably lacks a functional recA gene
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1996. - Vol. 178, N 3. - С. 862-870
Аннотация: Ранее было описано применение репликативной формы (РФ) ДНК фага SpV1 Spiroplasma citri в качестве вектора для экспрессии в S. citri эпитопа адгезина Р1 из Mycoplasma pneumoniae. Найдено, что рекомбинантная РФ ДНК нестабильна и часто утрачивает вставку. Анализ фаговых клонов с делециями показал, что в образовании делеций участвует как незаконная, так и гомологич. рекомбинация. В одном из таких клонов делеция образовалась в результате двойного кроссоверного обмена между кольцевой свободной РФ ДНК и последовательностями ДНК фага SpV1 в хромосоме S. citri. Гомологич. рекомбинация обычно зависит от белка RecA. Однако изучение гена recA в использованном штамме R8A2 S. citri показало, что более 2/3 открытой рамки считывания recA делетировано в С-концевой части, так что этот штамм должен быть дефектен по RecA. Франция, Lab. de Biol. Cellulaire et Moleculaire, INRA, Univ. de Bordeaux II, 33883 Villenave d'Ornan. Библ. 71
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ВЕКТОРЫ
ВИРУС SPV1
ДЕЛЕЦИИ
ОБРАЗОВАНИЕ
ВЛИЯНИЕ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
SPIROPLASMA CITRI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.09-04Б2.133

Автор(ы) : Shimizu, Hatsushi, Yamaguchi, Hirotaka, Ashizawa, Yuki, Kohno, Yuko, Asami, Mihoko, Kato, Jun-ichi, Ikeda, Hideo
Заглавие : Short-homology-independent illegitimate recombination in Escherichia coli: Distinct mechanism from short-homology-dependent illegitimate recombination
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 266, N 2. - С. 297-305
Аннотация: Выделен температурочувствительный мутант gyr Ahr1 по субъединице А ДНК-гиразы (I) Escherichia coli, у к-рого повышена частота спонтанной незаконной рекомбинации (НР) и наблюдается спонтанная индукция профага 'лямбда'. Высказано предположение, что мутация вызывает образование в хромосоме разрывов, стимулирующих НР. Анализ рекомбинац. стыков у трансдуцирующих фагов 'лямбда'bio, спонтанно образовавшихся в мутанте gyr Ahr1, показал, что сайты НР в гене bio и в ДНК 'лямбда' имеют среднюю длину участка гомологии всего 1,3 п. н. В клетках дикого типа стыки фагов 'лямбда'bio имеют среднюю длину области гомологии 8,4 п. н. Т. обр. НР в мутанте gyr Ahr1 отличается от НР в клетках дикого типа. После УФ-облучения мутанта gyr Ahr1 в стыках также обнаружена очень короткая гомология. Предложена модель НР, не зависящей от короткой гомологии и опосредованной обменом субъединицами между I. Япония, Dep. of Molecular Biol., Inst. of Med. Sci., Univ. of Tokyo, Tokyo 108. Библ. 28
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ФЕРМЕНТЫ
ДНК-ГИРАЗА
СУБЪЕДИНИЦА A
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.211

Автор(ы) : Ouchane, Soufian, Picaud, Martine, Vernotte, Claudie, Astier, Chantal
Заглавие : Photooxidative stress stimulates illegitimate recombination and mutability in carotenoid-less mutants of Rubrivivax gelatinosus
Источник статьи : EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16, N 15. - С. 4777-4787
Аннотация: Сконструированы мутанты Rubrivivax gelatinosus с разрушением гена crtB, не образующие каротиноиды (I). Изучено влияние фотоокислительного стресса (ФОС) на клетки дикого типа, мутанты crtB и мутанты crtC и crtD, синтезирующие промежуточные продукты биосинтеза I. Только у мутантов crtB ФОС вызывает появление с высокой частотой 4 классов мутантов: 1) с частичным восстановлением синтеза I; 2) дефектных по фотосинтезу; 3) с пониженным уровнем антенн LH1; 4) с ингибированием синтеза фотосинтетич. аппарата только в условиях оэробиоза. Молекулярный анализ показал, что ФОС индуцирует мутации и незаконную рекомбинацию, приводящую к образованию функциональных или нефункциональных химерных генов. Франция, Centre de Genetique Moleculaire du CNRS, 91198 Gif sur Yvette. Библ. 34
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
АКТИВАЦИЯ
ВЛИЯНИЕ
ФОТООКИСЛИТЕЛЬНЫЙ СТРЕСС
ГЕНЫ
ГЕН СИНТЕЗА КАРАТИНОИДОВ CRTB
ФУНКЦИЯ
RUBRIVIVAX GELATINOSUS
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.214

Автор(ы) : Wang, Jianhui, Masuzawa, Toshiyuki, Li, Miqing, Yanagihara, Yasutake
Заглавие : An unusual illegitimate recombination occurs in the linear-plasmid-encoded outer-surface protein A gene of Borrelia afzelii
Источник статьи : Microbiology. - 1997. - Vol. 143, N 12. - С. 3819-3825
Аннотация: Из пациента с хронич. болезнью Лайма выделен мутант Borrelia afzelii, у к-рого произошла необычная незаконная рекомбинация в плазмидном гене ompA белка А внешней поверхности, вызвавшая делецию сегмента длиной 96 п. н. Природа перестройки позволяет предположить, что она произошла по механизму проскальзывания нити, стимулированной палиндромом (18 п. н.) и короткими прямыми повторами (5 п. н.) на обоих концах делетированной ДНК. Делетированная последовательность может образовывать сложную шпилечную структуру. Высказано предположение, что эта структура может играть важную роль в задержке репликации и проскальзывании вновь синтезированной нити ДНК через репликативную вилку. Япония, Dept. of Microbiol., School of Pharmacentical Sci., Univ. of Shizuoka, Shizuoka 422. Библ. 47
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕН БЕЛКА ОБОЛОЧКИ OMPA
СТРУКТУРА
МУТАЦИИ
МУТАЦИЯ В ГЕНЕ БЕЛКА ОБОЛОЧКИ OMPA
ВОЗНИКНОВЕНИЕ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
BORRELIA AFZELII (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.346

Автор(ы) : Ukita, Toshiyuki, Ikeda, Hideo
Заглавие : Role of the recJ gene product in UV-induced illegitimate recombination at the hotspot
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1996. - Vol. 178, N 8. - С. 2362-2367
Аннотация: Незаконная рекомбинация (НР) между профагом и смежной бактериальной ДНК в горячей точке является первым шагом в образовании специализированных трансдуцирующих фагов (СТФ). Такая НР значительно стимулируется УФ-облучением клеток. Показано, что мутация recJ у Escherichia coli понижает частоту образования УФ-индуцированных СТФ 'лямбда'bio в 3-10 раз. Кроме того, горячая точка НР, ответственная за 60% СТФ 'лямбда'bio в клетках дикого типа, отсутствует в мутанте recJ. Введение в мутант recJ плазмиды, гиперпродуцирующей белок RecJ (I), восстанавливает НР в горячей точке. Эти данные показали, что I преимущественно стимулирует НР в горячей точке. Горячая точка НР и негорячие сайты имеют короткие участки гомологии, но только горячая точка содержит общие прямые повторы. Для объяснения участия I в НР в горячей точке предложена модель, учитывающая (5{|"}'-'3{|"})-экзонуклеазную активность I. Япония, Dep. of Molecular Biol., Inst. of Med. Sci., Univ. of Tokyo 108. Библ. 22
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
БЕЛОК
БЕЛОК НЕЗАКОННОЙ РЕКОМБИНАЦИИ RECJ
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.02-04Б2.214

Автор(ы) : Глазер В.М.
Заглавие : Генетическая рекомбинация без гомологии: процессы, ведущие к перестройкам в геноме
Источник статьи : Сорос. образ. ж. - 1998. - N 7. - С. 22-29
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЕТИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ТРАНСПОЗИЦИИ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ГЕНОМНЫЕ ПЕРЕСТРОЙКИ
МЕХАНИЗМЫ
ПРОКАРИОТЫ
ФАГИ
ЭУКАРИОТЫ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 4
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.12-04Б1.148

Автор(ы) : Mosig, Gisela, Colowick Nancy E., Pietz Bradley C.
Заглавие : Several new bacteriophage T4 genes, mapped by sequencing deletion endpoints between genes 56 (dCTPase) and dda (a DNA-dependent ATPase-helicase) modulate transcription
Источник статьи : Gene. - 1998. - Vol. 223, N 1-2. - С. 143-155
Аннотация: Изучена ДНК 13 независимых жизнеспособных мутантов фага Т4 с большими делециями, к-рые образовались в результате незаконной рекомбинации между короткими (4-15 п. н.) эктопич. повторами. Последовательность 5'-ГГГЦ встретилась в 3 повторах и еще рядом с 4 повторами. 5 ранее известных генов (69, soc, mrh, modA и dda) картированы относительно концевых точек делеций. Между ними обнаружены еще 9 дополнительных открытых рамок считывания (ОРС). Одна из ОРС похожа на ген mrh (модуляция rpoH), в вторая на ген modA (АДФ-рибозилтрансфераза, модулирующая 'альфа'-субъединицу РНК-полимеразы). Показано, что клеточный 'сигма'-фактор теплового шока 'сигма'{32} фосфорилирован и что эта модификация модулируется белком Mrh. ОРС dda.9 с 3'-стороны от гена mrh, имеющая частичную гомологию с C-концевым мотивом 'сигма'{32}, названа srh. ОРС dda.2, расположенная между modA и dda и гомологичная 'сигма'{70}, названа srd. Высказано предположение, что белки Srh и Srd действуют как приманки для 'сигма'{32} и 'сигма'{70} соотв. Экспрессия нескольких ОРС токсична для Escherichia coli. Из гена 69 и из modA могут быть сконструированы только мутантные клоны. Клоны, несущие ОРС dda.2 (srd), растут очень медленно и образуют филаменты. Клоны, содержащие mrh и srh, проявляет менее сильную филаментацию. США, Dep. Mol. Biol., Vanderbilt Univ., Nashville, TN 37235. Библ. 39
ГРНТИ : 34.25.21
Предметные рубрики: ДЕЛЕЦИИ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ГЕНЫ
69
SOC
MRH
MODA
DDA
КАРТИРОВАНИЕ
ВЛИЯНИЕ НА
ТРАНСКРИПЦИЯ
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ Т4
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.08-04Б2.314

Автор(ы) : Ouchane S., Picaud M., Vernotte C., Astier C.
Заглавие : Photooxidative stress stimulates illegitimate recombination and mutability in carotenoid-less mutants of Rubrivivax gelatinosus
Источник статьи : 9th Int. Symp. Phototroph. Prokaryotes, Vienna, Sept. 6-12, 1997. - [Vienna], 1997. - С. 151
Аннотация: В условиях фотоокислительного стресса мутант crtB Rubrivivax gelatinosus, лишенный каротеноидов, с высокой частотой (10{-3}) дает 4 класса спонтанных мутантов: 1) с частичным восстановлением биосинтеза каротеноидов; 2) с понижением количества комплексов LHI; 3) с дефектом по фотосинтезу; 4) с ингибированием синтеза фотосинтетического аппарата только в условиях анаэробиоза. Молекулярный анализ показал, что в отсутствие защитного действия каротеноидов фотоокислительные повреждения индуцируют мутации и незаконную рекомбинацию, порождающую функциональные или нефункциональные гены. Франция, CGM, CNRS, 91191 Gif-sur-Yvette. Библ. 3
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ФОТООКИСЛИТЕЛЬНЫЙ СТРЕСС
ВЛИЯНИЕ НА
МУТАЦИИ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ИДУКЦИЯ
МУТАНТЫ ПО КАРОТЕНОИДАМ
RUBRIVIVAX GELATINOSUS (BACT.)
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.346

Автор(ы) : Cormack Brendan P., Falkow, Stanley
Заглавие : Efficient homologous and illegitimate recombination in the opportunistic yeast pathogen Candida glabrata
Источник статьи : Genetics. - USA, 1999. - Vol. 151, N 3. - С. 979-987
Аннотация: Сконструированы ауксотрофные мутанты клинического изолята Candida glabrata с дефектами хромосомных генов ura3 или his3. Линеаризированные плазмиды с геном URA3 Saccharomyces cerevisiae эффективно трансформируют мутант ura3 к прототрофности. Если эти плазмиды содержат короткие концевые области гомологии с хромосомой C. glabrata, наблюдается гомологическая рекомбинация. В отсутствие гомологии с хромосомой плазмиды интегрируются по механизму незаконной рекомбинации в случайные сайты генома. Секвенирование показало, что у большинства незаконных рекомбинантов отсутствует микрогомология в сайтах интеграции. Около 0,25% вставок приводит к ауксотрофности по аминокислотам. Секвенирование позволило предположить, что незаконная рекомбинация является неслучайной на уровне одного гена и что интегрирующаяся плазмида предпочитает встраиваться в некодирующие области генома. Сравнение числа событий гомологической и незаконной рекомбинации показало, что C. glabrata имеет эффективные системы как гомологической, так и незаконной рекомбинации. США, Dep. Microbiol. and Immunol., Stanford Univ. Sch. Med., Stanford, CA 94305-5402. Библ. 23
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
ВСТРАИВАЕМЫЕ ГЕНЫ
ГОМОЛОГИЯ
ФУНКЦИЯ
CANDIDA GLABRATA (FUNGI)
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 01.12-04В2.399

Автор(ы) : Cormack Brendan P., Falkow, Stanley
Заглавие : Efficient homologous and illegitimate recombination in the opportunistic yeast pathogen Candida glabrata
Источник статьи : Genetics. - USA, 1999. - Vol. 151, N 3. - С. 979-987
Аннотация: Сконструированы ауксотрофные мутанты клинического изолята Candida glabrata с дефектами хромосомных генов ura3 или his3. Линеаризированные плазмиды с геном URA3 Saccharomyces cerevisiae эффективно трансформируют мутант ura3 к прототрофности. Если эти плазмиды содержат короткие концевые области гомологии с хромосомой C. glabrata, наблюдается гомологическая рекомбинация. В отсутствие гомологии с хромосомой плазмиды интегрируются по механизму незаконной рекомбинации в случайные сайты генома. Секвенирование показало, что у большинства незаконных рекомбинантов отсутствует микрогомология в сайтах интеграции. Около 0,25% вставок приводит к ауксотрофности по аминокислотам. Секвенирование позволило предположить, что незаконная рекомбинация является неслучайной на уровне одного гена и что интегрирующаяся плазмида предпочитает встраиваться в некодирующие области генома. Сравнение числа событий гомологической и незаконной рекомбинации показало, что C. glabrata имеет эффективные системы как гомологической, так и незаконной рекомбинации. США, Dep. Microbiol. and Immunol., Stanford Univ. Sch. Med., Stanford, CA 94305-5402. Библ. 23
ГРНТИ : 34.29.15
Предметные рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ
ВСТРАИВАЕМЫЕ ГЕНЫ
ГОМОЛОГИЯ
ФУНКЦИЯ
CANDIDA GLABRATA (FUNGI)
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.06-04Б1.151

Автор(ы) : Juhala Robert J., Ford Michael E., Duda Robert L., Youlton, Anthony, Hatfull Graham F., Hendrix Roger W.
Заглавие : Genomic sequences of bacteriophages HK97 and HK022: Pervasive genetic mosaicism in the lambdoid bacteriophages
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 2000. - Vol. 299, N 1. - С. 27-51
Аннотация: Определены полные последовательности геномных днДНК фагов HK97 (39 732 п. н.) и HK022 (40 751 п. н.) Escherichia coli - членов лямбдоидной группы фагов. Сравнение этих последовательностей друг с другом и с фагами 'лямбда' E. coli и P22 Salmonella typhimurium подтвердило, что эти фаги являются генетич. мозаиками, у к-рых мозаичные сегменты разделены резкими переходами в последовательности. Это доказало, что главным компонентом эволюции лямбдоидных фагов является горизонтальный перенос генетич. материала. Предложена модель эволюции, в к-рой генетич. разнообразие порождается сочетанием незаконной и гомологич. рекомбинации и мутационного сдвига, а селекция по ф-циям порождает популяцию, в к-рой большинство выживающих мозаичных границ расположено на границах генов и иногда на границах белковых доменов в генах. Сравнительный анализ позволил приписать ф-ции генам и др. генетич. элементам. Приведены примеры генов общей рекомбинации фагов HK97, HK022 и P22 и предполагаемого белка-адаптора головки и хвостового отростка фагов HK97 и HK022. Сравнительный анализ позволил идентифицировать новый класс элементов - "мороны", к-рые состоят из кодирующей белок области, фланкированной промоторами типа 'сигма'{70} и не зависящим от факторов терминатором транскрипции. Все мороны расположены между 2 генами, к-рые являются смежными у других фагов. Мороны, вероятно, являются автономными генетич. модулями, к-рые экспрессируются из внутриклеточных профагов. Сравнение последовательностей моронов позволило предположить, что они сравнительно недавно вошли в фаговые геномы по механизму горизонтального переноса. США, Dep. Biol. Studies, Univ. Pittsburgh, Pittsburgh, PA 15260. Библ. 66
ГРНТИ : 34.25.21
Предметные рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ЛЯМБДОИДНЫЙ ФАГ HK97
ЛЯМБДОИДНЫЙ ФАГ HK022
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ МАЗАИЦИЗМ
ЭВОЛЮЦИЯ
ФАГ ЛЯМБДА
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ГОРИЗОНТАЛЬНЫЙ ПЕРЕНОС ГЕНОВ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.167

Автор(ы) : Sekizaki, Tsutomu, Otani, Yoshiko, Osaki, Makoto, Takamatsu, Daisuke, Shimoji, Yoshihiro
Заглавие : Evidence for horizontal tranfer of SsuDAT1I restriction-modification genes to the Streptococcus suis genome
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 2. - С. 500-511
Аннотация: Штаммы Streptococcus suis серотипов 1 и 2, выделенные от свиней, различаются наличием системы рестрикции-модификации (РМС), изошизомера РМС DpnII S. pneumoniae, узнающей сайт 5{'}-GATC-3{'}. Секвенирование генов, кодирующих РМС S. suis DATI, названную SsuDAT1I, показало, что в эту систему входят гены 2 метилтрансфераз, ssuMA и ssuMB, как и в РМС DpnII. Аминокислотные последовательности (ПС) M.SsuMA и M.SsuMB на 70 и 90% идентичны ПС M.DpnII и M.DpnA соотв. Однако РМС SsuDAT1I содержит гены 2 рестриктаз - изошизомеров, ssuRA и ssuRB. Аминокислотные ПС R.SsuRA и R.SsuRB на 49 и 72% идентичны ПС R. Dpn1I и R.LlaDCHI Lactococcus lactis subsp. cremoris DCH-4 соотв. Гены SsuDAT1I перекрываются и окружены генами биосинтеза пуринов: purF-purM-purN-purH-ssuMA-ssuMB-ssuRA-ssuRB-purD-purE. GC-состав в области генов SsuDAT1I (34,1%) ниже, чем в области генов pur (48,9%), что указывает на горизонтальный перенос генов системы SsuDAT1I. Во фланкирующих ПС не найдены длинные концевые повторы или транспозоны. Сравнение ПС генов ssuDAT показало, что только ПС от 53 п. н. выше гена ssuMA до 5 п. н. ниже ssuRB встроилась между генами purH и purD, причем сайт инсерции не является сайтом узнавания SsuDAT1I. Предполагается, что система SsuDAT1I могла интегрироваться в хромосому S. suis посредством незаконной рекомбинации. Япония, Lab. Molec. Bacteriol., Nat. Inst. Animal Hlth, 3-1-1 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-0856. Библ. 60
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
СИСТЕМА SSUDAT1I
ГЕНЫ
ГОРИЗОНТАЛЬНЫЙ ПЕРЕНОС
STREPTOCOCCUS SUIS (BACT.)
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.233

Автор(ы) : Hanada, Katsuhiro, Iwasaki, Mihoko, Ihashi, Sonoe, Ikeda, Hideo
Заглавие : UvrA and UvrB suppress illegitimate recombination: Synergistic action with RecQ helicase
Источник статьи : Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2000. - Vol. 97, N 11. - С. 5989-5994
Аннотация: Показано, что УФ-индуцированная незаконная рекомбинация (НР) у Escherichia coli усиливается мутациями в генах нуклеотидной эксцизионной репарации uvrA и uvrB и в меньшей степени uvrC, но не мутацией uvrD. Двойная мутация uvrA и uvrB, но двойная мутация uvrB uvrC, повышает частоту НР даже в отсутствие УФ-облучения. Это позволило предположить, что НР подавляется белками UvrA (I) и UvrB (II). НР синергично усиливается двойной мутацией recQ uvrA. Гиперпродукция I устраняет фенотип НР у мутантов recQ и uvrB, но не влияет на УФ-чувствительность мутанта uvrB. Эти данные позволили предположить, что комплекс I-II подавляет НР по пути, в к-ром участвует геликаза RecQ. Один I может устранять НР по этому пути. Обсуждаются возможные ф-ции белков, участвующих в этих путях НР. Япония, Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo, Tokyo 108-8639. Библ. 25
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
БЕЛОК
БЕЛКИ ЭКСЦИЗИОННОЙ РЕПАРАЦИИ UVRAB
ФУНКЦИЯ
ФЕРМЕНТЫ
ГЕЛИКАЗА RECQ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

16.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI08) 07.06-04Я6.107

Автор(ы) : Уманская О.Н., Юдинкова Е.С., Разин С.В., Быстрицкий А.А.
Заглавие : Ингибирование ДНК-топоизомеразы II в живых клетках стимулирует процесс незаконной рекомбинации
Источник статьи : Докл. РАН. - 2005. - Т. 405, N 3. - С. 419-421
Аннотация: Разработана и апробирована тест-система, позволяющая отследить рекомбинационные события, а также определить их частоту. С помощью такой системы изучалось влияние ингибитора ДНК-топоизомеразы II тенипозида на незаконную рекомбинацию. При индукции незаконной рекомбинации топоизомеразой II в минимальной in vitro системе рекомбинационных событий обнаружено не было. В живых клетках ингибирование топоизомеразы II тенипозидом значительно увеличивало частоту незаконной рекомбинации. Эти данные интерпретированы как свидетельство того, что основная часть всех перестроек под действием ингибиторов топоизомеразы II в живых клетках происходит по "индукционному" механизму, согласно которому топоизомераза II только вносит двухцепочечные разрывы в ДНК, в то время как их репарация происходит под действием других клеточных систем. Россия, Ин-т биол. гена РАН, Москва. Библ. 8
ГРНТИ : 34.19.19
Предметные рубрики: ДНК-ТОПОИЗОМЕРАЗА II
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ЖИВЫЕ КЛЕТКИ
ТЕСТ-СИСТЕМА
Дата ввода:

17.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 11.04-04А4.11

Автор(ы) : Nagasawa, Hatsumi, Brogan John R., Peng, Yuanlin, Little John B., Bedford Joel S.
Заглавие : Some unsolved problems and unresolved issues in radiation cytogenetics. A review and new data on roles of homologous recombination and non-homologous end joining
Источник статьи : Mutat. Res. Genet. Toxicol. and Environ. Mutagen. - 2010. - Vol. 701, N 1. - С. 12-22
Аннотация: В историческом аспекте рассмотрены следующие вопросы: 1) повреждения и процессы, влияющие на появление хроматидных и(или) хромосомных аберраций после облучения; 2) процесс воссоединения двунитевых разрывов ДНК и воссоединение разрывов либо образование обменов; 3) роль процесса гомологичной рекомбинационной репарации в защите клеток от индукции аберраций хроматидного типа при облучении в поздней S/G2 фазе; 4) роль структуры интерфазного хроматина в организации ядра и индукции аберраций; 5) реакция клеток на индукцию аберраций в зависимости от типа ткани, к которой они принадлежат; 6) подходы к определению "скрытых" аберраций
ГРНТИ : 34.49.19
Предметные рубрики: АБЕРРАЦИИ ХРОМОСОМ
МЕХАНИЗМ ОБРАЗОВАНИЯ
ДНК
РЕПАРАЦИЯ
ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ОБЗОРЫ
Дата ввода:

18.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.02-04Б2.310

Автор(ы) : Yi, Tau-Mu, Tearns, Duncan, Demple, Bruce
Заглавие : Illegitimate recombination in an Escherichia coli plasmid: modulation by DNA damage and a new bacterial gene
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 7. - С. 2898-2903
Аннотация: Исследовали перестройки в ДНК E. coli, используя плазмиду с "молчащим" геном tet. Отбирали Tet{r}-мутанты. Наиболее частым изменением, приводящим к восстановлению Tet{r}-фенотипа, была делеция в 1,3 т. н. п. между 2 сайтами с частичной гомологией (14 из 19 н. п. идентичны). Такие делеции возникали с одинаковой частотой в штамме recA+ и мутанте recA13. При действии ультрафиолета частота появления Tet{r}-мутантов возрастала в 50 раз. Делеция в области xth - pnc (1,3 т. н. п.) в хромосоме значительно увеличивала частоту появлениTet{r}-Кл. Это увеличение исчезало при введении в Кл эписомы, содержащей xth - pnc, но не изменялось при клонировании гена xth. Эти результаты позволяют судить о значении разных изменений ДНК для "незаконной" рекомбинации и идентифицировать участок хромосомы E. coli, содержащий гены, продукты которых супрессируют незаконные делеции. Ил. 3. Табл. 3. Библ. 35. США, Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Harvard Univ., Cambridge, MA 02138.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ДНК ПОВРЕЖДЕНИЯ
ОБЛАСТЬ XTH - PNC
ВЛИЯНИЕ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ПЛАЗМИДНЫЙ МОЛЧАЩИЙ ГЕН TET
БЕСПРОМОТОРНЫЙ ГЕН
Дата ввода:

19.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.05-04Б2.449

Автор(ы) : Bien M., Steffen H., Schulte-Frohlinde D.
Заглавие : Repair of the plasmid pBR322 damaged by 'гамма'-irradiation or by restriction endonucleases using different recombination-proficient E. coli strains
Источник статьи : Mutat. Res. DNA Repair Repts. - 1988. - Vol. 194, N 3. - С. 193-205
Аннотация: ДНК плазмиды pBR322 обрабатывали рестриктазами BamHI, PvuII или 'гамма'-облучением для образования двунитевых разрывов со структурно различающимися концами и проводили сравнение данных об эффективности трансформирующей способности, частоте образования мутаций и клонального анализа в случае ферментативно и радиолитически поврежденных ДНК. Выявлено, что в рекомбинационно-дефектном (recBO} шт. E. coli K-12 SFX выход трансформантов при использовании препаратов ДНК, обработанных BamHI, PvuII либо 'гамма'-лучами составлял соотв. 4,3%, 0,14% и 0,1%. Выживаемость открытых кольцевых форм ДНК при облучении в дозе 30 Gy составляла 1,3%. Эффективность трансформации лишь слабо заисела от SOS-индукции и белка RecA. Частота мутаций по признаку чувствительности к тетрациклину (tet{s}) в расчете на выжившую плазмиду составляла 2,6%, 11,8% и 0,2% в случае обработки BamHI, PvuII или 'гамма'-лучами в дозе 30 Gy соответственно. Отмечено, что во всем исследованном диапазоне доз (от 1 до 30 Gy) облучение слабо индуцировало мутации. При этом лишь 15% мутантов tet{s}, образованных 'гамма'-облученными плазмидами содержало делеции, тогда как процент делеций в случае испытания на частоту мутагенеза ДНК, обработанной BamHI или PvuII составлял 30-50 и 90% соотв. Во всех случаях делеции имели протяженность 500-1700 п. н. При SOS-индукции частота мутагенеза 'гамма'-облученной плазмиды увеличивалась в 4 раза, а обработанной рестриктазами не изменялась. Предполагается, что репарация ферментативно линеаризованной ДНК осуществляется с помощью двух рекомбинационных путей, а репарация облученной ДНК связана с механизмом эксцизии повреждений. Библ. 46. ФРГ, Max-Planck-Institut fur Strahlenchemie, Stifstr. 34-36, D4300 Mulheim a. d. Ruhr.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММЫ СПОСОБНЫЕ К РЕКОМБИНАЦИИ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ДНК ПЛАЗМИДНАЯ
ДНК ЛИАНОРИЗОВАННАЯ
УФ-ОБЛУЧЕННАЯ ДНК
ДНК ПОВРЕЖДЕНИЯ
ДВУНИТЕВЫЕ РАЗРЫВЫ
ФЕРМЕНТЫ РЕСТРИКЦИИ
РЕПАРАЦИЯ
МЕХАНИЗМЫ
Дата ввода:

20.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.06-04Б2.269

Автор(ы) : Bashkirov V.I.
Заглавие : Illegitimate recombination and amplification in Bacillus subtilis
Источник статьи : Biol. Zbl. - 1988. - Vol. 107, N 6. - С. 682-684
Аннотация: Исследована интеграция плазмиды pGG20, являющейся гибридом pE194 и pBR322, в хромосому Bacillus subtilis. Секвенирование ДНК в сайтах рекомбинации выявило присутствие гомологичной последовательности из 8 п. н. в pBR322 и участке хромосомы клона b2, в к-рых произошла встройка pGG20. В случае 2 других клонов, b1 и b5, в к-рых гибридная плазмида встроилась по сайтам, локализованным в pE194, не обнаружено гомологии между этими сайтами и хромосомой. Показано также, что pGG20 и pE194 могут не только интегрировать в хромосому, но и не родственную плазмиду pUB110 с помощью recE-независимого процесса, приводящего к образованию коинтегратов. Секвенирование ДНК в области стыка рекомбинирующих молекул выявило, что рекомбинация происходит в пределах коротких (9-15 п. н.) участков гомологии, присутствующих у взаимодействующих плазмид. Однако в случае коинтеграта, обозначенного t542, рекомбинация произошла между негомологичными сайтами. Предполагается, что в подобный процесс незаконной рекомбинации вовлечена пока неидентифицированная рекомбиназа B. subtilis. По отбору клонов с повышенной устойчивостью к хлорамфениколу исследована возможность амплификации последовательностей, интегрировавших хромосому через иную гибридную плазмиду, rep-ts, образованную путем рекомбинации между pE194 и pC194. Обнаружены 2 амплифицированные структуры. Одна из них амплифицирована в сайтах стыка одиночной копии плазмиды с хромосомой, а другая - в сайтах, локализованных внутри плазмиды и соответствующего участка хромосомы. Предполагается, что в амплификацию 2-ого типа вовлечены инвертированные повторы. Библ. 36. СССР, Ин-т общей генетики им. Н. И. Вавилова АН СССР, Москва В-333.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ПЛАЗМИДА PGG20
ИНТЕГРАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ХРОМОСОМА
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
АМПЛИФИКАЦИЯ
ИНТЕГРИРОВАННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
Дата ввода:

1-20 21-26

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска