Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткий полный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ<.>)
Общее количество найденных документов : 171
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
1.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 96.07-04Т1.51

Автор(ы) : Dalpiaz, Alessandro, Bertolasi, Valerio, Borea, Pier Andrea, Nacci, Vito, Fiorini, Isabella, Campiani, Giuseppe, Mennini, Tiziana, Manzoni, Cristina, Novellino, Ettore, Greco, Giovanni
Заглавие : A concerted study using binding measurements, X-ray structural data, and molecular modeling on the stereochemical features responsible for the affinity of 6-arylpyrrolo[2,1-d][1,5]benzothiazepines toward mitochondrial benzodiazepine receptors
Источник статьи : J. Med. Chem. - 1995. - Vol. 38, N 23. - С. 4730-4738
Аннотация: Методом радиолигандного анализа с использованием лиганда бензодиазепиновых рецепторов (БДР) в опытах на мембранах митохондрий коры мозга мышей показано, что величина K[i] новых бензодиазепиновых производных составляла 9-10{4} нМ. Наименьшим сродством к БДР характеризовались соединения, содержащие ароилокси-группу. На основании данных по связыванию, рентгеноструктурного анализа и молекулярного моделирования обсуждены требования к структуре высокоаффинных лигандов периферических БДР. Италия, Univ. di Ferrara, 44100 Ferrara. Библ. 56
ГРНТИ : 34.45.05
Предметные рубрики: БЕНЗОДИАЗЕПИНОВЫЕ РЕЦЕПТОРЫ
ПЕРИФЕРИЧЕСКИЕ
ВЫСОКОЭФФИННЫЕ ЛИГАНДЫ
БЕНЗОТИАЗЕПИНЫ
ПРОИЗВОДНЫЕ
СТРУКТУРА - СРОДСТВО
РЕНТГЕНОСТРУКТУРНЫЙ АНАЛИЗ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
Дата ввода:
2.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 93.07-04Т2.164

Автор(ы) : van Drooge Marc J., Donne-op den Kelder Gabrielle M., ter Laak Anton M., Timmerman, Hendrik
Заглавие : A molecular modeling study on the histamine H[1] antagonist binding site : [Pap.] Symp. Enzyme Inhibit. and Drug Discovery, Antwerp, 6 Nov., 1992
Источник статьи : Pharm. weekbl. Sci. Ed. - 1992. - Vol. 14, N 6 Suppl. 1. - С. 12
Аннотация: Путем молекулярного моделирования проведен анализ активных конформаций блокаторов H[1]-гистаминорецепторов ципрогептадина (I), фениндамина и трипролидина. Установлено, что пиперидиленовое кольцо (ПК) I характеризовалось достаточной гибкостью. Вторичные энергетич. минимумы I с конформацией ПК в виде "кресла" или с конформациями ПК в виде "лодки" менее чем на 5 ккал/моль превышали основной энергетич. минимум I с конформацией ПК в виде "кресла". Предполагается, что в связанном с H[1]-рецептором состоянии ПК I имеет конформацию "лодки". Нидерланды, Dep. of Pharmacochemistry, Fac. of Chemistry, Vrije Univ. 1081HV Amsterdam.
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: ГИСТАМИНОРЕЦЕПТОРЫ* H1-
БЛОКАТОРЫ
ЦЕНТР СВЯЗЫВАНИЯ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
ЦИПРОГЕПТАДИН
ФЕНИНДАМИН
Дата ввода:
3.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 01.03-04Т2.323

Автор(ы) : Abad-Zapatero C., Stewart K.
Заглавие : The role of protein crystallography and molecular modelling in targeted antifungal drug design : Pap. 5th Congr. Eur. Confed. Med. Mycol. and 33.Tag. Dtschsprach. Mykol. Ges., Dresden, June 3-6, 1999
Источник статьи : Mycoses. - 1999. - Vol. 42, N 3. - С. 125
Аннотация: Обсуждаются возможности макромолекулярной кристаллографии и молекулярного моделирования в поиске новых противогрибковых средств (ПГС). Этот подход основан на структурном анализе комплексов мишеневого фермента микроорганизма с различными ингибиторами его активности. В качестве мишеневого фермента выбрана секретирующаяся возбудителем кандидоза аспартил протеиназа (САП), являющаяся фактором вирулентности этого возбудителя. Установлена трехмерная структура двух вариантов САП2 в комплексе с сильным ингибитором (K[i]=0,17 нм) этого фермента. Предложен метод конструирования новых ПГС на этой основе. США, Lab. Protein Crystallography, Abbott Labs., Abbott Park, Illinois
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: ПРОТИВОГРИБКОВЫЕ СРЕДСТВА
КОНСТРУИРОВАНИЕ
КРИСТАЛЛОГРАФИЯ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
Дата ввода:
4.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 01.03-04Б4.231

Автор(ы) : Abad-Zapatero C., Stewart K.
Заглавие : The role of protein crystallography and molecular modelling in targeted antifungal drug design : Pap. 5th Congr. Eur. Confed. Med. Mycol. and 33.Tag. Dtschsprach. Mykol. Ges., Dresden, June 3-6, 1999
Источник статьи : Mycoses. - 1999. - Vol. 42, N 3. - С. 125
Аннотация: Обсуждаются возможности макромолекулярной кристаллографии и молекулярного моделирования в поиске новых противогрибковых средств (ПГС). Этот подход основан на структурном анализе комплексов мишеневого фермента микроорганизма с различными ингибиторами его активности. В качестве мишеневого фермента выбрана секретирующаяся возбудителем кандидоза аспартил протеиназа (САП), являющаяся фактором вирулентности этого возбудителя. Установлена трехмерная структура двух вариантов САП2 в комплексе с сильным ингибитором (K[i]=0,17 нм) этого фермента. Предложен метод конструирования новых ПГС на этой основе. США, Lab. Protein Crystallography, Abbott Labs., Abbott Park, Illinois
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: ПРОТИВОГРИБКОВЫЕ СРЕДСТВА
КОНСТРУИРОВАНИЕ
КРИСТАЛЛОГРАФИЯ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
Дата ввода:
5.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 04.02-04А1.155

Автор(ы) : Rampa, Angela, Bisi, Alessandra, Belluti, Federica, Gobbi, Silvia, Valenti, Piero, Andrisano, Vincenza, Cavrini, Vanni, Cavalli, Andrea, Recanatini, Maurizio
Заглавие : Acetylcholinesterase inhibitors for potential use in Alzheimer's disease: Molecular modeling, synthesis and kinetic evaluation of 11H-indeno-[1,2-b]-quinolin-10-ylamine derivatives
Источник статьи : Bioorg. and Med. Chem. - 2000. - Vol. 8, N 3. - С. 497-506
Аннотация: В рамках программы изучения тетрациклических аналогов такрина проведен синтез ингибиторов АХЭ 11Н-индено-[1,2-b]-хинолин-10-иламиновой структуры, к-рому предшествовало молекулярное моделирование связывания соединений с активным центром фермента. Показано, что инденохинолиновое ядро является максимально возможной по молекулярному размеру структурой, допускающей взаимодействие с АХЭ. Включение атома F в положение 2 структуры повышало ингибиторную избирательность в отношении АХЭ по сравнению с бутирил-ХЭ. Обсуждена возможность использования синтезированных соединений для разработки средств фармакотерапии б-ни Альцгеймера. Италия, Univ. of Bologna, I-40126 Bologna. Библ. 27
ГРНТИ : 34.03.27
Предметные рубрики: ТАКРИНА АНАЛОГИ
АНТИХОЛИНЭСТЕРАЗНАЯ АКТИВНОСТЬ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
АЛЬЦГЕЙМЕРА БОЛЕЗНЬ
Дата ввода:
6.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 04.01-04Т1.171

Автор(ы) : Rampa, Angela, Bisi, Alessandra, Belluti, Federica, Gobbi, Silvia, Valenti, Piero, Andrisano, Vincenza, Cavrini, Vanni, Cavalli, Andrea, Recanatini, Maurizio
Заглавие : Acetylcholinesterase inhibitors for potential use in Alzheimer's disease: Molecular modeling, synthesis and kinetic evaluation of 11H-indeno-[1,2-b]-quinolin-10-ylamine derivatives
Источник статьи : Bioorg. and Med. Chem. - 2000. - Vol. 8, N 3. - С. 497-506
Аннотация: В рамках программы изучения тетрациклических аналогов такрина проведен синтез ингибиторов АХЭ 11Н-индено-[1,2-b]-хинолин-10-иламиновой структуры, к-рому предшествовало молекулярное моделирование связывания соединений с активным центром фермента. Показано, что инденохинолиновое ядро является максимально возможной по молекулярному размеру структурой, допускающей взаимодействие с АХЭ. Включение атома F в положение 2 структуры повышало ингибиторную избирательность в отношении АХЭ по сравнению с бутирил-ХЭ. Обсуждена возможность использования синтезированных соединений для разработки средств фармакотерапии б-ни Альцгеймера. Италия, Univ. of Bologna, I-40126 Bologna. Библ. 27
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: ТАКРИНА АНАЛОГИ
АНТИХОЛИНЭСТЕРАЗНАЯ АКТИВНОСТЬ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
АЛЬЦГЕЙМЕРА БОЛЕЗНЬ
Дата ввода:
7.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 04.06-04Т1.91

Автор(ы) : Adikwu Michael U., Holtje, Hans-Dieter
Заглавие : Mechanistic appraisal of the charge-transfer complexes of promethazine with chloranil: A modelling approach
Источник статьи : Chem. and Pharm. Bull. - 2001. - Vol. 49, N 6. - С. 669-674
Аннотация: Методами молекулярного моделирования и с использованием расчета молекулярных орбиталей сделано заключение, что протонированная N-метильная группа прометазина играет основную роль в образовании его комплекса с п-хлоранилом. Германия, Heinrich Heine Univ., 40225 Dusseldorf. Библ. 17
ГРНТИ : 34.45.15
Предметные рубрики: ПРОМЕТАЗИН
ХЛОРАНИД
КОМПЛЕКСЫ
ПЕРЕНОС ЗАРЯДОВ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
Дата ввода:
8.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 97.06-04Т2.186

Автор(ы) : Ahmed, Sabbir
Заглавие : Molecular modelling of 5'альфа'-reductase inhibitors : [Abstr] Brit. Pharm. Conf.: Sci. Proc. 132 Meet., Warwick, Sept. 15-18, 1995
Источник статьи : J. Pharm. and Pharmacol. - 1995. - Vol. 47, N 12B. - С. 1106
Аннотация: Проведен компьютерный анализ связи структура-активность среди потенциальных ингибиторов 5'альфа'-редуктазы. Существенным для проявления активности является взаимодействие ингибиторов с кольцами A или D молекулы тестостерона. В структуре ингибиторов стероидной природы функционально важной является C(3) C-0 группа. В экспериментах in vitro изучали активность новых соединений, полученных на основе теоретического анализа. Испытанные препараты характеризовались высокой ингибиторной активностью в отношении 5'альфа'-редуктазы (IC[50]=100 мМ). Великобритания, Dep. of Pharmacy, Univ. of Brighton, Cockcroft Building, Lewes Road, Brighton BN2 4GJ. Библ. 2
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: ФЕРМЕНТОВ ИНГИБИТОРЫ
РЕДУКТАЗЫ 5'АЛЬФА'-ИНГИБИТОРЫ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
СТРУКТУРА-АКТИВНОСТЬ
ПРЕВРАЩЕНИЕ ТЕСТОСТЕРОНА
ЛЕЧЕНИЕ
ДИГИДРОТЕСТОСТЕРОН
ГИПЕРПЛАЗИЯ ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
Дата ввода:
9.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 76 (BI28) 97.07-04Н3.158

Автор(ы) : Ahmed, Sabbir
Заглавие : Molecular modelling of 5'альфа'-reductase inhibitors : [Abstr] Brit. Pharm. Conf.: Sci. Proc. 132 Meet., Warwick, Sept. 15-18, 1995
Источник статьи : J. Pharm. and Pharmacol. - 1995. - Vol. 47, N 12B. - С. 1106
Аннотация: Проведен компьютерный анализ связи структура-активность среди потенциальных ингибиторов 5'альфа'-редуктазы. Существенным для проявления активности является взаимодействие ингибиторов с кольцами A или D молекулы тестостерона. В структуре ингибиторов стероидной природы функционально важной является C(3) C-0 группа. В экспериментах in vitro изучали активность новых соединений, полученных на основе теоретического анализа. Испытанные препараты характеризовались высокой ингибиторной активностью в отношении 5'альфа'-редуктазы (IC[50]=100 мМ). Великобритания, Dep. of Pharmacy, Univ. of Brighton, Cockcroft Building, Lewes Road, Brighton BN2 4GJ. Библ. 2
ГРНТИ : 76.29.49
Предметные рубрики: ФЕРМЕНТОВ ИНГИБИТОРЫ
РЕДУКТАЗЫ 5'АЛЬФА'-ИНГИБИТОРЫ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
СТРУКТУРА-АКТИВНОСТЬ
ПРЕВРАЩЕНИЕ ТЕСТОСТЕРОНА
ЛЕЧЕНИЕ
ДИГИДРОТЕСТОСТЕРОН
ГИПЕРПЛАЗИЯ ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
Дата ввода:
10.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 04.03-04Т1.262

Автор(ы) : Yamakura, Tomohiro, Bertaccini, Edward, Trudell James R., Harris R.Adro
Заглавие : Anesthetics and ion channels: Molecular models and sites of action
Источник статьи : Annual Review of Pharmacology and Toxicology. - Palo Alto (Calif.), 2001. - Vol. 41. - С. 23-51
Аннотация: Обзор. Рассмотрены современные представления о сопряженных с рецепторами ионных каналах, управляемых лигандами. Приведены данные об использовании клонированных рецептор-управляемых ионных каналов для анализа молекулярных мех-мов их взаимодействия с общими анестетиками. В большинстве случаев мишенью действия анестетиков являются ионные каналы ГАМК[A]-рецепторов. Однако, эти каналы не являются универсальной мишенью и демонстрируют отсутствие чувствительности к газообразным анестетикам (N[2]O и Xe, фторированные спирты, кетамин). Особое внимание уделено роли 'альфа'[1]-субъединицы ГАМК[A]-рецептора как мишени воздействия анестетиков. США, Univ. of Texas, Austin, TX 78712. Библ. 158
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: СРЕДСТВА ДЛЯ НАРКОЗА
ИОННЫЕ КАНАЛЫ
РЕКОМБИНАНТНЫЕ РЕЦЕПТОРЫ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 158
Дата ввода:
11.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 92.11-04Т2.372

Автор(ы) : Soler Roca R.M., Sipan Sarrion M.C., Garcia Domenech R., Galvez Alvarez J.
Заглавие : Aplicacion del metodo de Conectividad Molecular al diseno de farmacos antiviricos
Источник статьи : An. Real acad. farm. - 1992. - Vol. 58, N 1. - С. 31-47
Аннотация: Обобщают результаты применения метода молекулярного моделирования для прогнозирования и интерпретации фармакол. и противомикробных св-в в ряду противовирусных соединений. Отмечено, что наилучшие результаты удалось получить в ряду структурно гомогенных групп. На основании проведенного анализа с применением компьютерных программ отобрано 3 производных ацикловира и азидотимидина, характеризующихся более высокой противовирусной активностью в сочетании с уменьшенной токсичностью. Испания, Univ. de Valencia. Библ. 13.
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: ПРОТИВОВИРУСНЫЕ СРЕДСТВА
ПОЛУЧЕНИЕ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
КОМПЬЮТЕРНОЕ КОНСТРУИРОВАНИЕ
Дата ввода:
12.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 92.06-04Т1.308

Автор(ы) : Aprison M.H., Lipkowitz K.B.
Заглавие : Molecular modeling of the weak glycine antagonist iso-THAO
Источник статьи : J. Neurosci. Res. - 1991. - Vol. 30, N 2. - С. 442-446
Аннотация: Соединение изо-ТГАО (5,6,7,8-тетрагидро-4Н-изоксазол [4,3-с] азепин-3-ол; I) сравнительно с глицином для определения структуры и распределения зарядов. Подтверждена гипотеза, что антагонист тормозных медиаторов, подобных глицину и ГАМК, имеет в молекуле по меньшей мере 3 участка связывания (УС) с рецептором, сходных с 3 УС в молекуле медиатора и его агонистов, и, кроме того, дополнит. УС. Библ. 16.
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: ГЛИЦИН
АНТАГОНИСТ
ТЕТРАГИДРО-4Н-ИЗОКСАЗОЛ[4,3 С]АЗЕПИН-ОЛ * 5,6,7,8-
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
Дата ввода:
13.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 93.01-04Т1.191

Автор(ы) : Aprison M.H., Lipkowitz K.B.
Заглавие : Muscimol and N,Ndimethylmuscimol: From a GABA agonist to a glycine antagonist
Источник статьи : J. Neurosci. Res. - 1992. - Vol. 31, N 1. - С. 166-174
Аннотация: При помощи методов мол. моделирования определяли мол. мех-м, к-рый может объяснить тот факт, что включение 2 метильных групп вместо 2 атомов водорода на концевом атоме азота молекулы мусцимола (I) привело не только к преобразованию эффективного агониста ГАМК-рецепторов (Рц) в соединение, неактивное по отношению к указанным Рц, но и способствовало превращению N,N-диметилмусцимола в антагонист глициновых Рц. США, Indiana Univ. Med. Center, Indianapolis, IN 46202. Библ. 14.
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: МУСЦИМОЛ
ДИМЕТИЛМУСЦИМОЛ* *N,N-
РЕЦЕПТОРЫ*ГАМК-
ГЛИЦИНОВЫЕ РЕЦЕПТОРЫ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
Дата ввода:
14.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 96.03-04Т1.251

Автор(ы) : Aprison M.H., Galvez-Ruano E., Lipkowitz K.B.
Заглавие : On a molecular comparison of strong and weak antagonists at the glycinergic receptor
Источник статьи : J. Neurosci. Res. - 1995. - Vol. 41, N 2. - С. 259-269
Аннотация: Using molecular modeling techniques, we studied nine glycine antagonists in order to try to identify the molecular descriptors that characterize strychnine as a strong antagonist and N,N-dimethyl-muscimol, iso-THIA, THIA, N-methyl-THIP, iso-THAZ, THAZ, iso-THPO, and iso-THAO. We confirm that all nine compounds have the three-atom regions (two negative and one positive) that we have postulated are necessary to permit such compounds to attach to the recognition site in the glycinergic synapse. In the case of antagonists we have postulated the presence of a fourth atom that can attach to the top of the chloride ion channel. Each of the nine antagonists has such a fourth negative atom and the latter property gives each of these compounds their antagonistic characteristic. Only in the case of strychnine is there evidence that at its positively charged end does the positive charge extend to cover a region that could bind through electrostatic domains to a tertiary carboxyl group in an amino acid like aspartate. The two negative atom sites in each antagonist are also in a position to participate in electrostatic binding through bidentate involvement with the positively charged guanidinium group of arginine. The latter amino acid also has been identified in the portion of the polypeptide chain at the glycine receptor. Our molecular data predict that after strychnine, the eight weak glycine antagonists listed above are in order of decreasing potency, i.e., N,N-dimethyl-muscimol is the best of the weak antagonists and iso-THAO should be the weakest. США, Inst. of Psychiatric Res., Indiana Univ. Med. Center, Indianapolis, IN 46202. Библ. 18
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: ГЛИЦИН
РЕЦЕПТОРЫ
СТРИХНИН
АНТАГОНИСТЫ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
Дата ввода:
15.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI52) 89.11-04Т6.394

Автор(ы) : Aprison M.H., Lipkowitz K.B.
Заглавие : On the GABA receptor: A molecular modeling approach
Источник статьи : J. Neurosci. Res. - 1989. - Vol. 23, N 2. - С. 129-135
Аннотация: С применением методов молекулярного моделирования изучали мех-м действия бикукуллина метобромида (I), оценивая сходство и различия между I, ГАМК и 4 агонистами ГАМК-мусцимолом (II), изогувацином, транс-3-аминоциклопентакарбоновой к-той и 4,5,6,7-тетрагидроизоксазол [5,4С]-пиридин-3-олом. Детально исследовали топологич. и электронно-плотностную конгруэнтность. Каждая из 5 молекул содержала по 3 атома, участвующих в связывании с ГАМК-рецептором. Предполагают, что дополнит. отрицательно заряженный атом на I является дополнит. точкой связывания, блокирующей расположенный рядом Clканал. Модель объясняет более сильное агонистич. действие II по сравнению с ГАМК, а также стереоспецифичность действия (+)-I. США, Inst. Psychiatric Res., Indiana Univ. Med. Center, Indianapolis, IN 46223. Библ. 35.
ГРНТИ : 34.45.25
Предметные рубрики: ГАМК
РЕЦЕПТОРЫ ГАМК-А
АГОНИСТЫ
АНТАГОНИСТ
БИКУКУЛЛИНА МЕТОБРОМИД
МУСЦИНОЛ
ИЗОГУВАЦИН
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
Дата ввода:
16.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI34) 97.08-04Т4.329

Автор(ы) : Barbosa Joao Alexandre R.G., Saldanha Jose W., Garratt Richard C.
Заглавие : Novel features of serine protease active sites and specificity pockets: Sequence analysis and modelling studies of glutamate-specific endopeptidases and epidermolytic toxins
Источник статьи : Protein Eng. - 1996. - Vol. 9, N 7. - С. 591-601
Аннотация: Для выявления структурных детерминант специфичности к глутамату в позиции P1 глутамат-специфичных эндопептидаз (ГСЭ) проведена модификация таких ферментов из Bac. licheniformis (ГСЭ-BL), Bac. subtilis (MPR) и Staphylococcus aureus (протеаза V8), а также стафилококковых эпидермолитических токсинов (ЭТ). Каноническая структура подцентра S1 содержит His213 и Thr190, предположительно взаимодействующие с глутаматом P1. Исследовано также значение Arg30 (в ГСЭ-BL и MPR) и N-конца (в ГСЭ-BL, MPR и V8). В случае MPR предсказано, что в мутанте G193C Cys193 образует новую S-S-связь, стабилизирующую оксианионную полость. Отсутствие или замена некоторых остатков вокруг Asp102 каталитической триады в протеазе V8 объясняет ее пониженную каталитическую активность. В ЭТ Lys216 вероятно важен для активности, подобной фосфолипазе C, т. к. модель предсказывает, что он стабилизирует отрицательный заряд фосфонильной группы. Бразилия, Inst. Fis., Univ. Sao Paulo, CP 369, Sao Carlos, SP, CEP 13560-970. Библ. 70
ГРНТИ : 34.47.21
Предметные рубрики: ЭНДОПЕПТИДАЗЫ
ГЛУТАМАТ-СПЕЦИФИЧНЫЕ
ЭПИДЕРМОЛИТИЧЕСКИЕ ТОКСИНЫ
АКТИВНЫЕ ЦЕНТРЫ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
BACILLUS LICHENIFORMIS
BACILLUS SUBTILIS
STAPHYLOCOCCUS AUREUS
Дата ввода:
17.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 97.10-04Б4.185

Автор(ы) : Barbosa Joao Alexandre R.G., Saldanha Jose W., Garratt Richard C.
Заглавие : Novel features of serine protease active sites and specificity pockets: Sequence analysis and modelling studies of glutamate-specific endopeptidases and epidermolytic toxins
Источник статьи : Protein Eng. - 1996. - Vol. 9, N 7. - С. 591-601
Аннотация: Для выявления структурных детерминант специфичности к глутамату в позиции P1 глутамат-специфичных эндопептидаз (ГСЭ) проведена модификация таких ферментов из Bac. licheniformis (ГСЭ-BL), Bac. subtilis (MPR) и Staphylococcus aureus (протеаза V8), а также стафилококковых эпидермолитических токсинов (ЭТ). Каноническая структура подцентра S1 содержит His213 и Thr190, предположительно взаимодействующие с глутаматом P1. Исследовано также значение Arg30 (в ГСЭ-BL и MPR) и N-конца (в ГСЭ-BL, MPR и V8). В случае MPR предсказано, что в мутанте G193C Cys193 образует новую S-S-связь, стабилизирующую оксианионную полость. Отсутствие или замена некоторых остатков вокруг Asp102 каталитической триады в протеазе V8 объясняет ее пониженную каталитическую активность. В ЭТ Lys216 вероятно важен для активности, подобной фосфолипазе C, т. к. модель предсказывает, что он стабилизирует отрицательный заряд фосфонильной группы. Бразилия, Inst. Fis., Univ. Sao Paulo, CP 369, Sao Carlos, SP, CEP 13560-970. Библ. 70
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: ЭНДОПЕПТИДАЗЫ
ГЛУТАМАТ-СПЕЦИФИЧНЫЕ
ЭПИДЕРМОЛИТИЧЕСКИЕ ТОКСИНЫ
АКТИВНЫЕ ЦЕНТРЫ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
BACILLUS LICHENIFORMIS
BACILLUS SUBTILIS
STAPHYLOCOCCUS AUREUS
Дата ввода:
18.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI24) 02.06-04М3.208

Автор(ы) : Bernard, Philippe, Guedin, Denis, Hibert, Marcel
Заглавие : Molecular modeling of the GABA/GABA[B] receptor complex
Источник статьи : J. Med. Chem. - 2001. - Vol. 44, N 1. - С. 27-35
Аннотация: Трехмерная модель внеклеточного домена ГАМК[B]-рецептора создана по гомологии с лейцин/изолейцин/валинсвязывающим белком. Описали полный предполагаемый сайт связывания в открытой и закрытой формах. Исследовали динамику механизма "венериной мухоловки"; по-видимому, молекулярные дипольные моменты играют ключевую роль при связывании ГАМК и активации рецептора. Выяснены аминокислоты, существенные для связывания лиганда или для динамики рецептора; обсуждают аминокислоты-мишени по данным мутагенеза и проверки обоснованности модели. Франция, UMR CNRS/ULP 7081, Tllkirch-Graffenstaden. Библ. 42
ГРНТИ : 34.39.17
Предметные рубрики: ГАМК[B]-РЕЦЕПТОР
ГАМК
СВЯЗЫВАНИЕ
КОМПЛЕКСЫ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
Дата ввода:
19.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 96.11-04Т1.22

Автор(ы) : Bohacek Regine S., McMartin, Colin, Guida Wayne C.
Заглавие : The art and practice of structure-based drug design: A molecular modeling perspective
Источник статьи : Med. Res. Rev. - 1996. - Vol. 16, N 1. - С. 3-50
Аннотация: Обзор. Рассмотрена в общем виде современная схема поиска и конструирования лекарственных в-в, включающая идентификацию биомишени, разработку представлений о структуре взаимодействующих с биомишенью в-в, синтез и отбор возможных кандидатов и отбор предлагаемого лекарственного средства. На современном этапе особую роль приобретает компьютерное моделирование структуры лекарственных средств. Приведены примеры применения данного подхода к разработке аналогов циклоспорина, ингибиторов ангиотензин-конвертирующего фермента, ингибиторов тимидилатсинтазы и др. соединений. США, Ciba-Geigy Corporation, Summit, NJ 07901. Библ. 22
ГРНТИ : 34.45.05
Предметные рубрики: ЛЕКАРСТВЕННЫЕ СРЕДСТВА
РАЗРАБОТКА
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 22
Дата ввода:
20.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.06-04Б1.176

Автор(ы) : Boulanger, Yvan, Senecal, Louis, Sauve, Gilles
Заглавие : Solution structure of the HIV protease inhibitor acetyl-pepstatin as determined by NMR and molecular modeling
Источник статьи : J. Biomol. Struct. and Dyn. - 1997. - Vol. 14, N 4. - С. 421-428
ГРНТИ : 34.25.19
Предметные рубрики: ПЕПТИДЫ
АЦЕТИЛПЕПСТАТИН
ПЕНТАПЕПТИД
ИНГИБИТОР ПРОТЕАЗЫ ВИЧ
СТРУКТУРА В РАСТВОРЕ
ЯМР
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ
Дата ввода:
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)