СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=МЕТАГЕНОМНОЕ<.>)

Общее количество найденных документов : 6
Показаны документы с 1 по 6

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 13.06-04Б3.136

Автор(ы) : Ferer M., Werner J., Chernikova T.N., Bargiela R., Fernandez L., La Cono V., Waldmann J., Teeling H., Golyshina O.V., Glockner F.O., Yakimov M.M., Golyshin P.N.
Заглавие : Unveiling microbial life in the new deep-sea hypersaline Lake Thetis . Pt.II : A metagenomic study
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2012. - Vol. 14, N 1. - С. 268-281
Аннотация: Предполагается, что недавно открытое в юго-восточной части Средиземного моря оз. Тетис может служить моделью ранней Земли. С помощью метагеномики впервые исследовали микробное сообщество (МС) оз. Тетис и особенности обмена в нем. Выявили контрастный состав МС и высокое число новых (candidate) таксонов. На границе рассол (РА)/морская вода были выявлены не менее 3 автотрофных путей усвоения CO[2], связанных с разветвленными путями S-цикла. В РА-МС были найдены гены редуктивных путей: ацетил-КоА и цикла трикарбоновых к-т. Подчеркивается роль автотрофии в экстремальной среде. Выявлены гены, кодирующие ферментативный путь RuBisCo. На границе сред были обнаружены гены, кодирующие 3 типа окисления S{2-}: мультиферментный комплекс Sox, катализирующий полное окисление S{2-} в SO[4]{2-}, следование по пути SOR сульфид:хинон-редуктаза для окисления S{2-} до S'ГРАДУС', которая в присутствии S{2-} может дальше восстанавливаться полисульфидредуктазами по 3-му пути. Наличие двух последних путей позволяет достигать максимальной энергетич. выгоды при окислении S{2-}, одновременно предупреждая подкисление и отложение S'ГРАДУС'. Италия, Lab. of Marine Molec. Microbiology, IAMC, CNR, Messina. E-mail:michail.yakimov@iamc.cnr.it
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: СООБЩЕСТВА БАКТЕРИЙ
ХЕМОАВТОТРОФЫ
БИОРАЗНООБРАЗИЕ
МОРСКОЕ СВЕРХСОЛЕНОЕ ОЗЕРО
МЕТАГЕНОМНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
МЕТАБОЛИЧЕСКИЕ ПУТИ
РЕКОНСТРУКЦИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.03-04Б2.52

Автор(ы) : Ferer M., Werner J., Chernikova T.N., Bargiela R., Fernandez L., La Cono V., Waldmann J., Teeling H., Golyshina O.V., Glockner F.O., Yakimov M.M., Golyshin P.N.
Заглавие : Unveiling microbial life in the new deep-sea hypersaline Lake Thetis . Pt.II : A metagenomic study
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2012. - Vol. 14, N 1. - С. 268-281
Аннотация: Предполагается, что недавно открытое в юго-восточной части Средиземного моря оз. Тетис может служить моделью ранней Земли. С помощью метагеномики впервые исследовали микробное сообщество (МС) оз. Тетис и особенности обмена в нем. Выявили контрастный состав МС и высокое число новых (candidate) таксонов. На границе рассол (РА)/морская вода были выявлены не менее 3 автотрофных путей усвоения CO[2], связанных с разветвленными путями S-цикла. В РА-МС были найдены гены редуктивных путей: ацетил-КоА и цикла трикарбоновых к-т. Подчеркивается роль автотрофии в экстремальной среде. Выявлены гены, кодирующие ферментативный путь RuBisCo. На границе сред были обнаружены гены, кодирующие 3 типа окисления S{2-}: мультиферментный комплекс Sox, катализирующий полное окисление S{2-} в SO[4]{2-}, следование по пути SOR сульфид:хинон-редуктаза для окисления S{2-} до S'ГРАДУС', которая в присутствии S{2-} может дальше восстанавливаться полисульфидредуктазами по 3-му пути. Наличие двух последних путей позволяет достигать максимальной энергетич. выгоды при окислении S{2-}, одновременно предупреждая подкисление и отложение S'ГРАДУС'. Италия, Lab. of Marine Molec. Microbiology, IAMC, CNR, Messina. E-mail:michail.yakimov@iamc.cnr.it
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: СООБЩЕСТВА БАКТЕРИЙ
ХЕМОАВТОТРОФЫ
БИОРАЗНООБРАЗИЕ
МОРСКОЕ СВЕРХСОЛЕНОЕ ОЗЕРО
МЕТАГЕНОМНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
МЕТАБОЛИЧЕСКИЕ ПУТИ
РЕКОНСТРУКЦИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 13.06-04Б3.164

Автор(ы) : Wilson S.L., Grogan P., Walker V.K.
Заглавие : Prospecting for ice association: Characterization of freeze-thaw selected enrichment cultures from latitudinally distant soils
Источник статьи : Can. J. Microbiol. - 2012. - Vol. 58, N 4. - С. 402-412
Аннотация: В качестве фактора отбора среди микробных сообществ (МС) использовали стресс, вызванный замораживанием-оттаиванием (ЗО). Получали высеваемые психротолерантные МС организмов, обитателей почв приарктического Канадского щита (плато). Для анализа МС до и после ЗО применяли колич. ПЦР-анализ 16S-рРНК и метагенномное секвенирование. Из 22 исходных родов МС после ЗО оставалось только 6. До начала отбора они не преобладали в составе МС. Выживших проверяли на торможение рекристаллизации льда и на способность образовывать центры нуклеации льда. Свыше 60% изолятов проявляли по меньшей мере одно из этих свойств. Подчеркнуто, что подобные фенотипы не составляли большинства в МС арктических почв. Стратегия накопительных культур с использованием ЗО показала функционально сходные МС в различных районах приарктического плато. Канада, Dep. of Biology, Queen's Univ., Kingston, ON K7L 3N6
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: ПОЧВЕННЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ
ПРИАРАКТИЧЕСКИЙ КАНАДСКИЙ ЩИТ
ОТБОР ЗАМОРАЖИВАНИЕМ-ОТТАИВАНИЕМ
АНТИФРИЗНАЯ АКТИВНОСТЬ
НУКЛЕАЦИЯ ЛЬДА
РЕКРИСТАЛЛИЗАЦИЯ ЛЬДА
АНАЛИЗ 16S-РРНК
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР
МЕТАГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.03-04Б2.41

Автор(ы) : Wilson S.L., Grogan P., Walker V.K.
Заглавие : Prospecting for ice association: Characterization of freeze-thaw selected enrichment cultures from latitudinally distant soils
Источник статьи : Can. J. Microbiol. - 2012. - Vol. 58, N 4. - С. 402-412
Аннотация: В качестве фактора отбора среди микробных сообществ (МС) использовали стресс, вызванный замораживанием-оттаиванием (ЗО). Получали высеваемые психротолерантные МС организмов, обитателей почв приарктического Канадского щита (плато). Для анализа МС до и после ЗО применяли колич. ПЦР-анализ 16S-рРНК и метагенномное секвенирование. Из 22 исходных родов МС после ЗО оставалось только 6. До начала отбора они не преобладали в составе МС. Выживших проверяли на торможение рекристаллизации льда и на способность образовывать центры нуклеации льда. Свыше 60% изолятов проявляли по меньшей мере одно из этих свойств. Подчеркнуто, что подобные фенотипы не составляли большинства в МС арктических почв. Стратегия накопительных культур с использованием ЗО показала функционально сходные МС в различных районах приарктического плато. Канада, Dep. of Biology, Queen's Univ., Kingston, ON K7L 3N6
ГРНТИ : 34.27.19
Предметные рубрики: ПОЧВЕННЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ
ПРИАРАКТИЧЕСКИЙ КАНАДСКИЙ ЩИТ
ОТБОР ЗАМОРАЖИВАНИЕМ-ОТТАИВАНИЕМ
АНТИФРИЗНАЯ АКТИВНОСТЬ
НУКЛЕАЦИЯ ЛЬДА
РЕКРИСТАЛЛИЗАЦИЯ ЛЬДА
АНАЛИЗ 16S-РРНК
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ПЦР
МЕТАГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 15.10-04Б1.22

Автор(ы) : Рубальский Е.О., Тихонова Н.Т., Алешкин В.А., Чикобава М.Г., Афанасьев С.С., Рубальская А.Ф.
Заглавие : Особенности исследований вирусов человека методами высокопроизводительного секвенирования
Источник статьи : Естеств. науки. - 2014. - N 4. - С. 100-108
Аннотация: В обзоре рассматривается использование современных методов высокопроизводительного секвенирования (next generation sequencing, NGS) в исследованиях вирусов человека. Проанализированы и обобщены особенности NGS, возникающие в зависимости от поставленных практических задач при полногеномном секвенировании de novo, повторном секвенировании (ресеквенировании), секвенировании РНК, метагеномном секвенировании. Подходы NGS изложены с учетом ключевых проблем, важных для эффективного использования методов. Приведены некоторые особенности пробоподготовки, выделения нуклеиновых кислот, полногеномной амплификации, получения ампликонов, приготовления библиотек для секвенирования. Типовые этапы биоинформационного анализа данных NGS изложены с учетом прикладных задач медицинской вирусологии. Россия, Московский НИИ эпид. и микробиол. им. Г.Н. Габричевского, Москва. Библ. 31
ГРНТИ : 34.25.05
Предметные рубрики: ВИРУСЫ ЧЕЛОВЕКА
ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ПОЛНОГЕНОМНОЕ
DE NOVO
РНК
МЕТАГЕНОМНОЕ
БИОИНФОРМАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
МЕДИЦИНСКИЕ АСПЕКТЫ
ОБЗОРЫ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 16.03-04Б2.38

Автор(ы) : Селиванова Е.А., Гоголева Н.Е., Хлопко Ю.А., Плотников А.О.
Заглавие : Таксономический состав прокариот-ассоциантов галофильных протистов
Источник статьи : 6 Международная Верещагинская Байкальская конференция, Иркутск, 7-12 сент., 2015, 4 Байкальский микробиологический симпозиум с международным участием "Микроорганизмы и вирусы в водных экосистемах", Иркутск, 14-20 сент., 2015. - Иркутск, 2015. - С. 306-307
Примечания : 2
Аннотация: Впервые методом 16S метагеномного секвенирования изучен таксономический состав прокариот-ассоциантов автотрофных и гетеротрофных протистов, выделенных из соленых водоемов Соль-Илецка и Приэльтонья. Важным фактором, определяющим таксономический состав прокариот в ассоциациях галофильных протистов, является уровень минерализации среды. В ассоциациях с гетеротрофными протистами таксономическое разнообразие прокариот выше, чем в ассоациях с автротрофными. Россия, Ин-т клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, Оренбург
ГРНТИ : 34.27.15
Предметные рубрики: ПРОКАРИОТЫ
ГАЛОФИЛЬНЫЕ ПРОТИСТЫ
ПРОК-АРИОТЫ-АССОЦИАНТЫ
ТАКСОНОМИЧЕСКИЙ СОСТАВ
МЕТОДЫ
16S МЕТАГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ
Дата ввода:

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска