СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=КЛАСТЕР ГЕНОВ HRP<.>)

Общее количество найденных документов : 4
Показаны документы с 1 по 4

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.06-04Б2.164

Автор(ы) : Bell Kenneth S., Avrova Anna O., Holeva Maria C., Cardle, Linda, Morris, Wayne, De, Jong Walter, Toth Ian K., Waugh, Robbie, Bryan Glenn J., Birch Paul R.J.
Заглавие : Sample sequencing of a selected region of the genome of Erwinia carotovora subsp. atroseptica reveals candidate phytopathogenicity genes and allows comparison with Escherichia coli
Источник статьи : Microbiology. - 2002. - Vol. 148, N 5. - С. 1367-1378
Аннотация: Секвенирование генома оказало существенное влияние на микробиологию. В настоящее время известна геномная последовательность только для одного растительного патогена. В данной работе описали мишенное секвенирование образца для исследования генома Erwinia carotovora подвид atroseptica (Eca), главного патогена мягкой гнили картофеля. Большая библиотека ДНК Eca была сконструирована с использованием бактериального искусственного хромосомного вектора (BAC). Гибридизация и секвенирование конца ДНК показали наличие двух перекрывающихся BAC клонов, которые включали целый кластер генов hrp. Субклонирование и секвенирование позволило идентифицировать 25 (89%) из 28 генов hrp, предсказанных на основании ортологичного кластера hrp из Erwinia amylovora. Области, фланкирующие hrp кластер, содержали ортологи известных предполагаемых оперонов патогенности из других видов Erwinia, включая dspEF (E. amylovora), hecAB и pecSM (E. chrysanthemi), последовательности сходные с геном из растительного патогена Xylella fastidiosa, включая гемагглютининподобные гены и последовательности, сходные с генами, участвующими во взаимодействии ризобия-растение. Приблизительно 10% последовательностей показали сильное нуклеотидное сходство с генами близкородственной модельной бактерии и животного патогена Escherichia coli. Однако, положения некоторых из этих генов были отличными в двух геномах. Приблизительно 30% последовательностей не имели значительного сходства с какими-либо базовыми данными. Сконструировали физическую карту геномной области, включающей кластер генов hrp посредством гибридизации с BAC библиотекой, с гидролизованными BAC клонами и посредством ПЦР. Великобритания, Unit of Mycology, Bacteriology and Nematology and Unit of Genomics, Scottish Crop Research Institute, Invergowrie, Dundee DD2 5DA. Библ. 37
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНОМ
БИБЛИОТЕКА ДНК
ГИБРИДИЗАЦИЯ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
BAC КЛОНЫ
КЛАСТЕР ГЕНОВ HRP
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ГЕНЫ ПАТОГЕННОСТИ
ФИЗИЧЕСКАЯ КАРТА
ERWINIA CAROTOVORA (BACT.)
SUBSP. ATROSEPTICA
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 08.12-04В5.39

Автор(ы) : Zeng, Shen-yan, Hu, Jun, Huang, Gui-xiu, He, Chao-zu
Заглавие : Идентификация роли в патогенности Xanthomonas oryzae pv. oryzae hrp-ассоциированного гена hpaB
Источник статьи : Weishengwu xuebao. - 2007. - Vol. 47, N 3. - С. 402-406
ГРНТИ : 68.37.31
Предметные рубрики: МУТАЦИИ
ГЕН HPAB
СВЯЗЬ С
ПАТОГЕННОСТЬ
ДЕФИЦИТ
КЛАСТЕР ГЕНОВ HRP
TATL-ПЦР
XANTHOMONAS ORYZAE (BACT.)
PV. ORYZAE
ВОЗБУДИТЕЛЬ ЗАБОЛЕВАНИЙ РИСА
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.12-04Б2.108

Автор(ы) : Zeng, Shen-yan, Hu, Jun, Huang, Gui-xiu, He, Chao-zu
Заглавие : Идентификация роли в патогенности Xanthomonas oryzae pv. oryzae hrp-ассоциированного гена hpaB
Источник статьи : Weishengwu xuebao. - 2007. - Vol. 47, N 3. - С. 402-406
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: МУТАЦИИ
ГЕН HPAB
СВЯЗЬ С
ПАТОГЕННОСТЬ
ДЕФИЦИТ
КЛАСТЕР ГЕНОВ HRP
TATL-ПЦР
XANTHOMONAS ORYZAE (BACT.)
PV. ORYZAE
ВОЗБУДИТЕЛЬ ЗАБОЛЕВАНИЙ РИСА
Дата ввода:

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.07-04Б2.332

Автор(ы) : Rahme L., Mindrinos M., Grimm C., Frederick R., Lindgren P., Panopoulos N.
Заглавие : Organization and expression of the hrp gene cluster in Pseudomonas syringae pv. phaseolicola
Источник статьи : Vasc. Wilt Diseases Plants Basic Stud. ad Contr. - Berlin etc., 1989. - С. 303-314
Аннотация: Краткий обзор. Рассмотрено современное состояние молекулярно-генетич. исследований фитопатогена Pseudomonas syringae pv. phaseolicola (1). Его хромосомный кластер генов hrp, кодирующий способность 1 вызывать болезнь бобов "гало", индуцирует также реакцию гиперчувствительности (HR) у нек-рых растений, не относящихся к его кругу хозяев. У шт. 1 NPS121 гены hrp организованы в виде 2 связанных групп. Одна из них представляет собой единый локус, мутации в к-ром индуцируют мукоидную морфологию. Другая, размером 'ЭКВИВ'20 т. п. н., включает большинство генов hrp и известна как "кластер hrp". Короткий участок (0.5-1.0 т. п. н.) делит его на 2 примерно равных половины - "правую" и "левую". В hrp-кластере определено, по меньшей мере, 5 групп комплементации. Область hrp исследована методами обмена маркеров, комплементационного анализа, а также с помощью нового Тп (т. наз. reporter). Сведения о биохимич. механизмах экспрессии и регуляции hrp пока ограничены. В статье также изложены гипотезы о происхождении и эволюции кластера hrp. Библ. 27. США, Dep. of Plant Pathology, Univ. of California Berleley, CA 94720.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: PSEUDOMONAS SYRINGAE (BACT.)
PV. PHASEOLICOLA
ФИТОПАТОГЕНЕЗ
ВОЗБУДИТЕЛИ БОЛЕЗНИ БОБОВ "ГАЛО"
ГЕНЫ
КЛАСТЕР ГЕНОВ HRP
ОРГАНИЗАЦИЯ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 27
Дата ввода:

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска