СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК<.>)

Общее количество найденных документов : 9
Показаны документы с 1 по 9

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.02-04Б2.311

Автор(ы) : Drees Becky L., Sundin, Bryan, Brazeau, Elizabeth, Caviston Juliane P., Chen, Guang-Chao, Guo, Wei, Kozminski Keith G., Lau Michelle W., Moskow John J., Taong, Amy
Заглавие : A protein interaction map for cell polarity development
Источник статьи : J. Cell Biol. - 2001. - Vol. 154, N 3. - С. 549-571
Аннотация: Для более полного изучения белок-белковых взаимодействий, опосредующих развитие клеточной полярности, проведен крупномасштабный анализ в дрожжевой 2-гибридной системе. 64 слияния домена связывания с ДНК белка Gal4 (I) и дрожжевых белков, ассоциированных с актиновым цитоскелетом, септинами, секреторным аппаратом и ГТФазами типа Rho, использованы для скрининга набора трансформантов дрожжей, экспрессирующих 'ЭКВИВ'90% предполагаемых открытых рамок считывания Saccharomyces cerevisiae в виде слияний с доменом активации I. Обнаружено 191 белок-белковое взаимодействие, 128 из к-рых не были описаны ранее. В 44 взаимодействиях участвуют 20 ранее не охарактеризованных белков развития клеточной полярности. Для уточнения роли 13 из этих белков использованы их множественные 2-гибридные взаимодействия и анализ субклеточной локализации. В сеть взаимодействий включены ассоциации путей Cdc42 (II) и Rho2 (III) с белками, участвующими в экзоцитозе, организации септина, сборке актина (IV), организации микротрубочек, аутофагии, цитокинезе и синтезе клеточной стенки. Другие взаимодействия позволили предложить прямые связи между регулируемыми II и III путями, между аппаратом секреции и регуляторами установления полярности, между сборкой IV и контрольной точкой морфогенеза и между аппаратами экзоцитоза и эндоцитоза. В целом, установлена сеть взаимодействий, обеспечивающих интегральный ответ сигнальных белков, цитоскелета и органелл на пространственную информацию, направляющей развитие полярности S. cerevisiae. США, Dep. Mol. and Cell Biol., Univ California, Berkeley, CA 94720. Библ. 176
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: КЛЕТОЧНАЯ ПОЛЯРНОСТЬ
РАЗВИТИЕ
РЕГУЛЯЦИЯ
БЕЛОК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК GAL4
ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК
СЛИЯНИЕ
БЕЛКИ АССОЦИИРОВАННЫЕ
АКТИНОВЫЙ ЦИТОСКЕЛЕТ
СЕПТИНЫ
СЕКРЕТОРНЫЙ АППАРАТ
ГТФАЗЫ ТИПА RHO
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.12-04Б2.270

Автор(ы) : Wu, Martin, Schleif, Robert
Заглавие : Mapping arm-DNA-binding domain interactions in AraC
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 2001. - Vol. 307, N 4. - С. 1001-1009
Аннотация: В соответствии с известным механизмом действия регулятора AraC (I) арабинозного оперона Escherichia coli можно найти мутации в его домене связывания с ДНК (ДСД), к-рые ослабляют взаимодействие ДСД с N-концевым плечом (N-КП), выступающим из N-концевого домена димеризации, и делают I конститутивно активатором. Такие мутации получены при рандомизации 3 смежных остатков лей в ДСД и систематич. заменах поверхностных остатков ДНК на алу и глу. Выделены 20 конститутивных мутаций в 10 разных положениях. Они образуют непрерывный след на дистальной от ДНК стороне ДСД и определяют область, в к-рой N-КД контактирует с ДСД. США, Biol. Dep., Johns Hopkins Univ., Baltomore, MD 21218. Библ. 33
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
АРАБИНОЗНЫЙ ОПЕРОН
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
РЕГУЛЯТОР ARAC
ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
N-КОНЦЕВОЕ ПЛЕЧО
КАРТИРОВАНИЕ
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 03.03-04Я6.48

Автор(ы) : Drees Becky L., Sundin, Bryan, Brazeau, Elizabeth, Caviston Juliane P., Chen, Guang-Chao, Guo, Wei, Kozminski Keith G., Lau Michelle W., Moskow John J., Taong, Amy
Заглавие : A protein interaction map for cell polarity development
Источник статьи : J. Cell Biol. - 2001. - Vol. 154, N 3. - С. 549-571
Аннотация: Для более полного изучения белок-белковых взаимодействий, опосредующих развитие клеточной полярности, проведен крупномасштабный анализ в дрожжевой 2-гибридной системе. 64 слияния домена связывания с ДНК белка Gal4 (I) и дрожжевых белков, ассоциированных с актиновым цитоскелетом, септинами, секреторным аппаратом и ГТФазами типа Rho, использованы для скрининга набора трансформантов дрожжей, экспрессирующих 'ЭКВИВ'90% предполагаемых открытых рамок считывания Saccharomyces cerevisiae в виде слияний с доменом активации I. Обнаружено 191 белок-белковое взаимодействие, 128 из к-рых не были описаны ранее. В 44 взаимодействиях участвуют 20 ранее не охарактеризованных белков развития клеточной полярности. Для уточнения роли 13 из этих белков использованы их множественные 2-гибридные взаимодействия и анализ субклеточной локализации. В сеть взаимодействий включены ассоциации путей Cdc42 (II) и Rho2 (III) с белками, участвующими в экзоцитозе, организации септина, сборке актина (IV), организации микротрубочек, аутофагии, цитокинезе и синтезе клеточной стенки. Другие взаимодействия позволили предложить прямые связи между регулируемыми II и III путями, между аппаратом секреции и регуляторами установления полярности, между сборкой IV и контрольной точкой морфогенеза и между аппаратами экзоцитоза и эндоцитоза. В целом, установлена сеть взаимодействий, обеспечивающих интегральный ответ сигнальных белков, цитоскелета и органелл на пространственную информацию, направляющей развитие полярности S. cerevisiae. США, Dep. Mol. and Cell Biol., Univ California, Berkeley, CA 94720. Библ. 176
ГРНТИ : 34.19.19
Предметные рубрики: КЛЕТОЧНАЯ ПОЛЯРНОСТЬ
РАЗВИТИЕ
РЕГУЛЯЦИЯ
БЕЛОК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК GAL4
ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК
СЛИЯНИЕ
БЕЛКИ АССОЦИИРОВАННЫЕ
АКТИНОВЫЙ ЦИТОСКЕЛЕТ
СЕПТИНЫ
СЕКРЕТОРНЫЙ АППАРАТ
ГТФАЗЫ ТИПА RHO
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 03.02-04В2.174

Автор(ы) : Drees Becky L., Sundin, Bryan, Brazeau, Elizabeth, Caviston Juliane P., Chen, Guang-Chao, Guo, Wei, Kozminski Keith G., Lau Michelle W., Moskow John J., Taong, Amy
Заглавие : A protein interaction map for cell polarity development
Источник статьи : J. Cell Biol. - 2001. - Vol. 154, N 3. - С. 549-571
Аннотация: Для более полного изучения белок-белковых взаимодействий, опосредующих развитие клеточной полярности, проведен крупномасштабный анализ в дрожжевой 2-гибридной системе. 64 слияния домена связывания с ДНК белка Gal4 (I) и дрожжевых белков, ассоциированных с актиновым цитоскелетом, септинами, секреторным аппаратом и ГТФазами типа Rho, использованы для скрининга набора трансформантов дрожжей, экспрессирующих 'ЭКВИВ'90% предполагаемых открытых рамок считывания Saccharomyces cerevisiae в виде слияний с доменом активации I. Обнаружено 191 белок-белковое взаимодействие, 128 из к-рых не были описаны ранее. В 44 взаимодействиях участвуют 20 ранее не охарактеризованных белков развития клеточной полярности. Для уточнения роли 13 из этих белков использованы их множественные 2-гибридные взаимодействия и анализ субклеточной локализации. В сеть взаимодействий включены ассоциации путей Cdc42 (II) и Rho2 (III) с белками, участвующими в экзоцитозе, организации септина, сборке актина (IV), организации микротрубочек, аутофагии, цитокинезе и синтезе клеточной стенки. Другие взаимодействия позволили предложить прямые связи между регулируемыми II и III путями, между аппаратом секреции и регуляторами установления полярности, между сборкой IV и контрольной точкой морфогенеза и между аппаратами экзоцитоза и эндоцитоза. В целом, установлена сеть взаимодействий, обеспечивающих интегральный ответ сигнальных белков, цитоскелета и органелл на пространственную информацию, направляющей развитие полярности S. cerevisiae. США, Dep. Mol. and Cell Biol., Univ California, Berkeley, CA 94720. Библ. 176
ГРНТИ : 34.29.15
Предметные рубрики: КЛЕТОЧНАЯ ПОЛЯРНОСТЬ
РАЗВИТИЕ
РЕГУЛЯЦИЯ
БЕЛОК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК GAL4
ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК
СЛИЯНИЕ
БЕЛКИ АССОЦИИРОВАННЫЕ
АКТИНОВЫЙ ЦИТОСКЕЛЕТ
СЕПТИНЫ
СЕКРЕТОРНЫЙ АППАРАТ
ГТФАЗЫ ТИПА RHO
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.07-04Б2.301

Автор(ы) : Blaesing, Franca, Weigel, Christoph, Welzeck, Michaela, Messer, Walter
Заглавие : Analysis of the DNA-binding domain of Escherichia coli DnaA protein
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 36, N 3. - С. 557-569
Аннотация: За связывание с ДНК белка DnaA Escherichia coli отвечает домен 4 на С-конце DnaA (остатки 374-467). С использованием трансляционного слияния mioC::lacZ, интегрированного в хромосому индикаторного штамма, показано, что изолированный домен 4 является функциональным репрессором in vivo. Методами сайт-направленного и случайного ПЦР-мутагенеза сконструированы мутации домена 4, влияющие на экспрессию mioC::lacZ. Мутации, влияющие на связывание с ДНК, обнаружены по всему домену 4. Они сгруппированы в области основной петли, в спирали В и в высококонсервативной области на N-конце спирали C. Методом поверхностного плазмонного резонанса обнаружено несколько классов мутантов с разной способностью связываться с ДНК. Наиболее сильный дефект по связыванию вызывают замены остатков R399, R407, Q408, H434, T435, T436 и A440. Мутации в области длиной 12 остатков рядом с концом спирали C изменяют специфичность связывания. Дефекты классических температурочувствительных мутантов dnaA204, dnaA205 и dnaA211 являются результатом нестабильности белков DnaA при повышенной температуре. Мутации dnaA71 и dnaA721, являющиеся супрессорами dnaX, картированы в области около спирали C. Они вызывают неспецифическое связывание с ДНК. Германия, Max-Planck-Inst. Mol. Genet., D-14195 Berlin-Dahlem. Библ. 38
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: БЕЛОК
БЕЛОК DNAA
ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК
АНАЛИЗ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.232

Автор(ы) : Hwang J.S., Yang J., Pittard A.J.
Заглавие : Specific contacts between residues in the DNA-binding domain of the TyrR protein and bases in the operator of the tyrP gene of Escherichia coli
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 8. - С. 2338-2345
Аннотация: Предложено изучение контактов между остатками в домене связывания с ДНК репрессора TyrR (I) и основаниями в операторе гена tyrP Escherichia coli. Показано, что почти все основания в палиндромных плечах сильного и слабого блоков важны для связывания I. Очищены мутанты I с заменами H494A и T495A (IA и IB) и методом сдвига Эф-подвижности измерено их сродство к оператору tyrP. Связывание in vitro почти не уменьшилось по сравнению с I дикого типа в случае IB и полностью устранилось в случае IA. Методом отсутствующих остатков показано, что IB образует специфич. контакты с остатками А и Т в положениях '+-'5 блоков TyrR. Австралия, Dep. Microbiol. and Immunol., Univ. Melbourne, Parkville, Victoria 3052. Библ. 27
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: РЕПРЕССОРЫ
РЕПРЕССОР TYRR
ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК
ОПЕРАТОР - РЕПРЕССОР ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ОПЕРАТОРЫ
ОПЕРАТОР TYRP
ОСНОВАНИЯ
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 00.12-04В2.425

Автор(ы) : Jensen Laran T., Posewitz Matthew C., Srinivasan, Chandra, Wing Dennis R.
Заглавие : Mapping of the DNA binding domain of the cooper-responsive transcription factor Mac1 from Saccharomyces cerevisiae
Источник статьи : J. Biol. Chem. - 1998. - Vol. 273, N 37. - С. 23805-23811
Аннотация: Белок Mac1 (I) Saccharomyces cerevisiae активирует транскрипцию генов, включая CTR1, в дефицитных по Cu клетках. С использованием слияний N-концевых фрагментов I с доменом активации белка VP16 вируса простого герпеса показано, что минимальный домен связывания I с ДНК состоит из остатков 1-159. Фрагмент I-(1-159) (IA), очищенный из клеток Escherichia coli, содержит 2 связанных иона Zn{2+}. Методом сдвига ЭФ-подвижности обнаружено прямое и специфич. связывание IA с ДНК, содержащей элемент ТТТГЦТЦА ответа на Cu. Для комплекса IA с днДНК, содержащей 1 промоторный элемент или инвертированный повтор, K[d]=5 нМ. N-концевой сегмент I длиной 40 остатков гомологичен цинковому модулю связывания с ДНК активируемых Cu факторов транскрипции Ace1 и Amt1. Замена цис[11]'-'тир в I вызывает утрату ф-ции I in vivo. Для эффективной активации транскрипции под действием I нужны 2 элемента ТТТГЦТЦА, к-рые действуют синергично. Увеличение числа копий этих элементов вызывает более чем аддитивное усиление экспрессии гена CTR1. США, Dep. Med., Univ. Utah Hlth. Sci. Ctr., Salt Lake City, UT 84132. Библ. 43
ГРНТИ : 34.29.15
Предметные рубрики: ФАКТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ
ОТВЕЧАЮЩИЙ НА МЕДЬ ФАКТОР MAC1
ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК
КАРТИРОВАНИЕ
ФУНКЦИИ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.10-04Б1.142

Автор(ы) : Li, Jing, Broyles Steven S.
Заглавие : The DNA binding domain of the vaccinia virus early transcription factor small subunit is an extended helicase-like motif
Источник статьи : Nucl. Acids Res. - 1995. - Vol. 23, N 9. - С. 1590-1596
Аннотация: Малая субъединица (I) фактора ранней транскрипции VETF вируса осповакцины контактирует с промоторной ДНК. Чтобы идентифицировать остатки I, важные для связывания с ДНК, использован сайт-направленный мутагенез 2 типов последовательностей в I: участков, напоминающих консервативные мотивы геликазного семейства, и положительно заряженных остатков в предсказанных 'альфа'-спиралях. Мутации, влияющие на активацию транскрипции, образуют кластеры в 2 областях I. Связывание с ДНК нарушается: 1) мутацией на N-конце I в предполагаемом кармане связывания АТФ, являющимся геликазным мотивом I (ГМ-I); 2) мутациями в C-концевой трети I, в к-рой находятся ГМ-VI и 2 фланговые 'альфа'-спирали. Эти данные показали, что область связывания с ДНК в I не образует отдельный домен, как у большинства факторов транскрипции, а рассосредоточена по всей I длиной 637 остатков. Предложена модель структуры I, в к-рой активный центр гидролиза АТФ интегрирован с расширенным доменом связывания с ДНК т. обр., что они структурно и функционально влияют друг на друга. США, Dep. Biochem., Purdue Univ., W Lafayette, IN 47907-1153. Библ. 26
ГРНТИ : 34.25.19
Предметные рубрики: ВИРУС ОСПОВАКЦИНЫ
ФАКТОР ТРАНСКРИПЦИИ
РАННИЙ
МАЛАЯ СУБЪЕДИНИЦА
ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК
СТРУКТУРНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.04-04Б2.329

Автор(ы) : Reardon Brian J., Gordon, Donna, Ballard Michelle J., Winter, Edward
Заглавие : DNA binding properties of the Saccharomyces cerevisiae DAT1 gene product
Источник статьи : Nucl. Acids Res. - 1995. - Vol. 23, N 23. - С. 4900-4906
Аннотация: Ген DAT1 S. cerevisiae кодирует связывающийся с ДНК белок Dat1p (I), специфически узнающий малую канавку нечередующихся трактов олиго(A)*олиго(T) (II) и имеющий в домене связывания с ДНК (ДСД) 3 идеальных повтора пентапептида GRKPG. Описан быстрый и простой метод очистки ДСД I и изучено взаимодействие ДСД с II. Изучение связывания олигонуклеотидов и сайтов связывания I в геноме дрожжей показало, что I специфически связывается с любой последовательностью длиной 11 н., в к-рой 10 н. являются II. Анализ связывания производных I разного размера показал, что I может функционировать как мономер. Изучение конкуренции при связывании ДНК с использованием поли(I)*поли(C) продемонстрировало, что малой канавки II недостаточно для высокой специфичности связывания I с ДНК. Полученные данные ограничивают возможные модели комплексов I-II, позволяют предположить, что ДСД I в комплексе с ДНК имеет растянутую структуру, и показывают, что сайты связывания I распространены более широко, чем считали ранее. США, Dep. Biochem. and Mol. Biol., Thomas Jefferson Univ., Philadelphia, PA 19107. Библ. 28
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕН DAT1
БЕЛОК
DAT1P
ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК
СВОЙСТВА
SACCHAROMYCES CEREVISIAE
Дата ввода:

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска