СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНЫЕ УЧАСТКИ<.>)

Общее количество найденных документов : 6
Показаны документы с 1 по 6

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.12-04Б1.223

Автор(ы) : Chatterjee, Ranee, Tsarev, Sergei, Pillot, Jacques, Coursaget, Pierre, Emerson Suzanne U., Purcell Robert H.
Заглавие : African strains of hepatitis E virus that are distinct from Asian strains
Источник статьи : J. Med. Virol. - 1997. - Vol. 53, N 2. - С. 139-144
Аннотация: Получены частичные геномные последовательности четырех вирусных штаммов гепатита Е (HEV) из Африки (Марокко и Тунис) и один из Центральной Азии (Узбекистан, Ташкент). Использована RT-ПЦР для амплификации 5' и гипервариабильных участков ORF1 и участка перекрывающего все 3 ORF. Анализ последовательностей обнаружил отсутствие сходства африканских и всех известных азиатских штаммов, но больше сходства с мексиканским штаммом. Ташкентский штамм показал почти полную идентичность со штаммом из Оша (Киргизия). Результаты подтверждают дальнейшую дивергенцию географического происхождения HEV-штамма. США, Hepatitis Viruses Section, Lab. of Infect. Dis. Nat. Inst. of Allergy and Infect., Dis. Nat. Inst. of Health, Bethesda MD. Библ. 11
ГРНТИ : 34.25.29
Предметные рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА E
ШТАММЫ
АФРИКА
ЦЕНТРАЛЬНАЯ АЗИЯ
ГЕНОМ ВИРУСНЫЙ
ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНЫЕ УЧАСТКИ
АМПЛИФИКАЦИЯ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
ДИВЕРГЕНЦИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.10-04Б1.106

Автор(ы) : Crawford-Miksza, Leta, Schnurr David P.
Заглавие : Analysis of 15 adenovirus hexon proteins reveals the location and structure of seven hyperavariable regions containing serotype-specific residues
Источник статьи : J. Virol. - 1996. - Vol. 70, N 3. - С. 1836-1844
Аннотация: С помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) и клонирования определили полногеномную первичную структуру ДНК генома аденовируса (Ад) подкласса Д и рассчитали последовательность аминокислот (аминПС) этого гексона: кандидат Ад48, аминокислоты 85-0844. Сравнили с амин. ПС гексонов Ад человека A, B, C и F, Ад типа 3 крупного рогатого скота (BAB-3) и мыши (Ад1). Обнаружили 7 дискретных гипервариабельных участков (ГВУ) среди 250 различных остатков амин. в петлях 1 и 2. У разных серотипов Ад эти участки различались по длине (от 2 до 38 остатков). Они содержали более 99% серотипоспецифических участков гексонов среди Ад человека. Сопоставление с опубликованной кристаллической структурой Ад2 определяет локализацию и структуру типоспецифических областей. 5 ГВУ представляли собой часть линейной петли на свободных поверхностях белка, подобно серотипическим "вздутиям" в капсидных белках пикарновирусов. ГВУ поддерживаются общим каркасом из консервативных остатков, 68-75% к-рых являются гидрофобными. Уникальные амин. ПС лимитируются в 7 ГВУ, так что 1 или более участков содержат в этой области типоспецифические нейтрализуемые эпитопы. Специфическая сыворотка против гексона А48 узнает линейные пептиды, к-рые относятся по иммуноферментному анализу к 6 ГВУ. Можно удалить все взаимодействующие с пептидами антитела, но титр нейтрализации не изменяется. Элюированные после хроматографии пептиды не нейтрализуются. Нейтрализующая А48 сыворотка не узнает линейные пептиды. Очищенный тримерный нативный гексон угнетает нейтрализацию, а мономерный денатурированный нагреванием гексон не угнетает ее. Библ. 51
ГРНТИ : 34.25.17
Предметные рубрики: АДЕНОВИРУСЫ
ГЕКСОНЫ
БЕЛКИ
ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНЫЕ УЧАСТКИ
СЕРОТИПОСПЕЦИФИЧЕСКИЕ ОСТАТКИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 94.03-04Б1.103

Автор(ы) : Kato, Nobuyuki, Ootsuyama, Yuko, Ohkoshi, Showgo, Nakazawa, Takehide, Sekiya, Hitomi, Hijikata, Makoto, Shimotohno, Kunitada
Заглавие : Characterization of hypervariable regions in the putative envelope protein of hepatitis C virus
Источник статьи : Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 1992. - Vol. 189, N 1. - С. 119-127
Аннотация: Ранее в предполагаемом гликопротеиде gp70 вируса было идентифицировано 2 гипервариабильных участка HVR1 в 27 аминок-т и HVR2 в 7 аминок-т. С помощью PCR проведен анализ этих участков по нуклеотидным последовательностям в вирусных изолятах, получаемых от 2 больных при хроническом гепатите, вызываемом вирусом гепатита типа С. У обеих пациентов наблюдались значительные изменения только в участке HVR1 (в среднем 1 аминок-т в месяц). При этом не обнаружено каких-либо изменений в этом участке у больного в острой фазе хронического гепатита. Рестрикционный анализ дивергентных последовательностей показал, что геном вируса с вновь введенной мутацией в HVR1 составляет доминирующую популяцию при последующем анализе. Япония, Nat. Cancer Center Res Inst., Tokyo 104. Библ. 16.
ГРНТИ : 34.25.17
Предметные рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
БЕЛКИ
ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНЫЕ УЧАСТКИ
СТРУКТУРА
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.04-04Б1.351

Автор(ы) : Palukaitis, Peter, Roossinck Marilyn J.
Заглавие : Variation in the hypervariable region of cucumber mosaic virus satellite RNAs is affected by the helper virus and the initial sequence context
Источник статьи : Virology. - 1995. - Vol. 206, N 1. - С. 765-768
Аннотация: Ранее показано, что D-сателлитная РНК (sat РНК) вируса огуречной мозаики (CMV) содержит гипервариабельный участок вокруг нуклеотида 230 в популяциях дикого типа и в клонах кДНК и потомстве одного такого клона (pD sat 4) после пассажа со шт. Fny-CMV. Этот гипервариабельный участок (HVR) состоит из серии последовательностей A и/или U-остатков. Авторы установили, что вариабельность в HVR генерируется также транскриптом из pDsat 4 после пассажа со шт. LS-CMV и вирусом шероховатости томатов - TAV (вирусами-помощниками). Однако потомство отличается в последовательности от HVR после пассажа, как с LS-CMV, так и TAV. Другая D-sat РНК клона кДНК, содержащая С-остаток в HVR, pD sat 1, как было показано ранее, не развивает вариабельности в HVR при пассаже с Fny-CMV. Однако, когда С (позиция 231) была заменена на А-остаток, вариабельность наблюдалась при третьем пассаже с Fny-CMV. Кроме того клон кДНК, происходящий из B1-sat РНК pBsat 15, содержащий С-остаток в участке, аналогичном HVR D-sat РНК не дает вариабельности при пассаже с Fny- или LS-CMV. Изменение С-остатка на U не дает гипервариабельности в потомстве от транскрипта из этого мутанта. Дискутируются различные модели генерирования гипервариабельности. США, Plant Biol. Div., The S. R. Noble Found., P. O. Box 2180, Ardmore, OK 73402. Библ. 17
ГРНТИ : 34.25.29
Предметные рубрики: КУКУМОВИРУСЫ
ВИРУС ОГУРЕЧНОЙ МОЗАИКИ
РНК САТЕЛЛИТНЫЕ
ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНЫЕ УЧАСТКИ
ВАРИАЦИИ
ИНДУКЦИЯ
ВИРУСЫ-ПОМОЩНИКИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 07.08-04Б1.170

Автор(ы) : Xu, Hui-lin, Zhang, Wen-tong, Zhao, Nai-qing, Jiang, Qing-wu
Заглавие : Гипервариабильные участки последовательности гемагглютинина влияющие на вирулентность вируса гриппа AH5N1 для млекопитающих
Источник статьи : Fudan xuebao. Yixue ban. - 2006. - Vol. 33, N 5. - С. 642-646
Аннотация: Исследовали последовательность нуклеотидов гемагглютинина (НА) 54 штаммов вируса гриппа A/H5N1. Гипервариабильными оказались участки нуклеотидов 279, 102, 228, 156, 154, 172, 140 и 8. Четкое взаимодействие наблюдалось между участками 154, 156 и другими участками гена, а также между участками 172 и 140. Полагают, что гипервариабильные участки могут играть важную роль при вирулентности вируса гриппа H5N1 для млекопитающих. КНР, Dep. of Health Statistics and Social Med., Sch. of Public Health, Fudan Univ., Shanghai 200032. Библ. 15
ГРНТИ : 34.25.29
Предметные рубрики: ВИРУСЫ ГРИППА А
ВИРУС H5N1
ГЕМАГГЛЮТИНИН
ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНЫЕ УЧАСТКИ
ПАТОГЕННОСТЬ
МЛЕКОПИТАЮЩИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.10-04Б2.175

Автор(ы) : Rathore G., Verma D.K.
Заглавие : ИДЕНТИФИКАЦИЯ ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНЫХ УЧАСТКОВ В МЕЖГЕННОМ СПЕЙСЕРЕ 16S-23S рРНК Flavobacterium columnare И ИХ ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ДЛЯ ОТНЕСЕНИЯ ГРУПП ГЕНОМОВАРОВ К ИНДИВИДУАЛЬНЫМ ШТАММАМ
Источник статьи : Молекул. биол. - 2014. - Т. 48, N 4. - С. 640
Аннотация: Flavobacterium columnare - важный патоген рыб, обладающий широкой внутривидовой генетической вариабельностью. Внутривидовые варианты, выделенные по результатам анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов гена 16SрРНК и межгенного спейсера (ISR) 16S-23S рДНК, соответственно, называют геномоварами и группами геномоваров. Путем анализа нуклеотидной последовательности межгенного спейсера 16S-23S рДНК установлен источник генетической гетерогенности F. columnare. Длина спейсера варьирует у разных геномоваров от 553 до 592 н., тогда как сходство нуклеотидных последовательностей составляет 76.1-92.6%. Все геномовары F. columnare имеют сходную структуру межгенного спейсера 16S-23S рДНК со встроенными в нее генами тРНК{Ala} и тРНК{Ile}. По гетерогенности последовательностей межгенного спейсера 16S-23S рДНК штаммы F. columnare можно разделить на пять групп геномоваров. Штаммы геномоваров I и II можно подразделить еще на две группы, тогда как штаммы геномовара III принадлежат к одной группе. Сходство последовательностей межгенного спейсера у разных групп геномоваров (76.1-92.6%) было ниже, чем сходство последовательностей 16S рДНК (96.1-99.4%), что позволяет использовать межгенный спейсер для дискриминации близкородственных групп геномоваров F. columnare. Главным источником различий между группами геномоваров служат три гипервариабельных участка (V1, V2 и V3) в межгенном спейсере. Наиболее гетерогенный из них - V3 - может использоваться для отнесения группы геномоваров к индивидуальному штамму F. columnare
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: МЕЖГЕННЫЙ СПЕЙСЕР
16S-23S РРНК
ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНЫЕ УЧАСТКИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
ГРУППЫ ГЕНОМОВАРОВ
ОТНЕСЕНИЕ
ИНДИВИДУАЛЬНЫЕ ШТАММЫ
Дата ввода:

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска