СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ<.>)

Общее количество найденных документов : 52
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-52

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.07-04Б2.201

Автор(ы) : Romling, Ute, Schmidt Karen D., Tummler, Burkhard
Заглавие : Large genome rearrangements discovered by the detailed analysis of 21 Pseudomonas aeruginosa clone C isolates found in environment and disease habitats
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 271, N 3. - С. 386-404
Аннотация: Методом 2-мерного электрофореза в пульсирующем поле построены физич. карты хромосомных фрагментов SpeI, PacI, SnaI и I-CeuI для 21 изолята преобладающего клона С Pseudomonas aeruginosa, выделенных из больных кистозным фиброзом (изоляты КФ) и из окружающей водной среды. На генетич. картах определено положение 26 генов. Размер хромосомы составляет 6345-6606 т.п.н. У штаммов, не связанных с КФ, найдена плазмида размером 95 т.п.н., к-рая интегрирована у всех штаммов, кроме одного изолята КФ. 4 субгруппы штаммов клона С различаются приобретением или утратой больших блоков ДНК, к-рые могут занимать 10% хромосомы. Обмен блоками размером 1-214 т.п.н. происходит преимущественно вокруг области терминации репликации, бедной биосинтетич. генами. Генетич. материал, дополнительно введенный в штамм С по сравнению с штаммом РАО, является мишенью для мутационных процессов в штаммах клона С. Среди изолятов КФ часто встречаются большие инверсии, влияющие на структуру всей хромосомы. Обмен блоками ДНК в результате горизонтального переноса и большие хромосомные инверсии являются главными факторами, ведущими к дивергенции клона в виде Ps. aeruginosa. Швеция, Karolinska Inst., S-17 177 Stockholm. Библ. 65
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ДНК
ОБМЕН БЛОКАМИ
ХРОМОСОМНЫЕ ИНВЕРСИИ
ДИВЕРГЕНЦИЯ
КЛОНЫ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA
ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА
ОЧАГИ ВОЗНИКНОВЕНИЯ БОЛЕЗНИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.06-04Б2.274

Автор(ы) : Захаров И.А., Марков А.В.
Заглавие : Генные порядки в геномах альфа-протеобактерий: сходство и эволюция
Источник статьи : Генетика. - 2005. - Т. 41, N 12. - С. 1624-1633
Аннотация: Генные порядки в геномах 9 альфа-протеобактерий и 3 гамма-протеобактерий сравнивали при помощи количественных показателей S (относительное число общих пар соседних генов) и L (средняя разность межгенных расстояний). Использовалась выборка из 200 гомологичных генов, присутствующих у всех 11 штаммов. Во всех проанализированных геномах обнаружено 20 консервативных "неразрывных" участков, включающих в общей сложности 63 гена из 200. Скорость изменений порядка генов в эволюции сильно варьирует в разных эволюционных линиях. Наибольший темп изменений характерен для внутриклеточного паразита Wolbachia (Rickettsiales) (40-60 геномных перестроек за 100 млн. лет). При помощи компьютерного моделирования показано, что наблюдаемое в исследуемой выборке соотношение величин S и L свидетельствует о несколько сниженной вероятности крупных геномных перестроек по сравнению с мелкими. Россия, Ин-т общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН, Москва 119991; e-mail: zakharov@vigg.ru. Библ. 14
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ЭВОЛЮЦИЯ
ХРОМОСОМЫ
ГЕНЫ
ПОРЯДОК
КОЛИЧЕСТВЕННЫЕ ПОКАЗАТЕЛИ
ОТНОСИТЕЛЬНОЕ ЧИСЛО ОБЩИХ ПАР СОСЕДНИХ ГЕНОВ
СРЕДНЯЯ РАЗНОСТЬ МЕЖГЕННЫХ РАССТОЯНИЙ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
АЛЬФА-ПРОТЕОБАКТЕРИИ
RICKETTSIALES (BACT.)
ГОМОЛОГИЧНЫЕ ГЕНЫ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
СРАВНЕНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.07-04Б2.112

Автор(ы) : Марков А.В., Захаров И.А.
Заглавие : Крупные и мелкие перестройки в эволюции прокариотических геномов
Источник статьи : Генетика. - 2006. - Т. 42, N 11. - С. 1547-1557
Аннотация: Относительные частоты крупных и мелких геномных перестроек (инверсий и транспозиций) в эволюции прокариотических геномов можно оценить по соотношению показателей S (отношение числа одинаковых пар генов-соседей в двух геномах к общему числу генов в рассматриваемой выборке) и 1-6. L/n, где L - средняя разность межгенных расстояний, n - число генов в выборке. По мере фиксации геномных перестроек величина S снижается равномерно, тогда как скорость снижения величины 1-6. L/n определяется размером перестроек: крупные инверсии и транспозиции приводят к резкому снижению, мелкие - к незначительному. Соотношение данных показателей вычислено для 20 пар близкородственных видов, относящихся к разным группам бактерий и архей. Рассмотренные пары сильно различаются по относительной частоте крупных и мелких перестроек, однако компьютерное моделирование показало, что всю наблюдаемую вариабельность можно воспроизвести при одних и тех же входных параметрах модели. Это означает, что наблюдаемые различия могут объясняться простой случайностью и для их интерпретации не требуется прибегать к предположениям о существенно разных механизмах и факторах геномных перестроек у разных групп прокариот. Относительные частоты крупных и мелких перестроек не проявляют заметных корреляций с таксономическим положением, общей скоростью фиксации перестроек, условиями обитания, обилием транспозонов и повторяющихся последовательностей. Деятельность фагов, возможно, в ряде случаев повышает вероятность крупных геномных перестроек. Россия, Палеонтологический ин-т РАН, Москва. Библ. 45
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНОМ ПРОКАРИОТИЧЕСКИЙ
ЭВОЛЮЦИЯ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ИНВЕРСИИ
ТРАНСПОЗИЦИЯ
ЧАСТОТЫ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.04-04Б2.198

Автор(ы) : Brinig Mary M., Cummings Craig A., Sanden Gary N., Stefanelli, Paola, Lawrence, Andrew, Relman David A.
Заглавие : Significant gene order and expression differences in Bordetella pertussis despite limited gene content variation
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2006. - Vol. 188, N 7. - С. 2375-2382
Аннотация: Bordetella pertussis, облигатный патоген человека и агент вызывающий коклюш, является клональным видом, несмотря на динамичное давление селекции, обусловленное иммунной системой хозяина и использованием вакцин. Так как генерация вариаций является важной для эволюции видов бактерий, в данной работе использовали ряд подходов, чтобы изучить характеристики генетических вариаций у Bordetella pertussis. При использовании сравнительной гибридизации геномов обнаружили высокий уровень консервации генного содержания у 137 штаммов Bordetella pertussis с различными географическими, временными и эпидемиологическими характеристиками. Ограниченное число областей, в которых выявляли различия, было часто локализовано рядом с копиями инсерционного элемента IS481, который представлен в большем числе копий в хромосоме B. pertussis. Эта повторяющаяся последовательность, по-видимому, является мишенью для гомологичной рекомбинации, которая приводит к делеции мешающих последовательностей. Используя вычитающую гибридизацию, исследовали ранее не идентифицированные гены в различных клинических изолятах, но не выявили наличия каких-либо новых генов, что показало, что приобретение генов является редким процессом у Bordetella pertussis. Обнаружили измененный порядок генов в нескольких штаммах, который изучили и опять обнаружили связь IS481 с сайтами, в которых происходит перестройка генов. Сравнили профили экспрессии целого генома в различных штаммах и обнаружили значительные изменения в транскрипции, даже в одном и том же штамме после 12 лабораторных пассажей. Комбинация подходов позволила изучить небольшие потери или приобретения генов в штаммах B. pertussis и способность B. pertussis генерировать вариации посредством перестройки генов в хромосоме и изменения экспрессии генов. США, Dep. of Microbiology and Immunology and Medicine, Stanford Univ. Sch. of Medicine, Stanford, California 94305. Библ. 42
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЫ
СОДЕРЖАНИЕ
КОНСЕРВАЦИЯ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ИЗМЕНЕНИЯ
КОРРЕЛЯЦИЯ
BORDETELLA PERTUSSIS (BACT.)
ВАРИАЦИИ
ГЕНЕРИРОВАНИЕ
ВОЗБУДИТЕЛЬ КОКЛЮША
Дата ввода:

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.10-04Б2.184

Автор(ы) : Смирнов Г.Б.
Заглавие : Почему редуцируются бактериальные геномы?
Источник статьи : 2 Бреслеровские чтения "Молекулярная генетика, биофизика и медицина сегодня". - СПб, 2007. - С. 34-60
Аннотация: Приобретение и потеря генетического материала являются существенными событиями в эволюции геномов. Равновесие между этими процессами соблюдается не всегда. В результате происходит экспансия одних геномов и сокращение других. До последнего времени считалось, что редукции подвергаются геномы бактерий, которым свойственен только паразитический или симбиотический стиль существования. Сейчас очевидно, что редукция геномов имеет место не только у патогенных бактерий и эндосимбионтов, но и у свободноживущих непатогенных бактерий. Естественный отбор представляется сомнительной причиной редукции микробных геномов, поскольку бактерии близкородственных видов, существовавшие в тех же (или очень похожих) условиях, не редуцировали свои геномы. В некоторых случаях имело место даже приобретение генетического материала. Т. обр., паразитическое или эндосимбиотическое существование не может считаться основной причиной редукции геномов. Выдвигается концепция, согласно которой наследование новой последовательности ДНК зависит от нуклеотидной последовательности в сайте-мишени реципиентного генома. Это означает, что предметом отбора является не фенотипический признак, кодируемый донорной ДНК, а новая последовательность ДНК, независимо от ее кодирующей способности. Этот тип отбора обозначен как полинуклеотидный (Пн)-выбор. Для наследования новых нуклеотидных последовательностей Пн-выбор является необходимым и достаточным. Однако для потери участков ДНК требуется как Пн-выбор, так и естественный отбор. Предлагается гипотеза, согласно которой редукция геномов является фазой двунаправленного процесса "пульсации геномов". Предполагается, что после компактизации генома может происходить приобретение генетического материала, приводящее к образованию новых генетических сочетаний. Пульсация генома имеет эволюционный смысл только для очень быстро размножающихся организмов. Россия, ГУ НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н. Ф. Гамалеи РАМН, Москва. Библ. 120
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНОМ
ЭВОЛЮЦИЯ
ГЕНЫ
ПСЕВДОГЕНЫ
ДЕЛЕЦИЯ
ИНТЕГРАЦИЯ
МИГРИРУЮЩИЕ ЭЛЕМЕНТЫ
IS-ЭЛЕМЕНТЫ
ПОВТОРЫ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
РЕКОМБИНАЦИЯ
РЕДУКЦИЯ
ПАРАЗИТИЗМ
ЭНДОСИМБИОНТЫ
БАКТЕРИИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.01-04Б2.190

Автор(ы) : White James R., Escobar-Paramo, Patricia, Mongodin Emmanuel F., Nelson Karen E., DiRuggiero, Jocelyne
Заглавие : Extensive genome rearrangements and multiple horizontal gene transfers in a population of Pyrococcus isolates from Vulcano Island, Italy
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 74, N 20. - С. 6447-6451
Аннотация: С помощью высоко-производительных геномных методов (сравнительная гибридизация геномов Pyrococcus furiosus из 7 изолятов) проведена оценка степени хромосомных перестроек у изолятов Pyrococcus, выделенных из гипертермальных источников острова Vulcano (Италия). Полученные результаты иллюстрируют динамическую природу геномов рода Pyrococcus и дают возможность связать быстро изменяющиеся условия внешней среды и адаптивные свойства генома. США, Univ. Maryland, Coll. Park, Maryland. Библ. 40
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ГОРИЗОНТАЛЬНЫЙ ПЕРЕНОС ГЕНОВ
ПОПУЛЯЦИОННАЯ ГЕНЕТИКА
АДАПТАЦИЯ
ГИПЕРТЕРМИЯ
ИСТОЧНИКИ
ИТАЛИЯ
PYROCOCCUS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.07-04Б2.106

Автор(ы) : Shukla Sanjay K., Kislow, Jennifer, Briska, Adam, Henkhaus, John, Dykes, Colin
Заглавие : Optical mapping reveals a large genetic inversion between two methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 18. - С. 5717-5723
Аннотация: Staphylococcus aureus может эволюционировать благодаря однонуклеотидному полиморфизму, мобильным генетическим элементам и рекомбинации. Идентификация новых элементов генома является трудной задачей, пока не определена последовательность всего генома. Оптическое картирование - новый высокоразрешающий метод картирования in situ бактериального генома. Он помогает идентифицировать перестройки генома, такие как инсерции, делеции, дупликации и инверсии. С помощью этого метода осуществили идентификацию и получили приблизительную локализацию и характеристику генетической инверсии 'ЭКВИВ'500 т. п. н. элемента ДНК между штаммами NRS387(USA800) и FPR3757(USA300). Присутствие инверсии и локализацию сайтов подтвердили методами сайт-специфичной ПЦР и секвенирования. Идентифицировали элемент IS1181 и 73 п. н. последовательность в NRS387 как инвертированные повторы, что может объяснить механизм инверсии. США, Marshfield Clinic Research Foundation, 1000 North Oak Avenue, Marshfield, Wisconsin 54449. Библ. 37
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)
УСТОЙЧИВЫЕ К МЕТИЦИЛЛИНУ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ИНВЕРСИИ
TS1181
73 П. Н. ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
МЕТОДЫ
ОПТИЧЕСКОЕ КАРТИРОВАНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.04-04Б2.215

Автор(ы) : Lebeaux, David, Barbier, Francois, Angebault, Cecile, Benmahdi, Lahcene, Ruppe, Etienne, Felix, Benjamin, Gaillard, Kevin, Djossou, Felix, Epelboin, Loic, Dupont, Claire, Renard, Magaly
Заглавие : Evolution of nasal carriage of methicillin-resistant coagulase- negative staphylococci in a remote population
Источник статьи : Antimicrob. Agents and Chemother. - 2012. - Vol. 56, N 1. - С. 315-323
Аннотация: В популяции американских индейцев, изолированно живущих во Французской Гвиане, в течение 2006 и 2008 г. выделяли из мазков из носа и изучали изоляты стафилококков. Метициллин-резистентные коагулазо-негативные стафилококки (MR-CoNS) определяли путем тестирования чувствительности к 'бета'-лактамам и типирования элемента mec в хромосоме. Для характеристики метициллин-резистентных Staphylococcus epidermidis (MRSE), кроме того, использовали мультилокусный анализ варьирования числа тандемных повторов. Влияние социодемографических и медицинских показателей на носительство MR-CoNS оценивали с помощью двумерного анализа. Показано носительство MR-CoNS у 50,6% изученной популяции в 2006 г. и у 46,8% в 2008 г. У 274 изолятов VR-CoNS (включая S. epidermidis, S. Haemolyticus и S. hominis) выявлен 41 тип комплексов генов mec и ccr. Постоянное носительство, прерывистое носительство и отсутствие носительства оказались у 25,3, 47,4 и 27,3% участников обследования, соответственно. Франция, (Ruimy R.) Bacteriol. Unit and French Nat. Refer. Center for Bacr. Resist. in Commensal Flora "EA3964". Библ. 52
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: STAPHYLOCOCCUS (BACT.)
МЕТИЦИЛЛИН-РЕЗИСТЕНТНЫЕ КОАГУЛАЗО-НЕГАТИВНЫЕ СТАФИЛОКОККИ
ВЫДЕЛЕНИЕ
МАЗКИ
НОС
АМЕРИКАНСКИЕ ИНДЕЙЦЫ
ИЗОЛИРОВАННАЯ ПОПУЛЯЦИЯ
2006 Г.
2008 ГОД
ЭВОЛЮЦИЯ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ВОЗМОЖНОСТЬ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 13.04-04Б4.315

Автор(ы) : Lebeaux, David, Barbier, Francois, Angebault, Cecile, Benmahdi, Lahcene, Ruppe, Etienne, Felix, Benjamin, Gaillard, Kevin, Djossou, Felix, Epelboin, Loic, Dupont, Claire, Renard, Magaly
Заглавие : Evolution of nasal carriage of methicillin-resistant coagulase- negative staphylococci in a remote population
Источник статьи : Antimicrob. Agents and Chemother. - 2012. - Vol. 56, N 1. - С. 315-323
Аннотация: В популяции американских индейцев, изолированно живущих во Французской Гвиане, в течение 2006 и 2008 г. выделяли из мазков из носа и изучали изоляты стафилококков. Метициллин-резистентные коагулазо-негативные стафилококки (MR-CoNS) определяли путем тестирования чувствительности к 'бета'-лактамам и типирования элемента mec в хромосоме. Для характеристики метициллин-резистентных Staphylococcus epidermidis (MRSE), кроме того, использовали мультилокусный анализ варьирования числа тандемных повторов. Влияние социодемографических и медицинских показателей на носительство MR-CoNS оценивали с помощью двумерного анализа. Показано носительство MR-CoNS у 50,6% изученной популяции в 2006 г. и у 46,8% в 2008 г. У 274 изолятов VR-CoNS (включая S. epidermidis, S. Haemolyticus и S. hominis) выявлен 41 тип комплексов генов mec и ccr. Постоянное носительство, прерывистое носительство и отсутствие носительства оказались у 25,3, 47,4 и 27,3% участников обследования, соответственно. Франция, (Ruimy R.) Bacteriol. Unit and French Nat. Refer. Center for Bacr. Resist. in Commensal Flora "EA3964". Библ. 52
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: STAPHYLOCOCCUS (BACT.)
МЕТИЦИЛЛИН-РЕЗИСТЕНТНЫЕ КОАГУЛАЗО-НЕГАТИВНЫЕ СТАФИЛОКОККИ
ВЫДЕЛЕНИЕ
МАЗКИ
НОС
АМЕРИКАНСКИЕ ИНДЕЙЦЫ
ИЗОЛИРОВАННАЯ ПОПУЛЯЦИЯ
2006 Г.
2008 ГОД
ЭВОЛЮЦИЯ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ВОЗМОЖНОСТЬ
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.04-04Б2.356

Автор(ы) : Fasullo Michael T., Davis Ronald W.
Заглавие : Direction of chromosome rearrangements in Saccharomyces cerevisiae by use of his3 recombinational substrates
Источник статьи : Ml. and Cell Biol. - 1988. - Vol. 8, N 10. - С. 4370-4380
Аннотация: Описан метод направленного получения внутрихромосомных (делеции и тандемные дупликации) и межхромосомных (транслокации) перестроек в любом клонированном локусе у S. cerevisiae на основе отбора ревертантов His+, образующихся в результате спонтанной митотической рекомбинации между гомологичными мутантными фрагментами ДНК his 3 (по 300 п. н. каждый). При введении этих фрагментов в шт. RAD52+ и rad52 не содержащие гены HIS3 в норм. локусе на хромосоме XV, получены транслокации, делеции и дупликации локуса GAL (7, 10, 1). Из 2 типов тандемных дупликаций GAL (7, 10, 1) один не отмечен у мутантов rad52 Ил. 9. Табл. 3. Библ. 48. США, Dep. of Genet. and Dev., Coll. of Physicians and Surgeons, Columbia Univ., 701 W. 168th Str., New York, NY 10032.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
ДРОЖЖИ
ШТАММ RAD 52S CEREVISIAE (FUNGI)
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ЛОКУС GAL
ДЕЛЕЦИИ
ДУПЛИКАЦИИ
ТРАНСЛОКАЦИИ
МЕТОД ПОЛУЧЕНИЯ
КЛОНИРОВАНИЕ
МУТАНТНЫЕ ГЕНЫ HIS
РЕКОМБИНАЦИЯ
МУТАНТНЫЙ ЛОКУС HIS
ХРОМОСОМЫ XY
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.05-04Б2.487

Автор(ы) : Prajapati J.B., Batish V.K.
Заглавие : Transposable elements - DNA segments that jump - some new horizons
Источник статьи : Everyman's Sci. - 1987-1988. - Vol. 22, N 6. - С. 198-207
Аннотация: Обзор. Рассмотрены основные характеристики бактериальных транспозирующихся элементов, особенности организации IS-элементов и их роль в формировании R плазмид и Hfr-штаммов. Представлены основные типы перестроек ДНК, опосредованных IS-элементами. Приведены сведения об основных бактериальных транспозонах и механизмах транспозиции. Обсуждаются модели консервативной, симметричной и ассиметричной транспозиции. Рассмотрены существующие пути и дальнейшие перспективы использования транспозирующихся элементов в качестве инструментов генной инженерии. Ил. 8. Табл. 3. Индия, National Dairy Research Institute, Karnal-132 001 Haryana.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: МОБИЛЬНЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ
ТРАНСПОЗОНЫ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
СТРУКТУРА
ФУНКЦИИ
ПЛАЗМИДЫ R
ШТАММЫ HFR
ОРГАНИЗАЦИЯ
ОБЗОРЫ
IS ЭЛЕМЕНТЫ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 89.06-04Б1.467

Автор(ы) : Schubach William H., Horvath, Gary
Заглавие : Alternate structures and stabilities of c-myc RNA in a bursal lymphoma cell line
Источник статьи : Nucl. Acids Res. - 1988. - Vol. 16, N 23. - С. 11171-11186
Аннотация: Изучали изменение структуры и экспрессии гена c-myc в Кл лимфомы фабрициевой сумки птиц, вызванные вирусом лейкоза птиц RAV-2 (Кл ВК 25). Показали, что вставка провируса RAV-2 или его фрагментов не затрагивает кодирующие области c-myc BK 25, а сами Кл гаплоиды по c-myc гену. 90% транскриптов c-myc-гена ВК 25 инициируется с промотора длинного концевого повтора (LTR)RAV-2, расположенного в 160 п. н. от 2-го экзона c-myc, эти РНК имеют время полужизни 25 мин. Остальные 10% транскриптов инициируются с собственного промотора гена c-myc и имеют время полужизни более 100 мин. В Кл, в к-рых ген c-myc не подвергся перестройке, время полужизни c-myc составляло 15 мин. На основании этого сделали вывод, что помимо структуры 5'-конца РНК c-myc, др. факторы тоже влияют на стабильность этой РНК в Кл. США, Oncology Div. Health Sci. Center, State Univ. of New York at Stony Brook, Stony Brook, NY 11794-8174. Библ. 41.
ГРНТИ : 34.25.29
Предметные рубрики: ВИРУС ЛЕЙКОЗА ПТИЦ
RAV-2
ИНТЕГРАЦИЯ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ПРОТООНКОГЕН C-MYC
ТРАНСКРИПТЫ
ЛИМФОМЫ
ФАБРИЦИЕВА СУМКА
ПТИЦЫ
D РЕТРОВИРУСЫ
ОНКОВИРУСЫ
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.06-04Б2.217

Автор(ы) : Stoltzfus, Arlin, Leslie James F., Milkman, Roger
Заглавие : Molecular evolution of the Escherichia coli chromosome . I : Analysis of structure and natural variation in a previously uncharacterized region between trp and tonB
Источник статьи : Genetics. - 1988. - Vol. 120, N 2. - С. 345-358
Аннотация: Секвенировали нуклеотид Escherichia coli К-12 от 7338-го (конец trpA) до 1126-го основания (начало Р14). В ранее известную нуклеотидную последовательность до 7535-го и от 10 975-го основания внесли изменения: 7456-й и 7457-й нуклеотиды исправили на гуанин, а 7501-й и 7502-й - на цитозин. В исследуемой области из 12 возможных открытых рамок считывания отобрали 6, которым соответствуют предполагаемые гены полипептидов. С целью определения существования вариаций данной последовательности исследовали ДНК нескольких диких штаммов E. coli. Используя секвенирование ДНК и Саузерн-гибридизацию, показали наличие большого числа рекомбинаций, замены оснований и перестановок ДНК по сравнению с рядом лежащим trp-опероном. Рис. 7. Табл. 5. Библ. 28. США, Dep. of Biology, University of Iowa, Iowa City, IO 52242.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММ К-12
ГЕНОМ
ОБЛАСТЬ TRP-TONB
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ЭВОЛЮЦИЯ
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 89.07-04Б1.500

Автор(ы) : Marolleau, Jean-Pierre, Fondell Joseph D., Malissen, Marie, Trucy, Jeannine, Barbier, Eliane, Marcu Kenneth B., Cazenave, Pierre-Andre, Primi, Daniele
Заглавие : The joinind of germ-line V'альфа' to J'альфа' genes replaces the preexisting V'альфа'-J'альфа' complexes in a T cell receptor 'альфа','бета' positive T cell line
Источник статьи : Cell. - 1988. - Vol. 55, N 2. - С. 291-300
Аннотация: Для изучения перестроек генов, кодирующих 'альфа'- и 'бета'-субъединицы рецептора Т-лимфоцитов в качестве модели использовали субклоны линии Т-Кл МТ 14, получ. трансформацией ретровирусом лимфоцитов тимуса. На основании данных блот-гибридизации НК этих Кл предложили схему перестроек, затрагивающих гены 'альфа'-субъединицы и установили стабильность генов для 'бета'-субъединицы. Франция, Unite d'Immunochimie Analytique Dep. d'Immunologie CNRS 359 and Institut Pasteur 75724 Paris Cedex 15. Библ. 44.
ГРНТИ : 34.25.29
Предметные рубрики: ЛИМФОЦИТЫ Т
РЕЦЕПТОРЫ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
ТРАНСФОРМИРОВАННЫЕ КЛЕТКИ
ЛИНИЯ MT14
РЕТРОВИРУСЫ
ГЕНЫ ИММУНОГЛОБУЛИНОВ
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.10-04Б2.599

Автор(ы) : Soberon-Chavez, Gloria, Najera, Rebecca
Заглавие : Symbiotic plasmid rearrangement in a hyper-recombinant mutant of Rhizobium leguminosarum biovar phaseoli
Источник статьи : J. Gen. Microbiol. - 1989. - Vol. 135, N 1. - С. 47-54
Аннотация: У штамма CFN23 клубеньковых бактерий фасоли (Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli) получен канамицинчувствительный мутант CFN2300 (использовали метод пенициллинового обогащения). Этот мутант обладает повышенной чувствительностью к налидиксовой кислоте и лишен вирулентности вследствие утраты Sym-плазмиды (CFN23 имеет три плазмиды размером 135, 400 и более 450 т. п. н., вторая из которых является "симбиотической"). Установлено, что Sym-плазмида штамма CFN23, введенная в CFN2300, теряет часть генома - делеции (которые приводят к одновременной утрате вирулентности, способности гибридизоваться с геном nifH, а также детерминируемой транспозоном Tn5-mob-устойчивости к канамицину) в 20 раз чаще, чем если эта плазмида находится в исходном штамме CFN23 (в этом случае частота аналогичных делеций составляет 1%). Частота спонтанных мутаций устойчивости к рифампицин у CFN2300 на порядок выше, чем у CFN23 (4*107} и 4*108}, соотв.). По мнению авт., повышенная частота делеций Sym-плазмиды у CFN2300 обусловлена увеличением частоты гомологичной рекомбинации между повторяющимися последовательностями ДНК, находящимися на этой плазмиде вблизи генов, контролирующих симбиотические признаки. Библ. 26. Мексика, Centro de Ingenieria Genetica y Biotecnologia, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Apdo. Postal 530-1 Col. Miraval 62271, Cuernavaca, Morelos. Mexico.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: RHIZOBIUM LEGUMINOSARUM (BACT.)
BV. PHASEOLI
КАНАМИЦИНЧУВСТВИТЕЛЬНЫЙ МУТАНТ CNF2300
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
РЕКОМБИНАЦИЯ
ГЕНЫ, СОСЕДНИЕ С ГЕНАМИ NIF
ПЛАЗМИДА SYM
ПЛАЗМИДНЫЙ ГЕНОМ
ДЕЛЕЦИИ
Дата ввода:

16.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.03-04Б2.212

Автор(ы) : Balbinder, Elias, Mac, Vean Cheryl, Williams Robert E.
Заглавие : Overlapping direct repeats stimulate deletions in specially designed derivatives of plasmid pBR325 in Escherichia coli
Источник статьи : Mutat. Res. - 1989. - Vol. 214, N 2. - С. 233-252
Аннотация: Для изучения роли прямых повторов (ПП) и палиндромов в образовании делеций сконструированы 3 производных плазмиды pBR325 : рОСЕ15, pRS1 и pRS4 - у которых в уникальный EcoRI - сайт в гене cat хлорамфениколацетилтрансферазы клонированы фрагменты ДНК примерно одинакового размера (60-64 п. н.), но с разными последовательностями. Вставка в плазмиде pOCE15 является идеальным падиндромным фрагментом оператора lac. Плазмиды pRS1 и pRS4 содержат один и тот же непалиндромный фрагмент, но отличаются друг от друга последовательностями на 3' - конце вставки: плазмида pRS4 содержит дупликацию 9 п. н., создающую дополнительный сайт EcoRI на 3' - конце вставки. Такая структура pRS4 дает перекрывающиеся несовершенный ПП 17-18 п. н. и совершенный ПП 11 п. н. на концах делеций и обеспечивает стабилизацию ошибочно спаренных промежуточных продуктов в однонитевой ДНК, считающихся необходимыми для образования делеций. Частота делеций, измеренная по реверсии от чувствительности к хлорамфениколу (Cs{s}) к устойчивости (Cm{r}), наиболее высока у pRS4, промежуточная у рОСЕ15 и низка у pRS1 (отношения частот 100 : 10 : 1). Показано также, что белок RecA участвует в образовании делеций у сконструированных плазмид, но не является обязательным, т. к. такие же делеции возникают и в мутанте 'ДЕЛЬТА'recА306. Библ. 60. США, Dept. of Biochem., Biophys. and Genetics, Univ. of Colorado Health Sci. Center, Denver, CO 80262.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ДНК ПЛАЗМИДНАЯ
РЕКОМБИНАНТНЫЕ ПЛАЗМИДЫ PBR325
ДЕЛЕЦИИ
ОБРАЗОВАНИЕ
РЕГУЛЯЦИЯ
ПЕРЕКРЫВАЮЩИЕСЯ ПРЯМЫЕ ПОВТОРЫ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
Дата ввода:

17.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.03-04Б2.287

Автор(ы) : Peijnenburg Ad A.C.M., Breed Piet V., Bron, Sierd, Venema, Gerard
Заглавие : Plasmid deletion formation in recE4 and addB72 mutants of Bacillus subtilis
Источник статьи : Plasmid. - 1989. - Vol. 21, N 3. - С. 205-215
Аннотация: Проведен сравнительный анализ формирования плазмидных делеций в штаммах Bacillus subtilis дикого типа и в мутантах recE4 и addB72. Частота делеций в плазмиде pGP1, контролируемая с помощью слияния penP-fac Z, была ниже в recE4 и выше в addB72 мутантах в сравнении со штаммов дикого типа. И в штамме дикого типа и в recE4 делеции между прямыми повторяющимися последовательностями были редкими, в то время как в штамме addB72 примерно половина делеций была результатом рекомбинации прямых повторов в 5 п. н. или более. Последовательность оснований в/или вблизи левой границы делеции была поразительно сходной во всех трех штаммах. Предполагается, что вторичная структура ДНК, равно как и последовательность оснований, определяют значительную часть левых терминаторов делеций, которые, по-видимому, являются сайтами активности топоизомеразы I. Табл. 1. Ил. 4. Библ. 41. Нидерланды, Dep. of Genetics, Center of Biological Sciences, Kerklaan 30, 9751 NN Haren (Gn).
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
МУТАНТЫ RECE4
МУТАНТЫ ADDB72
ПЛАЗМИДА PGP1
ДЕЛЕЦИЯ
МЕХАНИЗМ ВОЗНИКНОВЕНИЯ
РЕКОМБИНАЦИЯ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
Дата ввода:

18.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.03-04Б2.308

Автор(ы) : Weston-Hafer, Kathleen, Berg Douglas E.
Заглавие : Специфичность делеционных событий в pBR322
Источник статьи : Plasmid. - 1989. - Vol. 21, N 3. - С. 251-253
Аннотация: Частота мутаций-реверсий, вызванных инсерцией идентичной палиндромной ДНК, строго на расстоянии 1 п. н. от гена amp плазмиды pBR322, может варьировать до 3000 раз. Результаты проведенных экспериментов показали, что и частота делеций из этих же сайтов очень различны. Делеции были отобраны по одновременной утрате генов sucB и facZa, клонированных вместе в этих сайтах, без восстановления amp{j}-аллеля. Обнаружено, что более 90% делеций в каждом из этих сайтов действительно восстанавливает amp{j}-аллель. Этот результат свидетельствует о том, что вероятность формирования определенных делеций сильно зависит от последовательности ДНК в заданной области. Ил. 2. Библ. 11. США, Dep. of Microbiology and Immunology and of Genetics, Box 8093, Washington Univ. School of Medicine, St. Louis, Missouri 63110.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ПЛАЗМИДА PBR322
ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕН AMP
ДЕЛЕЦИИ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ ВОЗНИКНОВЕНИЯ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
Дата ввода:

19.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.12-04Б2.463

Автор(ы) : Huetter R., Birch A., Haeusler A., Voegtei M., Madon J., Krek W.
Заглавие : Genome fluidity in streptomycetes
Источник статьи : Biol. Actinomycetes'88. - Tokyo, 1988. - С. 111-116
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: STREPTOMYCES (BACT.)
АКТИНОМИЦЕТЫ
ГЕНОМ
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ
ДЕЛЕЦИЯ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
РЕКОМБИНАЦИЯ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ
АМПЛИФИКАЦИЯ ГЕНОВ
Дата ввода:

20.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.12-04Б2.642

Автор(ы) : Ohta, Noriko, Mullin David A., Tarleton, Jack, Ely, Bert, Newton Austin.
Заглавие : Identification, distribution, and sequence analysis of new insertion elements in Caulobacter crescentus
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1990. - Vol. 172, N 1. - С. 236-242
Аннотация: Описаны 2 инсерционных элемента IS298 и IS511, выделенных из Caulobacter crescentus. Они клонированы из спонтанных fla-мутантов SC298 и SC511, полученных из шт. СВ15 (АТСС 19089) дикого типа. IS 298 и IS 511 содержатся у шт. СВ2 и СВ15 по меньшей мере в 4-х разных положениях, но отсутствуют у шт. СВ13 и у др. видов Caulobacter, включая C. vibrioides, C. leidyia и C. henricii. IS 298 расположен на расстоянии 152 п.н. с 5'-стороны от инициирующего кодона АТГ гена белка крюка жгутиков fla K, а IS511 встроен в кодон 186 гена flaK. В обоих случаях элементы IS фланкированы прямыми повторами 4 п.н. сайта-мишени. Мутация ilv B102 у штамма SC125 также является вставкой IS 511, но в этом случае на стыках IS511 с хромосомой не обнаружена дупликация геномной последовательности. На концах IS 298 и IS 511 расположены палиндромы. Библ. 27.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: CAULOBACTER CRESCENTUS (BACT)
ВОДНЫЕ БАКТЕРИИ
ШТАММ CB15
МУТАНТЫ ПО ЖГУТИКАМ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
ИНСЕРЦИОННЫЙ ЭЛЕМЕНТ IS298
ИНСЕРЦИОННЫЙ ЭЛЕМЕНТ IS511
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
КАРТИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ
МУТАЦИИ
МУТАЦИИ ГЕНА ЖГУТИКОВ FLAK
Дата ввода:

1-20 21-40 41-52

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска