СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ВСТАВОЧНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ<.>)

Общее количество найденных документов : 9
Показаны документы с 1 по 9

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 95.07-04Б4.93

Автор(ы) : Matsutani, Sachiko, Ohtsubo, Eiichi
Заглавие : Distribution of the Shigella sonnei insertion elements in enterobacteriaceae
Источник статьи : Gene. - 1993. - Vol. 127, N 1. - С. 111-115
Аннотация: Ранее было показано, что в хромосоме Shigella sonnei содержится много копий элементов IS1, IS600, IS629, IS630, IS640, IS2 и IS3. В данной работе авт. исследовали наличие элементов IS1, IS600, IS629, IS630 и IS640 в штаммах разл. видов энтеробактерий. Проводили гибридизацию зондов ДНК на каждый из IS-элементов по методу Саузерна. Число элементов определяли по числу гибридизующихся полос ДНК. Четыре вида Shigella, включая Sh. sonnei, содержали все тестируемые IS-элементы. У них обнаружено специфичное для видов расположение полос. Др. штаммы содержали нек-рые IS-элементы. Клинич. изоляты Escherichia coli были похожи по наличию элементов и их распределению на виды Shigella. Япония, Nat. Inst. Hyg. Sci., Kamiyoga 1-18-1, Setagaya-ku, Tokyo 158. Библ. 24
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: МОБИЛЬНЫЕ ДИСПЕРГИРОВАННЫЕ ГЕНЫ
ВСТАВОЧНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
IS1
IS600
IS629
IS630
IS640
БЛОТ-ГИБРИДИЗАЦИЯ
SHIGELLA SONNEI
ENTERIC BACTERIA
HOST RANGE
ESCHERICHIA COLI
TAXONOMY
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.07-04Б2.234

Автор(ы) : Ton-Hoang B., Polard P., Chandler M.
Заглавие : Efficient transposition of IS911 circles in vitro
Источник статьи : EMBO Journal. - 1998. - Vol. 17, N 4. - С. 1169-1181
Аннотация: Разработана система in vitro, поддерживающая эффективную интеграцию колец бактериального элемента IS911. С использованием очищенных препаратов белков, кодируемых IS911, показано, что для интеграции в мишенную последовательность нужны транспоназа OrfAB (составной белок, образующийся в результате трансляц. сдвига рамки между соседними генами orfA и orfB) и orfA (продукт 5'-гена orfA). Идентифицированы продукты межмолекулярных реакций с использованием одного или обоих концов транспозона, а также различные продукты внутримолекулярной транспозиции, включая смежные делеции и инверсии. Кольцевой стык, состоящий из сближенных правого и левого концов IS911, сохраняет способность к интеграции и в составе линейной донорной молекулы, так что ее суперспирализация не нужна для реакции. В этих условиях обнаружены 2-концевая интеграция и в меньшем кол-ве одноконцевые вставки. Частота этих событий зависит от расстояния между концами транспозона. 2-концевая интеграция наиболее эффективна при природном расстоянии (3 п. н.). Эти данные показали, что транспозонные кольца могут являться промежуточными продуктами в интеграции IS911. Франция, Lab. Microbiol. et Genetique Mol., CNRS, 31062 Toulouse. Библ. 49
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ВСТАВОЧНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
КОЛЬЦА IS911
ТРАНСПОЗИЦИЯ IN VITRO
МИШЕННАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ТРАНСПОНАЗА ORFAB
БЕЛОК ORFA
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.07-04Б2.268

Автор(ы) : Itoh, Takeshi, Okayama, Toshitsugu, Hashimoto, Hiroyuki, Takeda, Jun-ichi, Davis Ronald W., Mori, Hirotada, Gojobori, Takashi
Заглавие : A low rate of nucleotide changes in Escherichia coli K-12 estimated from a comparison of the genome sequences between two different substrains
Источник статьи : FEBS Lett. - 1999. - Vol. 450, N 1-2. - С. 72-76
Аннотация: Сравнены нуклеотидные последовательности длиной 2 м. п. н. у 2 субштаммов Escherichia coli K-12: в полностью секвенированном геноме штамма W3110 и в частично секвенированном геноме штамма MG1655. Если считать, что эти 2 субштамма разошлись 40 лет назад, то скорость нуклеотидных замен в геноме E. coli не превышает 10{-7} замен на сайт в год. Эти оценки подтверждены сравнением частичных последовательностей геномов E. coli и Shigella flexneri. Япония, Ctr. for Information Biol., Nat. Inst. Genet., Mishima, Shizuoka 411-8540. Библ. 29
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНОМ
НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СРАВНЕНИЕ
НУКЛЕОТИДНЫЕ ЗАМЕНЫ
НИЗКАЯ ЧАСТОТА
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
SHIGELLA FLEXNERI (BACT.)
ВСТАВОЧНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.181

Автор(ы) : Wilde, Caroline, Bachellier, Sophie, Hofnung, Maurice, Clement, Jean-Marie
Заглавие : Transposition of IS1397 in the family Enterobacteriaceae and first characterization of ISKpn1, a new insertion sequence associated with Klebsiella pneumoniae palindromic units
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 15. - С. 4395-4404
Аннотация: IS1397 и ISKpn1 - представители семейства IS3, которые специфично интегрируют в петлю палиндромных единиц (PU). IS1397 транспозируется в PU с практически идентичной последовательности консенсусу E. coli, а также в других Enterobacteriaceae. Впервые описанный элемент ISKpn1 специфичен для PU Klebsiella pneumoniae. Выявили мотив, отвечающий за специфичность интеграции этих двух инсерционных последовательностей. Франция, Un. Program. Mol. Toxicol. Genet., CNRS URA 1444, Inst. Pasteur, 28 rue de Dr Roux, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 44
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ВСТАВОЧНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
IS1397
ТРАНСПОЗИЦИЯ
ISKPN1
ИНТЕГРАЦИЯ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ПЕТЛЯ ПАЛИНДРОМНЫХ ЕДИНИЦ
СЕМЕЙСТВО ENTEROBACTERIACEA
KLEBSIELLA PNEUMONIAE (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.10-04Б2.141

Автор(ы) : Kiss, Janos, Nagy, Zita, Toth, Gabor, Kiss, Gyorgy Botond, Jakab, J'-'ulia, Chandler, Michael, Olasz, Ferenc
Заглавие : Transposition and target specificity of the typical IS30 family element IS 1655 from Neisseria meningitidis
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2007. - Vol. 63, N 6. - С. 1731-1747
Аннотация: Проанализировали транспозицию и специфичность выбора мишеней у элемента IS 1655 и типичного семейства IS 30 в Neisseria meningitides. Определили IS 1655 как элемент длиной 1080 п.н. с инвертированными повторами (IR) в 25 п.н., генерирующими дупликацию мишеней в 3 п.н., и показали, что транспозиция происходит через интермедиаты с IR, разделенными 2 п.н. Специфичность IS 1655 в отношении мишеней проявляется в предпочтительной вставке в последовательности, подобные либо IR, либо не родственным, но хорошо определяемым последовательностям. Во вновь образуемой структуре IR-мишень и одна из донорных IR разделены 2 п.н. Мишени, отличные от IR, охарактеризовали как 19 п.н. палиндром, в котором центральные пять позиций отличаются избытком ГЦ, а дистальный район - АТ. Сконструированные искусственные мишени узнавались элементом как горячие точки инсерции. По организации IS 1655 подобен другим членам семейства IS 30, отличаясь лишь по транспозаам, действующим в N-концевых районах. Обсуждаются эволюционные аспекты вариантов последовательностей. Венгрия, Agricultural Biootechnology Center, Szent-Giorgyi Albert u.4, H2100, Godolllo. Библ. 55
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ВСТАВОЧНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СЕМЕЙСТВО IS 30
ЭЛЕМЕНТ IS 1655
СТРУКТУРА
ТРАНСПОЗИЦИЯ
МИШЕНИ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ ВЫБОРА
NEISSERIA MENINGITIDES (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.289

Автор(ы) : Tomasz, Alexander, Moreillon, Philippe, Pozzi, Gianni
Заглавие : Insertional inactivation of the major autolysin gene of Streptococcus pneumoniae
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 12. - С. 5931-5934
Аннотация: Ген lytA, кодирующий главный ген пневмококкового автолизина (N-ацетилмурамоил-L-аланинамидазу) инактивируется при вставке 2 т.п.н. MspI-фрагмента рЕ194, содержащего стрептококковый ген ermC. Стабильные автолиз-дефицитные (Lyt} мутанты и их изогенные Lyt+ родители были использованы в экспериментах по изучению физиологических функций амидазы. При инкубации мутантов при 37'ГРАДУС' автолиз нельзя было индуцировать дезоксихолатом, инкубацией при стационарной фазе или обработкой пенициллином. С др. стороны, Lytмутанты нормально росли и демонстрировали нормальные адаптивные ответы при изменении условий культивирования. Не было доказательств существования препятствий к разделению клеток и образованию цепей. Колонии Lytинсерционных мутантов образовывали нормальные зоны гемолиза на агаре с кровью и обладали нормальной или высокой компетентностью при генетической трансформации. Lytмутанты продуцировали 3 и 6 типы капсульных полисахаридов и обладали той же степенью вирулентности на мышах, что и изогенные Lyt+ родительские штаммы. Т. обр., физиологические функции амидазы остаются пока не выясненными. Ил. 2. Табл. 2. Библ. 28. США, Lab. of Microbiology, The Rockefeller Univ., New York, NY 10021.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE (BACT.)
ГЕНЫ
ГЕН АЦЕТИЛМУРАМОИЛ-L-АЛАНИНАЛИФАЗЫ*N-
ИНАКТИВАЦИЯ
ФУНКЦИИ
ВСТАВОЧНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ДНК-ФРАГМЕНТ PE194
МУТАНТЫ ПО АВТОЛИЗИНУ
ПОЛУЧЕНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.11-04Б2.725

Автор(ы) : Bartlett Douglas H., Silverman, Michael
Заглавие : Nucleotide sequence of IS492, a novel insertion sequence causing variation in extracellular polysaccharide production in the marine bacterium Pseudomonas atlantica
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 3. - С. 1763-1766
Аннотация: Представлена полная нуклеотидная последовательность элемента IS492, который вызывает обратимую инактивацию продукции экстрацеллюлярного полисахарида EPS в морской бактерии Pseudomonas atlantica. Инсерция IS492 приводит к EPSфенотипу, а точное исключение этого элемента восстанавливает фенотип EPS+. Изучение последовательности ДНК в сайте вставки локуса eps установило, что IS492 генерирует повтор в 5 п. н. IS492 имеет длину 1202 нуклеотида и содержит 1 большую область считывания, которая кодирует белок в 318 аминокислот, возможный кандидат для осуществления функций транскрипции. Не выявлено какого-либо сходства между IS492 и другими транспозируемыми элементами. В отличие от других элементов IS, на концах IS492 не обнаружено ни прямых, ни инвертированных повторов. Рис. 2. Библ. 15. США, The Agouron Inst., 505 Coast Boulevard South, La Jolla, CA 92037.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: PSEUDOMONAS ATLANTICA (BACT.)
МОРСКИЕ БАКТЕРИИ
ПОЛИСАХАРИДЫ
ВНЕКЛЕТОЧНЫЕ ПОЛИСАХАРИДЫ
ПРОДУКЦИЯ
ИЗМЕНЕНИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ВСТАВОЧНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ЭЛЕМЕНТ IS492
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
СТРУКТУРА
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.04-04Б2.547

Автор(ы) : Machida, Chiyoko, Machida, Yasunori
Заглавие : Regulation of IS1 transposition by the insA gene product
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1989. - Vol. 208, N 4. - С. 567-574
Аннотация: В элементе IS1 содержатся 2 соседних гена insA и insB, которые необходимы для транспозиции этого элемента и опосредованной им коинтеграции плазмид. Установлено, что если указанные гены организованы идентично с соответствующими генами в IS1 дикого типа и экспрессируются одновременно при низких концентрациях экзогенного индуктора, то активность мутанта IS1 восстанавливалась в цис-, но не транс-положении. Суперэкспрессия мутантного insA или insB не влияли на коинтеграцию. Установлено, что продукт InsA ингибирует экспрессию IS1 генов, контролируемую его собственным промотором в insL. Япония, Dep. of Biology, Faculty of Sci Nagoya Univ., Chikusa-ku Nagoya 464.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ВСТАВОЧНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ЭЛЕМЕНТЫ IS1
ТРАНСПОЗИЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ПРОДУКТ ГЕНА INSA
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.04-04Б2.546

Автор(ы) : Umeda, Masaaki, Ohtsubo, Eiichi
Заглавие : Mapping of insertion elements IS1, IS2 и IS3 on the Escherichia coli K-12 chromosome
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1989. - Vol. 208, N 4. - С. 601-614
Аннотация: В хромосоме штамма W 3110 Escherichia coli К-12 содержится 7 копий элемента инсерции IS1, 12 копий IS2 и 6 копий IS3. Методом гибридизации блящек с использованием мини-библиотеки фага 'лямбда', включающей 476 клонов, определена локализация 6 копий IS1, 10 копий IS2 и 5 копий IS3. Карты сайтов разрыва хромосомы W 3110 и анализ ДНК фага 'лямбда' с элементами инсерции позволили локализовать более точно большинство элементов инсерции и выявить их ориентацию. По-видимому, эти элементы инсерции могут активно включаться в процесс формирования перестроек бактериальных хромосом. Япония, Institute of Applied Microbiology, University of Tokyo Yayoi 1-1-1 Bunkuo ku, Tokyo 113.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT)
ВСТАВОЧНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ЭЛЕМЕНТ IS1
IS2
IS3
КАРТИРОВАНИЕ
ФУНКЦИИ
ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКА
Дата ввода:

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска