СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ<.>)

Общее количество найденных документов : 21
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-21

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.07-04Б2.33

Автор(ы) : Клеваник А.В., Шкуропатов А.Я., Шувалов В.А.
Заглавие : Теоретическое исследование низкотемпературных оптических спектров реакционных центров Rhodopseudomonas viridis
Источник статьи : Биол. мембраны. - 1994. - Т. 11, N 4. - С. 357-370
Аннотация: В рамках теории мини-экситонов рассчитаны оптические спектры реакционных центров (РЦ) фотосинтезирующих бактерий Rhodopseudomonas viridis. Проведенный анализ показал, что опубликованные ранее расчеты оптических спектров РЦ этих бактерий, основанные на известной кристаллографической структурной модели РЦ, не воспроизводят достаточно детально относительное распределение дипольных сил оптических переходов, наблюдаемое в низкотемпературных спектрах поглощения. Значительно лучшее согласие экспериментальных и теоретических низкотемпературных (1,7 К) оптических спектров РЦ Rps. viridis достигнуто в результате изменений (по отношению к кристаллографическим) координат фотоактивного бактериофеофитина H[L] и " сопутствующих" бактериохлорофиллов B[L] и B[м]. Введенные смещения хромофоров H[L], B[L] и B[м] привели к увеличению значений интегралов перекрывания волновых функций первичного донора электрона и бактериохлорофилла B[L], а последнего с бактериофеофитином H[L], что может свидетельствовать о более оптимальном (с точки зрения процесса разделения зарядов) положении хромофоров в РЦ Rps. viridis. Россия, Ин-т почвоведения и фотосинтеза РАН, Пущино Московской обл. Библ. 40
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: РЕАКЦИОННЫЕ ЦЕНТРЫ
ОПТИЧЕСКИЕ СПЕКТРЫ
НИЗКОТЕМПЕРАТУРНЫЕ
МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ
БАКТЕРИОХЛОРОФИЛЛЫ
БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
RHODOPSEUDOMONAS VIRIDIS
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.08-04Б2.35

Автор(ы) : Kerfeld Cheryl A., Yeates Todd O., Thornber J.Philip
Заглавие : Purification and characterization of the peripheral antenna of the purple-sulfur bacterium Chromatium purpuratum: Evidence of an unusual pigment-protein composition
Источник статьи : Biochemistry. - 1994. - Vol. 33, N 8. - С. 2178-2184
Аннотация: Из пурпурной-серной бактерии C. purpuratum выделены и охарактеризованы периферические антенны, состоящие по данным ЭФ в ПААГ, содержащем ДДС Na, из 6 субъединиц, N-концевой анализ субъединиц показал, что они могут иметь дополнительный участок связывания бактериохлорофилла, локализованный вне трансмембранного домена, а также дополнительные участки связывания пигментов. КД- и секвенс-анализы структуры комплекса содержит значительное кол-во 'бета'-структур и 'альфа'-спиралей. Каротеноид-белковый комплекс этой бактерии включает 3 белка и каротеноид, близко связанные с периферической антенной. Анализ вторичной и четвертичной структуры говорит о значительном отличии структуры комплекса антенны от светособирающих комплексов других пурпурных фотосинтетических бактерий. Библ. 43. США, Dep. Biol. and Chem. and Biochem. Univ. California, Los Angeles, California 90024
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
СТРУКТУРА
ОСОБЕННОСТИ
CHROMATIUM PURPURATUM
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.11-04Б2.41

Автор(ы) : Половникова О.Ю., Симонова Т.Н., Тараховский Ю.С., Никонова Т.Н., Суханов С.В., Дубачев Г.Э., Боровягин В.Л., Василенко И.А., Барсуков Л.И.
Заглавие : Реконструкция пурпурных мембран из делипидированного бактериородопсина с использованием эндогенных и экзогенных липидов. Влияние структурных и внешних факторов
Источник статьи : Биол. мембраны. - 1995. - Т. 12, N 3. - С. 260-278
Аннотация: Изучено влияние липидного окружения и внешних факторов (температуры и ионной силы водной среды) на формирование двумерных белковых кристаллов в реконструированных мембранах из делипидированного бактериородопсина. В качестве липидной составляющей были использованы суммарная фракция полярных липидов клеток Halobacterium halobium, яичный фосфатидилхолин (ФХ) и дипальмитоилфосфатидилхолин (ДПФХ). Реконструкцию проводили при соотношениях липид/белок, максимально близких к нативному. Для исследования свойств полученных мембранных препаратов использовали абсорбционную спектроскопию, КД в видимой области, электронную микроскопию (замораживание-скалывание) и ДСК. Показано, что в зависимости от природы липида и соотношения липид/белок бактериородопсин дает различные модификации мембран, отличающиеся по характеру и типу упаковки белковых молекул. Кристаллическую структуру бактериородопсина можно получить в условиях реконструкции путем включения белка в бислой эндогенных липидов при нативном соотношении липид/белок, равном 0,33/1, и при низкой конц-ии NaCl. При избытке эндогенных липидов для регенерации требуется присутствие соли в высокой конц-ии (3,5-4 М NaCl) или нагревание до 40-45'ГРАДУС' С. В случае ФХ высокоупорядоченную структуру белка можно получить только в присутствии NaCl в высокой конц-ии. В присутствии эндогенных липидов олигомеры бактериородопсина упаковываются в гексагональную решетку p3 симметрии, тогда как в системе, содержащей яичный фосфатидилхолин, белок упорядочивается в виде орторомбической решетки р22[1]2[1] симметрии. Вероятно, процессы упорядочивания белка в плоскости мембраны в определенной степени могут зависеть от электростатического поверхностного потенциала и/или диэлектрической проницаемости примембранного слоя, которые определяются тонким балансом электростатических взаимодействий на поверхности мембраны между белком, полярными головками липидных молекул и ионами электролитов, присутствующих в омывающей мембрану водной среде. Россия, ин-т теор. и эксп. биофизики РАН, г. Пущино Московской обл. Библ. 36
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ПУРПУРНЫЕ МЕМБРАНЫ
МЕМБРАНЫ БАКТЕРИАЛЬНЫЕ
ЛИПИДЫ
ИОННАЯ СИЛА РАСТВОРА
ТЕМПЕРАТУРА
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.11-04Б2.43

Автор(ы) : Samatey Fadel A., Zaccai, Giuseppe, Engelman Donald M., Etchebest, Catherine, Popot, Jean-Luc
Заглавие : Rotational orientation of transmembrane 'альфа'-helices in bacteriorhodopsin. A neutron diffraction study
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1994. - Vol. 236, N 4. - С. 1093-1104
Аннотация: The rotational orientation of the seven transmembrane 'альфа'-helices (A-G) in bacteriorhodopsin has been investigated by neutron diffraction. The current model of bacteriorhodopsin is based on an electron density map obtained by high-resolution electron microscopy (EM). Assigning helix rotational positions in the EM model depended on fitting large side-chains, mainly aromatic residues, into bulges in the electron density map. For helix D, which contains no aromatic residues, the EM map is more difficult to interpret. For helices A and B, whose position and orientation had been determined previously by neutron diffraction, the positions defined by AM agree within experimental error with these earlier conclusions. The orientation of all seven helices has been examined by using meutron diffraction on bacteriorhodopsin samples with specifically deuterated valine, leucine and tryptophan residues. Experimental peak intensities were compared to those predicted for an extensive set of structural models. The models were generated by (1) rotating all helices around their axis; (2) moving deuterated residues in the extramembrane loops about their probable positions and changing the weight of their contribution to the neutron diffraction pattern; (3) allowing deuterated side-chains to change their conformation. The analysis confirmed exactly the positions previously determined for helices A and B. For an optimal fit to the data to be obrained, the other five helices, including helix D, must lie either at or within 20'ГРАДУС' of their position in the current EM model. The complementarity of medium-resolution EM, neutron diffraction and model building for the structural study of integral membrane proteins is discussed. Франция, Inst. Laue-Langevin, BP 156X, avenue des Martyrs F-38042 Grenoble. Библ. 41
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ТРАНСМЕМБРАННЫЕ АЛЬФА-СПИРАЛИ
МЕТОД ДИФРАКЦИИ НЕЙТРОНОВ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 95.11-04А3.91

Автор(ы) : Smith P.D., Cole J., Friauf W.S., Frederickson H., Hendler R.W.
Заглавие : 100kHz optical multi-channel analyzer
Источник статьи : Biophys. J. - 1994. - Vol. 66, N 2. - С. 376
Аннотация: An optical multi-channel analyzer capable of recording spectra at sampling rates up to 100 kHz has been designed, constructed, and applied to studying the kinetic reaction mechanisms associated with cytochrome oxidase and bacteriorhodopsin. The instrument features a massively parallel approach in which each photosensing element of the detector has a dedicated amplifier, integrator, and data buffer. 92 such elements are divided in two separate arrays, each of which sits at the focal plane of a 1/4 m Ebert monochromator. Both monochromators may be tuned to cover independent, 130 nm wide, regions of the spectrum from 350 nm to 900 nm with a dispersion of 2.6 nm per element. Each element has 12 bit resolution with an electronic dark count of +/-1 count. A total of 1024 reads from a single experiment can be made with intervals from 10us to several seconds. США, NCRR, DCRT, and NHLBJ, NJH, Bethesda, MD 20892
ГРНТИ : 34.57.15
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
МУЛЬТИКАНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗАТОР
МЕТОДЫ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.12-04Б2.71

Автор(ы) : Половникова О.Ю., Симонова Т.Н., Тараховский Ю.С., Никонова Т.Н., Суханов С.В., Дубачев Г.Э., Боровягин В.Л., Василенко И.А., Барсуков Л.И.
Заглавие : Реконструкция пурпурных мембран из делипидированного бактериородопсина с использованием эндогенных и экзогенных липидов. Влияние структурных и внешних факторов
Источник статьи : Биол. мембраны. - 1995. - Т. 12, N 3. - С. 260-278
Аннотация: Изучено влияние липидного окружения и внешних факторов (температуры и ионной силы водной среды) на формирование двумерных белковых кристаллов в реконструированных мембранах из делипидированного бактериородопсина. В качестве липидной составляющей были использованы суммарная фракция полярных липидов клеток Halobacterium halobium, яичный фосфатидилхолин (ФХ) и дипальмитоилфосфатидилхолин (ДПФХ). Реконструкцию проводили при соотношениях липид/белок, максимально близких к нативному. Для исследования свойств полученных мембранных препаратов использовали абсорбционную спектроскопию, КД в видимой области, электронную микроскопию (замораживание-скалывание) и ДСК. Показано, что в зависимости от природы липида и соотношения липид/белок бактериородопсин дает различные модификации мембран, отличающиеся по характеру и типу упаковки белковых молекул. Кристаллическую структуру бактериородопсина можно получить в условиях реконструкции путем включения белка в бислой эндогенных липидов при нативном соотношении липид/белок, равном 0,33/1, и при низкой конц-ии NaCl. При избытке эндогенных липидов для регенерации требуется присутствие соли в высокой конц-ии (3,5-4 М NaCl) или нагревание до 40-45'ГРАДУС' С. В случае ФХ высокоупорядоченную структуру белка можно получить только в присутствии NaCl в высокой конц-ии. В присутствии эндогенных липидов олигомеры бактериородопсина упаковываются в гексагональную решетку p3 симметрии, тогда как в системе, содержащей яичный фосфатидилхолин, белок упорядочивается в виде орторомбической решетки р22[1]2[1] симметрии. Вероятно, процессы упорядочивания белка в плоскости мембраны в определенной степени могут зависеть от электростатического поверхностного потенциала и/или диэлектрической проницаемости примембранного слоя, которые определяются тонким балансом электростатических взаимодействий на поверхности мембраны между белком, полярными головками липидных молекул и ионами электролитов, присутствующих в омывающей мембрану водной среде. Россия, ин-т теор. и эксп. биофизики РАН, г. Пущино Московской обл. Библ. 36
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ПУРПУРНЫЕ МЕМБРАНЫ
МЕМБРАНЫ БАКТЕРИАЛЬНЫЕ
ЛИПИДЫ
ИОННАЯ СИЛА РАСТВОРА
ТЕМПЕРАТУРА
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.12-04Б2.73

Автор(ы) : Samatey Fadel A., Zaccai, Giuseppe, Engelman Donald M., Etchebest, Catherine, Popot, Jean-Luc
Заглавие : Rotational orientation of transmembrane 'альфа'-helices in bacteriorhodopsin. A neutron diffraction study
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1994. - Vol. 236, N 4. - С. 1093-1104
Аннотация: The rotational orientation of the seven transmembrane 'альфа'-helices (A-G) in bacteriorhodopsin has been investigated by neutron diffraction. The current model of bacteriorhodopsin is based on an electron density map obtained by high-resolution electron microscopy (EM). Assigning helix rotational positions in the EM model depended on fitting large side-chains, mainly aromatic residues, into bulges in the electron density map. For helix D, which contains no aromatic residues, the EM map is more difficult to interpret. For helices A and B, whose position and orientation had been determined previously by neutron diffraction, the positions defined by AM agree within experimental error with these earlier conclusions. The orientation of all seven helices has been examined by using meutron diffraction on bacteriorhodopsin samples with specifically deuterated valine, leucine and tryptophan residues. Experimental peak intensities were compared to those predicted for an extensive set of structural models. The models were generated by (1) rotating all helices around their axis; (2) moving deuterated residues in the extramembrane loops about their probable positions and changing the weight of their contribution to the neutron diffraction pattern; (3) allowing deuterated side-chains to change their conformation. The analysis confirmed exactly the positions previously determined for helices A and B. For an optimal fit to the data to be obrained, the other five helices, including helix D, must lie either at or within 20'ГРАДУС' of their position in the current EM model. The complementarity of medium-resolution EM, neutron diffraction and model building for the structural study of integral membrane proteins is discussed. Франция, Inst. Laue-Langevin, BP 156X, avenue des Martyrs F-38042 Grenoble. Библ. 41
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ТРАНСМЕМБРАННЫЕ АЛЬФА-СПИРАЛИ
МЕТОД ДИФРАКЦИИ НЕЙТРОНОВ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 96.05-04Б3.96

Автор(ы) : Yao, Baoli, Xu, Dalun
Заглавие : Фотобиомолекулярное устройство бактериородопсина и его ультрабыстрый процесс
Источник статьи : Shengwuhuaxue yu shengwuwuli jinzhan. - 1995. - Vol. 22, N 2. - С. 117-121
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ФОТОБИОМОЛЕКУЛЯРНОЕ УСТРОЙСТВО
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.01-04Б2.66

Автор(ы) : Gergely, Csilla, Ganea, Constanta, Szaraz, Sandor, Varo, Gyorgy
Заглавие : Charge motions studied in the bacteriorhodolpsin mutants D85N and D212N
Источник статьи : J. Photochem. and Photobiol. B. - 1995. - Vol. 27, N 1. - С. 27-32
Аннотация: Исследованы сигналы фотоэлектрического ответа мутантных бактериородопсинов D85N и D212N, экспрессируемых в Halobacterium halobium. Пурпурные мембраны, содержащие только мутантный белок, были ориентированы и иммобилизованы в полиакриламидном теле. Изменения спектра поглощения и сигналы электрического ответа определяли после возбуждения лазером, позволяющим прослеживать перемещения в белке зарядов в процессе фотоцикла. Сигналы анализировали на основе последовательной модели с обратимыми реакциями для фотоцикла у мутантов D85N и D212N. Установлена относительная электрогенность L-интермедиатов. Полученные результаты подтверждают наличие конформационных изменений при фотоцикле у этих мутантных бактериородопсинов. Румыния, Dep. Bioph., Univ. Med., Pharm., Bucharest. Библ. 34
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
МУТАНТНЫЕ
ЗАРЯДЫ
ФОТОЦИКЛ
HALOBACTERIUM HALOBIUM
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.01-04Б2.67

Автор(ы) : Radionov Alexey N., Kaulen Andrey D.
Заглавие : Cooperative phenomena in the photocycle of D96N mutant bacteriorhodopsin
Источник статьи : FEBS Lett. - 1995. - Vol. 377, N 3. - С. 330-332
Аннотация: Распад интермедиата М в фотоцикле мутанта бактериородопсина Д96N не зависит от интенсивности света. Добавление азида ускоряло распад М, который кинетически отличался от распада N. Повышение интенсивности света замедляло распад М и значительно ускоряло распад N. Полученные данные подтверждают высказанное ранее предположение о том, что появление медленного интермедиата М в фотоцикле бактериородопсина дикого типа при высокой интенсивности света обусловлено дестабилизацией интермедиата N, что ускоряет р-ции N'-' М и N'-' бактериородопсин. Библ. 19
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
МУТАНТ Д96N
ФОТОЦИКЛ
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.01-04Б2.68

Автор(ы) : MUkhopadhyay Anup K., Dracheva, Swetlana, Bose, Salil, Hendeler Richard W.
Заглавие : Control of the integral membrane proton pump, bacteriorhodopsin, by purple membrane lipids of Halobacterium halobium
Источник статьи : Biochemistry. - 1996. - Vol. 35, N 28. - С. 9245-9252
Аннотация: Описаны условия, важные для реконструкции нативных пурпурных мембран и восстановления фотоцикла после действия на пурпурные мембраны тритона X-100. С использованием циркулярного дихроизма и спектроскопии в УФ- и видимой области показано, что тритон X-100 может разрушать как вторичную структуру бактериородопсина, так и его способность образовывать тримеры. В то время как изменение конформации белка может быть восстановлено только липидами, образование тримеров и восстановление нормального фотоцикла идет при наличии липидов и высокой конц-ии соли. США, Lab. Cell Biol., Nat. Heart, Lung, and Blood Inst., Nat. Inst. Health, Bethesda, Maryland 20892. Библ. 19
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ТРАНСПОРТ ВОДОРОДА
ЛИПИДЫ
ПУРПУРНЫЕ МЕМБРАНЫ
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 97.07-04Б3.7

Автор(ы) : Shibata, Akira
Заглавие : Бактериородопсин как биосенсор и его чувствительность к анестетикам
Источник статьи : Bitamin. - 1996. - Vol. 70, N 8. - С. 359-367
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
БИОСЕНСОРЫ
АНЕСТЕТИКИ
ВЛИЯНИЕ
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.09-04Б2.35

Автор(ы) : Радионов А.Н., Каулен А.Д.
Заглавие : Сравнение действия ингибиторов на распад интермедиата М при фотоцикле бактериородопсина дикого типа и мутанта D96N
Источник статьи : Биохимия. - 1996. - Т. 61, N 9. - С. 1539-1553
Аннотация: Изучено влияние в-в, замедляющих распад интермедиата М в фотоцикле бактериородопсина дикого типа, на распад интермедиата М у мутанта D96N. Обработка пурпурных мембран как дикого типа, так и мутанта глутаровым альдегидом или LuCl[3] вызывает появление двух фракций бактериородопсина, различающихся по скорости распада интермедиата М. У этих фракций в обработанных глутаровым альдегидом мембранах дикого типа распад интермедиата М замедлен в 10 и 70 раз. В присутствии LuCl[3] распад М замедляется в 150 и 3000 раз. В то же время глутаровый альдегид и LuCl[3] почти не влияют на распад М у подобных фракций мутанта. Однако оба агента резко ингибируют ускорение распада М, вызываемое азидом, при этом не влияя на линейный характер зависимости скорости распада М от конц-ии азида. Эффективность ускоряющего действия азида для двух фракций в присутствии глутарового альдегида уменьшается в 11 и 140 раз, а в присутствии LuCl[3] - в 200 и 1600 раз. Увеличение содержания в среде глицерина или сахарозы вызывает замедление распада М как у бактериородопсина дикого типа, так и у регистрируемого в присутствии азида распада М мутанта. Предложена схема фотоцикла, согласно которой существует равновесие между двумя формами интермедиата М, различающимися по проницаемости для молекул азидоводорода и, вероятно, молекул воды. Россия, Ин-т ФХБ, МГУ, Москва. Библ. 42
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ФОТОЦИКЛ
ПРОТОННЫЙ ТРАНСПОРТ
ПУРПУРНЫЕ МЕМБРАНЫ
HALOBACTERIUM SALINARIUM
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.09-04Б2.36

Автор(ы) : Chizhov I., Chernavskii D.S., Engelhard M., Mueller K.-H., Zubov B.V., Hess B.
Заглавие : Spectrally silent transitions in the bacteriorhodopsin photocycle
Источник статьи : Biophys. J. - 1996. - Vol. 71, N 5. - С. 2329-2345
Аннотация: Проведен анализ кинетики фотоцикла бактериородопсина (БР) при т-рах от 0 до 40'ГРАДУС'С в диапазоне длин волн 330-730 нм. Показано, что существует, по крайней мере восемь экспоненциальных компонентов, необходимых для описания фотоцикла БР, пять из которых (K, L, M, N и O) имеют четкие спектральные различия, а константы скоростей у трех спектрально неразличимы. Германия, Max-Planck-Inst fur Molec. Physiol., Rheinlanddamm 201, 44139 Dortmund. Библ. 33
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ФОТОЦИКЛ
КИНЕТИКА
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.07-04Б2.51

Автор(ы) : Hashimoto, Shinji, Obata, Kohki, Takeuchi, Hideo, Needleman, Richard, Lanyi Janos K.
Заглавие : Ultraviolet resonance raman spects of Trp-182 and Trp-189 in basteriorhodopsin: Novel information on the structure of Trp-182 and its steric interaction with retinal
Источник статьи : Biochemistry. - 1997. - Vol. 36, N 39. - С. 11583-11590
Аннотация: Путем вычитания резонансных рамановских спектров (возбуждение при 244 нм) мутантов W182F и W189F из спектра бактериородопсина дикого типа получены спектры остатков Trp182 и Trp189. Торсионные углы 'хи'{2,1} вокруг связи C'бета'-C3 равен '+-'93'ГРАДУС' у Trp182 и '+-'100'ГРАДУС' у Trp189. Оба остатка имеют H-связи умеренной силы между индольной NH-группой и акцепторами водорода. Гидрофобность особенно высока вокруг Trp182. Структура и окружение Trp189, но не Trp182, согласуются с моделью, полученной из данных дифракции электронов [Grigorieff N. et al. "J. Mol. Biol.", 1996, 259, 393-421]. Для согласования структуры Trp182 с моделью он должен быть развернут вокруг C'бета'-C3 на 60'ГРАДУС' в сторону ретиналя и иметь м-лу воды в H-связи с NH. Спектр свидетельствует о необычайно сильном стерическом отталкивании между индольной группировкой и 9- и 13-метильными группами ретиналя, что должно дестабилизировать 13-цис-изомер ретиналя. Япония, Pharm. Inst., Tohoku Univ., Aobayama, Sendai 980-77. Библ. 51
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
УФ РЕЗОНАНСНЫЕ РАМАНОВСКИЕ СПЕКТРЫ
МУТАНТЫ W182F И W189F
Дата ввода:

16.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 03.09-04А2.30

Автор(ы) : DeLong, Edward
Заглавие : Mille milliards de mille microbes
Источник статьи : Recherche. - 2002. - N 355. - С. 54-58
Аннотация: В статье научно-популярного характера обсуждаются наиболее сенсационные открытия морской микробиологии последних десятилетий. Одна из них - обнаружение в 80-х годах 20 века пикопланктонных фотосинтезирующих микроорганизмов - Synechococcus и Prochlorococcus. Это открытие значительно изменило наши представления о трофической цепи в океане, выявив большое значение цианобактерий в первичной популяции. Обнаружено также значительное разнообразие экотипов у представителей р. Prochlorococcus, к-рые, в частности, различаются по соотношению разных хлорофиллов, чувствительности к свету и др. особенностям. Отмечается также значение бактериофагов в регуляции численности бактериопланктона. Еще одно яркое открытие - обнаружение планктонных архебактерий, численность к-рых в воде океана оказалась очень высокой. В пробах ДНК из морской воды обнаружены гены, кодирующие синтез светочувствительных белков семейства родопсинов. Это может свидетельствовать о значительном вкладе бактериородопсина в фотосинтез океана
ГРНТИ : 34.35.33
Предметные рубрики: SYNECHOCOCCUS (BACT.)
PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
ОБНАРУЖЕНИЕ
БАКТЕРИОПЛАНКТОН
РЕГУЛЯЦИЯ ЧИСЛЕННОСТИ БАКТЕРИОФАГОМ
АРХЕИ
ПЛАНКТОННЫЕ АРХЕИ
БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
Дата ввода:

17.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.09-04Б2.13

Автор(ы) : DeLong, Edward
Заглавие : Mille milliards de mille microbes
Источник статьи : Recherche. - 2002. - N 355. - С. 54-58
Аннотация: В статье научно-популярного характера обсуждаются наиболее сенсационные открытия морской микробиологии последних десятилетий. Одна из них - обнаружение в 80-х годах 20 века пикопланктонных фотосинтезирующих микроорганизмов - Synechococcus и Prochlorococcus. Это открытие значительно изменило наши представления о трофической цепи в океане, выявив большое значение цианобактерий в первичной популяции. Обнаружено также значительное разнообразие экотипов у представителей р. Prochlorococcus, к-рые, в частности, различаются по соотношению разных хлорофиллов, чувствительности к свету и др. особенностям. Отмечается также значение бактериофагов в регуляции численности бактериопланктона. Еще одно яркое открытие - обнаружение планктонных архебактерий, численность к-рых в воде океана оказалась очень высокой. В пробах ДНК из морской воды обнаружены гены, кодирующие синтез светочувствительных белков семейства родопсинов. Это может свидетельствовать о значительном вкладе бактериородопсина в фотосинтез океана
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: SYNECHOCOCCUS (BACT.)
PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
ОБНАРУЖЕНИЕ
БАКТЕРИОПЛАНКТОН
РЕГУЛЯЦИЯ ЧИСЛЕННОСТИ БАКТЕРИОФАГОМ
АРХЕИ
ПЛАНКТОННЫЕ АРХЕИ
БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
Дата ввода:

18.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 03.09-04Б3.87

Автор(ы) : DeLong, Edward
Заглавие : Mille milliards de mille microbes
Источник статьи : Recherche. - 2002. - N 355. - С. 54-58
Аннотация: В статье научно-популярного характера обсуждаются наиболее сенсационные открытия морской микробиологии последних десятилетий. Одна из них - обнаружение в 80-х годах 20 века пикопланктонных фотосинтезирующих микроорганизмов - Synechococcus и Prochlorococcus. Это открытие значительно изменило наши представления о трофической цепи в океане, выявив большое значение цианобактерий в первичной популяции. Обнаружено также значительное разнообразие экотипов у представителей р. Prochlorococcus, к-рые, в частности, различаются по соотношению разных хлорофиллов, чувствительности к свету и др. особенностям. Отмечается также значение бактериофагов в регуляции численности бактериопланктона. Еще одно яркое открытие - обнаружение планктонных архебактерий, численность к-рых в воде океана оказалась очень высокой. В пробах ДНК из морской воды обнаружены гены, кодирующие синтез светочувствительных белков семейства родопсинов. Это может свидетельствовать о значительном вкладе бактериородопсина в фотосинтез океана
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: SYNECHOCOCCUS (BACT.)
PROCHLOROCOCCUS (BACT.)
ОБНАРУЖЕНИЕ
БАКТЕРИОПЛАНКТОН
РЕГУЛЯЦИЯ ЧИСЛЕННОСТИ БАКТЕРИОФАГОМ
АРХЕИ
ПЛАНКТОННЫЕ АРХЕИ
БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
Дата ввода:

19.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.12-04Б2.265

Автор(ы) : Xu, Xue-Wei, Wu, Min, Ruan, Hong, Huang, wei-Da, Tohty, Dilbar
Заглавие : Анализ неполной последовательности гена нового Br-белка
Источник статьи : Yichuan. - Beijing, 2004. - Vol. 26, N 3. - С. 343-348
Аннотация: Из озера Aibi в Китае выделен штамм галофильного архаеона AB1. С помощью ПЦР были амплифицированы гены бактериородопсина (Br) и 16S рРНК и определена их нуклеотидная последовательность. На основе гомологий и филогенетического анализа последовательностей 16S рРНК предложено отнести новый штамм к роду Natronococcus. Показано, что Br штамма AB1 обладает типичной для бактериородопсинов трансмембранной гептаспинальной структурой. С другой стороны, при совмещении предсказанных аминокислотных последовательностей Br штамма AB1 с другими Br между ними выявлены четкие различия. Таким образом, Br штамма AB1 является новым членом семейства бактериородопсина. КНР, Coll. Life Sci., Zhejiang Univ., Hangzhou 310027. Библ. 22
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ГАЛОФИЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ
ГЕНЫ
ГЕН 16S РРНК
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ГОМОЛОГИИ
БЕЛОК
БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
ГЕН БАКТЕРИОРОДОПСИНА
КЛОНИРОВАНИЕ
АРХЕБАКТЕРИИ
ГАЛОФИЛЬНЫЙ АРХАЕОН AB1
Дата ввода:

20.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.07-04Б2.48

Автор(ы) : Papke R.Thane, Douady Christophe J., Doolittle W.Ford, Rodriguez-Valera, Francisco
Заглавие : Diversity of bacteriorhodopsins in different hypersaline waters from a single Spanish saltern
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2003. - Vol. 5, N 11. - С. 1039-1045
Аннотация: Родопсины галоархей - группа различных трансмембранных белков, преобразующих энергию света в движущую силу различных клеточных процессов. Два родопсина - бактериородопсин и галородопсин, являются H{+} и Cl{-}-насосами, соответственно, а еще два родопсина - сенсорные родопсины I и II - регулируют фототаксис. Бактериородопсин представляет особый интерес, поскольку он служит нехлорофильной основой фототрофности (т. е. преобразования энергии света в химическую). Однако, о разнообразии и распространении генов родопсина в условиях гиперсолености известно мало. В настоящей работе применен метод ПЦР образцов окружающей среды и техника клонирования для прямого обнаружения генов родопсина из прудов с различной соленостью, находящихся на территории завода по производству морской соли в Испании. Рез-ты указывают на обнаружение ранее неизвестных вариантов, включая и те, к-рые, как предполагалось ранее, являются генами бактериородопсина из некультивируемых бактерий, доминирующих в этих условиях. В некоторых случаях идентичные гены были открыты в кажущихся различными ареалах обитания, что подтверждает встречаемость галофильных архей в широком диапазоне конц-ий соли
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: БАКТЕРИОРОДОПСИНЫ
РАЗНООБРАЗИЕ
АРХЕИ
ГАЛОАРХЕИ
СОЛЕВАРНИ
Дата ввода:

1-20 21-21

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска