Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткий полный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ<.>)
Общее количество найденных документов : 443
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
1.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 93.10-04А1.090

Автор(ы) : De Jong Wilfried W., Caspers, Gert-Jan
Заглавие : 'альфа'-Crystallin sequences and amniote relationships - a cladistic approach : [Pap.] Symp. "Macromol. Identif. and Classif. Organisms", Antwerp., Dec. 7, 1991
Источник статьи : Belg. J. Bot. - 1992. - Vol. 125, N 2. - С. 121
Аннотация: На основании аминокислотных последовательностей 'альфа'Акристаллина млекопитающих, птиц, крокодила и ящерицы построена кладограмма. В качестве внешних групп использовали лягушку и акулу. Монофилия амниот подтверждается по меньшей мере 7 уникальными синапоморфными замещениями. О монофилии диапсид свидетельствуют 5 уникальных замещений. Птицы и крокодил имеют 2 общих замещения. 'альфа'А-кристаллины плацентарных и сумчатых млекопитающих не свидетельствуют о монофилетизме. Нидерланды, Univ. of Nijmegen.
ГРНТИ : 34.03.17
Предметные рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
БЕЛКИ
АЛЬФА-КРИСТАЛЛИН
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ФИЛОГЕНЕЗ
ПОЗВОНОЧНЫЕ
ЭВОЛЮЦИОННЫЕ ДЕРЕВЬЯ
КЛАДИСТИЧЕСКИЙ ПОДХОД
Дата ввода:
2.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI26) 96.10-04М4.83

Автор(ы) : Rojas A., Arola Ll., Romeu A.
Заглавие : 'бета'-Glucosidase families revealed by computer analysis of protein sequences
Источник статьи : Biochem. and Mol. Biol. Int. - 1995. - Vol. 35, N 6. - С. 1223-1231
Аннотация: Осуществлен компьютерный анализ организации 'бета'-глюкозидазных подсемейств. 22 'бета'-глюкозидазы, принадлежащие как целлюлолитическим, так и нецеллюлолитическим организмам, были идентифицированы. Показано существование 2 четких подсемейств A и B. Подсемейство A делится на A1 и A2. A1 включает растительные глюкозидазы, а A2 прокариотические ферменты. Подсемейство B включает 3 новых подсемейства B1, B2 и B3. Ферменты B2 из дрожжей и грибов. Остатки Asp, Glu, His, которые предположительно участвуют в гидролизе, консервативны. Также обнаружены аминокислотные мотивы, консервативные в подсемействах A и B. Испания, Univ. Rovira, Dep. Biochem., E-43005 Tarragona. Библ. 25
ГРНТИ : 34.39.41
Предметные рубрики: ГЛЮКОЗИДАЗЫ БЕТА
СЕМЕЙСТВА
БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ
Дата ввода:
3.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 06.08-04А3.904

Автор(ы) : Poirot, Olivier, Suhre, Karsten, Abergel, Chantal, O'Toole, Eamonn, Notredame, Cedric
Заглавие : 3DCoffee@igs: A web server for combining sequences and structures into a multiple sequence alignment
Источник статьи : Nucl. Acids Res. - 2004. - Vol. 32, прил. Web Serv. issue. - С. 37-40
Аннотация: Представлен сетевой сервер 3DCoffee@igs, позволяющий вычислять высокачественные множественные сопоставления последовательностей (МСП). 3DCoffee позволяет для повышения точности МСП использовать сочетания последовательностей и структур белков. Структуры можно брать из PDB либо вводить в сервер. После введения структур и последовательностей структуры попарно сопоставляются программой SAP, а последовательности - программой Fugue. Затем полученный набор парных сопоставлений объединяется в МСП алгоритмом T-Coffee. Сервер доступен по адресу: http://igs-server.cnrs-mrs.fr/Tcoffee. Запросы по адресу: cedric.notredame@europe.com. Библ. 19
ГРНТИ : 34.05.25
Предметные рубрики: БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПРОСТРАНСТВЕННЫЕ СТРУКТУРЫ
МНОЖЕСТВЕННОЕ СОПОСТАВЛЕНИЕ
СЕТЕВОЙ СЕРВЕР 3DCOFFEE@IGS
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ
Дата ввода:
4.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.06-04А3.601

Автор(ы) : Bennett Steven P., Nevill-Manning Craig G., Brutlag Douglas L.
Заглавие : 3MOTIF: Visualizing conserved protein sequence motifs in the protein structure database
Источник статьи : Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 4. - С. 541-542
Аннотация: 3MOTIF (http://motif.stanford.edu/3motif) - это сетевая программа визуализации в трехмерных структурах банка белковых данных PDB карты консервативных мотивов в последовательностях. В изображениях структур разным цветом отмечаются такие важные свойства мотивов, как степень консервативности и площадь доступной растворителю поверхности каждого остатка. США, Dep. Biochem., B400 Beckman Ctr., Stanford Univ., Stanford, CA 94305-5307. Библ. 7
ГРНТИ : 34.05.25
Предметные рубрики: БЕЛОК
БАНК PDB
ТРЕХМЕРНЫЕ СТРУКТУРЫ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
КОНСЕРВАТИВНЫЕ МОТИВЫ
ВИЗУАЛИЗАЦИЯ
СЕТЕВАЯ ПРОГРАММА 3MOTIF
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ
Дата ввода:
5.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 91.08-04Б4.245

Автор(ы) : Jacobs E., Bock R., Dalehite L.
Заглавие : A B cell-, T cell-linked epitope located on the adhesin of Mycoplasma pneumoniae
Источник статьи : Infec. and Immun. - 1990. - Vol. 58, N 8. - С. 2464-2469
Аннотация: Для локализации В- и Т-клеточных эпитопов в белке Р[1], к-рый является адгезином и главным антигеном (АГ) Mycoplasma pneumoniae, был синтезирован набор пептидов с аминокислотными последовательностями, перекрывающими иммунную область his 821-gly 871 Р[1]. Наибольшей способностью вызывать бласттрансформацию Тлимфоцитов из бронхов инфицированных морских свинок обладал пептид Ser845-G-S-R-S-F-L-P-. IgG из сыворотки зараженных животных наиболее активно взаимодействовал с пептидом Tyr842-N-T-S, независимо от аминокислоты 845. Т. обр., В-клеточный эпитоп центральной области белка Р[1] Mycoplasma pneumoniae расположен вслед за N-концом Т-клеточного эпитопа через Ser 845. Планируется уточнить функцию обнаруженного Т-клеточного эпитопа в свете проблемы конструирования ситетич. клеточной вакцины. Библ. 25. ФРГ, Univ. of Fleiburg, D-7800 Fleiburg.
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: MYCOPLASMA PNEUMONIAE (BACT.)
АДГЕЗИНЫ
АНТИГЕНЫ
ЭПИТОПЫ
СТРУКТУРА
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ИММУНИТЕТ
В-КЛЕТОЧНЫЙ ОТВЕТ
ВАКЦИНЫ
Дата ввода:
6.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 93.05-04Б1.362

Автор(ы) : Thole, Vera, Dalmay, Tamas, Burgyan, Jozsef, Balazs, Ervin
Заглавие : A burgonya y virus magyar (H) izolatumanak klonozasa es elsodleges szerkezetenek meghatarozasa
Источник статьи : 38 Novenyved. tud. napok., Budapest, febr. 25-26, 1992. - Budapest, 1992. - С. 108
ГРНТИ : 34.25.29
Предметные рубрики: ВИРУС КАРТОФЕЛЯ Y
ВАРИАНТЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
Дата ввода:
7.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 89.09-04И9.181

Автор(ы) : Jenkins Mark C.
Заглавие : A cDNA encoding a merozoite surface protein of the protozoan Eimeria acervulina contains tandem-repeated sequences
Источник статьи : Nucl. Acids Res. - 1988. - Vol. 16, N 20. - С. 9863
Аннотация: Тандемно повторяющиеся последовательности аминокислот известны у некоторых иммуногенных белков малярийного плазмодия и по крайней мере у 1 поверхностного гликопротеина Trypanosoma cruzi и Leishmaria major. Иммуноскринингом клонотеки E. acervulina с аСв против мембранных белков выделен клон кДНК, кодирующей иммуногенную область поверхностного белка мерозоитов с мол. м. 250 кД. Изученная аминокислотная последовательность содержит у 5'-окончания 14 тандемных повторов SPPSTPV. США, Animal Parasitol. Group, LPSI, ARS, USDA, Beltsville, MD 20705. Библ. 5.
ГРНТИ : 34.33.23
Предметные рубрики: EIMERIA ACERVULINA (PROT.)
МЕРОЗОИТЫ
ПОВЕРХНОСТНЫЕ БЕЛКИ
СТРУКТУРА
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
Дата ввода:
8.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.03-04Б2.64

Автор(ы) : Hawkins Christopher F., Borges, Adolfo, Perham Richard N.
Заглавие : A common structural motif in thiamin pyrophosphate-binding enzymes
Источник статьи : FEBS Lett. - 1989. - Vol. 255, N 1. - С. 77-82
Аннотация: Сравнивали аминокислотные последовательности шестнадцати разных ферментов (из бактерий, дрожжей и млекопитающих), к-рые используют тиаминпирофосфат (ТПФ) в кач-ве кофактора. В этих ферментах обнаружен структурный элемент из 'ЭКВИВ'30 аминокислотных остатков, начинающийся с высококонсервативной последовательности -GDG- и оканчивающийся также высококонсервативной последовательностью -NN-. Остатки между ними намного менее консервативны, но имеют несколько общих особенностей. Так, на расстоянии 10 остатков от С-концевой стороны -GDG- обычно расположен отрицательно заряженный остаток (Е или D), через 5 и 11 остатков от к-рого расположены аланин и пролин соответственно. Последовательности -NN- предшествует кластер из 6 или 7 высокогидрофобных остатков. Этот структурный лейтмотив, как предполагается, может формировать вторичную структуру типа 'бета''альфа''бета' и служить сайтом присоединения ТПФ. Такой же структурный элемент обнаружен в выведенной аминокислотной цепи неидентифицированного белка из Rhodobacter capsulata. Ил. 3. Табл. 1. Библ. 40. Великобритания, [R. N. Perham], Dep. of Biochem., Univ. of Cambridge, Tennis Court Road, Cambridge CB2 1QW.
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: ФЕРМЕНТЫ
ТИАМИНПИРОФОСФАТСВЯЗЫВАЮЩИЕ ФЕРМЕНТЫ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СРАВНЕНИЕ
КОФЕРМЕНТЫ
ТИАМИНПИРОФОСФАТ
МИКРООРГАНИЗМЫ
БАКТЕРИИ
ДРОЖЖИ
МЛЕКОПИТАЮЩИЕ
ПИРУВАТДЕКАРБОКСИЛАЗА
ПИРУВАТДЕГИДРОГЕНАЗА
Дата ввода:
9.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 98.03-04И1.101

Автор(ы) : Shishikura, Fumio, Nakamura, Masako
Заглавие : A comparative study on earthworm hemoglobins: An amino acid sequence comparison of monomer globin chains of two species, Pontodrilus matsushimensis and Pheretima communissima that belong to the family Megascolecidae
Источник статьи : Zool. Sci. - 1996. - Vol. 13, N 6. - С. 849-856
Аннотация: Очищены субъединицы внеклеточных гемоглобинов из 2 видов мегасколецид. У Pontodrilus matsushimensis мол. масса субъединицы 16366 Да, в ней 141 аминокислотный остаток. У Pheretima communissima мол. масса субъединицы 16000 Да, она состоит из 140 остатков. Проведено сравнение с гемоглобинами 3 других видов дождевых червей, трубочника и полихеты. Дивергенция между 3 видами р. Pheretima произошла 50-100 млн. лет назад, а между рр. Pheretima и Pontodrilus - 209 млн. лет назад. Япония, Dep. of Biol., Nihon Univ. School of Medicine, Ohyaguchi-kami machi, Itabashi-ku, Tokyo. Ил. 6. Табл. 1. Библ. 41
ГРНТИ : 34.33.15
Предметные рубрики: ОЛИГОХЕТЫ
MEGASCOLECIDAE (OLIGOCH.)
ГЕМОГЛОБИНЫ
МОНОМЕРНЫЕ ЦЕПИ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
Дата ввода:
10.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.293

Автор(ы) : Ely, Bert, Ely Tracey W., Crymes William B., Minnich Scott A.
Заглавие : A family of six flagellin genes contributes to the Caulobacter crescentus flagellar filament
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 17. - С. 5001-5004
Аннотация: У Caulobacter crescentus жгутиковый филамент собирается из 6 флагеллинов (I), кодируемых разными генами. По аминокислотным последовательностям I FljJ (IA) и FljL (IB) отличаются от 4 остальных I. Т. к. IA и IB первыми собираются в жгутиковый филамент, они могут являться специализированными I, облегчающим инициацию сборки. США, Dep. Biol. Sci., Univ. South Carolina, Columbia, SC 29208. Библ. 41
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ЖГУТИКОВЫЙ ФИЛАМЕНТ
СБОРКА
6 ФЛАГЕЛЛИНОВ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
FIJJ
FIJL
CAULOBACTER CRESCENTUS (BACT.)
Дата ввода:
11.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.04-04А3.410

Автор(ы) : Loytynoja, Ari, Milinkovitch Michel C.
Заглавие : A hidden Markov model for progressive multiple alignment
Источник статьи : Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 12. - С. 1505-1513
Аннотация: Представлен новый алгоритм множественного сопоставления последовательностей, который сочетает метод скрытых марковских моделей, алгоритм последовательного сопоставления и вероятностную модель эволюции, описывающую характер процессов замещения. Метод использует итеративные попарные сопоставления в соответствии с эволюционным древом, определяя каждый предшественник последовательности из парного сопоставления последующих узлов и последовательно конструируя множественное сопоставление. Метод позволяет рассчитывать минимальную апостериорную вероятность для каждой колонки сопоставления. Как показано, эта величина коррелирует с правильностью результата сопоставления и потому позволяет отфильтровывать недостоверно сопоставленные колонки. Программа доступна по адресу: http://www.ilb.ac.be/sciences/ueg/. Бельгия, Unit Evolutionary Genet., Free Univ. Brussels, CP 300, Inst. Mol. Biol. & Med., 6041 Gosselies. Библ. 23
ГРНТИ : 34.05.25
Предметные рубрики: БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОЕ МНОЖЕСТВЕННОЕ СОПОСТАВЛЕНИЕ
СКРЫТАЯ МАРКОВСКАЯ МОДЕЛЬ
КОМПЬЮТЕРНАЯ ПРОГРАММА
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ
Дата ввода:
12.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.05-04А3.681

Автор(ы) : Buzko, Oleksandr, Shokat Kevan M.
Заглавие : A kinase sequence database: Sequence alignments and family assignment
Источник статьи : Bioinformatics. - 2002. - Vol. 18, N 9. - С. 1274-1275
Аннотация: База данных последовательностей киназ KSD (http://kinase.ucsf.edu/ksd) содержит информацию о 290 семействах протеинкиназ, сформированных с помощью кластерного анализа профилей невырожденных последовательностей 5041 протеинкиназ из 100 видов из GenBank. Классификация семейств основана на степени гомологичности киназных каталитических доменов (длиной 250- 300 остатков). Сопоставления представлены в формате Excel. Кроме того KSD содержит эволюционные древа для каждого семейства и детальную информацию о каждой последовательности. Имеются также программы генерирования эволюционных древ, отнесения последовательностей и статистического анализа. США, Dep. Cell. & Mol. Pharmac., Univ. California San Francisco, San Francisco, CA 94143-9450. Библ. 5
ГРНТИ : 34.05.25
Предметные рубрики: КИНАЗА
ПРОТЕИНКИНАЗЫ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СОПОСТАВЛЕНИЕ
КЛАССИФИКАЦИЯ СЕМЕЙСТВ
БАЗЫ ДАННЫХ
БАЗА ДАННЫХ KSD
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ
Дата ввода:
13.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 90.11-04Б4.236

Автор(ы) : Thole Jelle E.R., Stabel Linda F.E.M., Суыкервуык Марйон Е.Г., де Щит Маделеине Ы.Л., Клатсер Паул Р., Колк Аренд Ш.Й., Шартскеерл Руды А.
Заглавие : A major immunogenic 36,000-molecular-weight antigen from Mycobacterium leprae contains an immunoreactive region of proline-rich repeats
Источник статьи : Infec. and Immun. - 1990. - Vol. 58, N 1. - С. 80-87
Аннотация: Из библиотеки рекомбинантной ДНК M. leprae в бактериофагах 'лямбда'gt11 и космидах выделены клоны, содержащие полностью ген (pra), кодирующий иммунодоминантный белок с мол. м. 36 кД M. leprae, несущий Т- и В-клеточные антигенные детерминанты. Показано, что последовательность ДНК гена pra кодирует полипептид, состоящий из 249 аминокислот и имеющий мол. м. 26,299 кД. Установлено, что на NH[2]-конце полипептида расположен богатый пролином участок (42%), состоящий из повторов аналогичных или идентичных последовательности PGGSYPPPPP. Продемонстрировано, что мАТ F47-9, F67-1, F67-5 и F126-5 взаимодействуют именно с этим участком полипептида PRA. Анализ иммунореактивности полипептида и нуклеотидной последовательности ДНК pra позволяет предположить, что выделенный ранее (R. A. Young и соавт., "Nature", 316: 450-452, 1985) с помощью мАТ F47-9 рекомбинант Y3180 ('лямбда'gt11) кодирует не имеющий отношения к PRA белок слияния, содержащий аналогичный эпитоп, распознаваемый мАТ F47-9. Библ. 41. Нидерланды, N. H. Swellengrebel Lab. of Trop. Hygiene, Royal Tropical Inst. Mcibergdreef 39. 1105 AZ Amsterdam.
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: MYCOBACTERIUM LEPRAE (BACT.)
АНТИГЕНЫ
СТРУКТУРА
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ГЕНЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
МОНОКЛОНАЛЬНЫЕ АТИТЕЛА
ДНК
НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
Дата ввода:
14.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 89.12-04А1.110

Автор(ы) : Martin P.G., Dowd I.M.
Заглавие : A molecular evolutionary clock for angiospering
Источник статьи : Taxon. - 1988. - Vol. 37, N 2. - С. 364-377
Аннотация: Для определения скорости молекулярной эволюции проводили сравнение N-терминальных аминокислотных последовательностей малой субъединицы фермента "рубиско" некоторых таксонов Proteaceae, Winteraceae, Nothofagus и Solanum, имеющих разрыв ареалов, связанный с разделением Гондваны и последующим континентальным дрейфом. Сравнивали таксоны Австралии (А) и Юж. Америки, А и Новой Зеландии, А и Африки. В результате получены ур-ния линейной регрессии ("молекулярные часы"), связывающие макромолекулярные изменения (замещения аминокислотных остатков) со временем. Концепция "молекулярных эволюционных часов" была разработана на гомологичных белках животных, гл. обр. млекопитающих, для к-рых хорошо датируется время дивергенции. По растениям аналогичных данных по последовательностям мало, и авторы могли использовать только свои результаты по 40 терминальным аминокислотным остаткам рубиско. Время дивергенции определяли ориентировочно по палеогеографическим реконструкциям. Составлены филогенетические деревья для Nothofagus (внешняя группа - Quercus), Winteraceae (внешняя группа - agnoliaceae), Proteaceae (выбор внешней группы оказался сложным, в качестве таковой рассматриваются Promonocotyledones) и др. На этой основе построены деревья согласия миним. длины, т. е. использован один из методов максимальной парсимонии. Хотя по различным таксонам наблюдается большая дисперсия данных, скорость эволюции по наиболее вероятной линии регрессии составляет одну нуклеотидную замену в течение 7 миллионо лет. Результаты рассматриваются как предварительные. Австралия, South Australia 5001, Adelaide, Univ. of Adelaide, Dept. of Bot. Ил. 4. Табл. 4. Библ. 39.
ГРНТИ : 34.03.17
Предметные рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
ТЕМПЫ ЭВОЛЮЦИИ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ФЕРМЕНТ "РУБИСКО"
ПОКРЫТОСЕМЕННЫЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ДРЕВА
ПАРСИМОНИЯ
Дата ввода:
15.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 89.01-04Н1.173

Автор(ы) : Mars Wendy M., van, Tuinen Peter, Drabkin Harry A., White James W., Saunders Grady F.
Заглавие : A myeloid-related sequence that localizes to human chromosome 8q21.1-22
Источник статьи : Blood. - 1988. - Vol. 71, N 6. - С. 1713-1719
Аннотация: Ранее показано существование такой последовательности (Пс) и комплементарной ДНК в лейкоцитах б-ных хронич. миелоидным лейкозом (Mars W. M. и соавторы, Blood, 1985, 65, 1218). Нуклеотидный анализ показал, что Пс кодирует уникальный белок из 93 аминокислот, включающий 18 основных аминокислотных последовательностей. Гибридизация пробы комплементарной ДНК Пс с ДНК Кл соматич. гибридов человека выявила 1000%-ное соответствие с Хр 8 человека и подтвердила расположение Пс на этой Хр. Гибридизация in situ метафазных Хр позволила уточнить местонахождение Пс в положении 8q21.1-22, поскольку 58% гранул, проявляемых на Хр 8, сконцентрированы в этой обл. Зона скопления гранул окружает точку поломки при транслокации с вовлечением полосы 8q22. Такая транслокация наблюдается у 18% б-ных острыми нелимфоидными лейкозами. Проводили гибридизацию с использованием ДНК соматич. гибридов человека, содержащих либо делецию 8q-, либо добавочное плечо 21q+, от 2 б-ных острыми нелимфоидными лейкозами. Сигнал появлялся только в случае делеции 8q-. США, Univ. of Texas M. D. Anderson Hosp. and Tumor Inst. at Houston. Библ. 37.
ГРНТИ : 76.29.49
Предметные рубрики: ХРОМОСОМЫ
ОБЛАСТЬ 8Q21.1-22
ДНК
БЕЛКИ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ЛЕЙКОЗ ХРОНИЧЕСКИЙ МИЕЛОИДНЫЙ
ЧЕЛОВЕК
Дата ввода:
16.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 94.03-04А3.498

Автор(ы) : Friemann, Andreas, Schmitz, Stefan
Заглавие : A new approach for displaying identities and differences among aligned amino acid sequences
Источник статьи : Comput. Appl. Biosci. - 1992. - Vol. 8, N 3. - С. 261-265
Аннотация: Предложен алгоритм подсчета степени сходства выравненных последовательностей аминокислот. Для каждой позиции определяется идентичный участок др. последовательности, и затем определяется среднее значение по окрестностям по всей последовательности. 2-й алгоритм определяет аналогичным образом отличия последовательностей. Оба удобны для реализации на микро-ЭВМ. Приведены примеры их использования на нитратредуктазах высших растений, показывающие быстродействие и высокую точность анализа. Германия, Botanisches Inst. der Univ. Bonn, D-5300 Bonn I. Ил. 2. Библ. 20.
ГРНТИ : 34.05.25
Предметные рубрики: ОБРАБОТКА ДАННЫХ
АЛГОРИТМЫ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ОТОБРАЖЕНИЕ
Дата ввода:
17.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 91.01-04Б4.251

Автор(ы) : Heuzenroeder Michael W., Elliot Trevor R., Thomas Connor J., Halter, Roman, Manning Paul A.
Заглавие : A new fimbrial type (PCF09) on enterotoxigenic Escherichia coli 09:HLT+ isolated from a case of infant diarrhea in Central Australia
Источник статьи : FEMS Microbiol Lett. - 1990. - Vol. 66, N 1-3. - С. 55-60
Аннотация: Исследовали некоторые молекулярные х-ки нового предполагаемого фактора колонизации, обозначенного PCF 09 и продуцируемого энтеротоксигенными Escherichia coli 09:Н выделенными при вспышке диареи у детей в Центральной Австралии, а также его генетический контроль. Основной белок PCF 09, полученный в чистом виде, имел мол. м. 27 кД и отличался по NH[2]-концевой последовательности от др. фимбриальных АГ (CS 5, PAP A, K99, К88АВ), хотя у них был выявлен общий аминокислотный состав. Установлен температурозависимый характер экспрессии PCF 09 и показано путем эл. микроскопии бактериальных клеток, маркированных частицами золота, что этот АГ обнаруживается на поверхности бактерий в виде фибрилл. Гены, детерминирующие синтез АГ PCF 09, были клонированы из хромосомной ДНК исходного шт. E. coli на фрагменте величиной 6,7 т. п. о. и построена физическая карта рекомбинантной плазмиды. Локализация гена, кодирующего синтез основной субъединицы PCF 09, на клонированном фрагменте ДНК определена с помощью синтетического олигонуклеотидного зонда. Библ. 26. Австралия, Dept. Microbiol. Immunol., Univ. Adelaide.
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ФАКТОРЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
КОЛОНИЗАЦИЯ
ФИМБРИИ
СТРУКТУРА
ПИЛИН
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ГЕНЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ЗОНДЫ
ДНК ГИБРИДИЗАЦИЯ
ЭЛЕКТРОННАЯ МИКРОСКОПИЯ
Дата ввода:
18.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.12-04А3.988

Автор(ы) : Dopazo, Joaquin
Заглавие : A new index to find regions showing an unexpected variability or conservation in sequence alignments
Источник статьи : Comput. Appl. Biosci. - 1997. - Vol. 13, N 3. - С. 313-317
Аннотация: Разработаны показатели для идентификации областей неожиданной вариабельности или консерватизма при выравнивании аминок-тных последовательностей белков. Индекс основан на определении наблюдаемого и ожидаемого уровней вариабельности с использованием табличных данных о вероятности аминок-тных замен. Испания, Dep. Bioinformatica, TDI, c/Severo Ochoa S/N, Edificio B3, Nave 103, 28100 Alcobendas, Madrid. Библ. 15
ГРНТИ : 34.05.25
Предметные рубрики: БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫРАВНИВАНИЕ
ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ И КОНСЕРВАТИЗМ
ВЫЯВЛЕНИЕ
ИНДЕКС
РАЗРАБОТКА
МЕТОДЫ
Дата ввода:
19.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.02-04А3.907

Автор(ы) : Yang, Ziheng, Kumar, Sudhir, Nei, Masatoshi
Заглавие : A new method of inference of ancestral nucleotide and amino acid sequences
Источник статьи : Genetics. - 1995. - Vol. 141, N 4. - С. 1641-1650
Аннотация: Предложена статистическая модель, позволяющая на основе эмпирических баз данных выстраивать предковые нуклеотидные (генные) или аминокислотные (полипептидные) последовательности. Предлагаемая модель основана на расчислении вероятностей точковых (нуклеотидных - смысловых или несмысловых) замен и вероятностей дивергенции вариантов эволюционирующих последовательностей. Апробация разработанного метода проведена на материале параметров лизоцимов-c у 6 млекопитающих с использованием методов максимального правдоподобия и парсимонии;в целом отмечено хорошее совпадение с реальным филогенезом этих таксономических групп. Определены максимальные вероятности точности метода всех аминокислот в отдельных узлах выстраиваемой филогенетической схемы - 0,73-0,91; точность метода парсимонии 0,51-0,84. Для 4 последовательностей метод максимального правдоподобия дает результат 91,3':-'98,7%. США, Dep. Integr. Biol., Univ. California, Berkeley, CA 94720-3140; e-mail - ziheng
ГРНТИ : 34.05.25
Предметные рубрики: НУКЛЕОТИДНЫЕ ПРЕДКОВЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВОССТАНОВЛЕНИЕ
МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ
Дата ввода:
20.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 05.08-04А3.532

Автор(ы) : Sugie, Takashige, Horita, Keiji, Hosono, Satoru, Ito, Tomoyoshi, Ebisuzaki, Toshikazu
Заглавие : A special-purpose computer for exploring similar protein sequences by the dynamic programming method
Источник статьи : Comput. Phys. Commun. - 2004. - Vol. 157, N 1. - С. 1-8
Аннотация: Создан специализированный компьютер BIOLER-1 для исследования сходных аминокислотных последовательностей белков методом динамического программирования. Он может устанавливать сходство между последовательностями двух белков длиной до 1024 остатков. Описана конструкция BIOLER-1, подсоединяемого к персональному компьютеру. Его производительность составляет 3564 миллиона команд в 1 с, что втрое быстрее, чем у персонального компьютера с Pentium 4 с частотой 1,8 ГГц. Япония, Dep. Electronics & Mech. Eng., Chiba Univ., 1-33 Yayoi, Inage, Chiba 263-8522. Библ. 18
ГРНТИ : 34.05.25
Предметные рубрики: БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
УСТАНОВЛЕНИЕ СХОДСТВА
СПЕЦИАЛИЗИРОВАННЫЙ КОМПЬЮТЕР BIOLER-1
МЕТОД ДИНАМИЧЕСКОГО ПРОГРАММИРОВАНИЯ
Дата ввода:
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)