СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Schuler, Dirk$<.>)

Общее количество найденных документов : 21
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-21

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.10-04Б2.20

Автор(ы) : Spring, Stefan, Amann, Rudolf, Ludwig, Wolfgang, Schleifer, Karl-Heinz, Schuler, Dirk, Poralla, Karl, Petersen, Nikolai
Заглавие : Phylogenetic analysis of uncultured magnetotactic bacteria from the alpha-subclass of Proteobacteria
Источник статьи : Syst. and Appl. Microbiol. - 1995. - Vol. 17, N 4. - С. 501-508
Аннотация: Из осадков различных пресных водоемов в Германии выделены накопительные культуры бактерий, обладающих магнитотаксисом; по морфологии 9 из них являются кокками, а одна характеризуется палочковидными клетками. На основании рез-тов секвенирования 16S рДНК и использования флуоресциирующих олигонуклеотидных зондов обсуждается их таксономическое положение и филогенетические связи. Установлено, что бактерии принадлежат к альфа-подклассу класса Proteobacteria, образуя в нем самостоятельную ветвь. Констатировано значительное филогенетическое разнообразие обладающих магнитотаксисом кокков. Германия, Lehrstuhl fur Mikrobiol., Technishe Univ. Munchen, D-80290 Munchen. Библ. 29
ГРНТИ : 34.27.15
Предметные рубрики: PROTEOBACTERIA (BACT.)
МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
ТАКСОНОМИЯ
ФИЛОГЕНИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 96.10-04Б2.4

Автор(ы) : Schuler, Dirk, Uhl, Rainer, Bauerlein, Edmund
Заглавие : A simple light scattering method to assay magnetism in Magnetospirillum gryphiswaldense
Источник статьи : FEMS Microbiol. Lett. - 1995. - Vol. 132, N 1-2. - С. 139-145
Аннотация: Разработан простой оптический метод для определения клеточного магнетизма в культуре магнитных бактерий р. Magnetospirillum. При помещении в магнитное поле клетки выстраиваются параллельно его линиям, что вызывает изменение светорассеяния. Соотношение величин светорассеяния при разных углах магнитного поля характеризует среднюю магнитную ориентацию клеток, к-рая, как оказалось, коррелирует со средним числом частиц в клетках магнитных бактерий. Предложенный метод позволяет легко и быстро прослеживать динамику образования магнетита в растущих культурах M. gryphiswaldense. Германия, Max-Planck-Inst. fur Biochemie, Abt. Membranbiochemie, D-82 152 Martinsried. Библ. 17
ГРНТИ : 34.27.05
Предметные рубрики: МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
МАГНЕТИТ
МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.07-04Б2.21

Автор(ы) : Schuler, Dirk, Baeuerlein, Edmund
Заглавие : Iron-limited growth and kinetics of iron uptake in Magnetospirilum gryphiswaldense
Источник статьи : Arch. Microbiol. - 1996. - Vol. 166, N 5. - С. 301-307
Аннотация: Рост и образование магнетита у Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 максимальны при внеклеточной конц-ии железа (I) 15-20 мкМ. Включение I происходит медленно, процесс подобен диффузии. Хелаторы I, включая сидерофоры микроорганизмов, не могут ускорять транспорт I в клетки. Отработанная культуральная жидкость стимулирует поглощение ионов I истощенными по I клетками, а свежая среда и буфер - не стимулируют. В отработанной жидкости не удалось обнаружить сидерофороподобных веществ с использованием анализа с хром-азуролом S. Поглощение иона I описывается кинетикой Михаэлиса-Ментен с К[м] 3 мкМ и V[max] 0,86 нмоль мин{-1} мг сухой массы{-1}, следовательно, транспортная система имеет относительно низкое сродство, но высокую скорость. Включение I чувствительно к 2,4-динитрофенолу и карбонилцианид-м- хлорфенилгидразону (что указывает на энергозависимость системы). Германия, [E. Baeuerlein], M.-P.-I. fur Biochem., Abteilung Membranenbiochemie, D-82152 Martinsried. Библ. 33
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
ШТАММ MSR-1
МАГНЕТИТ
ОБРАЗОВАНИЕ
ЖЕЛЕЗО
ПОГЛОЩЕНИЕ
КИНЕТИКА
ТРАНСПОРТНАЯ СИСТЕМА
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 97.07-04Б3.35

Автор(ы) : Schuler, Dirk, Baeuerlein, Edmund
Заглавие : Iron-limited growth and kinetics of iron uptake in Magnetospirilum gryphiswaldense
Источник статьи : Arch. Microbiol. - 1996. - Vol. 166, N 5. - С. 301-307
Аннотация: Рост и образование магнетита у Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 максимальны при внеклеточной конц-ии железа (I) 15-20 мкМ. Включение I происходит медленно, процесс подобен диффузии. Хелаторы I, включая сидерофоры микроорганизмов, не могут ускорять транспорт I в клетки. Отработанная культуральная жидкость стимулирует поглощение ионов I истощенными по I клетками, а свежая среда и буфер - не стимулируют. В отработанной жидкости не удалось обнаружить сидерофороподобных веществ с использованием анализа с хром-азуролом S. Поглощение иона I описывается кинетикой Михаэлиса-Ментен с К[м] 3 мкМ и V[max] 0,86 нмоль мин{-1} мг сухой массы{-1}, следовательно, транспортная система имеет относительно низкое сродство, но высокую скорость. Включение I чувствительно к 2,4-динитрофенолу и карбонилцианид-м- хлорфенилгидразону (что указывает на энергозависимость системы). Германия, [E. Baeuerlein], M.-P.-I. fur Biochem., Abteilung Membranenbiochemie, D-82152 Martinsried. Библ. 33
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
ШТАММ MSR-1
МАГНЕТИТ
ОБРАЗОВАНИЕ
ЖЕЛЕЗО
ПОГЛОЩЕНИЕ
КИНЕТИКА
ТРАНСПОРТНАЯ СИСТЕМА
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 99.01-04Б3.54

Автор(ы) : Schuler, Dirk, Baeuerlein, Edmund
Заглавие : Dynamics of iron uptake and Fe[3]O[4] biomineralization during aerobic and microaerobic growth of Magnetospirillum gryphiswaldense
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 1. - С. 159-162
Аннотация: С помощью радиоактивного и оптического (основанного на светорассеянии клеток в магнитном поле) методов исследовали поглощение Fe{3+} и образование магнетита (Fe[3]O[4]) клетками Magnetospirillum gryphiswaldense. Обнаружено, что образование магнетита сопряжено с интенсивным поглощением Fe{3+} и происходит только в микроаэробных условиях, при конц-ии O[2] от 2 до 7 мкМ (при 30'ГРАДУС'C). Клетки запасали до 2% Fe в виде магнетита, локализованного во внутрицитоплазматических везикулах. Число кристаллов магнетита диаметром 42-45 нм на клетку достигало 60. Германия, Abteilung Membranbiochemie, Max-Planck-Inst. fur Biochemie, D-82152 Martinsrieg. Библ. 20
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
АЭРОБНЫЙ РОСТ
ЖЕЛЕЗО (III)
ПОГЛОЩЕНИЕ
МАГНЕТИТ
ОБРАЗОВАНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.02-04Б2.16

Автор(ы) : Schuler, Dirk, Baeuerlein, Edmund
Заглавие : Dynamics of iron uptake and Fe[3]O[4] biomineralization during aerobic and microaerobic growth of Magnetospirillum gryphiswaldense
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 1. - С. 159-162
Аннотация: С помощью радиоактивного и оптического (основанного на светорассеянии клеток в магнитном поле) методов исследовали поглощение Fe{3+} и образование магнетита (Fe[3]O[4]) клетками Magnetospirillum gryphiswaldense. Обнаружено, что образование магнетита сопряжено с интенсивным поглощением Fe{3+} и происходит только в микроаэробных условиях, при конц-ии O[2] от 2 до 7 мкМ (при 30'ГРАДУС'C). Клетки запасали до 2% Fe в виде магнетита, локализованного во внутрицитоплазматических везикулах. Число кристаллов магнетита диаметром 42-45 нм на клетку достигало 60. Германия, Abteilung Membranbiochemie, Max-Planck-Inst. fur Biochemie, D-82152 Martinsrieg. Библ. 20
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
АЭРОБНЫЙ РОСТ
ЖЕЛЕЗО (III)
ПОГЛОЩЕНИЕ
МАГНЕТИТ
ОБРАЗОВАНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.10-04Б2.172

Автор(ы) : Schuler, Dirk, Spring, Stefan, Bazylinski Dennis A.
Заглавие : Improved technique for the isolation of magnetotactic spirilla from a freshwater sediment and their phylogenetic characterization
Источник статьи : Syst. and Appl. Microbiol. - 1999. - Vol. 22, N 3. - С. 466-471
Аннотация: Для выделения микроанаэрофильных магнетотактич. спирилл из пресноводных осадков использовали разделение от немагнетотактич. бактерий активной миграцией вдоль силовых линий магнитного поля в капиллярах и последующую инокуляцию в 2-слойную среду с противоположными градиентами конц-ий O[2] и сульфида. Выделено несколько штаммов, к-рые по морфологии, физиологии и почти полным последовательностям гена рРНК 16S отнесены к p. Magnetospirillum. 5 изолятов близкородственны описанным ранее видам (гомология более 99%), а 2 представляют третий филогенетич. кластер в этом роде. Германия, Max-Planck-Inst. Marine Mirobiol., D-28359 Bremen. Библ. 28
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: MAGNETOSPIRILLUM (BACT.)
МАГНЕТОТАКТИЧЕСКИЕ СПИРИЛЛЫ
ПРЕСНОВОДНЫЕ ОСАДКИ
ВЫДЕЛЕНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА
ГЕН РРНК 16S
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.02-04Б2.298

Автор(ы) : Schubbe, Sabrina, Kube, Michael, Scheffel, Andre, Wawer, Cathrin, Heyen, Udo, Meyerdierks, Anke, Madkour Mohamed H., Mayer, Frank, Reinhard, Richard, Schuler, Dirk
Заглавие : Characterization of a spontaneous nonmagnetic mutant of Magnetospirillum gryphiswaldense reveals a large deletion comprising a putative magnetosome island
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, N 19. - С. 5779-5790
Аннотация: Спонтанную утрату магнитного фенотипа наблюдали в культурах стационарной фазы бактерии Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1. Выделили и охарактеризовали немагнитный мутант MSR-1B, у которого отсутствовали магнитные кристаллы и внутренние мембранные везикулы. Штамм характеризовался ухудшением роста при любых условиях и снижением аккумуляции железа. Идентифицировали большую хромосомную делецию в 80 т. п. н., которая включала кластеры mamAB и mamDC, а также опероны, кодирующие белки, связанные с магнитными свойствами. Из геномной библиотеки M. gryphiswaldense выделили клон, частично перекрывающий район делеции. Секвенирование этого фрагмента выявило тесную связь генов mam с генами, кодирующими другие белки магнетосомы. Этот район был также богат инсерционными элементами и генами неизвестных семейств, по-видимому, специфичных для магнитотактильных бактерий. Сделан вывод о наличии большого магнитосомного острова в M. gryphiswaldense и других родственных бактерий. Германия, Max-Planck-Inst. fur Marine Microbiol., 28359 Bremen. Библ. 53
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ОРГАНЕЛЛЫ
МАГНИТОСОМЫ
СИНТЕЗ
БЕЛОК
БЕЛКИ МАГНИТОСОМ MAMAB, MAMDC
ФУНКЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕНЫ СИНТЕЗА МАГНИТОСОМ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
MAGNETOSPRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.11-04Б2.119

Автор(ы) : Flies Christine B., Peplies, Jorg, Schuler, Dirk
Заглавие : Combined approach for characterization of uncultivated magnetotactic bacteria from various aquatic environments
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 71, N 5. - С. 2723-2731
Аннотация: Активная миграция магнитных бактерий (MB) вдоль линий магнитного поля обеспечивает уникальную возможность определения, очистки и накопления этих организмов из внешней среды. Некультивируемые МВ могут быть селективно отделены от частиц донных осадков и не МБ с помощью магнитного обогащения и капиллярного метода "race track" очистки. Использовали рестрикционный анализ амплифицированной рДНК и DGGE (электрофорез в денатурирующем градиенте геля) в сочетании с анализом последовательности 16S рРНК. Используя эти методы очистки, изучали распространение и разнообразие МВ в микрокосмах из различных морских и пресноводных местообитаний с помощью микроскопических, молекулярных и культуральных методов. В большинстве микрокосмов доминировали магнитные кокки. Большинство последовательностей 16S рРНК (к-рые были определены) объединялись с отдельным кластером внутри 'альфа'-Proteobacteria. Внутри этой линии родства уровни дивергенции последовательностей были 1-11%, показывая разнообразие на уровне рода среди магнитных кокков из различных микрокосмов, а также среди MB из различных стадий сукцессии одних и тех же микрокосмов. Состав сообщества в микрокосмах, подвержен серьезной сукцессии в течение инкубации, и в микрокосмах из одних и тех же местообитаний наблюдали значительную неоднородность. Новая магнитная палочковидная бактерия (MHB-1) была обнаружена в образце донных отложений из озера в сев. Германии с помощью флуоресцентной гибридизации in situ. MHB-1 отнесен к филуму Nitrospira, обнаружив 91% сходства последовательностей 16S рРНК с "Magnetobacterium bavaricum". Интенсивные попытки культивирования потерпели неудачу при выделении MHB-1, так же как и др. MB, присутствующих в изучаемых образцах. Однако, хотя магнитные спириллы не часто обнаруживались в накопительных культурах, 10 новых изолятов р. Magnetospirillum, к-рые обычными рутинными методами не выделялись ранее в виде чистых культур, были получены. Германия, Max Planck Inst. for Marine Microbiology, 28359 Bremen. Библ. 43
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ВОДНЫХ МЕСТООБИТАНИЙ
ОЧИСТКА
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
MAGNETOSPIRILLUM (BACT.)
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 05.11-04Б3.32

Автор(ы) : Flies Christine B., Peplies, Jorg, Schuler, Dirk
Заглавие : Combined approach for characterization of uncultivated magnetotactic bacteria from various aquatic environments
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 71, N 5. - С. 2723-2731
Аннотация: Активная миграция магнитных бактерий (MB) вдоль линий магнитного поля обеспечивает уникальную возможность определения, очистки и накопления этих организмов из внешней среды. Некультивируемые МВ могут быть селективно отделены от частиц донных осадков и не МБ с помощью магнитного обогащения и капиллярного метода "race track" очистки. Использовали рестрикционный анализ амплифицированной рДНК и DGGE (электрофорез в денатурирующем градиенте геля) в сочетании с анализом последовательности 16S рРНК. Используя эти методы очистки, изучали распространение и разнообразие МВ в микрокосмах из различных морских и пресноводных местообитаний с помощью микроскопических, молекулярных и культуральных методов. В большинстве микрокосмов доминировали магнитные кокки. Большинство последовательностей 16S рРНК (к-рые были определены) объединялись с отдельным кластером внутри 'альфа'-Proteobacteria. Внутри этой линии родства уровни дивергенции последовательностей были 1-11%, показывая разнообразие на уровне рода среди магнитных кокков из различных микрокосмов, а также среди MB из различных стадий сукцессии одних и тех же микрокосмов. Состав сообщества в микрокосмах, подвержен серьезной сукцессии в течение инкубации, и в микрокосмах из одних и тех же местообитаний наблюдали значительную неоднородность. Новая магнитная палочковидная бактерия (MHB-1) была обнаружена в образце донных отложений из озера в сев. Германии с помощью флуоресцентной гибридизации in situ. MHB-1 отнесен к филуму Nitrospira, обнаружив 91% сходства последовательностей 16S рРНК с "Magnetobacterium bavaricum". Интенсивные попытки культивирования потерпели неудачу при выделении MHB-1, так же как и др. MB, присутствующих в изучаемых образцах. Однако, хотя магнитные спириллы не часто обнаруживались в накопительных культурах, 10 новых изолятов р. Magnetospirillum, к-рые обычными рутинными методами не выделялись ранее в виде чистых культур, были получены. Германия, Max Planck Inst. for Marine Microbiology, 28359 Bremen. Библ. 43
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ВОДНЫХ МЕСТООБИТАНИЙ
ОЧИСТКА
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
MAGNETOSPIRILLUM (BACT.)
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.12-04Б2.253

Автор(ы) : Schultheiss, Daniel, Schuler, Dirk
Заглавие : Development of a genetic system for Magnetospirillum gryphiswaldense
Источник статьи : Arch. Microbiol. - 2003. - Vol. 179, N 2. - С. 89-94
Аннотация: Генетический анализ биоминерализации бактериальных магнетосом затруднен из-за отсутствия приемлемой методологии культивирования и генетических манипуляций для большинства бактерий, проявляющих магнитотаксис. Предлагается генетическая система для Magnetospirillum gryphiswaldense, включающая технику посева, которая обеспечивает скрининг "магнитных" и "немагнитных" колоний, а также протокол переноса чужеродной ДНК электропорацией и высоко-эффективной конъюгации. Показано, что различные векторы с широким спектром хозяев, относящиеся к группам IncQ, IncP и pBBR1, способны реплицироваться в клетках M. gryphiswaldense, также идентифицированы маркеры устойчивости к антибиотикам, которые могут быть экспрессированы в этих бактериях. Tn5 транспозоны, доставленные суицидными плазмидами, были обнаружены в виде инсерций в случайных хромосомных сайтах
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТАКСИС
МАГНИТОТАКСИС
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
БИОМИНЕРАЛИЗАЦИЯ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
МЕТОДЫ
МАГНИТНЫЕ КОЛОНИИ
НЕМАГНИТНЫЕ КОЛОНИИ
СКРИНИНГ
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.07-04Б2.42

Автор(ы) : Schuler, Dirk
Заглавие : Molecular analysis of a subcellular compartment: the magnetosome membrane in Magnetospirillum gryphiswaldense
Источник статьи : Arch. Microbiol. - 2004. - Vol. 181, N 1. - С. 1-7
Аннотация: Проводили биохимический и генетический анализ функций магнитосомоных мембранных белков (ММБ) в процессе биоминерализации магнетита, экспрессии кодирующих их генов и локализации в ходе роста бактерий. У Magnitospirillum gryphiswaldense мембрана магнитосом имеет определенный биохимический состав и содержит комплекс специфических ММБ. Одни классы ММБ включают белки, ответственные за направленный в магнитосомы транспорт и связывание железа, образование ядер кристаллизации и сборку магнитосомных мембранных мультибелковых комплексов. Другие ММБ включают белковые семейства с еще неизвестной функцией, вероятно, консервативной среди других магнитных бактерий. Гены mam и mms кодируют большинство ММБ, их кластеры образуют несколько оперонов, являющихся частью большого нестабильного района генома, представляющего предположительно магнитосомный остров
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: МАГНИТОСОМЫ
МАГНИТОСОМНЫЕ МЕМБРАННЫЕ БЕЛКИ
ФУНКЦИИ
БИОМИНЕРАЛИЗАЦИЯ МАГНЕТИТА
ТРАНСПОРТ ЖЕЛЕЗА
MAGNITOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.01-04Б2.9

Автор(ы) : Wurdemann, Chris, Peplies, Jorg, Schubbe, Sabrina, Ellrott, Andreas, Schuler, Dirk, Glockner, Frank Oliver
Заглавие : Evaluation of gene expression analysis using RNA-targeted partial genome arrays
Источник статьи : Syst. and Appl. Microbiol. - 2006. - Vol. 29, N 5. - С. 349-357
Аннотация: Методическая работа, посвященная постоянно нарастающему объему работ по прямому обнаружению РНК или аРНК (амплифицированной РНК), что позволяет обойти зависимость получения молекулярных препаратов от специфических ферментов. Авторы оценивали степень неспецифического связывания олигонуклеотидных микроматриц, созданных для профилирования экспрессии суммарной РНК. Для этой цели применяли модельную систему, включающую 70-звенные пробы, ориентированные на гены mam. Эти гены участвуют в образовании магнитосом у бактерии Magnetospirillum gryphiswaldense. Испытывали штамм дикого типа MSR-1 и его изогенный мутант MSR-1B с выпадением всех генов mam. Использовали подход с применением прямого химического мечения суммарной клеточной РНК. Наблюдали линейную корреляцию между кол-вом использованной РНК и средней всеобщей фоновой интенсивностью. Она обеспечивала простой и объективный путь нормализации данных. Рез-ты, полученные на мутанте MSR-1B, выявили большое число ошибочных положительных сигналов даже в оптимальных условиях гибридизации. Это указывало на высокую степень неспецифического связывания в опытах с наборами микроматриц в случае применения более длинных олиго- или полинуклеотидов и РНК в кач-ве молекулы мишени. Провели сравнительный анализ культуры MSR-1B и двух культур MSR-1 (дикого типа). Их выращивали в разных условиях и применяли метод трехцветной гибридизации. Дополнительные данные, полученные по MSR-1B-транскриптому, выявили отличающуюся экспрессию генов у двух культур MSR-1. Различить их иными способами было невозможно. Германия, Max Plank Inst. for Marine Microbiol., 28359 Bremen (E-mail: fog
ГРНТИ : 34.27.05
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ MAM
УЧАСТИЕ В ОБРАЗОВАНИИ МАГНИТОСОМ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
ШТАММ ДИКОГО ТИПА
ИЗОГЕННЫЙ МУТАНТ
РНК
СУММАРНАЯ КЛЕТОЧНАЯ РНК
ХИМИЧЕСКОЕ МЕЧЕНИЕ
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.04-04Б2.206

Автор(ы) : Schubbe, Sabrina, Wurdemann, Chris, Peplies, Jorg, Heyen, Udo, Wawer, Cathrin, Glockner, Frank Oliver, Schuler, Dirk
Заглавие : Transcriptional organization and regulation of mangetosome operons in Magnetospirillum gryphiswaldense
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 72, N 9. - С. 5757-5765
Аннотация: В клетках магнетотоксической спириллы Magnetospirillum gryphiswaldense гены, участвующие в биоминерализации магнетита (Fe[3]O[4]), сосредоточены в островке магнетосомы. С помощью ПЦР с обратной транскрипцией показана котранскрипция генов внутри кластеров mamAB, mamDC и mms. Сайты инициации транскрипции оперонов mamAB, mamDC и mms маркированы на 22 п. н., 52 п. н. и 58 п. н. перед первым геном кластера, соответственно. Показано наличие -10 и -35 box в промоторах этих оперонов, они близки канонической последовательности узнавания сигма 70. При сравнении реакции магнитных бактерий и немагнитного мутантного штамма на железо или кислород установлено, что экспрессия генов mam и mms подавляется в мутантных клетках при недостатке железа и в меньшей степени при аэробном росте по сравнению с образующими магнетит клетками, выращиваемыми в условиях микроаэрации и при достаточном количестве железа. Германия, Max Planck Inst. Marine Microbiol., Dept. Mocrobiol., Celsiusstr. 1, 28359 Bremen. Библ. 38
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕНЫ МАГНЕТОСОМЫ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
ЖЕЛЕЗО
КИСЛОРОД
МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
МАГНЕТИТ
БИОМИНЕРАЛИЗАЦИЯ
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.01-04Б2.2

Автор(ы) : Lang, Claus, Schuler, Dirk
Заглавие : Expression of green fluorescent protein fused to magnetosome proteins in microaerophilic magnetotactic bacteria
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 74, N 15. - С. 4944-4953
Аннотация: Магнитосомы бактерий - органеллы, состоящие из кристаллов магнетита, окруженных фосфолипидным бислоем с серией белков, обладающих различными функциями. Они нашли широкое применение, обычно после присоединения функциональных молекул к мембране магнитосом. Изучалась возможность использования белка с зеленой флуоресценцией (GFP) как репортера локализации белков магнитосом. Слитые с GFP белки MamC, MamF и MamG были экспрессированы в Magnetospirillum gryphiswaldense. Хотя оптимальные условия синтеза магнетита и флуорофора были взаимоисключающие, удалось подобрать подходящие условия (с ограничением по кислороду) для одновременного роста, биоминерализации магнетита и образования GFP флуорофора. Все слитые белки были локализованы на мембране магнитосом, но наиболее выраженной экспрессией и флуоресценцией характеризовался MamC-GFP. Белок MamC может использоваться как "якорь" для дисплея гетерологичных белков на магнитосомах. Германия, Ludwig-Maximillians-Univ. Munchen, Dep. Biol. I, Bereich Mikrobiol., Maria-Ward-Str., Ia, 80638 Munich. Библ. 56
ГРНТИ : 34.27.05
Предметные рубрики: МАГНИТОСОМЫ
ФУНКЦИОНАЛИЗАЦИЯ
АНАЛИЗ ЛОКАЛИЗАЦИИ БЕЛКОВ
GFP КАК РЕПОРТЕР
MAMC КАК "ЯКОРЬ"
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
ГИБРИДНЫЕ БЕЛКИ
СЛИТЫЕ С GFP БЕЛКИ МАГНИТОСОМ
ЭКСПРЕССИЯ
Дата ввода:

16.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.01-04Б2.168

Автор(ы) : Lin, Wei, Li, Jinhua, Schuler, Dirk, Jogler, Christian, Pan, Yongxin
Заглавие : Diversity analysis of magnetotactic bacteria in Lake Miyun, northern China, by restriction fragment length polymorphism
Источник статьи : Syst. and Appl. Microbiol. - 2009. - Vol. 32, N 5. - С. 342-350
Аннотация: In silico определена эффективность действия 12 наборов традиционно используемых рестриктаз для анализа полиморфизма длины фрагментов рестрикции магнитных бактерий, для этого из GenBank были взяты 23 последовательности генов рРНК 16S этих организмов. Показано, что наиболее эффективной для выявления операционных таксономических единиц последовательностей генов 16S рРНК магнитных бактерий является пара рестриктаз - MspI и RsaI. После обогащения микробного сообщества во взятых образцах придонного осадка озера Miyun магнитными бактериями, проводили амплификацию генов 16S рРНК, амплифицированные продукты клонировали с помощью вектора pMD19-T. Трансформированные клетки наносили на агаровые пластины и отбирали колонии со вставками гена 16S рРНК, которые затем амплифицировали с праймерами, специфичными к плазмиде pMD19-T. Продукты ПЦР обрабатывали смесью рестриктаз и разделяли в 4% агарозе электрофорезом. В исследуемых образцах было обнаружено 8 операционных таксономических единиц, 5 из них принадлежат Alphaproteobacteria, а остальные - к филуму Nitrospira. Операционные таксономические единицы C, D и I на 91,8-98,4% сходны с "Magnetobacterium bavariucum". КНР, Biogeomagnetism Group, Paleomagnetism & Geochronology Lab., St. Key Lab. Lithospheric Evolution, Inst. Geol. & Geophys., Chinese Acad. Sci., Beijing 100029. Библ. 49
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: МАГНИТОТАКСИС
ГЕНЫ
ГЕНЫ 16S РРНК
РЕСТРИКЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ПОЛИМОРФИЗМ ДЛИНЫ ФРАГМЕНТОВ РЕСТРИКЦИИ
ТАКСОНОМИЯ
ОПЕРАЦИОННЫЕ ТАКСОНОМИЧЕСКИЕ ЕДИНИЦЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
MAGNITOBACTERIUM (BACT.)
Дата ввода:

17.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.03-04Б2.78

Автор(ы) : Ullrich, Susanne, Schuler, Dirk
Заглавие : Cre-lox-based method for generation of large deletions within the genomic magnetosome island of Magnetospirillum gryphiswaldense
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 2010. - Vol. 76, N 8. - С. 2439-2444
Аннотация: Разработали метод получения делеций на основе Cre-lox, позволяющий эксцизию больших геномных фрагментов в Magnetospirillum gryphiswaldense. Две конъюгативные суицидальные плазмиды, несущие сайты lox, фланкирующие ген-мишень, последовательно вставили в хромосому путем гомологичной рекомбинации. Эксцизию сегмента хромосомы маркеров устойчивости индуцировали экспрессией in trans Cre-рекомбиназы, Хелперную плазмиду Cre затем удалили из делетируемого штамма путем отбора с помощью антибиотиков. Использовали этот метод для получения делеций 16,3 т.п.н., 61 т.п.н. и 67,3 т.п.н. фрагментов из геномного магнетосомного острова M. gryphiswaldense (MAI), либо с помощью одного цикла, либо с последующим циклом делеций, перекрывающим район 'ЭКВИВ' 87 т.п.н., включающий опероны mamAB, mms6 и mamGFDC. Германия, Ludwig-Maximillians-Univ. Munchen, Dep. Biologie I., Bereich Mikrobiologie, Biozentrum der LMU, Groshadernestr. 4, Planegg-Martinsried
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ДЕЛЕЦИИ
ПОЛУЧЕНИЕ
ГЕНОМНЫЕ ФРАГМЕНТЫ
ЭКСЦИЗИЯ
МАГНЕТОСОМНЫЙ ОСТРОВ
ГЕНЫ
ФУНКЦИИ
АНАЛИЗ
МЕТОДЫ
ОСНОВА CRE-LOX
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
Дата ввода:

18.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.06-04Б2.177

Автор(ы) : Uebe, Rene, Voigt, Brigit, Schweber, Thomas, Albrecht, Dirk, Katzmann, Emanuel, Lang, Claus, Bottger, Lars, Matzanke, Berthold, Schuler, Dirk
Заглавие : Deletion of a fur-like gene affects iron homeostasis and magnetosome formation in Magnetospirillum gryphiswaldense
Источник статьи : J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 16. - С. 4192-4204
Аннотация: Начато исследование компонентов основного метаболизма железа и их вклада в биоминерализацию магнетита у Magnetospirillum gryphiswaldense. Проведено сравнение содержания внутриклеточных метаболитов железа и профилей экспрессии генов мутанта с делецией в гене, гомологичном гену основного регулятора потребления железа fur, и клеток дикого типа. Установлено, что Fur является глобальным регулятором ответа на ионы железа у этих бактерий, а также влияет на образование магнетосом. Германия, Ludwig-Maximillians-Univ. Munchen, Dept. Biol I, Beriech Mikrobiol., Biozentrum der LMU, Grosshaderterstr. 4. Библ. 79
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: МЕТАБОЛИЗМ
ЖЕЛЕЗО
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН FUR
ГЛОБАЛЬНЫЙ РЕГУЛЯТОР ОТВЕТА
БЕЛОК FUR
МАГНЕТОСОМЫ
ОБРАЗОВАНИЕ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACH.)
Дата ввода:

19.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.01-04Б2.181

Автор(ы) : Uebe, Rene, Junge, Katja, Henn, Verena, Poxleitner, Gabriele, Katzmann, Emanuel, Plitzko Jurgen M., Zarivach, Raz, Kasama, Takeshi, Wanner, Gerhard, Posfai, Mihaly, Bottger, Lars, Matzanke, Berthold, Schuler, Dirk
Заглавие : The cation diffusion facilitator proteins MamB and MamM of Magnetospirillum gryphiswaldense have distinct and complex functions, and are involved in magnetite biomineralization and magnetosome membrane assembly
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 2011. - Vol. 82, N 4. - С. 818-835
Аннотация: Показали, что белки MamB и MamM, облегчающие диффузию катионов Magnetospirillum gryphiswaldense, участвуют в нескольких этапах образования магнитосомы. Оба белка важны для биоминерализации, но только делеция mamB ведет к потере магнитосомных мембранных везикул. Стабильность MamB зависит от присутствия MamM при образовании гетеродимерного комплекса. MamB взаимодействует с несколькими белками, включая домен PDZ1 MamE. Любая генетическая модификация MamB ведет к потере функции, а сайт-специфичный мутагенез внутри MamM ведет к усиленному образованию магнитных частиц. Полученные данные свидетельствуют, что MamB и MamM имеют сложные функции и участвуют в контроле ключевых этапов образования магнитосомы благодаря их взаимодействию. Германия, Ludwig Maximillian Univ. Munich, Dept. Biol. I., Grosshademer Str., 2, D-82152 Martinsried
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: МАГНИТОСОМЫ
МЕМБРАННЫЕ
СБОРКА
БИОМИНЕРАЛИЗАЦИЯ
БЕЛОК
MAMB
MAMM
ФУНКЦИЯ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
Дата ввода:

20.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 92.04-04В2.034

Автор(ы) : Schleifer, Karl Heinz, Schuler, Dirk, Spring, Stefan, Weizenegger M., Amann R., Ludwig, Wolfgang, Kohler, Manfred
Заглавие : The genus Magnetospirillum gen. nov. description of magnetospirillum gryphiswaldense sp. nov. and transfer of Aquaspirillum magnetotacticum to Magnetospirillum magnetotacticum comb. nov
Источник статьи : Sys. and Appl. Microbiol. - 1991. - Vol. 14, N 4. - С. 379-286
Аннотация: Из евтрофной реки в Германии выделена новая бактерия (штамм MSR-1), обладающая магнитотаксисом. В рез-те сравнительного изучения морфологии, ультраструктуры, биохимич. признаков и секвенирования 16S рРНК (16 S рДНК) установлено, что MSR-1 близок к Aquaspirillum magnetotacticum, и оба вида существенно отличаются от др. представителей р. Aquaspirillum. Более того, они относятся к 'альфа'-подклассу Proteobacteria, а A. serpens (типовой вид р. Aquaspirillum) - к 'бета'-подклассу. Поэтому авт. предлагают выделить MSR-1 и A. magnetotacticum в новый род Magnetospirillum в качестве M. gryphiswaldense sp. nov. и M. magnetotacticum, соответственно, и дают его описание. Спириллы (0,2- 0,7*1-20 мкм), грамотрицательные, подвижные благодаря наличию биполярных жгутиков. В цитоплазме содержатся цепочки магнетосом. Микроаэрофилы. Хемоорганотрофы. Содержат или не содержат каталазу и оксидазу. Растут в рез-те использования органич. к-т, редко углеводов. Содержание ГЦ в ДНК 64-71%. Тип, вид M. gryphiswaldense с типовым штаммом MSR-1. Библ. 30. ФРГ, Lehrstuhl fur Mikrobiol., Technische Univ. Munchen, W 8000 Munchen 2.
ГРНТИ : 34.27.15
Предметные рубрики: НОВЫЕ РОДЫ
МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
MAGNETOSPIRILLUM MAGNETOTACTICUM (BACT.)
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
ШТАММ MSR-1
ГЕНОСИСТЕМАТИКА
ФИЛОГЕНИЯ
Дата ввода:

1-20 21-21

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска