СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Kowalski, David$<.>)

Общее количество найденных документов : 8
Показаны документы с 1 по 8

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.08-04Б1.177

Автор(ы) : Lin, Sluan, Kowalski, David
Заглавие : DNA helical instability facilitates initiation at the SV40 replication origin
Источник статьи : J. Mol. Biol. - 1994. - Vol. 235, N 2. - С. 496-507
Аннотация: Зона ori SV 40 включает 3 структурных домена - ранний палиндром (EP) из несовершенных обращенных повторов, повторяющийся пентануклеотид и AT-богатый домен (AT). По аналогии с E. coli и дрожжами, у к-рых в зоне ori ранее выявили т. наз. ДНК-расплетающий элемент (DUE) со спиральной нестабильностью, существование подобных элементов допустили и в ori SV 40. При расчете стабильности спирали различных участков вирусной ori обнаружили 2 зоны с аномально низкой стабильностью. Они совпали с доменами EP и AT, несмотря на существенную разницу в содержании AT - 60% у EP- и 100% у AT-домена. В то же время мутации, к-рые стабилизируют спираль ДНК, ухудшают эффективность ori SV 40, но это относится только к мутациям в EP-, но не AT-домене. Наиболее вероятным кандидатом на роль DUE-элемента является субдомен EP, совпадающий с ori двунаправленной репликации SV 40 in vivo и сайтом локального расплетания ДНК при связывании in vitro с T-антигеном. Размер этого DUE-элемента у SV 40 составляет всего 9 п. н., что существенно меньше, чем у E. coli (47) или дрожжей (40-100 п. н.). США, Mol. Biol. Dept, Roswell Park Canc. Inst., Buffalo, NY 14263. Библ. 54
ГРНТИ : 34.25.19
Предметные рубрики: ВИРУС SV40
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
ДНК
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.334

Автор(ы) : Lin, Sluan, Kowalski, David
Заглавие : Functional equivalency and diversity of cis-acting elements among yeast replication origins
Источник статьи : Mol. and Cell. Biol. - 1997. - Vol. 17, N 9. - С. 5473-5484
Аннотация: ДНК в зоне начала репликации Saccharomyces cerevisiae всегда содержит несколько коротких функциональных элементов, большинство из к-рых не консервативно по последовательности. Для х-ки ARS305, репликатора хромосомного происхождения сравнивали его функциональные элементы с известным элементом ARS1. ARS305 содержит элементы, функционально заменяемые элементами A и B1 ARS1. Однако А элемент не требует 3'-концевого бокса, примыкающего к консенсусу, ответственного за автономную репликацию. В позиции, соотв. B3 ARS1, ARS305 содержит новый элемент B4, к-рый может функционально замещать др. типы B-элементов. Замещение элемента B4 энхансером репликации B3 из ARS1 привело к функциональному ингибированию ARS305. ARS305 не содержит элемента, соотв. B2 из ARS1, но содержит область с лабильной вторичной структурой (DUE), что было подтверждено мутациями, повышающими содержание G+C. По-видимому, и B2 и DUE выполняют аналогичную ф-цию раскручивания ДНК в процессе инициации, хотя не обязательно это происходит с использованием одинакового механизма. США, Molec. Cell. Biol. Dep. Roswell Park Canc. Inst., Buffalo, NY 14263. Библ. 48
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ДНК
РЕПЛИКАЦИЯ
ОБЛАСТЬ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
ЭЛЕМЕНТЫ ЦИС-ДЕЙСТВУЮЩИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 01.08-04В2.437

Автор(ы) : Miller Charles A., Umek Robert M., Kowalski, David
Заглавие : The inefficient replication origin from yeast ribosomal DNA is naturally impaired in the ARS consensus sequence and in DNA unwinding
Источник статьи : Nucl. Acids Res. - 1999. - Vol. 27, N 19. - С. 3921-3930
Аннотация: Изучены компоненты автономно реплицирующейся последовательности ARS рДНК Saccharomyces cerevisiae, вносящие вклад в неэффективную внехромосомную репликацию. Подобно эффективной ARS H4, ARS рДНК требует совпадения с консенсусной последовательностью ACS длиной 11 п. н. и широкой консервативной области, содержащей несколько элементов, включая элемент DUE расплетания ДНК. С использованием анализа гиперчувствительности к нуклеазе, специфичной для онДНК, и суперспиральной плотности, требующейся для стабильного расплетания ДНК, показано, что ДНК ARS рДНК расплетается не так легко, как ДНК ARS H4. Расплетание ARS рДНК требует дополнительной энергии, как в случае мутантов ARS H4, у к-рых стабилизирована днДНК в области DUE. Внехромосомная репликация ARS рДНК холодочувствительна, как и в случае указанных мутантов ARS H4. Это позволяет предположить, что требование повышенной энергии, характерное для ARS рДНК дикого типа, вносит вклад в неэффективную ф-цию репликации. Последовательность ACS в ARS рДНК неидеальна в одном положении. Точечная мутация, исправляющая это отличие от консенсусной ACS, повышает эффективность внехромосомной репликации. Эти данные показали, что элемент ACS и расплетание ДНК в ARS рДНК являются природно поврежденными. Вероятно, неэффективная ф-ция ARS рДНК имеет биологическое значение. США, Canc. Genet. Dep., Roswell Park Canc. Inst., Buffalo, NY 14263. Библ. 57
ГРНТИ : 34.29.15
Предметные рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ДНК РИБОСОМНАЯ
ОБЛАСТЬ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
ARS-ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
АНАЛИЗ МУТАЦИОННЫЙ
ДНК
РАСПЛЕТАНИЕ
ДРОЖЖИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.09-04Б2.264

Автор(ы) : Kowalski, David, Eddy Martha J.
Заглавие : The dna unwinding element: An essential, cis-acting component of the E. coli replication origin
Источник статьи : J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N13D. - С. 129
Аннотация: Расплетание ДНК, необходимое для инициации репликации, индуцируется взаимодействием белка DnaA с участком ДНК oriC. Расплетание происходит в трех тандемно повторяющихся последовательностях из 13 п. н. (ТПП). Показали, что расплетание ТПП может происходить и без участия белка DnaA, только под воздействием отрицательной сверхспиральности ДНК. Обнаружили, что одна из трех ТПП является наиболее существенной для функции oriC. Обозначили эту последовательность DUE(ДНК-расплетающий элемент). Установили наличие DUE у др. энтеробактерий, а также у дрожжей. Полагают, что DUE является существенным компонентом механизма инициации репликации клетки. США, Mol. & Cellular Biol. Dep., Roswell Park Memorial Inst., Buffalo, NY 14263.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ
РАСПЛЕТАНИЕ ДНК
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ТАНДЕМНО ПОВТОРЯЮЩИЕСЯ НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЛИЯНИЕ НА ORIC
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ DUE
ДРОЖЖИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.09-04Б2.370

Автор(ы) : Umek Robert M., Kowalski, David
Заглавие : Temperature is a determinant of DNA unwinding and initiation at yeast replication origins
Источник статьи : J. Cell. Biochem. - 1989. - Vol. Suppl. N13D. - С. 175
Аннотация: Установлено, что процесс расплетания области начала репликации у дрожжей термодинамически стабилен в условиях обработки нуклеазой. По мнению авт., эти данные подтверждают предположение о том, что фланкирующая последовательность ARS-элемента определяет свободную энергию, необходимую для расплетания области начала репликации. Найдено также, что температура является фактором, определяющим расплетание, поскольку область начала репликации расплетена на 37'ГРАДУС' С, но не при 23'ГРАДУС' С. Фланкирующая последовательность ARS-элемента названа элементом расплетания ДНК (DNA uniwinding element) DUE. Библ. 1. США, Mol. & Cellular Biol. Dep., Roswell Park Memorial Inst., Buffalo, NY 14263.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
ДРОЖЖИ
РЕПЛИКАЦИЯ
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
РАСПЛЕТАНИЕ
РЕГУЛЯЦИЯ
ТЕМПЕРАТУРА
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ЭЛЕМЕНТ ARS
ЭЛЕМЕНТ РАСПЛЕТАНИЯ ДНК DUE
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 68 (BI06) 90.03-04В7.85

Автор(ы) : Dawson Jlfferey O., Kowalski David G., Dart Peter J.
Заглавие : Variation with soil depth, topographic position and host species in the capacity of soils from an Australian locale to nodulate Casuarina and Allocasuarina seedlings
Источник статьи : Plant and Soil. - 1989. - Vol. 118, N 1-2. - С. 1-11
Аннотация: Исследования проведены на пойменных песчаных аллювиальных почвах (П) под естественными насаждениями Casuarina cunninghamiana Mig. на юго-востоке Австралии. Саженцы (С) Casuarina spp., растущие на этих хорошо аэрированных П, в 3 раза чаще образовывали клубеньки на корнях, а кол-во клубеньков на зараженных С у них было вдвое больше по сравнению с С, растущими на глинистосуглинистых красных П, распространенных на склонах соседней долины. Во всех вариантах с разным топографическим положением П встречаемость С с клубеньками была на 76% выше в том случае, если П отбирали на глубине 20 см. Библ. 24.
ГРНТИ : 68.47.03
Предметные рубрики: CASUARINA
ALLOCASUARINA
СЕЯНЦЫ
КОРНЕВЫЕ КЛУБЕНЬКИ
АВСТРАЛИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.05-04Б2.230

Автор(ы) : Kowalski, David, Eddy Martha J.
Заглавие : The DNA unwinding element: a novel, cis-acting component that facilitates opening of the Escherichia coli replication origin
Источник статьи : EMBO Journal. - 1989. - Vol. 8, N 13. - С. 4335-4344
Аннотация: Показано, что суперспирализация ДНК даже в отсутствие репликативных белков индуцирует локальное расплетание в области начала репликации (ОНР) ori C Escherichia coli, в той же последовательности, которая раскрывается при связывании инициаторного белка Dna A. Эта последовательность содержит тандемные повторы длиной 13 п. н. (13-меры). Двойная спираль ДНК в этой области термодинамически нестабильна (имеет низкую свободную энергию деспирализации), о чем свидетельствуют гиперчувствительность к нуклеазе (I), специфичной для однонитевой ДНК, в негативно суперскрученной плазмиде и стабильное расплетение ДНК, обнаруженное методом двумерного электрофореза топоизомеров. У дефектного по репликации мутанта, лишенного самого левого 13-мера, не наблюдается гиперчувствительность к I остальных 2 13-меров и спонтанное расплетение ДНК. Дефект по репликации этого мутанта ori C может быть исправлен путем встраивания вместо левого 13-мера чужеродной последовательности, имеющей пониженную спиральную стабильность. Таким образом, нестабильность спирали ДНК левого 13-мера, а не его специфическая последовательность, нужна для функции ОНР. Самый правый 13-мер также проявляет спиральную нестабильность, но он отличается от левого 13-мера строгим сохранением последовательности у родственных видов бактерий. Полученные данные показывают, что область повторяющихся 13-меров выполняет в ОНР две перекрывающихся функции: связывания репликативных белков и спиральной нестабильности. Предложено называть цис-действующую последовательность, спиральная нестабильность которой необходима для функции ОНР, элементом расплетания ДНК (DUE). Библ. 53.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РЕПЛИКАЦИЯ
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
РАСКРЫВАНИЕ
ИНДУКЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ ДНК
ЦИС-ФАКТОР
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.01-04Б2.612

Автор(ы) : Umek Robert M., Kowalski, David
Заглавие : Thermal energy suppresses mutational defects in DNA unwinding at a yeast replication origin
Источник статьи : Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1990. - Vol. 87, N 7. - С. 2486-2490
Аннотация: У Saccharomyces cerevisiae область начала репликации (ARS) содержит элемент последовательности ДНК, биологич. активность к-рого в негативно сверхспирализованных плазмидах коррелирует с повышенной чувствительностью к нуклеазам, специфичным в отношении однонитевой ДНК. Показали, что в живых Кл повышение тепловой энергии может супрессировать мутации ARS, к-рые повышают потребность в энергии для расплетания. Сверхчувствительная к нуклеазам последовательность названа элементом расплетания ДНК (DNA unwinding element; DUE). Ил. 3. Табл. 1. Библ. 32. США, Dep. of Mol. and Cell. Biol., Roswell Park Cancer Inst., Buffalo, NY 14263.
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
ШТАММ YPH3
РЕПЛИКАЦИЯ
ARS-ОБЛАСТЬ
ЛОКУС РАСПЛЕТАНИЯ ДНК DUE
СТРУКТУРА
МУТАЦИИ
МУТАЦИИ ПО ARS-САЙТАМ
ПОВЫШЕНИЕ ТЕПЛОВОЙ ЭНЕРГИИ
СУПРЕССИЯ
Дата ввода:

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска