Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткий полный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Freire, Ernesto$<.>)
Общее количество найденных документов : 19
Показаны документы с 1 по 19
1.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 02.07-04Т1.29

Автор(ы) : Velazquez-Campoy, Adrian, Kiso, Yoshiaki, Freire, Ernesto
Заглавие : The binding energetics of first- and second-generation HIV-1 protease inhibitors: Implications for drug design
Источник статьи : Arch. Biochem. and Biophys. - 2001. - Vol. 390, N 2. - С. 169-175
Аннотация: Определены термодинамические параметры связывания протеазы ВИЧ-1 и ее резистентного к лекарственным препаратам мутанта V82F/I84V с рядом ингибиторов, применяемых в клинике: индинавиром, саквинавиром, нелфинавиром, ритонавиром и ингибитором второго поколения KNI-764. Установлено, что KNI-764 связывается с протеазой дикого типа с очень высоким сродством, которое в 26 раз выше, чем для резистентного мутанта. Тем не менее параметры связывания мутанта с KNI-764 сопоставимы с таковыми для протеазы дикого типа с другими ингибиторами. Обсуждаются полученные результаты, и сделано заключение, что определение термодинамических показателей целесообразно включить в общую стратегию дизайна лекарственных препаратов. США, Dep. Biol. Biocal. Ctr J. Hopkins Univ., Baltimore, MD. Библ. 24
ГРНТИ : 34.45.05
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗА ВИЧ-1
МУТАНТНАЯ ФОРМА V82F
СРАВНИТЕЛЬНЫЕ СВОЙСТВА
ИНГИБИТОРЫ
ПРИМЕНЯЕМЫЕ В КЛИНИКЕ ИНГИБИТОРЫ ВИЧ-1 ПРОТЕАЗЫ
СВЯЗЫВАНИЕ
ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИЕ ПАРАМЕТРЫ
ПРИМЕНЕНИЕ
Дата ввода:
2.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 02.07-04Т2.210

Автор(ы) : Velazquez-Campoy, Adrian, Kiso, Yoshiaki, Freire, Ernesto
Заглавие : The binding energetics of first- and second-generation HIV-1 protease inhibitors: Implications for drug design
Источник статьи : Arch. Biochem. and Biophys. - 2001. - Vol. 390, N 2. - С. 169-175
Аннотация: Определены термодинамические параметры связывания протеазы ВИЧ-1 и ее резистентного к лекарственным препаратам мутанта V82F/I84V с рядом ингибиторов, применяемых в клинике: индинавиром, саквинавиром, нелфинавиром, ритонавиром и ингибитором второго поколения KNI-764. Установлено, что KNI-764 связывается с протеазой дикого типа с очень высоким сродством, которое в 26 раз выше, чем для резистентного мутанта. Тем не менее параметры связывания мутанта с KNI-764 сопоставимы с таковыми для протеазы дикого типа с другими ингибиторами. Обсуждаются полученные результаты, и сделано заключение, что определение термодинамических показателей целесообразно включить в общую стратегию дизайна лекарственных препаратов. США, Dep. Biol. Biocal. Ctr J. Hopkins Univ., Baltimore, MD. Библ. 24
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗА ВИЧ-1
МУТАНТНАЯ ФОРМА V82F
СРАВНИТЕЛЬНЫЕ СВОЙСТВА
ИНГИБИТОРЫ
ПРИМЕНЯЕМЫЕ В КЛИНИКЕ ИНГИБИТОРЫ ВИЧ-1 ПРОТЕАЗЫ
СВЯЗЫВАНИЕ
ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИЕ ПАРАМЕТРЫ
ПРИМЕНЕНИЕ
Дата ввода:
3.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.08-04Б1.71

Автор(ы) : Velazquez-Campoy, Adrian, Kiso, Yoshiaki, Freire, Ernesto
Заглавие : The binding energetics of first- and second-generation HIV-1 protease inhibitors: Implications for drug design
Источник статьи : Arch. Biochem. and Biophys. - 2001. - Vol. 390, N 2. - С. 169-175
Аннотация: Определены термодинамические параметры связывания протеазы ВИЧ-1 и ее резистентного к лекарственным препаратам мутанта V82F/I84V с рядом ингибиторов, применяемых в клинике: индинавиром, саквинавиром, нелфинавиром, ритонавиром и ингибитором второго поколения KNI-764. Установлено, что KNI-764 связывается с протеазой дикого типа с очень высоким сродством, которое в 26 раз выше, чем для резистентного мутанта. Тем не менее параметры связывания мутанта с KNI-764 сопоставимы с таковыми для протеазы дикого типа с другими ингибиторами. Обсуждаются полученные результаты, и сделано заключение, что определение термодинамических показателей целесообразно включить в общую стратегию дизайна лекарственных препаратов. США, Dep. Biol. Biocal. Ctr J. Hopkins Univ., Baltimore, MD. Библ. 24
ГРНТИ : 34.25.17
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗА ВИЧ-1
МУТАНТНАЯ ФОРМА V82F
СРАВНИТЕЛЬНЫЕ СВОЙСТВА
ИНГИБИТОРЫ
ПРИМЕНЯЕМЫЕ В КЛИНИКЕ ИНГИБИТОРЫ ВИЧ-1 ПРОТЕАЗЫ
СВЯЗЫВАНИЕ
ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИЕ ПАРАМЕТРЫ
ПРИМЕНЕНИЕ
Дата ввода:
4.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.02-04Б1.111

Автор(ы) : Velazquez-Campoy, Adrian, Todd Matthew J., Freire, Ernesto
Заглавие : HIV-1 protease inhibitors: Enthalpic versus entropic optimization of the binding affinity
Источник статьи : Biochemistry. - 2000. - Vol. 39, N 9. - С. 2201-2207
Аннотация: Термодинамический анализ связывания показал, что такие трипептидные ингибиторы как Glu-Asp-Leu и Glu-Asp-Phe связываются с протеазой ВИЧ-1 с благоприятным изменением энтальпии. Такое поведение качественно отличается от связывания известных ингибиторов и открывает новые пути проектирования ингибиторов. Поскольку свободная энергия связывания (сродство) энтальпийно благоприятных и энтальпийно неблагоприятных ингибиторов имеет противоположно направленные зависимости от т-ры, становится возможным выработать протокол скрининга проектируемых ингибиторов, к-рый одновременно отбирает ингибиторы на базе сродства и энтальпии связывания. США, Dep. Biol., Johns Hopkins Univ., Baltimore, MD 21218. Библ. 16
ГРНТИ : 34.25.19
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗА ВИЧ-1
ТРИПЕПТИДНЫЕ ИНГИБИТОРЫ
ЭНЕРГИЯ СВЯЗЫВАНИЯ
ЭНТАЛЬПИЯ
ЭНТРОПИЯ
СООТНОШЕНИЕ
ОПТИМИЗАЦИЯ
Дата ввода:
5.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.10-04Б2.99

Автор(ы) : Haltia, Tuomas, Semo, Nora, Arrondo Jose L.R., Goni Felix M., Freire, Ernesto
Заглавие : Thermodynamic and structural stability of cytochrome c oxidase from Paracoccus denitrificans
Источник статьи : Biochemistry. - 1994. - Vol. 33, N 32. - С. 9731-9740
Аннотация: Методами разностной сканирующей калориметрии и Фурье-ИК-спектроскопии исследовали структурную стабильность интегральной мембранной цитохром-c-оксидазы из P. denitrificans, состоящей всего из 3 или 4 субъединиц. Исследования проведены на ферменте дикого типа и на мутанте, лишенном субъединицы III. Субъединицы I и II образуют высокооперативный комплекс, денатурирующий как единый элемент при 67'ГРАДУС'С; субъединица III денатурирует при 47'ГРАДУС'С. Восстановление сильно стабилизирует субъединицу I и II, не влияя на субъединицу III. Удаление субъединицы III вызывает потерю способности к переносу электрона. Судя по энергетическим параметрам и данным ИК-спектроскопии, при тепловой денатурации молекула разворачивается не полностью и сохраняет значительную упорядоченность структуры: содержание 'альфа'-спиралей при денатурации падает от 45% только до 30%. Предполагается, что сохраняющиеся спирали принадлежат трансмембранной части молекулы. Калориметрические свойства субъединицы III не полностью соответствуют высокоспиральному мембранному белку. США, Dep. Biol. & Biophys., The Johns Hopkins Univ., Baltimore, MD 21218. Библ. 68
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: ЦИТОХРОМ C ОКСИДАЗА
СТРУКТУРНАЯ СТАБИЛЬНОСТЬ
КАЛОРИМЕТРИЯ СКАНИРУЮЩАЯ
PARACOCCUS DENITRIFICANS
Дата ввода:
6.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI21) 04.03-04И2.74

Автор(ы) : Nezami, Azin, Freire, Ernesto
Заглавие : New inhibitors of plasmepsin II as antimalarial drugs : Тез. [45 Annual Meeting of the Bioiphysical Society, Boston, Mass., Febr. 17-21, 2001]
Источник статьи : Biophys. J. - 2001. - Vol. 80, N 1. - С. 280
Аннотация: Плазмепсин II (Пл) это аспартат протеаза малярийного Plasmodium falciparum. Разработан новый класс пептидомиметиков, обладающих значительным ингибирующим действием и высокой селективностью против Пл. Наиболее активным является соединение BCC184, константа ингибирования которого 50 нМ, причем в отношении катепсина D, структурно подобного Пл, эффективность снижается в 25 раз (1220 нМ). Заключают, что ингибирование, селективность и противомалярийная активность этого класса соединений значительно выше, чем известных ингибиторов. США, Johns Hopkins Univ., Baltimore, MD 21218
ГРНТИ : 34.33.23
Предметные рубрики: ПРОТИВОМАЛЯРИЙНЫЕ ПРЕПАРАТЫ
ПЛАЗМЕПСИН II
ИНГИБИТОРЫ АСПАРТАТ ПРОТЕАЗ
НОВЫЕ СОЕДИНЕНИЯ
АКТИВНОСТЬ
СЕЛЕКТИВНОСТЬ
Дата ввода:
7.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 03.10-04Т2.98

Автор(ы) : Nezami, Azin, Freire, Ernesto
Заглавие : New inhibitors of plasmepsin II as antimalarial drugs : Тез. [45 Annual Meeting of the Bioiphysical Society, Boston, Mass., Febr. 17-21, 2001]
Источник статьи : Biophys. J. - 2001. - Vol. 80, N 1. - С. 280
Аннотация: Плазмепсин II (Пл) это аспартат протеаза малярийного Plasmodium falciparum. Разработан новый класс пептидомиметиков, обладающих значительным ингибирующим действием и высокой селективностью против Пл. Наиболее активным является соединение BCC184, константа ингибирования которого 50 нМ, причем в отношении катепсина D, структурно подобного Пл, эффективность снижается в 25 раз (1220 нМ). Заключают, что ингибирование, селективность и противомалярийная активность этого класса соединений значительно выше, чем известных ингибиторов. США, Johns Hopkins Univ., Baltimore, MD 21218
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: ПРОТИВОМАЛЯРИЙНЫЕ ПРЕПАРАТЫ
ПЛАЗМЕПСИН II
ИНГИБИТОРЫ АСПАРТАТ ПРОТЕАЗ
НОВЫЕ СОЕДИНЕНИЯ
АКТИВНОСТЬ
СЕЛЕКТИВНОСТЬ
Дата ввода:
8.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.02-04Б1.187

Автор(ы) : Luque, Irene, Todd Matthew J., Gomez, Javier, Semo, Nora, Freire, Ernesto
Заглавие : Molecular basis of resistance to HIV-1 protease inhibition: A plausible hypothesis
Источник статьи : Biochemistry. - 1998. - Vol. 37, N 17. - С. 5791-5797
Аннотация: В предыдущей статье [Bardi J. S., Luque I., Freire E. "Biochemistry". 1997, 36, 6588-6596] было проведено термодинамическое исследование связывания 13 синтетических ингибиторов протеазы ВИЧ-1, для к-рых известна пространственная структура. Теперь проведено изучение связывания субстратов и ингибиторов с помощью комбинации термодинамических измерений и структурных расчетов. На базе полученных характеристик связывания ингибиторов и субстратов сформулирована гипотеза молекулярной природы устойчивости мутантов протеазы к ингибированию, основанная на факте более высокой подвижности пептидных субстратов, по сравнению с синтетическими ингибиторами, что приводит к более высоким потерям конформационной энтропии и меньшему сродству при связывании субстратов. С другой стороны, жесткость ингибитора препятствует его хорошей подгонке к центру связывания. В результате мутации намного сильнее нарушают сродство ингибиторов. США, Dep. Biol., Johns Hopkins Univ., Baltimore, MD 21218. Библ. 35
ГРНТИ : 34.25.19
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗА
МУТАНТНЫЕ ФОРМЫ
КАТАЛИТИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ
СИНТЕТИЧЕСКИЕ ИНГИБИТОРЫ
СВЯЗЫВАНИЕ
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ОСНОВЫ УСТОЙЧИВОСТИ
ВИЧ-1
Дата ввода:
9.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 05.02-04Б1.60

Автор(ы) : Biorn Alyssa C., Cocklin, Simon, Madani, Navid, Si, Zhihai, Ivanovic, Tijana, Samanen, James, Van Ryk Donald I., Pantophlet, Ralph, Burton Dennis R., Freire, Ernesto
Заглавие : Mode of action for linear peptide inhibitors of HIV-1 gp120 interactions
Источник статьи : Biochemistry. - 2004. - Vol. 43, N 7. - С. 1928-1938
Аннотация: Подтвердили ингибирование линейным пептидом 12pl (RINNIPWSEAMM) взаимодействия gp120 с CD4, 17b и CCR5 и показали стехиометрию 1:1 при ингибиторных концентрациях. Trp7 играет решающую роль в 12p1-ингибировании связывания gp120 с СD4 и 17b; укорочение пептида ослабляет его ингибирующее действие; 12p1 связывается с неактивированной конформацией gp120 с неконкурентным ингибированием связывания лигандов в зависимости от активированного состояния CD4. США, Drexel Univ. Coll. med., Philadelphia PA 19102. Библ. 24
ГРНТИ : 34.25.19
Предметные рубрики: ВИЧ-1
ГЛИКОПРОТЕИН GP120
БЕЛОК CD4
РЕЦЕПТОР CCR5
Дата ввода:
10.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI21) 04.08-04И2.67

Автор(ы) : Nezami, Azin, Kimura, Tooru, Hidaka, Koushi, Kiso, Aiko, Liu, Jun, Kiso, Yoshiaki, Goldberg Daniel E., Freire, Ernesto
Заглавие : High-affinity inhibition of a family of Plasmodium falciparum proteases by a designed adaptive inhibitor
Источник статьи : Biochemistry. - 2003. - Vol. 42, N 28. - С. 8459-8464
Аннотация: Предложен новый подход для дизайна адаптивных ингибиторов, реагирующих с группой родственных ферментов. Инженерия адаптивных ингибиторов предполагает сочетание в структуре ингибитора элементов, определящих сильное взаимодействие с консервативной частью активного центра фермента, с присутствием подвижных асимметричных функциональных групп, которые приспосабливают ингибитор к реакции с отдельными ферментами-мишенями. Подход использован для дизайна и конструирования ингибитора с высокой аффинностью к 4 плазмепсинам - протеазам, присутствующим в вакуоли P. falciparum. Полагают, что адаптивные ингибиторы найдут применение в качестве лекарственных препаратов против инфекционных заболеваний. США, Dep. Biol. Johns Hopkins Univ., Baltimore, M.D. Библ. 15
ГРНТИ : 34.33.23
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗЫ
ПЛАЗМЕПСИНЫ
ИНГИБИТОРЫ
АДАПТИВНЫЕ ИНГИБИТОРЫ
НОВЫЙ ПОДХОД К КОНСТРУИРОВАНИЮ
ПРИМЕНЕНИЕ
PLASMODIUM FALCIPARUM
Дата ввода:
11.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 96.12-04А3.553

Автор(ы) : Freire, Ernesto
Заглавие : Thermodynamics of partly folded intermediates in proteins
Источник статьи : Annu. Rev. Biophys. and Biomol. Struct. - Palo Alto (Calif.), 1995. - Vol. 24. - С. 141-165
Аннотация: Обзор. Содержание: Введение (Структурные черты расплавленных глобул). Экспериментальная энергетика (Разницы теплоемкости. Разницы энтальпии. Стабилизация расплавленной глобулы. Относительная энтропия расплавленной глобулы.). Тепловые переходы. Структурные детерминанты расплавленной глобулы (Приложение комбинаторного алгоритма разворачивания к стафилококковой нуклеазе P117G. Результаты исследования расплавленной глобулы в 'альфа'-лактальбумине и стафилококковой нуклеазе P117G). США, Dep. Biol. & Biocalorimetry Ctr, Johns Hopkins Univ., Baltimore, MD 21218. Библ. 68
ГРНТИ : 34.57.23
Предметные рубрики: БЕЛОК
ИНТЕРМЕДИАТЫ
ТЕРМОДИНАМИКА
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 68
Дата ввода:
12.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 89.08-04М1.44

Автор(ы) : Ramsay, Glen, Montgomery, Diana, Berger, Dolores, Freire, Ernesto
Заглавие : Energetics of diphtheria toxin membrane insertion and translocation: calorimetric characterization of the acid pH induced transition
Источник статьи : Biochemistry. - 1989. - Vol. 28, N 2. - С. 529-533
Аннотация: С помощью метода дифференциальной сканирующей калориметрии изучали конформационные переходы (КП) в молекуле дифтерийного токсина (ДТ) при кислых рН. КП при 37'ГРАДУС' происходит при рН 4,7 в р-рах низкой ионной силы и при рН 5,4 в среде с 0,2 М NaCl. При рН 8,0 КП наблюдался при 52'ГРАДУС' С в случае свободного ДТ и при 58'ГРАДУС' - в случае комплекса ДТ с динуклеотидом АфУф. Делается вывод, что связывание динуклеотида стабилизирует нативную конформацию ДТ. Исследуемый КП осуществляется в две стадии. Опытами с использованием т. н. А-фрагмента ДТ показано, что первая из этих стадий связана с разворачиванием А-фрагмента, а вторая - с разворачиванием В-фрагмента. Первая стадия КП является обратимой. Полученные рез-ты рассматриваются в свете современных представлений о мех-мах встраивания ДТ в клеточные мембраны и его последующей транслокации в цитозоль. Предполагается, что индуцируемый кислыми рН КП является одной из важнейших стадий в процессе проникновения молекул ДТ через мембраны. США, Dep. of Biol., Johns Hopkins Univ., Baltimore, MD 21218. Библ. 30.
ГРНТИ : 34.19.17
Предметные рубрики: МЕМБРАНЫ
ТОКСИНЫ
ДИФТЕРИЙНЫЙ ТОКСИН
КОНФОРМАЦИОННЫЕ ПЕРЕХОДЫ
РН
Дата ввода:
13.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 05.10-04Т2.223

Автор(ы) : Abdel-Rahman Hamdy M., Kimura, Tooru, Hidaka, Koushi, Kiso, Aiko, Nezami, Azin, Freire, Ernesto, Hayashi, Yohio, Kiso, Yoshiaki
Заглавие : Design of inhibitors against HIV, HTLV-I, and Plasmodium falciparum aspartic proteases
Источник статьи : Biol. Chem. - 2004. - Vol. 385, N 11. - С. 1035-1039
Аннотация: В кратком обзоре обсуждаются данные о дизайне и синтезе нового класса ингибиторов аспартильных протеаз, структура которых имитирует переходное состояние, образующееся при гидролизе пептидных субстратов. Эти ингибиторы пептидомиметики содержат в P1 положении неприродную аминокислоту - аллофенилнорстатин и "изостер" гидроксиметилкарбонила [hydroxymethylearbonyl isostere] и успешно применяются при терапии таких заболеваний как СПИД, лейкоз, малярия. В обзоре приведены последние достижения в области дизайна и синтеза новых ингибиторов протеазы ВИЧ-1, вируса лейкоза человека HTLV-1 и плазмепсина, продуцируемого P. faleiparum. Япония, Dep. Med. Chem. Ctr. Front. Res. Med. Sci Kyoto Pharm. Univ., Kyoto. Библ. 22
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗЫ
АСПАРТИЛЬНЫЕ ПРОТЕАЗЫ
ИНГИБИТОРЫ
НОВЫЙ КЛАСС
ДИЗАЙН
СИНТЕЗ
СТРУКТУРА
ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ВИРУС ЛЕЙКОЗА ЧЕЛОВЕКА
Дата ввода:
14.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI21) 05.12-04И2.90

Автор(ы) : Abdel-Rahman Hamdy M., Kimura, Tooru, Hidaka, Koushi, Kiso, Aiko, Nezami, Azin, Freire, Ernesto, Hayashi, Yohio, Kiso, Yoshiaki
Заглавие : Design of inhibitors against HIV, HTLV-I, and Plasmodium falciparum aspartic proteases
Источник статьи : Biol. Chem. - 2004. - Vol. 385, N 11. - С. 1035-1039
Аннотация: В кратком обзоре обсуждаются данные о дизайне и синтезе нового класса ингибиторов аспартильных протеаз, структура которых имитирует переходное состояние, образующееся при гидролизе пептидных субстратов. Эти ингибиторы пептидомиметики содержат в P1 положении неприродную аминокислоту - аллофенилнорстатин и "изостер" гидроксиметилкарбонила [hydroxymethylearbonyl isostere] и успешно применяются при терапии таких заболеваний как СПИД, лейкоз, малярия. В обзоре приведены последние достижения в области дизайна и синтеза новых ингибиторов протеазы ВИЧ-1, вируса лейкоза человека HTLV-1 и плазмепсина, продуцируемого P. faleiparum. Япония, Dep. Med. Chem. Ctr. Front. Res. Med. Sci Kyoto Pharm. Univ., Kyoto. Библ. 22
ГРНТИ : 34.33.23
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗЫ
АСПАРТИЛЬНЫЕ ПРОТЕАЗЫ
ИНГИБИТОРЫ
НОВЫЙ КЛАСС
ДИЗАЙН
СИНТЕЗ
СТРУКТУРА
ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ВИРУС ЛЕЙКОЗА ЧЕЛОВЕКА
Дата ввода:
15.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 05.10-04Б1.64

Автор(ы) : Abdel-Rahman Hamdy M., Kimura, Tooru, Hidaka, Koushi, Kiso, Aiko, Nezami, Azin, Freire, Ernesto, Hayashi, Yohio, Kiso, Yoshiaki
Заглавие : Design of inhibitors against HIV, HTLV-I, and Plasmodium falciparum aspartic proteases
Источник статьи : Biol. Chem. - 2004. - Vol. 385, N 11. - С. 1035-1039
Аннотация: В кратком обзоре обсуждаются данные о дизайне и синтезе нового класса ингибиторов аспартильных протеаз, структура которых имитирует переходное состояние, образующееся при гидролизе пептидных субстратов. Эти ингибиторы пептидомиметики содержат в P1 положении неприродную аминокислоту - аллофенилнорстатин и "изостер" гидроксиметилкарбонила [hydroxymethylearbonyl isostere] и успешно применяются при терапии таких заболеваний как СПИД, лейкоз, малярия. В обзоре приведены последние достижения в области дизайна и синтеза новых ингибиторов протеазы ВИЧ-1, вируса лейкоза человека HTLV-1 и плазмепсина, продуцируемого P. faleiparum. Япония, Dep. Med. Chem. Ctr. Front. Res. Med. Sci Kyoto Pharm. Univ., Kyoto. Библ. 22
ГРНТИ : 34.25.19
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗЫ
АСПАРТИЛЬНЫЕ ПРОТЕАЗЫ
ИНГИБИТОРЫ
НОВЫЙ КЛАСС
ДИЗАЙН
СИНТЕЗ
СТРУКТУРА
ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ВИРУС ЛЕЙКОЗА ЧЕЛОВЕКА
Дата ввода:
16.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.06-04Б1.87

Автор(ы) : Velazquez-Campoy, Adrian, Todd Matthew J., Vega, Sonia, Freire, Ernesto
Заглавие : Catalytic efficiency and vitality of HIV-1 proteases from African viral subtypes
Источник статьи : Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2001. - Vol. 98, N 11. - С. 6062-6067
Аннотация: Изучали каталитическую эффективность и ингибирование мутантных форм протеазы ВИЧ-1 (субтип B), которые имели 7 и 4 мутации, характерные для встречающихся в Африке субтипов вируса A и C. Обнаружено, что k[кат] для гидролиза двух разных субстратов протеазами субтипов A и C такие же, как и у фермента субтипа B. Величины K[М] для протеазы субтипа C ниже, что ведет к увеличению каталитической эффективности в 2-4 раза по сравнению с протеазой субтипа B. При сравнительном изучении действия 4 разных ингибиторов установлено, что K[i] для протеазы A в 2,5-7 раз, а для протеазы C в 2-4,5 раза ниже, чем для протеазы субтипа B. Совокупность данных показывает, что жизнеспособность протеаз субтипа C в 4-11 раз, а субтипа A в 1,5-5 раз выше, чем у протеазы субтипа B, который распространен в Европе и США. США, Dep. Biol., Johns Hopkins Univ., Baltimore, MD. Библ. 28
ГРНТИ : 34.25.17
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗА
КАТАЛИТИЧЕСКАЯ ЭФФЕКТИВНОСТЬ
ЖИЗНЕСПОСОБНОСТЬ
СРАВНЕНИЕ
ВИЧ-1
СУБТИП B
СУБТИПЫ A И C
Дата ввода:
17.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 90.04-04М1.162

Автор(ы) : Bradrick Thomas D., Freire, Ernesto, Georghiou S.
Заглавие : A high-sensitivity differential scanning calorimetric study of the interaction of melittin with dipalmiloylphosphatidylcholine fused unilamellar vesicles
Источник статьи : Biochim. et biophys. acta. Biomembranes. - 1989. - Vol. 982, N 1. - С. 94-102
Аннотация: По профилю т-рного фазового перехода изучали взаимодействие мономерного (при низкой конц-ии соли) или тетрамерного (при высокой конц-ии соли) мелиттина (Мл) с однослойными слившимися везикулами из дипальмитоилфосфатидилхолина. Показано, что обе формы Мл устраняют "предпереход" при относительно высоком соотношении белка к липиду (R[i]=200), а при средних значениях R[i] Мл вызывает уширение профиля основного перехода и уменьшает энтальпию перехода. Авт. считают, что Мл хотя бы частично погружается в неполярную область бислоя. При низких значениях R[i] на профиле т-рных переходов липида заметны два пика, к-рые могли возникнуть либо из-за гетерогенности везикул, образовавшихся при вызванном Мл слиянии, либо при разделении липида на фазы. Обсуждена роль мономерного и тетрамерного Мл в фазовых переходах в липидах и в слиянии везикул. США, Georghiou S., Mol. Biophys. Lab., Dep. of Phys. Univ. of Tennessee, Knoxville, TN 37996-1200. Ил. 5. Библ. 43.
ГРНТИ : 34.19.19
Предметные рубрики: ПУЗЫРЬКИ
ФОСФОЛИПИДЫ
ЛЕЦИТИН
МИЛИТТИН
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ СКАНИРУЮЩАЯ КАЛОРИМЕТРИЯ
ФАЗОВЫЕ ПЕРЕХОДЫ
ПРЕДПЕРЕХОД
Дата ввода:
18.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 98.02-04Т2.424

Автор(ы) : Bardi Jason S., Luque, Irene, Freire, Ernesto
Заглавие : Structure-based thermodynamic analysis of HIV-1 protease inhibitors
Источник статьи : Biochemistry. - 1997. - Vol. 36, N 22. - С. 6588-6596
Аннотация: Структурная параметризация связывания и энергетики укладки структуры позволила количественно описать термодинамику связывания 13 ингибиторов протеазы ВИЧ-1, для к-рых пространственная структура известна с высокой точностью. Со стандартным отклонением '+-'1,1 ккал/моль ('+-'10%) предсказаны свободная энергия связывания этих ингибиторов. Правильно предсказано изменение константы ингибирования мутанта протеазы V82A ингибитором A77003. Проведено структурное картирование вкладов остатков в энергетику связывания. Сравнение полученной карты с картой вкладов в стабильность белка показало, что связывающий участок м-лы протеазы имеет двойственный характер: половина центра связывания создается наиболее стабильной областью м-лы белка, а др. половина не структурирована в отсутствие ингибитора или субстрата. Это объясняет значительное влияние мутаций дистальных остатков на связывающую способность центра. США, Dep. Biol., Johns Hopkins Univ., Baltimore, MD 21218. Библ. 42
ГРНТИ : 34.45.21
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗА ВИЧ-1
МУТАНТНЫЕ ФОРМЫ
ИНГИБИТОРЫ
СВЯЗЫВАНИЕ
ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
Дата ввода:
19.

Вид документа : Статья из журнала
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.03-04Б1.142

Автор(ы) : Bardi Jason S., Luque, Irene, Freire, Ernesto
Заглавие : Structure-based thermodynamic analysis of HIV-1 protease inhibitors
Источник статьи : Biochemistry. - 1997. - Vol. 36, N 22. - С. 6588-6596
Аннотация: Структурная параметризация связывания и энергетики укладки структуры позволила количественно описать термодинамику связывания 13 ингибиторов протеазы ВИЧ-1, для к-рых пространственная структура известна с высокой точностью. Со стандартным отклонением '+-'1,1 ккал/моль ('+-'10%) предсказаны свободная энергия связывания этих ингибиторов. Правильно предсказано изменение константы ингибирования мутанта протеазы V82A ингибитором A77003. Проведено структурное картирование вкладов остатков в энергетику связывания. Сравнение полученной карты с картой вкладов в стабильность белка показало, что связывающий участок м-лы протеазы имеет двойственный характер: половина центра связывания создается наиболее стабильной областью м-лы белка, а др. половина не структурирована в отсутствие ингибитора или субстрата. Это объясняет значительное влияние мутаций дистальных остатков на связывающую способность центра. США, Dep. Biol., Johns Hopkins Univ., Baltimore, MD 21218. Библ. 42
ГРНТИ : 34.25.19
Предметные рубрики: ПРОТЕАЗА ВИЧ-1
МУТАНТНЫЕ ФОРМЫ
ИНГИБИТОРЫ
СВЯЗЫВАНИЕ
ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
Дата ввода:
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)