СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Danchin, Antoine$<.>)

Общее количество найденных документов : 57
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-57

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 97.05-04Б4.87

Автор(ы) : Bouhss, Ahmed, Vincent, Michel, Munier, Helene, Gilles, Anne-Marie, Takahashi, Masayuchi, Barzu, Octavian, Danchin, Antoine, Gallay, Jacques
Заглавие : Conformational transitions within the calmodulin-binding site of Bordetella pertussis adenylate cyclase studied by time-resolved fluorescence of Trp242 and circular dichroism
Источник статьи : Eur. J. Biochem. - 1996. - Vol. 237, N 3. - С. 619-628
Аннотация: С помощью кинетической флуоресцентной спектроскопии исследовали свойства пептидов аденилатциклазы Bordetella pertussis различной длины и с различным сродством к кальмодулину, но с той же последовательностью вокруг Trp242. Их динамические свойства сравнивали со свойствами каталитического домена аденилатциклазы, соотв-щего первым 400 аминокислотным остаткам белка, и его мутанта, в к-ром остаток Trp69 заменен на Phe. Гетерогенность затухания интенсивности флуоресценции Trp242, по-видимому, возникает благодаря равновесию между конформерами, что подтверждается данными по влиянию трифторэтанола как на содержание вторичной структуры, так и на распределение времен жизни флуоресценции; на последнее сильно влияет связывание кальмодулина, отбирая главную популяцию возбужденных состояний, т. е. один главный конформер. Trp242 в комплексе все еще обладает определенной степенью вращательной свободы. Уменьшение вращательной свободы более важно для более коротких пептидов, чем для более длинных. Аналогичный отбор одного главного конформера с тем же временем жизни флуоресценции наблюдается также для Trp242 в мутантном белке при связывании кальмодулина, а также для комплексов с пептидами. Сделан вывод, что центр взаимодействия аденилатциклазы с кальмодулином обладает такой же конформационной гибкостью, как и в изолированных пептидах. Полагают, что это свойство молекулы обеспечивает лучшую подгонку фермента к кальмодулину при их взаимодействии. Франция, Lab. I'Utilisation Rayonnement Electromagnetique, Univ. Paris Sud, F-91405 Orsay-Cedex. Библ. 34
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: АДЕНИЛАТЦИКЛАЗА
КАЛЬМОДУЛИН-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ЦЕНТР
КОНФОРМАЦИОННЫЕ ПЕРЕХОДЫ
ФЛУОРЕСЦЕНЦИЯ И КД
BORDETELLA PERTUSSIS
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.09-04Б2.133

Автор(ы) : Bouhss, Ahmed, Vincent, Michel, Munier, Helene, Gilles, Anne-Marie, Takahashi, Masayuchi, Barzu, Octavian, Danchin, Antoine, Gallay, Jacques
Заглавие : Conformational transitions within the calmodulin-binding site of Bordetella pertussis adenylate cyclase studied by time-resolved fluorescence of Trp242 and circular dichroism
Источник статьи : Eur. J. Biochem. - 1996. - Vol. 237, N 3. - С. 619-628
Аннотация: С помощью кинетической флуоресцентной спектроскопии исследовали свойства пептидов аденилатциклазы Bordetella pertussis различной длины и с различным сродством к кальмодулину, но с той же последовательностью вокруг Trp242. Их динамические свойства сравнивали со свойствами каталитического домена аденилатциклазы, соотв-щего первым 400 аминокислотным остаткам белка, и его мутанта, в к-ром остаток Trp69 заменен на Phe. Гетерогенность затухания интенсивности флуоресценции Trp242, по-видимому, возникает благодаря равновесию между конформерами, что подтверждается данными по влиянию трифторэтанола как на содержание вторичной структуры, так и на распределение времен жизни флуоресценции; на последнее сильно влияет связывание кальмодулина, отбирая главную популяцию возбужденных состояний, т. е. один главный конформер. Trp242 в комплексе все еще обладает определенной степенью вращательной свободы. Уменьшение вращательной свободы более важно для более коротких пептидов, чем для более длинных. Аналогичный отбор одного главного конформера с тем же временем жизни флуоресценции наблюдается также для Trp242 в мутантном белке при связывании кальмодулина, а также для комплексов с пептидами. Сделан вывод, что центр взаимодействия аденилатциклазы с кальмодулином обладает такой же конформационной гибкостью, как и в изолированных пептидах. Полагают, что это свойство молекулы обеспечивает лучшую подгонку фермента к кальмодулину при их взаимодействии. Франция, Lab. I'Utilisation Rayonnement Electromagnetique, Univ. Paris Sud, F-91405 Orsay-Cedex. Библ. 34
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: АДЕНИЛАТЦИКЛАЗА
КАЛЬМОДУЛИН-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ЦЕНТР
КОНФОРМАЦИОННЫЕ ПЕРЕХОДЫ
ФЛУОРЕСЦЕНЦИЯ И КД
BORDETELLA PERTUSSIS
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.10-04Б2.115

Автор(ы) : Crecy-Lagard, Valerie de, Binet, Marie, Danchin, Antoine
Заглавие : Fructose phosphotransferase system of Xanthomonas campestris pv. campestris: Characterization of the fruB gene
Источник статьи : Microbiology. - 1995. - Vol. 141, N 9. - С. 2253-2260
Аннотация: Авторы клонировали и секвенировали ген fruB Xanthomonas campestris pv. campestris, связанный со специфической фосфотрансферазной системой фруктозы. Показали, что fruB, также как и локализованный выше ген fruK, являются частью единой транскрипционной единицы. Полученные данные показывают сходство (46%) белка, кодируемого fruB, и соответствующего белка Rhodobacter capsulatus. Франция, Unite de Regulation de l'Expression genetique, Inst. Pasteur, 75724 Paris cedex 15. Ил. 5. Табл. 1. Библ. 52
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: САХАРА
ФРУКТОЗА
ТРАНСПОРТ
МЕХАНИЗМ
ГЕНЫ
ГЕН ТРАНСПОРТА ФРУКТОЗЫ FRUB
КЛОНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
XANTHOMONAS CAMPESTRIS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.10-04Б2.176

Автор(ы) : Bucurenci, Nadia, Sakamoto, Hiroshi, Briozzo, Pierre, Palibroda, Nicolae, Serina, Lidia, Sarfati Robert S., Labesse, Gilles, Briand, Gilbert, Danchin, Antoine, Barzu, Octavian, Gilles, Anne-Marie
Заглавие : CMP kinase from Escherichia coli is structurally related to other nucleoside monophosphate kinases
Источник статьи : J. Biol. Chem. - 1996. - Vol. 271, N 5. - С. 2865-2862
Аннотация: ЦМФ киназа E. coli имеет незначительное сходство последовательности аминокислот с другими нуклеозидмонофосфат (НМФ) киназами. Однако, наличие консервативных остатков, участвующих в связывании субстрата и в катализе, указывает на сохранение общей укладки, найденной у других НМФ киназ. Очищенная до гомогенного состояния ЦМФ кристаллизуется с образованием кристаллов гексагональной формы (a=b=82,3 A, c=60,7 A, группа P6[3]). При возбуждении при 295 нм ЦМФ киназа дает флюоресцентный спектр испускания с максимумом при 328 нм. ЦМФ киназа активна в присутствии АТФ, дАТФ или ГТФ в качестве доноров и ЦМФ, дЦМФ и арабинофуранозил-ЦМФ в качестве акцепторов. Связывание с ЦМФ усиливает сродство ЦМФ киназы к АТФ или АДФ. Франция, Unite Biochim. Regulations Cell., Inst. Pasteur, 28, rue du Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 44
ГРНТИ : 34.27.17
Предметные рубрики: ЦДФ-КИНАЗА
СТРУКТУРА
СХОДСТВО
НУКЛЕОЗИДМОНОФОСФАТКИНАЗА
ESCHERICHIA COLI
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 97.12-04Б3.105

Автор(ы) : Bucurenci, Nadia, Sakamoto, Hiroshi, Briozzo, Pierre, Palibroda, Nicolae, Serina, Lidia, Sarfati Robert S., Labesse, Gilles, Briand, Gilbert, Danchin, Antoine, Barzu, Octavian, Gilles, Anne-Marie
Заглавие : CMP kinase from Escherichia coli is structurally related to other nucleoside monophosphate kinases
Источник статьи : J. Biol. Chem. - 1996. - Vol. 271, N 5. - С. 2865-2862
Аннотация: ЦМФ киназа E. coli имеет незначительное сходство последовательности аминокислот с другими нуклеозидмонофосфат (НМФ) киназами. Однако, наличие консервативных остатков, участвующих в связывании субстрата и в катализе, указывает на сохранение общей укладки, найденной у других НМФ киназ. Очищенная до гомогенного состояния ЦМФ кристаллизуется с образованием кристаллов гексагональной формы (a=b=82,3 A, c=60,7 A, группа P6[3]). При возбуждении при 295 нм ЦМФ киназа дает флюоресцентный спектр испускания с максимумом при 328 нм. ЦМФ киназа активна в присутствии АТФ, дАТФ или ГТФ в качестве доноров и ЦМФ, дЦМФ и арабинофуранозил-ЦМФ в качестве акцепторов. Связывание с ЦМФ усиливает сродство ЦМФ киназы к АТФ или АДФ. Франция, Unite Biochim. Regulations Cell., Inst. Pasteur, 28, rue du Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 44
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: ЦДФ-КИНАЗА
СТРУКТУРА
СХОДСТВО
НУКЛЕОЗИДМОНОФОСФАТКИНАЗА
ESCHERICHIA COLI
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.04-04Б2.114

Автор(ы) : Serina, Lidia, Blondin, Catherine, Krin, Evelyne, Sismeiro, Odile, Danchin, Antoine, Sakamoto, Hiroshi, Giles, Anne-Marie, Barzu, Octavian
Заглавие : Escherichia coli UMP-kinase, a member of the aspartokinase family, is a hexamer regulated by guanine nucleotides and UTP
Источник статьи : Biochemistry. - 1995. - Vol. 34, N 15. - С. 5066-5074
Аннотация: Клонирован и секвенирован ген pyrH УМФ-киназы (I) Escherichia coli. Он имеет длину 723 п. н. и идентичен гену smbA, участвующему в распределении хромосом. I не гомологична известным нуклеозидмонофосфаткиназам, но гомологична аспартокиназам, глутаматкиназам и карбаматкиназе Pseudomonas aeruginosa. I гиперэкспрессирована в E. coli и изучены структурные и кинетич. свойства ее гомогенного препарата. I состоит из 6 одинаковых субъединиц длиной 240 остатков (N-концевой мет отсутствует в зрелой I). При возбуждении светом 295 нм I имеет максимум спектра флуоресценции при 332 нм. Это показывает, что единственный остаток трп в I (трп[119]) находится в гидрофобном окружении. ГТФ служит аллостерич. активатором, а УТФ - аллостерич. ингибитором I. УДФ и УТФ, но не другие нуклеотиды (ГТФ, АТФ и УМФ), усиливают флуоресценцию I. Сигмоидная форма кривой доза - ответ свидетельствует о кооперативности связывания УДФ и УТФ. I с заменой D201N, ответственной за фенотип измененной морфологии клеток E. coli, имеет пониженную в 10 раз активность и измененные стабильность и регуляторные свойства. Это согласуется с предположением, что I лишь косвенно участвует в делении клеток. Франция, Unite de Biochim. des Regulation Cellulaire, Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 57
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕН УМФ-КИНАЗЫ PYR
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ГИПЕРЭКСПРЕССИЯ
УМФ-КИНАЗА
СТРУКТУРНЫЕ СВОЙСТВА
КИНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
ESCHERICHIA COLI
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 99.02-04И2.103

Автор(ы) : Delbac, Frederic, Peyret, Pierre, Metenier, Guy, David, Danielle, Danchin, Antoine, Vivares Christian P.
Заглавие : On proteins of the microsporidian invasive apparatus: Complete sequence of a polar tube protein of Encephalitozoon cuniculi
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 29, N 3. - С. 825-834
Аннотация: Из геномной клонотеки микроспоридия E. cuniculi выделена нуклеотидная последовательность гена, кодирующего один из белков семейства PTP - эти "белки полярных трубок" являются важными факторами вирулентности микроспоридий, к-рые обусловливают широко распространенные инвазии при СПИДе. Расшифрованная последовательность полипептида состоит из 395 аминокислот, 22 из к-рых приходятся на сигнальный участок: расчетная мол. масса зрелого пептида - 37230 Д, - что соответствует прямой оценке, полученной с помощью электрофореза в полиакриламидном геле (37 кД). Подтверждено присутствие в составе полипептида 4 26-аминокислотных повторяющихся участков. Отмечено, что сколько-нибудь существенное сходство с ранее исследованными белками различных организмов не обнаруживается. Осуществлена модельная экспрессия выделенного гена в клетках кишечной палочки: исследованы кинетические и биохимические св-ва рекомбинантного продукта. Обсуждаются перспективы использования полученных данных для разработки новых стратегий в терапии микроспоридиозов. Франция, Protistol. Mol. et Cell. Parasites Opportunistes, LBCP, URESA CNRS 6023, Univ. B. Pascal, F-63177 Aubiere Cedex. Библ. 53
ГРНТИ : 34.33.23
Предметные рубрики: ENCEPHALITOZOON CUNICULI (PROT.)
ПОЛЯРНАЯ ТРУБКА
ПРОТЕИНЫ
СТРУКТУРА
ФУНКЦИИ
ФАКТОРЫ ПАТОГЕННОСТИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.160

Автор(ы) : Danchin, Antoine, Glasser, Philippe, Kunst, Frank, Moszer, Ivan, Rapoport, Georges
Заглавие : Bacillus subtilis devoile ses genes
Источник статьи : Biofutur. - 1998. - N 174. - С. 14-17
Аннотация: Обзор. Завершено секвенирование генома Bacillus subtilis длиной 421481 п. н. Сравнение предсказанных последовательностей позволило приписать функции 58% белков. Из 4100 генов Bac. subtilis по меньшей мере 212 являются регуляторными. В геноме обнаружены 6 профагов или их остатков, содержащих от 15 до 160 генов. Многие гены Bac. subtilis являются многокопийными (число копий равно 2, 3, 4 и 5 соотв. для 284, 91, 168 и 100 генов). Франция, Unite Biochim. Microbienne, Inst. Pasteur, 750015 Paris
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНОМ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНЫ
КОЛИЧЕСТВО КОПИЙНОСТЬ
БЕЛОК
ФУНКЦИИ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 76 (BI38) 99.10-04А3.94

Автор(ы) : Medique, Claudine, Rechenmenn, Francois, Danchin, Antoine, Viari, Alain
Заглавие : IMAGENE: An integrated computer envitronment for sequence annotation and analysis
Источник статьи : Bioinformatics. - 1999. - Vol. 15, N 1. - С. 2-15
Аннотация: Создана первая версия системы IMAGENE для максимально полного и всестороннего описания и анализа нуклеотидных и аминокислотных последовательностей. Рассмотрена общая архитектура этой системы, положенные в ее основу стратегические принципы и функциональные возможности. Система предназначена для работы на достаточно мощных рабочих станциях и распространяется бесплатно на лицензионной основе через сайт http://wwwabi.snv.jussieu.fr/imagene. Франция, Inst. Pasteur, REG, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 36
ГРНТИ : 76.03.59
Предметные рубрики: НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ОПИСАНИЕ
АНАЛИЗ
КОМПЬЮТЕРНЫЕ ПРОГРАММЫ
ПРОГРАММА IMAGENE
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.10-04Б2.167

Автор(ы) : Sekowska, Agnieszka, Bertin, Philippe, Danchin, Antoine
Заглавие : Characterization of polyamine synthesis pathway in Bacillus subtilis 168
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 29, N 3. - С. 851-858
Аннотация: Показано, что у Bacillus subtilis 168 имеется единственный путь биосинтеза полиаминов (I), к-рый начинается от аргинина и использует в кач-ве промежуточного продукта агматин. Идентифицирован ген аргининдекарбоксилазы speA (ранее cad). Описан оперон speE speB, направляющий синтез спермидинсинтазы и агматиназы (II). Он транскрибируется с образованием двух мРНК: главная соответствует одному гену speE, а минорная - обоим генам. Методом удлинения праймера картирован стартовый сайт транскрипции оперона. Анализ транскрипции оперона показал, что уровень синтеза II очень низок. Это обеспечивает строгий контроль синтеза путресцина и всех I. Полученные данные согласуются с уровнем I, измеренным в клетках. Франция, Regulation Expression Genetique, Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 26
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: МЕТАБОЛИЗМ
ПОЛИАМИНЫ
СИНТЕЗ
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН SPE BE
КЛОНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ФЕРМЕНТЫ
АРГИНИНДЕКАРБОКСИЛАЗА SPEA
СПЕРМИДИН-СИНТАЗА SPEE
АГМАТИНАЗА SPEB
ФУНКЦИЯ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.11-04Б2.89

Автор(ы) : Danchin, Antoine
Заглавие : Biochimie et Genetique moleculaire
Источник статьи : Lett. Inst. Pasteur. - 1998. - N 22. - С. 9-10
Аннотация: Основными направлениями исследований в Отделе биохимии и молекулярной генетики Института Пастера (Париж) являются: 1) введение искусственных оснований в хромосомы; 2) механизмы устранения измененных белков, накапливающихся при старении; 3) "репарация" белков, поврежденных клеточным дыханием; 4) структурный анализ белков и их взаимодействий с субстратами; 5) изучение цианобактерий и поддержание коллекции 600 штаммов организмов из биосферы; 6) участие в секвенировании генома Bacillus subtilis; 7) изучение гена переносчика Fe у трансгенных мышей; 8) изучение на трансгенных мышах 3 белков человека, участвующих в обмене холестерина
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: БИОХИМИЯ
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ГЕНЕТИКА
НАПРАВЛЕНИЯ ИССЛЕДОВАНИЙ
ПАСТЕРА ИНСТИТУТ
ОТДЕЛ БИОХИМИИ И МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 99.11-04Б4.74

Автор(ы) : Villani, Gaetano, Capitanio, Nazzareno, Bizzoca, antonella, Palese Luigi L., Carlino, Valeria, Tattoli, Maria, Glaser, Philippe, Danchin, Antoine, Papa, Sergio
Заглавие : Effects of site-directed mutagenesis of protolytic residues in subunit I of Bacillus subtilis aa[3]-600 quinol oxidase. Role of lysine 304 in proton translocation
Источник статьи : Biochemistry. - 1999. - Vol. 38, N 8. - С. 2287-2294
Аннотация: Исследовали функциональные последствия сайт-адресованного мутагенеза с заменами протолитических остатков на гидрофобные в субъединице I aa[3]-600-хинолоксидазы (ХО) B. subtilis. Идентифицированы 2 мутации (Y284F и K304L), нарушающие биоэнергетические функции этого микроорганизма. Мутация Y284F подавляет электрон-транспортную активность ХО и нарушает ее взаимодействие с CO и с H[2]H[2], т. е. вызывает деструкцию двухъядерного домена ХО. Мутация K304L не нарушает этих функций ХО, но блокирует активность ХО как протонного насоса. Сделан вывод, что остаток K304 консервативен для всех гем-медь-оксидаз и необходим для протон-транслоцирующей активности этих ферментов. Италия, Inst. Med. Biochem., Chem., Univ., Bari. Библ. 45
ГРНТИ : 34.27.29
Предметные рубрики: ХИНОЛОКСИДАЗА AA[3]-600
СУБЪЕДИНИЦА I
РОЛЬ LYS-304
ПЕРЕНОС ПРОТОНОВ
МУТАЦИИ
ВЛИЯНИЕ
BACILLUS SUBTILIS
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.12-04Б2.239

Автор(ы) : Baranova Natalya N., Danchin, Antoine, Neyfakh Alexander A.
Заглавие : Mta, a global MerR-type regulator of the Bacillus subtilis multidrug-efflux transporters
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 31, N 5. - С. 1549-1559
Аннотация: Выделены мутанты Bacillus subtilis, гиперэкспрессирующие транспортеры множественной лекарственной устойчивости Bmr (I) и Bml (II). Они имеют мутации в локусе mta (315'ГРАДУС' генетич. карты), клонирование и секвенирование к-рого показало, что он кодирует глобальный транскрипц. активатор Mta (III) - член семейства MerR регуляторных белков. Индивидуально экспрессированный N-концевой домен связывания I с ДНК взаимодействует с промоторами генов bmr и bml и индуцирует их транскрипцию. Этот домен стимулирует экспрессию самого гена mta и гена ydfK, кодирующего гипотетич. мембранный белок. Эти данные и гомология I с индуцируемым тиострептоном белком TipA Streptococcus lividans позволили предположить, что I является аутогенно контролируемым глобальным регулятором транскрипции, активность к-рого стимулируется неидентифицированным индуктором. Эта стимуляция имитируется удалением N-концевого домена III, связывающего индуктор. Т. к. I и II контролируются одним и тем же III, можно предположить, что некоторые функции I и II одинаковы или родственны. США, Ctr. for Pharm. Biotechnol., Univ. Illinois, Chicago, IL 60607. Библ. 33
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ТРАНСПОРТЕРОМ МНОЖЕСТВЕННОЙ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ГЛОБАЛЬНЫЙ РЕГУЛЯТОР ТРАНСКРИПЦИИ MTA
ФУНКЦИЯ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.01-04Б2.207

Автор(ы) : Rocha Eduardo P.C., Danchin, Antoine, Viari, Alain
Заглавие : Universal replication biases in bacteria
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 32, N 1. - С. 11-16
Аннотация: Анализ 15 полных бактериальных геномов обнаружил важные предочтения в организации генов. Сильная асимметрия состава нуклеотидов между генами в ведущей нити и генами в отстающей нити наблюдается на уровне нуклеотидов, кодонов и даже аминокислотных остатков в кодируемых генами белках. Для нек-рых видов этот перекос так велик, что простого знания аминокислотной последовательности белка достаточно для почти безошибочного предсказания, с какой из нитей ДНК транскрибируется данный ген. Эти предпочтения являются универсальными, а не видоспецифичными. Полученные данные могут иметь важные последствия для понимания таких фундаментальных биологических процессов, как точность репликации, использование кодонов в генах и даже использование аминокислот в белках. Франция, Atelier Bioinformatique, Univ. Paris VI, 75005 Paris. Библ. 29
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНОМ
АНАЛИЗ
ГЕНЫ
ОРГАНИЗАЦИЯ
СОСТАВ НУКЛЕОТИДОВ
СИЛЬНАЯ АССИМЕТРИЯ
КОРРЕЛЯЦИЯ
ТОЧНОСТЬ РЕПЛИКАЦИИ
БАКТЕРИИ
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.05-04Б2.299

Автор(ы) : Perrotte-Piquemal, Marina, Danchin, Antoine, Biville, Francis
Заглавие : Pyrophosphate increases the efficiency of enterobactin-dependent iron uptake in Escherichia coli
Источник статьи : Biochimie. - 1999. - Vol. 81, N 3. - С. 245-253
Аннотация: Добавление пирофосфата (I), аммоний-Fe{3+}-цитрата или FeCl[3] в минимальную среду М63, содержащую 1,7 мкМ Fe, повышает выход биомассы Escherichia coli. Из этих добавок только I вреден для штаммов, неспособных синтезировать энтеробактин (II). Т. обр. положительный эффект I связан с влиянием на энтеробактиновую систему поглощения в среде с низким содержанием Fe. В минимальной среде I репрессирует экспрессию генов, регулируемых белком Fur (III). В среде, богатой Fe, в к-рой синтез II значительно понижен, добавление I усиливает экспрессию генов, регулируемых III. Этот регуляторный эффект I усиливается в отсутствие синтеза II. Добавление I защищает клетки от окислительного стресса, вызванного присутствием H[2]O[2] в средах, богатых Fe. Эти данные показали, что I, действуя как хелатирующий Fe агент, запускает систему поглощения Fe, зависящую от II, и способствует усиленному связыванию Fe с II. Франция, Unite Regulation Expression Genet., Dep. Biochim. et. Genet., Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 50
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ЖЕЛЕЗО
СИСТЕМА ПОГЛОЩЕНИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ЭНТЕРОБАКТИН
ПИРОФОСФАТ
ФУНКЦИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
БИОМАССА
ВЫХОД
Дата ввода:

16.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.07-04Б2.304

Автор(ы) : Bertin, Philippe, Benhabiles, Nora, Krin, Evelyne, Laurent-Winter, Christine, Tendeng, Christian, Turlin, Evelyne, Thomas, Annick, Danchin, Antoine, Brasseur, Robert
Заглавие : The structural and functional organization of H-NS-like proteins is evolutionarily conserved in Gram-negative bacteria
Источник статьи : Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 31, N 1. - С. 319-329
Аннотация: Ранее гомологи белка H-NS (I) Escherichia coli были найдены у кишечных бактерий, Erwinia chrysanthemi и Haemophilus influenzae. Кроме того, у Bordetella pertussis белок BpH3 (II) имеет небольшую гомологию с I, особенно в N-концевом домене. Белок-активатор HvrA (III) Rhodobacter capsulatus также имеет небольшую, но достоверную гомологию с I. С использованием предсказания вторичной структуры и моделирования домена связывания с ДНК, основанного на аминок-тных последовательностях I-III и белка StpA (похожего на I белка E. coli), а также изучения комплементации связанных с I фенотипов и конкурентного сдвига ЭФ-подвижности доказано, что эти белки принадлежат к одному классу связывающихся с ДНК белков. Анализ in silico позволил предположить, что к этому семейству относятся также III из R. sphaeroides, XrvA из Xanthomonas oryzae и VirH из Vibrio cholerae. Т. обр. белки, структурно и функционально родственные I, широко распространены у грам-отрицательных бактерий. Франция, Unite Regulation Expression Getet., Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 55
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: БЕЛОК
H-NS
ГОМОЛОГИЯ
БЕЛОК BPH3
BORDETELLA PERTUSSIS (BACT.)
БЕЛОК HVR A
RHODOBACTER CAPSULATUS (BACT.)
ДНК-СВЯЗЫВАЮЩИЕ БЕЛКИ
СТРУКТУРА ВТОРИЧНАЯ
ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ
ЭВОЛЮЦИОННАЯ КОНСЕРВАТИВНОСТЬ
ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ
Дата ввода:

17.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.08-04Б2.155

Автор(ы) : Sismeiro, Odile, Trotot, Pascale, Biville, Francis, Vivares, Christian, Danchin, Antoine
Заглавие : Aeromonas hydrophila adenylyl cyclase 2: A new class of adenylyl cyclases with thermophilic properties and sequence similarities to proteins from hyperthermophilic archaebacteria
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 13. - С. 3339-3344
Аннотация: При комплементации мутанта cya Escherichia coli геномной библиотекой Aeromonas hydrophila выделены клоны с 2 разными генами аденилилциклаз (I). Ген cyaA кодирует I-1, гомологичную известным I, а ген cyaB - новую I-2, не имеющую гомологов в базах данных и не гомологичную 3 известным классам I. Очищенная I-2 имеет высокие оптимальные т-ру (65'ГРАДУС') и pH (9,5). Гены cyaA и cyaB инактивированы в хромосоме A. hydrophila. Показано, что в отличие от cyaA, ген cyaB не экспрессируется в обычных лабораторных условиях роста. Однако введение плазмиды с геном cyaB в мутанты cyaA и cyaA cyaB вызывает образование цАМФ. I-2 является первым членом нового класса I, не имеющим гомологов у др. организмов. Однако обнаружена гомология I-2 с продуктами генов 3 термофильных археев: Methanobacterium thermoautotrophicum, Archaeoglobus fulgidus и Methanococcus jannaschii. Франция, Dep. Biol. et Genet. Mol., Inst. Pasteur, 75015 Paris. Библ. 28
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕН АДЕНАЛИЛЦИКЛАЗЫ-1 CYAA
ГЕН АДЕНИЛИЛЦИКЛАЗЫ-2 CYAB ВЫДЕЛЕНИЕ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
АДЕНИЛИЛЦИКЛАЗА-2
ГОМОЛОГИЯ
ПРОДУКТЫ ГЕНОВ
ГИПЕРТЕРМОФИЛЬНЫЕ АРХЕИ
Дата ввода:

18.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.09-04Б2.253

Автор(ы) : Bucurenci, Nadia, Serina, Lidia, Zaharia, Cristina, Landais, Stphanie, Danchin, Antoine, Barzu, Barzu
Заглавие : Mutational analysis of UMP kinase from Escherichia coli
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 3. - С. 473-477
Аннотация: Хотя УМФ-киназа Escherichia coli (I) не гомологична др. нуклеозидмонофосфаткиназам, 2 ее сегмента (остатки 35-78 и 145-194) идентичны соотв. фосфоглицераткиназе (на 28%) и аспартокиназе (на 30%). Исходя из этих гомологий, выбрано несколько остатков I в кач-ве мишеней для сайт-направленного мутагенеза. Биохимич., генетич. и спектроскопич. анализ модифицированных I идентифицировал остатки, существенные для катализа (асп[146]), связывания УМФ (асп[174]) и взаимодействия с аллостерич. эффекторами ГТФ и УТФ (арг[62] и асп[77]). Франция, Lab. Chim. Structurales Macromolecules, Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 18
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: УМФ-КИНАЗА
САЙТ-НАПРАВЛЕННЫЙ МУТАГЕНЕЗ
ОСТАТКИ СУЩЕСТВЕННЫЕ ДЛЯ КАТАЛИЗА
СВЯЗЫВАНИЕ УМФ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С АЛЛОСТЕРИЧЕСКИМИ ЭФФЕКТОРАМИ
ГТФ
УТФ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

19.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 00.11-04А3.900

Автор(ы) : Danchin, Antoine
Заглавие : A brief history of genome research and bioinformatics in France
Источник статьи : Bioinformatics. - 2000. - Vol. 16, N 1. - С. 65-75
Аннотация: Медленное развитие геномики in silico во Франции обусловлено различными политическими причинами. В кратком обзоре рассмотрена деятельность 2 организаций, координирующих развитие геномики и биоинформатики во Франции: Groupement de Recherche sur les Genomes (GREG) и Groupement de Recherche 1029 (GDR 1029), входящих в Национальную академию наук (CNRS). Франция, Inst. Pasteur, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 27
ГРНТИ : 34.05.25
Предметные рубрики: БИОИНФОРМАТИКА
ГЕНОМИКА
ФРАНЦИЯ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 57
Дата ввода:

20.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.04-04Б2.269

Автор(ы) : Landais, Stephanie, Gounon, Pierre, Laurent-Winter, Christine, Mazie, Jean-Claude, Danchin, Antoine, Barzu, Octavian, Sakamoto, Hiroshi
Заглавие : Immunochemical analysis of UMP kinase from Escherichia coli
Источник статьи : J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 3. - С. 833-840
Аннотация: Изучено взаимодействие поликлональных и моноклональных антител (ПКА и МКА) с целой УМФ-киназой (I) и ее фрагментами, полученными методом делец. мутагенеза. Обнаружена иммунодоминантность C-концевой четверти I. ПКА ингибируют активность I с частичным или полным устранением аллостерич. эффектов УТФ и ГТФ соотв., что указало на частичное перекрывание сайтов связывания УТФ и ГТФ в I. МКА 44-2 (II) узнает линейный эпитоп остатков 171-180 в I. Замена D174N в I устраняет взаимодействие с II. С использованием ПКА показано, что: 1) при 2-мерном ЭФ I образует пятно с pI 7,24 и мол. м. 26 кД; 2) I расположена в клетках E. coli рядом с мембранами. Такая локализация I объясняется св-вами агрегации I in vitro и указывает на возможную роль I в клеточном делении. Франция, Lab. Chim. Structurales Macromolecules, Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 39
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ФЕРМЕНТЫ
УМФ-КИНАЗА
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
ИММУНОХИМИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
ПОЛИКЛОНАЛЬНЫЕ АНТИТЕЛА
МОНОКЛОНАЛЬНЫЕ АНТИТЕЛА
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
Дата ввода:

1-20 21-40 41-57

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска