СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Coolen, Marco J. L.$<.>)

Общее количество найденных документов : 15
Показаны документы с 1 по 15

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.06-04Б2.150

Автор(ы) : Coolen Marco J.L., Overmann, Jorg
Заглавие : 217 000-year-old DNA sequences of green sulfur bacteria in Mediterranean sapropels and their implications for the reconstruction of the paleoenvironment
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 9, N 1. - С. 238-249
Аннотация: Глубоководные донные отложения восточного средиземноморья содержат множество органических богатых углеродом слоев, т. наз. сапропелей. В этих слоях обнаружен каротиноид изорениератен. Поскольку он специфичен для облигатно анаэробных фототрофных зеленых серных бактерий (ЗСБ), его присутствие может служить свидетельством существования обширных водяных столбов с аноксигенными условиями в древнем средиземмноморье. Для ЗСБ характерны три каротиноида (изорениератен, 'бета'-изорениератен и хлоробактен), к-рые, однако, не позволяют различить 'ЭКВИВ'80 известных филотипов. Чтобы сделать более детальную реконструкцию палеоэкологических условий, проведен поиск ископаемых последовательностей 16S рРНК ЗСБ с применением методологии, пригодной для древних ДНК. Из сапропелей 217 000-летней давности можно амплифицировать последовательности длиной 540 п. н. Такие последовательности были выделены и из бедных углеродом промежуточных слоев отложений, откладывающихся по времена, когда водные столбы были полностью кислородными. Неожиданным оказалось то, что все последовательности 16S рРНК группировались с пресноводными или солоноватыми, а не морскими типами ЗСБ. Возможно, молекулярные останки ЗСБ происходят из популяций, которые процветали в прилегающих районах или эстуариях на побережье, а не из пелагических популяций. Германия (J. Overmann), Section Microbiol., Ludwig-Maximilians-Univ. Munchen, D-80638 Munchen. E-mail: j.overmann@lrz.uni-muenchen.de. Fax: (+49)89 2180 6125
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: ЗЕЛЕНЫЕ СЕРНЫЕ БАКТЕРИИ
ДРЕВНИЕ САПРОПЕЛИ
ДНК
ВЫДЕЛЕНИЕ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
ДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 09.06-04Б3.158

Автор(ы) : Coolen Marco J.L., Overmann, Jorg
Заглавие : 217 000-year-old DNA sequences of green sulfur bacteria in Mediterranean sapropels and their implications for the reconstruction of the paleoenvironment
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 9, N 1. - С. 238-249
Аннотация: Глубоководные донные отложения восточного средиземноморья содержат множество органических богатых углеродом слоев, т. наз. сапропелей. В этих слоях обнаружен каротиноид изорениератен. Поскольку он специфичен для облигатно анаэробных фототрофных зеленых серных бактерий (ЗСБ), его присутствие может служить свидетельством существования обширных водяных столбов с аноксигенными условиями в древнем средиземмноморье. Для ЗСБ характерны три каротиноида (изорениератен, 'бета'-изорениератен и хлоробактен), к-рые, однако, не позволяют различить 'ЭКВИВ'80 известных филотипов. Чтобы сделать более детальную реконструкцию палеоэкологических условий, проведен поиск ископаемых последовательностей 16S рРНК ЗСБ с применением методологии, пригодной для древних ДНК. Из сапропелей 217 000-летней давности можно амплифицировать последовательности длиной 540 п. н. Такие последовательности были выделены и из бедных углеродом промежуточных слоев отложений, откладывающихся по времена, когда водные столбы были полностью кислородными. Неожиданным оказалось то, что все последовательности 16S рРНК группировались с пресноводными или солоноватыми, а не морскими типами ЗСБ. Возможно, молекулярные останки ЗСБ происходят из популяций, которые процветали в прилегающих районах или эстуариях на побережье, а не из пелагических популяций. Германия (J. Overmann), Section Microbiol., Ludwig-Maximilians-Univ. Munchen, D-80638 Munchen. E-mail: j.overmann@lrz.uni-muenchen.de. Fax: (+49)89 2180 6125
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: ЗЕЛЕНЫЕ СЕРНЫЕ БАКТЕРИИ
ДРЕВНИЕ САПРОПЕЛИ
ДНК
ВЫДЕЛЕНИЕ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
ДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.07-04Б2.50

Автор(ы) : Schubert Carsden J., Coolen Marco J.L., Neretin Le N., Schippers, Axel, Abbas, Ben, Durisch-Kaiser, Edith, Wehrli, Bernhard, Hopmans Ellen C., Damste Jaap S.Sinninghe, Wakeham, Stuart, Kuypers Marcel M.M.
Заглавие : Aerobic and anaerobic methanotrophis in the Black Sea water column
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 10. - С. 1844-1856
Аннотация: Установлено, что аэр. метанотрофы типа I ответственны за окисление метана в оксическом водяном столбе и ANME-1 и ANME-2 - родственные организмы - за анаэр. окисление метана. Распространение метанотрофов типа I в аноксической зоне означает, что неактивные клетки поселяются в более глубоких водах. Молекулярные и биомаркерные рез-ты показывают, что существует четкое различие между распространением ANME-1 и ANME-2 - близкими линиями родства, т. е. первые ответственны за анаэр. окисление метана в водяном столбе 600 м глубиной, а вторые - за этот процесс в аноксическом водяном столбе 'ЭКВИВ'600 м глубиной
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: МЕТАНОТРОФНЫЕ БАКТЕРИИ
АЭРОБНЫЕ МЕТАНОТРОФЫ
АНАЭРОБНЫЕ МЕТАНОТРОФЫ
РАСПРОСТРАНЕНИЕ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 08.01-04Б3.136

Автор(ы) : Schubert Carsden J., Coolen Marco J.L., Neretin Le N., Schippers, Axel, Abbas, Ben, Durisch-Kaiser, Edith, Wehrli, Bernhard, Hopmans Ellen C., Damste Jaap S.Sinninghe, Wakeham, Stuart, Kuypers Marcel M.M.
Заглавие : Aerobic and anaerobic methanotrophis in the Black Sea water column
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 8, N 10. - С. 1844-1856
Аннотация: Установлено, что аэр. метанотрофы типа I ответственны за окисление метана в оксическом водяном столбе и ANME-1 и ANME-2 - родственные организмы - за анаэр. окисление метана. Распространение метанотрофов типа I в аноксической зоне означает, что неактивные клетки поселяются в более глубоких водах. Молекулярные и биомаркерные рез-ты показывают, что существует четкое различие между распространением ANME-1 и ANME-2 - близкими линиями родства, т. е. первые ответственны за анаэр. окисление метана в водяном столбе 600 м глубиной, а вторые - за этот процесс в аноксическом водяном столбе 'ЭКВИВ'600 м глубиной
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: МЕТАНОТРОФНЫЕ БАКТЕРИИ
АЭРОБНЫЕ МЕТАНОТРОФЫ
АНАЭРОБНЫЕ МЕТАНОТРОФЫ
РАСПРОСТРАНЕНИЕ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.11-04Б2.133

Автор(ы) : Coolen Marco J.L., Overman, Jorg
Заглавие : Analysis of subfossil molecular remains of purpe sulfur bacterial in a lake sediment
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 11. - С. 4513-4521
Аннотация: Обнаружены молекулярные останки пурпурных серных бактерий (ПСБ). В осадках, имеющих возраст до 11 000 лет, найдены каротеноидокенон (I) и бактериофеофитин a. I специфичен для нескольких видов Chromatiaceae, включая Amoebobacter purpureus, преобладающих в современном хемоклинном бактериальном сообществе озера. С набором праймеров, специфичных для Chromatiaceae, из различных глубин осадка амплифицированы последовательности гена рРНК 16S для 4 разных видов Chromatiaceae. Одна из последовательностей из образца возрастом 9100 лет на 99,2% идентичен гену рРНК 16S изолята A. purpureus ML1 из хемоклина. С праймерами, специфичными для A. purpureus ML1, и до т-блот-гибридизацией продуктов ПЦР предел обнаружения ДНК A. purpureus ML1 понижен до 0,004% валовой ДНК сообщества. Этим методом ДНК изолята обнаружена в 7 из 10 слоев осадка. Это показало, что A. purpureus ML1 является одним из членов древнего сообщества СПБ. Конц-ии ДНК A. purpureus и I в осадке не коррелируют друг с другом: в субископаемых слоях осадка отношение конц-ий ДНК и I гораздо меньше (2,7*10{-6}), чем в целых клетках (1,4). Это показало, что скорость деградации для ДНК гораздо выше, чем для углеводородных компонентов клетки, даже при очень высокой конц-ии сульфида в аноксич. условиях в озере Махони. Германия, Inst. for Chem. and Biol. Marine Environ., Univ. Oldenburg, D-26111 Oldenburg. Библ. 51
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ПУРПУРНЫЕ СЕРНЫЕ БАКТЕРИИ
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ОСТАНКИ
СОЛЕНОЕ ОЗЕРО МАХОНИ
КАНАДА
ГЕНЫ
ГЕНЫ РРНК 16S
АМПЛИФИКАЦИЯ
ИДЕНТИЧНОСТЬ
ГЕН РРНК 16S
ИЗОЛЯТ AMOEBOBACTER PURPUREUS
ШТАММ ML1
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 14.12-04А2.37

Автор(ы) : Coolen Marco J.L., Orsi William D., Balkema, Cherel, Quince, Christopher, Harris, Keith, Sylva Sean P., Filipova-Marinova, Mariana, Giosan, Liviu
Заглавие : Evolution of the plankton paleome in the Black Sea from the Deglacial to Anthropocene
Источник статьи : Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2013. - Vol. 110, N 21. - С. 8609-8614
Аннотация: Для реконструкции состава планктона Черного моря за последние 11400 лет использованы остатки ДНК в донных отложениях. Из 2710 видов 150 реагировали на 4 стадии экол. изменений с позднего ледникового периода до голоцена. Около 9000 г. до н.э. имелись пресноводные водоросли, но присутствовали и неопределенные морские таксоны. На осолонение в середине голоцена сильно реагировали динофлагелляты, Cercozoa, Eustigmatophyceae и Haptophyta. Соленость быстро выросла примерно 5000 лет назад, после чего появились морские грибы и копеподы. Около 2500 лет назад некоторое опреснение привело к сукцессии динофлагеллят, диатомовых и хризофитов. США, Marine Chemistry and Geochemistry Dept., Woods Hole Oceanographic Inst., Woods Hole, MA 02543. E-mail:mcoolen@whol.edu. Ил.3. Библ. 48
ГРНТИ : 34.35.33
Предметные рубрики: ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
МОРЯ
ПЛАНКТОН
ПАЛЕОРЕКОНСТРУКЦИИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 15.03-04И1.53

Автор(ы) : Coolen Marco J.L., Orsi William D., Balkema, Cherel, Quince, Christopher, Harris, Keith, Sylva Sean P., Filipova-Marinova, Mariana, Giosan, Liviu
Заглавие : Evolution of the plankton paleome in the Black Sea from the Deglacial to Anthropocene
Источник статьи : Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2013. - Vol. 110, N 21. - С. 8609-8614
Аннотация: Для реконструкции состава планктона Черного моря за последние 11400 лет использованы остатки ДНК в донных отложениях. Из 2710 видов 150 реагировали на 4 стадии экол. изменений с позднего ледникового периода до голоцена. Около 9000 г. до н.э. имелись пресноводные водоросли, но присутствовали и неопределенные морские таксоны. На осолонение в середине голоцена сильно реагировали динофлагелляты, Cercozoa, Eustigmatophyceae и Haptophyta. Соленость быстро выросла примерно 5000 лет назад, после чего появились морские грибы и копеподы. Около 2500 лет назад некоторое опреснение привело к сукцессии динофлагеллят, диатомовых и хризофитов. США, Marine Chemistry and Geochemistry Dept., Woods Hole Oceanographic Inst., Woods Hole, MA 02543. E-mail:mcoolen@whol.edu. Ил.3. Библ. 48
ГРНТИ : 34.33.15
Предметные рубрики: ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
МОРЯ
ПЛАНКТОН
ПАЛЕОРЕКОНСТРУКЦИИ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.11-04Б2.159

Автор(ы) : Coolen Marco J.L., Overmann, Jorg
Заглавие : Functional exoenzymes as indicators of metabolically active bacteria in 124,000-year-old sapropel layers of the eastern mediterranean sea
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 2000. - Vol. 66, N 6. - С. 2589-2598
Аннотация: Слои сапропеля содержали до 1,5*10{8} бактериальных клеток в 1 см{3}, тогда как в промежуточных слоях находилось в 10 раз меньше бактерий. В сапропелях при определении активности экзоферментов с флуоресцентно меченными аналогами субстратов сильно мешало поглощение возникающих в результате ферментативного отщепления флуорофоров (4-метилумбеллиферона и 7-амино-4-метилкумарина) частицами в отложениях. Поскольку все способы экстракции сорбированных флуорофоров оказались неподходящими для сапропелевых частиц, авторы ввели способ коррекции, основанный на измерениях равновесных изотерм связывания обоих соединений. С применением этого подхода удалось определить высокие уровни активности аминопептидазы и щелочной фосфатазы даже в отложениях сапропеля 124 000-летней давности, а активность 'бета'-глюкозидазы во всех слоях оказалась низкой. Высокая сорбционная способность частиц сапропеля проявлялась не только в отношении флуорофоров, но и ДНК. Германия (Overmann J.), Paleomicrobiology Group, Inst. For the Chem. and Biol. of the Marine Environment, Univ. Oldenburg, D-26111 Oldenburg, E-mail: j.overmann@icbm.de Fax: 49-441-798-3583. Библ. 66
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: САПРОПЕЛИ
ДРЕВНИЕ ОТЛОЖЕНИЯ
БАКТЕРИИ
ЭКЗОФЕРМЕНТЫ
МЕТАБОЛИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ
ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ СУБСТРАТЫ
ФЛУОРОФОРЫ
СОРБЦИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 01.11-04Б3.205

Автор(ы) : Coolen Marco J.L., Overmann, Jorg
Заглавие : Functional exoenzymes as indicators of metabolically active bacteria in 124,000-year-old sapropel layers of the eastern mediterranean sea
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 2000. - Vol. 66, N 6. - С. 2589-2598
Аннотация: Слои сапропеля содержали до 1,5*10{8} бактериальных клеток в 1 см{3}, тогда как в промежуточных слоях находилось в 10 раз меньше бактерий. В сапропелях при определении активности экзоферментов с флуоресцентно меченными аналогами субстратов сильно мешало поглощение возникающих в результате ферментативного отщепления флуорофоров (4-метилумбеллиферона и 7-амино-4-метилкумарина) частицами в отложениях. Поскольку все способы экстракции сорбированных флуорофоров оказались неподходящими для сапропелевых частиц, авторы ввели способ коррекции, основанный на измерениях равновесных изотерм связывания обоих соединений. С применением этого подхода удалось определить высокие уровни активности аминопептидазы и щелочной фосфатазы даже в отложениях сапропеля 124 000-летней давности, а активность 'бета'-глюкозидазы во всех слоях оказалась низкой. Высокая сорбционная способность частиц сапропеля проявлялась не только в отношении флуорофоров, но и ДНК. Германия (Overmann J.), Paleomicrobiology Group, Inst. For the Chem. and Biol. of the Marine Environment, Univ. Oldenburg, D-26111 Oldenburg, E-mail: j.overmann@icbm.de Fax: 49-441-798-3583. Библ. 66
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: САПРОПЕЛИ
ДРЕВНИЕ ОТЛОЖЕНИЯ
БАКТЕРИИ
ЭКЗОФЕРМЕНТЫ
МЕТАБОЛИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ
ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ СУБСТРАТЫ
ФЛУОРОФОРЫ
СОРБЦИЯ
Дата ввода:

10.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 02.12-04Б3.141

Автор(ы) : Coolen Marco J.L., Cypionka, Heribert, Sass Andrea M., Sass, Henrik, Overmann, Jorg
Заглавие : Ongoing modification of Mediterranean Pleistocene sapropels mediated by prokaryotes
Источник статьи : Science. - 2002. - Vol. 296, N 5577. - С. 2407-2410
Аннотация: В богатых органикой осадках позднего плейстоцена (сапропели) восточного Средиземноморья обитают неизвестные хемоорганотрофные, метаболически активные прокариоты. Сапропели были обследованы с помощью окрашивания акридиновым оранжевым с последующей флуоресцентной микроскопией. По сравнению с бедными C промежуточными слоями, сапропели были населены большим кол-вом микробных клеток. Их отличала высокая активность экзогидролаз ('бета'-глюкозидаз, аминопептидаз и щелочных фосфатаз). Использование равномерно меченной D-[{14}C]-глюкозы выявило повышенную скорость ее деградации. Подтвердилось происхождение микробных C-субстратов из сапропельных слоев возрастом в 217 000 лет. Анализ гена 16S-рРНК показал, что на долю некультивируемых зеленых несерных бактерий приходится до 70% всей микробной биомассы. Crenarchaeota составляли около 16% микробиоты. Был обнаружен медленный, но заметный оборот глюкозы. Подчеркиваются современные изменения состава сапропелей под действием метаболически активных зеленых несерных бактерий и Crenarchaeota. Германия, Inst. for Chem. & Biol. of the Marine Environment, Univ. of Oldenburg [E-mail:J.overmann@LRZ.uni-muenchen.de]. Библ. 25
ГРНТИ : 34.27.39
Предметные рубрики: ПРОКАРИОТЫ
ХЕМООРГАНОТРОФНЫЕ ПРОКАРИОТЫ
ОБНАРУЖЕНИЕ В САПРОПЕЛЯХ
ЗЕЛЕНЫЕ НЕСЕРНЫЕ БАКТЕРИИ
CRENARCHAEOTA (ARCHAEA)
ОБОРОТ ГЛЮКОЗЫ
АКТИВНОСТЬ ЭКЗОГИДРОЛАЗ
Дата ввода:

11.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.01-04Б2.208

Автор(ы) : Coolen Marco J.L., Cypionka, Heribert, Sass Andrea M., Sass, Henrik, Overmann, Jorg
Заглавие : Ongoing modification of Mediterranean Pleistocene sapropels mediated by prokaryotes
Источник статьи : Science. - 2002. - Vol. 296, N 5577. - С. 2407-2410
Аннотация: В богатых органикой осадках позднего плейстоцена (сапропели) восточного Средиземноморья обитают неизвестные хемоорганотрофные, метаболически активные прокариоты. Сапропели были обследованы с помощью окрашивания акридиновым оранжевым с последующей флуоресцентной микроскопией. По сравнению с бедными C промежуточными слоями, сапропели были населены большим кол-вом микробных клеток. Их отличала высокая активность экзогидролаз ('бета'-глюкозидаз, аминопептидаз и щелочных фосфатаз). Использование равномерно меченной D-[{14}C]-глюкозы выявило повышенную скорость ее деградации. Подтвердилось происхождение микробных C-субстратов из сапропельных слоев возрастом в 217 000 лет. Анализ гена 16S-рРНК показал, что на долю некультивируемых зеленых несерных бактерий приходится до 70% всей микробной биомассы. Crenarchaeota составляли около 16% микробиоты. Был обнаружен медленный, но заметный оборот глюкозы. Подчеркиваются современные изменения состава сапропелей под действием метаболически активных зеленых несерных бактерий и Crenarchaeota. Германия, Inst. for Chem. & Biol. of the Marine Environment, Univ. of Oldenburg [E-mail:J.overmann@LRZ.uni-muenchen.de]. Библ. 25
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: ПРОКАРИОТЫ
ХЕМООРГАНОТРОФНЫЕ ПРОКАРИОТЫ
ОБНАРУЖЕНИЕ В САПРОПЕЛЯХ
ЗЕЛЕНЫЕ НЕСЕРНЫЕ БАКТЕРИИ
CRENARCHAEOTA (ARCHAEA)
ОБОРОТ ГЛЮКОЗЫ
АКТИВНОСТЬ ЭКЗОГИДРОЛАЗ
Дата ввода:

12.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.02-04Б2.124

Автор(ы) : Coolen Marco J.L., Talbot Helen M., Abbas Ben A., Ward, Christopher, Shouten, Stefan, Volkman John K., Damste Jaap S.Sinninghe
Заглавие : Sources for sedimentary bacteriohopanepolyols as revealed by 16S rDNA stratigraphy
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 10, N 7. - С. 1783-1803
Аннотация: Бактериогапоноиды - это широко распространенные липидные биомаркеры в летописи осадков. Источниками этих липидов являются многие аэр. и анаэр. бактерии, но использование этих биомаркеров как показателей экологических изменений порой осложнено. Для уточняющего обследования биологических образцов гопанеполиолов бактерий (ГПБ) времен голоцена использовали анализ сохранившихся в осадках 16S рРНК. Обследование проводили в стратифицированных непрерывно накапливаемых сульфидных осадках послеледникового оз. Ace (в Антарктике). Анализировали набор сохранившихся ГПБ. Они обнаруживали разнообразие структурных форм, состав к-рых отличался по вертикали осадков, отражая изменения в популяциях бактерий, вызванных крупными изменениями в солености озера. Состав устойчивых изотопов в молекулах гопанолов, образовавшихся из ГПБ после их расщепления надйодной к-той, показал, что некоторые из низ были существенно обеднены по {13}C, что указывало на их метанотрофное происхождение. Используя чувствительные молекулярные приемы, показали, что метанотрофные бактерии I- и II-типа (соответственно Methylomonas и Methylocystis) были уникальны в кач-ве обитателей старейших из осадков этого озера (возраста 9400 лет). Количественный анализ законсервированных остатков ДНК показал, что метанотрофы I-типа, включая метанотрофов-симбионтов, обитавших на жабрах моллюсков из глубоководных холодных высачиваний метана, давали 35-аминоГПБ (т.е. аминопентол, -тетрол и -триолы). После отделения озера 'ЭКВИВ'3000 лет назад один представитель метанотрофов I-типа "метанотрофного кластера жаберных симбионтов" оставался наиболее вероятным источником аминотетрола и триола. В старейших из озерных осадков был обнаружен филотип Synechococcus, родственный пелагическим пресноводным штаммам. Очевидно, он и был источником метилированного ГПБ (2-Me-ГПБ). Заключается, что одновременное использование современных геохимических и палеогеномных подходов обогащает наши знания о биогехимических процессах, происходивших в голоцене в оз. Ace. Нидерланды, Dep. of Marine Orgnic Biogeochemistry, NIOZ Royal Netherlands Inst. for Sea Res., PO Box 59, 1790 AB Den Burg (Texel), (E-mail: mcoolen@whoi.edu)
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: ГАПОНЕПОЛИОЛЫ
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ГАПОНЕПОЛИОЛЫ ВРЕМЕН ГОЛОЦЕНА
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ
ОЗЕРА
ПОСЛЕЛЕДНИКОВОЕ ОЗЕРО
СУЛЬФИДНЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ
МЕТАНОТРОФНЫЕ БАКТЕРИИ
SYNECHOCOCCUS (BACT.)
Дата ввода:

13.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 13.08-04А2.23

Автор(ы) : Boere Arjan C., Damste Jaap S.Sinninghe, Rijpstra W.Iren C., Volkman John K., Coolen Marco J.L.
Заглавие : Surce-specific variability in post-depositional DNA preservation with potential implications for DNA based paleoecological records
Источник статьи : Org. Geochem. - 2011. - Vol. 42, N 10. - С. 1216-1225
Аннотация: Сравнили степень сохранности ископаемой ДНК планктонных видов разного клеточного строения в 2700-летнем осадке в антарктическом фьорде Эллис. Объем сохранившихся малых субъединиц рибосомной ДНК (SSU-рДНК, 'ЭКВИВ'500 пар оснований) динофлагеллят (скорее внутриклеточной, чем внутрицистовой), поддающийся PCR-амплификации, снижался до 5 порядков величины с глубиной и возрастом осадка. В противоположность этому, сходным по размеру SSU рДНК диатомей (гл. обр. Chaetoceros) уменьшались лишь 10-кратно в ходе 2700-летнего отложения. Размер природно разрушаемых фрагментов, слишком малых для PCR-тестов, был наибольшим у динофлагеллят и наименьшим - у фотосинтезирующих зеленых сульфобактерий (GSB). Обсуждаются возможные причины изменчивости сохранности ДНК у разных групп планктона
ГРНТИ : 34.35.33
Предметные рубрики: ДОННЫЕ ОТЛОЖЕНИЯ
ВОЗРАСТ
ПЛАНКТОННЫЕ ОРГАНИЗМЫ
ДНК
СОХРАННОСТЬ
ПАЛЕОЭКОЛОГИЯ
ФЬОРД ЭЛЛИС
АНТАРКТИКА
Дата ввода:

14.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 08.11-04А2.57

Автор(ы) : Herfort, Lydie, Schouten, Stefan, Abbas, Ben, Veldhuis Marcel J.W., Coolen Marco J.L., Wuchter, Cornelia, Boon Jan P., Herndl Gerhard J., Sinninghe Damste Jaap S.
Заглавие : Variations in spatial and temporal distribution of Archaea in the North Sea in relation to environmental variables
Источник статьи : FEMS Microbiol. Ecol. - 2007. - Vol. 62, N 3. - С. 242-257
Аннотация: Изучали пространственное и временное распределение пелагических Archaea в юж. части Северного моря с помощью рРНК гибридизации, секвенирования и количественного определения 16S рРНК, анализа мембранных липидов и физ., хим. и биол. параметров окружающей среды, чтобы определить факторы, влияющие на биогеографию архей. Наблюдалась четкая временная изменчивость, причем морские Crenarchaeota (группа I. 1a) были относительно более многочисленны зимой, а Euryarchaeota доминировали в архейном сообществе весной и летом. Также были очевидны пространственные различия в латеральном распределении Crenarchaeota. В действительности их обилие положительно коррелировало с кол-вом копий гена, кодирующего 'альфа'-субъединицу аммоний-монооксигеназы кренархеот и с конц-иями аммиака, нитрата, нитрита и фосфора. Это означает, что большинство Crenarchaeota в Северном море - нитрификаторы, и что их распределение определяется конц-иями питательных компонентов. Однако, Crenarchaeota не были обильными, когда в большей части фитопланктона доминировали водоросли. Предполагается, что вместе с конц-ией питательных компонентов, биомасса фитопланктона и структура сообщества могут предсказать обилие кренархеот в юж. части Северного моря. Численность эвриархеот положительно коррелировала с конц-иями хлорофилла a, но не со структурой фитопланктонного сообщества. Так или иначе, это связано с возможностью Euryarchaota осуществлять аэробную аноксигенную фототрофию, но заметный сезонный тип распределения Crenarchaeota и Euryarchaeota означает, что они занимают различные экологические ниши. США, Environ. and Biomolecular Systems. OGI School of Sci. and Engineering, Oregon Health a. Sci. Univ., Beaverton, OR 97006. E-mail: Herfortl@ebs.ogi.edu
ГРНТИ : 34.35.33
Предметные рубрики: CRENARCHAEOTA (ARCH.)
EURYARCHAEOTA (ARCH.)
ПРОСТРАНСТВЕННОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
СЕЗОННОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
МОРСКИЕ СРЕДЫ
Дата ввода:

15.

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.11-04Б2.86

Автор(ы) : Herfort, Lydie, Schouten, Stefan, Abbas, Ben, Veldhuis Marcel J.W., Coolen Marco J.L., Wuchter, Cornelia, Boon Jan P., Herndl Gerhard J., Sinninghe Damste Jaap S.
Заглавие : Variations in spatial and temporal distribution of Archaea in the North Sea in relation to environmental variables
Источник статьи : FEMS Microbiol. Ecol. - 2007. - Vol. 62, N 3. - С. 242-257
Аннотация: Изучали пространственное и временное распределение пелагических Archaea в юж. части Северного моря с помощью рРНК гибридизации, секвенирования и количественного определения 16S рРНК, анализа мембранных липидов и физ., хим. и биол. параметров окружающей среды, чтобы определить факторы, влияющие на биогеографию архей. Наблюдалась четкая временная изменчивость, причем морские Crenarchaeota (группа I. 1a) были относительно более многочисленны зимой, а Euryarchaeota доминировали в архейном сообществе весной и летом. Также были очевидны пространственные различия в латеральном распределении Crenarchaeota. В действительности их обилие положительно коррелировало с кол-вом копий гена, кодирующего 'альфа'-субъединицу аммоний-монооксигеназы кренархеот и с конц-иями аммиака, нитрата, нитрита и фосфора. Это означает, что большинство Crenarchaeota в Северном море - нитрификаторы, и что их распределение определяется конц-иями питательных компонентов. Однако, Crenarchaeota не были обильными, когда в большей части фитопланктона доминировали водоросли. Предполагается, что вместе с конц-ией питательных компонентов, биомасса фитопланктона и структура сообщества могут предсказать обилие кренархеот в юж. части Северного моря. Численность эвриархеот положительно коррелировала с конц-иями хлорофилла a, но не со структурой фитопланктонного сообщества. Так или иначе, это связано с возможностью Euryarchaota осуществлять аэробную аноксигенную фототрофию, но заметный сезонный тип распределения Crenarchaeota и Euryarchaeota означает, что они занимают различные экологические ниши. США, Environ. and Biomolecular Systems. OGI School of Sci. and Engineering, Oregon Health a. Sci. Univ., Beaverton, OR 97006. E-mail: Herfortl@ebs.ogi.edu
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: CRENARCHAEOTA (ARCH.)
EURYARCHAEOTA (ARCH.)
ПРОСТРАНСТВЕННОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
СЕЗОННОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
МОРСКИЕ СРЕДЫ
Дата ввода:

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска