СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Auguet, Jean-Christophe$<.>)

Общее количество найденных документов : 5
Показаны документы с 1 по 5

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI10) 09.02-04А2.164

Автор(ы) : Auguet, Jean-Christophe, Casamayor Emilio O.
Заглавие : A hotspot for cold crenarchaeota in the neuston of high mountain lakes
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 10, N 4. - С. 1080-1086
Аннотация: Исследовали обилие и доминирование филотипов архей в планктоне (в верхнем 1-метровом слое воды) 10 высокогорных озер в Центральных Пиренеях (Испания). Использованы методы CARD-FISH и анализ 16S рРНК. Археи (по окраске DAPI) составляли от 3% до 37% населения планктона и были представлены, гл. обр., кренархеотами морской группы 1.1а. (Crenarchaeota, Marine Group 1.1a). В более глубоких слоях воды, напротив, среди архей преобладали представители Euryarchaeota. Проанализированы соотношения между площадью озера, его глубиной, временем существования воды (таяния ледового покрова) и содержанием архей в нейстоне, полученные данные сопоставлены с таковыми для нижележащих слоев воды. Отмечается, что горные озера представляют интересную возможность для изучения экологии архей. Испания, Dep. of Continental Ecology, Centre d'Estudis Avancats des Blanes-CSIC, 17300 Blanes, Girona. E-mail: casamayor@ceab.csic.es
ГРНТИ : 34.35.33
Предметные рубрики: CRENARCHAEOTA (ARCH.)
EURYARCHAEOTA (ARCH.)
ОБИЛИЕ
ДОМИНИРОВАНИЕ
ОЗЕРА
ВЫСОКОГОРНЫЕ ОЗЕРА
ГИДРОЛОГИЧЕСКИЕ УСЛОВИЯ
ВЛИЯНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.01-04Б2.146

Автор(ы) : Auguet, Jean-Christophe, Casamayor Emilio O.
Заглавие : A hotspot for cold crenarchaeota in the neuston of high mountain lakes
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 10, N 4. - С. 1080-1086
Аннотация: Исследовали обилие и доминирование филотипов архей в планктоне (в верхнем 1-метровом слое воды) 10 высокогорных озер в Центральных Пиренеях (Испания). Использованы методы CARD-FISH и анализ 16S рРНК. Археи (по окраске DAPI) составляли от 3% до 37% населения планктона и были представлены, гл. обр., кренархеотами морской группы 1.1а. (Crenarchaeota, Marine Group 1.1a). В более глубоких слоях воды, напротив, среди архей преобладали представители Euryarchaeota. Проанализированы соотношения между площадью озера, его глубиной, временем существования воды (таяния ледового покрова) и содержанием архей в нейстоне, полученные данные сопоставлены с таковыми для нижележащих слоев воды. Отмечается, что горные озера представляют интересную возможность для изучения экологии архей. Испания, Dep. of Continental Ecology, Centre d'Estudis Avancats des Blanes-CSIC, 17300 Blanes, Girona. E-mail: casamayor@ceab.csic.es
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: CRENARCHAEOTA (ARCH.)
EURYARCHAEOTA (ARCH.)
ОБИЛИЕ
ДОМИНИРОВАНИЕ
ОЗЕРА
ВЫСОКОГОРНЫЕ ОЗЕРА
ГИДРОЛОГИЧЕСКИЕ УСЛОВИЯ
ВЛИЯНИЕ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.01-04Б2.147

Автор(ы) : Auguet, Jean-Christophe, Borrego Carles M., Baneras, Lluis, Casamayor Emilio O.
Заглавие : Fingerprinting the genetic diversity of the biotin carboxylase gene (accC) in aquatic ecosystems as a potential marker for studies of carbon dioxide assimilation in the dark
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 10, N 10. - С. 2527-2536
Аннотация: Сконструирован набор специфических праймеров для ПЦР амплификации гена биотинкарбоксилазной субъединицы (accC) ацетил-CoA-карбоксилазы. Продуктом данной амплификации является олигонуклеотид 460 п. н., который пригоден для фингерпринтирования в условиях денатурирующего градиентного электрофореза в геле с последующим прямым секвенированием вырезанных из геля зон, соответствующих accC. Проведено сравнение фингерпринтов, полученных для нескольких образцов пресноводного планктона: число специфических полос на электрофореграммах варьировало от 2 до 19. У большинства образцов исследуемые последовательности группировались с бактериальным accC, определяющим анаплеротическую фиксацию неорганического углерода. Однако, в образцах из олиготрофных высокогорных и гиполимнии богатых сульфидом озер выявлены последовательности, кластеризующиеся с геном Crenarchaeota и родственные ферменту 3-гидроксипропионат/4-гидроксибутиратному цикла автотрофных кренархаеот, где ранее были обнаружены популяции Crenarchaeota. Таким образом, предлагается быстрый метод обнаружения генов accC в естественных условиях, который является потенциальным маркером ассимиляции окиси углерода в темноте. Планируется создание более специфичных праймеров для архей, что позволит получить новые сведения о биогеохимии этих организмов. Испания, Group Limnology-Dept. Continental Ecology, Centre d'Estudis Avancats de Blanes, ceab-csic, Acces Calaa Sant Francesc, 14, 17300 Blanes, Girona
ГРНТИ : 34.27.21
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕН БИОТИНКАРБОКСИЛАЗЫ ACCC
МАРКЕРЫ
ФИНГЕРПРИНТИНГ
ПЦР
ОКИСЬ УГЛЕРОДА
АССИМИЛЯЦИЯ
ТЕМНОТА
ЭКОСИСТЕМЫ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
БИОГЕОХИМИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.12-04Б4.60

Автор(ы) : Auguet, Jean-Christophe, Borrego Carles M., Baneras, Lluis, Casamayor Emilio O.
Заглавие : Fingerprinting the genetic diversity of the biotin carboxylase gene (accC) in aquatic ecosystems as a potential marker for studies of carbon dioxide assimilation in the dark
Источник статьи : Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 10, N 10. - С. 2527-2536
Аннотация: Сконструирован набор специфических праймеров для ПЦР амплификации гена биотинкарбоксилазной субъединицы (accC) ацетил-CoA-карбоксилазы. Продуктом данной амплификации является олигонуклеотид 460 п. н., который пригоден для фингерпринтирования в условиях денатурирующего градиентного электрофореза в геле с последующим прямым секвенированием вырезанных из геля зон, соответствующих accC. Проведено сравнение фингерпринтов, полученных для нескольких образцов пресноводного планктона: число специфических полос на электрофореграммах варьировало от 2 до 19. У большинства образцов исследуемые последовательности группировались с бактериальным accC, определяющим анаплеротическую фиксацию неорганического углерода. Однако, в образцах из олиготрофных высокогорных и гиполимнии богатых сульфидом озер выявлены последовательности, кластеризующиеся с геном Crenarchaeota и родственные ферменту 3-гидроксипропионат/4-гидроксибутиратному цикла автотрофных кренархаеот, где ранее были обнаружены популяции Crenarchaeota. Таким образом, предлагается быстрый метод обнаружения генов accC в естественных условиях, который является потенциальным маркером ассимиляции окиси углерода в темноте. Планируется создание более специфичных праймеров для архей, что позволит получить новые сведения о биогеохимии этих организмов. Испания, Group Limnology-Dept. Continental Ecology, Centre d'Estudis Avancats de Blanes, ceab-csic, Acces Calaa Sant Francesc, 14, 17300 Blanes, Girona
ГРНТИ : 34.27.49
Предметные рубрики: ГЕНЫ
ГЕН БИОТИНКАРБОКСИЛАЗЫ ACCC
МАРКЕРЫ
ФИНГЕРПРИНТИНГ
ПЦР
ОКИСЬ УГЛЕРОДА
АССИМИЛЯЦИЯ
ТЕМНОТА
ЭКОСИСТЕМЫ
ВОДНЫЕ ЭКОСИСТЕМЫ
БИОГЕОХИМИЯ
Дата ввода:

Вид документа : Статья из журнала

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.07-04Б2.140

Автор(ы) : Lliros, Marc, Gich, Frederic, Plasencia, Anna, Auguet, Jean-Christophe, Darchambeau, Francois, Casamayor Emilio O., Descy, Jean-Pierre, Borrego, Carles
Заглавие : Vertical distribution of ammonia-oxidizing crenarchaeota and methanogens in the epipelagic waters of Lake Kivu (Rwanda-Democratic Republic of the Congo)
Источник статьи : Appl. and Environ. Microbiol. - 2010. - Vol. 76, N 20. - С. 6853-6863
Аннотация: Взяты образцы из 4 стратифицированных бассейнов оз. Kivu в марте 2007 г. для изучения обилия, распространения и потенциальной биогеохимической роли планктонных археев. Использовали методы CARD-FISH, DJJE фингерпринтинг, колич. ПЦР генов аммиакокисляющих археев. Филогенетический анализ архейного планктонного сообщества обнаружил большее обилие кренархеотных последовательностей 16S рРНК по сравннеию с эвриаркеотными. Последовательности, относящиеся к Euryarchaeota, гл. обр. выделялись из аноксических вод и большей частью группировались в метаногенные линии родословной (Methonasarcinales и Methanocellales). Напротив, кренархейные филотипы выделялись из эпипелагичесикх вод (0 - до 100-м глубины), с четким филогенетическим разделением вдоль границы оксических и аноксических вод. Отмечена потенциальная причастность Crenarchaeota к процессам нитрификации в эпилимнионе озера. Испания, Univ. of Girona, E-17071 Girona. E-mail:carles.borrgo@udg.edu. Библ. 89
ГРНТИ : 34.27.23
Предметные рубрики: EURYARCHAEOTA (ARCH.)
CRENARCHAEOTA (ARCH.)
METHANOSARCINALES (ARCH.)
METHANOCELLALES (ARCH.)
РАСПРОСТРАНЕНИЕ
ОЗЕРА
ЭПИПЕЛАГИЧЕСКИЕ ВОДЫ
Дата ввода:

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска